单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 539 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Shows T-Cell Exhaustion Landscape in the Peripheral Blood of Patients with Hepatitis B Virus-Associated Acute-on-Chronic Liver Failure
2024-05-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl220449
PMID:37317515
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血中T细胞亚群的异质性和耗竭T淋巴细胞的特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血中T细胞的耗竭景观，并分析了耗竭T细胞的基因表达谱和发展轨迹 | 研究样本仅包括乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者和健康对照，未涉及其他疾病状态的患者 | 探索乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血T细胞亚群的异质性和耗竭T淋巴细胞的特征，以识别免疫功能障碍的潜在治疗靶点 | 乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者和健康对照的外周血T细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 83,577个T细胞 |
| 202 | 2024-08-08 |
Spatial and single-cell colocalisation analysis reveals MDK-mediated immunosuppressive environment with regulatory T cells in colorectal carcinogenesis
2024-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105102
PMID:38614865
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞共定位分析，揭示了中肾因子（MDK）介导的免疫抑制环境与调节性T细胞（Tregs）在结直肠癌发生中的作用 | 首次在结直肠癌早期阶段通过空间分布的单细胞分析，识别出MDK作为肿瘤上皮细胞向Tregs发送的主要信号分子，并发现MDK与SDC4的相互作用与Treg共定位相关 | 研究样本量较小，仅包括五个早期结直肠癌病例和一个晚期病例 | 探究促进腺瘤向散发性结直肠癌进展的细胞间相互作用因子，并评估其在结直肠癌患者中的临床意义 | 结直肠癌的肿瘤微环境中的细胞间相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，单细胞转录组 | 深度生成模型 | 单细胞数据 | 五个早期结直肠癌病例和一个晚期病例 |
| 203 | 2024-08-08 |
Intratumoral CD38+CD19+B cells associate with poor clinical outcomes and immunosuppression in patients with pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105098
PMID:38608514
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨胰腺导管腺癌（PDAC）中B细胞的异质性，并发现CD38+ B细胞的存在与不良临床结果和免疫抑制相关。 | 首次揭示了PDAC中CD38+ B细胞的免疫调节功能及其作为独立预后因子的潜力。 | 研究样本量有限，且未涉及所有可能的B细胞亚型及其在不同肿瘤微环境中的作用。 | 旨在识别PDAC中B细胞的异质性，并探索其作为治疗策略的新靶点。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的B细胞及其与临床结果的关系。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | FUSCC队列147例，TCGA队列176例 |
| 204 | 2024-08-07 |
Targeting MMP9 in CTNNB1 mutant hepatocellular carcinoma restores CD8+ T cell-mediated antitumour immunity and improves anti-PD-1 efficacy
2024-05-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331342
PMID:38123979
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研究论文 | 本文研究了CTNNB1功能获得性突变（CTNNB1 GOF）在肝细胞癌（HCC）中导致的免疫逃逸机制，并提出了一种新的治疗策略以增强HCC中抗PD-1疗法的疗效 | 发现MMP9在CTNNB1 GOF HCC中的显著上调，并通过抑制CD8+ T细胞的浸润和细胞毒性，驱动抑制性肿瘤免疫微环境（TIME）和抗PD-1抵抗 | NA | 探究CTNNB1 GOF HCC介导的免疫逃逸机制，并提出新的治疗策略以增强抗PD-1疗法的疗效 | CTNNB1 GOF HCC中的免疫逃逸机制及MMP9的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | RNA序列、蛋白质 | 使用了体外共培养系统、小鼠皮下或原位模型、条件性基因敲除小鼠的自发肿瘤模型 |
| 205 | 2024-08-07 |
Feature selection followed by a novel residuals-based normalization simplifies and improves single-cell gene expression analysis
2024-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.02.530891
PMID:38328133
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研究论文 | 本文提出了一种改进的单细胞RNA测序数据分析流程，包括先进行特征选择再进行基于残差的归一化方法 | 提出了一种新的基于残差的归一化方法和先特征选择后归一化的流程，显著改善了下游聚类分析 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 生物已知和模拟的计数数据集 |
| 206 | 2024-08-07 |
Integrative multi-omics profiling in human decedents receiving pig heart xenografts
2024-May, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02972-1
PMID:38760586
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研究论文 | 本文通过多组学分析方法，研究了接受猪心脏异种移植的人类受者的分子和免疫反应 | 首次详细描述了心脏异种移植后早期分子和免疫反应的差异，并揭示了新的见解 | 研究仅基于两名受者的样本，可能限制了结果的普遍性 | 深入理解异种移植后的详细分子景观，并探索改善移植结果的靶向治疗方法 | 接受猪心脏异种移植的人类受者的血液和组织样本 | 数字病理学 | NA | 转录组学、脂质组学、蛋白质组学和代谢组学 | NA | 血液样本和组织样本 | 两名受者 |
| 207 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals subtype-specific clonal evolution and microenvironmental changes in liver metastasis of pancreatic adenocarcinoma and their clinical implications
2024-May-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02003-0
PMID:38702773
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺腺癌肝转移的亚型特异性克隆演化和微环境变化及其临床意义 | 揭示了基底样亚型细胞在化疗反应和患者结局中的关键作用以及PDAC的克隆演变与癌症相关基因的剂量变化之间的关系 | 研究仍需进一步探讨不同细胞亚型与TME的具体相互作用 | 了解胰腺导管腺癌的肿瘤演变和其临床关联 | 治疗前的原发性胰腺导管腺癌样本及其配对肝转移样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 治疗前的原发性PDAC样本和配对的肝转移样本 |
| 208 | 2024-08-04 |
The mucosal concept in chronic rhinosinusitis: Focus on the epithelial barrier
2024-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.01.015
PMID:38295881
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综述 | 该文献主要探讨了慢性鼻窦炎中上皮屏障的关键作用 | 文章强调了新技术（如单细胞转录组学）揭示的上皮屏障的新功能，如炎症记忆和神经内分泌功能 | 未提供具体的实验数据或样本数量，以支持提出的观点 | 旨在深入理解慢性鼻窦炎中的上皮细胞在粘膜框架中的作用 | 针对慢性鼻窦炎中上皮细胞的相关研究 | NA | 慢性鼻窦炎 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 209 | 2024-08-05 |
STAT3 protects hematopoietic stem cells by preventing activation of a deleterious autocrine type-I interferon response
2024-May, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02218-6
PMID:38467768
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3在造血干细胞中的保护作用，防止有害自分泌式I型干扰素反应的激活 | 揭示了STAT3如何通过抑制有害的自分泌型I型干扰素反应来维持造血干细胞功能的全新机制 | 由于在骨髓嵌合小鼠中进行的研究，可能存在系统性炎症未完全消除的潜在影响 | 研究STAT3在造血干细胞功能中的作用及其潜在的治疗应用 | STAT3缺失的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 20%的造血腔室中的混合骨髓嵌合小鼠 |
| 210 | 2024-08-05 |
Rejuvenation of peripheral immune cells attenuates Alzheimer's disease-like pathologies and behavioral deficits in a mouse model
2024-May-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl1123
PMID:38809977
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研究论文 | 本研究探讨了免疫复兴作为阿尔茨海默病治疗策略的潜力 | 该研究首次通过年轻骨髓移植恢复了老年小鼠血液免疫细胞中与衰老和AD相关基因的表达 | 研究仅在小鼠模型中进行，未在临床试验中验证其有效性 | 研究免疫复兴在阿尔茨海默病治疗中的应用 | 老年小鼠的免疫系统及其在阿尔茨海默病中的作用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 老年小鼠 |
| 211 | 2024-08-04 |
LINC01002 functions as a ceRNA to regulate FRMD8 by sponging miR-4324 for the development of COVID-19
2024-05-11, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-024-02382-2
PMID:38734674
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研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2 N蛋白通过调节LINC01002作为ceRNA的功能，以抑制IFN-β的诱导。 | 本研究首次揭示了LINC01002通过吸附miR-4324调节FRMD8，并指出其在SARS-CoV-2感染早期干预治疗中的潜力。 | 本研究的局限性在于仅使用了A549细胞线，未在其他细胞类型中验证结果。 | 研究SARS-CoV-2 N蛋白在免疫逃逸中的作用机制。 | 研究的对象为SARS-CoV-2结构蛋白及相关的免疫调节基因。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了A549细胞线及858个差异表达基因 |
| 212 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
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研究论文 | 该文章探讨了IL-7治疗如何通过激活T细胞和促炎性髓系细胞来诱导抗肿瘤免疫 | 发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多重表达，并证实IL-7治疗在小鼠模型中的有效性 | 在研究中未提供人类患者的临床数据以支持发现 | 研究IL-7抗癌免疫治疗对T细胞和免疫微环境的共同刺激作用 | 分析来自多种人类癌症和小鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自多个人类癌症的数据与一个小鼠肿瘤移植模型 |
| 213 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell RNA-seq analysis using deep interpretable generative modeling guided by biological hierarchy knowledge
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae314
PMID:38960404
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研究论文 | 本文提出了一种深度可解释生成模型d-scIGM，用于单细胞数据分析。 | d-scIGM结合锯齿连接技术和残差网络，并引入生物领域的层次先验知识，增强了模型的可解释性。 | 之前基于生成模型的研究大多限于浅层神经网络，可能限制了模型的能力。 | 探讨细胞异质性并提高单细胞转录组数据分析的可解释性。 | 单细胞转录组数据及其生物学解释。 | 计算机视觉 | 黑色素瘤 | RNA-seq | 深度生成模型 | 单细胞数据 | 涉及多个大规模实验和黑色素瘤数据集 |
| 214 | 2024-08-05 |
Identification of MUC1-C as a Target for Suppressing Progression of Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2024-May-14, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0011
PMID:38619287
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研究论文 | 本研究报告了MUC1-C蛋白在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其作为抑制癌症进展的靶点 | 揭示了MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌中的新角色，并且表明其与肿瘤干细胞状态的联系 | 该研究在临床应用方面的具体有效性尚需进一步验证 | 探究MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌的发病机制中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 215 | 2024-08-04 |
A phosphate transporter in VIPergic neurons of the suprachiasmatic nucleus gates locomotor activity during the light/dark transition in mice
2024-May-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114220
PMID:38735047
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研究论文 | 这篇文章研究了磷酸盐转运蛋白PiT2在小鼠上丘脑SCN中对行为的影响 | 鉴定了PiT2作为调节小鼠活动的磷酸盐转运蛋白，揭示了其在昼夜转换中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于其他物种 | 探索上丘脑如何通过分子机制调节行为 | 小鼠SCN中的VipNms神经元 | 数字病理学 | NA | 斑点钳记录和单细胞测序 | NA | 生物电活动和基因表达数据 | 涉及的样本为小鼠SCN神经元群体 |
| 216 | 2024-08-05 |
The molecular basis of scale development highlighted by a single-cell atlas of Bicyclus anynana butterfly pupal forewings
2024-May-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114147
PMID:38662541
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research paper | 本研究探讨了Bicyclus anynana蝴蝶蛹前翅中鳞片细胞的多样性及其分子基础 | 通过单细胞RNA测序技术识别了不同类型的鳞片细胞，并揭示了关键基因在细胞分化中的作用 | 研究主要集中在单一物种的细胞类型，可能无法全面代表其他节肢动物的情况 | 探索蝴蝶翅膀鳞片细胞的多样性及其转录组学基础 | Bicyclus anynana蝴蝶的雄性蛹前翅中的大约5200个鳞片细胞 | 机遇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 约5200个大细胞 |
| 217 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of neutrophils in non-small cell lung cancer
2024-May, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3690
PMID:38735760
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研究论文 | 本研究探讨了非小细胞肺癌中中性粒细胞的异质性 | 识别了四种主要类型的肿瘤相关中性粒细胞，并分析了其动态特征及转录因子调控 | 未提及具体的样本数量和来源的多样性 | 研究非小细胞肺癌中中性粒细胞的异质性 | 肿瘤相关的中性粒细胞和人源多形核中性粒细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自基因表达综合数据库的样本 |
| 218 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis of human tendon adhesion reveals that ACKR1-regulated macrophage migration is involved in regeneration
2024-May-07, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00324-w
PMID:38714649
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了ACKR1调控的巨噬细胞迁移参与人类肌腱粘连的再生过程 | 发现了一种新的抗纤维化巨噬细胞群体及其来源 | 研究中的抗纤维化机制仍需进一步验证和探讨 | 研究肌腱损伤后肌腱粘连的纤维化微环境 | 分析人类和小鼠的肌腱粘连组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白组学 | NA | 组织样本 | 超过74000个单细胞 |
| 219 | 2024-08-04 |
MetalinksDB: a flexible and contextualizable resource of metabolite-protein interactions
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae347
PMID:39038934
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研究论文 | 本文介绍了一个名为MetalinksDB的资源，用于代谢物与蛋白质之间的相互作用 | MetalinksDB比现有的代谢物-受体资源大一个数量级，并能够根据具体的生物学背景进行定制 | 目前的细胞间知识资源对于代谢物关注的范围有限，但MetalinksDB致力于对此进行扩展 | 研究代谢物与蛋白质之间的相互作用，以理解其在细胞功能中的重要性 | 代谢物和蛋白质的相互作用，特别是在肾癌和急性肾损伤中的作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学 | 知识图谱 | 多组学数据 | NA |
| 220 | 2024-08-04 |
Single-Cell multiomics reveals ENL mutation perturbs kidney developmental trajectory by rewiring gene regulatory landscape
2024-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.09.591709
PMID:38766219
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研究论文 | 研究单细胞多组学揭示ENL突变通过重塑基因调控景观来扰乱肾脏发育轨迹 | 该研究首次揭示了与Wilms肿瘤相关的ENL突变如何在单细胞水平上重塑基因调控网络并影响肾脏发育 | 该研究主要集中于小鼠模型，可能不完全适用于人类肾脏发育的研究 | 探讨表观遗传调控因子突变在肾脏发育和病理生理中的作用 | Wilms肿瘤相关的ENL突变及其对肾脏发育的影响 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组学，组蛋白乙酰化结合活性抑制 | 小鼠模型 | 基因组数据 | NA |