单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 540 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-04 |
LINC01002 functions as a ceRNA to regulate FRMD8 by sponging miR-4324 for the development of COVID-19
2024-05-11, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-024-02382-2
PMID:38734674
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研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2 N蛋白通过调节LINC01002作为ceRNA的功能，以抑制IFN-β的诱导。 | 本研究首次揭示了LINC01002通过吸附miR-4324调节FRMD8，并指出其在SARS-CoV-2感染早期干预治疗中的潜力。 | 本研究的局限性在于仅使用了A549细胞线，未在其他细胞类型中验证结果。 | 研究SARS-CoV-2 N蛋白在免疫逃逸中的作用机制。 | 研究的对象为SARS-CoV-2结构蛋白及相关的免疫调节基因。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了A549细胞线及858个差异表达基因 |
| 202 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
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研究论文 | 该文章探讨了IL-7治疗如何通过激活T细胞和促炎性髓系细胞来诱导抗肿瘤免疫 | 发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多重表达，并证实IL-7治疗在小鼠模型中的有效性 | 在研究中未提供人类患者的临床数据以支持发现 | 研究IL-7抗癌免疫治疗对T细胞和免疫微环境的共同刺激作用 | 分析来自多种人类癌症和小鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自多个人类癌症的数据与一个小鼠肿瘤移植模型 |
| 203 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell RNA-seq analysis using deep interpretable generative modeling guided by biological hierarchy knowledge
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae314
PMID:38960404
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研究论文 | 本文提出了一种深度可解释生成模型d-scIGM，用于单细胞数据分析。 | d-scIGM结合锯齿连接技术和残差网络，并引入生物领域的层次先验知识，增强了模型的可解释性。 | 之前基于生成模型的研究大多限于浅层神经网络，可能限制了模型的能力。 | 探讨细胞异质性并提高单细胞转录组数据分析的可解释性。 | 单细胞转录组数据及其生物学解释。 | 计算机视觉 | 黑色素瘤 | RNA-seq | 深度生成模型 | 单细胞数据 | 涉及多个大规模实验和黑色素瘤数据集 |
| 204 | 2024-08-05 |
Identification of MUC1-C as a Target for Suppressing Progression of Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2024-May-14, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0011
PMID:38619287
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研究论文 | 本研究报告了MUC1-C蛋白在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其作为抑制癌症进展的靶点 | 揭示了MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌中的新角色，并且表明其与肿瘤干细胞状态的联系 | 该研究在临床应用方面的具体有效性尚需进一步验证 | 探究MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌的发病机制中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-04 |
A phosphate transporter in VIPergic neurons of the suprachiasmatic nucleus gates locomotor activity during the light/dark transition in mice
2024-May-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114220
PMID:38735047
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研究论文 | 这篇文章研究了磷酸盐转运蛋白PiT2在小鼠上丘脑SCN中对行为的影响 | 鉴定了PiT2作为调节小鼠活动的磷酸盐转运蛋白，揭示了其在昼夜转换中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于其他物种 | 探索上丘脑如何通过分子机制调节行为 | 小鼠SCN中的VipNms神经元 | 数字病理学 | NA | 斑点钳记录和单细胞测序 | NA | 生物电活动和基因表达数据 | 涉及的样本为小鼠SCN神经元群体 |
| 206 | 2024-08-05 |
Multiplexed single-cell lineage tracing of mitotic kinesin inhibitor resistance in glioblastoma
2024-May-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114139
PMID:38652658
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研究论文 | 本文探讨了胶质母细胞瘤中对KIF11抑制剂的抵抗机制 | 首次将谱系追踪条形码和单细胞RNA测序结合用于分析患者来源的胶质母细胞瘤中的药物抵抗 | 主要集中在药物对细胞的影响，缺乏对更大临床样本的验证 | 研究胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂的抵抗机制 | 患者来源的胶质母细胞瘤神经球及其对ispinesib的反应 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | 患者来源的异种移植模型 | 基因表达数据 | 涉及多个患者来源的胶质母细胞瘤样本 |
| 207 | 2024-08-05 |
The molecular basis of scale development highlighted by a single-cell atlas of Bicyclus anynana butterfly pupal forewings
2024-May-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114147
PMID:38662541
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research paper | 本研究探讨了Bicyclus anynana蝴蝶蛹前翅中鳞片细胞的多样性及其分子基础 | 通过单细胞RNA测序技术识别了不同类型的鳞片细胞，并揭示了关键基因在细胞分化中的作用 | 研究主要集中在单一物种的细胞类型，可能无法全面代表其他节肢动物的情况 | 探索蝴蝶翅膀鳞片细胞的多样性及其转录组学基础 | Bicyclus anynana蝴蝶的雄性蛹前翅中的大约5200个鳞片细胞 | 机遇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 约5200个大细胞 |
| 208 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of neutrophils in non-small cell lung cancer
2024-May, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3690
PMID:38735760
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研究论文 | 本研究探讨了非小细胞肺癌中中性粒细胞的异质性 | 识别了四种主要类型的肿瘤相关中性粒细胞，并分析了其动态特征及转录因子调控 | 未提及具体的样本数量和来源的多样性 | 研究非小细胞肺癌中中性粒细胞的异质性 | 肿瘤相关的中性粒细胞和人源多形核中性粒细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自基因表达综合数据库的样本 |
| 209 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis of human tendon adhesion reveals that ACKR1-regulated macrophage migration is involved in regeneration
2024-May-07, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00324-w
PMID:38714649
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了ACKR1调控的巨噬细胞迁移参与人类肌腱粘连的再生过程 | 发现了一种新的抗纤维化巨噬细胞群体及其来源 | 研究中的抗纤维化机制仍需进一步验证和探讨 | 研究肌腱损伤后肌腱粘连的纤维化微环境 | 分析人类和小鼠的肌腱粘连组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白组学 | NA | 组织样本 | 超过74000个单细胞 |
| 210 | 2024-08-04 |
MetalinksDB: a flexible and contextualizable resource of metabolite-protein interactions
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae347
PMID:39038934
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研究论文 | 本文介绍了一个名为MetalinksDB的资源，用于代谢物与蛋白质之间的相互作用 | MetalinksDB比现有的代谢物-受体资源大一个数量级，并能够根据具体的生物学背景进行定制 | 目前的细胞间知识资源对于代谢物关注的范围有限，但MetalinksDB致力于对此进行扩展 | 研究代谢物与蛋白质之间的相互作用，以理解其在细胞功能中的重要性 | 代谢物和蛋白质的相互作用，特别是在肾癌和急性肾损伤中的作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学 | 知识图谱 | 多组学数据 | NA |
| 211 | 2024-08-04 |
Single-Cell multiomics reveals ENL mutation perturbs kidney developmental trajectory by rewiring gene regulatory landscape
2024-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.09.591709
PMID:38766219
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研究论文 | 研究单细胞多组学揭示ENL突变通过重塑基因调控景观来扰乱肾脏发育轨迹 | 该研究首次揭示了与Wilms肿瘤相关的ENL突变如何在单细胞水平上重塑基因调控网络并影响肾脏发育 | 该研究主要集中于小鼠模型，可能不完全适用于人类肾脏发育的研究 | 探讨表观遗传调控因子突变在肾脏发育和病理生理中的作用 | Wilms肿瘤相关的ENL突变及其对肾脏发育的影响 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组学，组蛋白乙酰化结合活性抑制 | 小鼠模型 | 基因组数据 | NA |
| 212 | 2024-08-05 |
Increased Thyroid DPP4 Expression Is Associated With Inflammatory Process in Patients With Hashimoto Thyroiditis
2024-May-17, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgad723
PMID:38127960
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研究论文 | 本研究旨在调查Hashimoto甲状腺炎患者外周血和甲状腺组织中DPP4的表达，并探索其在病理生理过程中的作用 | 首次在Hashimoto甲状腺炎患者的甲状腺中发现DPP4表达显著增加，并主要局限于淋巴细胞 | 样本量较小，且未能探讨DPP4在其他类型甲状腺疾病中的作用 | 研究Hashimoto甲状腺炎患者中DPP4的表达及其在炎症过程中的角色 | 40名未服药的Hashimoto甲状腺炎患者和81名对照个体 | 数字病理学 | Hashimoto甲状腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液和甲状腺组织样本 | 共121个样本（40名HT患者和81名对照个体） |
| 213 | 2024-08-04 |
HATCHet2: clone- and haplotype-specific copy number inference from bulk tumor sequencing data
2024-05-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03267-x
PMID:38773520
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研究论文 | 本文介绍了一种新算法HATCHet2，用于从肿瘤的多样本群体DNA测序数据中同时推断克隆和单倍型特异的拷贝数异常。 | HATCHet2改进了早期HATCHet方法，通过引入新的统计量mhBAF来提高对焦点拷贝数异常的识别，并能识别镜像亚克隆CNAs。 | 该研究可能受限于从相对较小的样本中得出的结论，并未涵盖更广泛的样本多样性。 | 研究的目的是提高从肿瘤样本中推断拷贝数异常的准确性。 | 研究对象为来自10名前列腺癌患者的肿瘤样本。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 群体DNA测序 | HATCHet2 | 基因组数据 | 10个前列腺癌患者的肿瘤样本 |
| 214 | 2024-08-05 |
SorLA restricts TNFα release from microglia to shape a glioma-supportive brain microenvironment
2024-May, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00117-6
PMID:38499808
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研究论文 | 本文探讨了SorLA在胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞功能特性中的影响 | 揭示了SorLA在调节小胶质细胞释放TNFα中的作用，其对胶质瘤微环境及肿瘤进展有重要影响 | 本研究主要依赖于已发布的scRNA-seq数据和体外模型，可能限制了在临床背景下的直接适用性 | 研究SorLA如何影响胶质瘤微环境中的小胶质细胞功能 | 胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞（GAMs） | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 215 | 2024-08-05 |
ZEB1 controls a lineage-specific transcriptional program essential for melanoma cell state transitions
2024-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03010-7
PMID:38519642
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研究论文 | 本研究解码了ZEB1转录因子在黑色素瘤细胞状态转变中的关键作用 | 识别并验证了关键谱系特异基因的ZEB1结合峰，阐明了其在黑色素瘤细胞身份中的重要性 | 未提及具体实验的局限性 | 探讨ZEB1在黑色素瘤细胞内肿瘤异质性中的转录调控机制 | 黑色素瘤细胞模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | ChIP-sequencing和RNA-sequencing | NA | 单细胞空间多重分析及scRNA-Seq分析 | 人类黑色素瘤样本 |
| 216 | 2024-08-05 |
Destabilization of mRNAs enhances competence to initiate meiosis in mouse spermatogenic cells
2024-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.20.557439
PMID:37781613
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研究论文 | 这篇文章探讨了MEIOC如何在小鼠生殖细胞中分子地支持早期减数分裂。 | 该研究首次揭示了MEIOC在减数分裂启动前如何介导转录组变化，并早于之前的认识。 | 本研究主要集中在小鼠模型，结果的普遍适用性可能有限。 | 研究MEIOC如何影响小鼠生殖细胞中的减数分裂启动。 | 小鼠的生殖细胞，特别是有能力启动减数分裂的 spermatogenic cells。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq 和 bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 217 | 2024-08-05 |
Comparative single cell analysis reveals complex patterns of cell type and cell signaling innovations at the fetal-maternal interface
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.01.591945
PMID:38746137
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研究论文 | 本研究揭示了胎盘-母体接口处细胞类型和信号传导创新的复杂模式 | 发现了新型的绒毛膜和决定位细胞类型，并重建了细胞间信号网络 | 研究中未提及样本的具体数量和选择标准 | 探索哺乳动物胎盘-母体接口的细胞类型和信号传导动态 | 对树袋熊、马达加斯加普通刺猬和小鼠等不同哺乳动物胎盘-母体接口的单细胞RNA测序进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 218 | 2024-08-04 |
Emerging Roles of Spatial Transcriptomics in Liver Research
2024-May, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/a-2299-7880
PMID:38574750
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研究论文 | 空间转录组学在肝脏研究中的新兴角色，揭示了基因表达的复杂地图。 | 该文章通过空间转录组学技术识别肝细胞的分区功能，揭示了脂肪肝中脂质相关巨噬细胞的作用和肝再生过程中的内皮细胞信号。 | NA | 探讨空间转录组学在肝脏疾病理解和治疗中的应用 | 主要关注健康和病态肝脏中的细胞动力学和分子机制 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 219 | 2024-08-04 |
Somatic PDGFRB activating variants promote smooth muscle cell phenotype modulation in intracranial fusiform aneurysm
2024-May-13, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-024-01040-7
PMID:38741091
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研究论文 | 本研究探讨了PDGFRB体细胞变异在脑内梭形动脉瘤中对平滑肌细胞表型调节的作用。 | 该文章揭示了PDGFRB体细胞突变如何影响脑内梭形动脉瘤中平滑肌细胞表型，并探索了相关细胞信号通路及治疗干预。 | 本研究的样本量较小，且研究主要集中在单细胞水平，未能全面揭示所有可能的分子机制。 | 研究PDGFRB体细胞突变对梭形动脉瘤平滑肌细胞表型调节的影响及其潜在的治疗方案。 | 研究对象为脑内梭形动脉瘤的平滑肌细胞及相关基因突变。 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞测序、全外显子测序、免疫荧光 | 斑马鱼模型 | 生物样本 | 七个脑动脉瘤样本（六个梭形和一个囊性） |
| 220 | 2024-08-04 |
Integrating population genetics, stem cell biology and cellular genomics to study complex human diseases
2024-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01731-9
PMID:38741017
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研究论文 | 探讨了如何将种群遗传学、干细胞生物学和细胞基因组学整合在一起以研究复杂的人类疾病 | 文章创新性地将人类多能干细胞与单细胞测序相结合，揭示了人类遗传变异的功能后果 | 整合这些领域和方法存在重大挑战，特别是在经济性和实用性上的问题 | 研究人类遗传变异的功能后果及其对复杂疾病的影响 | 主要研究对象为人类多能干细胞及其与遗传变异的关系 | 干细胞生物学 | 复杂疾病 | 单细胞测序 | 人类多能干细胞 | 细胞基因组数据 | NA |