单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 539 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-11-10 |
Contribution of VEGF-B-Induced Endocardial Endothelial Cell Lineage in Physiological Versus Pathological Cardiac Hypertrophy
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324136
PMID:38655691
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研究论文 | 研究VEGF-B诱导的心内膜内皮细胞谱系在生理性和病理性心脏肥大中的作用 | 首次探讨了自分泌和旁分泌VEGF-B表达在转基因和基因转导小鼠中的心脏效应，揭示了VEGF-B诱导的特定心内膜来源内皮细胞群体的扩展及其在生理性和病理性心脏肥大中的不同作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探讨VEGF-B在心脏肥大中的作用及其对心脏功能的潜在影响 | VEGF-B诱导的心内膜内皮细胞谱系及其在生理性和病理性心脏肥大中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 转基因小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2024-11-08 |
Pan-cancer analysis of CDKN2A alterations identifies a subset of gastric cancer with a cold tumor immune microenvironment
2024-05-31, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00615-7
PMID:38822443
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研究论文 | 研究探讨了CDKN2A突变和缺失与泛癌种中免疫检查点抑制剂治疗反应及总体生存期的关联 | 发现CDKN2A突变和缺失与免疫检查点抑制剂治疗反应及总体生存期的关联，并揭示了CDKN2A突变和缺失对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究样本主要来自四个队列，可能存在样本偏倚；未详细探讨CDKN2A突变和缺失的具体机制 | 确定CDKN2A突变和缺失与泛癌种中总体生存期及免疫检查点抑制剂治疗反应的关联 | CDKN2A突变和缺失在泛癌种中的作用及其对免疫检查点抑制剂治疗反应的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 肿瘤测序 | NA | 基因组数据 | 45,000名肿瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2024-11-04 |
Momordicine-I Suppresses Head and Neck Cancer Growth by Reprogrammimg Immunosuppressive Effect of the Tumor-Infiltrating Macrophages and B Lymphocytes
2024-May-02, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-23-0718
PMID:38315993
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研究论文 | 研究了Momordicine-I通过重编程肿瘤浸润巨噬细胞和B淋巴细胞的免疫抑制效应来抑制头颈癌生长的机制 | 揭示了Momordicine-I通过调节肿瘤微环境中免疫细胞的分子表达，特别是通过抑制Sfln4和Cxcl3的表达，来抑制头颈癌生长的机制 | 研究主要在免疫功能正常的鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探讨Momordicine-I抑制头颈癌生长的机制，特别是在肿瘤微环境中的作用 | 头颈癌、肿瘤浸润巨噬细胞、B淋巴细胞 | NA | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了两种免疫功能正常的鼠模型，分别使用MOC2和SCC VII细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 204 | 2024-11-02 |
Identification of restrictive molecules involved in oncolytic virotherapy using genome-wide CRISPR screening
2024-05-23, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01554-5
PMID:38783389
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选技术，识别出限制溶瘤病毒疗法效果的分子，并研究了其在胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌中的应用 | 本文创新性地通过CRISPR筛选技术识别出PARP1作为HSV-1复制的限制因子，并展示了PARP抑制剂与免疫检查点抑制剂联合使用在溶瘤病毒疗法中的协同作用 | NA | 克服溶瘤病毒疗法的固有限制，为三阴性乳腺癌、胶质母细胞瘤和其他恶性肿瘤的临床治疗提供有价值的见解 | 溶瘤病毒疗法在胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌中的应用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | CRISPR筛选 | NA | RNA | 涉及胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌的模型 | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-11-02 |
GRouNdGAN: GRN-guided simulation of single-cell RNA-seq data using causal generative adversarial networks
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48516-6
PMID:38744843
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研究论文 | 介绍了一种基于基因调控网络（GRN）引导的参考型因果隐式生成模型GRouNdGAN，用于模拟单细胞RNA-seq数据、体内扰动实验和基准测试GRN推断方法 | 通过在其架构中施加用户定义的GRN，GRouNdGAN模拟稳态和瞬态单细胞数据集，其中基因在其调控转录因子（TF）的控制下因果表达 | NA | 开发一种新的生成模型，用于模拟单细胞RNA-seq数据和基准测试基因调控网络推断方法 | 单细胞RNA-seq数据、基因调控网络推断方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 生成对抗网络（GAN） | 基因表达数据 | 六个实验参考数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2024-11-02 |
Quantifying 3'UTR length from scRNA-seq data reveals changes independent of gene expression
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48254-9
PMID:38744866
|
研究论文 | 本文开发了一种名为scUTRquant的计算流程，用于从单细胞RNA测序数据中快速、准确地同时量化基因和3'UTR异构体的表达 | 首次提出了从单细胞RNA测序数据中量化3'UTR长度的方法，并发现3'UTR长度的变化与基因表达变化广泛且协调，但影响不同的基因 | NA | 研究3'UTR长度在不同细胞类型中的变化及其对基因调控的影响 | 人类和小鼠的200多种初级细胞类型 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 474种细胞类型和2134种扰动 | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2024-10-30 |
EmptyDropsMultiome discriminates real cells from background in single-cell multiomics assays
2024-05-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03259-x
PMID:38741206
|
研究论文 | 本文开发了一种名为EmptyDropsMultiome的方法，用于区分单细胞多组学测序中的真实细胞和背景 | EmptyDropsMultiome在统计能力和准确性上优于现有的方法，如CellRanger-arc和EmptyDrops | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞多组学测序中真实细胞的识别率 | 单细胞多组学测序中的真实细胞和背景 | 数字病理学 | NA | scATAC-seq和scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 208 | 2024-10-27 |
Development of a CD163-Targeted PET Radiotracer That Images Resident Macrophages in Atherosclerosis
2024-May-01, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.123.266910
PMID:38548349
|
研究论文 | 开发了一种靶向CD163的PET放射性示踪剂，用于成像动脉粥样硬化中的常驻巨噬细胞 | 首次开发了一种靶向CD163的PET放射性示踪剂，用于非侵入性检测动脉粥样硬化中的常驻巨噬细胞 | 需要在转化研究中进一步验证[Cu]Cu-ICT-01的敏感性和特异性 | 开发一种靶向PET放射性示踪剂，用于成像动脉粥样硬化中的CD163阳性巨噬细胞，并评估CD163作为人类动脉粥样硬化生物标志物的潜力 | CD163阳性巨噬细胞和动脉粥样硬化斑块 | NA | 心血管疾病 | PET成像 | NA | 图像 | 多个小鼠动脉粥样硬化模型和人类颈动脉粥样硬化斑块 | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2024-10-24 |
Aggressive high-grade NF2 mutant meningiomas downregulate oncogenic YAP signaling via the upregulation of VGLL4 and FAT3/4
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596719
PMID:38854109
|
研究论文 | 研究了NF2突变型脑膜瘤中YAP信号通路的下调机制 | 发现VGLL4和FAT3/4的上调是高级别NF2突变型脑膜瘤中YAP活性下调的潜在机制 | 研究主要基于体外实验和RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨NF2突变型脑膜瘤中YAP信号通路的调控机制 | NF2突变型脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量人类脑膜瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 210 | 2024-10-24 |
Single-cell transcriptomics reveals stage- and side-specificity of gene modules in colorectal cancer
2024-May-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4402565/v1
PMID:38826219
|
研究论文 | 本研究利用网络理论方法分析结直肠癌（CRC）的单细胞转录组数据，以更好地描述其进展和侧向性 | 本研究首次通过单细胞转录组数据分析，揭示了结直肠癌在不同阶段和侧向的基因模块特异性 | 本研究仅使用了单一数据集，未来需要更多数据集验证结果 | 旨在通过网络理论方法分析结直肠癌的单细胞转录组数据，以更好地理解其发展和进展机制 | 结直肠癌的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | 使用了GEO-GSE178341数据集中的细胞X基因数据 | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2024-10-24 |
Endothelial deletion of p53 generates transitional endothelial cells and improves lung development during neonatal hyperoxia
2024-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.07.593014
PMID:38766251
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研究论文 | 研究探讨了p53在新生儿高氧环境下对肺发育和内皮细胞类型的影响 | 首次揭示了p53在内皮细胞类型转换中的作用，并展示了内皮特异性p53缺失对高氧环境下血管和肺泡简化的改善效果 | NA | 探讨p53在新生儿高氧环境下对肺发育和内皮细胞类型的影响 | 内皮细胞、肺血管和肺泡 | NA | 肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 212 | 2024-10-24 |
Host-derived Interleukin 1α induces an immunosuppressive tumor microenvironment via regulating monocyte-to-macrophage differentiation
2024-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.03.592354
PMID:38746389
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研究论文 | 研究探讨了IL-1α在调节单核细胞向巨噬细胞分化过程中对免疫抑制性肿瘤微环境的影响 | 首次揭示了IL-1α在调节巨噬细胞分化和活性中的关键作用，并提出其作为乳腺癌治疗潜在靶点的可能性 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨IL-1α在肿瘤微环境中对巨噬细胞分化的调控机制及其对免疫抑制性微环境的影响 | IL-1α、巨噬细胞、肿瘤微环境 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 使用乳腺癌小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2024-10-24 |
Unveiling Novel Double-Negative Prostate Cancer Subtypes Through Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.11.553009
PMID:38746150
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了前列腺癌中的新型双阴性亚型 | 发现了两种新型双阴性前列腺癌亚型：KRT7细胞和祖细胞样细胞，并开发了用于可视化基因表达的网络应用程序 | NA | 揭示前列腺癌中的新型亚型，并为临床诊断和治疗策略提供新见解 | 前列腺癌的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个研究中的公开队列和本研究团队生成的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2024-10-19 |
The role of HPV11 E7 in modulating STING-dependent interferon β response in recurrent respiratory papillomatosis
2024-May-14, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01925-23
PMID:38624230
|
研究论文 | 研究HPV11 E7在复发性呼吸道乳头状瘤病中调节STING依赖性干扰素β反应的作用 | 首次揭示了HPV11 E7通过抑制STING蛋白的磷酸化来逃避宿主的抗病毒反应，并展示了激活的巨噬细胞在抗病毒免疫中的潜在作用 | 研究主要集中在细胞模型和单细胞RNA测序分析上，缺乏临床试验数据支持 | 探讨HPV在复发性呼吸道乳头状瘤病中逃避宿主先天免疫反应的机制 | 复发性呼吸道乳头状瘤病样本中的免疫细胞状态和HPV感染的细胞模型 | NA | 复发性呼吸道乳头状瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个复发性呼吸道乳头状瘤病样本 | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2024-10-16 |
Efficient and accurate mixed model association tool for single-cell eQTL analysis
2024-May-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.05.15.24307317
PMID:38798318
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研究论文 | 本文提出了一种高效且准确的混合模型关联工具SAIGE-QTL，用于单细胞eQTL分析 | SAIGE-QTL可以直接使用单细胞数据进行eQTL映射，无需聚合到伪批量水平，并且支持通过基于集合的测试来检测稀有遗传变异的影响 | NA | 研究基因表达的遗传基础，以帮助理解人类性状和疾病的分子机制 | 单细胞eQTL映射 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模型 | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 216 | 2024-10-16 |
Expression of SOX4 Significantly Predicts the Risk of Lymph Node Metastasis for Patients With Early-Stage Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2024-05, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102042
PMID:38431117
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研究论文 | 研究探讨了SOX4基因表达与早期食管鳞状细胞癌患者淋巴结转移风险的关系 | 首次通过单细胞RNA测序发现SOX4基因与侵袭性转移高度相关，并进一步验证了其在预测淋巴结转移中的独立作用 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 研究SOX4基因在早期食管鳞状细胞癌患者淋巴结转移中的预测作用 | SOX4基因表达与食管鳞状细胞癌患者的淋巴结转移风险 | 数字病理学 | 食管癌 | 免疫组化染色 | NA | 组织样本 | 124个组织样本，来自106名患者（106个肿瘤样本和18个淋巴结样本） | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2024-10-05 |
Single-cell analysis reveals an antiviral network that controls Zika virus infection in human dendritic cells
2024-May-14, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00194-24
PMID:38567950
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了人类树突状细胞对寨卡病毒感染的抗病毒反应 | 首次在单细胞水平上揭示了寨卡病毒感染时抗病毒网络的组成和功能 | 研究仅限于人类树突状细胞，未涉及其他细胞类型 | 深入理解宿主对寨卡病毒感染的反应机制 | 人类树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 一批人类单核细胞衍生的树突状细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 218 | 2024-10-01 |
Helicobacter pylori CagA Promotes the Formation of Gallstones by Increasing the Permeability of Gallbladder Epithelial Cells
2024 May-Jun, Helicobacter
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/hel.13100
PMID:38873839
|
研究论文 | 研究了幽门螺杆菌CagA通过增加胆囊上皮细胞的通透性促进胆结石形成的作用 | 首次发现幽门螺杆菌CagA是导致胆结石形成的关键致病因素 | 研究主要基于小鼠模型和少量患者样本，需要进一步的人体研究验证 | 探索导致慢性炎症和胆结石形成的关键致病菌及其机制 | 胆结石患者和小鼠模型的胆囊上皮细胞 | NA | 胆结石 | 单细胞转录组测序、bulk转录组测序、16S rRNA测序 | NA | 转录组数据、微生物组数据 | 6名胆结石患者和6名肝移植供体的胆囊黏膜样本，以及胆结石小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2024-09-28 |
HCCDB v2.0: Decompose Expression Variations by Single-cell RNA-seq and Spatial Transcriptomics in HCC
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae011
PMID:38886186
|
研究论文 | 本文介绍了HCCDB v2.0数据库，该数据库整合了肝细胞癌（HCC）临床样本的bulk、单细胞和空间转录组数据，提供了对HCC分子特征的深入理解 | 提出了sc-2D指标，用于总结细胞类型特异性和失调基因表达模式，并整合了最新的单细胞和空间转录组数据 | NA | 通过整合大规模转录组数据，深入理解肝细胞癌的分子特征 | 肝细胞癌（HCC）临床样本的bulk、单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 共整合了3917个bulk样本和1656个新样本，以及182,832个单细胞和69,352个空间位点 | NA | NA | NA | NA |
| 220 | 2024-09-21 |
Interactions between LAMP3+ dendritic cells and T-cell subpopulations promote immune evasion in papillary thyroid carcinoma
2024-May-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008983
PMID:38816233
|
研究论文 | 研究探讨了LAMP3+树突状细胞与T细胞亚群在乳头状甲状腺癌中的相互作用及其对免疫逃逸的影响 | 首次揭示了LAMP3+树突状细胞在乳头状甲状腺癌进展中的高度浸润及其与T细胞亚群的相互作用，为免疫治疗提供了新的思路 | 研究样本量较小，且仅限于手术组织样本，可能影响结果的普适性 | 探讨乳头状甲状腺癌免疫重塑的机制，寻找新的治疗靶点 | LAMP3+树突状细胞与T细胞亚群在乳头状甲状腺癌中的相互作用 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 18个手术组织样本，来自14名患者 | NA | NA | NA | NA |