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当前共找到 539 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-08 |
Characterizing dysregulations via cell-cell communications in Alzheimer's brains using single-cell transcriptomes
2024-05-13, BMC neuroscience
IF:2.4Q3
DOI:10.1186/s12868-024-00867-y
PMID:38741048
|
研究论文 | 利用单细胞转录组数据表征阿尔茨海默病大脑中细胞间通讯的失调 | 通过大规模单核RNA测序数据构建高置信度细胞间通讯网络，揭示了阿尔茨海默病中细胞类型特异性信号通路失调，并连接了细胞外风险基因与细胞内风险基因的关联 | NA | 研究阿尔茨海默病大脑中细胞间通讯的失调及其机制 | 人类前额叶皮层中的细胞类型（包括兴奋性神经元、抑制性神经元、小胶质细胞、星形胶质细胞等） | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大规模公开数据，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-06 |
Single-cell transcriptomics reveals evolutionary reconfiguration of embryonic cell fate specification in the sea urchin Heliocidaris erythrogramma
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.30.591752
PMID:38746376
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了海胆物种Heliocidaris erythrogramma在胚胎细胞命运决定过程中的进化重组 | 利用海胆发育进化中的自然实验，通过比较单细胞RNA测序发育时间序列，揭示了胚胎模式化中广泛的进化变化，包括细胞命运决定和信号中心在空间和时间上的分离 | 未提及具体局限性 | 识别发育机制中的进化变化，特别是与生活史转变相关的胚胎模式化改变 | 海胆物种Heliocidaris erythrogramma及其近缘种（代表衍生和祖先状态） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个发育时间点的海胆胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-05 |
Single-cell RNA sequencing to explore cancer-associated fibroblasts heterogeneity: "Single" vision for "heterogeneous" environment
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13592
PMID:38158643
|
综述 | 综述单细胞RNA测序技术在揭示癌症相关成纤维细胞异质性中的应用 | 从单细胞RNA测序视角系统综述癌症相关成纤维细胞异质性，并探讨多模态单细胞平台整合策略 | 未提供具体实验验证或定量分析结果 | 探讨单细胞RNA测序在理解癌症相关成纤维细胞异质性中的应用及临床转化潜力 | 癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-03 |
Spatial Biology of Breast Cancer
2024-05-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041335
PMID:38110242
|
综述 | 该文章综述了空间生物学方法（包括空间转录组学和蛋白质组学）如何促进对乳腺癌进展和治疗的理解，并探讨了新兴多重成像技术的影响 | 强调了空间生物学方法在揭示乳腺癌空间关系中的创新性应用，以及多重成像技术如何推动该领域未来发展 | 未明确提及具体局限性，但作为综述，可能依赖于现有研究并缺乏新实验数据 | 总结空间生物学方法在乳腺癌研究中的贡献，并展望未来研究方向 | 乳腺癌的空间生物学 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，蛋白质组学 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-04-25 |
Periportal macrophages protect against commensal-driven liver inflammation
2024-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07372-6
PMID:38658756
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研究论文 | 揭示了门静脉周围区域富含一种表达Marco的免疫抑制性巨噬细胞，该细胞由肠道微生物群诱导，通过白细胞介素-10和Marco受体抑制炎症，其功能缺失会促进肝脏炎性疾病 | 首次通过活体成像和区域特异性单细胞转录组学发现门静脉周围区域存在免疫抑制性巨噬细胞，并鉴定出Odoribacteraceae菌科及其后生元isoallolithocholic acid诱导该细胞亚群，阐明了共生菌与肝脏免疫稳态之间的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外验证，缺乏直接的人类临床数据支持 | 探究肝脏门静脉周围与中央静脉周围区域免疫系统的功能差异及其在炎症调控中的作用机制 | 肝脏门静脉周围区域富含Marco的免疫抑制性巨噬细胞及其与肠道微生物群的互作关系 | 免疫学 | 原发性硬化性胆管炎、非酒精性脂肪性肝炎 | 活体成像、区域特异性单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及体外培养细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析平台 |
| 6 | 2026-04-22 |
Integrating spatial transcriptomics and bulk RNA-seq: predicting gene expression with enhanced resolution through graph attention networks
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae316
PMID:38960406
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为STGAT的新方法，利用图注意力网络整合空间转录组学和bulk RNA-seq数据，以预测乳腺癌组织中的基因表达和肿瘤/非肿瘤区域 | STGAT首次结合图注意力网络来捕捉spots之间的空间依赖性，从WSI和bulk RNA-seq数据中估计spot级基因表达，并在TCGA数据中验证了其在乳腺癌亚型和分期预测中的优越性 | 方法依赖于有限的乳腺癌空间转录组学数据进行训练，可能在其他癌症类型或更大规模数据中的泛化能力未充分验证 | 开发一种从WSI和bulk RNA-seq数据预测spot级基因表达的方法，以弥补大规模癌症研究中空间转录组学数据不足的缺口 | 乳腺癌组织样本，包括空间转录组学数据集和TCGA项目中的bulk RNA-seq与WSI数据 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，bulk RNA-seq，全切片成像 | GAT | 图像，基因表达数据 | 两个乳腺癌空间转录组学数据集和TCGA乳腺癌数据集 | NA | 空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-04-14 |
Single-Nucleus RNA-Seq Reveals Spermatogonial Stem Cell Developmental Pattern in Shaziling Pigs
2024-05-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060607
PMID:38927011
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了沙子岭猪睾丸中精原干细胞（SSCs）的发育模式 | 首次在沙子岭猪中应用单细胞RNA测序技术构建睾丸组织细胞发育图谱，并识别了调控SSCs自我更新和维持的潜在标记基因及信号通路 | 研究样本仅来自沙子岭猪，可能限制了结果的普适性；且未进行功能验证实验 | 探究沙子岭猪睾丸发育，特别是精原干细胞的发育模式 | 沙子岭猪睾丸组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 来自9只沙子岭猪睾丸的82,027个单细胞，覆盖三个关键出生后发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-04-09 |
A human neural crest model reveals the developmental impact of neuroblastoma-associated chromosomal aberrations
2024-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47945-7
PMID:38702304
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研究论文 | 本研究利用人类胚胎干细胞分化模型，结合单细胞转录组和表观组分析，探索了神经母细胞瘤中染色体17q/1q增益对神经嵴细胞发育的影响 | 首次建立了人类神经嵴模型，系统评估了神经母细胞瘤相关染色体畸变在发育过程中的作用，揭示了拷贝数变异与MYCN过表达协同促进肿瘤发生的机制 | 模型基于体外分化系统，可能无法完全模拟体内肿瘤发生的复杂微环境 | 探究胚胎肿瘤中拷贝数变异如何影响发育过程并驱动肿瘤发生 | 人类胚胎干细胞分化的神经嵴细胞及其交感肾上腺衍生物 | 发育生物学与肿瘤学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序，单细胞表观组分析 | 人类胚胎干细胞分化模型 | 单细胞转录组数据，表观组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞表观组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-04-07 |
STAT3 protects hematopoietic stem cells by preventing activation of a deleterious autocrine type-I interferon response
2024-05, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02218-6
PMID:38467768
|
研究论文 | 本研究通过混合骨髓嵌合小鼠模型，揭示了STAT3通过抑制有害的自分泌I型干扰素反应来保护造血干细胞功能 | 开发了可避免系统性炎症的混合骨髓嵌合小鼠模型，首次证明STAT3通过抑制自分泌I型干扰素反应维持造血干细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类造血干细胞中验证；嵌合模型可能无法完全模拟生理状态 | 探究STAT3在造血干细胞中的内在调控机制及其对干细胞功能的影响 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs），特别是Lin⁻c-kit⁺Sca-1⁺骨髓细胞 | 血液学与干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序，骨髓移植实验，免疫荧光染色 | 混合骨髓嵌合小鼠模型 | 单细胞转录组数据，表型数据 | 未明确具体样本数量，使用嵌合小鼠模型进行研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-04-04 |
Single-cell RNA sequencing of mutant whole mouse embryos: from the epiblast to the end of gastrulation
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591777
PMID:38746120
|
研究论文 | 本文设计了一种稳健的流程，用于对E6.5至E8阶段的小鼠胚胎进行单细胞和细胞核分析，以研究突变胚胎在胚胎发育过程中的细胞景观 | 开发了一种针对突变小鼠胚胎的单细胞RNA测序方法，克服了基因分型、定时妊娠和细胞数量少等技术限制，提高了在胚胎发育阶段进行单细胞分析的可行性 | 方法主要针对小鼠胚胎，可能不直接适用于其他物种或更晚期的发育阶段，且依赖于优化的育种和基因分型流程 | 研究突变如何影响胚胎发育过程中的细胞景观和基因表达动态 | 小鼠胚胎，特别是从E6.5到E8阶段的突变胚胎 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 微滴式单细胞分析 |
| 11 | 2026-04-03 |
A novel sorting method for the enrichment of early human spermatocytes from clinical biopsies
2024-05, F&S science
DOI:10.1016/j.xfss.2024.02.002
PMID:38369016
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用荧光激活细胞分选技术富集人类睾丸活检样本中早期精母细胞的新方法 | 首次通过生物信息学分析鉴定出早期精母细胞特异性表面标志物TSP50，并成功应用于临床活检样本的细胞分选富集 | 研究样本量较小（仅3名参与者），且仅限于梗阻性无精子症患者，结果可能需要更大样本验证 | 开发从人类睾丸活检样本中富集早期精母细胞的方法，以促进减数分裂起始阶段生殖细胞的靶向研究 | 人类睾丸活检组织中的早期精母细胞 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫染色图像 | 3名30-40岁梗阻性无精子症男性的睾丸活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-04-01 |
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-05-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66850
PMID:38767376
|
研究论文 | 本文描述了一种处理新鲜骨组织样本以生成高质量空间转录组数据的方法，并提供了针对先前石蜡包埋样本的详细指南 | 开发了一种针对硬组织（如骨）的空间转录组学方法，解决了在切片处理过程中保持RNA质量和组织形态的挑战 | NA | 开发适用于骨组织的空间转录组学方法，以分析细胞基因表达与组织学背景的关系 | 骨组织样本，包括新鲜样本和先前石蜡包埋的样本，如骨肉瘤原发肿瘤和肺转移样本 | 空间转录组学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
A New Immunological Index for the Elderly: High Proportion of Multiple TCR T Cells Based on scRNA-Seq
2024-05-07, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0509-1
PMID:38722790
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2026-03-25 |
Single-Cell Gene-Regulatory Networks of Advanced Symptomatic Atherosclerosis
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323184
PMID:38639096
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了晚期症状性动脉粥样硬化中的关键平滑肌细胞和巨噬细胞亚型，并整合基因调控网络分析，揭示了GRN39在疾病进展中的核心作用 | 首次将最基因丰富的单细胞亚簇与冠状动脉疾病的基因调控网络框架整合，识别并独立验证了GRN39在促进晚期症状性动脉粥样硬化中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能无法完全反映人类疾病的复杂性；单细胞测序技术（SmartSeq2）的基因覆盖范围（约8000基因/细胞）相对有限 | 探究动脉粥样硬化进展中血管细胞类型转化的单细胞基因表达模式及其临床和病理生理学相关性 | Ldlr-/-Apob100/100小鼠（具有人类样血浆脂蛋白）以及人类无症状和症状性颈动脉斑块中的单细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（SmartSeq2），基因调控网络分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 16,588个单细胞（来自小鼠和人类），600名冠状动脉疾病患者（STARNET研究） | NA | 单细胞RNA-seq | SmartSeq2 | SmartSeq2（约8000基因/细胞） |
| 15 | 2026-03-21 |
YBX1 promotes stemness and cisplatin insensitivity in intrahepatic cholangiocarcinoma via the AKT/β-catenin axis
2024-05, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3689
PMID:38676365
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研究论文 | 本研究探讨了YBX1在肝内胆管癌中通过AKT/β-catenin轴促进肿瘤干细胞性和顺铂不敏感性的作用 | 揭示了YBX1作为调控肝内胆管癌干细胞性和化疗耐药的关键分子，并阐明了其通过AKT/β-catenin轴的作用机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，临床样本验证有限，且未涉及其他化疗药物的敏感性 | 探究YBX1在肝内胆管癌干细胞性和顺铂敏感性中的调控作用及分子机制 | 肝内胆管癌细胞系、临床组织样本及小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 肝内胆管癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 集落形成实验, 球体形成实验, 体内肿瘤生长实验 | NA | RNA-seq数据, 临床数据, 实验数据 | 三个bulk和单细胞RNA-seq数据集, 临床样本, 细胞系及小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of neutrophils in non-small cell lung cancer
2024-05, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3690
PMID:38735760
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了非小细胞肺癌中中性粒细胞的异质性 | 识别了四种主要的肿瘤相关中性粒细胞亚群，包括一个促进肿瘤形成的终末分化状态，并揭示了其与巨噬细胞的密切关联及糖酵解活性增强 | 研究基于公共数据库数据，可能受样本来源和数量的限制，未进行实验验证 | 探究非小细胞肺癌中中性粒细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 肿瘤相关中性粒细胞和来自血液的多形核中性粒细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-03-21 |
Comprehensive profiling of endocrine metabolism identifies a novel signature with robust predictive value in ovarian cancer
2024-05, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3686
PMID:38689382
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研究论文 | 本研究通过分析卵巢癌的单细胞RNA测序数据，基于分泌信号通路构建了一个四基因签名，用于预测卵巢癌的预后和免疫治疗反应 | 首次从分泌信号通路角度构建卵巢癌预后模型，并验证其在免疫治疗预测中的价值 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏独立的前瞻性队列验证 | 开发卵巢癌的预后预测模型并评估其与免疫治疗反应的关系 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 单核苷酸变异主成分分析 | 随机森林 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-03-15 |
Tracking in situ checkpoint inhibitor-bound target T cells in patients with checkpoint-induced colitis
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.010
PMID:38744246
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研究论文 | 本研究利用多模态单细胞和亚细胞空间转录组学追踪检查点抑制剂（CPI）结合T细胞在肠道组织中的分布，以揭示CPI诱导结肠炎的机制 | 首次在患者肠道组织中应用多模态单细胞和亚细胞空间转录组学技术追踪CPI结合T细胞，并识别出与炎症相关的特定微域和细胞间信号通路 | 研究样本可能有限，且机制分析主要基于观察性数据，需要进一步实验验证 | 探究检查点抑制剂诱导结肠炎的免疫机制，识别关键细胞类型和空间分布特征 | 接受检查点抑制剂治疗并出现结肠炎的患者的肠道组织样本 | 数字病理学 | 结肠炎 | 多模态单细胞和亚细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-03-06 |
6-Formylindolo[3,2-b]carbazole, a potent ligand for the aryl hydrocarbon receptor, attenuates concanavalin-induced hepatitis by limiting T-cell activation and infiltration of proinflammatory CD11b+ Kupffer cells
2024-05-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae018
PMID:38366630
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研究论文 | 本研究探讨了强效芳烃受体激动剂FICZ在刀豆蛋白A诱导的小鼠自身免疫性肝炎模型中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序技术，系统揭示了FICZ通过限制CD3+ T细胞活化和CD11b+ Kupffer细胞浸润减轻肝炎的分子机制 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人体中验证；机制研究主要聚焦于免疫细胞亚群，对肝实质细胞的直接作用未充分探讨 | 阐明芳烃受体激活在自身免疫性肝炎中的保护作用机制 | 刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-03-06 |
Human IL-6 fosters long-term engraftment of patient-derived disease-driving myeloma cells in immunodeficient mice
2024-May-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177300
PMID:38713510
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研究论文 | 本文介绍了一种基于人IL-6转基因NSG小鼠的异种移植模型，用于支持患者来源的多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的长期植入和研究 | 开发了人IL-6转基因NSG小鼠模型，首次可靠地支持恶性及癌前人类浆细胞的植入，包括从多种浆细胞疾病患者中获取的细胞 | 模型依赖于免疫缺陷小鼠，可能无法完全模拟人类免疫系统与骨髓瘤的相互作用，且样本来源和规模可能有限 | 建立一种有效的患者来源异种移植模型，用于多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的研究和临床前药物开发 | 患者来源的恶性及癌前人类浆细胞，包括来自未确定意义的单克隆丙种球蛋白病、复发前后多发性骨髓瘤、浆细胞白血病和淀粉样轻链淀粉样变性患者的细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 异种移植模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |