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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-24 |
Nfe2l3 promotes neuroprotection and long-distance axon regeneration after injury in vivo
2024-05, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114741
PMID:38395216
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research paper | 本文研究了Nfe2l3基因在体内中枢神经系统损伤后促进神经保护和长距离轴突再生的功能 | 首次发现Nfe2l3在中枢神经系统损伤后具有促进神经保护和长距离轴突再生的作用,并揭示了其与已建立的神经保护和轴突再生机制的关联 | 未明确提及限制,但可能包括体内实验的样本量较小、基因网络分析依赖生物信息学预测需进一步验证 | 探究Nfe2l3在中枢神经系统损伤后对神经保护和轴突再生的调节作用 | 小鼠皮质和视网膜神经节细胞 | NA | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | scRNA-seq数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2 | 2026-07-07 |
FCRL3 expression is upregulated and closely correlates with TIGIT expression in regulatory T cells of patients with systemic lupus erythematosus
2024-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350739
PMID:38461541
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术,发现系统性红斑狼疮患者调节性T细胞中FCRL3表达上调且与TIGIT表达正相关 | 首次揭示FCRL3与TIGIT在系统性红斑狼疮调节性T细胞中的共表达关系 | 未深入探讨FCRL3和TIGIT共表达的功能机制及临床意义 | 探究系统性红斑狼疮中FCRL3在调节性T细胞的表达及其与TIGIT的关联 | 系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-06-30 |
Characterizing enteric neurons in dopamine transporter (DAT)-Cre reporter mice reveals dopaminergic subtypes with dual-transmitter content
2024-05, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16307
PMID:38487941
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研究论文 | 利用DAT-Cre报告小鼠对肠神经元进行特征描述,揭示了具有双递质含量的多巴胺能亚型 | 首次利用DAT-Cre报告小鼠系全面表征肠道多巴胺神经元,结合免疫荧光、单细胞转录组学和原位杂交技术,发现了ENS特有的新型多巴胺神经元亚群(ChAT/DAT-tdTomato阳性,表达Grp、Calcb和Sst) | 需要进一步研究以明确这些多巴胺能肠道神经元的功能特征及其在疾病中的作用 | 全面表征肠道多巴胺神经元的特征、亚型及其在疾病中的意义 | DAT-Cre报告小鼠的肠道多巴胺神经元 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光, 单细胞转录组学, 原位杂交 | NA | 图像, 文本 | DAT-Cre报告小鼠(具体样本量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-06-20 |
Targeting pathogenic fibroblast-like synoviocyte subsets in rheumatoid arthritis
2024-05-23, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03343-4
PMID:38783357
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综述 | 本文综述了类风湿关节炎中致病性成纤维样滑膜细胞亚群及其作为治疗靶点的潜力 | 系统总结了近年通过单细胞RNA测序等高通量技术鉴定的RA中致病性FLS亚群及其特征,并探讨了靶向这些亚群的新策略 | 目前尚无FLS特异性靶向疗法应用于RA临床管理,且直接靶向通用成纤维细胞标志物可能引起伤口愈合减慢或纤维化等副作用 | 探讨RA中致病性FLS亚群的特征及其分化机制,为开发新型FLS靶向策略提供见解 | 类风湿关节炎患者发炎滑膜中的成纤维样滑膜细胞致病性亚群 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 5 | 2026-06-20 |
Identification and verification of a novel signature that combines cuproptosis-related genes with ferroptosis-related genes in osteoarthritis using bioinformatics analysis and experimental validation
2024-05-13, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03328-3
PMID:38741149
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证,构建了结合铜凋亡相关基因与铁死亡相关基因的新型特征基因,用于探索骨关节炎的发病机制 | 首次将铜凋亡相关基因与铁死亡相关基因结合构建骨关节炎的新型特征基因签名,并整合单细胞RNA-seq数据分析细胞分布 | 未提供 | 探索骨关节炎的发病机制并辅助其治疗 | 骨关节炎 | 机器学习 | 骨关节炎 | 生物信息学分析, 单细胞RNA-seq | 机器学习方法 | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 | GSE82107数据集 | 未提供 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 未提供 | 未提供 |
| 6 | 2026-06-20 |
Integrative multi-omics profiling in human decedents receiving pig heart xenografts
2024-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02972-1
PMID:38760586
|
研究论文 | 通过多组学分析,研究了接受猪心脏异种移植的人类患者的分子反应 | 首次在人类接受猪心脏异种移植后,通过多组学(转录组、脂质组、蛋白质组和代谢组)分析,揭示了早期分子和免疫反应的差异 | 仅涉及两例患者,样本量小,且观察时间短,难以推广至更广泛人群 | 深入了解异种移植后的分子景观,特别是早期免疫和代谢反应 | 接受10基因编辑猪心脏异种移植的两名人类患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 脂质组学, 蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 血液样本, 组织样本 | 2名人类患者(1男1女),每6小时采集血液样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 脂质组学, 蛋白质组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-06-20 |
SOCS3 regulates pathological retinal angiogenesis through modulating SPP1 expression in microglia and macrophages
2024-05-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.025
PMID:38504518
|
研究论文 | 本研究揭示了SOCS3通过调节微胶质细胞和巨噬细胞中SPP1的表达来调控病理性视网膜血管生成 | 首次发现SOCS3/STAT3/SPP1轴在病理性视网膜血管生成中的关键调控作用,并鉴定出表达Spp1的微胶质细胞和巨噬细胞亚群 | 未提供具体局限性信息 | 探究髓系细胞中SOCS3缺失对眼部新生血管形成过程中微胶质细胞和巨噬细胞积累的影响及其分子机制 | 小鼠模型中的微胶质细胞和巨噬细胞 | 机器学习和数字病理学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠血管生成模型中的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-06-20 |
Envelope protein-specific B cell receptors direct lentiviral vector tropism in vivo
2024-05-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.002
PMID:38449314
|
研究论文 | 研究发现慢病毒载体经不同假型包膜蛋白修饰后,通过B细胞受体(BCR)介导的方式特异性地转导不同的脾脏B细胞亚群 | 首次揭示假型慢病毒载体可通过与包膜蛋白特异性结合的B细胞受体进入B细胞,实现亚群选择性的基因递送,并激活转导B细胞的增殖与分化 | NA | 探究慢病毒载体经系统给药后脾脏B细胞转导的机制及不同假型对B细胞亚群的选择性 | 慢病毒载体、脾脏B细胞、B细胞受体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-06-19 |
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-05-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.04.006
PMID:38754367
|
研究论文 | 提出Polaris分析流程,通过弱监督深度学习实现基于图像的空间转录组学中单分子斑点的精确检测 | 结合深度学习模型进行细胞分割和斑点检测,并利用概率基因解码器准确量化单细胞基因表达,提供统一的现成解决方案 | 未明确提及但可能依赖于训练数据的质量和多样性,以及在不同实验条件下的泛化能力 | 开发一个准确、自动化的分析流程,用于基于图像的空间转录组学数据,减少手动调整的复杂性 | 基于图像的空间转录组学数据,包括MERFISH、seqFISH和ISS实验 | 计算机视觉, 深度学习 | 不适用 | MERFISH, seqFISH, 原位RNA测序 | 深度学习(弱监督学习) | 图像 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 10 | 2026-06-19 |
Reconstructing developmental trajectories using latent dynamical systems and time-resolved transcriptomics
2024-05-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.04.004
PMID:38754365
|
研究论文 | 提出一种利用潜伏动力系统和时间分辨转录组学重建发育轨迹的框架,包括优化的代谢标记方法sci-FATE2和计算模型VelvetVAE及VelvetSDE | 首次结合代谢标记优化方法sci-FATE2与两阶段动力系统框架(VelvetVAE和VelvetSDE),实现从单细胞快照数据到动态生成模型的转变,超越现有工具的性能 | NA | 开发能够从单细胞转录组快照数据重建细胞命运决定动态轨迹的方法 | 分化为神经管身份的45,000个小鼠胚胎干细胞 | 机器学习 | NA | 代谢标记,单细胞RNA-seq | 变分自编码器(VAE),神经随机微分方程(nSDE) | 单细胞转录组数据 | 45,000个胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,代谢标记 | sci-FATE2 | NA |
| 11 | 2026-06-18 |
Spatial analysis of recurrent glioblastoma reveals perivascular niche organization
2024-05-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179853
PMID:38805346
|
研究论文 | 通过空间分析揭示复发性胶质母细胞瘤的血管周围微环境组织特征 | 同时结合成像技术、无标记反射成像和单细胞空间转录组学,在同一切片上分析缺氧、血管生成、炎症微环境、细胞外基质组织、TERT启动子突变状态及致癌扩增,首次发现ECM纹理可预测单细胞遗传特征,并揭示复发性GBM中血管周围微环境的结构化组织 | NA | 探究遗传异质性与肿瘤微环境之间的相互作用,特别是在原发和复发性胶质母细胞瘤中的空间组织对肿瘤演化的影响 | 配对的原发和复发性胶质母细胞瘤存档肿瘤组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 成像技术、无标记反射成像、单细胞空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 配对的原发和复发性肿瘤组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 单细胞空间转录组学 |
| 12 | 2026-06-18 |
Coordinated immune dysregulation in juvenile dermatomyositis revealed by single-cell genomics
2024-05-14, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176963
PMID:38743491
|
研究论文 | 通过单细胞基因组学揭示青少年皮肌炎中的协调性免疫失调 | 首次利用单细胞转录组学结合表面蛋白表达,系统揭示JDM不同疾病活动阶段的免疫细胞状态变化,并发现B细胞向未成熟幼稚状态的偏移以及Th2介导的炎症持续存在 | 未提及具体局限 | 解析青少年皮肌炎中免疫系统失调的细胞状态及机制 | 青少年皮肌炎患者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 青少年皮肌炎 | 单细胞转录组学、表面蛋白表达分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 不同疾病活动阶段的JDM患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 10x Genomics平台 |
| 13 | 2026-06-18 |
Selective CAR T cell-mediated B cell depletion suppresses IFN signature in SLE
2024-05-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179433
PMID:38722688
|
研究论文 | 应用单细胞RNA测序和T/B细胞库分析,深入解析CD19 CAR T细胞介导的B细胞清除对系统性红斑狼疮患者免疫信号通路的分子变化 | 首次通过结合单细胞RNA-Seq和T/B细胞库分析,揭示了B细胞清除后单核细胞和T细胞亚群中I型IFN信号通路的显著下调,证实了B细胞反应与SLE中IFN信号升高的因果关系 | 未在摘要中明确说明 | 阐明CD19 CAR T细胞介导的B细胞清除后SLE患者免疫信号通路的分子变化,以及B细胞反应与I型IFN信号升高之间的因果关系 | 系统性红斑狼疮患者 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA-Seq、T/B细胞库分析 | NA | 基因表达数据、免疫细胞库数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-18 |
Single-cell profiling transcriptomic reveals cellular heterogeneity and cellular crosstalk in choroidal neovascularization model
2024-05, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109877
PMID:38537669
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示脉络膜新生血管模型中视网膜色素上皮/脉络膜复合体的细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次利用单细胞测序全面解析视网膜色素上皮/脉络膜复合体的细胞异质性,鉴定出与脉络膜新生血管紧密相关的内皮细胞簇、参与nAMD发病的五种成纤维细胞簇和三种巨噬细胞簇,并构建了细胞间通讯网络 | 未提及该研究的局限 | 探索脉络膜新生血管模型中视网膜色素上皮/脉络膜复合体的细胞多样性和细胞间相互作用 | 脉络膜新生血管模型中的视网膜色素上皮/脉络膜复合体 | 生物信息学 | 老年性黄斑变性 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从脉络膜新生血管模型获取的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-17 |
Cross-species single-cell analysis uncovers the immunopathological mechanisms associated with IgA nephropathy progression
2024-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173651
PMID:38716725
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研究论文 | 通过跨物种单细胞分析揭示了IgA肾病进展相关的免疫病理机制 | 首次在人类IgAN小鼠和大鼠模型中进行跨物种单细胞RNA测序,识别出IgAN系膜细胞与巨噬细胞之间的特异性相互作用轴(如CXCL12/CXCR4、CSF1/IL-34/CSF1受体),并通过功能实验验证了CXCL12/CXCR4通路的阻断可减轻肾损伤 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、跨物种模型的人类疾病模拟不完全等 | 探究IgA肾病进展的免疫病理机制 | 人类IgAN患者及小鼠和大鼠IgAN模型 | 单细胞组学 | IgA肾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 21个进展性和28个非进展性IgAN样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 16 | 2026-06-17 |
Liver sinusoidal endothelial cells contribute to portal hypertension through collagen type IV-driven sinusoidal remodeling
2024-05-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174775
PMID:38713515
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研究论文 | 该论文研究了肝窦内皮细胞通过IV型胶原蛋白驱动的肝窦重塑导致门静脉高压的机制 | 首次发现肝窦内皮细胞是纤维化肝脏中IV型胶原蛋白上调的主要来源,并揭示了TNF-α/NF-κB依赖的表观遗传调控机制,以及通过CRISPRi-dCas9-KRAB进行表观基因组编辑可沉默COL4基因表达 | 未提及具体局限性,但研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步在人体中验证 | 探究IV型胶原蛋白在肝纤维化和门静脉高压中调控肝窦重塑的作用及机制 | 肝窦内皮细胞和IV型胶原蛋白 | 数字病理学 | 肝病、门静脉高压 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、CRISPRi-dCas9-KRAB | NA | 文本、图像 | 人类肝硬化肝样本及小鼠纤维化肝模型 | Illumina | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 17 | 2026-06-17 |
Human IL-6 fosters long-term engraftment of patient-derived disease-driving myeloma cells in immunodeficient mice
2024-05-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177300
PMID:38713510
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研究论文 | 使用人IL-6转基因NSG小鼠建立多发性骨髓瘤患者来源异种移植模型,并验证其在临床前药物开发中的应用 | 首次证明白消安预处理的人IL-6转基因NSG小鼠能可靠支持恶性及癌前浆细胞的长期植入,涵盖从意义未明的单克隆丙种球蛋白病到浆细胞白血病和轻链淀粉样变性等多种疾病阶段 | 未提及具体局限性 | 建立有效且广泛可用的多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的患者来源异种移植模型 | 多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病患者的恶性及癌前浆细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病患者的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 18 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-05, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IL-7抗癌免疫疗法介导的髓系细胞和T细胞共刺激作用 | 首次发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多效性表达,并证明重组IL-7疗法通过激活T细胞和促炎性髓系细胞诱导抗肿瘤免疫 | 检查点抑制剂的靶点缺乏表达和免疫抑制细胞的持续存在限制了其普遍疗效 | 探索IL-7疗法作为替代方法共刺激T细胞和免疫微环境以克服检查点抑制剂的局限性 | 多种人类癌症和鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种人类癌症样本和鼠肿瘤移植模型样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-06-02 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-05-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序表征小鼠肾淋巴内皮细胞在静息和顺铂损伤肾中的反应,首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的分子通路 | 首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的新分子通路,为AKI治疗提供潜在靶点 | 仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证;仅分析了顺铂损伤后72小时时间点,未涵盖AKI全病程 | 探究肾淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的反应及其免疫调节作用 | 小鼠肾淋巴内皮细胞(顺铂损伤和缺血再灌注损伤模型)及体外培养人淋巴内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾脏样本(顺铂损伤组和对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-31 |
Advancing skeletal health and disease research with single-cell RNA sequencing
2024-05-30, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00538-3
PMID:38816888
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综述 | 全面介绍了单细胞RNA测序技术在骨骼健康与疾病研究中的应用,包括细胞获取方法、技术概述和生物信息学分析流程 | 提出了一种从骨骼组织中获取高质量单细胞的简化方法,并系统总结了scRNA-seq在脊柱、关节、骨、肌肉和肌腱疾病中的最新研究进展 | 高度矿化的骨骼组织在单细胞水平上研究机制仍面临技术挑战 | 推动对骨骼疾病细胞和分子水平病理过程的理解,发现新的治疗靶点 | 骨骼组织中的细胞,包括脊柱、关节、骨、肌肉和肌腱相关细胞 | 单细胞转录组学 | 退行性椎间盘疾病, 骨关节炎, 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |