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当前共找到 491 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-07 |
Single-cell insights: pioneering an integrated atlas of chromatin accessibility and transcriptomic landscapes in diabetic cardiomyopathy
2024-04-25, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02233-y
PMID:38664790
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据，揭示了糖尿病心肌病中染色质可及性和转录组景观的细胞状态和分子变化 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据构建糖尿病心肌病的综合图谱，识别了关键的转录因子和细胞亚群特异性变化 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明糖尿病心肌病的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 野生型和糖尿病心肌病小鼠的心脏组织 | 单细胞多组学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光染色 | Seurat, Signac, chromVAR, Cicero | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | WT和DCM小鼠心脏样本 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Multiome | 10x Multiome单细胞RNA和ATAC联合测序文库 |
| 162 | 2025-10-07 |
Mechanisms of imbalanced testicular homeostasis in infancy due to aberrant histone acetylation in undifferentiated spermatogonia under different concentrations of Di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) exposure
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123742
PMID:38460586
|
研究论文 | 本研究探讨了婴儿期不同浓度DEHP暴露通过组蛋白乙酰化异常导致睾丸稳态失衡的分子机制 | 首次揭示了婴儿期DEHP暴露通过线粒体功能障碍和组蛋白乙酰化异常导致未分化精原细胞命运差异的机制，并发现其对睾丸稳态的长期影响持续至成年期 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；DEHP暴露剂量和时程可能无法完全模拟真实环境暴露情况 | 阐明婴儿期DEHP暴露对睾丸发育和生殖系统功能的毒性机制 | 新生小鼠睾丸组织中的未分化精原细胞、支持细胞和间质细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第5天小鼠，分别接受40μg/kg和80μg/kg DEHP暴露10天 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2024-12-31 |
Defining predictors of responsiveness to advanced therapies in Crohn's disease and ulcerative colitis: protocol for the IBD-RESPONSE and nested CD-metaRESPONSE prospective, multicentre, observational cohort study in precision medicine
2024-04-17, BMJ open
IF:2.4Q1
DOI:10.1136/bmjopen-2023-073639
PMID:38631839
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研究论文 | 本文介绍了一项前瞻性、多中心、观察性队列研究，旨在通过多组学数据创建预测工具，以预测克罗恩病和溃疡性结肠炎患者对先进疗法的反应 | 该研究首次整合了肠道微生物组、代谢组、单细胞转录组、人类基因组、饮食和临床数据，以创建预测模型，并计划进行跨治疗比较和独立复制队列研究 | 研究的主要局限性在于其观察性设计，可能无法完全控制混杂因素，且样本量相对较小（1325名参与者） | 研究目标是识别和验证预测模型，以预测克罗恩病和溃疡性结肠炎患者对先进疗法的反应 | 研究对象为开始接受先进疗法的克罗恩病和溃疡性结肠炎患者 | 精准医学 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎 | 多组学数据分析 | 预测模型 | 多组学数据（肠道微生物组、代谢组、单细胞转录组、人类基因组、饮食和临床数据） | 1325名参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-12-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular and molecular heterogeneity of treatment-naïve primary osteosarcoma in dogs
2024-04-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06182-w
PMID:38658617
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了未经治疗的犬原发性骨肉瘤的细胞和分子异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了犬原发性骨肉瘤的肿瘤微环境中的细胞和分子组成，并发现了41种转录组学上不同的细胞类型，包括滤泡辅助T细胞、成熟的调节性树突状细胞和8种肿瘤相关巨噬细胞群体 | 研究仅限于6只未经治疗的犬，样本量较小，可能无法完全代表所有犬骨肉瘤的情况 | 揭示犬原发性骨肉瘤的肿瘤微环境中的细胞和分子异质性，为转化免疫肿瘤学研究提供基础 | 6只未经治疗的犬原发性骨肉瘤 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 35,310个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-12-17 |
Single-cell transcriptomics unveil profiles and interplay of immune subsets in rare autoimmune childhood Sjögren's disease
2024-04-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06124-6
PMID:38641668
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了儿童罕见自身免疫性疾病Sjögren病的免疫亚群特征及其相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出儿童Sjögren病中的关键免疫细胞亚群，包括IFN基因富集的单核细胞、CD4 T效应记忆细胞和XCL1 NK细胞，并发现这些细胞在伴有复发性腮腺炎的儿童患者中尤为显著 | 研究仅限于儿童Sjögren病的外周免疫细胞，未涉及其他组织或器官的免疫细胞 | 揭示儿童Sjögren病的免疫细胞亚群及其相互作用，为精准医学奠定基础 | 儿童Sjögren病患者的免疫细胞亚群及其相互作用 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-12-17 |
SPADE: spatial deconvolution for domain specific cell-type estimation
2024-04-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06172-y
PMID:38632414
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研究论文 | 本文提出了一种名为SPADE的空间反卷积方法，用于在特定领域中估计细胞类型的组成 | SPADE通过整合空间模式到细胞类型组成的分析中，显著提升了对空间基因表达模式的理解 | NA | 理解不同细胞类型在其空间背景下的基因表达 | 细胞类型的组成及其在不同位置的比例 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、组织学数据 | 空间反卷积 | 基因表达数据 | 合成数据和真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-12-15 |
Vaccine-elicited IL-1R signaling results in Th17 TRM-mediated immunity
2024-04-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06138-0
PMID:38594380
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研究论文 | 本文研究了疫苗引发的IL-1R信号传导如何导致Th17 TRM介导的免疫反应 | 首次揭示了IL-1α在疫苗介导的肺部Th17 TRM细胞生成中的关键作用，并证明了IL-1α可以作为分子佐剂独立于LTA1生成肺部Th17 TRM细胞 | 研究主要集中在IL-1α的作用，未探讨其他IL-1家族成员在Th17 TRM细胞生成中的潜在作用 | 探讨疫苗引发的IL-1R信号传导在肺部Th17 TRM细胞生成中的作用 | 疫苗引发的IL-1R信号传导、肺部Th17 TRM细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-12-14 |
A multiplexed, single-cell sequencing screen identifies compounds that increase neurogenic reprogramming of murine Muller glia
2024-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559569
PMID:37808650
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研究论文 | 本文通过单细胞测序筛选出能够促进小鼠Müller胶质细胞神经再生的化合物 | 首次使用sci-Plex技术进行高通量单细胞分子分析，筛选出促进神经再生的化合物 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 提高哺乳动物中Müller胶质细胞的神经再生能力，以恢复视网膜疾病患者的视力 | 小鼠Müller胶质细胞的神经再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 92种化合物 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-12-14 |
q-Diffusion leverages the full dimensionality of gene coexpression in single-cell transcriptomics
2024-04-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06104-w
PMID:38565955
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为q-diffusion的框架，用于捕捉单细胞转录组数据中基因共表达的完整维度 | q-diffusion框架在捕捉基因共表达结构方面优于现有的分析工具，能够提供更丰富的细胞生物学理解 | NA | 探索单细胞RNA测序数据的完整维度，以更深入地理解细胞生物学 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达结构 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及CALGB/SWOG 80405临床试验、体外PBMC数据集和人类皮质组织的空间单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-12-12 |
The effect of data transformation on low-dimensional integration of single-cell RNA-seq
2024-Apr-30, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05788-5
PMID:38689234
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研究论文 | 研究了数据转换方法对单细胞RNA测序数据低维整合的影响 | 比较了16种数据转换方法对单细胞聚类分析和批次整合分析的影响，并探讨了数据转换对深度特征编码分析的影响 | 数据转换方法的性能在不同数据集之间差异较大，每个数据集的最优方法不同 | 研究数据转换方法对单细胞RNA测序数据低维整合的影响 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器模型、原型网络 | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-12-12 |
NKX2-2 based nuclei sorting on frozen human archival pancreas enables the enrichment of islet endocrine populations for single-nucleus RNA sequencing
2024-Apr-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10335-w
PMID:38689254
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研究论文 | 本文开发了一种基于NKX2-2抗体的单核RNA测序方法，用于从冷冻存档的人胰腺组织中富集胰岛内分泌细胞群体 | 创新性地使用NKX2-2抗体进行荧光激活的核排序，以富集胰腺内分泌细胞的核，并首次在冷冻存档的胰腺组织中进行单核RNA测序 | 研究仅限于胰腺内分泌细胞群体，未涵盖其他细胞类型 | 开发一种新的方法，利用冷冻存档的胰腺组织进行单核RNA测序，以富集胰岛内分泌细胞群体 | 人胰腺组织中的胰岛内分泌细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从冷冻存档的人胰腺组织中提取的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-12-12 |
Comparative analysis of 10X Chromium vs. BD Rhapsody whole transcriptome single-cell sequencing technologies in complex human tissues
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28358
PMID:38689972
|
研究论文 | 本文比较了10X Chromium和BD Rhapsody两种单细胞RNA测序技术在复杂人体组织中的应用 | 首次直接比较了两种商业化的高通量单细胞RNA测序技术在前列腺癌样本中的应用，揭示了平台间的差异 | 研究仅限于局部前列腺癌样本，未涵盖其他类型的癌症或组织 | 比较不同单细胞RNA测序技术在复杂人体组织中的表现，为选择合适的测序平台提供依据 | 局部前列腺癌患者的样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自接受根治性前列腺切除术的局部前列腺癌患者的配对样本 | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-12-10 |
Joint Bayesian estimation of cell dependence and gene associations in spatially resolved transcriptomic data
2024-04-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60002-z
PMID:38664448
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研究论文 | 本文提出了一种联合贝叶斯方法，用于同时估计空间转录组数据中的基因关联和细胞依赖性 | 本文的创新点在于提出了一种联合贝叶斯方法，能够同时估计基因和空间细胞的相关性，从而保留基因表达的依赖结构 | 本文的局限性在于仅通过模拟和真实数据集进行了方法的验证，未探讨其在其他类型数据上的适用性 | 本文的研究目的是开发一种新的方法，用于分析空间转录组数据中的基因关联和细胞依赖性 | 本文的研究对象是空间转录组数据中的基因表达和细胞空间位置 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | 多个真实空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-12-10 |
Glioblastoma-instructed microglia transition to heterogeneous phenotypic states with phagocytic and dendritic cell-like features in patient tumors and patient-derived orthotopic xenografts
2024-04-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01321-8
PMID:38566128
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研究论文 | 研究了胶质母细胞瘤（GBM）患者肿瘤和患者来源的同种异体移植瘤中，GBM诱导的微胶质细胞向具有吞噬和树突状细胞样特征的异质表型状态的转变 | 首次系统地描述了GBM患者肿瘤和PDOX中肿瘤微环境（TME）的单细胞和空间水平特征，揭示了GBM细胞与宿主细胞之间的相互作用及其在TME中的异质性 | 研究主要集中在GBM患者肿瘤和PDOX中的TME，未涉及其他类型的肿瘤或更广泛的免疫细胞群体 | 深入了解GBM生态系统及其在临床前模型中的再现，以提高临床试验的准确性和成功率 | GBM患者肿瘤和患者来源的同种异体移植瘤中的肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多色流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 不同肿瘤表型的GBM PDOX和患者肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-12-09 |
Shaoxia: a web-based interactive analysis platform for single cell RNA sequencing data
2024-Apr-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10322-1
PMID:38658838
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Shaoxia的基于网络的单细胞RNA测序数据交互分析平台 | Shaoxia平台通过高性能计算能力和用户友好的界面，使不具备编程专业知识的实验室研究人员也能进行单细胞RNA测序数据分析 | NA | 开发一个易于使用的软件，涵盖单细胞RNA测序数据分析的所有方面 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-12-09 |
Library size confounds biology in spatial transcriptomics data
2024-04-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03241-7
PMID:38637899
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组学数据中库大小对生物学解释的影响 | 首次揭示了库大小与组织结构之间的关联，并指出使用单细胞RNA测序的归一化方法会对空间域识别产生负面影响 | 仅限于空间转录组学数据，未涵盖其他类型的分子数据 | 研究空间转录组学数据中的库大小效应及其对分析的影响 | 空间转录组学数据及其分析方法 | 单细胞测序 | NA | RNA-seq | NA | 空间转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-12-09 |
The impact of package selection and versioning on single-cell RNA-seq analysis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588111
PMID:38617255
|
研究论文 | 本文详细研究了Seurat和Scanpy在单细胞RNA测序分析中的算法和方法差异 | 发现了Seurat和Scanpy在输出结果上存在显著差异，这种差异相当于在基准测试中减少5%的读取量或分析20%的细胞群体 | 本文未提及具体的解决方案或改进措施 | 探讨不同软件包和版本对单细胞RNA测序分析结果的影响 | Seurat和Scanpy软件包及其不同版本 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-12-02 |
Fibroblast expression of neurotransmitter receptor HTR2A associates with inflammation in rheumatoid arthritis joint
2024-Apr-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-024-01352-w
PMID:38662111
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研究论文 | 研究神经递质受体HTR2A在类风湿性关节炎（RA）中的表达及其与炎症的关系 | 首次探讨了HTR2A在RA中的表达及其与炎症的关系，并发现miRNAs在调节HTR2A表达中的作用 | 研究主要基于scRNA-seq数据和免疫组化验证，样本量有限，需要进一步的大规模验证 | 探讨神经递质受体HTR2A在RA中的表达及其与炎症的关系，寻找潜在的治疗策略 | 类风湿性关节炎（RA）和骨关节炎（OA）患者的滑膜组织和滑液中的细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化染色、qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫组化图像 | RA和OA患者的滑膜组织样本，以及RA患者滑液中的外泌体样本 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-11-27 |
To be or not to be - Decoding the Trabecular Meshwork Cell Identity
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.591346
PMID:38746421
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序比较人小梁网细胞培养与组织，探讨细胞身份和可翻译性 | 首次报道了通过单细胞RNA测序比较人小梁网细胞培养与组织的研究方法 | 研究结果从细胞培养到组织研究的翻译仍存在挑战 | 探讨小梁网细胞的身份及其在组织中的可翻译性 | 人小梁网细胞培养与组织 | NA | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 共14个初级人小梁网样本，包括4个青光眼患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-11-26 |
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA-sequencing
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.23.589797
PMID:38712294
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研究论文 | 本文介绍了一种用于视网膜单细胞RNA测序的样本多重化方法 | 提出了使用胆固醇修饰寡核苷酸进行样本多重化的方法，以提高单细胞RNA测序分析的精度 | NA | 研究视网膜神经节细胞的细胞类型分布和转录组变异 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |