本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-07 |
Single-Cell DNA Sequencing Reveals an Evolutionary Pattern of CHIP in Transplant Eligible Multiple Myeloma Patients
2024-04-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080657
PMID:38667272
|
研究论文 | 通过单细胞DNA测序揭示适合移植的多发性骨髓瘤患者中CHIP的进化模式 | 首次使用单细胞DNA测序技术研究多发性骨髓瘤患者自体干细胞移植前后CHIP的克隆进化动态 | 样本量较小(仅12例患者),仅检测了20个白血病相关基因 | 研究多发性骨髓瘤患者中克隆造血现象的进化模式及其与治疗反应的关系 | 多发性骨髓瘤患者的循环CD34+细胞 | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞DNA测序,高通量扩增子测序 | NA | 单细胞DNA测序数据 | 12例多发性骨髓瘤患者,其中4例有纵向样本 | Mission Bio | 单细胞DNA测序 | Tapestri | MissionBio Tapestri平台,包含20个白血病相关基因的靶向panel |
| 142 | 2025-10-07 |
Potential Roles of Specific Subclasses of Premotor Interneurons in Spinal Cord Function Recovery after Traumatic Spinal Cord Injury in Adults
2024-04-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080652
PMID:38667267
|
综述 | 回顾了成年创伤性脊髓损伤后运动前中间神经元在形成新脊髓内回路中的作用研究 | 强调单细胞RNA测序揭示成年脊髓中间神经元表达谱重叠的新发现,挑战传统基于胚胎发育转录因子的分类方法 | 明确指出现有研究很少澄清参与功能恢复的具体细胞身份,研究人员在分类这些群体时面临困难 | 探讨特定运动前中间神经元亚类在成年创伤性脊髓损伤后功能恢复中的潜在作用 | 脊髓运动前中间神经元 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,转录组学实验 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-07 |
Pten regulates endocytic trafficking of cell adhesion and Wnt signaling molecules to pattern the retina
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114005
PMID:38551961
|
研究论文 | 本研究揭示Pten通过调控细胞粘附分子和Wnt蛋白的囊泡运输来控制视网膜星爆无长突细胞的间距模式 | 首次发现Pten通过调节内吞运输途径来控制视网膜神经元的空间排列,并鉴定出DSCAM、FAT3和MEGF10等关键分子 | 研究主要聚焦于星爆无长突细胞,未涉及其他视网膜神经元类型 | 探索Pten在视网膜神经元空间模式形成中的分子机制 | 小鼠视网膜星爆无长突细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学,双突变体分析,蛋白质组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-10-07 |
Ptch1 is essential for cochlear marginal cell differentiation and stria vascularis formation
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114083
PMID:38602877
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了Ptch1在耳蜗边缘细胞分化和血管纹形成中的关键作用 | 首次发现Shh受体Ptch1对边缘细胞分化至关重要,并揭示了Ptch1-Gli2轴在调控血管纹发育中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索耳蜗血管纹形成的分子机制 | 小鼠耳蜗组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期14天小鼠耳蜗组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-07 |
The nociceptive activity of peripheral sensory neurons is modulated by the neuronal membrane proteasome
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114058
PMID:38614084
|
研究论文 | 本研究揭示了外周感觉神经元膜蛋白酶体对痛觉活动的调控作用 | 首次发现神经元膜蛋白酶体(NMP)在外周神经系统中的存在及其对痛觉敏感性的调控功能 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探究神经元膜蛋白酶体在外周神经系统中的功能及其对痛觉调控的机制 | 小鼠背根神经节(DRG)神经元及其外周神经纤维 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序, 钙成像, 电生理 | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 行为学数据 | 小鼠背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-07 |
ptx3a+ fibroblast/epicardial cells provide a transient macrophage niche to promote heart regeneration
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114092
PMID:38607913
|
研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼心脏再生过程中成纤维细胞/心外膜细胞通过ptx3a+细胞为巨噬细胞提供临时微环境的重要机制 | 首次发现ptx3a+成纤维细胞/心外膜细胞构成巨噬细胞临时生态位,并阐明csf1a信号通路在此过程中的关键作用 | 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究心脏再生过程中巨噬细胞生态位的组成和功能机制 | 斑马鱼心脏再生模型中的成纤维细胞/心外膜细胞和巨噬细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2025-10-07 |
Regulation of muscle hypertrophy through granulin: Relayed communication among mesenchymal progenitors, macrophages, and satellite cells
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114052
PMID:38573860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肌肉肥大过程中间充质祖细胞、巨噬细胞和卫星细胞之间的级联通讯机制 | 首次发现巨噬细胞来源的颗粒蛋白通过抑制卫星细胞分化来促进肌肉肥大的新机制 | 研究主要关注4天超负荷肌肉和10天再生肌肉的比较,其他时间点的变化可能未被充分探索 | 探究肌肉适应性肥大过程中的细胞网络和分子机制 | 小鼠骨骼肌组织中的间充质祖细胞、巨噬细胞和肌肉卫星细胞 | 单细胞生物学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 超负荷肌肉和再生肌肉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2025-10-07 |
MAFB in macrophages regulates cold-induced neuronal density in brown adipose tissue
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113978
PMID:38522069
|
研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞中转录因子MAFB通过调控IL-6表达影响棕色脂肪组织交感神经元密度和产热功能的机制 | 首次揭示MAFB通过调控巨噬细胞IL-6表达影响棕色脂肪组织交感神经支配的新机制 | 研究主要基于基因敲除小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明巨噬细胞MAFB在棕色脂肪组织产热调控中的作用机制 | 巨噬细胞特异性Mafb缺陷小鼠、RAW-264.7巨噬细胞系、棕色脂肪组织 | 分子生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、免疫组织化学、荧光素酶报告基因检测 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、组织学图像、代谢参数 | 巨噬细胞特异性Mafb缺陷小鼠模型及对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-07 |
An autophagy program that promotes T cell egress from the lymph node controls responses to immune checkpoint blockade
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114020
PMID:38554280
|
研究论文 | 本研究揭示了淋巴结内皮细胞自噬程序通过调控T细胞迁出机制增强免疫检查点阻断治疗反应 | 首次发现LEC特异性自噬基因Atg5通过调节鞘氨醇-1-磷酸信号控制T细胞淋巴结迁出,并证明该机制对免疫治疗疗效的关键作用 | 研究主要聚焦于LEC特异性自噬机制,对其他细胞类型自噬作用的探讨较少 | 探究淋巴结内皮细胞自噬程序在调控T细胞动态及免疫检查点阻断治疗反应中的作用机制 | 淋巴结内皮细胞、T细胞、自然杀伤细胞 | 免疫学 | 肿瘤免疫 | 活体成像、免疫表型分析、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2025-10-07 |
Stem cell-derived vessels-on-chip for cardiovascular disease modeling
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114008
PMID:38536819
|
研究论文 | 开发了一种开放式微流体血管芯片平台,用于心血管疾病建模 | 采用开放式微流体设计,整合人多能干细胞来源的内皮细胞,实现与单细胞RNA测序、蛋白质组学和高分辨率成像等先进分析技术的无缝集成 | NA | 建立人类体外疾病模型以更好地理解血管功能障碍并指导临床治疗 | 人多能干细胞来源的内皮细胞 | 器官芯片 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学, 高分辨率成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | 低样本体积和细胞数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 开放式微流体血管芯片平台 |
| 151 | 2025-10-07 |
ATF3 characterizes aggressive drug-tolerant persister cells in HGSOC
2024-04-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06674-x
PMID:38658567
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现ATF3在高级别浆液性卵巢癌耐药持续细胞中的关键作用 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中鉴定出ATF3标记的侵袭性耐药持续细胞亚群,并揭示其与部分上皮间质转化的关联 | 研究样本量有限,主要基于细胞系和少量患者样本 | 探索高级别浆液性卵巢癌中耐药持续细胞的形成机制和分子特征 | 高级别浆液性卵巢癌细胞系、异种移植模型和患者样本 | 单细胞测序分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,基因敲低,细胞谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据,临床生存数据 | 4名HGSOC患者的上皮细胞,259名TCGA HGSOC患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-07 |
Intestinal cell diversity and treatment responses in a parasitic nematode at single cell resolution
2024-Apr-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10203-7
PMID:38575858
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学技术揭示猪蛔虫肠道细胞的多样性及其对驱虫药物治疗的差异反应 | 首次在单细胞分辨率下表征寄生性线虫肠道细胞的表型多样性,并鉴定出独特的Clade III相关基因富集群 | 研究仅针对成年雌性猪蛔虫,未涵盖其他发育阶段或性别 | 解析寄生性线虫肠道细胞多样性及其对驱虫药物的反应机制 | 成年雌性猪蛔虫的肠道细胞 | 单细胞生物学 | 寄生虫感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未处理肠道细胞的单个细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 153 | 2025-10-07 |
Single-cell insights: pioneering an integrated atlas of chromatin accessibility and transcriptomic landscapes in diabetic cardiomyopathy
2024-04-25, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02233-y
PMID:38664790
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据,揭示了糖尿病心肌病中染色质可及性和转录组景观的细胞状态和分子变化 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据构建糖尿病心肌病的综合图谱,识别了关键的转录因子和细胞亚群特异性变化 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明糖尿病心肌病的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 野生型和糖尿病心肌病小鼠的心脏组织 | 单细胞多组学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光染色 | Seurat, Signac, chromVAR, Cicero | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | WT和DCM小鼠心脏样本 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Multiome | 10x Multiome单细胞RNA和ATAC联合测序文库 |
| 154 | 2025-10-07 |
Mechanisms of imbalanced testicular homeostasis in infancy due to aberrant histone acetylation in undifferentiated spermatogonia under different concentrations of Di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) exposure
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123742
PMID:38460586
|
研究论文 | 本研究探讨了婴儿期不同浓度DEHP暴露通过组蛋白乙酰化异常导致睾丸稳态失衡的分子机制 | 首次揭示了婴儿期DEHP暴露通过线粒体功能障碍和组蛋白乙酰化异常导致未分化精原细胞命运差异的机制,并发现其对睾丸稳态的长期影响持续至成年期 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证;DEHP暴露剂量和时程可能无法完全模拟真实环境暴露情况 | 阐明婴儿期DEHP暴露对睾丸发育和生殖系统功能的毒性机制 | 新生小鼠睾丸组织中的未分化精原细胞、支持细胞和间质细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第5天小鼠,分别接受40μg/kg和80μg/kg DEHP暴露10天 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 155 | 2024-12-31 |
Defining predictors of responsiveness to advanced therapies in Crohn's disease and ulcerative colitis: protocol for the IBD-RESPONSE and nested CD-metaRESPONSE prospective, multicentre, observational cohort study in precision medicine
2024-04-17, BMJ open
IF:2.4Q1
DOI:10.1136/bmjopen-2023-073639
PMID:38631839
|
研究论文 | 本文介绍了一项前瞻性、多中心、观察性队列研究,旨在通过多组学数据创建预测工具,以预测克罗恩病和溃疡性结肠炎患者对先进疗法的反应 | 该研究首次整合了肠道微生物组、代谢组、单细胞转录组、人类基因组、饮食和临床数据,以创建预测模型,并计划进行跨治疗比较和独立复制队列研究 | 研究的主要局限性在于其观察性设计,可能无法完全控制混杂因素,且样本量相对较小(1325名参与者) | 研究目标是识别和验证预测模型,以预测克罗恩病和溃疡性结肠炎患者对先进疗法的反应 | 研究对象为开始接受先进疗法的克罗恩病和溃疡性结肠炎患者 | 精准医学 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎 | 多组学数据分析 | 预测模型 | 多组学数据(肠道微生物组、代谢组、单细胞转录组、人类基因组、饮食和临床数据) | 1325名参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-12-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular and molecular heterogeneity of treatment-naïve primary osteosarcoma in dogs
2024-04-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06182-w
PMID:38658617
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了未经治疗的犬原发性骨肉瘤的细胞和分子异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了犬原发性骨肉瘤的肿瘤微环境中的细胞和分子组成,并发现了41种转录组学上不同的细胞类型,包括滤泡辅助T细胞、成熟的调节性树突状细胞和8种肿瘤相关巨噬细胞群体 | 研究仅限于6只未经治疗的犬,样本量较小,可能无法完全代表所有犬骨肉瘤的情况 | 揭示犬原发性骨肉瘤的肿瘤微环境中的细胞和分子异质性,为转化免疫肿瘤学研究提供基础 | 6只未经治疗的犬原发性骨肉瘤 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 35,310个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-12-17 |
Single-cell transcriptomics unveil profiles and interplay of immune subsets in rare autoimmune childhood Sjögren's disease
2024-04-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06124-6
PMID:38641668
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了儿童罕见自身免疫性疾病Sjögren病的免疫亚群特征及其相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出儿童Sjögren病中的关键免疫细胞亚群,包括IFN基因富集的单核细胞、CD4 T效应记忆细胞和XCL1 NK细胞,并发现这些细胞在伴有复发性腮腺炎的儿童患者中尤为显著 | 研究仅限于儿童Sjögren病的外周免疫细胞,未涉及其他组织或器官的免疫细胞 | 揭示儿童Sjögren病的免疫细胞亚群及其相互作用,为精准医学奠定基础 | 儿童Sjögren病患者的免疫细胞亚群及其相互作用 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-12-17 |
SPADE: spatial deconvolution for domain specific cell-type estimation
2024-04-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06172-y
PMID:38632414
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SPADE的空间反卷积方法,用于在特定领域中估计细胞类型的组成 | SPADE通过整合空间模式到细胞类型组成的分析中,显著提升了对空间基因表达模式的理解 | NA | 理解不同细胞类型在其空间背景下的基因表达 | 细胞类型的组成及其在不同位置的比例 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、组织学数据 | 空间反卷积 | 基因表达数据 | 合成数据和真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-12-15 |
Vaccine-elicited IL-1R signaling results in Th17 TRM-mediated immunity
2024-04-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06138-0
PMID:38594380
|
研究论文 | 本文研究了疫苗引发的IL-1R信号传导如何导致Th17 TRM介导的免疫反应 | 首次揭示了IL-1α在疫苗介导的肺部Th17 TRM细胞生成中的关键作用,并证明了IL-1α可以作为分子佐剂独立于LTA1生成肺部Th17 TRM细胞 | 研究主要集中在IL-1α的作用,未探讨其他IL-1家族成员在Th17 TRM细胞生成中的潜在作用 | 探讨疫苗引发的IL-1R信号传导在肺部Th17 TRM细胞生成中的作用 | 疫苗引发的IL-1R信号传导、肺部Th17 TRM细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-12-14 |
A multiplexed, single-cell sequencing screen identifies compounds that increase neurogenic reprogramming of murine Muller glia
2024-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559569
PMID:37808650
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序筛选出能够促进小鼠Müller胶质细胞神经再生的化合物 | 首次使用sci-Plex技术进行高通量单细胞分子分析,筛选出促进神经再生的化合物 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 提高哺乳动物中Müller胶质细胞的神经再生能力,以恢复视网膜疾病患者的视力 | 小鼠Müller胶质细胞的神经再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 92种化合物 | NA | NA | NA | NA |