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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-07 |
Maternal factor Trim75 contributes to zygotic genome activation program in mouse early embryos
2024-Apr-20, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09349-0
PMID:38643284
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据发现母源因子Trim75在小鼠早期胚胎合子基因组激活中的潜在作用 | 首次通过RNA速率分析识别Trim75作为次要ZGA的潜在驱动因子,并揭示其可能通过招募EP300和建立H3K27ac修饰促进胚胎发育 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据,需要进一步实验验证 | 探索母源因子在哺乳动物合子基因组激活中的作用机制 | 小鼠早期胚胎和胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,RNA速率分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2025-10-07 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals the alterations in epithelial cells during nodular formation in benign prostatic hyperplasia
2024-04-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05212-9
PMID:38654277
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了良性前列腺增生结节形成过程中上皮细胞的改变 | 首次发现BE5基底上皮细胞亚群在结节形成中的关键作用,并阐明其通过缺氧诱导的上皮-间质转化信号通路驱动BPH进展的机制 | 技术限制阻碍了对BPH患者的体内深入研究 | 探究良性前列腺增生结节形成的具体机制 | 良性前列腺增生患者的组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光染色,免疫组织化学染色 | RCTD(稳健细胞类型分解) | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,组织图像 | 未明确说明样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics dissects the transcriptome alterations of hematopoietic stem cells in myelodysplastic neoplasms
2024-04-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05165-z
PMID:38632656
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析骨髓增生异常肿瘤中造血干细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示MDS患者造血干细胞沿伪时间轴的转录组变化轨迹,并鉴定出PLCB1在白血病转化中的关键作用 | 样本量有限,需要更大规模研究验证;体外实验结果需进一步体内验证 | 探索骨髓增生异常肿瘤中造血干细胞分化轨迹和白血病转化机制 | 骨髓增生异常肿瘤患者的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞组学 | 骨髓增生异常肿瘤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | MDS患者造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-10-07 |
A Systematic Overview of Single-Cell Transcriptomics Databases, their Use cases, and Limitations
2024-Apr-15, ArXiv
PMID:38699169
|
综述 | 系统评述单细胞转录组数据库的分类、应用场景与局限性 | 首次系统性地对大规模单细胞RNA测序数据库进行分类梳理,并提出通过用户友好型平台弥合计算科学与实验科学间的鸿沟 | 未涉及具体实验验证,主要聚焦数据库的宏观分析 | 评估单细胞转录组数据库的现状与发展方向 | 在线单细胞RNA测序数据库与存储库 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2025-10-07 |
The integration of single-cell and bulk RNA-seq atlas reveals ERS-mediated acinar cell damage in acute pancreatitis
2024-04-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05156-0
PMID:38605381
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA-seq图谱揭示内质网应激介导的腺泡细胞损伤在急性胰腺炎中的作用机制 | 首次在单细胞水平描绘急性胰腺炎中腺泡细胞的转录组图谱,发现内质网应激和ERAD通路的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明急性胰腺炎的发病机制,特别是腺泡细胞的分子变化 | 急性胰腺炎小鼠的胰腺组织、急性胰腺炎患者的外周血样本 | 单细胞转录组学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因集富集分析, 伪时间分析, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 单细胞转录组数据, bulk RNA测序数据 | 多个单细胞测序数据集和bulk RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell transcriptome and chromatin accessibility and its application on tumor investigation
2024-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae015
PMID:39872661
|
综述 | 总结单细胞转录组和染色质可及性测序方法的最新进展,及其在肿瘤研究中的整合应用 | 整合单细胞转录组和表观遗传测序数据的生物信息学策略,深化对肿瘤发生发展的理解 | 未提及具体实验样本量和数据验证结果 | 探讨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用与整合策略 | 单细胞转录组和染色质可及性测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 147 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cardiac Fibroblast-Specific Transcriptomic Changes in Dilated Cardiomyopathy
2024-04-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13090752
PMID:38727290
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示扩张型心肌病中心脏成纤维细胞特异性转录组变化 | 采用更新的生物信息学流程结合无监督聚类和参考标签转移,更全面注释单细胞数据集,发现心脏成纤维细胞特异性基因表达改变 | 未明确说明样本数量和技术重复情况,功能验证部分基因功能评估尚未完成 | 检测扩张型心肌病中细胞特异性转录组改变 | 人类扩张型心肌病心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Heterogeneity and Transcriptional Dynamics in Porcine Circulating CD8+ T Cells
2024-04-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080692
PMID:38667307
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示猪循环CD8+ T细胞的异质性和转录动态 | 首次系统表征猪外周血CD8+ T细胞的异质性,定义四种亚型并揭示其分化轨迹和转录组差异 | NA | 解析猪免疫系统中CD8+ T细胞亚型的异质性和功能特征 | 猪外周血循环细胞中的CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2025-10-07 |
Single-Cell DNA Sequencing Reveals an Evolutionary Pattern of CHIP in Transplant Eligible Multiple Myeloma Patients
2024-04-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080657
PMID:38667272
|
研究论文 | 通过单细胞DNA测序揭示适合移植的多发性骨髓瘤患者中CHIP的进化模式 | 首次使用单细胞DNA测序技术研究多发性骨髓瘤患者自体干细胞移植前后CHIP的克隆进化动态 | 样本量较小(仅12例患者),仅检测了20个白血病相关基因 | 研究多发性骨髓瘤患者中克隆造血现象的进化模式及其与治疗反应的关系 | 多发性骨髓瘤患者的循环CD34+细胞 | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞DNA测序,高通量扩增子测序 | NA | 单细胞DNA测序数据 | 12例多发性骨髓瘤患者,其中4例有纵向样本 | Mission Bio | 单细胞DNA测序 | Tapestri | MissionBio Tapestri平台,包含20个白血病相关基因的靶向panel |
| 150 | 2025-10-07 |
Potential Roles of Specific Subclasses of Premotor Interneurons in Spinal Cord Function Recovery after Traumatic Spinal Cord Injury in Adults
2024-04-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080652
PMID:38667267
|
综述 | 回顾了成年创伤性脊髓损伤后运动前中间神经元在形成新脊髓内回路中的作用研究 | 强调单细胞RNA测序揭示成年脊髓中间神经元表达谱重叠的新发现,挑战传统基于胚胎发育转录因子的分类方法 | 明确指出现有研究很少澄清参与功能恢复的具体细胞身份,研究人员在分类这些群体时面临困难 | 探讨特定运动前中间神经元亚类在成年创伤性脊髓损伤后功能恢复中的潜在作用 | 脊髓运动前中间神经元 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,转录组学实验 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-07 |
Pten regulates endocytic trafficking of cell adhesion and Wnt signaling molecules to pattern the retina
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114005
PMID:38551961
|
研究论文 | 本研究揭示Pten通过调控细胞粘附分子和Wnt蛋白的囊泡运输来控制视网膜星爆无长突细胞的间距模式 | 首次发现Pten通过调节内吞运输途径来控制视网膜神经元的空间排列,并鉴定出DSCAM、FAT3和MEGF10等关键分子 | 研究主要聚焦于星爆无长突细胞,未涉及其他视网膜神经元类型 | 探索Pten在视网膜神经元空间模式形成中的分子机制 | 小鼠视网膜星爆无长突细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学,双突变体分析,蛋白质组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 152 | 2025-10-07 |
Ptch1 is essential for cochlear marginal cell differentiation and stria vascularis formation
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114083
PMID:38602877
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了Ptch1在耳蜗边缘细胞分化和血管纹形成中的关键作用 | 首次发现Shh受体Ptch1对边缘细胞分化至关重要,并揭示了Ptch1-Gli2轴在调控血管纹发育中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索耳蜗血管纹形成的分子机制 | 小鼠耳蜗组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期14天小鼠耳蜗组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 153 | 2025-10-07 |
The nociceptive activity of peripheral sensory neurons is modulated by the neuronal membrane proteasome
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114058
PMID:38614084
|
研究论文 | 本研究揭示了外周感觉神经元膜蛋白酶体对痛觉活动的调控作用 | 首次发现神经元膜蛋白酶体(NMP)在外周神经系统中的存在及其对痛觉敏感性的调控功能 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探究神经元膜蛋白酶体在外周神经系统中的功能及其对痛觉调控的机制 | 小鼠背根神经节(DRG)神经元及其外周神经纤维 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序, 钙成像, 电生理 | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 行为学数据 | 小鼠背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-07 |
ptx3a+ fibroblast/epicardial cells provide a transient macrophage niche to promote heart regeneration
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114092
PMID:38607913
|
研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼心脏再生过程中成纤维细胞/心外膜细胞通过ptx3a+细胞为巨噬细胞提供临时微环境的重要机制 | 首次发现ptx3a+成纤维细胞/心外膜细胞构成巨噬细胞临时生态位,并阐明csf1a信号通路在此过程中的关键作用 | 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究心脏再生过程中巨噬细胞生态位的组成和功能机制 | 斑马鱼心脏再生模型中的成纤维细胞/心外膜细胞和巨噬细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2025-10-07 |
Regulation of muscle hypertrophy through granulin: Relayed communication among mesenchymal progenitors, macrophages, and satellite cells
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114052
PMID:38573860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肌肉肥大过程中间充质祖细胞、巨噬细胞和卫星细胞之间的级联通讯机制 | 首次发现巨噬细胞来源的颗粒蛋白通过抑制卫星细胞分化来促进肌肉肥大的新机制 | 研究主要关注4天超负荷肌肉和10天再生肌肉的比较,其他时间点的变化可能未被充分探索 | 探究肌肉适应性肥大过程中的细胞网络和分子机制 | 小鼠骨骼肌组织中的间充质祖细胞、巨噬细胞和肌肉卫星细胞 | 单细胞生物学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 超负荷肌肉和再生肌肉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 156 | 2025-10-07 |
MAFB in macrophages regulates cold-induced neuronal density in brown adipose tissue
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113978
PMID:38522069
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研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞中转录因子MAFB通过调控IL-6表达影响棕色脂肪组织交感神经元密度和产热功能的机制 | 首次揭示MAFB通过调控巨噬细胞IL-6表达影响棕色脂肪组织交感神经支配的新机制 | 研究主要基于基因敲除小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明巨噬细胞MAFB在棕色脂肪组织产热调控中的作用机制 | 巨噬细胞特异性Mafb缺陷小鼠、RAW-264.7巨噬细胞系、棕色脂肪组织 | 分子生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、免疫组织化学、荧光素酶报告基因检测 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、组织学图像、代谢参数 | 巨噬细胞特异性Mafb缺陷小鼠模型及对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 157 | 2025-10-07 |
An autophagy program that promotes T cell egress from the lymph node controls responses to immune checkpoint blockade
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114020
PMID:38554280
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研究论文 | 本研究揭示了淋巴结内皮细胞自噬程序通过调控T细胞迁出机制增强免疫检查点阻断治疗反应 | 首次发现LEC特异性自噬基因Atg5通过调节鞘氨醇-1-磷酸信号控制T细胞淋巴结迁出,并证明该机制对免疫治疗疗效的关键作用 | 研究主要聚焦于LEC特异性自噬机制,对其他细胞类型自噬作用的探讨较少 | 探究淋巴结内皮细胞自噬程序在调控T细胞动态及免疫检查点阻断治疗反应中的作用机制 | 淋巴结内皮细胞、T细胞、自然杀伤细胞 | 免疫学 | 肿瘤免疫 | 活体成像、免疫表型分析、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-07 |
Stem cell-derived vessels-on-chip for cardiovascular disease modeling
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114008
PMID:38536819
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研究论文 | 开发了一种开放式微流体血管芯片平台,用于心血管疾病建模 | 采用开放式微流体设计,整合人多能干细胞来源的内皮细胞,实现与单细胞RNA测序、蛋白质组学和高分辨率成像等先进分析技术的无缝集成 | NA | 建立人类体外疾病模型以更好地理解血管功能障碍并指导临床治疗 | 人多能干细胞来源的内皮细胞 | 器官芯片 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学, 高分辨率成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | 低样本体积和细胞数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 开放式微流体血管芯片平台 |
| 159 | 2025-10-07 |
ATF3 characterizes aggressive drug-tolerant persister cells in HGSOC
2024-04-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06674-x
PMID:38658567
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现ATF3在高级别浆液性卵巢癌耐药持续细胞中的关键作用 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中鉴定出ATF3标记的侵袭性耐药持续细胞亚群,并揭示其与部分上皮间质转化的关联 | 研究样本量有限,主要基于细胞系和少量患者样本 | 探索高级别浆液性卵巢癌中耐药持续细胞的形成机制和分子特征 | 高级别浆液性卵巢癌细胞系、异种移植模型和患者样本 | 单细胞测序分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,基因敲低,细胞谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据,临床生存数据 | 4名HGSOC患者的上皮细胞,259名TCGA HGSOC患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-07 |
Intestinal cell diversity and treatment responses in a parasitic nematode at single cell resolution
2024-Apr-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10203-7
PMID:38575858
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研究论文 | 利用单细胞转录组学技术揭示猪蛔虫肠道细胞的多样性及其对驱虫药物治疗的差异反应 | 首次在单细胞分辨率下表征寄生性线虫肠道细胞的表型多样性,并鉴定出独特的Clade III相关基因富集群 | 研究仅针对成年雌性猪蛔虫,未涵盖其他发育阶段或性别 | 解析寄生性线虫肠道细胞多样性及其对驱虫药物的反应机制 | 成年雌性猪蛔虫的肠道细胞 | 单细胞生物学 | 寄生虫感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未处理肠道细胞的单个细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |