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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-07 |
Multimodal hierarchical classification of CITE-seq data delineates immune cell states across lineages and tissues
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.06.547944
PMID:37461466
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研究论文 | 提出一种基于标记的多模态分类方法MMoCHi,用于整合CITE-seq数据中的基因和蛋白表达信息进行细胞类型注释 | 开发了不依赖参考图谱的多模态层次分类方法,能够识别传统方法难以解析的免疫细胞亚群并发现新的亚群标记 | NA | 开发能够整合多模态单细胞数据的细胞类型分类方法 | 免疫细胞,特别是T淋巴细胞亚群和跨组织人类免疫细胞 | 生物信息学 | NA | CITE-seq,单细胞RNA测序 | 基于标记的分类器 | 单细胞转录组数据,表面蛋白组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 122 | 2025-10-07 |
Restoration of neuronal progenitors by partial reprogramming in the aged neurogenic niche
2024-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00594-3
PMID:38553564
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学系统分析部分重编程对老年小鼠脑室下区神经发生生态位的影响 | 首次揭示部分重编程可特异性恢复老年神经发生生态位中的神经母细胞比例,并证明其改善作用具有生态位内在性 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性仍需验证 | 探索部分重编程对老年大脑神经发生生态位的影响机制 | 老年小鼠的脑室下区神经发生生态位和神经干细胞培养物 | 神经科学 | 老年性脑功能衰退 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年小鼠神经发生生态位和神经干细胞培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-07 |
Lipoxin A 4 /FPR2 signaling mitigates ferroptosis of alveolar epithelial cells via NRF2-dependent pathway during lung ischemia-reperfusion injury
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590127
PMID:38712069
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研究论文 | 本研究探讨了肺泡上皮细胞中铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用及Lipoxin A4/FPR2信号通路的保护机制 | 首次揭示了Lipoxin A4通过FPR2受体激活NRF2通路抑制肺泡上皮细胞铁死亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的转化价值需进一步验证 | 探究铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的细胞特异性作用及Lipoxin A4的保护机制 | 肺移植患者样本、C57BL/6小鼠、Fpr2-/-和Nrf2-/-基因敲除小鼠、肺泡II型上皮细胞 | 分子生物学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、基因敲除模型、原位肺移植模型、体外细胞研究 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、生理指标、生化指标 | 未明确样本数量,包含患者组织样本和多个小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals genome evolution in predatory litostomatean ciliates
2024-Apr, European journal of protistology
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.ejop.2024.126062
PMID:38368736
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示捕食性裂口纲纤毛虫的基因组进化机制 | 首次对六种捕食性裂口纲纤毛虫进行单细胞转录组测序,发现与跨膜活性和氧化应激反应相关的基因家族扩张及三次全基因组复制事件 | 样本数量有限(仅六种捕食性物种),基因组进化机制仍需功能验证 | 探究纤毛虫捕食能力的遗传进化基础 | 六种捕食性裂口纲纤毛虫 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 6种捕食性裂口纲纤毛虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-07 |
IL-12/IL23 blockade reveals patterns of asynchronous inflammation in pyoderma gangrenosum
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.591387
PMID:38746177
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示坏疽性脓皮病的炎症特征及IL-12/IL-23阻断治疗的分子机制 | 首次发现坏疽性脓皮病皮损中存在B细胞大量浸润和三级淋巴结构形成,并揭示IL-12/IL-23阻断治疗对不同炎症通路的差异化影响 | 研究样本量较小(仅2名患者),需要更大规模研究验证发现 | 阐明坏疽性脓皮病的免疫失调机制及IL-12/IL-23阻断治疗的分子作用 | 坏疽性脓皮病患者皮损组织 | 空间转录组学 | 坏疽性脓皮病 | 空间转录组学,比较计算分析 | NA | 空间转录组数据 | 2名患者的治疗前后皮损活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-07 |
Nanoceria-Mediated Cyclosporin A Delivery for Dry Eye Disease Management through Modulating Immune-Epithelial Crosstalk
2024-04-30, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c11514
PMID:38632691
|
研究论文 | 开发了一种基于纳米酶的滴眼液,通过调节免疫-上皮细胞相互作用来治疗干眼病 | 首次开发具有长期抗氧化和抗炎能力的纳米酶滴眼液,能够同时打破氧化应激-炎症恶性循环并调节细胞间通讯 | 未提及临床研究阶段及具体样本量限制 | 开发干眼病的新型治疗方法 | 干眼病的治疗机制研究 | 生物医学工程 | 干眼病 | 流式细胞术、单细胞测序 | NA | 测序数据、细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-10-07 |
Interleukin-1β polarization in M1 macrophage mediates myocardial fibrosis in diabetes
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111858
PMID:38492336
|
研究论文 | 本研究探讨了M1巨噬细胞通过白细胞介素-1β介导糖尿病心肌纤维化的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示糖尿病发展中巨噬细胞M1极化通过IL-1β促进心肌纤维化的具体机制 | 研究仅限于db/db小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究巨噬细胞在糖尿病心肌纤维化中的作用机制 | db/db糖尿病模型小鼠的心脏组织 | 单细胞组学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序, 超声心动图, Masson三色染色, 细胞共培养 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 不同糖尿病阶段的db/db小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-10-07 |
Epigenetic dysregulation in Alzheimer's disease peripheral immunity
2024-Apr-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.013
PMID:38340719
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传调控异常 | 首次系统研究AD外周免疫系统的表观遗传变化,发现CD8 T细胞中CXCR3基因启动子的顺式调控元件和单核细胞中AD特异的RELA转录因子结合位点 | 外周免疫系统研究相对有限,样本规模未明确说明 | 探究阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传和转录调控改变 | 阿尔茨海默病患者的外周免疫细胞(CD8 T细胞和单核细胞) | 表观遗传学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序,转座酶可及染色质测定,RNA测序 | NA | 表观遗传数据,转录组数据 | NA | NA | single-cell ATAC-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-10-07 |
Mechanisms of sex differences in Alzheimer's disease
2024-Apr-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.024
PMID:38402606
|
综述 | 探讨阿尔茨海默病性别差异的潜在生物学机制 | 整合单细胞RNA测序、代谢组学和多组学分析等先进技术,系统研究性别差异在阿尔茨海默病中的作用机制 | NA | 理解阿尔茨海默病性别差异的生物学基础 | 阿尔茨海默病发病机制中的性别相关因素 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-07 |
The neuroendocrine transition in prostate cancer is dynamic and dependent on ASCL1
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.09.588557
PMID:38645223
|
研究论文 | 本研究开发了一个动态平台来探究前列腺癌神经内分泌转化的分子机制 | 建立了能够模拟前列腺癌神经内分泌转化的动态模型,揭示了ASCL1在此过程中的关键作用 | 需要原生微环境支持,传统类器官培养无法复制这一过程 | 探究前列腺癌神经内分泌谱系可塑性的分子决定因素 | 小鼠前列腺类器官和神经内分泌前列腺癌模型 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 多重免疫荧光,空间转录组学,PrismSpot分析 | NA | 空间基因表达数据,免疫荧光图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 131 | 2025-10-07 |
Single cell analysis unveils B cell-dominated immune subtypes in HNSCC for enhanced prognostic and therapeutic stratification
2024-04-16, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00292-1
PMID:38622125
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示头颈鳞状细胞癌中B细胞主导的免疫亚型,用于改善预后和治疗分层 | 首次通过单细胞RNA测序系统分析头颈鳞癌中肿瘤浸润B细胞的基因表达模式,并建立基于B细胞活化的新型肿瘤分类系统 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证B细胞在免疫微环境中的具体作用机制 | 探索肿瘤浸润B细胞在头颈鳞癌免疫微环境中的作用及其对免疫治疗反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和肿瘤浸润B细胞 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的头颈鳞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis revealed a potential role of T-cell exhaustion in colorectal cancer with liver metastasis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18341
PMID:38647235
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示T细胞耗竭在结直肠癌肝转移中的潜在作用 | 首次通过单细胞测序技术系统分析结直肠癌肝转移中T细胞耗竭的作用机制,发现CEACAM5和ADGRE5-CD55在Tex与Treg-上皮细胞相互作用中的关键角色 | 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 探究T细胞耗竭在结直肠癌肝转移过程中的作用机制 | 结直肠癌肝转移患者的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析,伪时间分析,ssGSEA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2025-10-07 |
Integrated analysis highlights the significance role of ITGAL in lung adenocarcinoma
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18289
PMID:38613346
|
研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了ITGAL在肺腺癌中的预后价值和抑制肿瘤恶性进展的作用 | 首次系统阐明ITGAL在肺腺癌中的预后价值及其通过调控NK细胞因子影响肿瘤微环境的机制 | 研究主要基于TCGA数据库和体外实验,缺乏大规模临床样本验证 | 探究ITGAL在肺腺癌中的生物学功能和临床意义 | 肺腺癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,3D Matrigel培养,BrdU ELISA,伤口愈合迁移实验,细胞粘附实验 | NA | 基因表达数据,临床预后数据,单细胞测序数据 | TCGA数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-07 |
Detecting early-warning biomarkers associated with heart-exosome genetic-signature for acute myocardial infarction: A source-tracking study of exosome
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18334
PMID:38661439
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研究论文 | 本研究通过溯源分析血浆外泌体,检测与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 | 首次通过去卷积算法实现血浆外泌体溯源分析,识别出三个与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 | 仅分析了血浆总外泌体中的心脏来源部分,未完全排除其他器官外泌体的干扰 | 检测与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 | 急性心肌梗死患者的血浆外泌体 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 去卷积算法, 加权基因共表达网络, 机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据 | 住院患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-07 |
Identification of PPAR-related differentially expressed genes liver hepatocellular carcinoma and construction of a prognostic model based on data analysis and molecular docking
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18304
PMID:38652093
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝细胞癌中PPAR相关基因表达,构建预后模型并筛选潜在治疗药物 | 首次在单细胞水平分析肝细胞癌中PPAR相关基因表达特征,构建基于8个PPAR相关基因的预后模型,并通过分子对接筛选潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索肝细胞癌发展的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 肝细胞癌组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,伤口愈合实验 | LASSO-Cox回归模型,ConsensusCluster分析 | 基因表达数据 | TCGA-LIHC、ICGC-LIRI和GSE14520数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-10-07 |
Integrative analysis unveils ECM signatures and pathways driving hepatocellular carcinoma progression: A multi-omics approach and prognostic model development
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18230
PMID:38568083
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示细胞外基质在肝细胞癌进展中的特征和作用机制,并开发了基于ECM的预后模型 | 整合单细胞转录组分析和多组学数据,系统揭示ECM在LIHC免疫浸润和预后分层中的新作用,并构建了有效的ECM预后模型 | 样本量相对有限(10个LIHC样本),需要在更大队列中进一步验证 | 探索细胞外基质在肝细胞癌进展中的作用机制并开发预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本、肝癌细胞系 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 侵袭实验, Transwell实验 | Lasso回归 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 10个LIHC样本(单细胞数据), TCGA-LIHC队列, CheckMate研究独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and RNA-seq data to explore the role of focal adhesion-related genes in osteoporosis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18271
PMID:38534087
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研究论文 | 通过整合单细胞和RNA测序数据探索黏着斑相关基因在骨质疏松症中的作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序和RNA测序数据识别出与骨质疏松相关的两个关键基因FAM129A和RNF24 | 研究样本量有限,仅基于GSE56815和GSE56116两个队列数据 | 挖掘与黏着斑相关的枢纽基因并研究其在骨质疏松症中的作用 | 骨质疏松症患者样本、小鼠模型、人类血液样本 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个基因表达数据集(GSE56815和GSE56116) | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2025-10-07 |
Histone modification-linked prognostic model for ovarian cancer reveals LBX2 as a novel growth promoter
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18260
PMID:38520216
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研究论文 | 本研究构建了基于组蛋白修饰相关基因的卵巢癌预后模型,并发现LBX2作为新的生长促进因子 | 首次将组蛋白修饰相关基因与卵巢癌预后关联,并鉴定LBX2为新的卵巢癌增殖促进因子 | 研究基于回顾性数据,需要进一步实验验证 | 探索组蛋白修饰相关基因在卵巢癌预后预测中的作用 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序 | Lasso回归 | 转录组数据 | 多个队列的卵巢癌患者数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2025-10-07 |
Prognostic and immunotherapeutic potential of regulatory T cell-associated signature in ovarian cancer
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18248
PMID:38520220
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别Treg相关生物标志物,开发了卵巢癌预后模型并评估其免疫治疗潜力 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习算法构建Treg相关特征评分,用于卵巢癌预后预测和免疫治疗反应评估 | 需要进一步的外部验证和临床转化研究 | 探索调节性T细胞相关基因在卵巢癌中的预后价值和免疫治疗潜力 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | 随机生存森林(RSF), LASSO | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但识别了365个Treg相关基因 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2025-10-07 |
Construction of a prognostic model with CAFs for predicting the prognosis and immunotherapeutic response of lung squamous cell carcinoma
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18262
PMID:38520221
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研究论文 | 本研究构建了基于癌症相关成纤维细胞(CAFs)的预后模型,用于预测肺鳞状细胞癌(LUSC)的预后和免疫治疗反应 | 首次在LUSC中系统分类CAFs亚型并构建包含9个CAF相关基因的预后特征模型 | CAFs在LUSC中的功能复杂且不确定,需要进一步验证 | 开发预测LUSC预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 肺鳞状细胞癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单变量Cox分析, 多变量Cox分析, ssGSEA, Kaplan-Meier分析 | Cox比例风险模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |