单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 491 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-ome regression models identify functional and disease-associated enhancers and enable chromatin potential analysis
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01689-8
PMID:38514783
|
研究论文 | 开发了一种名为SCARlink的单细胞多组学回归模型，用于预测基因表达并将增强子与靶基因关联 | 使用正则化泊松回归对瓦片水平可及性数据进行建模，避免了传统基因-峰相关性分析和峰值调用的限制 | NA | 建立基因水平调控模型，识别功能性增强子并分析染色质潜能 | 单细胞多组学测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学测序 | 正则化泊松回归 | 基因组可及性数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 122 | 2025-10-07 |
β-Catenin in Dendritic Cells Negatively Regulates CD8 T Cell Immune Responses through the Immune Checkpoint Molecule Tim-3
2024-Apr-25, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines12050460
PMID:38793711
|
研究论文 | 本研究揭示了树突状细胞中β-连环蛋白通过上调免疫检查点分子Tim-3抑制CD8 T细胞免疫应答的新机制 | 首次发现β-catenin/Tim-3轴在树突状细胞中负调控CD8 T细胞免疫应答，并证明抗Tim-3抗体与DC疫苗联合治疗的协同抗肿瘤效果 | 机制研究仍需深入，临床前模型需进一步验证 | 探究树突状细胞中β-连环蛋白调控CD8 T细胞免疫应答的分子机制 | 树突状细胞、CD8 T细胞、黑色素瘤模型小鼠 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、免疫组化、动物模型 | NA | 基因表达数据、免疫应答数据 | CD11c-β-catenin基因工程小鼠、B16F10荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-07 |
IQGAP2 regulates blood-brain barrier immune dynamics
2024-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.07.527394
PMID:38645082
|
研究论文 | 本研究揭示了IQGAP2蛋白在调控血脑屏障免疫特权和免疫细胞进入中枢神经系统中的关键作用 | 首次发现IQGAP2作为支架蛋白在调控血脑屏障免疫动态中的核心功能，并证明其在阿尔茨海默病患者海马体中表达降低 | IQGAP2调控免疫细胞浸润的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究IQGAP2蛋白如何调控血脑屏障的免疫细胞浸润 | 小鼠、斑马鱼模型以及人类组织样本 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像数据 | 小鼠和斑马鱼模型，人类阿尔茨海默病组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-07 |
Dupilumab-associated head and neck dermatitis shows a pronounced type 22 immune signature mediated by oligoclonally expanded T cells
2024-Apr-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46540-0
PMID:38565563
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析dupilumab相关头颈部皮炎，揭示其独特的22型免疫特征 | 首次发现dupilumab治疗伴随T细胞寡克隆扩增驱动的22型免疫反应过度激活 | 样本量有限，机制研究仍需进一步验证 | 探究dupilumab相关头颈部皮炎的发生机制 | dupilumab相关头颈部皮炎患者皮肤活检组织 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自DAHND、未治疗AD和健康对照的皮肤穿刺活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-07 |
Molecular differences between neonatal and adult stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.24.590986
PMID:38712156
|
研究论文 | 本研究通过建立新生和成年小鼠血管纹器官型外植体模型并结合单细胞RNA测序，揭示了血管纹发育和维持的关键分子差异 | 首次建立了保留血-迷路屏障完整性的新生和成年血管纹器官型外植体模型，并结合单细胞RNA测序揭示了发育特异性基因表达谱 | 研究主要基于小鼠模型，人类血管纹可能存在物种特异性差异 | 研究血管纹在发育和成熟过程中的分子差异，为听力损失治疗提供新见解 | 新生和成年小鼠的血管纹组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序，器官型外植体培养，药理学干预 | 小鼠器官型外植体模型 | 单细胞转录组数据，组织学数据 | 新生和成年小鼠血管纹组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-07 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588538
PMID:38645090
|
研究论文 | 本研究构建了首个小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，揭示了该组织的细胞组成和功能特征 | 首次创建小鼠精囊的单细胞转录组图谱，系统定义了分泌细胞和免疫细胞群体 | NA | 研究精囊组织的细胞组成和功能，探索其在生殖过程中的作用 | 小鼠精囊组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23只不同年龄和饮食条件的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2025-10-07 |
Seq-Scope Protocol: Repurposing Illumina Sequencing Flow Cells for High-Resolution Spatial Transcriptomics
2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.29.587285
PMID:38617262
|
研究论文 | 介绍Seq-Scope协议，将Illumina测序流动池重新用于高分辨率空间转录组学分析 | 开发了将Illumina测序平台重新用于高分辨率、高通量空间转录组分析的新方法 | 需要Illumina NovaSeq 6000等专业设备，方法复杂度较高 | 建立高分辨率空间转录组学分析协议 | 多种生物组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 无分割分析方法 | 图像, 转录组数据 | NA | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina测序流动池，支持7 mm × 7 mm或更大区域的多组织切片分析 |
| 128 | 2025-10-07 |
Inflammatory recruitment of healthy hematopoietic stem and progenitor cells in the acute myeloid leukemia niche
2024-04, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02136-7
PMID:38228679
|
研究论文 | 本研究揭示了健康造血干细胞和祖细胞在急性髓系白血病微环境中通过炎症反应主动参与疾病进程 | 首次发现HSPCs是白血病细胞介导骨髓炎症适应的未知组成部分，并证明AML来源的细胞外囊泡足以触发这种炎症反应 | 研究基于两种同源AML模型，结果在人类AML中的适用性需要进一步验证 | 探究健康造血干细胞和祖细胞在AML骨髓微环境炎症反应中的作用机制 | 造血干细胞和祖细胞(HSPCs)、急性髓系白血病细胞 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、骨髓血浆分泌组分析、细胞外囊泡研究 | NA | 基因表达数据、蛋白质分泌数据 | 两种同源AML模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 129 | 2025-10-07 |
Letter to editor: single-cell transcriptome analysis upon ECM-remodeling meningioma cells of published cases
2024-Apr-02, Neurosurgical review
IF:2.5Q1
DOI:10.1007/s10143-024-02375-3
PMID:38561568
|
comments | 对已发表的ECM重塑脑膜瘤细胞单细胞转录组分析研究进行细致评估 | 强调需要更全面地考虑肿瘤异质性和微环境影响，指出ECM重塑研究可能忽略其他关键肿瘤生物学方面 | 存在数据解读和验证的挑战，ECM重塑研究可能无意中忽视肿瘤生物学的其他关键方面 | 评估ECM重塑脑膜瘤细胞的单细胞转录组分析研究 | 已发表的ECM重塑脑膜瘤细胞研究 | digital pathology | meningioma | single-cell transcriptome analysis | NA | transcriptome data | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2025-10-07 |
Refining the identity of mesenchymal cell types associated with murine periosteal and endosteal bone
2024-04, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107158
PMID:38479598
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据构建小鼠骨相关细胞图谱，澄清了与骨相关的间充质细胞类型身份 | 揭示了11个主要的骨相关间充质细胞簇，包括新发现的骨-X细胞，并发现Wnt16在骨膜细胞中的特异性表达 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 增加骨细胞单细胞RNA测序数据，比较骨膜和骨内细胞，澄清小鼠骨相关主要细胞类型 | 小鼠骨相关间充质细胞，特别是成骨细胞和骨细胞 | 单细胞测序分析 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过100,000个间充质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-10-07 |
The rise of single-cell transcriptomics in yeast
2024-04, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.3934
PMID:38403881
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在酵母研究中的应用现状与发展前景 | 系统总结了酵母单细胞RNA测序技术面临的独特技术挑战及解决方案 | NA | 探讨单细胞转录组技术在酵母研究中的技术发展和应用潜力 | 酵母单细胞转录组学研究 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2025-10-07 |
[Microglia differential genes and their functions in paraquat-induced Parkinson's disease-like in mice's brains based on single-cell RNA sequencing]
2024-Apr-20, Zhonghua lao dong wei sheng zhi ye bing za zhi = Zhonghua laodong weisheng zhiyebing zazhi = Chinese journal of industrial hygiene and occupational diseases
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序分析百草枯诱导帕金森病样小鼠脑内小胶质细胞亚群的差异基因及相关信号通路 | 首次在百草枯诱导的帕金森病样小鼠模型中通过单细胞RNA测鉴定了小胶质细胞亚群，并发现其向M2表型极化的新机制 | 样本量较小（每组3只小鼠），且仅在细胞系中验证了部分基因表达 | 阐明百草枯诱导帕金森病样脑部变化的机制 | C57BL/6小鼠和小鼠小胶质细胞（BV2细胞） | 单细胞测序分析 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，实时荧光定量PCR，生物信息学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 6只6周龄雄性C57BL/6小鼠（对照组和实验组各3只），BV2细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 133 | 2025-10-07 |
Association of HLA-DRB1*15:01 Status with Transcriptomic Pattern of B cells in CSF in Multiple Sclerosis (P7-6.011)
2024-Apr-09, Neurology
IF:7.7Q1
DOI:10.1212/WNL.0000000000208131
PMID:39977876
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性硬化症患者脑脊液中B细胞的基因表达模式与HLA-DRB1*15:01单倍型状态的关联 | 首次在单细胞水平揭示HLA-DRB1*15:01单倍型状态与多发性硬化症患者脑脊液B细胞转录组模式的关联 | 样本量有限（25个脑脊液样本），且使用公开数据可能受原始研究设计限制 | 探讨HLA-DRB1*15:01单倍型状态对多发性硬化症患者脑脊液B细胞基因表达模式的影响 | 多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单核细胞和脑脊液样本 | 单细胞转录组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, VDJ分析 | TRUST4, ArcasHLA | 单细胞RNA测序数据 | 25个脑脊液样本中的1376个B系细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-07 |
Interleukin-22 inhibits cardiac fibrosis by regulating fibroblast metabolic reprogramming in myocardial infarction
2024-Apr, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2024.155256
PMID:38492359
|
研究论文 | 本研究探讨白细胞介素-22通过调节成纤维细胞代谢重编程抑制心肌梗死后心脏纤维化的作用机制 | 首次揭示IL-22通过JNK/PKM2通路抑制有氧糖酵解从而减轻心脏纤维化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在临床患者中验证 | 探究IL-22在心肌梗死后心肌纤维化中的作用及代谢机制 | 心肌梗死患者和小鼠模型的成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序，代谢分析，体外实验，体内实验 | NA | 单细胞测序数据，代谢数据，分子表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-07 |
Proinflammatory phenotype of B10 and B10pro cells elicited by TNF-α in rheumatoid arthritis
2024-Apr-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224878
PMID:38302261
|
研究论文 | 本研究揭示了TNF-α通过干扰SHIP-1诱发B10和B10pro细胞促炎表型在类风湿关节炎中的机制 | 首次发现TNF-α能够改变B10和B10pro细胞的免疫表型，使其从抑炎转为促炎，并阐明了SHIP-1在这一过程中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，在人类患者中的直接证据仍需进一步验证 | 探究TNF-α对B10和B10pro细胞表型和功能的调控机制及其在类风湿关节炎发病中的作用 | B10和B10pro细胞、类风湿关节炎患者、健康个体、基因敲除小鼠模型 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、转录组测序、基因敲除模型 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞频率数据 | 健康个体和RA患者的外周血样本、TNF-α-/-和SHIP-1-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analyses reveal disturbed decidual homoeostasis in obstetric antiphospholipid syndrome
2024-Apr-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224930
PMID:38331588
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示产科抗磷脂综合征中蜕膜稳态失衡的细胞组成和分子特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘OAPS患者蜕膜细胞的异常微环境，发现巨噬细胞/dNK细胞比例失衡、血管内皮细胞收缩及代谢通路改变等新特征 | 样本量有限（5例患者+5例对照），需更大队列验证；主要聚焦早孕期蜕膜组织 | 揭示产科抗磷脂综合征的发病机制 | 早孕期蜕膜组织细胞 | 单细胞组学 | 产科抗磷脂综合征 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组化，免疫荧光，ELISA | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 5例OAPS患者和5例健康对照的蜕膜组织（初验证扩大队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2025-10-07 |
p53 accelerates endothelial cell senescence in diabetic retinopathy by enhancing FoxO3a ubiquitylation and degradation via UBE2L6
2024-Apr, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2024.112391
PMID:38437929
|
研究论文 | 本研究揭示了p53通过增强UBE2L6介导的FoxO3a泛素化降解加速糖尿病视网膜病变中内皮细胞衰老的机制 | 首次发现p53通过上调UBE2L6表达促进FoxO3a泛素化降解，从而加速内皮细胞衰老的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未在人体临床试验中验证 | 阐明糖尿病视网膜病变中内皮细胞衰老的具体分子机制 | db/db糖尿病小鼠视网膜组织和人视网膜微血管内皮细胞(HRMECs) | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2025-10-07 |
Bulk and single-cell transcriptome datasets of the mouse fetal and adult rete ovarii and surrounding tissues
2024-Apr-13, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03227-x
PMID:38615064
|
研究论文 | 本研究通过批量、单细胞和细胞核水平的转录组测序，揭示了小鼠胎儿和成年期卵巢网及其周围组织的转录组特征 | 首次系统性地对卵巢网三个区域进行多层次的转录组分析，并利用Pax8-rtTA; Tre-H2B-GFP转基因小鼠模型实现卵巢网特异性标记 | 研究局限于小鼠模型，卵巢网的具体功能意义仍需进一步实验验证 | 探索卵巢网在卵巢稳态和生理变化响应中的潜在功能 | 小鼠胎儿和成年期卵巢网组织及其周围组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胎儿和成年期卵巢网组织样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling of bronchoalveolar cells reveals a Th17 signature in neutrophilic severe equine asthma
2024-04, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13745
PMID:38153159
|
研究论文 | 通过单细胞mRNA测序分析马支气管肺泡细胞，揭示中性粒细胞性重度马哮喘中存在显著的Th17免疫特征 | 首次在重度马哮喘中通过单细胞测序发现显著的Th17免疫反应特征，并鉴定出单核-淋巴细胞复合物及CXCL13在中间单核细胞中的上调 | 样本量较小（11匹马），使用冷冻保存的细胞可能影响细胞活性 | 揭示重度马哮喘的免疫驱动机制 | 温血马的支气管肺泡细胞 | 单细胞测序分析 | 哮喘 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 11匹温血马（5匹对照，6匹SEA患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics: background, technologies, applications, and challenges
2024-Apr-30, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09553-y
PMID:38689046
|
综述 | 本文综述单细胞转录组学技术的发展背景、技术平台、应用场景及当前面临的挑战 | 系统整合单细胞转录组学最新技术进展，涵盖空间转录组学和多组学技术的衔接点 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 | 总结单细胞转录组学技术发展现状与未来方向 | 单细胞测序技术及其生物信息学方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |