本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
STRUCTURE-FUNCTION RELATIONSHIPS OF MUCOCILIARY CLEARANCE IN HUMAN AIRWAYS
2024-Apr-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4164522/v1
PMID:38746209
|
研究论文 | 本研究首次绘制了人类和大鼠气道树中纤毛细胞和分泌细胞的分布图谱,揭示了组织水平结构与纤毛功能之间的关系 | 首次在人类和大鼠中系统比较气道树细胞分布,发现物种特异性纤毛功能差异,并识别出能预测清除功能的上皮结构参数 | 研究仍部分依赖动物模型数据,对人类气道屏障功能的理解仍有限 | 探索人类气道组织水平结构与纤毛器官功能之间的关系,特别是形态组织与黏液纤毛清除功能的联系 | 人类和大鼠的气道组织 | 组织生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 组织样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-06 |
Candida albicans-myeloid cells-T lymphocytes axis in the tumor microenvironment of oral tumor-bearing mice
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216814
PMID:38499264
|
研究论文 | 本研究揭示白色念珠菌感染通过调节髓系细胞-T淋巴细胞轴改变口腔肿瘤微环境并促进肿瘤进展 | 首次发现白色念珠菌感染通过髓系细胞-T淋巴细胞轴调控口腔肿瘤微环境,揭示了IL-17A和γδ T细胞在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究白色念珠菌感染对口腔肿瘤微环境的影响机制 | 口腔肿瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
An effective two-stage NMBzA-induced rat esophageal tumor model revealing that the FAT-Hippo-YAP1 axis drives the progression of ESCC
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216813
PMID:38499266
|
研究论文 | 本研究建立了一种高效的两阶段NMBzA诱导大鼠食管癌模型,并发现FAT-Hippo-YAP1轴驱动食管鳞癌进展 | 使用索拉非尼作为肿瘤促进剂建立高效两阶段致癌模型,首次揭示大鼠ESCC中FAT-Hippo-YAP1轴的渐进性超活化 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 建立高效的食管鳞癌动物模型并研究其致癌机制 | NMBzA诱导的大鼠食管鳞癌模型及衍生细胞系 | 癌症研究 | 食管鳞状细胞癌 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 多组学分析, 3D类器官培养 | 动物模型, 细胞系模型, 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据, 细胞表型数据 | NMBzA诱导的大鼠食管肿瘤样本及衍生细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
Antigen/HLA-agnostic strategies for Characterizing Tumor-responsive T cell receptors in PDAC patients via single-cell sequencing and autologous organoid application
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216741
PMID:38395378
|
研究论文 | 本研究通过超深度单细胞TCR/RNA测序和自体类器官技术,在PDAC患者中鉴定和验证肿瘤反应性T细胞受体 | 开发了不依赖抗原/HLA的肿瘤反应性TCR表征策略,结合单细胞测序和自体类器官技术 | 仅为概念验证研究,样本量有限(仅2例PDAC患者) | 开发个性化TCR-T细胞疗法的肿瘤反应性TCR表征方法 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者 | 单细胞测序 | 胰腺癌 | 单细胞TCR/RNA测序,类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据,TCR序列数据 | 2例PDAC患者,超过82,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-06 |
Characterization of the distinct immune microenvironments between hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216799
PMID:38479553
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统比较了肝细胞癌和肝内胆管癌的肿瘤免疫微环境差异 | 首次通过整合41个单细胞RNA测序样本系统比较两种主要原发性肝癌的免疫微环境,并发现HCC中EGR1巨噬细胞的特异性富集 | 样本数量相对有限,仅包含41个样本 | 系统评估肝细胞癌和肝内胆管癌肿瘤免疫微环境的异同 | 肝细胞癌和肝内胆管癌的肿瘤组织样本 | 单细胞基因组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 41个单细胞RNA测序样本,涵盖两种恶性肿瘤的四种不同组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-10-06 |
Association of preoperative aspartate aminotransferase to platelet ratio index with outcomes and tumour microenvironment among colorectal cancer with liver metastases
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216778
PMID:38458593
|
研究论文 | 探讨术前APRI指标对结直肠癌肝转移患者预后及肿瘤微环境的预测价值 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫组化揭示APRI与肿瘤微环境的关联机制 | 回顾性多中心研究,需前瞻性研究进一步验证 | 寻找改善结直肠癌肝转移患者预后预测的可靠生物标志物 | 1323例接受同步切除的结直肠癌肝转移患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化/免疫荧光 | Cox风险回归模型 | 血液检测数据, 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 1323例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 多重免疫组化 | NA | NA |
| 107 | 2025-10-06 |
CD63+ cancer-associated fibroblasts confer CDK4/6 inhibitor resistance to breast cancer cells by exosomal miR-20
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216747
PMID:38403110
|
研究论文 | 本研究揭示CD63+癌症相关成纤维细胞通过外泌体miR-20介导乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂产生耐药性 | 首次发现CD63+癌症相关成纤维细胞亚群在CDK4/6抑制剂耐药肿瘤组织中富集,并阐明其通过外泌体miR-20靶向RB1 mRNA的耐药机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序和肿瘤异种移植模型,临床验证尚需进一步研究 | 探究乳腺癌对CDK4/6抑制剂产生耐药性的机制及潜在治疗策略 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞、肿瘤异种移植模型 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 外泌体分析, 纳米颗粒合成 | 肿瘤异种移植模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the landscape of epithelial-mesenchymal transition molecular heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-04-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216723
PMID:38342234
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示食管鳞状细胞癌上皮间质转化的分子异质性景观 | 首次在单细胞水平系统描绘ESCC中EMT的分子异质性,发现SERPINH1作为新的EMT标志物,并验证靶向EMT的潜在药物 | 样本量相对有限,需要更大规模验证 | 探究食管鳞状细胞癌中上皮间质转化的分子异质性及其临床意义 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,TCGA数据 | 44名患者的39个肿瘤样本和16个癌旁样本,共209,231个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2025-10-06 |
Up-regulation of RAN by MYBL2 maintains osteosarcoma cancer stem-like cells population during heterogeneous tumor generation
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216708
PMID:38336287
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示骨肉瘤癌症干细胞通过MYBL2-RAN通路维持异质性肿瘤的分子机制 | 首次发现MYBL2转录上调RAN并通过增强MYC蛋白核积累促进癌症干细胞自我更新的正反馈机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索骨肉瘤癌症干细胞维持肿瘤异质性的调控机制 | 骨肉瘤癌症干细胞及其分化的异质性细胞群体 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床骨肉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2025-10-06 |
Inhibition of ATM promotes PD-L1 expression by activating JNK/c-Jun/TNF-α signaling axis in triple-negative breast cancer
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216642
PMID:38278470
|
研究论文 | 本研究揭示ATM通过抑制JNK/c-Jun/TNF-α信号轴负向调控PD-L1表达的新机制 | 首次发现ATM通过JNK/c-Jun/TNF-α信号通路负向调控PD-L1表达的分子机制 | 样本量有限(4例scRNA-seq,86例免疫组化),需更大规模研究验证 | 探索ATM调控PD-L1表达的分子机制及其在TNBC免疫治疗中的意义 | 三阴性乳腺癌细胞系、动物模型和临床标本 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组化染色,细胞因子阵列分析,Western blot,荧光素酶报告基因检测 | 基因敲低稳定细胞系,动物模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,临床病理数据 | 4例scRNA-seq临床标本,86例免疫组化TNBC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-06 |
Single-cell characterization of infiltrating T cells identifies novel targets for gallbladder cancer immunotherapy
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216675
PMID:38280478
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建胆囊癌浸润T细胞图谱并建立分子分型标准 | 首次基于T细胞特征建立胆囊癌分子分型标准,识别了12种T细胞亚型及其与肿瘤微环境的关系 | 未提及样本量大小和研究队列的局限性 | 探索胆囊癌中T细胞的异质性并开发免疫治疗新靶点 | 胆囊癌患者的浸润T细胞 | 单细胞生物学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-10-06 |
PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2
2024-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.15.589676
PMID:38659941
|
研究论文 | 研究发现小分子抑制剂RMC-113通过双重抑制PIP4K2C和PIKfyve脂质激酶,逆转SARS-CoV-2诱导的自噬流损伤,发挥广谱抗病毒作用 | 首次揭示PIP4K2C在SARS-CoV-2进入、RNA复制和组装/释放过程中的作用,并发现其与病毒非结构蛋白6结合调控自噬流 | NA | 开发广谱抗病毒药物并阐明其作用机制 | 人类肺类器官和多种RNA病毒包括SARS-CoV-2 | 病毒学 | COVID-19 | 脂质组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、功能测定 | NA | 分子数据、转录组数据、功能测定数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-06 |
DPSCs regulate epithelial-T cell interactions in oral submucous fibrosis
2024-04-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03720-5
PMID:38650025
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示口腔黏膜下纤维化中上皮细胞与T细胞的相互作用机制,并探索牙髓干细胞治疗潜力 | 发现具有促炎促纤维化功能的独特上皮细胞亚群Epi1.2,揭示MIF-CD74和CXCR4介导的上皮-T细胞相互作用机制,首次系统评估DPSCs治疗OSF的效果 | OSF致病机制尚未完全阐明,DPSCs临床应用效果需进一步验证 | 探索口腔黏膜下纤维化的致病机制并开发新的治疗策略 | 口腔黏膜组织、牙髓干细胞、动物模型 | 单细胞生物学 | 口腔黏膜下纤维化 | 单细胞RNA测序、组织染色、免疫组化、扫描电镜、原子力显微镜 | 动物模型 | 单细胞转录组数据、组织图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-10-06 |
An integrated toolkit for human microglia functional genomics
2024-04-10, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03700-9
PMID:38600587
|
研究论文 | 开发用于人类小胶质细胞功能基因组学的集成工具包,包括优化的iPSC分化方案和多组学分析平台 | 建立简化的两步20天分化流程,整合CRISPR-ON/OFF时序控制系统,并提供在线多组学数据比较平台 | 未提及与现有方法的直接比较数据,长期功能稳定性需要进一步验证 | 开发高效的人类小胶质细胞功能基因组学研究工具 | 人类iPSC衍生的小胶质细胞(iMG) | 功能基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, ATAC-Seq, 蛋白质组学, CRISPR-Cas9 | CRISPR-ON/OFF系统 | 转录组, 表观基因组, 蛋白质组, 功能测试数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 多组学分析 | NA | 在线可搜索平台(https://sherlab.shinyapps.io/IPSC-derived-Microglia/) |
| 115 | 2025-10-06 |
Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis
2024-04-30, Clinical oral investigations
IF:3.1Q1
DOI:10.1007/s00784-024-05659-6
PMID:38684576
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序在Coffin-Siris综合征患者中发现了一个新的SOX4基因从头突变,并探索了其在综合征性牙齿缺失中的作用机制 | 首次报道SOX4错义突变导致综合征性牙齿缺失,通过单细胞RNA测序和WGCNA分析验证了SOX4在牙齿发育中的关键作用 | 研究仅基于单个患者病例,样本量有限,需要更多病例验证 | 识别导致综合征性牙齿缺失的致病突变并探索其调控机制 | Coffin-Siris综合征患者和小鼠牙齿发育模型 | 遗传学 | Coffin-Siris综合征 | 全外显子测序, Sanger测序, 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, WGCNA分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 1名中国CSS患者和小鼠牙齿发育样本 | NA | 全外显子测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-10-06 |
Cannabidiol protects against acute aortic dissection by inhibiting macrophage infiltration and PMAIP1-induced vascular smooth muscle cell apoptosis
2024-04, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.02.006
PMID:38387723
|
研究论文 | 本研究探讨了大麻二酚通过抑制巨噬细胞浸润和PMAIP1诱导的血管平滑肌细胞凋亡来预防急性主动脉夹层的作用机制 | 首次揭示CBD通过调控巨噬细胞中PMAIP1表达来抑制血管平滑肌细胞线粒体依赖性凋亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未进行人体临床试验验证 | 探究大麻二酚对急性主动脉夹层的保护作用及其分子机制 | 小鼠急性主动脉夹层模型、人主动脉血管平滑肌细胞、M1巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 病理学检测, 体外共培养实验 | 动物疾病模型 | 基因表达数据, 病理图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals segregation of tumor cell states in glioblastoma and marked immunosuppression within the perinecrotic niche
2024-04-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01769-0
PMID:38650010
|
研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤细胞状态的空间分离模式以及坏死周围区域的免疫抑制特征 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术,系统揭示了胶质母细胞瘤中不同肿瘤细胞状态的空间分布规律及坏死周围区域的免疫抑制微环境 | 研究仅包含3例患者样本,样本量较小,可能限制结果的普适性 | 探究胶质母细胞瘤微环境中细胞类型和肿瘤细胞状态的空间分布特征 | 胶质母细胞瘤患者组织样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 3例胶质母细胞瘤患者 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学平台 |
| 118 | 2025-10-06 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2024-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579846
PMID:38370670
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次发现FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞代谢重编程和动脉分化的新功能 | 研究主要基于动物模型,在人类患者中的验证仍需进一步深入 | 探究肺动脉高压发病的细胞分子机制并寻找新的治疗靶点 | 肺动脉内皮细胞、肺动脉高压动物模型和IPAH患者样本 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 特发性PAH患者、肺动脉高压大鼠和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-10-06 |
col1a2+ fibroblasts/muscle progenitors finetune xanthophore countershading by differentially expressing csf1a/1b in embryonic zebrafish
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9637
PMID:38578990
|
研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼胚胎中成纤维细胞和肌肉祖细胞通过差异表达csf1a/1b调控黄色素细胞反荫蔽色素模式的机制 | 首次发现col1a2+成纤维细胞和肌肉祖细胞通过空间差异表达csf1a和csf1b来精细调控黄色素细胞的反荫蔽色素模式 | NA | 探究斑马鱼胚胎中反荫蔽色素模式形成的调控机制 | 斑马鱼胚胎的黄色素细胞和col1a2+细胞群体 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,基因突变,细胞消融,异位表达 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-06 |
Identification and validation of an immunotherapeutic signature for colon cancer based on the regulatory patterns of ferroptosis and their association with the tumor microenvironment
2024-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119698
PMID:38387508
|
研究论文 | 本研究基于铁死亡调控模式构建了结肠癌免疫治疗特征,并验证其与肿瘤微环境的关联 | 首次系统识别结肠癌中铁死亡的三种调控模式,构建FRG-score量化体系,发现APOL6作为铁死亡相关药物敏感靶点 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 开发基于铁死亡调控模式的结肠癌免疫治疗特征 | 结肠癌样本和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 1623个结肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |