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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-07 |
Integrative analysis unveils ECM signatures and pathways driving hepatocellular carcinoma progression: A multi-omics approach and prognostic model development
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18230
PMID:38568083
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示细胞外基质在肝细胞癌进展中的特征和作用机制,并开发了基于ECM的预后模型 | 整合单细胞转录组分析和多组学数据,系统揭示ECM在LIHC免疫浸润和预后分层中的新作用,并构建了有效的ECM预后模型 | 样本量相对有限(10个LIHC样本),需要在更大队列中进一步验证 | 探索细胞外基质在肝细胞癌进展中的作用机制并开发预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本、肝癌细胞系 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 侵袭实验, Transwell实验 | Lasso回归 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 10个LIHC样本(单细胞数据), TCGA-LIHC队列, CheckMate研究独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and RNA-seq data to explore the role of focal adhesion-related genes in osteoporosis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18271
PMID:38534087
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研究论文 | 通过整合单细胞和RNA测序数据探索黏着斑相关基因在骨质疏松症中的作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序和RNA测序数据识别出与骨质疏松相关的两个关键基因FAM129A和RNF24 | 研究样本量有限,仅基于GSE56815和GSE56116两个队列数据 | 挖掘与黏着斑相关的枢纽基因并研究其在骨质疏松症中的作用 | 骨质疏松症患者样本、小鼠模型、人类血液样本 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个基因表达数据集(GSE56815和GSE56116) | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-10-07 |
Histone modification-linked prognostic model for ovarian cancer reveals LBX2 as a novel growth promoter
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18260
PMID:38520216
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研究论文 | 本研究构建了基于组蛋白修饰相关基因的卵巢癌预后模型,并发现LBX2作为新的生长促进因子 | 首次将组蛋白修饰相关基因与卵巢癌预后关联,并鉴定LBX2为新的卵巢癌增殖促进因子 | 研究基于回顾性数据,需要进一步实验验证 | 探索组蛋白修饰相关基因在卵巢癌预后预测中的作用 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序 | Lasso回归 | 转录组数据 | 多个队列的卵巢癌患者数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2025-10-07 |
Prognostic and immunotherapeutic potential of regulatory T cell-associated signature in ovarian cancer
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18248
PMID:38520220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别Treg相关生物标志物,开发了卵巢癌预后模型并评估其免疫治疗潜力 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习算法构建Treg相关特征评分,用于卵巢癌预后预测和免疫治疗反应评估 | 需要进一步的外部验证和临床转化研究 | 探索调节性T细胞相关基因在卵巢癌中的预后价值和免疫治疗潜力 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | 随机生存森林(RSF), LASSO | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但识别了365个Treg相关基因 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2025-10-07 |
Construction of a prognostic model with CAFs for predicting the prognosis and immunotherapeutic response of lung squamous cell carcinoma
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18262
PMID:38520221
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研究论文 | 本研究构建了基于癌症相关成纤维细胞(CAFs)的预后模型,用于预测肺鳞状细胞癌(LUSC)的预后和免疫治疗反应 | 首次在LUSC中系统分类CAFs亚型并构建包含9个CAF相关基因的预后特征模型 | CAFs在LUSC中的功能复杂且不确定,需要进一步验证 | 开发预测LUSC预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 肺鳞状细胞癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单变量Cox分析, 多变量Cox分析, ssGSEA, Kaplan-Meier分析 | Cox比例风险模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-10-07 |
Autofluorescence is a biomarker of neural stem cell activation state
2024-Apr-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.02.011
PMID:38521057
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研究论文 | 本研究利用自发荧光成像技术识别神经干细胞静息和激活状态的生物标志物 | 首次发现静息神经干细胞在特定溶酶体亚群中富集自发荧光,可作为单细胞水平预测干细胞行为的梯度标志物 | 研究仅限于小鼠神经干细胞,技术应用范围需进一步验证 | 开发非破坏性活细胞成像方法追踪神经干细胞激活状态 | 小鼠神经干细胞 | 细胞生物学 | NA | 荧光寿命成像(FLIM), 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2025-10-07 |
Air Pollutants and Mortality Risk in Patients with Aortic Dissection: Evidence from a Clinical Cohort, Single-Cell Sequencing, and Proteomics
2024-Apr-16, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.4c00534
PMID:38561599
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研究论文 | 本研究通过临床队列、单细胞测序和蛋白质组学探讨空气污染物与主动脉夹层患者死亡风险的关联及机制 | 首次结合临床队列、单细胞测序和蛋白质组学多维度揭示PM2.5通过肥大细胞激活和脱颗粒影响主动脉夹层预后的机制 | 研究为观察性设计,不能确定因果关系;空气污染物数据来自监测站而非个人暴露水平 | 评估空气污染物与急性主动脉夹层患者死亡风险的关联并探索潜在机制 | 1,267例急性主动脉夹层患者及主动脉组织样本 | 临床医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 蛋白质组学, 多变量Cox回归模型 | Cox回归模型 | 临床数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 1,267例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-07 |
An ultra high-throughput, massively multiplexable, single-cell RNA-seq platform in yeasts
2024-04, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.3927
PMID:38282330
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研究论文 | 本研究优化了适用于酵母的超高通量单细胞RNA测序平台SPLiT-seq,实现了大规模并行转录组分析 | 开发了基于组合条形码策略的酵母单细胞RNA测序方法,无需物理隔离细胞即可同时处理数百种基因型或生长条件 | 方法主要针对酵母物种开发,在其他生物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发高效、低成本的酵母单细胞转录组测序技术 | 多种物种和倍性的酵母细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序( scRNAseq),SPLiT-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 43,388个酵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | SPLiT-seq | 基于分裂池连接转录组测序的单细胞RNA测序平台 |
| 109 | 2025-10-07 |
Profibrotic VEGFR3-Dependent Lymphatic Vessel Growth in Autoimmune Valvular Carditis
2024-04, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320326
PMID:38269589
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研究论文 | 本研究揭示了自身免疫性瓣膜炎中VEGFR3依赖性淋巴管生长的新机制及其与心脏纤维化的关联 | 首次发现瓣膜表面内皮细胞在疾病进展中形成新生毛细淋巴管,并鉴定出具有促纤维化转录特征的新型淋巴瓣膜内皮细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究内皮细胞在风湿性心脏病发病机制中的作用 | K/B.g7自身免疫性瓣膜炎小鼠模型和人类风湿性心脏病患者的二尖瓣组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色,组织学分析,超声心动图 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠模型和人类二尖瓣置换术患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-07 |
Characterizing the T Cell Repertoire in the Proximal Airway in Health and Disease
2024-04, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.31088
PMID:37787469
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较声门下狭窄患者与健康对照组近端气道T细胞受体库的多样性和特征 | 首次在单细胞水平上系统比较声门下狭窄疾病与健康状态下近端气道T细胞受体库的多样性和克隆性特征 | 高频克隆型的目标抗原仍未解析,样本量相对有限(iSGS n=24, iLTS n=8, 对照组 n=7) | 验证声门下狭窄病例是否具有较低多样性(高度克隆性)的适应性免疫反应假说 | 声门下狭窄患者(iSGS和iLTS)与健康对照组的近端气道黏膜组织 | 免疫学 | 声门下狭窄 | 单细胞RNA测序,T细胞受体序列分析 | Immunarch生物信息学流程 | 单细胞RNA测序数据,T细胞受体序列数据 | iSGS患者24例,iLTS患者8例,健康对照组7例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-07 |
Silencing XIST on the future active X: Searching human and bovine preimplantation embryos for the repressor
2024-Apr, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-022-01115-9
PMID:35585273
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研究论文 | 本研究通过分析人类和牛早期胚胎的单细胞RNA测序数据,探索X染色体上XIST基因在活性X染色体上的抑制机制 | 首次在人类和牛早期胚胎中同时研究XIST在活性X染色体上的抑制机制,并确定了与XIST抑制相关的候选基因 | 研究主要基于转录组数据分析,需要进一步的实验验证候选基因的具体功能机制 | 探索活性X染色体如何避免被自身XIST基因沉默的分子机制 | 人类和牛的早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 人类和牛早期胚胎(4-8细胞期、桑椹胚期、早期囊胚期) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-10-07 |
Potential Therapeutic Targets for Hypotension in Duchenne Muscular Dystrophy
2024-Apr, Medical hypotheses
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.mehy.2024.111318
PMID:38585412
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现KCNQ5和RyR2基因可能是导致杜氏肌营养不良患者低血压的潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出KCNQ5和RyR2基因在DMD突变小鼠血管平滑肌细胞中的显著上调表达 | 研究机制尚不明确,且主要基于小鼠模型数据 | 探索杜氏肌营养不良患者低血压的分子机制和潜在治疗靶点 | 杜氏肌营养不良突变小鼠的血管平滑肌细胞 | 单细胞测序分析 | 杜氏肌营养不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-ome regression models identify functional and disease-associated enhancers and enable chromatin potential analysis
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01689-8
PMID:38514783
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研究论文 | 开发了一种名为SCARlink的单细胞多组学回归模型,用于预测基因表达并将增强子与靶基因关联 | 使用正则化泊松回归对瓦片水平可及性数据进行建模,避免了传统基因-峰相关性分析和峰值调用的限制 | NA | 建立基因水平调控模型,识别功能性增强子并分析染色质潜能 | 单细胞多组学测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学测序 | 正则化泊松回归 | 基因组可及性数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 114 | 2025-10-07 |
β-Catenin in Dendritic Cells Negatively Regulates CD8 T Cell Immune Responses through the Immune Checkpoint Molecule Tim-3
2024-Apr-25, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines12050460
PMID:38793711
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研究论文 | 本研究揭示了树突状细胞中β-连环蛋白通过上调免疫检查点分子Tim-3抑制CD8 T细胞免疫应答的新机制 | 首次发现β-catenin/Tim-3轴在树突状细胞中负调控CD8 T细胞免疫应答,并证明抗Tim-3抗体与DC疫苗联合治疗的协同抗肿瘤效果 | 机制研究仍需深入,临床前模型需进一步验证 | 探究树突状细胞中β-连环蛋白调控CD8 T细胞免疫应答的分子机制 | 树突状细胞、CD8 T细胞、黑色素瘤模型小鼠 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、免疫组化、动物模型 | NA | 基因表达数据、免疫应答数据 | CD11c-β-catenin基因工程小鼠、B16F10荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-10-07 |
IQGAP2 regulates blood-brain barrier immune dynamics
2024-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.07.527394
PMID:38645082
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研究论文 | 本研究揭示了IQGAP2蛋白在调控血脑屏障免疫特权和免疫细胞进入中枢神经系统中的关键作用 | 首次发现IQGAP2作为支架蛋白在调控血脑屏障免疫动态中的核心功能,并证明其在阿尔茨海默病患者海马体中表达降低 | IQGAP2调控免疫细胞浸润的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究IQGAP2蛋白如何调控血脑屏障的免疫细胞浸润 | 小鼠、斑马鱼模型以及人类组织样本 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | 小鼠和斑马鱼模型,人类阿尔茨海默病组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-10-07 |
Dupilumab-associated head and neck dermatitis shows a pronounced type 22 immune signature mediated by oligoclonally expanded T cells
2024-Apr-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46540-0
PMID:38565563
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析dupilumab相关头颈部皮炎,揭示其独特的22型免疫特征 | 首次发现dupilumab治疗伴随T细胞寡克隆扩增驱动的22型免疫反应过度激活 | 样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 探究dupilumab相关头颈部皮炎的发生机制 | dupilumab相关头颈部皮炎患者皮肤活检组织 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自DAHND、未治疗AD和健康对照的皮肤穿刺活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-07 |
Molecular differences between neonatal and adult stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.24.590986
PMID:38712156
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研究论文 | 本研究通过建立新生和成年小鼠血管纹器官型外植体模型并结合单细胞RNA测序,揭示了血管纹发育和维持的关键分子差异 | 首次建立了保留血-迷路屏障完整性的新生和成年血管纹器官型外植体模型,并结合单细胞RNA测序揭示了发育特异性基因表达谱 | 研究主要基于小鼠模型,人类血管纹可能存在物种特异性差异 | 研究血管纹在发育和成熟过程中的分子差异,为听力损失治疗提供新见解 | 新生和成年小鼠的血管纹组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序,器官型外植体培养,药理学干预 | 小鼠器官型外植体模型 | 单细胞转录组数据,组织学数据 | 新生和成年小鼠血管纹组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-07 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588538
PMID:38645090
|
研究论文 | 本研究构建了首个小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱,揭示了该组织的细胞组成和功能特征 | 首次创建小鼠精囊的单细胞转录组图谱,系统定义了分泌细胞和免疫细胞群体 | NA | 研究精囊组织的细胞组成和功能,探索其在生殖过程中的作用 | 小鼠精囊组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23只不同年龄和饮食条件的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-10-07 |
Seq-Scope Protocol: Repurposing Illumina Sequencing Flow Cells for High-Resolution Spatial Transcriptomics
2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.29.587285
PMID:38617262
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研究论文 | 介绍Seq-Scope协议,将Illumina测序流动池重新用于高分辨率空间转录组学分析 | 开发了将Illumina测序平台重新用于高分辨率、高通量空间转录组分析的新方法 | 需要Illumina NovaSeq 6000等专业设备,方法复杂度较高 | 建立高分辨率空间转录组学分析协议 | 多种生物组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 无分割分析方法 | 图像, 转录组数据 | NA | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina测序流动池,支持7 mm × 7 mm或更大区域的多组织切片分析 |
| 120 | 2025-10-07 |
Inflammatory recruitment of healthy hematopoietic stem and progenitor cells in the acute myeloid leukemia niche
2024-04, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02136-7
PMID:38228679
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研究论文 | 本研究揭示了健康造血干细胞和祖细胞在急性髓系白血病微环境中通过炎症反应主动参与疾病进程 | 首次发现HSPCs是白血病细胞介导骨髓炎症适应的未知组成部分,并证明AML来源的细胞外囊泡足以触发这种炎症反应 | 研究基于两种同源AML模型,结果在人类AML中的适用性需要进一步验证 | 探究健康造血干细胞和祖细胞在AML骨髓微环境炎症反应中的作用机制 | 造血干细胞和祖细胞(HSPCs)、急性髓系白血病细胞 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、骨髓血浆分泌组分析、细胞外囊泡研究 | NA | 基因表达数据、蛋白质分泌数据 | 两种同源AML模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |