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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Inhibition of ATR opposes glioblastoma invasion through disruption of cytoskeletal networks and integrin internalization via macropinocytosis
2024-04-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad210
PMID:37936324
|
研究论文 | 本研究揭示了抑制ATR激酶可通过破坏细胞骨架网络和整合素内存作用来抑制胶质母细胞瘤的侵袭 | 首次发现ATR在胶质母细胞瘤侵袭中的新作用机制,涉及细胞骨架调控和巨胞饮介导的整合素内存 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行临床试验验证 | 探索ATR抑制对胶质母细胞瘤侵袭的抑制作用及其分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 延时显微镜、超高分辨率成像、活体成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 两种原位胶质母细胞瘤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Immune microniches shape intestinal Treg function
2024-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07251-0
PMID:38570678
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研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学技术揭示了肠道免疫微环境如何塑造调节性T细胞功能 | 首次结合活体成像、光激活引导的单细胞RNA测序和空间转录组学技术,追踪肠道内微生物反应性T细胞在耐受和炎症状态下的时空动态 | 研究主要聚焦于Helicobacter hepaticus反应性T细胞,可能不适用于所有肠道微生物群 | 阐明肠道免疫微环境如何维持对共生微生物的耐受性机制 | 肠道调节性T细胞和效应T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠道疾病 | 活体成像, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas enables mapping of homeostatic cellular shifts in the adult human breast
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01688-9
PMID:38548988
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了包含55名捐赠者的人类乳腺细胞图谱,揭示了乳腺组织稳态的细胞变化 | 首次系统性地绘制了成人乳腺单细胞图谱,发现BRCA1/2携带者的免疫细胞具有独特的基因表达特征 | 样本主要来自整形手术和风险降低乳房切除术患者,可能无法完全代表普通人群 | 构建人类乳腺细胞图谱并研究影响乳腺癌风险的细胞稳态变化 | 55名接受乳房缩小术或风险降低乳房切除术的捐赠者的乳腺组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫组织化学数据 | 55名捐赠者,超过800,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-Apr, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
|
综述 | 提出一个多物种多组学整合分析框架,用于推动心血管再生治疗靶点的发现 | 首次提出结合多物种、多组学和荟萃分析的系统性框架来识别心血管再生靶点 | NA | 开发促进心血管再生的新策略靶点 | 健康和损伤心脏的多物种样本(不同发育阶段) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Synovial fibroblast gene expression is associated with sensory nerve growth and pain in rheumatoid arthritis
2024-04-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adk3506
PMID:38598614
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别与类风湿关节炎疼痛相关的滑膜成纤维细胞基因表达模块,并验证其促进疼痛感觉神经生长的机制 | 开发了基于图的基因表达模块识别方法,首次发现滑膜衬里层成纤维细胞基因表达与疼痛感觉神经生长的直接关联 | 研究样本主要来自炎症程度较低的类风湿关节炎患者,结果在高度炎症情况下的适用性需进一步验证 | 探究类风湿关节炎疼痛机制与滑膜成纤维细胞基因表达的关系 | 类风湿关节炎患者的滑膜活检样本、滑膜成纤维细胞、背根神经节神经元 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、机器学习、受体-配体相互作用分析 | GbGMI(基于图的基因表达模块识别) | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 两个独立队列的类风湿关节炎患者滑膜活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Multimodal Analytical Tools to Enhance Mechanistic Understanding of Aortic Valve Calcification
2024-04, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2023.06.017
PMID:37517686
|
综述 | 本文综述了用于增强主动脉瓣钙化机制理解的多模态分析工具 | 整合转录组学、蛋白质组学和分子成像技术,构建研究钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)的整体方法,具有识别新调控通路的潜力 | NA | 推进钙化性主动脉瓣疾病和药物靶点研究 | 钙化性主动脉瓣疾病(CAVD) | 生物医学研究 | 心血管疾病 | 转录组学, 蛋白质组学, 分子成像, 正电子发射断层扫描/计算机断层扫描 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
Characterizing Spatially Continuous Variations in Tissue Microenvironment through Niche Trajectory Analysis
2024-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.23.590827
PMID:38712255
|
研究论文 | 提出一种基于图神经网络的空间微环境连续变化分析方法ONTraC | 首次开发基于图神经网络的生态位轨迹构建方法,能够系统表征组织微环境的空间连续变化 | NA | 分析组织微环境的空间连续变化特征 | 组织微环境、胚胎发育过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络(GNN) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
scRNA-seq analysis of cells comprising the amphioxus notochord
2024-04, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.003
PMID:38224933
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析文昌鱼脊索细胞的组成和功能特性 | 首次在单细胞水平揭示文昌鱼脊索细胞的基因表达特征,发现脊索特异性肌原纤维基因和不同类型Müller细胞的功能分化 | 未涉及其他脊索动物物种的比较分析,样本来源相对单一 | 解析脊索细胞的组成特性和功能分化 | 文昌鱼脊索细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, Iso-seq分析, 原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Neutrophils facilitate the epicardial regenerative response after zebrafish heart injury
2024-04, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.011
PMID:38286185
|
研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞在斑马鱼心脏损伤后通过激活FGF和MAPK/ERK信号通路促进心外膜再生反应的新机制 | 首次发现中性粒细胞作为早期响应细胞通过分泌hbegfa配体协同FGF和MAPK/ERK信号通路激活心外膜细胞增殖和扩张 | 研究仅限于斑马鱼模型,未在哺乳动物系统中验证 | 探究中性粒细胞在斑马鱼心脏再生早期事件中的功能和作用机制 | 斑马鱼心脏损伤模型中的中性粒细胞和心外膜细胞 | 发育生物学 | 心脏损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1天心脏损伤后的中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-07 |
Spatial co-transcriptomics reveals discrete stages of the arbuscular mycorrhizal symbiosis
2024-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01666-3
PMID:38589485
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组技术揭示了植物与丛枝菌根真菌共生关系的细胞和空间动态过程 | 首次在细胞和空间分辨率水平整合分析植物和真菌转录组,揭示了皮层细胞在不同定殖阶段的动态转录组特征 | 研究仅限于两种模式生物,且技术方法可能无法完全捕获所有细胞类型的转录信息 | 探索植物与丛枝菌根真菌共生关系的分子机制 | 蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)和根内球囊霉(Rhizophagus irregularis) | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-07 |
ALDH2 as an immunological and prognostic biomarker: Insights from pan-cancer analysis
2024-Apr-19, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037820
PMID:38640328
|
研究论文 | 通过泛癌分析揭示ALDH2作为免疫和预后生物标志物的潜力 | 首次在泛癌水平系统分析ALDH2表达与免疫细胞浸润的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 评估ALDH2在泛癌中的生物学意义和临床价值 | 多种癌症类型和正常组织 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞测序、免疫组化染色、生物信息学分析 | 多种算法(EPIC, MCPCOUNTER, TIDTIMER, xCell, CIBERSORT, quanTIseq) | 基因组数据、表达数据、临床数据 | TCGA等多数据库的泛癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-10-07 |
Integrated cancer cell-specific single-cell RNA-seq datasets of immune checkpoint blockade-treated patients
2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.17.576110
PMID:38328153
|
研究论文 | 整合了免疫检查点阻断治疗患者的癌细胞特异性单细胞RNA-seq数据集 | 整合了来自9种癌症类型、174名患者的8个scRNA-seq数据集,创建了专门用于研究癌细胞对ICB治疗反应的独特资源 | 样本量相对有限,数据来源于已有的研究数据集 | 研究不同癌症类型中癌细胞对免疫检查点阻断治疗的反应机制 | 癌细胞 | 单细胞组学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 174名患者,90,270个癌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-10-07 |
How Mycobacterium tuberculosis builds a home: Single-cell analysis reveals M. tuberculosis ESX-1-mediated accumulation of anti-inflammatory macrophages in infected mouse lungs
2024-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.20.590421
PMID:38712150
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究结核分枝杆菌ESX-1系统在感染小鼠肺部调控单核吞噬细胞异质性和抗炎反应的作用机制 | 首次揭示ESX-1系统通过招募和分化抗炎性单核吞噬细胞帮助结核分枝杆菌建立生存环境的机制 | 研究仅使用小鼠和鼠源骨髓衍生巨噬细胞模型,未在人体样本中验证 | 探究结核分枝杆菌ESX-1分泌系统对宿主单核吞噬细胞招募和分化的调控作用 | 感染结核分枝杆菌的小鼠肺部组织和鼠骨髓衍生巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠肺部组织和骨髓衍生巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-07 |
Multimodal hierarchical classification of CITE-seq data delineates immune cell states across lineages and tissues
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.06.547944
PMID:37461466
|
研究论文 | 提出一种基于标记的多模态分类方法MMoCHi,用于整合CITE-seq数据中的基因和蛋白表达信息进行细胞类型注释 | 开发了不依赖参考图谱的多模态层次分类方法,能够识别传统方法难以解析的免疫细胞亚群并发现新的亚群标记 | NA | 开发能够整合多模态单细胞数据的细胞类型分类方法 | 免疫细胞,特别是T淋巴细胞亚群和跨组织人类免疫细胞 | 生物信息学 | NA | CITE-seq,单细胞RNA测序 | 基于标记的分类器 | 单细胞转录组数据,表面蛋白组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-07 |
Restoration of neuronal progenitors by partial reprogramming in the aged neurogenic niche
2024-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00594-3
PMID:38553564
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学系统分析部分重编程对老年小鼠脑室下区神经发生生态位的影响 | 首次揭示部分重编程可特异性恢复老年神经发生生态位中的神经母细胞比例,并证明其改善作用具有生态位内在性 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性仍需验证 | 探索部分重编程对老年大脑神经发生生态位的影响机制 | 老年小鼠的脑室下区神经发生生态位和神经干细胞培养物 | 神经科学 | 老年性脑功能衰退 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年小鼠神经发生生态位和神经干细胞培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-07 |
Lipoxin A 4 /FPR2 signaling mitigates ferroptosis of alveolar epithelial cells via NRF2-dependent pathway during lung ischemia-reperfusion injury
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590127
PMID:38712069
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研究论文 | 本研究探讨了肺泡上皮细胞中铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用及Lipoxin A4/FPR2信号通路的保护机制 | 首次揭示了Lipoxin A4通过FPR2受体激活NRF2通路抑制肺泡上皮细胞铁死亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的转化价值需进一步验证 | 探究铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的细胞特异性作用及Lipoxin A4的保护机制 | 肺移植患者样本、C57BL/6小鼠、Fpr2-/-和Nrf2-/-基因敲除小鼠、肺泡II型上皮细胞 | 分子生物学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、基因敲除模型、原位肺移植模型、体外细胞研究 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、生理指标、生化指标 | 未明确样本数量,包含患者组织样本和多个小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals genome evolution in predatory litostomatean ciliates
2024-Apr, European journal of protistology
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.ejop.2024.126062
PMID:38368736
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示捕食性裂口纲纤毛虫的基因组进化机制 | 首次对六种捕食性裂口纲纤毛虫进行单细胞转录组测序,发现与跨膜活性和氧化应激反应相关的基因家族扩张及三次全基因组复制事件 | 样本数量有限(仅六种捕食性物种),基因组进化机制仍需功能验证 | 探究纤毛虫捕食能力的遗传进化基础 | 六种捕食性裂口纲纤毛虫 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 6种捕食性裂口纲纤毛虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-07 |
IL-12/IL23 blockade reveals patterns of asynchronous inflammation in pyoderma gangrenosum
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.591387
PMID:38746177
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示坏疽性脓皮病的炎症特征及IL-12/IL-23阻断治疗的分子机制 | 首次发现坏疽性脓皮病皮损中存在B细胞大量浸润和三级淋巴结构形成,并揭示IL-12/IL-23阻断治疗对不同炎症通路的差异化影响 | 研究样本量较小(仅2名患者),需要更大规模研究验证发现 | 阐明坏疽性脓皮病的免疫失调机制及IL-12/IL-23阻断治疗的分子作用 | 坏疽性脓皮病患者皮损组织 | 空间转录组学 | 坏疽性脓皮病 | 空间转录组学,比较计算分析 | NA | 空间转录组数据 | 2名患者的治疗前后皮损活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-07 |
Nanoceria-Mediated Cyclosporin A Delivery for Dry Eye Disease Management through Modulating Immune-Epithelial Crosstalk
2024-04-30, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c11514
PMID:38632691
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研究论文 | 开发了一种基于纳米酶的滴眼液,通过调节免疫-上皮细胞相互作用来治疗干眼病 | 首次开发具有长期抗氧化和抗炎能力的纳米酶滴眼液,能够同时打破氧化应激-炎症恶性循环并调节细胞间通讯 | 未提及临床研究阶段及具体样本量限制 | 开发干眼病的新型治疗方法 | 干眼病的治疗机制研究 | 生物医学工程 | 干眼病 | 流式细胞术、单细胞测序 | NA | 测序数据、细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-07 |
Interleukin-1β polarization in M1 macrophage mediates myocardial fibrosis in diabetes
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111858
PMID:38492336
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研究论文 | 本研究探讨了M1巨噬细胞通过白细胞介素-1β介导糖尿病心肌纤维化的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示糖尿病发展中巨噬细胞M1极化通过IL-1β促进心肌纤维化的具体机制 | 研究仅限于db/db小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究巨噬细胞在糖尿病心肌纤维化中的作用机制 | db/db糖尿病模型小鼠的心脏组织 | 单细胞组学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序, 超声心动图, Masson三色染色, 细胞共培养 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 不同糖尿病阶段的db/db小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |