单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 498 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-11-26 |
Extracellular cancer‑associated fibroblasts: A novel subgroup in the cervical cancer microenvironment that exhibits tumor‑promoting roles and prognosis biomarker functions
2024-Apr, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2024.14300
PMID:38449793
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析宫颈癌微环境中CAF的异质性，并发现了一种新的亚群ecCAFs，具有促肿瘤作用和预后生物标志物功能 | 首次通过单细胞RNA测序将宫颈癌微环境中的CAF分为myCAFs和ecCAFs，并发现ecCAFs具有更强的促肿瘤作用 | 研究样本量较小，仅基于五个宫颈癌样本进行分析 | 评估宫颈癌微环境中CAF的异质性，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 宫颈癌微环境中的CAF及其在肿瘤进展中的作用 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 五个宫颈癌样本 |
| 82 | 2024-11-24 |
The neuroendocrine transition in prostate cancer is dynamic and dependent on ASCL1
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.09.588557
PMID:38645223
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研究论文 | 研究描述了前列腺癌中神经内分泌转变的动态过程及其依赖于ASCL1的分子机制 | 开发了一个多功能平台，用于识别和研究前列腺癌进展不同阶段神经内分泌谱系转化的分子决定因素 | 研究主要集中在小鼠模型和特定基因的缺失上，可能不完全适用于人类疾病 | 揭示前列腺癌中神经内分泌谱系转化的分子机制及其对治疗结果的影响 | 前列腺癌中的神经内分泌转变及其分子机制 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 多重免疫荧光、空间转录组学、PrismSpot | NA | 基因表达数据 | 小鼠前列腺器官样本 |
| 83 | 2024-11-21 |
RNA splicing analysis deciphers developmental hierarchies and reveals therapeutic targets in adult glioma
2024-Apr-25, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173789
PMID:38662454
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研究论文 | 本文通过计算方法分析了成人胶质瘤中的RNA可变剪接（AS），揭示了与神经发育层次相关的预后AS特征，并探讨了其治疗潜力 | 本文首次揭示了AS特征与神经发育层次的关联，并验证了PTBP1作为AS特征的关键调控因子，为胶质瘤治疗提供了新的靶点 | 本文主要依赖于计算分析和体外模型验证，尚未在临床样本中进行全面验证 | 探讨成人胶质瘤中RNA可变剪接的调控机制及其在治疗中的潜在应用 | 成人胶质瘤中的RNA可变剪接及其调控因子 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及大量和单细胞RNA测序数据，具体样本数量未明确提及 |
| 84 | 2024-11-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular landscape of fetal cystic hygroma
2024-04-22, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01859-x
PMID:38650036
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组测序技术揭示了胎儿囊性水囊瘤的细胞和分子景观 | 首次报道了胎儿囊性水囊瘤中单细胞的转录组变化，并揭示了淋巴内皮细胞在其中的富集以及VEGF信号通路的激活 | 本研究仅限于CH患者的淋巴组织，未涵盖其他可能的相关组织或细胞类型 | 探讨胎儿囊性水囊瘤的分子机制，特别是细胞亚群的转录组特征和VEGF信号通路的作用 | 胎儿囊性水囊瘤患者的淋巴组织 | 数字病理学 | 胎儿疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | CH患者和对照捐赠者的淋巴组织样本 |
| 85 | 2024-11-21 |
Revealing Prdx4 as a potential diagnostic and therapeutic target for acute pancreatitis based on machine learning analysis
2024-04-19, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01854-2
PMID:38641608
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研究论文 | 本研究通过机器学习分析揭示了Prdx4作为急性胰腺炎的潜在诊断和治疗靶点 | 首次使用LASSO和SVM-RFE机器学习方法筛选出Prdx4作为急性胰腺炎的潜在生物标志物，并通过免疫组织化学和重组Prdx4治疗验证了其治疗潜力 | 研究样本量较小，且仅限于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探索急性胰腺炎的关键基因，以实现有效的诊断和治疗 | 急性胰腺炎及其相关基因Prdx4 | 机器学习 | 急性胰腺炎 | LASSO, SVM-RFE, ssGSEA, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 1357个差异表达基因, 小鼠胰腺组织样本 |
| 86 | 2024-08-07 |
2024-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.534
PMID:38585235
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研究论文 | 本研究通过诱导实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）模型，探讨了视网膜小胶质细胞在疾病发展中的动态变化及其在调节免疫反应中的作用 | 首次在EAU模型中识别出一种新的炎症亚型视网膜小胶质细胞，并揭示了CD74和CCL5在调节其炎症表型中的作用 | NA | 探讨自身免疫性葡萄膜炎发病机制及寻找潜在治疗策略 | 视网膜免疫细胞及小胶质细胞的动态变化 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 在EAU小鼠模型中，对四个时间点的视网膜免疫细胞进行了单细胞RNA测序 |
| 87 | 2024-11-17 |
Osimertinib in combination with anti-angiogenesis therapy presents a promising option for osimertinib-resistant non-small cell lung cancer
2024-04-24, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03389-w
PMID:38658988
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研究论文 | 本文探讨了奥希替尼联合抗血管生成疗法在奥希替尼耐药的非小细胞肺癌患者中的应用 | 提出了奥希替尼联合抗血管生成疗法作为奥希替尼耐药非小细胞肺癌的新治疗策略 | 研究为回顾性研究，且样本量有限 | 探讨奥希替尼联合抗血管生成疗法在奥希替尼耐药非小细胞肺癌患者中的疗效 | 奥希替尼耐药的非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 111例晚期非小细胞肺癌患者 |
| 88 | 2024-11-10 |
High throughput functional profiling of genes at intraocular pressure loci reveals distinct networks for glaucoma
2024-04-18, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae003
PMID:38272457
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研究论文 | 研究通过基因敲除和高通量功能分析，揭示了与青光眼相关基因的网络 | 首次在单细胞水平上通过高通量分析研究了基因敲除对眼内压相关基因的影响，并识别出三个具有相似转录组特征的基因网络 | 研究仅限于特定的细胞系和基因敲除，可能无法完全代表所有青光眼病例 | 旨在识别与原发性开角型青光眼相关的遗传和形态变异 | 原发性开角型青光眼相关的基因和细胞形态 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像和基因表达数据 | 62个基因在55个位点的敲除，包括五个非靶向对照组 |
| 89 | 2024-11-08 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-Apr, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在多物种和多发育阶段中研究健康和受损心脏的发现，并提出了一种多物种、多组学的元分析框架，以推动心血管再生新靶点的发现 | 提出了一个多物种、多组学的元分析框架，以推动心血管再生新靶点的发现 | NA | 推动心血管再生新靶点的发现 | 健康和受损心脏的细胞转录组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组 | 多物种和多发育阶段的样本 |
| 90 | 2024-11-08 |
Histone modification-linked prognostic model for ovarian cancer reveals LBX2 as a novel growth promoter
2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18260
PMID:38520216
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白修饰相关基因在卵巢癌患者预后预测中的作用 | 构建了基于组蛋白修饰相关基因的风险评分模型，并发现LBX2作为卵巢癌的新型生长促进因子 | NA | 研究组蛋白修饰相关基因在卵巢癌预后预测中的作用 | 卵巢癌患者的预后预测 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | Lasso回归 | 转录组数据 | 多个队列的bulk RNA-Seq数据和单细胞scRNA-Seq数据 |
| 91 | 2024-11-08 |
Prognostic and immunotherapeutic potential of regulatory T cell-associated signature in ovarian cancer
2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18248
PMID:38520220
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研究论文 | 本文研究了卵巢癌中调节性T细胞相关基因的预后和免疫治疗潜力 | 利用单细胞RNA测序和机器学习算法，开发了一种新的调节性T细胞相关签名（TAS），用于预测卵巢癌患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 探讨调节性T细胞在卵巢癌中的预后和免疫治疗潜力 | 卵巢癌患者的调节性T细胞相关基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林（RSF）和最小绝对收缩与选择算子（LASSO） | 基因表达数据 | 365个调节性T细胞相关基因，其中70个与卵巢癌预后相关 |
| 92 | 2024-11-08 |
Construction of a prognostic model with CAFs for predicting the prognosis and immunotherapeutic response of lung squamous cell carcinoma
2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18262
PMID:38520221
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研究论文 | 构建基于癌症相关成纤维细胞（CAFs）的预测模型，用于预测肺鳞状细胞癌（LUSC）的预后和免疫治疗反应 | 首次基于单细胞RNA测序数据对CAFs进行分类，并开发了一个具有显著预后相关性的预测模型，用于预测LUSC的预后和免疫治疗反应 | NA | 开发一个预测模型，用于评估肺鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 肺鳞状细胞癌（LUSC）患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | NA |
| 93 | 2024-11-07 |
Deciphering the regulatory landscape of murine splenic response to anemic stress at single-cell resolution
2024-04-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023011965
PMID:38315834
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研究论文 | 研究了小鼠脾脏在贫血压力下的单细胞分辨率调控景观 | 发现了早期红系前体细胞在贫血压力下的显著出现，并识别出一种新的标记物CD81用于标记红细胞岛中的中心巨噬细胞 | NA | 探索贫血压力下红系前体细胞的分子机制 | 小鼠脾脏组织中的红系前体细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从接受苯肼和连续放血的小鼠中分离的脾脏组织样本 |
| 94 | 2024-10-30 |
scLENS: data-driven signal detection for unbiased scRNA-seq data analysis
2024-Apr-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47884-3
PMID:38678050
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研究论文 | 本文开发了一种名为scLENS的降维工具，用于无偏差的单细胞RNA测序数据分析 | scLENS通过L2归一化解决了对数归一化过程中的信号失真问题，并利用随机矩阵理论和信号鲁棒性测试实现了数据驱动的信号维度确定 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中的信号失真和用户偏差问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 95 | 2024-10-26 |
Senolytic and senomorphic agent procyanidin C1 alleviates structural and functional decline in the aged retina
2024-Apr-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311028121
PMID:38657052
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研究论文 | 研究了衰老视网膜中细胞衰老负担增加对结构和功能的影响，并验证了原花青素C1（PCC1）的抗衰老和抗衰老细胞特性 | 首次全面描述了PCC1对衰老视网膜的改善作用，并通过单细胞RNA测序揭示了其分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类中验证 | 探讨衰老视网膜中的细胞衰老负担及其治疗潜力 | 衰老视网膜的结构和功能变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 96 | 2024-10-24 |
Characterizing Spatially Continuous Variations in Tissue Microenvironment through Niche Trajectory Analysis
2024-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.23.590827
PMID:38712255
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图神经网络的建模框架ONTraC，用于分析组织微环境中空间连续变化 | 提出了ONTraC方法，通过图神经网络构建微环境轨迹，相比现有方法在重建空间轨迹方面表现更优 | NA | 开发一种新的计算方法来分析组织微环境中的空间连续变化 | 组织微环境中的空间连续变化 | 计算机视觉 | NA | 图神经网络 | 图神经网络 | 空间转录组数据 | NA |
| 97 | 2024-10-24 |
PROSTATE CELL HETEROGENEITY AND CXCL17 UPREGULATION IN MOUSE STEROID HORMONE IMBALANCE
2024-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.24.590980
PMID:38712029
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研究论文 | 研究了在小鼠激素失衡模型中前列腺细胞异质性和CXCL17上调的现象 | 首次在小鼠激素失衡模型中识别出特定的泡沫细胞亚群，并确认了CXCL17在驱动巨噬细胞迁移和腔内定位中的潜在病理作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证结果 | 进一步表征激素失衡模型中前列腺的细胞异质性，并识别招募的泡沫细胞的特定转录组特征 | 小鼠前列腺中的巨噬细胞和泡沫细胞 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6J雄性小鼠，植入睾酮和雌二醇缓释颗粒（T+E2），两周后采集前列腺样本 |
| 98 | 2024-10-24 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590125
PMID:38712088
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研究论文 | 研究构建了结肠在不同解剖区域和年龄组的细胞和空间图谱，并开发了一种新的计算框架cSplotch，用于分析空间转录组学和单核RNA测序数据，以揭示结肠衰老过程中的细胞和分子动态变化 | 开发了新的计算框架cSplotch，利用层次贝叶斯模型分析空间解析的细胞表达，结合组织学特征跨样本和数据模式共享信息 | NA | 揭示结肠衰老过程中的细胞和分子动态变化 | 结肠组织在不同解剖区域和年龄组的细胞和分子表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据，单核RNA测序数据 | 约1500个鼠类肠道组织样本，约400,000个单核RNA测序样本 |
| 99 | 2024-10-24 |
Therapeutic Activity of Resolvin D1 (RvD1) in Murine MASH
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590633
PMID:38712196
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研究论文 | 研究了Resolvin D1 (RvD1)在实验性代谢相关脂肪性肝炎（MASH）小鼠模型中的治疗作用及其机制 | 揭示了RvD1通过抑制Stat1-Cxcl10信号通路减少炎症、缓解内质网应激介导的细胞凋亡以及促进MMP介导的纤维化逆转 | NA | 确定RvD1保护MASH进展的机制 | 实验性MASH小鼠模型中的RvD1治疗效果 | NA | 代谢相关脂肪性肝炎 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括骨髓来源的巨噬细胞（BMDMs）、Kupffer细胞、T细胞和原代肝细胞 |
| 100 | 2024-10-24 |
Long-Term Follow-Up Defines the Population That Benefits from Early Interception in a High-Risk Smoldering Multiple Myeloma Clinical Trial Using the Combination of Ixazomib, Lenalidomide, and Dexamethasone
2024-Apr-19, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.04.19.24306082
PMID:38699307
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研究论文 | 本研究探讨了伊沙佐米、来那度胺和地塞米松联合治疗高风险冒烟型多发性骨髓瘤（HR-SMM）的长期随访结果，并分析了深度反应对长期预后的影响 | 首次研究了深度反应对HR-SMM患者长期预后的影响，并探讨了基因组改变和20/2/20模型在定义早期治疗受益人群中的作用 | 研究样本量较小，且未探讨所有可能的基因组改变对预后的影响 | 评估伊沙佐米、来那度胺和地塞米松联合治疗HR-SMM的长期疗效和安全性，并探讨深度反应对预后的影响 | 高风险冒烟型多发性骨髓瘤患者 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、全基因组测序 | NA | 基因组数据、单细胞数据 | 55名患者 |