单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 491 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 61 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals segregation of tumor cell states in glioblastoma and marked immunosuppression within the perinecrotic niche
2024-04-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01769-0
PMID:38650010
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据，揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤细胞状态的空间分离模式以及坏死周围区域的免疫抑制特征 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术，系统揭示了胶质母细胞瘤中不同肿瘤细胞状态的空间分布规律及坏死周围区域的免疫抑制微环境 | 研究仅包含3例患者样本，样本量较小，可能限制结果的普适性 | 探究胶质母细胞瘤微环境中细胞类型和肿瘤细胞状态的空间分布特征 | 胶质母细胞瘤患者组织样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 3例胶质母细胞瘤患者 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学平台 |
| 62 | 2025-10-06 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2024-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579846
PMID:38370670
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次发现FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞代谢重编程和动脉分化的新功能 | 研究主要基于动物模型，在人类患者中的验证仍需进一步深入 | 探究肺动脉高压发病的细胞分子机制并寻找新的治疗靶点 | 肺动脉内皮细胞、肺动脉高压动物模型和IPAH患者样本 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 特发性PAH患者、肺动脉高压大鼠和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Cellular atlas of the human ovary using morphologically guided spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7506
PMID:38578993
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研究论文 | 通过形态学引导的空间转录组学和单细胞测序构建人类卵巢细胞图谱 | 结合空间转录组学和单细胞测序技术，首次系统揭示卵巢细胞的空间分布特征和功能特性 | 样本量有限（仅5名供体），仅包含绝经前女性 | 解析卵巢细胞的空间组织和功能特征 | 人类卵巢组织 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 5名供体（2名用于空间转录组学，3名用于单细胞测序），257个区域，21,198个细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
col1a2+ fibroblasts/muscle progenitors finetune xanthophore countershading by differentially expressing csf1a/1b in embryonic zebrafish
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9637
PMID:38578990
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研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼胚胎中成纤维细胞和肌肉祖细胞通过差异表达csf1a/1b调控黄色素细胞反荫蔽色素模式的机制 | 首次发现col1a2+成纤维细胞和肌肉祖细胞通过空间差异表达csf1a和csf1b来精细调控黄色素细胞的反荫蔽色素模式 | NA | 探究斑马鱼胚胎中反荫蔽色素模式形成的调控机制 | 斑马鱼胚胎的黄色素细胞和col1a2+细胞群体 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,基因突变,细胞消融,异位表达 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534017
PMID:37034704
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研究论文 | 开发了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架，用于识别细胞类型特异性调控元件 | 首次将高度多重化的CRISPRa扰动与单细胞RNA测序相结合，能够同时测试增强子和启动子对邻近基因表达的调控作用 | 调控元件的CRISPRa响应性可能受到染色质景观和辅助因子的限制 | 开发识别细胞类型特异性CRISPRa响应调控元件的方法 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因编辑与单细胞分析 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 使用493个gRNAs靶向候选调控元件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
Identification and validation of an immunotherapeutic signature for colon cancer based on the regulatory patterns of ferroptosis and their association with the tumor microenvironment
2024-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119698
PMID:38387508
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研究论文 | 本研究基于铁死亡调控模式构建了结肠癌免疫治疗特征，并验证其与肿瘤微环境的关联 | 首次系统识别结肠癌中铁死亡的三种调控模式，构建FRG-score量化体系，发现APOL6作为铁死亡相关药物敏感靶点 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 开发基于铁死亡调控模式的结肠癌免疫治疗特征 | 结肠癌样本和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 1623个结肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
CYBB-Mediated Ferroptosis Associated with Immunosuppression in Mycobacterium leprae-Infected Monocyte-Derived Macrophages
2024-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.10.012
PMID:37925067
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示麻风分枝杆菌感染通过CYBB介导的铁死亡促进巨噬细胞M2极化，导致免疫逃逸的机制 | 首次发现CYBB介导的铁死亡在麻风分枝杆菌感染中促进巨噬细胞M2极化的新机制 | 研究样本量较小（4名健康个体），主要在体外实验验证 | 探究麻风分枝杆菌感染巨噬细胞后触发M2极化的分子机制 | 人单核细胞来源的巨噬细胞和麻风分枝杆菌 | 单细胞测序分析 | 麻风病 | 单细胞RNA测序, 多组学数据分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 | 4名健康个体的单核细胞来源巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Direct programming of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors with SOX17 and FGF2
2024-04-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.006
PMID:38518781
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现SOX17因子可将人多能干细胞直接编程为内皮祖细胞 | 首次发现SOX17过表达单独即可诱导内皮祖细胞分化，并与FGF2联合实现90%以上分化效率 | 未探讨SOX17调控下游靶基因的具体分子机制 | 探索转录因子在人多能干细胞向内皮祖细胞分化过程中的调控作用 | 人多能干细胞(hPSCs)和内皮祖细胞(EPs) | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas13d基因编辑 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses reveal transient retinal progenitor cells in the ciliary margin of developing human retina
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47933-x
PMID:38670973
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示人类视网膜发育过程中睫状缘区存在短暂性视网膜祖细胞 | 首次在人类视网膜发育过程中发现睫状缘区存在短暂性早期视网膜祖细胞，并揭示其随时间递减的出现规律 | 研究仅涵盖人类视网膜发育至妊娠中期的过程 | 研究人类视网膜发育过程中视网膜祖细胞的规范和分化机制 | 人类发育期视网膜组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据,空间转录组数据 | 人类发育期视网膜样本（涵盖至妊娠中期） | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Adult Human, but Not Rodent, Spermatogonial Stem Cells Retain States with a Foetal-like Signature
2024-04-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13090742
PMID:38727278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了人类与啮齿类动物精原干细胞在发育过程中的转录组差异 | 发现人类成年精原干细胞保留具有胎儿样特征的0B状态，而啮齿类动物则不会在成年期维持此状态 | 研究主要基于转录组数据分析，需要进一步的功能实验验证 | 比较不同物种精原干细胞的发育轨迹和转录状态 | 人类、绵羊、猪、水牛、猕猴、大鼠和小鼠的睾丸生殖细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 34个成年人类睾丸样本，28个胎儿和青春期前样本，以及多个其他物种样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Deciphering the spatiotemporal transcriptional and chromatin accessibility of human retinal organoid development at the single-cell level
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109397
PMID:38510120
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，首次绘制了人类视网膜类器官发育的单细胞时空转录组图谱 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统解析人类视网膜类器官发育的时空转录组特征，并揭示染色质可及性与转录因子结合模式的动态变化 | 研究基于体外培养的视网膜类器官模型，与真实人类视网膜发育过程可能存在时间出现和细胞丰度方面的差异 | 解析人类视网膜发育早期的分子机制 | 人多能干细胞来源的视网膜类器官 | 空间转录组学 | 视网膜发育疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
Cell-type-specific mRNA transcription and degradation kinetics in zebrafish embryogenesis from metabolically labeled single-cell RNA-seq
2024-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47290-9
PMID:38600066
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和代谢标记技术，定量分析斑马鱼胚胎发育过程中不同细胞类型的mRNA转录和降解动力学 | 首次在具有多样细胞身份的胚胎中系统解析mRNA转录和降解对基因表达谱形成的相对贡献，开发了量化单个细胞类型中mRNA转录和降解速率的动力学模型 | 研究局限于斑马鱼胚胎发育早期阶段，尚未扩展到更多发育时期或其他生物系统 | 系统解析胚胎发育过程中mRNA转录和降解动力学对细胞特化的调控机制 | 斑马鱼胚胎发育过程中的不同细胞类型，特别是原始生殖细胞和包被层细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢标记 | 动力学模型 | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Inhibition of ATR opposes glioblastoma invasion through disruption of cytoskeletal networks and integrin internalization via macropinocytosis
2024-04-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad210
PMID:37936324
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研究论文 | 本研究揭示了抑制ATR激酶可通过破坏细胞骨架网络和整合素内存作用来抑制胶质母细胞瘤的侵袭 | 首次发现ATR在胶质母细胞瘤侵袭中的新作用机制，涉及细胞骨架调控和巨胞饮介导的整合素内存 | 研究主要基于临床前模型，尚未进行临床试验验证 | 探索ATR抑制对胶质母细胞瘤侵袭的抑制作用及其分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 延时显微镜、超高分辨率成像、活体成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 两种原位胶质母细胞瘤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Immune microniches shape intestinal Treg function
2024-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07251-0
PMID:38570678
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研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学技术揭示了肠道免疫微环境如何塑造调节性T细胞功能 | 首次结合活体成像、光激活引导的单细胞RNA测序和空间转录组学技术，追踪肠道内微生物反应性T细胞在耐受和炎症状态下的时空动态 | 研究主要聚焦于Helicobacter hepaticus反应性T细胞，可能不适用于所有肠道微生物群 | 阐明肠道免疫微环境如何维持对共生微生物的耐受性机制 | 肠道调节性T细胞和效应T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠道疾病 | 活体成像, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas enables mapping of homeostatic cellular shifts in the adult human breast
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01688-9
PMID:38548988
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了包含55名捐赠者的人类乳腺细胞图谱，揭示了乳腺组织稳态的细胞变化 | 首次系统性地绘制了成人乳腺单细胞图谱，发现BRCA1/2携带者的免疫细胞具有独特的基因表达特征 | 样本主要来自整形手术和风险降低乳房切除术患者，可能无法完全代表普通人群 | 构建人类乳腺细胞图谱并研究影响乳腺癌风险的细胞稳态变化 | 55名接受乳房缩小术或风险降低乳房切除术的捐赠者的乳腺组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫组织化学数据 | 55名捐赠者，超过800,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-Apr, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 提出一个多物种多组学整合分析框架，用于推动心血管再生治疗靶点的发现 | 首次提出结合多物种、多组学和荟萃分析的系统性框架来识别心血管再生靶点 | NA | 开发促进心血管再生的新策略靶点 | 健康和损伤心脏的多物种样本（不同发育阶段） | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
Synovial fibroblast gene expression is associated with sensory nerve growth and pain in rheumatoid arthritis
2024-04-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adk3506
PMID:38598614
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别与类风湿关节炎疼痛相关的滑膜成纤维细胞基因表达模块，并验证其促进疼痛感觉神经生长的机制 | 开发了基于图的基因表达模块识别方法，首次发现滑膜衬里层成纤维细胞基因表达与疼痛感觉神经生长的直接关联 | 研究样本主要来自炎症程度较低的类风湿关节炎患者，结果在高度炎症情况下的适用性需进一步验证 | 探究类风湿关节炎疼痛机制与滑膜成纤维细胞基因表达的关系 | 类风湿关节炎患者的滑膜活检样本、滑膜成纤维细胞、背根神经节神经元 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、机器学习、受体-配体相互作用分析 | GbGMI（基于图的基因表达模块识别） | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 两个独立队列的类风湿关节炎患者滑膜活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Multimodal Analytical Tools to Enhance Mechanistic Understanding of Aortic Valve Calcification
2024-04, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2023.06.017
PMID:37517686
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综述 | 本文综述了用于增强主动脉瓣钙化机制理解的多模态分析工具 | 整合转录组学、蛋白质组学和分子成像技术，构建研究钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)的整体方法，具有识别新调控通路的潜力 | NA | 推进钙化性主动脉瓣疾病和药物靶点研究 | 钙化性主动脉瓣疾病(CAVD) | 生物医学研究 | 心血管疾病 | 转录组学, 蛋白质组学, 分子成像, 正电子发射断层扫描/计算机断层扫描 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Characterizing Spatially Continuous Variations in Tissue Microenvironment through Niche Trajectory Analysis
2024-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.23.590827
PMID:38712255
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研究论文 | 提出一种基于图神经网络的空间微环境连续变化分析方法ONTraC | 首次开发基于图神经网络的生态位轨迹构建方法，能够系统表征组织微环境的空间连续变化 | NA | 分析组织微环境的空间连续变化特征 | 组织微环境、胚胎发育过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络(GNN) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
scRNA-seq analysis of cells comprising the amphioxus notochord
2024-04, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.003
PMID:38224933
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析文昌鱼脊索细胞的组成和功能特性 | 首次在单细胞水平揭示文昌鱼脊索细胞的基因表达特征，发现脊索特异性肌原纤维基因和不同类型Müller细胞的功能分化 | 未涉及其他脊索动物物种的比较分析，样本来源相对单一 | 解析脊索细胞的组成特性和功能分化 | 文昌鱼脊索细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, Iso-seq分析, 原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |