单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202404-202404] [清除筛选条件]
当前共找到 490 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-04-11
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性调控元件及其调控基因 开发了一种新方法,通过随机组合多个gRNA并利用单细胞RNA测序分析,系统性地测试CRISPRa对增强子和启动子的扰动效果,实现了细胞类型特异性调控元件的大规模筛选 方法可能依赖于细胞特定的染色质景观或额外作用因子,限制了在某些细胞类型中的普适性,且样本规模相对较小 旨在识别细胞类型特异性、CRISPRa响应的调控元件,以促进基因治疗中靶向基因激活的gRNA筛选 K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 基因编辑与单细胞组学 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 CRISPRa、单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 使用493个gRNA靶向候选调控元件,在K562细胞和iPSC衍生神经元中进行测试 NA 单细胞RNA-seq NA NA
62 2026-04-09
Single-cell multi-ome regression models identify functional and disease-associated enhancers and enable chromatin potential analysis
2024-Apr, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为SCARlink的单细胞多组学回归模型,用于预测基因表达并识别功能性和疾病相关的增强子 开发了基于正则化泊松回归的基因级调控模型,避免了传统基因-峰相关性分析的局限性,并支持染色质潜力分析 未明确提及具体样本量或实验验证的局限性 构建单细胞多组学回归模型以识别增强子与靶基因的关联并分析染色质潜力 单细胞多组学测序数据(scRNA-seq和scATAC-seq) 机器学习 NA 单细胞多组学测序 正则化泊松回归模型 单细胞多组学测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
63 2026-04-07
A novel subpopulation of monocytes with a strong interferon signature indicated by SIGLEC-1 is present in patients with in recent-onset type 1 diabetes
2024-04, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,在成人隐匿性自身免疫性糖尿病和1型糖尿病患者中发现了一群具有强干扰素特征、以SIGLEC-1为标志的新型单核细胞亚群,并探讨了其在疾病发生中的作用 首次在1型糖尿病相关患者中鉴定出一个以SIGLEC-1为标志、具有强干扰素特征的新型经典单核细胞亚群,并证实其与疾病活动度相关且能加速NOD小鼠糖尿病发病 样本量相对较小(特别是scRNA-seq部分),研究队列主要基于LADA和儿科1型糖尿病患者,结果在更广泛的1型糖尿病群体中的普适性有待进一步验证 探索1型糖尿病起始阶段的致病性免疫反应,寻找新的免疫学靶点用于1型糖尿病的预防和治疗 成人隐匿性自身免疫性糖尿病患者、成人发病的2型糖尿病患者、健康成人、儿科1型糖尿病患者、健康儿童以及非肥胖糖尿病小鼠的外周血和胰腺组织 单细胞组学 糖尿病 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 细胞过继转移实验, 清除实验 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 人类:scRNA-seq(4例LADA患者+4例健康对照);流式验证队列(54例LADA+17例T2D+26例健康成人;15例儿科T1D+15例健康儿童)。小鼠:NOD小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
64 2026-04-03
Staphylococcus aureus induces drug resistance in cancer T cells in Sézary syndrome
2024-04-11, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究揭示了金黄色葡萄球菌及其肠毒素如何诱导Sézary综合征中恶性T细胞产生药物耐药性 首次发现金黄色葡萄球菌肠毒素通过TCR、NF-κB和JAK/STAT信号通路诱导恶性T细胞对多种抗癌药物产生耐药性 研究主要基于体外实验,需要进一步在体实验验证;耐药机制的具体分子通路细节仍需深入探索 探究金黄色葡萄球菌感染如何导致Sézary综合征患者治疗耐药性 Sézary综合征患者的原代恶性T细胞和金黄色葡萄球菌肠毒素 肿瘤免疫学 皮肤T细胞淋巴瘤 多模态单细胞测序 NA 单细胞测序数据 患者原代恶性T细胞样本 NA 单细胞测序 NA NA
65 2026-04-03
Autofluorescence is a biomarker of neural stem cell activation state
2024-Apr-04, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文利用自发荧光成像技术,揭示了小鼠神经干细胞静息与激活状态的独特自发荧光特征,并建立了基于自发荧光的细胞状态预测方法 首次将自发荧光成像技术应用于神经干细胞状态研究,发现静息神经干细胞中特定溶酶体自发荧光可作为细胞静息程度的梯度标志物 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证;技术依赖特定成像设备,可能限制广泛应用 开发一种无标记、活细胞成像方法,以研究神经干细胞从静息到激活状态的转变过程 小鼠神经干细胞(包括静息状态和激活状态) 数字病理学 NA 荧光寿命成像(FLIM)、单细胞RNA测序 NA 图像、转录组数据 未明确具体样本数量,但涉及小鼠神经干细胞群体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
66 2026-04-01
Single-cell analyses reveal transient retinal progenitor cells in the ciliary margin of developing human retina
2024-Apr-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了人类视网膜发育过程中睫状缘区存在短暂性视网膜祖细胞 结合单细胞RNA测序和空间转录组学,首次在人类视网膜发育中鉴定出睫状缘区的短暂性早期视网膜祖细胞,并揭示了其转录和染色质可及性变化 研究仅涵盖人类视网膜发育至妊娠中期的阶段,未涉及后期发育或成熟视网膜 探究人类视网膜发育过程中视网膜祖细胞的起源、分化和时空分布 人类视网膜发育过程中的细胞,特别是睫状缘区的视网膜祖细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 人类早期眼样本,涵盖至妊娠中期 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
67 2026-03-25
Identification of cells of leukemic stem cell origin with non-canonical regenerative properties
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,识别了急性髓系白血病中具有非典型再生特性的细胞群——再生富集细胞,并探讨了其在白血病复发中的作用 首次揭示了AML中RECs这一新细胞群,它们源自白血病干细胞但缺乏干细胞能力,并通过空间转录组学证实了其与CD34+细胞的邻近关系及对再生的调控作用 未明确RECs的具体分子机制,且样本量可能有限,需要进一步验证 探究急性髓系白血病化疗后复发细胞的特性及其再生机制 急性髓系白血病患者样本中的细胞群体 数字病理学 白血病 单细胞转录组学,空间转录组学 NA 转录组数据,空间数据 AML患者队列样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
68 2026-03-25
Multicellular ecotypes shape progression of lung adenocarcinoma from ground-glass opacity toward advanced stages
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过机器学习、单细胞RNA测序和全外显子组测序,分析了58例肺腺癌患者,揭示了与不同影像学模式和癌细胞状态相关的六种肺多细胞生态型 首次系统性地将肺腺癌的影像学表现(磨玻璃影与实性结节)与肿瘤微环境中的多细胞生态型、免疫状态及特定驱动基因(如EGFR L858R)联系起来,并发现了CTHCR1成纤维细胞在免疫抑制环境中的关键作用 样本量相对有限(58例患者),且研究主要基于特定队列,需要在更大人群和不同种族中进行验证 探究肺腺癌从磨玻璃影向晚期进展过程中的肿瘤异质性及微环境演变机制 58例肺腺癌患者及其肿瘤组织 数字病理 肺癌 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 机器学习 机器学习 基因表达数据, 基因组数据, 影像数据 58例肺腺癌患者 NA 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 NA NA
69 2026-03-25
Single-cell transcriptomics reveal metastatic CLDN4+ cancer cells underlying the recurrence of malignant pleural effusion in patients with advanced non-small-cell lung cancer
2024-04, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了晚期非小细胞肺癌患者恶性胸腔积液复发中CLDN4阳性转移性癌细胞的作用 首次在单细胞水平上识别出与恶性胸腔积液复发相关的CLDN4阳性转移性癌细胞亚群,并揭示了其与细胞迁移、缺氧和血管生成信号通路的关联 样本量较小(16例用于单细胞测序),需要更大样本队列验证临床价值,且生物学功能机制有待深入研究 探究晚期非小细胞肺癌患者恶性胸腔积液复发的细胞和遗传特征,寻找预测标志物 非小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,定量聚合酶链反应 生物信息学算法 单细胞转录组数据 16例患者用于单细胞测序,64例患者用于验证队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
70 2026-03-21
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2024-04-16, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本文重新分析了先前关于小鼠非神经元神经节细胞中HSV-1潜伏的单细胞RNA测序数据,并指出该结论基于存在缺陷的数据集 通过重新分析scRNA-Seq数据,揭示了非多聚腺苷酸化的HSV-1内含子RNA的检测是由于脱靶引物效应,并发现数据集中存在广泛的神经元破坏和细胞游离RNA污染 研究基于对已有数据的再分析,未进行新的实验验证,且主要关注小鼠模型,可能不直接适用于人类 验证HSV-1是否能在非神经元细胞中建立潜伏感染,挑战现有关于HSV-1潜伏仅限于神经元的观点 小鼠神经节中的细胞,包括神经元和免疫细胞 单细胞转录组学 疱疹病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 基于先前研究的小鼠神经节细胞scRNA-Seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
71 2026-03-13
Modulating inflammation with interleukin 37 treatment ameliorates murine Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2024-04, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本研究探讨了抗炎细胞因子IL37b在治疗常染色体显性多囊肾病(ADPKD)中的潜力,通过基因小鼠模型证明其能减少囊肿负担并促进干扰素信号通路 首次揭示IL37b通过促进肾脏驻留巨噬细胞中的干扰素信号通路来抑制ADPKD囊肿形成,为其作为潜在疗法提供了新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化效果尚需验证,且未详细探讨IL37b在其他细胞类型中的作用 评估IL37b作为ADPKD治疗策略的有效性及其作用机制 ADPKD基因小鼠模型(包括早期和成年发病型)及肾脏组织 数字病理学 常染色体显性多囊肾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 基因工程小鼠模型 RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
72 2026-03-04
Single-cell profile reveals the landscape of cardiac immunity and identifies a cardio-protective Ym-1hi neutrophil in myocardial ischemia-reperfusion injury
2024-04-15, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示了心肌缺血再灌注损伤中免疫细胞的动态变化,并鉴定出一种具有心脏保护作用的Ym-1hi中性粒细胞亚型 首次在MIRI中通过单细胞测序系统描绘了心脏免疫细胞景观,并发现了一种新型的Ym-1hi中性粒细胞亚型,该亚型具有心脏保护作用 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限 探究心肌缺血再灌注损伤中免疫细胞亚型及其动态变化,并鉴定具有保护作用的细胞亚型 小鼠心肌组织中的CD45阳性免疫细胞,以及临床患者样本 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠心肌组织在六个时间点采集的CD45细胞,以及临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
73 2026-03-02
Bento: a toolkit for subcellular analysis of spatial transcriptomics data
2024-04-02, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文介绍了Bento,一个用于亚细胞尺度空间转录组数据分析的Python工具包 Bento利用单分子信息,首次实现了亚细胞尺度的空间分析,突破了现有方法仅限于多细胞尺度的限制 NA 开发一个工具包,用于在亚细胞尺度分析空间转录组数据 空间转录组数据,包括MERFISH、seqFISH+、Molecular Cartography和Xenium数据集 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 分子坐标和分割边界数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
74 2026-02-28
Single-cell transcriptome analysis reveals tumoral microenvironment heterogenicity and hypervascularization in human carotid body tumor
2024-04, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析人颈动脉体肿瘤,揭示了其微环境异质性和高血管化特征 首次对颈动脉体肿瘤进行单细胞转录组分析,识别了16种细胞群并阐明了内皮细胞、巨噬细胞和神经元细胞在肿瘤形成中的新机制 NA 定义导致颈动脉体肿瘤高血管化和慢性增生的细胞类型 人颈动脉体肿瘤样本 数字病理学 颈动脉体肿瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
75 2026-02-27
Bulk and single-cell transcriptome datasets of the mouse fetal and adult rete ovarii and surrounding tissues
2024-04-13, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究提供了小鼠胎儿和成年卵巢网及其周围组织的批量、单细胞和细胞核水平转录组数据集,以揭示卵巢网在卵巢稳态和生理反应中的潜在功能 首次利用Pax8-rtTA; Tre-H2B-GFP小鼠模型对卵巢网的三个区域进行转录组分析,整合了批量、单细胞和细胞核水平的数据 研究主要基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类,且卵巢网的具体功能机制仍需进一步验证 探索卵巢网在卵巢发育、女性成熟和成年生育力中的角色 小鼠胎儿和成年卵巢网组织,包括卵巢内网、卵巢外网和连接网三个区域 数字病理学 NA 转录组分析,包括批量、单细胞和细胞核水平测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
76 2026-02-27
Single-cell RNA-sequencing of virus-specific cellular immune responses in chronic hepatitis B patients
2024-04-08, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了慢性乙型肝炎患者中病毒特异性细胞免疫反应的转录组特征 创建了首个包含HBV特异性T细胞、非初始T细胞和PD1 T细胞的单细胞转录组数据集,并同时分析了血液和肝脏组织样本 样本量相对有限(21名患者和10名健康对照),且肝脏活检样本仅来自5名患者的匹配子集 深入理解慢性乙型肝炎中失调的免疫反应机制,特别是T细胞功能异常的表型 慢性乙型肝炎患者和健康对照者的免疫细胞,包括HBV特异性T细胞、非初始T细胞和PD1 T细胞 单细胞组学 乙型肝炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 21名慢性乙型肝炎患者和10名健康对照者,包含5名患者的匹配肝脏活检样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10X Genomics平台(用于186,123个细胞)和全长Smart-seq2协议(用于1,069个细胞)
77 2026-02-27
SOXC are critical regulators of adult bone mass
2024-Apr-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型和单细胞转录组学揭示了SOXC转录因子(特别是SOX4)在调控成年骨量中的关键作用,包括促进骨吸收和抑制骨形成 首次明确了SOXC转录因子在成年骨量调控中的冗余和特异性作用,特别是SOX4在调节骨吸收与骨形成平衡中的主导角色,并通过单细胞转录组学揭示了其分子机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证;单细胞转录组学数据仅提供了表达谱,功能验证有待深入 探究SOXC转录因子如何调控成年骨量,并阐明其分子机制 小鼠模型(SOXC功能缺失和功能获得模型)以及Lepr间充质细胞 NA 骨质疏松症 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
78 2026-02-27
Cellular atlas of the human ovary using morphologically guided spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2024-04-05, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过形态学引导的空间转录组学和单细胞测序技术,构建了人类卵巢的细胞图谱 结合空间转录组学和单细胞测序,首次在人类卵巢中揭示了卵泡发育的分子程序及激素和细胞外基质重塑活动的空间变异 样本量较小,仅涉及少数绝经前捐赠者,可能限制了结果的普适性 研究卵巢的功能单元和细胞间空间相互作用,以增进对生育和内分泌健康的理解 人类卵巢组织,包括卵母细胞、卵泡膜细胞、颗粒细胞等细胞类型 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,空间位置数据 来自5名捐赠者的卵巢组织,包括257个区域的空间转录组数据和21,198个细胞的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
79 2026-02-27
Insights for disease modeling from single-cell transcriptomics of iPSC-derived Ngn2-induced neurons and astrocytes across differentiation time and co-culture
2024-Apr-02, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组学分析,研究了iPSC衍生的Ngn2诱导神经元和星形胶质细胞在分化时间和共培养条件下的同质性、相似性及其在神经精神疾病建模中的应用 结合公共单细胞RNA-seq数据和体内发育脑数据,首次系统评估了hiPSC-N和hiPSC-A的谱系起源、成熟度及共培养效应,并构建了集成网络资源平台 研究揭示了细胞模型的异质性和局限性,可能不完全模拟体内复杂环境,需进一步优化 评估iPSC衍生神经元和星形胶质细胞模型在神经精神疾病研究中的适用性和优化策略 人诱导多能干细胞衍生的Ngn2诱导神经元(hiPSC-N)和星形胶质细胞(hiPSC-A) 数字病理学 神经精神疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
80 2026-01-14
Myeloid-Mas Signaling Modulates Pathogenic Crosstalk among MYC+CD63+ Endothelial Cells, MMP12+ Macrophages, and Monocytes in Acetaminophen-Induced Liver Injury
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和活体成像技术,揭示了骨髓细胞-Mas信号在调节对乙酰氨基酚诱导的肝损伤中MYC+CD63+内皮细胞、MMP12+巨噬细胞和单核细胞之间致病性串扰的作用 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和长时间活体成像,系统解析了骨髓细胞-Mas信号在AILI微环境中的调控机制,并在患者样本中验证了其临床相关性 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩大规模;Mas信号的具体下游效应分子机制有待进一步阐明 阐明对乙酰氨基酚诱导的肝损伤中微环境的细胞互作和分子机制 Mas1缺陷小鼠和对乙酰氨基酚诱导的肝损伤患者样本 单细胞组学 肝损伤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 活体成像 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 影像数据 Mas1缺陷小鼠模型和急性肝衰竭患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
回到顶部