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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Up-regulation of RAN by MYBL2 maintains osteosarcoma cancer stem-like cells population during heterogeneous tumor generation
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216708
PMID:38336287
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示骨肉瘤癌症干细胞通过MYBL2-RAN通路维持异质性肿瘤的分子机制 | 首次发现MYBL2转录上调RAN并通过增强MYC蛋白核积累促进癌症干细胞自我更新的正反馈机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索骨肉瘤癌症干细胞维持肿瘤异质性的调控机制 | 骨肉瘤癌症干细胞及其分化的异质性细胞群体 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床骨肉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Inhibition of ATM promotes PD-L1 expression by activating JNK/c-Jun/TNF-α signaling axis in triple-negative breast cancer
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216642
PMID:38278470
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研究论文 | 本研究揭示ATM通过抑制JNK/c-Jun/TNF-α信号轴负向调控PD-L1表达的新机制 | 首次发现ATM通过JNK/c-Jun/TNF-α信号通路负向调控PD-L1表达的分子机制 | 样本量有限(4例scRNA-seq,86例免疫组化),需更大规模研究验证 | 探索ATM调控PD-L1表达的分子机制及其在TNBC免疫治疗中的意义 | 三阴性乳腺癌细胞系、动物模型和临床标本 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组化染色,细胞因子阵列分析,Western blot,荧光素酶报告基因检测 | 基因敲低稳定细胞系,动物模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,临床病理数据 | 4例scRNA-seq临床标本,86例免疫组化TNBC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Single-cell characterization of infiltrating T cells identifies novel targets for gallbladder cancer immunotherapy
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216675
PMID:38280478
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建胆囊癌浸润T细胞图谱并建立分子分型标准 | 首次基于T细胞特征建立胆囊癌分子分型标准,识别了12种T细胞亚型及其与肿瘤微环境的关系 | 未提及样本量大小和研究队列的局限性 | 探索胆囊癌中T细胞的异质性并开发免疫治疗新靶点 | 胆囊癌患者的浸润T细胞 | 单细胞生物学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2
2024-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.15.589676
PMID:38659941
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研究论文 | 研究发现小分子抑制剂RMC-113通过双重抑制PIP4K2C和PIKfyve脂质激酶,逆转SARS-CoV-2诱导的自噬流损伤,发挥广谱抗病毒作用 | 首次揭示PIP4K2C在SARS-CoV-2进入、RNA复制和组装/释放过程中的作用,并发现其与病毒非结构蛋白6结合调控自噬流 | NA | 开发广谱抗病毒药物并阐明其作用机制 | 人类肺类器官和多种RNA病毒包括SARS-CoV-2 | 病毒学 | COVID-19 | 脂质组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、功能测定 | NA | 分子数据、转录组数据、功能测定数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
DPSCs regulate epithelial-T cell interactions in oral submucous fibrosis
2024-04-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03720-5
PMID:38650025
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示口腔黏膜下纤维化中上皮细胞与T细胞的相互作用机制,并探索牙髓干细胞治疗潜力 | 发现具有促炎促纤维化功能的独特上皮细胞亚群Epi1.2,揭示MIF-CD74和CXCR4介导的上皮-T细胞相互作用机制,首次系统评估DPSCs治疗OSF的效果 | OSF致病机制尚未完全阐明,DPSCs临床应用效果需进一步验证 | 探索口腔黏膜下纤维化的致病机制并开发新的治疗策略 | 口腔黏膜组织、牙髓干细胞、动物模型 | 单细胞生物学 | 口腔黏膜下纤维化 | 单细胞RNA测序、组织染色、免疫组化、扫描电镜、原子力显微镜 | 动物模型 | 单细胞转录组数据、组织图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
An integrated toolkit for human microglia functional genomics
2024-04-10, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03700-9
PMID:38600587
|
研究论文 | 开发用于人类小胶质细胞功能基因组学的集成工具包,包括优化的iPSC分化方案和多组学分析平台 | 建立简化的两步20天分化流程,整合CRISPR-ON/OFF时序控制系统,并提供在线多组学数据比较平台 | 未提及与现有方法的直接比较数据,长期功能稳定性需要进一步验证 | 开发高效的人类小胶质细胞功能基因组学研究工具 | 人类iPSC衍生的小胶质细胞(iMG) | 功能基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, ATAC-Seq, 蛋白质组学, CRISPR-Cas9 | CRISPR-ON/OFF系统 | 转录组, 表观基因组, 蛋白质组, 功能测试数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 多组学分析 | NA | 在线可搜索平台(https://sherlab.shinyapps.io/IPSC-derived-Microglia/) |
| 67 | 2025-10-06 |
Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis
2024-04-30, Clinical oral investigations
IF:3.1Q1
DOI:10.1007/s00784-024-05659-6
PMID:38684576
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序在Coffin-Siris综合征患者中发现了一个新的SOX4基因从头突变,并探索了其在综合征性牙齿缺失中的作用机制 | 首次报道SOX4错义突变导致综合征性牙齿缺失,通过单细胞RNA测序和WGCNA分析验证了SOX4在牙齿发育中的关键作用 | 研究仅基于单个患者病例,样本量有限,需要更多病例验证 | 识别导致综合征性牙齿缺失的致病突变并探索其调控机制 | Coffin-Siris综合征患者和小鼠牙齿发育模型 | 遗传学 | Coffin-Siris综合征 | 全外显子测序, Sanger测序, 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, WGCNA分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 1名中国CSS患者和小鼠牙齿发育样本 | NA | 全外显子测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Cannabidiol protects against acute aortic dissection by inhibiting macrophage infiltration and PMAIP1-induced vascular smooth muscle cell apoptosis
2024-04, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.02.006
PMID:38387723
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研究论文 | 本研究探讨了大麻二酚通过抑制巨噬细胞浸润和PMAIP1诱导的血管平滑肌细胞凋亡来预防急性主动脉夹层的作用机制 | 首次揭示CBD通过调控巨噬细胞中PMAIP1表达来抑制血管平滑肌细胞线粒体依赖性凋亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未进行人体临床试验验证 | 探究大麻二酚对急性主动脉夹层的保护作用及其分子机制 | 小鼠急性主动脉夹层模型、人主动脉血管平滑肌细胞、M1巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 病理学检测, 体外共培养实验 | 动物疾病模型 | 基因表达数据, 病理图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals segregation of tumor cell states in glioblastoma and marked immunosuppression within the perinecrotic niche
2024-04-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01769-0
PMID:38650010
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤细胞状态的空间分离模式以及坏死周围区域的免疫抑制特征 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术,系统揭示了胶质母细胞瘤中不同肿瘤细胞状态的空间分布规律及坏死周围区域的免疫抑制微环境 | 研究仅包含3例患者样本,样本量较小,可能限制结果的普适性 | 探究胶质母细胞瘤微环境中细胞类型和肿瘤细胞状态的空间分布特征 | 胶质母细胞瘤患者组织样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 3例胶质母细胞瘤患者 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学平台 |
| 70 | 2025-10-06 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2024-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579846
PMID:38370670
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次发现FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞代谢重编程和动脉分化的新功能 | 研究主要基于动物模型,在人类患者中的验证仍需进一步深入 | 探究肺动脉高压发病的细胞分子机制并寻找新的治疗靶点 | 肺动脉内皮细胞、肺动脉高压动物模型和IPAH患者样本 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 特发性PAH患者、肺动脉高压大鼠和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Cellular atlas of the human ovary using morphologically guided spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7506
PMID:38578993
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研究论文 | 通过形态学引导的空间转录组学和单细胞测序构建人类卵巢细胞图谱 | 结合空间转录组学和单细胞测序技术,首次系统揭示卵巢细胞的空间分布特征和功能特性 | 样本量有限(仅5名供体),仅包含绝经前女性 | 解析卵巢细胞的空间组织和功能特征 | 人类卵巢组织 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 5名供体(2名用于空间转录组学,3名用于单细胞测序),257个区域,21,198个细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
col1a2+ fibroblasts/muscle progenitors finetune xanthophore countershading by differentially expressing csf1a/1b in embryonic zebrafish
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9637
PMID:38578990
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研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼胚胎中成纤维细胞和肌肉祖细胞通过差异表达csf1a/1b调控黄色素细胞反荫蔽色素模式的机制 | 首次发现col1a2+成纤维细胞和肌肉祖细胞通过空间差异表达csf1a和csf1b来精细调控黄色素细胞的反荫蔽色素模式 | NA | 探究斑马鱼胚胎中反荫蔽色素模式形成的调控机制 | 斑马鱼胚胎的黄色素细胞和col1a2+细胞群体 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,基因突变,细胞消融,异位表达 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534017
PMID:37034704
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研究论文 | 开发了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性调控元件 | 首次将高度多重化的CRISPRa扰动与单细胞RNA测序相结合,能够同时测试增强子和启动子对邻近基因表达的调控作用 | 调控元件的CRISPRa响应性可能受到染色质景观和辅助因子的限制 | 开发识别细胞类型特异性CRISPRa响应调控元件的方法 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因编辑与单细胞分析 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 使用493个gRNAs靶向候选调控元件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Identification and validation of an immunotherapeutic signature for colon cancer based on the regulatory patterns of ferroptosis and their association with the tumor microenvironment
2024-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119698
PMID:38387508
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研究论文 | 本研究基于铁死亡调控模式构建了结肠癌免疫治疗特征,并验证其与肿瘤微环境的关联 | 首次系统识别结肠癌中铁死亡的三种调控模式,构建FRG-score量化体系,发现APOL6作为铁死亡相关药物敏感靶点 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 开发基于铁死亡调控模式的结肠癌免疫治疗特征 | 结肠癌样本和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 1623个结肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
CYBB-Mediated Ferroptosis Associated with Immunosuppression in Mycobacterium leprae-Infected Monocyte-Derived Macrophages
2024-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.10.012
PMID:37925067
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示麻风分枝杆菌感染通过CYBB介导的铁死亡促进巨噬细胞M2极化,导致免疫逃逸的机制 | 首次发现CYBB介导的铁死亡在麻风分枝杆菌感染中促进巨噬细胞M2极化的新机制 | 研究样本量较小(4名健康个体),主要在体外实验验证 | 探究麻风分枝杆菌感染巨噬细胞后触发M2极化的分子机制 | 人单核细胞来源的巨噬细胞和麻风分枝杆菌 | 单细胞测序分析 | 麻风病 | 单细胞RNA测序, 多组学数据分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 | 4名健康个体的单核细胞来源巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
Direct programming of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors with SOX17 and FGF2
2024-04-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.006
PMID:38518781
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现SOX17因子可将人多能干细胞直接编程为内皮祖细胞 | 首次发现SOX17过表达单独即可诱导内皮祖细胞分化,并与FGF2联合实现90%以上分化效率 | 未探讨SOX17调控下游靶基因的具体分子机制 | 探索转录因子在人多能干细胞向内皮祖细胞分化过程中的调控作用 | 人多能干细胞(hPSCs)和内皮祖细胞(EPs) | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas13d基因编辑 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses reveal transient retinal progenitor cells in the ciliary margin of developing human retina
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47933-x
PMID:38670973
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示人类视网膜发育过程中睫状缘区存在短暂性视网膜祖细胞 | 首次在人类视网膜发育过程中发现睫状缘区存在短暂性早期视网膜祖细胞,并揭示其随时间递减的出现规律 | 研究仅涵盖人类视网膜发育至妊娠中期的过程 | 研究人类视网膜发育过程中视网膜祖细胞的规范和分化机制 | 人类发育期视网膜组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据,空间转录组数据 | 人类发育期视网膜样本(涵盖至妊娠中期) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Adult Human, but Not Rodent, Spermatogonial Stem Cells Retain States with a Foetal-like Signature
2024-04-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13090742
PMID:38727278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了人类与啮齿类动物精原干细胞在发育过程中的转录组差异 | 发现人类成年精原干细胞保留具有胎儿样特征的0B状态,而啮齿类动物则不会在成年期维持此状态 | 研究主要基于转录组数据分析,需要进一步的功能实验验证 | 比较不同物种精原干细胞的发育轨迹和转录状态 | 人类、绵羊、猪、水牛、猕猴、大鼠和小鼠的睾丸生殖细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 34个成年人类睾丸样本,28个胎儿和青春期前样本,以及多个其他物种样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Deciphering the spatiotemporal transcriptional and chromatin accessibility of human retinal organoid development at the single-cell level
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109397
PMID:38510120
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,首次绘制了人类视网膜类器官发育的单细胞时空转录组图谱 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统解析人类视网膜类器官发育的时空转录组特征,并揭示染色质可及性与转录因子结合模式的动态变化 | 研究基于体外培养的视网膜类器官模型,与真实人类视网膜发育过程可能存在时间出现和细胞丰度方面的差异 | 解析人类视网膜发育早期的分子机制 | 人多能干细胞来源的视网膜类器官 | 空间转录组学 | 视网膜发育疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Cell-type-specific mRNA transcription and degradation kinetics in zebrafish embryogenesis from metabolically labeled single-cell RNA-seq
2024-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47290-9
PMID:38600066
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和代谢标记技术,定量分析斑马鱼胚胎发育过程中不同细胞类型的mRNA转录和降解动力学 | 首次在具有多样细胞身份的胚胎中系统解析mRNA转录和降解对基因表达谱形成的相对贡献,开发了量化单个细胞类型中mRNA转录和降解速率的动力学模型 | 研究局限于斑马鱼胚胎发育早期阶段,尚未扩展到更多发育时期或其他生物系统 | 系统解析胚胎发育过程中mRNA转录和降解动力学对细胞特化的调控机制 | 斑马鱼胚胎发育过程中的不同细胞类型,特别是原始生殖细胞和包被层细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢标记 | 动力学模型 | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |