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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Comparative single-cell RNA sequencing analysis of immune response to inactivated vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2024-04, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29577
PMID:38572977
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较分析灭活疫苗与自然SARS-CoV-2感染引起的免疫反应差异 | 首次对灭活疫苗和自然感染进行系统性单细胞RNA测序比较分析,揭示了IL-15RA/IL-15受体通路在疫苗加强免疫中的选择性激活作用 | 样本量相对有限(12名疫苗接种者),仅分析了外周血单核细胞 | 比较灭活SARS-CoV-2疫苗与自然感染引起的免疫反应差异 | 12名接种灭活疫苗的个体和COVID-19患者的外周血单核细胞 | 单细胞基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名疫苗接种者和COVID-19患者的系列PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
Immune features revealed by single-cell RNA and single-cell TCR/BCR sequencing in patients with rheumatoid arthritis receiving COVID-19 booster vaccination
2024-04, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29573
PMID:38566569
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研究论文 | 通过单细胞RNA和TCR/BCR测序揭示类风湿关节炎患者接种COVID-19加强疫苗后的免疫特征 | 首次在RA患者中结合单细胞RNA测序和单细胞TCR/BCR测序分析COVID-19加强疫苗的免疫反应 | 样本量较小,仅观察了疫苗接种前后两个时间点 | 研究COVID-19加强疫苗对类风湿关节炎患者免疫细胞亚群和免疫反应的影响 | 稳定期类风湿关节炎患者 | 单细胞测序分析 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR/BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫受体序列数据 | 配对的外周血单个核细胞样本(接种前1周和接种后4周) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫组库测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
High-throughput RNA isoform sequencing using programmed cDNA concatenation
2024-Apr, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01815-7
PMID:37291427
|
研究论文 | 介绍了一种通过程序化cDNA串联实现高通量RNA异构体测序的新方法MAS-ISO-seq | 通过程序化串联cDNA分子,将长读长测序通量提高15倍以上,单次运行可获得近4000万条cDNA读长 | NA | 开发高通量全长RNA异构体测序技术 | 肿瘤浸润T细胞的转录组 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,长读长测序 | NA | RNA序列数据 | NA | PacBio | 长读长测序,单细胞RNA测序 | Sequel IIe | PacBio Sequel IIe测序仪 |
| 44 | 2025-10-06 |
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: molecular features and clinical significance
2024-04-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01779-3
PMID:38570490
|
综述 | 本文系统回顾了乳腺导管原位癌向浸润性乳腺癌进展的分子特征、研究工具及临床管理进展 | 全面整合DCIS向IDC转化的分子机制,系统总结单细胞测序、空间转录组学等新技术在研究中的应用 | 作为综述文章,未包含原始研究数据,主要基于现有文献进行归纳分析 | 深入理解DCIS的生物学特性及其向IDC转化的分子路径,为临床个性化治疗提供依据 | 乳腺导管原位癌(DCIS)和浸润性导管癌(IDC) | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞测序,空间转录组学,人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Autophagy unrelated transcriptional mechanisms of hydroxychloroquine resistance revealed by integrated multi-omics of evolved cancer cells
2024-Apr, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2024.2402191
PMID:39299930
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示癌细胞对羟氯喹耐药的自噬无关转录机制 | 发现羟氯喹耐药主要通过转录可塑性而非自噬途径实现,识别了糖酵解、外泌作用和染色体凝聚/分离等新耐药机制 | 研究仅使用OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞两种细胞系,样本规模有限 | 探究癌细胞对羟氯喹耐药的分子机制 | OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞 | 多组学分析 | 卵巢癌,结直肠癌 | 全基因组筛选,正向遗传筛选,反向遗传筛选,CRISPR-Cas9,RNA-seq,外显子组测序,单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据 | 两种癌细胞系,经过15次药物脉冲追踪处理 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,外显子组测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Marmosets contain multitudes
2024-Apr-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97866
PMID:38661001
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示狨猴携带来自其兄弟姐妹的遗传差异细胞的程度 | 利用单细胞RNA测序技术首次在狨猴中量化了来自兄弟姐妹的遗传嵌合细胞 | NA | 研究狨猴体内遗传嵌合现象 | 狨猴细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
Stimulator of Interferon Genes Pathway Activation through the Controlled Release of STINGel Mediates Analgesia and Anti-Cancer Effects in Oral Squamous Cell Carcinoma
2024-Apr-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12040920
PMID:38672274
|
研究论文 | 本研究开发了STINGel缓释制剂,通过激活干扰素基因刺激因子通路,在口腔鳞状细胞癌模型中同时实现镇痛和抗癌效果 | 开发了延长STING激动剂可用时间的缓释制剂STINGel,首次系统研究其在口腔鳞癌疼痛管理中的作用机制 | 研究局限于动物模型,尚未进行临床试验验证 | 研究STINGel缓释制剂对口腔鳞状细胞癌疼痛的镇痛作用及其机制 | 口腔鳞状细胞癌动物模型 | 癌症研究 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,行为学检测 | NA | 基因表达数据,行为学数据 | 两种口腔鳞癌模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
BuDDI: BulkDeconvolution withDomainInvariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2024-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.20.549951
PMID:37503097
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研究论文 | 提出BuDDI方法,通过域适应技术整合单细胞和批量RNA-seq数据来预测细胞类型特异性扰动效应 | 使用变分自编码器学习四个独立潜在空间,能够模拟细胞类型特异性扰动响应,无需单细胞扰动数据训练 | NA | 开发从批量数据推断细胞类型特异性扰动效应的方法 | 单细胞RNA-seq数据和批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Fine-mapping analysis including over 254,000 East Asian and European descendants identifies 136 putative colorectal cancer susceptibility genes
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47399-x
PMID:38670944
|
研究论文 | 通过精细定位分析识别了136个结直肠癌易感基因 | 首次在超过25万东亚和欧洲裔人群中开展大规模精细定位分析,发现56个新的结直肠癌易感基因 | 因果变异和目标基因的确切功能机制仍需进一步验证 | 精细定位已知结直肠癌风险位点并识别致病基因 | 100,204例结直肠癌患者和154,587例对照的东亚和欧洲裔人群 | 基因组学 | 结直肠癌 | GWAS, 精细定位分析, cis-eQTL/mQTL, 共定位分析, 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | 条件分析, 富集分析 | 基因组数据, 转录组数据, 甲基化数据 | 254,791个样本(100,204病例+154,587对照),1,299个结直肠组织转录组样本,321个甲基化样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序, 转录组测序, 甲基化测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
Single cell analysis reveals the roles and regulatory mechanisms of type-I interferons in Parkinson's disease
2024-04-02, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01590-1
PMID:38566100
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示I型干扰素在帕金森病中的角色和调控机制 | 首次在单细胞水平系统分析PD中I型干扰素反应的细胞特异性特征,并鉴定NFATc2作为关键调控因子 | 样本量较小(5例PD患者和6例健康对照),需在更大队列中验证 | 探究I型干扰素在帕金森病神经炎症中的具体作用和调控机制 | 帕金森病患者脑组织单细胞数据、MPTP诱导的PD小鼠模型、MPP诱导的BV2细胞模型 | 单细胞转录组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序、轨迹分析、转录调控网络分析、细胞模型验证 | AUCell、Monocle、SCENIC | 单细胞转录组数据 | 39,024个单细胞(来自5名PD患者和6名健康对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
High-Dimensional Single-Cell Multimodal Landscape of Human Carotid Atherosclerosis
2024-04, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320524
PMID:38385291
|
研究论文 | 通过单细胞多组学技术绘制人类颈动脉粥样硬化的高维细胞图谱 | 首次结合转录组和表位测序技术系统鉴定动脉粥样硬化病变中的25种细胞群体,发现新型平滑肌细胞来源的泡沫细胞亚群 | 样本量相对有限(n=21),仅针对颈动脉病变进行研究 | 全面解析人类颈动脉粥样硬化的细胞组成和临床病理关联 | 人类颈动脉粥样硬化病变组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,细胞转录组和表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据,表位数据 | 21例颈动脉病变样本(13例有症状) | 10x Genomics | 单细胞多组学,单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 细胞转录组和表位索引测序技术 |
| 52 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome
2024-04-29, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03734-z
PMID:38679747
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研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过刺激骨髓血管和基质生态位来缓解急性辐射综合征的机制 | 首次阐明了TPOm通过调节骨髓血管和基质生态位促进造血干细胞再生的新机制,并发现其能增强间充质基质细胞的胶原表达和再生通路 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 研究血小板生成素模拟物在缓解急性辐射综合征中的作用机制 | C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞、血管内皮细胞和间充质基质细胞 | 放射医学 | 急性辐射综合征 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据,细胞计数数据,组织学图像 | 9-14周龄C57BL/6J小鼠,在辐射后多个时间点(第4、7、10、14、18、21天)采集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
STRUCTURE-FUNCTION RELATIONSHIPS OF MUCOCILIARY CLEARANCE IN HUMAN AIRWAYS
2024-Apr-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4164522/v1
PMID:38746209
|
研究论文 | 本研究首次绘制了人类和大鼠气道树中纤毛细胞和分泌细胞的分布图谱,揭示了组织水平结构与纤毛功能之间的关系 | 首次在人类和大鼠中系统比较气道树细胞分布,发现物种特异性纤毛功能差异,并识别出能预测清除功能的上皮结构参数 | 研究仍部分依赖动物模型数据,对人类气道屏障功能的理解仍有限 | 探索人类气道组织水平结构与纤毛器官功能之间的关系,特别是形态组织与黏液纤毛清除功能的联系 | 人类和大鼠的气道组织 | 组织生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 组织样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-06 |
Candida albicans-myeloid cells-T lymphocytes axis in the tumor microenvironment of oral tumor-bearing mice
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216814
PMID:38499264
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研究论文 | 本研究揭示白色念珠菌感染通过调节髓系细胞-T淋巴细胞轴改变口腔肿瘤微环境并促进肿瘤进展 | 首次发现白色念珠菌感染通过髓系细胞-T淋巴细胞轴调控口腔肿瘤微环境,揭示了IL-17A和γδ T细胞在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究白色念珠菌感染对口腔肿瘤微环境的影响机制 | 口腔肿瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
An effective two-stage NMBzA-induced rat esophageal tumor model revealing that the FAT-Hippo-YAP1 axis drives the progression of ESCC
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216813
PMID:38499266
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研究论文 | 本研究建立了一种高效的两阶段NMBzA诱导大鼠食管癌模型,并发现FAT-Hippo-YAP1轴驱动食管鳞癌进展 | 使用索拉非尼作为肿瘤促进剂建立高效两阶段致癌模型,首次揭示大鼠ESCC中FAT-Hippo-YAP1轴的渐进性超活化 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 建立高效的食管鳞癌动物模型并研究其致癌机制 | NMBzA诱导的大鼠食管鳞癌模型及衍生细胞系 | 癌症研究 | 食管鳞状细胞癌 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 多组学分析, 3D类器官培养 | 动物模型, 细胞系模型, 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据, 细胞表型数据 | NMBzA诱导的大鼠食管肿瘤样本及衍生细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
Antigen/HLA-agnostic strategies for Characterizing Tumor-responsive T cell receptors in PDAC patients via single-cell sequencing and autologous organoid application
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216741
PMID:38395378
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研究论文 | 本研究通过超深度单细胞TCR/RNA测序和自体类器官技术,在PDAC患者中鉴定和验证肿瘤反应性T细胞受体 | 开发了不依赖抗原/HLA的肿瘤反应性TCR表征策略,结合单细胞测序和自体类器官技术 | 仅为概念验证研究,样本量有限(仅2例PDAC患者) | 开发个性化TCR-T细胞疗法的肿瘤反应性TCR表征方法 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者 | 单细胞测序 | 胰腺癌 | 单细胞TCR/RNA测序,类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据,TCR序列数据 | 2例PDAC患者,超过82,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
Characterization of the distinct immune microenvironments between hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216799
PMID:38479553
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统比较了肝细胞癌和肝内胆管癌的肿瘤免疫微环境差异 | 首次通过整合41个单细胞RNA测序样本系统比较两种主要原发性肝癌的免疫微环境,并发现HCC中EGR1巨噬细胞的特异性富集 | 样本数量相对有限,仅包含41个样本 | 系统评估肝细胞癌和肝内胆管癌肿瘤免疫微环境的异同 | 肝细胞癌和肝内胆管癌的肿瘤组织样本 | 单细胞基因组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 41个单细胞RNA测序样本,涵盖两种恶性肿瘤的四种不同组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2025-10-06 |
Association of preoperative aspartate aminotransferase to platelet ratio index with outcomes and tumour microenvironment among colorectal cancer with liver metastases
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216778
PMID:38458593
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研究论文 | 探讨术前APRI指标对结直肠癌肝转移患者预后及肿瘤微环境的预测价值 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫组化揭示APRI与肿瘤微环境的关联机制 | 回顾性多中心研究,需前瞻性研究进一步验证 | 寻找改善结直肠癌肝转移患者预后预测的可靠生物标志物 | 1323例接受同步切除的结直肠癌肝转移患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化/免疫荧光 | Cox风险回归模型 | 血液检测数据, 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 1323例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 多重免疫组化 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
CD63+ cancer-associated fibroblasts confer CDK4/6 inhibitor resistance to breast cancer cells by exosomal miR-20
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216747
PMID:38403110
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研究论文 | 本研究揭示CD63+癌症相关成纤维细胞通过外泌体miR-20介导乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂产生耐药性 | 首次发现CD63+癌症相关成纤维细胞亚群在CDK4/6抑制剂耐药肿瘤组织中富集,并阐明其通过外泌体miR-20靶向RB1 mRNA的耐药机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序和肿瘤异种移植模型,临床验证尚需进一步研究 | 探究乳腺癌对CDK4/6抑制剂产生耐药性的机制及潜在治疗策略 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞、肿瘤异种移植模型 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 外泌体分析, 纳米颗粒合成 | 肿瘤异种移植模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the landscape of epithelial-mesenchymal transition molecular heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-04-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216723
PMID:38342234
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示食管鳞状细胞癌上皮间质转化的分子异质性景观 | 首次在单细胞水平系统描绘ESCC中EMT的分子异质性,发现SERPINH1作为新的EMT标志物,并验证靶向EMT的潜在药物 | 样本量相对有限,需要更大规模验证 | 探究食管鳞状细胞癌中上皮间质转化的分子异质性及其临床意义 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,TCGA数据 | 44名患者的39个肿瘤样本和16个癌旁样本,共209,231个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |