单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-08-07 |
Modeling gene expression cascades during cell state transitions
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109386
PMID:38500834
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据和贝叶斯推理方法，对细胞状态转换过程中的基因表达动态变化进行建模 | 提出了一种贝叶斯推理方法来推断伪时间序列中细胞的转录动态，从而能够对基因表达的时序差异和调控基因相互作用进行分析 | NA | 研究细胞在分化或对外界刺激响应过程中的基因表达动态变化 | 小鼠胚胎前脑和胰腺样本的单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯推理模型 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎前脑和胰腺样本的单细胞RNA测序数据 |
| 482 | 2024-08-07 |
Colorectal Cancer-Associated Myofibroblasts Exhibit Enhanced Angiogenin Expression and Signaling via the PLXNB2 Receptor
2024-Apr, The Journal of surgical research
IF:1.8Q2
DOI:10.1016/j.jss.2023.12.036
PMID:38295715
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研究论文 | 本文研究了结直肠癌相关肌成纤维细胞中血管生成素表达及通过PLXNB2受体的信号传导 | 首次在人类结直肠癌组织中发现肌成纤维细胞中血管生成素和PLXNB2受体表达上调，并探讨了其在肿瘤-基质细胞通讯中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及临床样本的直接验证 | 探讨血管生成素在人类结直肠癌中的作用及其与肌成纤维细胞的通讯机制 | 结直肠癌组织及其周围的肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 配对的正常人类结肠和结直肠癌组织样本 |
| 483 | 2024-08-07 |
IDO1 Inhibition Promotes Activation of Tumor-intrinsic STAT3 Pathway and Induces Adverse Tumor-protective Effects
2024-Apr-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300545
PMID:38391297
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨IDO1抑制剂在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤细胞的影响 | 发现IDO1抑制剂不仅激活肿瘤内免疫细胞，还促进M2巨噬细胞的浸润和IL-6的分泌，进而激活JAK2/STAT3信号通路，导致肿瘤细胞在高度免疫活性下仍能存活 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类临床试验中验证这些发现 | 探究IDO1抑制剂在癌症治疗中的临床失败原因及其对肿瘤微环境的影响 | IDO1抑制剂对肿瘤内免疫细胞和肿瘤细胞的影响 | 癌症治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠结肠癌细胞CT26移植于BALB/C小鼠 |
| 484 | 2024-08-04 |
Identity and nature of neural stem cells in the adult human subventricular zone
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109342
PMID:38495819
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研究论文 | 本文探讨了成人人体旁脑室区的神经干细胞的存在及其特征 | 本研究首次通过单细胞转录组学揭示了成人旁脑室区存在多种神经干细胞状态并提供了单细胞细胞图谱 | 研究主要基于新鲜的神经外科样本，可能限制了样本的代表性 | 旨在确认成人人体旁脑室区神经干细胞的存在和特性 | 成人旁脑室区的神经干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞转录组数据 | 新鲜的神经外科样本 |
| 485 | 2024-08-04 |
Up-regulation of RAN by MYBL2 maintains osteosarcoma cancer stem-like cells population during heterogeneous tumor generation
2024-Apr-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216708
PMID:38336287
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研究论文 | 这篇文章探讨了MYBL2通过上调RAN维持骨肉瘤癌干细胞样细胞群体的机制 | 本研究揭示了MYBL2-RAN通路在骨肉瘤癌干细胞自我更新和异质性肿瘤发生中的新作用 | 没有提供具体的临床试验数据来支持MYBL2-RAN通路的治疗潜力 | 理解癌干细胞在异质性肿瘤复发过程中的调控机制 | 骨肉瘤癌干细胞及其衍生的异质性肿瘤 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 486 | 2024-08-07 |
Inhibition of ATM promotes PD-L1 expression by activating JNK/c-Jun/TNF-α signaling axis in triple-negative breast cancer
2024-Apr-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216642
PMID:38278470
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫化学染色，发现ATM与PD-L1在三阴性乳腺癌中的负相关关系，并通过体外实验和动物实验证实ATM通过抑制JNK/c-Jun/TNF-α信号轴负调控PD-L1表达 | 揭示了ATM通过下调JNK/c-Jun/TNF-α信号轴负调控PD-L1的新机制 | NA | 探讨ATM在三阴性乳腺癌中对PD-L1表达的调控机制 | 三阴性乳腺癌细胞和临床样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4个三阴性乳腺癌临床样本和86个三阴性乳腺癌样本 |
| 487 | 2024-08-07 |
Cytokine expression patterns: A single-cell RNA sequencing and machine learning based roadmap for cancer classification
2024-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习技术，分析了肿瘤免疫微环境中的细胞因子表达模式，用于精确的癌症分类 | 首次利用单细胞RNA测序数据结合机器学习模型，识别出不同癌症类型的独特细胞因子表达模式，并应用于癌症分类 | NA | 旨在解决特定类型癌症中细胞因子表达模式的识别问题，并提高癌症分类的准确性 | 肿瘤免疫微环境中的细胞因子表达模式 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习分类模型 | 表达数据 | 包括39种癌症，整合了来自多个公共数据库的684个肿瘤单细胞RNA测序样本 |
| 488 | 2024-08-07 |
Single-cell characterization of infiltrating T cells identifies novel targets for gallbladder cancer immunotherapy
2024-Apr-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216675
PMID:38280478
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建T细胞图谱，识别胆囊癌中的T细胞亚型，并基于这些亚型进行分子分型，以期为胆囊癌的个性化治疗提供新策略 | 首次建立了基于促肿瘤微环境的胆囊癌亚型分类标准，并发现Th17和Treg细胞数量之间的反比关系 | NA | 探索胆囊癌免疫治疗的新靶点 | 胆囊癌中的T细胞亚型及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12种T细胞亚型 |
| 489 | 2024-08-07 |
A BET inhibitor, NHWD-870, can downregulate dendritic cells maturation via the IRF7-mediated signaling pathway to ameliorate imiquimod-induced psoriasis-like murine skin inflammation
2024-Apr-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.176382
PMID:38311277
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研究论文 | 研究了BET抑制剂NHWD-870通过IRF7介导的信号通路下调树突状细胞成熟，从而减轻咪喹莫特诱导的类牛皮癣小鼠皮肤炎症的效果 | 发现NHWD-870能通过抑制IRF7的表达来抑制树突状细胞的成熟和激活，从而减轻牛皮癣样皮肤病变 | NA | 探讨NHWD-870对咪喹莫特诱导的类牛皮癣小鼠模型和体外树突状细胞成熟的影响 | NHWD-870对咪喹莫特诱导的类牛皮癣小鼠皮肤炎症和树突状细胞成熟的影响 | NA | 牛皮癣 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型和树突状细胞 |
| 490 | 2024-08-04 |
Comprehensive analyses and experimental verification of NETs and an EMT gene signature for prognostic prediction, immunotherapy, and chemotherapy in pancreatic adenocarcinoma
2024-Apr, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24082
PMID:38088494
|
研究论文 | 本文探讨了中性粒细胞外网和上皮-间充质转化基因在胰腺腺癌预后预测中的作用 | 建立了一个基于八个NET和EMT相关基因的风险模型，并进行了实验验证 | 未详细描述样本数量和外部数据库的选择标准 | 探究NET和EMT基因与胰腺腺癌患者预后的相关性 | 胰腺腺癌患者及其相关的基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | NA |
| 491 | 2024-08-07 |
Bioinformatics analyses and experimental validation of the role of phagocytosis in low-grade glioma
2024-Apr, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24095
PMID:38112449
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析和实验验证，探讨了吞噬作用在低级别胶质瘤中的作用及其分子特征 | 首次研究了低级别胶质瘤中吞噬作用的改变，并构建了吞噬作用相关的预后标志物 | NA | 揭示吞噬作用的分子特征，并为低级别胶质瘤的个性化治疗奠定基础 | 低级别胶质瘤中的吞噬作用及相关基因 | 生物信息学 | 脑瘤 | 非负矩阵分解聚类、LASSO回归分析、单细胞RNA测序、多重免疫组织化学技术 | NA | mRNA、拷贝数变异、单核苷酸变异、甲基化水平、单细胞RNA测序数据 | 涉及多种癌症类型的样本及低级别胶质瘤样本 |
| 492 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of bronchoalveolar cells reveals a Th17 signature in neutrophilic severe equine asthma
2024-Apr, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13745
PMID:38153159
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研究论文 | 本研究通过单细胞mRNA测序分析了马匹的支气管肺泡细胞，揭示了中性粒细胞性严重马哮喘中的Th17特征 | 首次通过单细胞mRNA测序揭示了中性粒细胞性严重马哮喘中的Th17免疫反应，并发现了与该疾病相关的基因失调 | 研究样本仅限于11匹温血马，可能影响结果的普遍性 | 揭示驱动中性粒细胞性严重马哮喘的免疫机制 | 马匹的支气管肺泡细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞mRNA测序 | NA | 细胞 | 11匹温血马，其中5匹为对照组，6匹为哮喘组 |
| 493 | 2024-08-07 |
Neutrophils facilitate the epicardial regenerative response after zebrafish heart injury
2024-Apr, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.011
PMID:38286185
|
研究论文 | 本文研究了中性粒细胞在斑马鱼心脏再生过程中的作用，特别是在心肌切除后早期再生事件中的功能。 | 首次揭示了中性粒细胞在斑马鱼心脏再生中对心外膜细胞的快速激活作用，并通过scRNA-seq分析确定了FGF和MAPK/ERK信号通路在中性粒细胞介导的心外膜再生反应中的关键作用。 | NA | 探讨中性粒细胞在斑马鱼心脏再生中的作用及其分子机制。 | 中性粒细胞在斑马鱼心脏再生中的功能及分子机制。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 494 | 2024-08-04 |
A dynamical perspective: moving towards mechanism in single-cell transcriptomics
2024-Apr-22, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2023.0049
PMID:38432314
|
评论 | 本文探讨了单细胞转录组学中从表象描述转向机制理解的重要性 | 提出在单细胞分辨率下捕获动态信息的价值，以获取机制见解 | 未明确指出该研究的具体限制 | 目的在于促进对基因调控的机制理解 | 主要研究单细胞转录组学技术和动态信息 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 495 | 2024-08-04 |
scRNA-seq analysis of cells comprising the amphioxus notochord
2024-Apr, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.003
PMID:38224933
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析了含有鳃索的头索动物细胞的特性 | 本研究首次探讨了头索动物鳃索细胞的单细胞特性，揭示了其在脊索发育中的潜在作用 | 单细胞水平的特性分析仍然在某些细胞群体中存在不足，可能需要进一步的研究 | 阐明头索动物鳃索细胞的特性和其在脊索发展中的功能 | 研究对象为头索动物的鳃索细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 496 | 2024-08-04 |
Space-feature measures on meshes for mapping spatial transcriptomics
2024-Apr, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2023.103068
PMID:38176357
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研究论文 | 本文描述了一套用于计算微分流形中的测地线的算法，拓展了大变形微分度量映射算法。 | 首次提出空间特征度量 LDDMM 算法，扩展了现有算法以支持组织尺度的空间特征作用 | 尚未实现通过共同坐标的统计平均整合分子和细胞尺度的人群 | 旨在构建一个跨模态的转录组数据对齐算法以实现共同坐标系统的整合 | 研究对象为小鼠脑中的细胞结构和转录组数据 | 计算解剖学 | NA | MERFISH | LDDMM | 几何测量 | 大量未结构化点 |
| 497 | 2024-08-07 |
A novel subpopulation of monocytes with a strong interferon signature indicated by SIGLEC-1 is present in patients with in recent-onset type 1 diabetes
2024-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06098-4
PMID:38349399
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研究论文 | 本研究探讨了1型糖尿病发病初期的病理性免疫反应，并发现了新的免疫治疗靶点 | 识别出一类新的SIGLEC-1+单核细胞亚群，该亚群在1型糖尿病患者中比例显著增加，并具有强烈的干扰素特征 | NA | 探索1型糖尿病发病初期的病理性免疫反应及新的免疫治疗靶点 | 新诊断的成人隐匿性自身免疫糖尿病（LADA）患者和健康对照者的外周血样本 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 4名LADA患者和4名健康对照者，以及包括54名LADA患者、17名成人2型糖尿病患者和26名健康成人的验证队列 |
| 498 | 2024-08-04 |
Applications of single‑cell omics and spatial transcriptomics technologies in gastric cancer (Review)
2024-Apr, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2024.14285
PMID:38406595
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综述 | 本文综述了单细胞组学和空间转录组学技术在胃癌研究中的应用与进展 | 综述了单细胞组学和ST技术在胃癌分子特征及肿瘤异质性研究中的独特见解 | 缺乏大规模临床数据验证应用效果的讨论 | 探讨单细胞组学和ST技术对胃癌研究的影响 | 单细胞组学和空间转录组学在胃癌中的具体应用 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞组学、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 499 | 2024-08-07 |
Beyond genome: Advanced omics progress of Panax ginseng
2024-Apr, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2024.112022
PMID:38311250
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综述 | 本文综述了人参在基因组学、转录组学和蛋白质组学领域的研究进展 | 讨论并展望了人参基因组等位基因图谱、时空转录组以及翻译后修饰蛋白质组的发展 | NA | 总结人参在不同组学领域的研究现状，并展望未来从系统生物学角度分析人参的研究方向 | 人参的基因组、转录组和蛋白质组 | NA | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | NA |
| 500 | 2024-08-04 |
Revealing the role of necroptosis microenvironment: FCGBP + tumor-associated macrophages drive primary liver cancer differentiation towards cHCC-CCA or iCCA
2024-Apr, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01908-3
PMID:38017206
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研究论文 | 本文揭示了与坏死性凋亡相关的肿瘤微环境在原发性肝癌分化过程中的作用 | 首次识别了调控坏死性凋亡微环境的特定细胞，并探讨了其对原发性肝癌进展的影响 | 本研究的样本量相对较小，仅涉及4例HCC患者和3例iCCA患者 | 探讨坏死性凋亡微环境如何调节肿瘤细胞转化及其对肝癌的影响 | 研究对象为HCC和iCCA患者的肿瘤微环境中不同细胞的作用 | 数字病理学 | 原发性肝癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 34个样本来自4名HCC患者和3名iCCA患者 |