单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
481	2024-08-04	Comprehensive analyses and experimental verification of NETs and an EMT gene signature for prognostic prediction, immunotherapy, and chemotherapy in pancreatic adenocarcinoma 2024-Apr, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24082 PMID:38088494	研究论文	本文探讨了中性粒细胞外网和上皮-间充质转化基因在胰腺腺癌预后预测中的作用	建立了一个基于八个NET和EMT相关基因的风险模型，并进行了实验验证	未详细描述样本数量和外部数据库的选择标准	探究NET和EMT基因与胰腺腺癌患者预后的相关性	胰腺腺癌患者及其相关的基因	数字病理学	胰腺癌	RNA测序	Cox回归模型	转录组数据	NA
482	2024-08-07	Bioinformatics analyses and experimental validation of the role of phagocytosis in low-grade glioma 2024-Apr, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24095 PMID:38112449	研究论文	本文通过生物信息学分析和实验验证，探讨了吞噬作用在低级别胶质瘤中的作用及其分子特征	首次研究了低级别胶质瘤中吞噬作用的改变，并构建了吞噬作用相关的预后标志物	NA	揭示吞噬作用的分子特征，并为低级别胶质瘤的个性化治疗奠定基础	低级别胶质瘤中的吞噬作用及相关基因	生物信息学	脑瘤	非负矩阵分解聚类、LASSO回归分析、单细胞RNA测序、多重免疫组织化学技术	NA	mRNA、拷贝数变异、单核苷酸变异、甲基化水平、单细胞RNA测序数据	涉及多种癌症类型的样本及低级别胶质瘤样本
483	2024-08-04	A dynamical perspective: moving towards mechanism in single-cell transcriptomics 2024-Apr-22, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences DOI:10.1098/rstb.2023.0049 PMID:38432314	评论	本文探讨了单细胞转录组学中从表象描述转向机制理解的重要性	提出在单细胞分辨率下捕获动态信息的价值，以获取机制见解	未明确指出该研究的具体限制	目的在于促进对基因调控的机制理解	主要研究单细胞转录组学技术和动态信息	数字病理学	NA	NA	NA	NA	NA
484	2024-08-04	scRNA-seq analysis of cells comprising the amphioxus notochord 2024-Apr, Developmental biology IF:2.5Q2 DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.003 PMID:38224933	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序分析了含有鳃索的头索动物细胞的特性	本研究首次探讨了头索动物鳃索细胞的单细胞特性，揭示了其在脊索发育中的潜在作用	单细胞水平的特性分析仍然在某些细胞群体中存在不足，可能需要进一步的研究	阐明头索动物鳃索细胞的特性和其在脊索发展中的功能	研究对象为头索动物的鳃索细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA数据	NA
485	2024-08-04	Space-feature measures on meshes for mapping spatial transcriptomics 2024-Apr, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2023.103068 PMID:38176357	研究论文	本文描述了一套用于计算微分流形中的测地线的算法，拓展了大变形微分度量映射算法。	首次提出空间特征度量 LDDMM 算法，扩展了现有算法以支持组织尺度的空间特征作用	尚未实现通过共同坐标的统计平均整合分子和细胞尺度的人群	旨在构建一个跨模态的转录组数据对齐算法以实现共同坐标系统的整合	研究对象为小鼠脑中的细胞结构和转录组数据	计算解剖学	NA	MERFISH	LDDMM	几何测量	大量未结构化点
486	2024-08-07	A novel subpopulation of monocytes with a strong interferon signature indicated by SIGLEC-1 is present in patients with in recent-onset type 1 diabetes 2024-Apr, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-024-06098-4 PMID:38349399	研究论文	本研究探讨了1型糖尿病发病初期的病理性免疫反应，并发现了新的免疫治疗靶点	识别出一类新的SIGLEC-1+单核细胞亚群，该亚群在1型糖尿病患者中比例显著增加，并具有强烈的干扰素特征	NA	探索1型糖尿病发病初期的病理性免疫反应及新的免疫治疗靶点	新诊断的成人隐匿性自身免疫糖尿病（LADA）患者和健康对照者的外周血样本	免疫学	1型糖尿病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列	4名LADA患者和4名健康对照者，以及包括54名LADA患者、17名成人2型糖尿病患者和26名健康成人的验证队列
487	2024-08-04	Applications of single‑cell omics and spatial transcriptomics technologies in gastric cancer (Review) 2024-Apr, Oncology letters IF:2.5Q3 DOI:10.3892/ol.2024.14285 PMID:38406595	综述	本文综述了单细胞组学和空间转录组学技术在胃癌研究中的应用与进展	综述了单细胞组学和ST技术在胃癌分子特征及肿瘤异质性研究中的独特见解	缺乏大规模临床数据验证应用效果的讨论	探讨单细胞组学和ST技术对胃癌研究的影响	单细胞组学和空间转录组学在胃癌中的具体应用	数字病理学	胃癌	单细胞组学、空间转录组学	NA	NA	NA
488	2024-08-07	Beyond genome: Advanced omics progress of Panax ginseng 2024-Apr, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.plantsci.2024.112022 PMID:38311250	综述	本文综述了人参在基因组学、转录组学和蛋白质组学领域的研究进展	讨论并展望了人参基因组等位基因图谱、时空转录组以及翻译后修饰蛋白质组的发展	NA	总结人参在不同组学领域的研究现状，并展望未来从系统生物学角度分析人参的研究方向	人参的基因组、转录组和蛋白质组	NA	NA	基因组学、转录组学、蛋白质组学	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	NA
489	2024-08-04	Revealing the role of necroptosis microenvironment: FCGBP + tumor-associated macrophages drive primary liver cancer differentiation towards cHCC-CCA or iCCA 2024-Apr, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1 DOI:10.1007/s10495-023-01908-3 PMID:38017206	研究论文	本文揭示了与坏死性凋亡相关的肿瘤微环境在原发性肝癌分化过程中的作用	首次识别了调控坏死性凋亡微环境的特定细胞，并探讨了其对原发性肝癌进展的影响	本研究的样本量相对较小，仅涉及4例HCC患者和3例iCCA患者	探讨坏死性凋亡微环境如何调节肿瘤细胞转化及其对肝癌的影响	研究对象为HCC和iCCA患者的肿瘤微环境中不同细胞的作用	数字病理学	原发性肝癌	单细胞RNA测序和空间转录组学	NA	基因表达数据	34个样本来自4名HCC患者和3名iCCA患者
490	2024-08-07	Apoptosis-related prognostic biomarkers and potential targets for acute kidney injury based on machine learning algorithm and in vivo experiments 2024-Apr, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1 DOI:10.1007/s10495-023-01896-4 PMID:37789227	研究论文	本研究通过机器学习算法和体内实验，识别与急性肾损伤（AKI）相关的凋亡相关生物标志物和潜在治疗靶点	本研究首次验证了包含三个核心凋亡相关基因（ARGs）的诊断模型，并探讨了这些基因在AKI进展中的作用	NA	探索急性肾损伤的诊断生物标志物和治疗靶点	急性肾损伤及其相关凋亡基因	机器学习	肾脏疾病	单细胞RNA测序分析	NA	基因表达数据	使用了叶酸和顺铂诱导的AKI小鼠模型
491	2024-08-07	Cuproptosis/OXPHOS tendency prediction of prognosis and immune microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma: Bioinformatics analysis and experimental validation 2024-Apr-15, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148156 PMID:38211899	研究论文	本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了氧化磷酸化（OXPHOS）与铜死亡（cuproptosis）在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的关联及其对预后的影响	首次揭示了OXPHOS与ESCC中铜死亡倾向的关系，并构建了铜死亡-OXPHOS预后标志物	NA	研究OXPHOS与ESCC中铜死亡倾向的关系及其对预后的影响	食管鳞状细胞癌（ESCC）中的铜死亡和氧化磷酸化	生物信息学	食管癌	scRNA-seq	CNN	单细胞数据	10种核心细胞类型
492	2024-08-07	Single cell RNA-sequencing data generated from mouse adipose tissue during the development of obesity 2024-Apr, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.110119 PMID:38348326	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠附睾脂肪组织在肥胖发展过程中免疫微环境的变化及其细胞类型和基因的变化	首次探讨了肥胖早期阶段脂肪组织是否释放促炎细胞因子的问题，并分析了肥胖发展过程中脂肪组织免疫微环境的变化	NA	研究肥胖发展过程中脂肪组织的免疫微环境和细胞类型及基因的变化	小鼠附睾脂肪组织在肥胖发展过程中的免疫微环境	数字病理学	肥胖	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	NA
493	2024-08-05	Molecular functional characterization of the setdb1 and its potential target gene sox5 illuminate the histone modification-mediated orchestration of gonadal development in Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis) 2024-Apr-05, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148199 PMID:38253299	研究论文	该研究揭示了setdb1在中国舌鳎性别分化和生殖细胞发育中的作用	首次在中国舌鳎中详细描述了setdb1及其潜在靶基因sox5在性别发育调控中的分子机制	缺乏对setdb1在其他发育阶段的功能研究	探讨setdb1如何通过调控sox5的转录影响性别分化和生殖细胞发育	中国舌鳎的setdb1基因及其靶基因sox5	数字病理学	NA	qRT-PCR, 单细胞RNA测序	NA	基因序列, RNA数据	NA
494	2024-08-07	Bulk RNA-sequencing, single-cell RNA-sequencing analysis, and experimental validation reveal iron metabolism-related genes CISD2 and CYP17A1 are potential diagnostic markers for recurrent pregnancy loss 2024-Apr-05, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148168 PMID:38244949	研究论文	本研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，结合实验验证，发现铁代谢相关基因CISD2和CYP17A1可能是复发性流产的潜在诊断标志物	首次揭示CISD2和CYP17A1基因在复发性流产中的作用，并验证了它们作为诊断和治疗标志物的潜力	NA	探索复发性流产的潜在诊断和治疗标志物	复发性流产患者的铁代谢相关基因	数字病理学	生殖系统疾病	RNA测序	NA	基因表达数据	涉及520个铁代谢相关基因，具体样本数量未详细说明
495	2024-08-07	Intracellular and extracellular synergistic therapy for restoring macrophage functions via anti-CD47 antibody-conjugated bifunctional nanoparticles in atherosclerosis 2024-Apr, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.12.024 PMID:38274294	研究论文	本研究开发了一种双功能纳米粒子，通过抗CD47抗体偶联，实现对巨噬细胞功能的细胞内和细胞外协同治疗，用于治疗动脉粥样硬化	本研究创新性地使用了双功能纳米粒子，结合抗CD47抗体和NLRP3抑制剂CY-09，实现了对巨噬细胞内外信号的有效调控	NA	研究旨在通过调控巨噬细胞功能，有效减少动脉粥样硬化斑块的形成，从而降低心血管疾病的风险	研究对象为动脉粥样硬化中的巨噬细胞及其功能	心血管疾病	心血管疾病	纳米技术	NA	RNA序列	研究使用了Apoe小鼠模型
496	2024-08-07	Microgel-based carriers enhance skeletal stem cell reprogramming towards immunomodulatory phenotype in osteoarthritic therapy 2024-Apr, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.12.022 PMID:38235309	研究论文	本研究探讨了微凝胶载体在骨关节炎治疗中对骨骼干细胞向免疫调节表型重编程的影响	首次揭示了微凝胶载体通过促进YAP蛋白核转位，增强骨骼干细胞的免疫调节能力，从而有效治疗骨关节炎	研究主要集中在实验室条件下，未来需进一步验证在临床环境中的效果	探索微凝胶载体在骨骼干细胞治疗骨关节炎中的作用机制	骨骼干细胞及其在骨关节炎治疗中的应用	生物医学工程	骨关节炎	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及骨关节炎大鼠模型
497	2024-08-07	Enhanced bone regeneration via endochondral ossification using Exendin-4-modified mesenchymal stem cells 2024-Apr, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.12.007 PMID:38186959	研究论文	本文介绍了一种通过Exendin-4修饰的间充质干细胞促进骨再生的策略	提出了过表达Exendin-4的间充质干细胞在骨重塑中的自分泌和旁分泌功能的作用	未提及具体的临床数据支持	研究通过内软骨骨化促进骨再生的潜力	过表达Exendin-4的间充质干细胞	数字病理学	NA	NA	NA	单细胞测序数据	在大鼠颅骨缺损模型中使用
498	2024-08-07	Transcriptome analysis reveals therapeutic potential of NAMPT in protecting against abdominal aortic aneurysm in human and mouse 2024-Apr, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.11.020 PMID:38173843	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了正常和腹主动脉瘤（AAA）腹主动脉的分子特征，发现AAA中细胞异质性增加，并揭示了NAMPT在保护AAA中的潜在治疗作用。	首次揭示了NAMPT在腹主动脉瘤中的下调及其通过外泌体补充NAMPT的潜在治疗作用。	NA	探索腹主动脉瘤的分子机制及其潜在治疗策略。	人类和小鼠的腹主动脉瘤。	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA