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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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461 | 2024-08-04 |
Genetic correlations, shared risk genes and immunity landscapes between COVID-19 and venous thromboembolism: evidence from GWAS and bulk transcriptome data
2024-Apr, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01857-w
PMID:38433131
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研究论文 | 本研究表征了COVID-19与静脉血栓栓塞(VTE)之间的遗传相关性及共同致病机制 | 首次揭示了COVID-19及VTE之间的遗传相关性和潜在共享基因,识别了TP53I3和SLPI作为关键基因 | 缺乏关于COVID-19和VTE影响的长期临床数据支持 | 旨在探讨COVID-19与VTE之间的遗传关联及其潜在共同机制 | 研究COVID-19和VTE相关的数据集及基因 | 数字病理学 | NA | GWAS,转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 共涉及四个数据集,包含多个样本 |
462 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Reveals Potential Mechanisms for Coronary Artery Lesions in Kawasaki Disease
2024-Apr, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320188
PMID:38357816
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了川崎病中冠状动脉病变的发展机制 | 首次揭示了川崎病中冠状动脉病变发展的免疫细胞和炎症因子风暴的作用机制 | 样本量较小,且仅包括儿童患者 | 探讨川崎病中冠状动脉病变的免疫学机制 | 川崎病患者的单核细胞和血小板 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 212,210个外周血单核细胞,来自16名儿童 |
463 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell and RNA-seq data to explore the role of focal adhesion-related genes in osteoporosis
2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18271
PMID:38534087
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和RNA测序数据,挖掘与焦点粘附相关的关键基因,并探讨其在骨质疏松症中的作用 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和RNA测序数据,识别了两个与焦点粘附相关的关键基因(FAM129A和RNF24),并构建了竞争性内源RNA网络和转录因子-关键基因网络,预测了潜在的治疗药物 | 研究主要基于现有数据集进行分析,未涉及大规模临床试验验证预测药物的疗效 | 旨在挖掘与焦点粘附相关的关键基因,并探讨其在骨质疏松症中的作用,为骨质疏松症的治疗和评估提供新视角 | 焦点粘附相关基因在骨质疏松症中的作用 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | RNA | 涉及GSE56815和GSE56116两个队列,具体样本数量未详细说明 |
464 | 2024-08-07 |
Programmed Death Ligand 1-Expressing Macrophages and Their Protective Role in the Joint During Arthritis
2024-Apr, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42749
PMID:37997621
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研究论文 | 本研究探讨了程序性死亡配体1(PD-L1)在胶原诱导性关节炎(CIA)小鼠模型中对关节稳态的作用 | 首次揭示了PD-L1+巨噬细胞在关节炎中的保护作用,并展示了其在人类滑膜中的存在 | 研究主要基于小鼠模型,其结果在人类中的直接应用可能存在局限性 | 研究PD-L1在关节炎中的作用及其对关节稳态的影响 | PD-L1在胶原诱导性关节炎中的表达及其对关节炎严重程度的影响 | NA | 关节炎 | 流式细胞术,逆转录-聚合酶链反应,单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用CIA小鼠模型和人类滑膜样本进行研究 |
465 | 2024-08-04 |
p53 accelerates endothelial cell senescence in diabetic retinopathy by enhancing FoxO3a ubiquitylation and degradation via UBE2L6
2024-Apr, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2024.112391
PMID:38437929
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研究论文 | 本文探讨了p53如何通过增强FoxO3a的泛素化和降解来加速糖尿病视网膜病变中的内皮细胞衰老 | 首次揭示了p53在糖尿病视网膜病变中加速内皮细胞衰老的新机制 | 未明确探讨该机制在其他类型视网膜疾病中的适用性 | 研究p53在糖尿病视网膜病变中的作用机制 | db/db小鼠视网膜及其内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | bulk RNA测序和单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠 |
466 | 2024-08-04 |
Intratumoral IL-12 delivery via mesenchymal stem cells combined with PD-1 blockade leads to long-term antitumor immunity in a mouse glioblastoma model
2024-Apr, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115790
PMID:38431436
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研究论文 | 本研究开发了IL-12分泌的间充质干细胞,并评估了其与抗PD-1联合治疗胶质母细胞瘤的疗效 | 通过将IL-12分泌的间充质干细胞与抗PD-1联合使用,显著增强了针对胶质母细胞瘤的抗肿瘤免疫 | 本研究在小鼠模型中进行,临床转化的有效性和安全性需进一步验证 | 探索抗PD-1与IL-12-secreting间充质干细胞联合治疗对胶质母细胞瘤的长期疗效 | 胶质母细胞瘤小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 小鼠单细胞转录组测序 | NA | 实验小鼠组织样本 | 共涉及29只小鼠,分别是16只和13只小鼠用于不同单疗法,12只小鼠用于联合疗法 |
467 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing: A promising approach for uncovering the characteristic of pancreatic islet cells in type 2 diabetes
2024-Apr, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2024.116292
PMID:38394848
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综述 | 这篇文章总结了单细胞测序在2型糖尿病胰岛细胞特征研究中的应用 | 该研究强调了单细胞测序在揭示细胞异质性和改善干细胞治疗中的创新应用 | 文章讨论了单细胞测序的局限性,但未具体阐述 | 探讨单细胞测序在2型糖尿病发病机制中的潜在应用和治疗靶点 | 胰岛细胞和功能性β细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学、表观遗传学数据 | NA |
468 | 2024-08-04 |
Detailed survey of an in vitro intestinal epithelium model by single-cell transcriptomics
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109383
PMID:38523788
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序详细调查了两种成人结直肠癌细胞系共培养模型的细胞类型异质性 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了肠上皮模型的细胞类型异质性,并与人类生理进行全面比较 | 共培养模型无法完整模拟人类上皮的先天免疫特征 | 探索成人结直肠癌细胞系共培养模型的生物学特性及其与人类生理的相似性 | 两种成人结直肠癌细胞系Caco-2和HT29的共培养系统 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用两种结直肠癌细胞系的共培养系统 |
469 | 2024-08-07 |
Mild hypothermia promotes neuronal differentiation of human neural stem cells via RBM3-SOX11 signaling pathway
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109435
PMID:38523796
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研究论文 | 本研究探讨了轻度低温(35°C)对人类神经干细胞(hNSCs)神经元分化的影响 | 发现了轻度低温通过RBM3-SOX11信号通路促进hNSCs神经元分化的机制 | NA | 研究轻度低温对hNSCs神经元分化的影响及其机制 | 人类神经干细胞(hNSCs) | 神经科学 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
470 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the landscape of epithelial-mesenchymal transition molecular heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Apr-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216723
PMID:38342234
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研究论文 | 本研究通过分析209,231个食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞的高分辨率单细胞转录组数据,揭示了ESCC中上皮-间质转化(EMT)的分子异质性 | 首次全面分析了ESCC发展过程中EMT的分子异质性,并鉴定了87个EMT相关分子,发现了SERPINH1作为ESCC EMT的新潜在标记物 | NA | 揭示食管鳞状细胞癌中上皮-间质转化的分子异质性,并探索潜在的抑制策略 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 209,231个ESCC细胞,来自44个个体中的39个肿瘤样本和16个邻近样本 |
471 | 2024-08-07 |
ICOS costimulation in combination with CTLA-4 blockade remodels tumor-associated macrophages toward an antitumor phenotype
2024-Apr-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231263
PMID:38517331
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研究论文 | 研究探讨了ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗对肿瘤相关巨噬细胞表型的重塑作用 | 发现ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗能显著重塑淋巴和髓系细胞,增强Th1 CD4 T细胞、效应CD8 T细胞和M1样抗肿瘤促炎巨噬细胞的富集 | NA | 研究ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗在抗肿瘤治疗中的协同作用及其机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和效应T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | CyTOF和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及B16-F10细胞疫苗和多种免疫细胞 |
472 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals genome evolution in predatory litostomatean ciliates
2024-Apr, European journal of protistology
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.ejop.2024.126062
PMID:38368736
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析揭示了捕食性小凹体纤毛虫的基因组演化 | 首次通过单细胞测序技术获取捕食性小凹体纤毛虫的转录组特征,提出捕食能力的潜在遗传基础 | 本研究可能缺乏对非捕食性纤毛虫的深入比较分析 | 研究捕食性小凹体纤毛虫的转录组特征及其基因组演化 | 六种捕食性小凹体纤毛虫 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 六种捕食性小凹体纤毛虫的转录组数据 |
473 | 2024-08-04 |
Modulating inflammation with interleukin 37 treatment ameliorates murine Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2024-Apr, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.12.006
PMID:38158181
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研究论文 | 本研究探讨了抗炎细胞因子IL37b作为治疗常染色体显性多囊肾病(ADPKD)的潜力。 | 发现IL37b通过促进干扰素信号通路抑制囊肿的形成,提出了其作为ADPKD潜在治疗的可能性。 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化仍需验证。 | 探讨IL37b在治疗常染色体显性多囊肾病中的作用。 | 使用遗传小鼠模型研究IL37b对ADPKD的影响。 | 数字病理学 | 常染色体显性多囊肾病 | RNA-seq | 转基因小鼠 | 基因组数据 | 多个ADPKD小鼠模型 |
474 | 2024-08-07 |
CYBB-Mediated Ferroptosis Associated with Immunosuppression in Mycobacterium leprae-Infected Monocyte-Derived Macrophages
2024-Apr, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.10.012
PMID:37925067
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康个体中由单核细胞衍生的巨噬细胞对麻风分枝杆菌感染的初始反应,并发现了一种主要类型的替代激活巨噬细胞,该巨噬细胞过度表达NEAT1、CCL2和CD163。进一步的功能分析显示,铁死亡与巨噬细胞的M2极化呈正相关,且体外实验表明抑制铁死亡有助于麻风分枝杆菌在巨噬细胞内的存活。 | 本研究首次揭示了CYBB作为关键分子在麻风分枝杆菌感染的巨噬细胞中促进铁死亡,进而导致M2极化和免疫逃逸的机制。 | 本研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据,未来需要更多的体内实验和临床数据来验证这些发现。 | 探讨麻风分枝杆菌感染的巨噬细胞中铁死亡与M2极化的关系及其分子机制。 | 健康个体中由单核细胞衍生的巨噬细胞对麻风分枝杆菌感染的反应。 | NA | 麻风病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4名健康个体 |
475 | 2024-08-07 |
Histone deacetylase 6 suppression of renal tubular epithelial cell promotes interstitial mineral deposition via alpha-tubulin acetylation
2024-04, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111057
PMID:38242268
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶6(HDAC6)在肾小管上皮细胞中的抑制作用及其通过α-微管蛋白乙酰化促进间质矿物沉积的机制 | 研究发现HDAC6的抑制加剧了MDCK细胞中的矿物沉积,而其过表达则减轻了这一现象,表明HDAC6在调节肾小管上皮细胞矿物沉积中起关键作用 | 研究未观察到与矿物沉积增加相关的成骨相关蛋白表达增加,且单细胞RNA测序结果显示上皮细胞的钙化活性较低,提示成骨性转分化可能并未实际发生 | 探讨HDAC6在肾小管上皮细胞中的作用及其对间质矿物沉积的影响 | 肾小管上皮细胞、高草酸尿大鼠的肾脏组织、体外培养的MDCK细胞及NRK49F细胞 | NA | 肾结石 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肾乳头样本的单细胞RNA测序 |
476 | 2024-08-04 |
Exogenous IL-2 delays memory precursors generation and is essential for enhancing memory cells effector functions
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109411
PMID:38510150
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研究论文 | 本研究探讨了外源IL-2信号对记忆前体细胞分化的影响 | 本研究首次揭示外源IL-2延迟记忆前体细胞的生成,并增强了记忆细胞的效应功能 | 本研究的局限性在于未探讨其他细胞因子对记忆前体细胞生成的共同作用 | 研究外源IL-2对CD8 T细胞记忆分化的影响 | CD8 T细胞及其在病毒感染小鼠中的记忆分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 病毒感染小鼠中的转移细胞 |
477 | 2024-08-04 |
scGREAT: Transformer-based deep-language model for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomics
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109352
PMID:38510148
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研究论文 | 提出了一种名为scGREAT的框架,用于从单细胞转录组数据推断基因调控网络。 | scGREAT使用基因嵌入和Transformer来优化推断过程,相较于现有方法具有更好的性能。 | 尽管scGREAT表现良好,但仍可能受到计算开销的限制。 | 研究单细胞转录组数据中的基因调控网络推断。 | 单细胞测序数据和基因调控信息。 | 计算机视觉 | NA | scRNA-seq | Transformer | 表达数据,基因文本信息 | NA |
478 | 2024-08-07 |
Aortic Cellular Heterogeneity in Health and Disease: Novel Insights Into Aortic Diseases From Single-Cell RNA Transcriptomic Data Sets
2024-Apr, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示健康与疾病状态下主动脉细胞异质性方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析了主动脉细胞类型在健康与疾病状态下的异质性及其相关生物过程 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何增强我们对主动脉疾病细胞驱动因素的理解 | 主动脉疾病如动脉粥样硬化、主动脉瘤和主动脉硬化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
479 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptome atlas of Lueyang black-bone chicken skin
2024-Apr, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.103513
PMID:38350389
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了黑羽鸡和白羽鸡皮肤细胞的转录组特征 | 首次报道了鸡皮肤细胞的组成和转录组特征,并鉴定了与色素颗粒捕获和沉积相关的特定细胞亚群 | NA | 揭示鸡皮肤细胞的转录组特征,为家禽育种提供重要信息 | 黑羽鸡和白羽鸡的皮肤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 黑羽鸡和白羽鸡的皮肤细胞样本 |
480 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing of diverse microorganisms
2024-Apr, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-024-00708-y
PMID:38366032
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |