单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
441	2024-08-04	Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer 2024-Apr-01, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-47068-z PMID:38561380	研究论文	本文分析了乳腺癌中免疫抑制成纤维细胞的空间格局和可塑性	首次构建了乳腺癌中FAP+ CAF相关的高分辨率空间细胞生态图谱	尚未充分理解FAP+ CAF的所有多样性与功能	研究乳腺癌中特定成纤维细胞亚群的空间分布和功能	主要关注乳腺癌中FAP+ 免疫抑制成纤维细胞的不同亚群	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学，功能测定	NA	单细胞转录组数据	NA
442	2024-08-07	FANCD2 deficiency sensitizes SHH medulloblastoma to radiotherapy via ferroptosis 2024-04, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6245 PMID:38229567	研究论文	研究探讨了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的表达及其对放射治疗敏感性的影响	首次揭示了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的高表达及其通过诱导铁死亡增强放射治疗敏感性的机制	研究主要集中在细胞和小鼠模型上，尚未在临床试验中验证	探究FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的作用及其对放射治疗的影响	SHH型髓母细胞瘤细胞及小鼠模型	数字病理学	髓母细胞瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	38个髓母细胞瘤组织样本
443	2024-08-07	Mustn1 is a smooth muscle cell-secreted microprotein that modulates skeletal muscle extracellular matrix composition 2024-Apr, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2024.101912 PMID:38458566	研究论文	本研究探讨了Mustn1蛋白在骨骼肌重塑和修复中的作用，特别是在肌肉萎缩和代偿性肥大转变中的功能。	发现Mustn1是一种由平滑肌细胞分泌的微蛋白，参与调节骨骼肌细胞外基质的组成，这一发现扩展了Mustn1的功能范围。	尚未完全探索Mustn1在肌肉损伤和肌营养不良中的纤维化和免疫浸润作用，以及其作为治疗干预的潜力。	旨在识别调节肌肉萎缩到代偿性肥大或损伤恢复转变的基因和分子途径。	使用后肢卸载和重载的小鼠模型，研究骨骼肌在萎缩和代偿性再生及肥大过程中的基因和蛋白表达变化。	NA	NA	qRT-PCR, 免疫组织化学, 批量和单细胞RNA测序	NA	转录组, 细胞外液蛋白组	包括Mustn1缺陷型遗传小鼠模型和野生型同窝小鼠
444	2024-08-07	Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing reveals a novel signature based on NK cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer 2024-04-01, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-57714-7 PMID:38561388	研究论文	本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出基于NK细胞标记基因的新型特征，用于预测胃癌的预后和免疫治疗反应	本研究首次建立了基于NK细胞标记基因的12基因特征，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应	本研究仅在TCGA和GEO数据集上进行了验证，未来需要在更多独立数据集上进行进一步验证	旨在建立基于NK细胞标记基因的可靠特征，为评估胃癌患者的免疫治疗和预后提供新视角	胃癌患者的预后和免疫治疗反应	数字病理学	胃癌	RNA测序	Cox回归分析	RNA测序数据	共分析了1560个样本
445	2024-08-07	Identification of genetic modifiers enhancing B7-H3-targeting CAR T cell therapy against glioblastoma through large-scale CRISPRi screening 2024-Apr-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1 DOI:10.1186/s13046-024-03027-6 PMID:38561797	研究论文	本研究通过大规模CRISPRi筛选，识别增强B7-H3靶向CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤的遗传修饰因子	发现了一系列遗传修饰因子，如ARPC4、PI4KA、ATP6V1A、UBA1和NDUFV1，这些因子调节CAR T细胞介导的肿瘤杀伤效果，并揭示了TNFSF15在调节肿瘤-CAR T细胞相互作用中的免疫刺激作用	NA	提高CAR T细胞疗法在胶质母细胞瘤中的疗效	胶质母细胞瘤细胞系U87 MG细胞与B7-H3靶向CAR T细胞	数字病理学	脑肿瘤	CRISPRi筛选	NA	RNA测序数据	大规模细胞系
446	2024-08-07	Single-Cell RNA Sequencing Profiling Cellular Heterogeneity and Specific Responses of Fish Gills to Microplastics and Nanoplastics 2024-Apr-02, Environmental science & technology IF:10.8Q1 DOI:10.1021/acs.est.3c10338 PMID:38512049	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了罗非鱼鳃对微塑料和纳米塑料暴露的细胞异质性和特定反应	首次揭示了罗非鱼鳃对微塑料和纳米塑料的细胞异质性反应，并提供了单细胞分辨率的毒理学机制敏感标记	NA	研究鱼鳃对微塑料和纳米塑料的细胞异质性和特定反应	罗非鱼鳃的单个细胞群体对微塑料和纳米塑料暴露的反应	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	涉及12种已识别的细胞群体
447	2024-08-04	Integrated single-cell transcriptomics reveals the hypoxia-induced inflammation-cancer transformation in NASH-derived hepatocellular carcinoma 2024-Apr, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13576 PMID:37994257	研究论文	本研究揭示了缺氧诱导的炎症-癌症转化机制在NASH衍生的肝细胞癌中的作用	首次通过单细胞转录组学整合研究识别出了从NAFLD到HCC的转变过程中CYP7A1肝细胞的功能和亚群体	未提及样本的具体数量及其在临床应用中的直接验证	探讨NAFLD相关肝细胞癌的发展机制	肝细胞和巨噬细胞的单细胞转录组分析	数字病理学	非酒精性脂肪肝病相关肝细胞癌	单细胞转录组学	小鼠模型	转录组数据	四个单细胞转录组数据集
448	2024-08-07	Single-cell analysis of 5-aminolevulinic acid intraoperative labeling specificity for glioblastoma 2024-Apr-01, Journal of neurosurgery IF:3.5Q1 DOI:10.3171/2023.7.JNS23122 PMID:37773782	研究论文	本研究通过单细胞光学表型分析和表达测序（SCOPE-seq2）方法，评估了5-氨基乙酰丙酸（5-ALA）在胶质母细胞瘤（GBM）手术中标记细胞类型的特异性	首次在单细胞水平上评估了5-ALA在胶质母细胞瘤中的标记特异性	研究发现5-ALA的标记并非仅限于肿瘤细胞，非肿瘤细胞也可能被标记，这质疑了5-ALA在荧光引导手术中对肿瘤细胞的特异性标记	确定5-ALA在胶质母细胞瘤中标记细胞类型的特异性	人胶质母细胞瘤手术标本中的单个细胞	数字病理学	脑肿瘤	单细胞光学表型分析和表达测序（SCOPE-seq2）	NA	图像和RNA序列	来自接受5-ALA治疗患者的胶质母细胞瘤手术标本
449	2024-08-04	Single-cell and spatial transcriptomics: Bridging current technologies with long-read sequencing 2024-04, Molecular aspects of medicine IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.mam.2024.101255 PMID:38368637	研究论文	本文探讨了单细胞和空间转录组学与长读长测序技术的结合	提出了将单细胞技术、空间转录组学与长读长测序结合的新方法	尚存在一些挑战和需要解决的问题	旨在描绘细胞在组织背景中的特征及其异质性	研究单细胞和空间转录组学领域的技术结合	数字病理学	NA	长读长测序	NA	NA	NA
450	2024-08-07	The role of positional information in determining dermal fibroblast diversity 2024-Apr, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology IF:4.5Q2 DOI:10.1016/j.matbio.2024.02.009 PMID:38423396	综述	本文综述了位置信息在决定皮肤成纤维细胞多样性中的作用及其对皮肤稳态、伤口愈合、纤维化和癌症的影响	探讨了成纤维细胞多样性对皮肤功能和疾病发展的影响，为抗纤维化治疗和个性化医疗提供新思路	NA	理解成纤维细胞多样性如何影响皮肤稳态、伤口愈合、纤维化和癌症	皮肤成纤维细胞及其在皮肤功能和疾病中的作用	NA	纤维化疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
451	2024-08-07	Development and validation of a prognostic model for cervical cancer by combination of machine learning and high-throughput sequencing 2024-Apr, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology DOI:10.1016/j.ejso.2024.108241 PMID:38452717	研究论文	本研究开发并验证了一种结合机器学习和高通量测序的宫颈癌预后模型	本研究首次结合单细胞RNA测序和高通量测序数据，利用多种机器学习算法构建宫颈癌预后模型	本研究仅使用了两个单细胞RNA测序项目和TCGA数据进行模型构建和验证，可能存在样本选择偏倚	开发一种评估宫颈癌预后的综合模型	宫颈癌患者	机器学习	宫颈癌	单细胞RNA测序	随机森林	基因表达数据	使用了两个单细胞RNA测序项目和TCGA数据，具体样本数量未详细说明
452	2024-08-07	T cells with increased responsiveness cause obesity in mice without diet intervention 2024-Apr-19, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.109471 PMID:38551005	研究论文	本研究使用增强T细胞反应性的老鼠模型，展示了肥胖可以通过免疫细胞驱动	首次证明增强的T细胞反应性可以直接导致肥胖，无需饮食干预	研究仅限于老鼠模型，尚未在人类中验证	探讨肥胖的免疫细胞机制，特别是T细胞的作用	增强T细胞反应性的老鼠模型	NA	肥胖	单细胞RNA测序和CyTOF分析	NA	细胞	多个老鼠模型
453	2024-08-04	Genetic correlations, shared risk genes and immunity landscapes between COVID-19 and venous thromboembolism: evidence from GWAS and bulk transcriptome data 2024-Apr, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2 DOI:10.1007/s00011-024-01857-w PMID:38433131	研究论文	本研究表征了COVID-19与静脉血栓栓塞（VTE）之间的遗传相关性及共同致病机制	首次揭示了COVID-19及VTE之间的遗传相关性和潜在共享基因，识别了TP53I3和SLPI作为关键基因	缺乏关于COVID-19和VTE影响的长期临床数据支持	旨在探讨COVID-19与VTE之间的遗传关联及其潜在共同机制	研究COVID-19和VTE相关的数据集及基因	数字病理学	NA	GWAS，转录组分析	NA	基因表达数据	共涉及四个数据集，包含多个样本
454	2024-08-07	Single-Cell Transcriptome Reveals Potential Mechanisms for Coronary Artery Lesions in Kawasaki Disease 2024-Apr, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320188 PMID:38357816	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，探讨了川崎病中冠状动脉病变的发展机制	首次揭示了川崎病中冠状动脉病变发展的免疫细胞和炎症因子风暴的作用机制	样本量较小，且仅包括儿童患者	探讨川崎病中冠状动脉病变的免疫学机制	川崎病患者的单核细胞和血小板	数字病理学	心血管疾病	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	212,210个外周血单核细胞，来自16名儿童
455	2024-08-07	Integration of single-cell and RNA-seq data to explore the role of focal adhesion-related genes in osteoporosis 2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.18271 PMID:38534087	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和RNA测序数据，挖掘与焦点粘附相关的关键基因，并探讨其在骨质疏松症中的作用	本研究首次结合单细胞RNA测序和RNA测序数据，识别了两个与焦点粘附相关的关键基因（FAM129A和RNF24），并构建了竞争性内源RNA网络和转录因子-关键基因网络，预测了潜在的治疗药物	研究主要基于现有数据集进行分析，未涉及大规模临床试验验证预测药物的疗效	旨在挖掘与焦点粘附相关的关键基因，并探讨其在骨质疏松症中的作用，为骨质疏松症的治疗和评估提供新视角	焦点粘附相关基因在骨质疏松症中的作用	数字病理学	骨质疏松症	单细胞RNA测序，RNA测序	NA	RNA	涉及GSE56815和GSE56116两个队列，具体样本数量未详细说明
456	2024-08-07	Programmed Death Ligand 1-Expressing Macrophages and Their Protective Role in the Joint During Arthritis 2024-Apr, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/art.42749 PMID:37997621	研究论文	本研究探讨了程序性死亡配体1（PD-L1）在胶原诱导性关节炎（CIA）小鼠模型中对关节稳态的作用	首次揭示了PD-L1+巨噬细胞在关节炎中的保护作用，并展示了其在人类滑膜中的存在	研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的直接应用可能存在局限性	研究PD-L1在关节炎中的作用及其对关节稳态的影响	PD-L1在胶原诱导性关节炎中的表达及其对关节炎严重程度的影响	NA	关节炎	流式细胞术，逆转录-聚合酶链反应，单细胞RNA测序	NA	RNA	使用CIA小鼠模型和人类滑膜样本进行研究
457	2024-08-04	p53 accelerates endothelial cell senescence in diabetic retinopathy by enhancing FoxO3a ubiquitylation and degradation via UBE2L6 2024-Apr, Experimental gerontology IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.exger.2024.112391 PMID:38437929	研究论文	本文探讨了p53如何通过增强FoxO3a的泛素化和降解来加速糖尿病视网膜病变中的内皮细胞衰老	首次揭示了p53在糖尿病视网膜病变中加速内皮细胞衰老的新机制	未明确探讨该机制在其他类型视网膜疾病中的适用性	研究p53在糖尿病视网膜病变中的作用机制	db/db小鼠视网膜及其内皮细胞	数字病理学	糖尿病视网膜病变	bulk RNA测序和单细胞测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	db/db小鼠
458	2024-08-04	Intratumoral IL-12 delivery via mesenchymal stem cells combined with PD-1 blockade leads to long-term antitumor immunity in a mouse glioblastoma model 2024-Apr, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2023.115790 PMID:38431436	研究论文	本研究开发了IL-12分泌的间充质干细胞，并评估了其与抗PD-1联合治疗胶质母细胞瘤的疗效	通过将IL-12分泌的间充质干细胞与抗PD-1联合使用，显著增强了针对胶质母细胞瘤的抗肿瘤免疫	本研究在小鼠模型中进行，临床转化的有效性和安全性需进一步验证	探索抗PD-1与IL-12-secreting间充质干细胞联合治疗对胶质母细胞瘤的长期疗效	胶质母细胞瘤小鼠模型	数字病理学	胶质母细胞瘤	小鼠单细胞转录组测序	NA	实验小鼠组织样本	共涉及29只小鼠，分别是16只和13只小鼠用于不同单疗法，12只小鼠用于联合疗法
459	2024-08-04	Single-cell sequencing: A promising approach for uncovering the characteristic of pancreatic islet cells in type 2 diabetes 2024-Apr, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2024.116292 PMID:38394848	综述	这篇文章总结了单细胞测序在2型糖尿病胰岛细胞特征研究中的应用	该研究强调了单细胞测序在揭示细胞异质性和改善干细胞治疗中的创新应用	文章讨论了单细胞测序的局限性，但未具体阐述	探讨单细胞测序在2型糖尿病发病机制中的潜在应用和治疗靶点	胰岛细胞和功能性β细胞	数字病理学	2型糖尿病	单细胞测序	NA	基因组学、转录组学、表观遗传学数据	NA
460	2024-08-04	Detailed survey of an in vitro intestinal epithelium model by single-cell transcriptomics 2024-Apr-19, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.109383 PMID:38523788	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序详细调查了两种成人结直肠癌细胞系共培养模型的细胞类型异质性	本研究通过单细胞转录组分析揭示了肠上皮模型的细胞类型异质性，并与人类生理进行全面比较	共培养模型无法完整模拟人类上皮的先天免疫特征	探索成人结直肠癌细胞系共培养模型的生物学特性及其与人类生理的相似性	两种成人结直肠癌细胞系Caco-2和HT29的共培养系统	数字病理学	结肠癌	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	使用两种结直肠癌细胞系的共培养系统