单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 490 篇文献,本页显示第 441 - 460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
441 2024-08-04
Spatial transcriptomics reveals discrete tumour microenvironments and autocrine loops within ovarian cancer subclones
2024-Apr-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该文使用空间转录组学识别卵巢癌亚克隆及其与浸润细胞群体的关联 研究揭示了卵巢癌亚克隆的高亚克隆异质性及其特定的配体和受体表达模式 NA 探索高等级浆液性卵巢癌中亚克隆的特征及其微环境交互 高等级浆液性卵巢癌亚克隆及其与免疫细胞和基质细胞的相互作用 数字病理学 卵巢癌 空间转录组学 NA NA 使用多个样本对单个肿瘤切片进行分析 NA NA NA NA
442 2024-08-04
The novel molecular mechanism of pulmonary fibrosis: insight into lipid metabolism from reanalysis of single-cell RNA-seq databases
2024-Apr-03, Lipids in health and disease IF:3.9Q2
研究论文 本研究探讨了肺纤维化中脂质代谢的异常与疾病机制之间的关系 首次识别低密度脂蛋白(LDL)的失调作为肺纤维化的新风险因素,揭示了不同细胞类型中脂质代谢基因的重新编程 研究中没有提供样本大小和具体的实验数据支持 研究肺纤维化的分子机制,特别是脂质代谢在其中的作用 重点分析与肺纤维化相关的单细胞RNA测序数据及脂质代谢基因 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA NA NA NA NA NA
443 2024-08-04
Shared inflammatory glial cell signature after stab wound injury, revealed by spatial, temporal, and cell-type-specific profiling of the murine cerebral cortex
2024-Apr-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该文章揭示了创伤性脑损伤后小鼠大脑皮层中炎症胶质细胞的转录组特征 首次结合空间和单细胞转录组学确定受伤小鼠脑皮层中特定胶质细胞的状态及其共享的伤害调控基因 未提及具体的临床相关性或在人类中的应用 全面了解特定细胞类型响应创伤的机制及其相互作用 受伤小鼠大脑皮层中的特定胶质细胞 数字病理学 神经退行性疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 小鼠模型 NA NA NA NA
444 2024-08-07
Eph-ephrin signaling couples endothelial cell sorting and arterial specification
2024-Apr-03, Nature communications IF:14.7Q1
research paper 本文通过结合细胞类型特异性和可诱导的小鼠遗传学、体外流动实验、单细胞RNA测序和生化方法,研究了Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 揭示了Eph-ephrin相互作用如何整合细胞分离和动静脉指定在血管中的机制,对由EPHB4突变引起的人类血管畸形具有潜在相关性 NA 探讨Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 Eph-ephrin信号在血管形成中的功能 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠模型 NA NA NA NA
445 2024-08-04
Macrophage diversity in human cancers: New insight provided by single-cell resolution and spatial context
2024-Apr-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本文总结了最近研究中使用先进技术揭示的人类癌症中肿瘤相关巨噬细胞的新功能亚群 该研究强调了特定肿瘤相关巨噬细胞亚群的转录组特征及其临床意义,并利用空间转录组学技术揭示了巨噬细胞与其他细胞类型之间的空间相互作用 对特定肿瘤类型中肿瘤相关巨噬细胞状态的知识仍然有限 探讨肿瘤微环境中巨噬细胞表型的多样性及其在不同人类癌症中的功能 研究肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞及其特定亚群 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据 涉及多个不同类型人类癌症的巨噬细胞 NA NA NA NA
446 2024-08-07
Identification and validation of mutual hub genes in idiopathic pulmonary fibrosis and rheumatoid arthritis-associated usual interstitial pneumonia
2024-Apr-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过综合生物信息学分析探索特发性肺纤维化(IPF)和类风湿关节炎相关寻常间质性肺炎(RA-UIP)中的共同枢纽基因和通路 筛选出四个共同枢纽基因(THBS2, TIMP1, POSTN, 和 CD19),并验证这些基因在IPF和RA-UIP中的潜在生物标志物作用 NA 探索IPF和RA-UIP中的共同枢纽基因和通路 IPF和RA-UIP患者的肺组织样本 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 GSE199152数据集中的IPF和RA-UIP患者肺组织样本 NA NA NA NA
447 2024-08-04
Virus-reactive T cells expanded in aplastic anemia eliminate hematopoietic progenitor cells by molecular mimicry
2024-Apr-04, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究探讨了反应性T细胞在再生障碍性贫血中的作用。 新发现的病毒相关T细胞通过分子模仿机制消除造血前体细胞的作用。 尚未明确T细胞克隆的具体贡献及其抗原特异性。 研究再生障碍性贫血患者中T细胞的分化状态及其对造血前体细胞的影响。 对15名获得性再生障碍性贫血患者的T细胞克隆进行分析。 数字病理学 再生障碍性贫血 单细胞测序和免疫表型分析 NA 细胞 15名获得性再生障碍性贫血患者 NA NA NA NA
448 2024-08-04
Dissecting the spatiotemporal diversity of adult neural stem cells
2024-Apr, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 本研究探讨了成体神经干细胞的时空多样性 该研究结合单细胞转录组学和在体RNA代谢标记技术,揭示了成体神经干细胞的组织原则 本研究主要集中于斑马鱼大脑,限制了其对其他类型动物的适用性 研究成体神经干细胞的功能状态及其在空间和时间上的调节 成体斑马鱼大脑中的神经干细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组学、在体RNA代谢标记 NA 基因表达数据 斑马鱼大脑不同区域的单细胞样本 NA NA NA NA
449 2024-08-04
Deciphering cutaneous melanoma prognosis through LDL metabolism: Single-cell transcriptomics analysis via 101 machine learning algorithms
2024-Apr, Experimental dermatology IF:3.5Q1
研究论文 本文探讨了低密度脂蛋白(LDL)代谢与皮肤黑色素瘤之间的关系 结合机器学习算法构建的LDL相关特征,可以用于评估皮肤黑色素瘤患者的预后和免疫状态 未提及具体的临床验证和应用,可能限制了结果的广泛适用性 调查低密度脂蛋白在皮肤黑色素瘤中的作用及其对肿瘤进展的影响 分析与低密度脂蛋白代谢相关的基因及其在皮肤黑色素瘤细胞中的表现 数字病理学 皮肤黑色素瘤 单细胞测序、bulk-RNA测序 机器学习算法 基因组数据 使用了多个数据集,包括GSE215120,TCGA,GSE19234,GSE22153和GSE65904 NA NA NA NA
450 2024-08-04
Single-cell transcriptomics reveals the ameliorative effect of rosmarinic acid on diabetic nephropathy-induced kidney injury by modulating oxidative stress and inflammation
2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
研究论文 本研究探讨了迷迭香酸对糖尿病肾病诱导的肾损伤的改善作用 揭示了单细胞层次上迷迭香酸对肾损伤的多样性反应及其机制 研究可能未涵盖所有与糖尿病肾病相关的细胞反应 探讨迷迭香酸在糖尿病肾病中改善肾脏损伤的作用 糖尿病肾病诱导的肾损伤及迷迭香酸的治疗效果 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞转录组学 NA 细胞数据 NA NA NA NA NA
451 2024-08-07
HES6 knockdown in human hematopoietic precursor cells reduces their in vivo engraftment potential and their capacity to differentiate into erythroid cells, B cells, T cells and plasmacytoid dendritic cells
2024-Apr-04, Haematologica IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了HES6在人类造血过程中的作用,通过体外和体内模型发现HES6敲降会影响造血前体细胞的植入潜力和分化能力 首次揭示了HES6在人类造血过程中的具体作用,包括影响细胞周期进展和下游目标基因 NA 研究HES6在人类造血过程中的作用 人类造血前体细胞 NA NA bulk和scRNA-seq NA RNA 脐带血衍生的造血前体细胞 NA NA NA NA
452 2024-08-07
INO80-Dependent Remodeling of Transcriptional Regulatory Network Underlies the Progression of Heart Failure
2024-04-02, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究通过整合人类样本、遗传小鼠模型和基因组学方法,探讨了INO80染色质重塑复合体在心脏稳态和功能障碍中的作用 揭示了INO80依赖的染色质景观和转录网络重塑是心脏功能障碍的主要机制 NA 探讨INO80染色质重塑复合体在心脏功能障碍中的作用 INO80染色质重塑复合体及其在心脏功能中的作用 数字病理学 心血管疾病 RNA测序、染色质免疫沉淀后高通量测序、转座酶可及染色质高通量测序 NA 基因组数据 人类样本和遗传小鼠模型 NA NA NA NA
453 2024-08-04
Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer
2024-Apr-01, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文分析了乳腺癌中免疫抑制成纤维细胞的空间格局和可塑性 首次构建了乳腺癌中FAP+ CAF相关的高分辨率空间细胞生态图谱 尚未充分理解FAP+ CAF的所有多样性与功能 研究乳腺癌中特定成纤维细胞亚群的空间分布和功能 主要关注乳腺癌中FAP+ 免疫抑制成纤维细胞的不同亚群 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学,功能测定 NA 单细胞转录组数据 NA NA NA NA NA
454 2024-08-07
FANCD2 deficiency sensitizes SHH medulloblastoma to radiotherapy via ferroptosis
2024-04, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 研究探讨了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的表达及其对放射治疗敏感性的影响 首次揭示了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的高表达及其通过诱导铁死亡增强放射治疗敏感性的机制 研究主要集中在细胞和小鼠模型上,尚未在临床试验中验证 探究FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的作用及其对放射治疗的影响 SHH型髓母细胞瘤细胞及小鼠模型 数字病理学 髓母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 38个髓母细胞瘤组织样本 NA NA NA NA
455 2024-08-07
Mustn1 is a smooth muscle cell-secreted microprotein that modulates skeletal muscle extracellular matrix composition
2024-Apr, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 本研究探讨了Mustn1蛋白在骨骼肌重塑和修复中的作用,特别是在肌肉萎缩和代偿性肥大转变中的功能。 发现Mustn1是一种由平滑肌细胞分泌的微蛋白,参与调节骨骼肌细胞外基质的组成,这一发现扩展了Mustn1的功能范围。 尚未完全探索Mustn1在肌肉损伤和肌营养不良中的纤维化和免疫浸润作用,以及其作为治疗干预的潜力。 旨在识别调节肌肉萎缩到代偿性肥大或损伤恢复转变的基因和分子途径。 使用后肢卸载和重载的小鼠模型,研究骨骼肌在萎缩和代偿性再生及肥大过程中的基因和蛋白表达变化。 NA NA qRT-PCR, 免疫组织化学, 批量和单细胞RNA测序 NA 转录组, 细胞外液蛋白组 包括Mustn1缺陷型遗传小鼠模型和野生型同窝小鼠 NA NA NA NA
456 2024-08-07
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing reveals a novel signature based on NK cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer
2024-04-01, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据,识别出基于NK细胞标记基因的新型特征,用于预测胃癌的预后和免疫治疗反应 本研究首次建立了基于NK细胞标记基因的12基因特征,用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 本研究仅在TCGA和GEO数据集上进行了验证,未来需要在更多独立数据集上进行进一步验证 旨在建立基于NK细胞标记基因的可靠特征,为评估胃癌患者的免疫治疗和预后提供新视角 胃癌患者的预后和免疫治疗反应 数字病理学 胃癌 RNA测序 Cox回归分析 RNA测序数据 共分析了1560个样本 NA NA NA NA
457 2024-08-07
Identification of genetic modifiers enhancing B7-H3-targeting CAR T cell therapy against glioblastoma through large-scale CRISPRi screening
2024-Apr-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过大规模CRISPRi筛选,识别增强B7-H3靶向CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤的遗传修饰因子 发现了一系列遗传修饰因子,如ARPC4、PI4KA、ATP6V1A、UBA1和NDUFV1,这些因子调节CAR T细胞介导的肿瘤杀伤效果,并揭示了TNFSF15在调节肿瘤-CAR T细胞相互作用中的免疫刺激作用 NA 提高CAR T细胞疗法在胶质母细胞瘤中的疗效 胶质母细胞瘤细胞系U87 MG细胞与B7-H3靶向CAR T细胞 数字病理学 脑肿瘤 CRISPRi筛选 NA RNA测序数据 大规模细胞系 NA NA NA NA
458 2024-08-07
Single-Cell RNA Sequencing Profiling Cellular Heterogeneity and Specific Responses of Fish Gills to Microplastics and Nanoplastics
2024-Apr-02, Environmental science & technology IF:10.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了罗非鱼鳃对微塑料和纳米塑料暴露的细胞异质性和特定反应 首次揭示了罗非鱼鳃对微塑料和纳米塑料的细胞异质性反应,并提供了单细胞分辨率的毒理学机制敏感标记 NA 研究鱼鳃对微塑料和纳米塑料的细胞异质性和特定反应 罗非鱼鳃的单个细胞群体对微塑料和纳米塑料暴露的反应 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及12种已识别的细胞群体 NA NA NA NA
459 2024-08-04
Integrated single-cell transcriptomics reveals the hypoxia-induced inflammation-cancer transformation in NASH-derived hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究揭示了缺氧诱导的炎症-癌症转化机制在NASH衍生的肝细胞癌中的作用 首次通过单细胞转录组学整合研究识别出了从NAFLD到HCC的转变过程中CYP7A1肝细胞的功能和亚群体 未提及样本的具体数量及其在临床应用中的直接验证 探讨NAFLD相关肝细胞癌的发展机制 肝细胞和巨噬细胞的单细胞转录组分析 数字病理学 非酒精性脂肪肝病相关肝细胞癌 单细胞转录组学 小鼠模型 转录组数据 四个单细胞转录组数据集 NA NA NA NA
460 2024-08-04
Single-cell and spatial transcriptomics: Bridging current technologies with long-read sequencing
2024-04, Molecular aspects of medicine IF:8.7Q1
研究论文 本文探讨了单细胞和空间转录组学与长读长测序技术的结合 提出了将单细胞技术、空间转录组学与长读长测序结合的新方法 尚存在一些挑战和需要解决的问题 旨在描绘细胞在组织背景中的特征及其异质性 研究单细胞和空间转录组学领域的技术结合 数字病理学 NA 长读长测序 NA NA NA NA NA NA NA
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