单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-08-07 |
Integrative analysis unveils ECM signatures and pathways driving hepatocellular carcinoma progression: A multi-omics approach and prognostic model development
2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18230
PMID:38568083
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研究论文 | 本研究通过多组学方法和预测模型开发，揭示了肝细胞癌进展中的细胞外基质（ECM）特征和通路 | 首次全面分析ECM在肝细胞癌（LIHC）免疫浸润和预后分层中的潜在价值，并开发了基于ECM的预后模型 | NA | 探讨ECM在肝细胞癌发展中的作用及其在预后分层中的应用 | 肝细胞癌（LIHC）及其细胞外基质（ECM） | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq, Lasso回归 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个LIHC样本 |
| 442 | 2024-08-07 |
Comparative single-cell RNA sequencing analysis of immune response to inactivated vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2024-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29577
PMID:38572977
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了灭活SARS-CoV-2疫苗与自然感染后的免疫反应 | 揭示了灭活疫苗与自然感染在免疫细胞比例和转录组方面的细微差异，以及细胞间通讯模式的独特变化 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 理解COVID-19免疫学中灭活疫苗与自然感染的免疫反应 | 灭活SARS-CoV-2疫苗接种者与COVID-19患者的PBMC样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名接种灭活疫苗的个体和COVID-19患者 |
| 443 | 2024-08-07 |
HES6 knockdown in human hematopoietic precursor cells reduces their in vivo engraftment potential and their capacity to differentiate into erythroid cells, B cells, T cells and plasmacytoid dendritic cells
2024-Apr-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283432
PMID:38572564
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研究论文 | 本研究探讨了HES6在人类造血过程中的作用，通过体外和体内模型发现HES6敲降会影响造血前体细胞的植入潜力和分化能力 | 首次揭示了HES6在人类造血过程中的具体作用，包括影响细胞周期进展和下游目标基因 | NA | 研究HES6在人类造血过程中的作用 | 人类造血前体细胞 | NA | NA | bulk和scRNA-seq | NA | RNA | 脐带血衍生的造血前体细胞 |
| 444 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing analysis reveals intra-tumor heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Apr-04, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24243
PMID:38572681
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤内异质性 | 利用单细胞转录组测序技术，深入研究了ESCC肿瘤微环境的分子机制，并构建了预测ESCC患者预后的风险模型 | NA | 探究食管鳞状细胞癌的发病机制，并识别潜在的关键分子事件 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境和细胞类型分布 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 60个肿瘤样本和4个癌旁样本 |
| 445 | 2024-08-07 |
Immune features revealed by single-cell RNA and single-cell TCR/BCR sequencing in patients with rheumatoid arthritis receiving COVID-19 booster vaccination
2024-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29573
PMID:38566569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞TCR/BCR测序分析，探讨了COVID-19加强疫苗在稳定期类风湿关节炎（RA）患者中的免疫反应 | 首次综合分析了COVID-19加强疫苗在RA患者中的单细胞免疫图谱和TCR/BCR免疫组库 | 研究样本量较小，且仅限于稳定期RA患者 | 探讨COVID-19加强疫苗对RA患者关键免疫细胞亚群及其反应的影响 | 稳定期类风湿关节炎患者在接受COVID-19加强疫苗前后的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞TCR/BCR测序（scTCR/BCR-seq） | NA | 单细胞数据 | 从稳定期RA患者中收集的配对外周血单个核细胞（PBMCs），共8个主要和27个次要细胞簇 |
| 446 | 2024-08-07 |
INO80-Dependent Remodeling of Transcriptional Regulatory Network Underlies the Progression of Heart Failure
2024-04-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过整合人类样本、遗传小鼠模型和基因组学方法，探讨了INO80染色质重塑复合体在心脏稳态和功能障碍中的作用 | 揭示了INO80依赖的染色质景观和转录网络重塑是心脏功能障碍的主要机制 | NA | 探讨INO80染色质重塑复合体在心脏功能障碍中的作用 | INO80染色质重塑复合体及其在心脏功能中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序、染色质免疫沉淀后高通量测序、转座酶可及染色质高通量测序 | NA | 基因组数据 | 人类样本和遗传小鼠模型 |
| 447 | 2024-08-04 |
The Extracellular Niche and Tumor Microenvironment Enhance KRAS Inhibitor Efficacy in Pancreatic Cancer
2024-Apr-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2504
PMID:38294344
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研究论文 | 本研究评估了KRAS抑制剂在胰腺癌中的疗效，强调了肿瘤微环境的影响 | 发现了ITGB1作为增强KRAS抑制剂MRTX1133疗效的靶点，并确认了其在细胞三维培养中的显著作用 | 尚需进一步研究确定该疗法在其他癌症类型中的普适性和有效性 | 探索KRAS抑制剂在胰腺导管腺癌中的疗效及其机制 | 胰腺导管腺癌细胞系及患者衍生的小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | CRISPR-Cas9基因敲除，单细胞测序 | NA | 细胞培养数据，肿瘤组织数据 | 多种PDAC细胞系，及来自多位患者的肿瘤组织 |
| 448 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer
2024-Apr-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47068-z
PMID:38561380
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研究论文 | 本文分析了乳腺癌中免疫抑制成纤维细胞的空间格局和可塑性 | 首次构建了乳腺癌中FAP+ CAF相关的高分辨率空间细胞生态图谱 | 尚未充分理解FAP+ CAF的所有多样性与功能 | 研究乳腺癌中特定成纤维细胞亚群的空间分布和功能 | 主要关注乳腺癌中FAP+ 免疫抑制成纤维细胞的不同亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，功能测定 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 449 | 2024-08-07 |
FANCD2 deficiency sensitizes SHH medulloblastoma to radiotherapy via ferroptosis
2024-04, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6245
PMID:38229567
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研究论文 | 研究探讨了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的表达及其对放射治疗敏感性的影响 | 首次揭示了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的高表达及其通过诱导铁死亡增强放射治疗敏感性的机制 | 研究主要集中在细胞和小鼠模型上，尚未在临床试验中验证 | 探究FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的作用及其对放射治疗的影响 | SHH型髓母细胞瘤细胞及小鼠模型 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 38个髓母细胞瘤组织样本 |
| 450 | 2024-08-07 |
Mustn1 is a smooth muscle cell-secreted microprotein that modulates skeletal muscle extracellular matrix composition
2024-Apr, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101912
PMID:38458566
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研究论文 | 本研究探讨了Mustn1蛋白在骨骼肌重塑和修复中的作用，特别是在肌肉萎缩和代偿性肥大转变中的功能。 | 发现Mustn1是一种由平滑肌细胞分泌的微蛋白，参与调节骨骼肌细胞外基质的组成，这一发现扩展了Mustn1的功能范围。 | 尚未完全探索Mustn1在肌肉损伤和肌营养不良中的纤维化和免疫浸润作用，以及其作为治疗干预的潜力。 | 旨在识别调节肌肉萎缩到代偿性肥大或损伤恢复转变的基因和分子途径。 | 使用后肢卸载和重载的小鼠模型，研究骨骼肌在萎缩和代偿性再生及肥大过程中的基因和蛋白表达变化。 | NA | NA | qRT-PCR, 免疫组织化学, 批量和单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 细胞外液蛋白组 | 包括Mustn1缺陷型遗传小鼠模型和野生型同窝小鼠 |
| 451 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing reveals a novel signature based on NK cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer
2024-04-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57714-7
PMID:38561388
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出基于NK细胞标记基因的新型特征，用于预测胃癌的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次建立了基于NK细胞标记基因的12基因特征，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究仅在TCGA和GEO数据集上进行了验证，未来需要在更多独立数据集上进行进一步验证 | 旨在建立基于NK细胞标记基因的可靠特征，为评估胃癌患者的免疫治疗和预后提供新视角 | 胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 共分析了1560个样本 |
| 452 | 2024-08-07 |
Identification of genetic modifiers enhancing B7-H3-targeting CAR T cell therapy against glioblastoma through large-scale CRISPRi screening
2024-Apr-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03027-6
PMID:38561797
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研究论文 | 本研究通过大规模CRISPRi筛选，识别增强B7-H3靶向CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤的遗传修饰因子 | 发现了一系列遗传修饰因子，如ARPC4、PI4KA、ATP6V1A、UBA1和NDUFV1，这些因子调节CAR T细胞介导的肿瘤杀伤效果，并揭示了TNFSF15在调节肿瘤-CAR T细胞相互作用中的免疫刺激作用 | NA | 提高CAR T细胞疗法在胶质母细胞瘤中的疗效 | 胶质母细胞瘤细胞系U87 MG细胞与B7-H3靶向CAR T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CRISPRi筛选 | NA | RNA测序数据 | 大规模细胞系 |
| 453 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Profiling Cellular Heterogeneity and Specific Responses of Fish Gills to Microplastics and Nanoplastics
2024-Apr-02, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.3c10338
PMID:38512049
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了罗非鱼鳃对微塑料和纳米塑料暴露的细胞异质性和特定反应 | 首次揭示了罗非鱼鳃对微塑料和纳米塑料的细胞异质性反应，并提供了单细胞分辨率的毒理学机制敏感标记 | NA | 研究鱼鳃对微塑料和纳米塑料的细胞异质性和特定反应 | 罗非鱼鳃的单个细胞群体对微塑料和纳米塑料暴露的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及12种已识别的细胞群体 |
| 454 | 2024-08-07 |
Letter to editor: single-cell transcriptome analysis upon ECM-remodeling meningioma cells of published cases
2024-Apr-02, Neurosurgical review
IF:2.5Q1
DOI:10.1007/s10143-024-02375-3
PMID:38561568
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comments | 本文对近期关于ECM重塑的脑膜瘤细胞单细胞转录组分析研究进行了细致评估 | 增强了肿瘤异质性的理解并识别了潜在的治疗靶点 | 数据解释和验证存在挑战，且ECM重塑的焦点可能掩盖了肿瘤生物学的其他关键方面 | 强调未来研究中考虑肿瘤异质性和微环境影响的广泛背景的重要性 | ECM重塑的脑膜瘤细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 455 | 2024-08-04 |
Integrated single-cell transcriptomics reveals the hypoxia-induced inflammation-cancer transformation in NASH-derived hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13576
PMID:37994257
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的炎症-癌症转化机制在NASH衍生的肝细胞癌中的作用 | 首次通过单细胞转录组学整合研究识别出了从NAFLD到HCC的转变过程中CYP7A1肝细胞的功能和亚群体 | 未提及样本的具体数量及其在临床应用中的直接验证 | 探讨NAFLD相关肝细胞癌的发展机制 | 肝细胞和巨噬细胞的单细胞转录组分析 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病相关肝细胞癌 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 四个单细胞转录组数据集 |
| 456 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of 5-aminolevulinic acid intraoperative labeling specificity for glioblastoma
2024-Apr-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2023.7.JNS23122
PMID:37773782
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研究论文 | 本研究通过单细胞光学表型分析和表达测序（SCOPE-seq2）方法，评估了5-氨基乙酰丙酸（5-ALA）在胶质母细胞瘤（GBM）手术中标记细胞类型的特异性 | 首次在单细胞水平上评估了5-ALA在胶质母细胞瘤中的标记特异性 | 研究发现5-ALA的标记并非仅限于肿瘤细胞，非肿瘤细胞也可能被标记，这质疑了5-ALA在荧光引导手术中对肿瘤细胞的特异性标记 | 确定5-ALA在胶质母细胞瘤中标记细胞类型的特异性 | 人胶质母细胞瘤手术标本中的单个细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞光学表型分析和表达测序（SCOPE-seq2） | NA | 图像和RNA序列 | 来自接受5-ALA治疗患者的胶质母细胞瘤手术标本 |
| 457 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics: Bridging current technologies with long-read sequencing
2024-04, Molecular aspects of medicine
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.mam.2024.101255
PMID:38368637
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研究论文 | 本文探讨了单细胞和空间转录组学与长读长测序技术的结合 | 提出了将单细胞技术、空间转录组学与长读长测序结合的新方法 | 尚存在一些挑战和需要解决的问题 | 旨在描绘细胞在组织背景中的特征及其异质性 | 研究单细胞和空间转录组学领域的技术结合 | 数字病理学 | NA | 长读长测序 | NA | NA | NA |
| 458 | 2024-08-07 |
The role of positional information in determining dermal fibroblast diversity
2024-Apr, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2024.02.009
PMID:38423396
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综述 | 本文综述了位置信息在决定皮肤成纤维细胞多样性中的作用及其对皮肤稳态、伤口愈合、纤维化和癌症的影响 | 探讨了成纤维细胞多样性对皮肤功能和疾病发展的影响，为抗纤维化治疗和个性化医疗提供新思路 | NA | 理解成纤维细胞多样性如何影响皮肤稳态、伤口愈合、纤维化和癌症 | 皮肤成纤维细胞及其在皮肤功能和疾病中的作用 | NA | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 459 | 2024-08-07 |
Development and validation of a prognostic model for cervical cancer by combination of machine learning and high-throughput sequencing
2024-Apr, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology
DOI:10.1016/j.ejso.2024.108241
PMID:38452717
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种结合机器学习和高通量测序的宫颈癌预后模型 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和高通量测序数据，利用多种机器学习算法构建宫颈癌预后模型 | 本研究仅使用了两个单细胞RNA测序项目和TCGA数据进行模型构建和验证，可能存在样本选择偏倚 | 开发一种评估宫颈癌预后的综合模型 | 宫颈癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 使用了两个单细胞RNA测序项目和TCGA数据，具体样本数量未详细说明 |
| 460 | 2024-08-07 |
T cells with increased responsiveness cause obesity in mice without diet intervention
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109471
PMID:38551005
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研究论文 | 本研究使用增强T细胞反应性的老鼠模型，展示了肥胖可以通过免疫细胞驱动 | 首次证明增强的T细胞反应性可以直接导致肥胖，无需饮食干预 | 研究仅限于老鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨肥胖的免疫细胞机制，特别是T细胞的作用 | 增强T细胞反应性的老鼠模型 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序和CyTOF分析 | NA | 细胞 | 多个老鼠模型 |