单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 492 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-04 |
The novel molecular mechanism of pulmonary fibrosis: insight into lipid metabolism from reanalysis of single-cell RNA-seq databases
2024-Apr-03, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-024-02062-8
PMID:38570797
|
研究论文 | 本研究探讨了肺纤维化中脂质代谢的异常与疾病机制之间的关系 | 首次识别低密度脂蛋白（LDL）的失调作为肺纤维化的新风险因素，揭示了不同细胞类型中脂质代谢基因的重新编程 | 研究中没有提供样本大小和具体的实验数据支持 | 研究肺纤维化的分子机制，特别是脂质代谢在其中的作用 | 重点分析与肺纤维化相关的单细胞RNA测序数据及脂质代谢基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 422 | 2024-08-04 |
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: molecular features and clinical significance
2024-Apr-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01779-3
PMID:38570490
|
研究论文 | 本研究探讨了导管内癌（DCIS）向浸润性乳腺癌（IDC）转变的分子特征及其临床意义 | 本研究系统总结了关于DCIS的关键信号通路和分子特征，并探索了肿瘤细胞内部变化及肿瘤微环境的影响 | 文中未提及具体的研究限制 | 深入理解DCIS及其向IDC转变的生物学特性以促进临床管理 | 主要关注DCIS和IDC的分子特征及其进展 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、人工智能 | 前临床模型 | NA | NA |
| 423 | 2024-08-04 |
Shared inflammatory glial cell signature after stab wound injury, revealed by spatial, temporal, and cell-type-specific profiling of the murine cerebral cortex
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46625-w
PMID:38570482
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研究论文 | 该文章揭示了创伤性脑损伤后小鼠大脑皮层中炎症胶质细胞的转录组特征 | 首次结合空间和单细胞转录组学确定受伤小鼠脑皮层中特定胶质细胞的状态及其共享的伤害调控基因 | 未提及具体的临床相关性或在人类中的应用 | 全面了解特定细胞类型响应创伤的机制及其相互作用 | 受伤小鼠大脑皮层中的特定胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 424 | 2024-08-07 |
Eph-ephrin signaling couples endothelial cell sorting and arterial specification
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46300-0
PMID:38570531
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research paper | 本文通过结合细胞类型特异性和可诱导的小鼠遗传学、体外流动实验、单细胞RNA测序和生化方法，研究了Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | 揭示了Eph-ephrin相互作用如何整合细胞分离和动静脉指定在血管中的机制，对由EPHB4突变引起的人类血管畸形具有潜在相关性 | NA | 探讨Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | Eph-ephrin信号在血管形成中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 425 | 2024-08-04 |
Single-cell profile reveals the landscape of cardiac immunity and identifies a cardio-protective Ym-1hi neutrophil in myocardial ischemia-reperfusion injury
2024-Apr-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.02.003
PMID:38395651
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研究论文 | 本研究揭示了心脏免疫学的整体情况，并确定了一种具有心脏保护作用的Ym-1hi中性粒细胞在心肌缺血再灌注损伤中的作用 | 首次识别心肌缺血再灌注损伤中具保护作用的新型 Ym-1hi 中性粒细胞亚型 | 未提供人类样本的详细分析，主要集中在小鼠实验上 | 研究心肌缺血再灌注损伤中中性粒细胞的亚型及其动态变化 | 小鼠心脏中隔离的CD45阳性细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 在六个时间点对小鼠心脏进行取样，具体样本量未明确说明 |
| 426 | 2024-08-04 |
Macrophage diversity in human cancers: New insight provided by single-cell resolution and spatial context
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28332
PMID:38571605
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研究论文 | 本文总结了最近研究中使用先进技术揭示的人类癌症中肿瘤相关巨噬细胞的新功能亚群 | 该研究强调了特定肿瘤相关巨噬细胞亚群的转录组特征及其临床意义，并利用空间转录组学技术揭示了巨噬细胞与其他细胞类型之间的空间相互作用 | 对特定肿瘤类型中肿瘤相关巨噬细胞状态的知识仍然有限 | 探讨肿瘤微环境中巨噬细胞表型的多样性及其在不同人类癌症中的功能 | 研究肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞及其特定亚群 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多个不同类型人类癌症的巨噬细胞 |
| 427 | 2024-08-07 |
Identification and validation of mutual hub genes in idiopathic pulmonary fibrosis and rheumatoid arthritis-associated usual interstitial pneumonia
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28088
PMID:38571583
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析探索特发性肺纤维化（IPF）和类风湿关节炎相关寻常间质性肺炎（RA-UIP）中的共同枢纽基因和通路 | 筛选出四个共同枢纽基因（THBS2, TIMP1, POSTN, 和 CD19），并验证这些基因在IPF和RA-UIP中的潜在生物标志物作用 | NA | 探索IPF和RA-UIP中的共同枢纽基因和通路 | IPF和RA-UIP患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | GSE199152数据集中的IPF和RA-UIP患者肺组织样本 |
| 428 | 2024-08-04 |
Virus-reactive T cells expanded in aplastic anemia eliminate hematopoietic progenitor cells by molecular mimicry
2024-Apr-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023023142
PMID:38277625
|
研究论文 | 本研究探讨了反应性T细胞在再生障碍性贫血中的作用。 | 新发现的病毒相关T细胞通过分子模仿机制消除造血前体细胞的作用。 | 尚未明确T细胞克隆的具体贡献及其抗原特异性。 | 研究再生障碍性贫血患者中T细胞的分化状态及其对造血前体细胞的影响。 | 对15名获得性再生障碍性贫血患者的T细胞克隆进行分析。 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞测序和免疫表型分析 | NA | 细胞 | 15名获得性再生障碍性贫血患者 |
| 429 | 2024-08-04 |
CITEViz: interactively classify cell populations in CITE-Seq via a flow cytometry-like gating workflow using R-Shiny
2024-Apr-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05762-1
PMID:38566005
|
研究论文 | CITEViz是一个交互式R-Shiny应用程序，用于在CITE-Seq数据中高效分类细胞群体 | CITEViz通过简化CITE-Seq数据的流式细胞术门控工作流程，实现了对细胞群体的标准化分类 | 目前CITEViz的功能可能不覆盖所有类型的多组学数据处理 | 开发一个工具以优化和标准化CITE-Seq数据的门控过程 | 外周血单核细胞的CITE-Seq数据集及主要血细胞群体 | 数字病理学 | NA | CITE-Seq | NA | 单细胞测序数据 | 涉及外周血单核细胞的CITE-Seq数据集 |
| 430 | 2024-08-07 |
Single cell analysis reveals the roles and regulatory mechanisms of type-I interferons in Parkinson's disease
2024-Apr-02, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01590-1
PMID:38566100
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了帕金森病中I型干扰素的作用及其调控机制 | 首次详细描述了不同细胞类型中I型干扰素的具体特征及其在帕金森病中的作用机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未来需更多实验验证 | 揭示I型干扰素在帕金森病中的作用及其调控机制 | 帕金森病患者和健康对照的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 39,024个单细胞RNA测序结果，包括5名帕金森病患者和6名健康对照 |
| 431 | 2024-08-04 |
Dissecting the spatiotemporal diversity of adult neural stem cells
2024-Apr, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00022-z
PMID:38365956
|
研究论文 | 本研究探讨了成体神经干细胞的时空多样性 | 该研究结合单细胞转录组学和在体RNA代谢标记技术，揭示了成体神经干细胞的组织原则 | 本研究主要集中于斑马鱼大脑，限制了其对其他类型动物的适用性 | 研究成体神经干细胞的功能状态及其在空间和时间上的调节 | 成体斑马鱼大脑中的神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、在体RNA代谢标记 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼大脑不同区域的单细胞样本 |
| 432 | 2024-08-04 |
Deciphering cutaneous melanoma prognosis through LDL metabolism: Single-cell transcriptomics analysis via 101 machine learning algorithms
2024-Apr, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15070
PMID:38570935
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研究论文 | 本文探讨了低密度脂蛋白（LDL）代谢与皮肤黑色素瘤之间的关系 | 结合机器学习算法构建的LDL相关特征，可以用于评估皮肤黑色素瘤患者的预后和免疫状态 | 未提及具体的临床验证和应用，可能限制了结果的广泛适用性 | 调查低密度脂蛋白在皮肤黑色素瘤中的作用及其对肿瘤进展的影响 | 分析与低密度脂蛋白代谢相关的基因及其在皮肤黑色素瘤细胞中的表现 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序、bulk-RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据 | 使用了多个数据集，包括GSE215120，TCGA，GSE19234，GSE22153和GSE65904 |
| 433 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the ameliorative effect of rosmarinic acid on diabetic nephropathy-induced kidney injury by modulating oxidative stress and inflammation
2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.01.003
PMID:38572101
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研究论文 | 本研究探讨了迷迭香酸对糖尿病肾病诱导的肾损伤的改善作用 | 揭示了单细胞层次上迷迭香酸对肾损伤的多样性反应及其机制 | 研究可能未涵盖所有与糖尿病肾病相关的细胞反应 | 探讨迷迭香酸在糖尿病肾病中改善肾脏损伤的作用 | 糖尿病肾病诱导的肾损伤及迷迭香酸的治疗效果 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 434 | 2024-08-07 |
Comparative single-cell RNA sequencing analysis of immune response to inactivated vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2024-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29577
PMID:38572977
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了灭活SARS-CoV-2疫苗与自然感染后的免疫反应 | 揭示了灭活疫苗与自然感染在免疫细胞比例和转录组方面的细微差异，以及细胞间通讯模式的独特变化 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 理解COVID-19免疫学中灭活疫苗与自然感染的免疫反应 | 灭活SARS-CoV-2疫苗接种者与COVID-19患者的PBMC样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名接种灭活疫苗的个体和COVID-19患者 |
| 435 | 2024-08-07 |
HES6 knockdown in human hematopoietic precursor cells reduces their in vivo engraftment potential and their capacity to differentiate into erythroid cells, B cells, T cells and plasmacytoid dendritic cells
2024-Apr-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283432
PMID:38572564
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研究论文 | 本研究探讨了HES6在人类造血过程中的作用，通过体外和体内模型发现HES6敲降会影响造血前体细胞的植入潜力和分化能力 | 首次揭示了HES6在人类造血过程中的具体作用，包括影响细胞周期进展和下游目标基因 | NA | 研究HES6在人类造血过程中的作用 | 人类造血前体细胞 | NA | NA | bulk和scRNA-seq | NA | RNA | 脐带血衍生的造血前体细胞 |
| 436 | 2024-08-07 |
Immune features revealed by single-cell RNA and single-cell TCR/BCR sequencing in patients with rheumatoid arthritis receiving COVID-19 booster vaccination
2024-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29573
PMID:38566569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞TCR/BCR测序分析，探讨了COVID-19加强疫苗在稳定期类风湿关节炎（RA）患者中的免疫反应 | 首次综合分析了COVID-19加强疫苗在RA患者中的单细胞免疫图谱和TCR/BCR免疫组库 | 研究样本量较小，且仅限于稳定期RA患者 | 探讨COVID-19加强疫苗对RA患者关键免疫细胞亚群及其反应的影响 | 稳定期类风湿关节炎患者在接受COVID-19加强疫苗前后的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞TCR/BCR测序（scTCR/BCR-seq） | NA | 单细胞数据 | 从稳定期RA患者中收集的配对外周血单个核细胞（PBMCs），共8个主要和27个次要细胞簇 |
| 437 | 2024-08-07 |
INO80-Dependent Remodeling of Transcriptional Regulatory Network Underlies the Progression of Heart Failure
2024-04-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过整合人类样本、遗传小鼠模型和基因组学方法，探讨了INO80染色质重塑复合体在心脏稳态和功能障碍中的作用 | 揭示了INO80依赖的染色质景观和转录网络重塑是心脏功能障碍的主要机制 | NA | 探讨INO80染色质重塑复合体在心脏功能障碍中的作用 | INO80染色质重塑复合体及其在心脏功能中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序、染色质免疫沉淀后高通量测序、转座酶可及染色质高通量测序 | NA | 基因组数据 | 人类样本和遗传小鼠模型 |
| 438 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer
2024-Apr-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47068-z
PMID:38561380
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研究论文 | 本文分析了乳腺癌中免疫抑制成纤维细胞的空间格局和可塑性 | 首次构建了乳腺癌中FAP+ CAF相关的高分辨率空间细胞生态图谱 | 尚未充分理解FAP+ CAF的所有多样性与功能 | 研究乳腺癌中特定成纤维细胞亚群的空间分布和功能 | 主要关注乳腺癌中FAP+ 免疫抑制成纤维细胞的不同亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，功能测定 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 439 | 2024-08-07 |
FANCD2 deficiency sensitizes SHH medulloblastoma to radiotherapy via ferroptosis
2024-04, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6245
PMID:38229567
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研究论文 | 研究探讨了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的表达及其对放射治疗敏感性的影响 | 首次揭示了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的高表达及其通过诱导铁死亡增强放射治疗敏感性的机制 | 研究主要集中在细胞和小鼠模型上，尚未在临床试验中验证 | 探究FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的作用及其对放射治疗的影响 | SHH型髓母细胞瘤细胞及小鼠模型 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 38个髓母细胞瘤组织样本 |
| 440 | 2024-08-07 |
Mustn1 is a smooth muscle cell-secreted microprotein that modulates skeletal muscle extracellular matrix composition
2024-Apr, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101912
PMID:38458566
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研究论文 | 本研究探讨了Mustn1蛋白在骨骼肌重塑和修复中的作用，特别是在肌肉萎缩和代偿性肥大转变中的功能。 | 发现Mustn1是一种由平滑肌细胞分泌的微蛋白，参与调节骨骼肌细胞外基质的组成，这一发现扩展了Mustn1的功能范围。 | 尚未完全探索Mustn1在肌肉损伤和肌营养不良中的纤维化和免疫浸润作用，以及其作为治疗干预的潜力。 | 旨在识别调节肌肉萎缩到代偿性肥大或损伤恢复转变的基因和分子途径。 | 使用后肢卸载和重载的小鼠模型，研究骨骼肌在萎缩和代偿性再生及肥大过程中的基因和蛋白表达变化。 | NA | NA | qRT-PCR, 免疫组织化学, 批量和单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 细胞外液蛋白组 | 包括Mustn1缺陷型遗传小鼠模型和野生型同窝小鼠 |