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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-07 |
Gene features of tumor-specific T cells relevant to immunotherapy, targeted therapy and chemotherapy in lung cancer
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28374
PMID:38590880
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序定义了肿瘤特异性T细胞(TSTs)及其特征(TSTGs),并应用LASSO回归筛选出与生存最相关的TSTGs,构建了肿瘤特异性T细胞评分(TSTS),以预测肺癌患者对免疫疗法、靶向疗法和化疗的反应。 | 本文创新性地通过单细胞RNA测序技术筛选出肿瘤特异性T细胞的特征基因,并构建了一个新的评分系统(TSTS),用于预测肺癌患者对不同治疗方式的反应。 | NA | 研究旨在寻找能够预测肺癌患者对免疫疗法、靶向疗法和化疗反应的生物标志物,以优化临床治疗选择。 | 肺癌患者的肿瘤特异性T细胞及其特征基因。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 422 | 2024-08-07 |
Identification of fatty acids synthesis and metabolism-related gene signature and prediction of prognostic model in hepatocellular carcinoma
2024-Apr-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03306-4
PMID:38584256
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研究论文 | 本研究通过分析基因表达综合数据库(GEO)、癌症基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)的数据,识别了与肝细胞癌(HCC)中脂肪酸合成与代谢(FASM)相关的基因特征,并构建了预测预后模型。 | 本研究首次揭示了FASM相关基因特征在HCC中的分子特性、生理功能和临床预后价值,并通过一系列功能实验验证了FASM效应基因在促进肿瘤进展中的作用。 | NA | 旨在理解肝细胞癌中脂肪酸合成与代谢的异质性,并评估其对患者预后和治疗反应的影响。 | 肝细胞癌患者及其脂肪酸合成与代谢相关的基因特征。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO回归分析 | 转录组数据 | 涉及来自GEO、TCGA和ICGC数据库的肝细胞癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 423 | 2024-08-07 |
Locally delivered hydrogels with controlled release of nanoscale exosomes promote cardiac repair after myocardial infarction
2024-Apr, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.02.035
PMID:38417558
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研究论文 | 本文介绍了一种生物工程化的可注射透明质酸水凝胶,用于优化滋养层干细胞衍生外泌体的局部递送效率,以促进心肌梗塞后的心脏修复。 | 该水凝胶通过精心设计的超支化聚合物交联剂,增强了生物降解性和独特的控释能力,同时保留了纳米级外泌体的生物活性。 | NA | 旨在通过局部递送含有控释纳米级外泌体的水凝胶,促进心肌梗塞后的心脏修复。 | 研究对象为心肌梗塞后的心脏修复。 | 生物工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 424 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing explores the evolution of the ecosystem from leukoplakia to head and neck squamous cell carcinoma
2024-04-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-58978-9
PMID:38582791
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索从白斑病到头颈鳞状细胞癌的生态系统演变过程 | 发现了在白斑病向头颈鳞状细胞癌进展过程中,与预后相关的多个细胞亚群及其不同的命运走向 | NA | 揭示白斑病向头颈鳞状细胞癌进展的分子机制,并为新治疗策略的开发提供理论基础 | 白斑病和头颈鳞状细胞癌的细胞生态系统 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自基因表达综合数据库和UCSC Xena数据库的样本信息 | NA | NA | NA | NA |
| 425 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of hepatic non-parenchymal cell responses to chronic PFO5DoDA exposure in male mice
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123721
PMID:38462192
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了雄性小鼠肝脏非实质细胞在长期暴露于PFO5DoDA后的异质性反应。 | 首次详细研究了PFO5DoDA对肝脏非实质细胞的影响,揭示了这些细胞在暴露后的异质性反应和相互作用变化。 | 研究仅限于雄性小鼠,且样本量较小,可能影响结果的普遍性。 | 探讨PFO5DoDA暴露对肝脏非实质细胞的异质性影响及其机制。 | 雄性小鼠肝脏非实质细胞在PFO5DoDA暴露后的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 15,008个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 426 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling reveals transcriptome dynamics during bovine oocyte growth
2024-Apr-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10234-0
PMID:38580918
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研究论文 | 本研究运用单细胞RNA测序揭示了牛卵母细胞生长过程中的转录组动态变化 | 通过单细胞RNA测序首次揭示了牛卵母细胞各生长阶段关键基因和通路的独特数据集 | 大部分研究集中于已完全成熟的卵母细胞,难以获得早期发育阶段的数据 | 探讨牛卵母细胞从次级卵泡阶段到中腺泡阶段的转录组动态 | 牛卵母细胞,包括不同直径的卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 已知直径的卵母细胞(< 60 到 > 120 μm) | NA | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-08-04 |
SOXC are critical regulators of adult bone mass
2024-Apr-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47413-2
PMID:38580651
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研究论文 | 这篇文章探讨了SOXC转录因子在调控成年骨量中的重要性 | 揭示了SOXC通过调节骨质吸收和形成在成年骨量维持中的作用 | 尚未完全理解SOXC在成人骨量控制中的具体机制 | 研究SOXC对成年骨量的调控作用 | 使用SOXC功能丧失和功能获得小鼠模型进行研究 | 生物医学 | 骨质疏松症 | 小鼠模型 | 功能丧失和功能获得模型 | 基因表达数据 | 具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 428 | 2024-08-07 |
Targeting pathogenic CD8+ tissue-resident T cells with chimeric antigen receptor therapy in murine autoimmune cholangitis
2024-Apr-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46654-5
PMID:38580644
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研究论文 | 本研究使用Il12bIl2ra小鼠(DKO小鼠)作为自身免疫性胆管炎模型,通过Cd8a敲除或抗CD8α抗体治疗预防/减少胆管免疫病理,并开发针对表达PD-1的CD8 Trm细胞的嵌合抗原受体(CAR)-T细胞疗法。 | 首次描述了针对表达PD-1的CD8 Trm细胞的嵌合抗原受体(CAR)-T细胞的开发,并证明了其在治疗自身免疫性胆管炎中的潜在疗效。 | NA | 研究CD8 Trm细胞在自身免疫性胆管炎中的致病作用及PD-1靶向CAR-T细胞的潜在治疗用途。 | 自身免疫性胆管炎模型小鼠及CD8 Trm细胞。 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Il12bIl2ra小鼠(DKO小鼠)作为模型 | NA | NA | NA | NA |
| 429 | 2024-08-07 |
Metacell-based differential expression analysis identifies cell type specific temporal gene response programs in COVID-19 patient PBMCs
2024-Apr-05, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00364-2
PMID:38580667
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,利用元细胞方法分析COVID-19患者外周血单个核细胞(PBMCs)中的细胞类型特异性时间基因响应程序 | 提出了一种新的计算框架,使用元细胞作为“重复”以增加统计严谨性,并展示了这种方法在保留表达变异性和产生更有生物学意义的差异表达基因(DEGs)方面的优势 | 当前单细胞RNA测序分析存在基因检测数量少、实验成本高导致重复样本不足以及数据分析中将单个细胞视为独立测量导致统计膨胀的问题 | 旨在解决单细胞RNA测序技术在时间序列样本分析中的局限性 | COVID-19患者外周血单个核细胞(PBMCs)中的细胞类型特异性时间基因响应程序 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 时间序列的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 430 | 2024-08-07 |
Comprehensive analyses of the cancer-associated fibroblast subtypes and their score system for prediction of outcomes and immunosuppressive microenvironment in prostate cancer
2024-Apr-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03305-5
PMID:38580966
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研究论文 | 本文通过综合分析癌症相关成纤维细胞(CAFs)的亚型及其评分系统,预测前列腺癌的预后和免疫抑制微环境 | 开发了一种CAF亚型评分系统,作为前列腺癌和其他癌症类型的预后因子,并有助于区分前列腺癌中不同的免疫抑制机制 | NA | 研究CAF亚型在前列腺癌中的生物学和临床意义,并开发一种评分系统来预测预后和免疫抑制微环境 | 前列腺癌细胞、正常成纤维细胞和CAFs | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 从TCGA、MSKCC、CPGEA和GEO数据库收集的序列、基因组和临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 431 | 2024-08-04 |
GPR65 sensing tumor-derived lactate induces HMGB1 release from TAM via the cAMP/PKA/CREB pathway to promote glioma progression
2024-Apr-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03025-8
PMID:38576043
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤衍生乳酸如何影响肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)并促进胶质瘤进展的机制 | 提出了GPR65在TAM上感应乳酸刺激,并通过cAMP/PKA/CREB信号通路促进HMGB1释放,从而促进肿瘤进展的新机制 | 本研究主要集中于体外实验和小鼠模型,缺乏临床样本验证 | 阐明肿瘤衍生乳酸对胶质瘤中TAMs的影响及其调控通路 | 胶质瘤细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, CCK8, 细胞克隆形成, 创伤愈合, 转移实验, 西方印迹, 免疫荧光染色, RT-PCR, ELISA | 小鼠异种移植肿瘤模型 | 基因表达数据,细胞 assays 数据 | 使用TCGA和CGGA数据集进行的生物信息学分析,以及不同实验中细胞类型的相关检测 | NA | NA | NA | NA |
| 432 | 2024-08-07 |
Correction for Keum et al., Heterogeneous osteoimmune profiles via single-cell transcriptomics in osteoporotic patients who fail bisphosphonate treatment
2024-Apr-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404416121
PMID:38547069
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 433 | 2024-08-04 |
[Prediction of prognosis of patients with radical resection of intrahepatic cholangiocarcinoma based on single cell omics]
2024-Apr-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
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研究论文 | 基于单细胞组学分析,旨在评估肝内胆管癌患者根治性切除术后的生存获益 | 探讨了与患者预后相关的上皮细胞群体,并提出了抗氧化型肝内胆管癌组织分类的概念 | 缺乏足够的临床指标及其对预后的影响数据 | 评估肝内胆管癌患者根治性切除术的预后 | 46例接受根治性切除术的肝内胆管癌患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞测序 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据和生存数据 | 共包括146名患者,46名进行根治性切除术,100名用于微阵列数据分析 | NA | NA | NA | NA |
| 434 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals discrete tumour microenvironments and autocrine loops within ovarian cancer subclones
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47271-y
PMID:38570491
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研究论文 | 该文使用空间转录组学识别卵巢癌亚克隆及其与浸润细胞群体的关联 | 研究揭示了卵巢癌亚克隆的高亚克隆异质性及其特定的配体和受体表达模式 | NA | 探索高等级浆液性卵巢癌中亚克隆的特征及其微环境交互 | 高等级浆液性卵巢癌亚克隆及其与免疫细胞和基质细胞的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | NA | 使用多个样本对单个肿瘤切片进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 435 | 2024-08-04 |
The novel molecular mechanism of pulmonary fibrosis: insight into lipid metabolism from reanalysis of single-cell RNA-seq databases
2024-Apr-03, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-024-02062-8
PMID:38570797
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研究论文 | 本研究探讨了肺纤维化中脂质代谢的异常与疾病机制之间的关系 | 首次识别低密度脂蛋白(LDL)的失调作为肺纤维化的新风险因素,揭示了不同细胞类型中脂质代谢基因的重新编程 | 研究中没有提供样本大小和具体的实验数据支持 | 研究肺纤维化的分子机制,特别是脂质代谢在其中的作用 | 重点分析与肺纤维化相关的单细胞RNA测序数据及脂质代谢基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 436 | 2024-08-04 |
Shared inflammatory glial cell signature after stab wound injury, revealed by spatial, temporal, and cell-type-specific profiling of the murine cerebral cortex
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46625-w
PMID:38570482
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研究论文 | 该文章揭示了创伤性脑损伤后小鼠大脑皮层中炎症胶质细胞的转录组特征 | 首次结合空间和单细胞转录组学确定受伤小鼠脑皮层中特定胶质细胞的状态及其共享的伤害调控基因 | 未提及具体的临床相关性或在人类中的应用 | 全面了解特定细胞类型响应创伤的机制及其相互作用 | 受伤小鼠大脑皮层中的特定胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 437 | 2024-08-07 |
Eph-ephrin signaling couples endothelial cell sorting and arterial specification
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46300-0
PMID:38570531
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research paper | 本文通过结合细胞类型特异性和可诱导的小鼠遗传学、体外流动实验、单细胞RNA测序和生化方法,研究了Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | 揭示了Eph-ephrin相互作用如何整合细胞分离和动静脉指定在血管中的机制,对由EPHB4突变引起的人类血管畸形具有潜在相关性 | NA | 探讨Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | Eph-ephrin信号在血管形成中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 438 | 2024-08-04 |
Single-cell profile reveals the landscape of cardiac immunity and identifies a cardio-protective Ym-1hi neutrophil in myocardial ischemia-reperfusion injury
2024-Apr-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.02.003
PMID:38395651
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研究论文 | 本研究揭示了心脏免疫学的整体情况,并确定了一种具有心脏保护作用的Ym-1hi中性粒细胞在心肌缺血再灌注损伤中的作用 | 首次识别心肌缺血再灌注损伤中具保护作用的新型 Ym-1hi 中性粒细胞亚型 | 未提供人类样本的详细分析,主要集中在小鼠实验上 | 研究心肌缺血再灌注损伤中中性粒细胞的亚型及其动态变化 | 小鼠心脏中隔离的CD45阳性细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 在六个时间点对小鼠心脏进行取样,具体样本量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 439 | 2024-08-04 |
Macrophage diversity in human cancers: New insight provided by single-cell resolution and spatial context
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28332
PMID:38571605
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研究论文 | 本文总结了最近研究中使用先进技术揭示的人类癌症中肿瘤相关巨噬细胞的新功能亚群 | 该研究强调了特定肿瘤相关巨噬细胞亚群的转录组特征及其临床意义,并利用空间转录组学技术揭示了巨噬细胞与其他细胞类型之间的空间相互作用 | 对特定肿瘤类型中肿瘤相关巨噬细胞状态的知识仍然有限 | 探讨肿瘤微环境中巨噬细胞表型的多样性及其在不同人类癌症中的功能 | 研究肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞及其特定亚群 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多个不同类型人类癌症的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 440 | 2024-08-07 |
Identification and validation of mutual hub genes in idiopathic pulmonary fibrosis and rheumatoid arthritis-associated usual interstitial pneumonia
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28088
PMID:38571583
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析探索特发性肺纤维化(IPF)和类风湿关节炎相关寻常间质性肺炎(RA-UIP)中的共同枢纽基因和通路 | 筛选出四个共同枢纽基因(THBS2, TIMP1, POSTN, 和 CD19),并验证这些基因在IPF和RA-UIP中的潜在生物标志物作用 | NA | 探索IPF和RA-UIP中的共同枢纽基因和通路 | IPF和RA-UIP患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | GSE199152数据集中的IPF和RA-UIP患者肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |