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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-07 |
Granzyme K- and amphiregulin-expressing cytotoxic T cells and activated extrafollicular B cells are potential drivers of IgG4-related disease
2024-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.11.916
PMID:38092138
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体及B细胞受体测序,全面、无偏倚地观察了IgG4相关疾病中组织浸润的T细胞和B细胞 | 首次揭示了Granzyme K和amphiregulin表达的细胞毒性T细胞及激活的外滤泡B细胞在IgG4相关疾病中的潜在驱动作用 | NA | 探索IgG4相关疾病中组织浸润的T细胞和B细胞的全面、无偏倚的视图 | IgG4相关疾病患者的组织浸润T细胞和B细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 68名IgG4相关疾病患者和30名Sjögren综合征患者 | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-08-07 |
Melanoma Derived Exosomes Amplify Radiotherapy Induced Abscopal Effect via IRF7/I-IFN Axis in Macrophages
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304991
PMID:38286661
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研究论文 | 本研究通过构建携带肿瘤的小鼠模型,探讨了放射治疗(RT)诱导的肿瘤微环境(TME)变化及其对肿瘤远处效应的影响机制 | 首次揭示了肿瘤来源的外泌体通过circPIK3R3/miR-872-3p/IRF7轴促进I型干扰素分泌,增强CD8 T细胞的抗肿瘤免疫反应 | NA | 探究放射治疗诱导的肿瘤远处效应的详细机制 | 肿瘤微环境(TME)及其对肿瘤远处效应的影响 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、荧光原位杂交(FISH) | NA | RNA | 携带肿瘤的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-08-07 |
Deep Imputation Bi-stochastic Graph Regularized Matrix Factorization for Clustering Single-cell RNA-sequencing Data
2024-Apr-12, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3387911
PMID:38607719
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research paper | 本文提出了一种新的方法DSINMF,通过深度矩阵分解对单细胞RNA测序数据进行聚类 | DSINMF方法包括特征选择、缺失值插补、降维和深度矩阵分解与双随机图正则化四个步骤,以提高聚类效果 | NA | 探索细胞异质性和功能,辅助识别疾病机制和生物标志物 | 单细胞RNA测序数据 | digital pathology | NA | RNA-seq | CNN | 基因转录组数据 | 九个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-08-07 |
A specific enterotype derived from gut microbiome of older individuals enables favorable responses to immune checkpoint blockade therapy
2024-Apr-10, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.03.002
PMID:38513657
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研究论文 | 本研究探讨了老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法的增强敏感性现象,并通过元分析和单细胞RNA测序数据揭示了其潜在机制,特别是与肠道微生物群相关的特定肠型。 | 识别了一种与老年患者免疫疗法效果改善相关的特定肠型,并通过小鼠实验证实了其治疗潜力。 | NA | 探索老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法增强敏感性的机制,并寻找个性化癌症免疫疗法的新途径。 | 老年癌症患者的肠道微生物群及其对免疫疗法的影响。 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 25个中小型试验 | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-08-05 |
scRNAseq and High-Throughput Spatial Analysis of Tumor and Normal Microenvironment in Solid Tumors Reveal a Possible Origin of Circulating Tumor Hybrid Cells
2024-Apr-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16071444
PMID:38611120
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研究论文 | 利用高通量单细胞和空间转录组学分析肿瘤混合细胞的来源. | 首次识别共表达上皮和巨噬细胞标记的肿瘤混合细胞,并提供了其特征转录组的信息. | 关于循环混合细胞在组织中的来源的研究较少,且基于一两种标记的研究方法有限. | 探讨循环混合细胞的组织来源及其在不同类型癌症中的表现. | 肿瘤混合细胞(THCs)和正常组织中的细胞(NHCs)的转录组特征. | 数字病理学 | 乳腺癌和结肠癌 | 高通量单细胞转录组和空间转录组学 | NA | NA | 涉及乳腺癌和结肠癌的稀有样本 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-08-04 |
Defining T cell receptor repertoires using nanovial-based binding and functional screening
2024-Apr-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320442121
PMID:38536748
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研究论文 | 本文利用纳米瓶进行T细胞受体多样性的定义和筛选 | 提出了一种新颖的纳米瓶技术,可以有效地捕获和激活特定的T细胞,从而链接TCR序列与其靶标 | 对特定抗原的识别和效率可能受到pMHC的选择和设计限制 | 开发一种新的方法来识别和筛选抗原反应性T细胞,以应用于免疫疗法 | 通过纳米瓶捕获并排序反应特定病毒和癌症抗原的T细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of cells from fresh or frozen tissue reveals a signature of freezing marked by heightened stress and activation
2024-Apr, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350660
PMID:38304946
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析新鲜和冷冻组织中的细胞,揭示了冷冻标志,表现为应激和激活的基因上调 | 首次揭示了冷冻处理对人类组织T细胞、ILCs和NK细胞的单细胞RNA测序结果的影响,特别是应激和激活相关基因的上调 | NA | 研究冷冻处理对人类组织中细胞的单细胞RNA测序结果的影响 | 人类组织中的T细胞、ILCs和NK细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-08-07 |
High lymphocyte signature genes expression in parathyroid endocrine cells and its downregulation linked to tumorigenesis
2024-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105053
PMID:38471398
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了甲状旁腺内分泌细胞中淋巴细胞标志物的高表达及其与肿瘤发生的关系 | 首次发现甲状旁腺内分泌细胞中CD4和CD226的高表达,并揭示了其在甲状旁腺腺瘤发病机制中的作用 | 由于正常甲状旁腺样本获取困难,研究样本数量有限 | 深入理解甲状旁腺内分泌细胞的功能及其在肿瘤发生中的作用 | 甲状旁腺内分泌细胞及其在甲状旁腺腺瘤中的变化 | 数字病理学 | 甲状旁腺疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 6个正常甲状旁腺样本和8个甲状旁腺腺瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-08-07 |
Lung type 3 innate lymphoid cells respond early following Mycobacterium tuberculosis infection
2024-Apr-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03299-23
PMID:38407132
|
研究论文 | 研究探讨了肺部类型3先天淋巴细胞(ILC3s)在结核分枝杆菌感染早期的反应机制 | 揭示了ILC3在结核分枝杆菌感染早期的激活和招募机制,特别是IL-1R信号通路和CXCR5信号通路的作用 | NA | 研究ILC3在结核分枝杆菌感染早期的反应机制及其作为潜在疫苗靶点的可能性 | 肺部类型3先天淋巴细胞(ILC3s)及其在结核分枝杆菌感染中的作用 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的肺部先天淋巴细胞(ILCs) | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-08-07 |
Interferon Regulatory Factor 6 Determines Intestinal Epithelial Cell Development and Immunity
2024-Apr-09, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.03.013
PMID:38604478
|
研究论文 | 研究探讨了干扰素调节因子6(IRF6)在肠道上皮细胞(IEC)发育和免疫中的作用 | 首次揭示了IRF6在IEC生物学中的作用,包括调节上皮细胞发育和调节先天免疫反应以减少细胞毒性和维持屏障功能 | NA | 研究IRF6在肠道上皮细胞发育和免疫中的具体作用 | 肠道上皮细胞(IEC)和IRF6的功能 | NA | NA | CRISPR筛选,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及转化的鼠IEC和IEC类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-08-04 |
Deciphering the cellular heterogeneity of the insect brain with single-cell RNA sequencing
2024-Apr, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.13270
PMID:37702319
|
综述 | 本文回顾了昆虫大脑的基本结构及其与行为的关联,重点探讨学习和记忆相关的方面 | 介绍了单细胞RNA测序在昆虫大脑研究中的应用,揭示了细胞亚群的分类及发育轨迹 | 缺乏关于昆虫大脑功能调节如何具体作用的更深入解析 | 探讨昆虫大脑的细胞异质性及其对行为的影响 | 昆虫大脑的不同细胞类型及其连接和功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-08-07 |
The Impact of FBN1-α5β1 Axis in Fibro/Adipogenic Progenitor Cells (FAPCD9-) on Intramuscular Fat Content in Pigs
2024-Apr-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00059
PMID:38598771
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析了广东小耳花猪(高IMF)和约克夏猪(低IMF)的背最长肌,发现高IMF猪具有更多的纤维/脂肪生成祖细胞(FAPs),而低IMF猪则表现出更高的FBN1-整合素α5β1轴表达,抑制了脂肪生成分化。 | 本研究首次揭示了FBN1-α5β1轴在纤维/脂肪生成祖细胞中的作用,及其对猪肌肉内脂肪含量的影响。 | NA | 探讨纤维/脂肪生成祖细胞及其相关分子轴在猪肌肉内脂肪含量中的作用。 | 广东小耳花猪和约克夏猪的背最长肌。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 广东小耳花猪和约克夏猪的背最长肌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-08-04 |
Single-cell multiomics reveals the interplay of clonal evolution and cellular plasticity in hepatoblastoma
2024-Apr-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47280-x
PMID:38589411
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研究论文 | 该研究利用单细胞多组学策略揭示了肝母细胞瘤中克隆演变与细胞可塑性之间的相互作用 | 通过单细胞测序,研究了HB细胞状态的连续性及其差异化极性,并揭示了基因调控网络与转录因子激活序列 | 具体的机制尚不完全明了,且对临床结果的影响仍需进一步研究 | 解析肝母细胞瘤细胞可塑性的分子决定因素 | 肝母细胞瘤中的不同基因亚克隆及其细胞状态变化 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞多组学 | NA | 基因组数据,空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-08-07 |
Differentiation of type 17 MAIT cells in circulation contributes to the severity of sepsis
2024-Apr-08, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.03.010
PMID:38599461
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研究论文 | 本研究探讨了黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞)在脓毒症严重程度中的作用 | 首次发现循环中的MAIT17细胞在脓毒症患者中比例较高,且与疾病严重程度相关 | NA | 揭示MAIT17细胞在脓毒症中的新作用及其分子机制 | MAIT17细胞在脓毒症中的作用及相关的信号通路 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-08-04 |
CD200+ fibroblasts form a pro-resolving mesenchymal network in arthritis
2024-Apr, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01774-4
PMID:38396288
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研究论文 | 这篇文章探讨了在关节炎中成纤维细胞的表型变化及其在炎症解决过程中的作用。 | 文章首次使用正电子发射断层扫描技术检测成纤维细胞激活蛋白,并展示了成纤维细胞在炎症解决过程中的动态分子调控。 | 这项研究主要集中在实验性关节炎模型中,可能不完全适用于人类的所有疾病状态。 | 研究成纤维细胞在炎症解决过程中的表型变化及其功能。 | 研究对象为在实验性关节炎中活化的成纤维细胞。 | 数字病理学 | 关节炎 | 正电子发射断层扫描(PET),单细胞RNA测序 | NA | 生物样本(活检) | 实验性关节炎的小鼠模型和人类关节活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-08-04 |
Tracking the immune response profiles elicited by the BNT162b2 vaccine in COVID-19 unexperienced and experienced individuals
2024-04, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110164
PMID:38417765
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研究论文 | 本文对BNT162b2疫苗在COVID-19经历和未经历感染个体中的免疫反应进行了纵向分析 | 研究揭示了疫苗接种后免疫反应的动态变化,在经历自然感染与否的个体中有不同的克隆扩展模式。 | 研究可能未考虑其他因素如个体遗传背景和免疫系统的差异对免疫反应的影响 | 旨在分析BNT162b2疫苗在不同感染经历个体中的免疫反应 | 针对曾经历和未经历SARS-CoV-2感染的个体进行了免疫学分析 | 数字病理学 | NA | CITE-seq, LIBRA-seq, VDJ-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell RNA sequencing analysis with 101 machine learning combinations reveal neutrophil extracellular trap involvement in hepatic ischemia-reperfusion injury and early allograft dysfunction
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111874
PMID:38493695
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研究论文 | 本研究分析了中性粒细胞外网在肝脏缺血再灌注损伤及早期移植物功能障碍中的作用 | 新发现了两种明显的肝脏缺血再灌注损伤亚型,并建立了一种早期移植物功能障碍预测模型 | 研究主要依赖于公开数据库,可能存在数据选择偏倚的风险 | 综合分析肝脏缺血再灌注损伤中的中性粒细胞外网相关基因表达模式 | 肝脏缺血再灌注损伤相关样本及其基因表达模式 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | RNA-seq | NMF算法 | 基因表达数据 | 101个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-08-07 |
MGP+ and IDO1+ tumor-associated macrophages facilitate immunoresistance in breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111818
PMID:38460300
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了31名接受PD-1免疫治疗的乳腺癌患者的肿瘤组织中髓系细胞的变化,揭示了MGP+和IDO1+肿瘤相关巨噬细胞在乳腺癌中的免疫抵抗机制 | 本研究发现了MGP TAMs和IDO1 TAMs在乳腺癌患者中影响免疫治疗效果的新机制,并提供了新的生物标志物以预测治疗反应和克服免疫治疗抵抗 | NA | 探讨乳腺癌患者在接受PD-1免疫治疗后肿瘤相关巨噬细胞的变化及其对免疫治疗效果的影响 | 乳腺癌患者的肿瘤组织中的髓系细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 31名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome profiling of infrapatellar fat pad highlights the role of interstitial inflammatory fibroblasts in osteoarthritis
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111888
PMID:38522139
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了髌下脂肪垫(IFP)的细胞异质性,揭示了间质炎症性成纤维细胞(iiFBs)在骨关节炎(OA)中的作用。 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了髌下脂肪垫中间质炎症性成纤维细胞的特性和其在骨关节炎中的作用。 | NA | 探索髌下脂肪垫在骨关节炎发病机制中的作用,并识别潜在的治疗靶点。 | 髌下脂肪垫的细胞异质性及其在骨关节炎中的作用。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞和单核RNA测序 | NA | 转录组 | 10个髌下脂肪垫样本,包括5个来自骨关节炎患者和5个来自健康对照。 | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq identifies FBXO2 as a candidate biomarker associated with chemoresistance in HGSOC
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28490
PMID:38590858
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研究论文 | 这项研究确定了FBXO2作为与HGSOC化疗抗药性相关的潜在生物标志物 | 首次通过结合单细胞RNA测序和整体RNA测序数据集识别出FBXO2在化疗抗药性中的作用 | 在体外验证中可能受限于细胞系的选择,临床适用性还有待进一步研究 | 研究HGSOC中与化疗抗药性相关的生物标志物 | 高等级浆液性卵巢癌患者的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 8871个恶性上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |