单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 498 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-04 |
Characterization of the distinct immune microenvironments between hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216799
PMID:38479553
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）和肝内胆管癌（ICC）之间明显不同的肿瘤免疫微环境 | 研究首次系统性评估了HCC和ICC的肿瘤免疫微环境的相似性和差异性 | 未提及研究的局限性 | 旨在揭示HCC和ICC的肿瘤免疫微环境的细胞组成和相互作用 | 研究对象为来自四种不同组织类型的HCC和ICC的41个单细胞RNA-seq样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 41个单细胞RNA-seq样本 |
| 402 | 2024-08-04 |
Association of preoperative aspartate aminotransferase to platelet ratio index with outcomes and tumour microenvironment among colorectal cancer with liver metastases
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216778
PMID:38458593
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研究论文 | 本研究旨在探讨可改善结直肠肝转移患者预后预测的生物标志物 | 本研究首次将术前天冬氨酸氨基转移酶与血小板比率指数(APRI)与结直肠肝转移患者的预后及肿瘤微环境关联起来 | 研究可能受到多中心数据的异质性影响，需注意结果的普遍适用性 | 旨在识别可应用的 robust 生物标志物以改善结直肠肝转移患者的预后预测 | 纳入了1323名接受同期切除手术的结直肠肝转移患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞 RNA 测序，复合免疫组化/免疫荧光 | IPTW调整的Cox风险回归分析 | 血液样本，肿瘤样本 | 1323名结直肠肝转移患者 |
| 403 | 2024-08-07 |
CD63+ cancer-associated fibroblasts confer CDK4/6 inhibitor resistance to breast cancer cells by exosomal miR-20
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216747
PMID:38403110
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研究论文 | 本研究揭示了CD63+癌症相关成纤维细胞通过外泌体miR-20赋予乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂的耐药性 | 发现CD63 CAFs通过外泌体miR-20促进乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂的耐药性，并设计合成了cRGD-miR-20海绵纳米粒子以增强CDK4/6抑制剂的治疗效果 | NA | 探讨CDK4/6抑制剂耐药性的机制并寻找新的治疗策略 | 乳腺癌细胞、CD63癌症相关成纤维细胞及外泌体miR-20 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 404 | 2024-08-07 |
Candida albicans-myeloid cells-T lymphocytes axis in the tumor microenvironment of oral tumor-bearing mice
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216814
PMID:38499264
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研究论文 | 本研究报告了口腔肿瘤小鼠模型中由白色念珠菌感染引起的肿瘤微环境变化 | 首次揭示了白色念珠菌感染下口腔肿瘤微环境中髓系细胞与T淋巴细胞轴的作用 | NA | 探讨白色念珠菌如何通过影响免疫微环境促进口腔癌发展 | 口腔肿瘤小鼠模型中的肿瘤微环境 | NA | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 405 | 2024-08-07 |
An effective two-stage NMBzA-induced rat esophageal tumor model revealing that the FAT-Hippo-YAP1 axis drives the progression of ESCC
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216813
PMID:38499266
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研究论文 | 本文报道了一种有效的两阶段NMBzA诱导的大鼠食管癌模型，并揭示了FAT-Hippo-YAP1轴在食管鳞状细胞癌（ESCC）进展中的作用。 | 使用多激酶抑制剂索拉非尼作为肿瘤促进剂，建立了高效的两阶段NMBzA诱导的大鼠ESCC致癌模型，增加了肿瘤发生率和缩短了肿瘤形成时间。 | 模型仍存在时间消耗较长和恶性肿瘤发生率低的问题。 | 研究食管鳞状细胞癌的起始、进展和新治疗策略。 | NMBzA诱导的大鼠食管鳞状细胞癌模型及其相关分子机制。 | 数字病理学 | 食管癌 | 全基因组测序、三维（3-D）器官培养、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、细胞系、组织样本 | 从NMBzA诱导的乳头状瘤和ESCC中生成的肿瘤细胞系，以及三维器官培养和单细胞RNA测序的样本。 |
| 406 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing explores the evolution of the ecosystem from leukoplakia to head and neck squamous cell carcinoma
2024-04-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-58978-9
PMID:38582791
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索从白斑病到头颈鳞状细胞癌的生态系统演变过程 | 发现了在白斑病向头颈鳞状细胞癌进展过程中，与预后相关的多个细胞亚群及其不同的命运走向 | NA | 揭示白斑病向头颈鳞状细胞癌进展的分子机制，并为新治疗策略的开发提供理论基础 | 白斑病和头颈鳞状细胞癌的细胞生态系统 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自基因表达综合数据库和UCSC Xena数据库的样本信息 |
| 407 | 2024-08-07 |
Mechanisms of imbalanced testicular homeostasis in infancy due to aberrant histone acetylation in undifferentiated spermatogonia under different concentrations of Di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) exposure
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123742
PMID:38460586
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研究论文 | 本研究探讨了不同浓度邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)暴露下，未分化精原细胞中组蛋白乙酰化异常导致的婴儿期睾丸内稳态失衡机制 | 首次揭示了DEHP暴露在婴儿期通过影响组蛋白乙酰化模式，导致未分化精原细胞凋亡或自噬，并影响成年期睾丸内稳态 | NA | 阐明DEHP暴露在婴儿期对睾丸细胞群发育的分子机制 | 未分化精原细胞、Sertoli细胞和Leydig细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | PD5小鼠，分别以40 μg/kg和80 μg/kg DEHP连续暴露十天 |
| 408 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of hepatic non-parenchymal cell responses to chronic PFO5DoDA exposure in male mice
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123721
PMID:38462192
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了雄性小鼠肝脏非实质细胞在长期暴露于PFO5DoDA后的异质性反应。 | 首次详细研究了PFO5DoDA对肝脏非实质细胞的影响，揭示了这些细胞在暴露后的异质性反应和相互作用变化。 | 研究仅限于雄性小鼠，且样本量较小，可能影响结果的普遍性。 | 探讨PFO5DoDA暴露对肝脏非实质细胞的异质性影响及其机制。 | 雄性小鼠肝脏非实质细胞在PFO5DoDA暴露后的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 15,008个细胞 |
| 409 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling reveals transcriptome dynamics during bovine oocyte growth
2024-Apr-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10234-0
PMID:38580918
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研究论文 | 本研究运用单细胞RNA测序揭示了牛卵母细胞生长过程中的转录组动态变化 | 通过单细胞RNA测序首次揭示了牛卵母细胞各生长阶段关键基因和通路的独特数据集 | 大部分研究集中于已完全成熟的卵母细胞，难以获得早期发育阶段的数据 | 探讨牛卵母细胞从次级卵泡阶段到中腺泡阶段的转录组动态 | 牛卵母细胞，包括不同直径的卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 已知直径的卵母细胞（< 60 到 > 120 μm） |
| 410 | 2024-08-04 |
SOXC are critical regulators of adult bone mass
2024-Apr-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47413-2
PMID:38580651
|
研究论文 | 这篇文章探讨了SOXC转录因子在调控成年骨量中的重要性 | 揭示了SOXC通过调节骨质吸收和形成在成年骨量维持中的作用 | 尚未完全理解SOXC在成人骨量控制中的具体机制 | 研究SOXC对成年骨量的调控作用 | 使用SOXC功能丧失和功能获得小鼠模型进行研究 | 生物医学 | 骨质疏松症 | 小鼠模型 | 功能丧失和功能获得模型 | 基因表达数据 | 具体样本数量未提供 |
| 411 | 2024-08-04 |
Cellular atlas of the human ovary using morphologically guided spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2024-Apr-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7506
PMID:38578993
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研究论文 | 本文构建了一个人类卵巢的细胞图谱，利用形态学引导的空间转录组学和单细胞测序。 | 研究揭示了卵母细胞、黄体细胞和颗粒细胞的特异性基因活动，并提供了相应的基因面板，扩展了对卵泡发育分子机制的认识。 | 研究仅使用了两名绝经前供体的卵巢样本，样本量相对较小。 | 探讨卵巢中细胞群体之间的功能特征及其相互作用。 | 来自五名供体的卵巢区域，包括257个区域的基因分析和21,198个细胞的单细胞RNA测序。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 257个区域和21,198个细胞 |
| 412 | 2024-08-07 |
col1a2+ fibroblasts/muscle progenitors finetune xanthophore countershading by differentially expressing csf1a/1b in embryonic zebrafish
2024-Apr-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9637
PMID:38578990
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研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼胚胎中黄素细胞反阴影模式调控的机制 | 首次发现纤维母细胞和肌肉前体细胞通过差异表达CSF1A/1B来调节黄素细胞的分布模式 | NA | 探究动物色素模式适应自然环境的机制 | 斑马鱼胚胎中的黄素细胞反阴影模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 413 | 2024-08-07 |
Targeting pathogenic CD8+ tissue-resident T cells with chimeric antigen receptor therapy in murine autoimmune cholangitis
2024-Apr-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46654-5
PMID:38580644
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研究论文 | 本研究使用Il12bIl2ra小鼠（DKO小鼠）作为自身免疫性胆管炎模型，通过Cd8a敲除或抗CD8α抗体治疗预防/减少胆管免疫病理，并开发针对表达PD-1的CD8 Trm细胞的嵌合抗原受体（CAR）-T细胞疗法。 | 首次描述了针对表达PD-1的CD8 Trm细胞的嵌合抗原受体（CAR）-T细胞的开发，并证明了其在治疗自身免疫性胆管炎中的潜在疗效。 | NA | 研究CD8 Trm细胞在自身免疫性胆管炎中的致病作用及PD-1靶向CAR-T细胞的潜在治疗用途。 | 自身免疫性胆管炎模型小鼠及CD8 Trm细胞。 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Il12bIl2ra小鼠（DKO小鼠）作为模型 |
| 414 | 2024-08-07 |
Metacell-based differential expression analysis identifies cell type specific temporal gene response programs in COVID-19 patient PBMCs
2024-Apr-05, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00364-2
PMID:38580667
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，利用元细胞方法分析COVID-19患者外周血单个核细胞（PBMCs）中的细胞类型特异性时间基因响应程序 | 提出了一种新的计算框架，使用元细胞作为“重复”以增加统计严谨性，并展示了这种方法在保留表达变异性和产生更有生物学意义的差异表达基因（DEGs）方面的优势 | 当前单细胞RNA测序分析存在基因检测数量少、实验成本高导致重复样本不足以及数据分析中将单个细胞视为独立测量导致统计膨胀的问题 | 旨在解决单细胞RNA测序技术在时间序列样本分析中的局限性 | COVID-19患者外周血单个核细胞（PBMCs）中的细胞类型特异性时间基因响应程序 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 时间序列的单细胞RNA测序数据集 |
| 415 | 2024-08-07 |
Comprehensive analyses of the cancer-associated fibroblast subtypes and their score system for prediction of outcomes and immunosuppressive microenvironment in prostate cancer
2024-Apr-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03305-5
PMID:38580966
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研究论文 | 本文通过综合分析癌症相关成纤维细胞（CAFs）的亚型及其评分系统，预测前列腺癌的预后和免疫抑制微环境 | 开发了一种CAF亚型评分系统，作为前列腺癌和其他癌症类型的预后因子，并有助于区分前列腺癌中不同的免疫抑制机制 | NA | 研究CAF亚型在前列腺癌中的生物学和临床意义，并开发一种评分系统来预测预后和免疫抑制微环境 | 前列腺癌细胞、正常成纤维细胞和CAFs | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从TCGA、MSKCC、CPGEA和GEO数据库收集的序列、基因组和临床数据 |
| 416 | 2024-08-04 |
GPR65 sensing tumor-derived lactate induces HMGB1 release from TAM via the cAMP/PKA/CREB pathway to promote glioma progression
2024-Apr-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03025-8
PMID:38576043
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤衍生乳酸如何影响肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）并促进胶质瘤进展的机制 | 提出了GPR65在TAM上感应乳酸刺激，并通过cAMP/PKA/CREB信号通路促进HMGB1释放，从而促进肿瘤进展的新机制 | 本研究主要集中于体外实验和小鼠模型，缺乏临床样本验证 | 阐明肿瘤衍生乳酸对胶质瘤中TAMs的影响及其调控通路 | 胶质瘤细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, CCK8, 细胞克隆形成, 创伤愈合, 转移实验, 西方印迹, 免疫荧光染色, RT-PCR, ELISA | 小鼠异种移植肿瘤模型 | 基因表达数据，细胞 assays 数据 | 使用TCGA和CGGA数据集进行的生物信息学分析，以及不同实验中细胞类型的相关检测 |
| 417 | 2024-08-07 |
Correction for Keum et al., Heterogeneous osteoimmune profiles via single-cell transcriptomics in osteoporotic patients who fail bisphosphonate treatment
2024-Apr-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404416121
PMID:38547069
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-08-04 |
[Prediction of prognosis of patients with radical resection of intrahepatic cholangiocarcinoma based on single cell omics]
2024-Apr-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
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研究论文 | 基于单细胞组学分析，旨在评估肝内胆管癌患者根治性切除术后的生存获益 | 探讨了与患者预后相关的上皮细胞群体，并提出了抗氧化型肝内胆管癌组织分类的概念 | 缺乏足够的临床指标及其对预后的影响数据 | 评估肝内胆管癌患者根治性切除术的预后 | 46例接受根治性切除术的肝内胆管癌患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞测序 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据和生存数据 | 共包括146名患者，46名进行根治性切除术，100名用于微阵列数据分析 |
| 419 | 2024-08-07 |
Osteosarcoma Cells Secrete CXCL14 That Activates Integrin α11β1 on Fibroblasts to Form a Lung Metastatic Niche
2024-Apr-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1307
PMID:38295227
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了未经治疗的骨肉瘤肿瘤微环境中的细胞群体，发现CXCL14在具有肿瘤细胞启动特性和促转移特性的干细胞样簇中特异性富集，并能通过与纤维母细胞上的整合素α11β1结合，诱导其重编程，形成支持肺转移的微环境。 | 本文首次揭示了骨肉瘤细胞与纤维母细胞之间的相互作用，以及CXCL14-整合素α11β1轴在促进骨肉瘤肺转移中的作用，并提出针对这一轴的治疗策略。 | NA | 研究骨肉瘤细胞与纤维母细胞之间的相互作用及其在肺转移形成中的机制。 | 骨肉瘤细胞、纤维母细胞、肺转移微环境。 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 420 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals discrete tumour microenvironments and autocrine loops within ovarian cancer subclones
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47271-y
PMID:38570491
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研究论文 | 该文使用空间转录组学识别卵巢癌亚克隆及其与浸润细胞群体的关联 | 研究揭示了卵巢癌亚克隆的高亚克隆异质性及其特定的配体和受体表达模式 | NA | 探索高等级浆液性卵巢癌中亚克隆的特征及其微环境交互 | 高等级浆液性卵巢癌亚克隆及其与免疫细胞和基质细胞的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | NA | 使用多个样本对单个肿瘤切片进行分析 |