单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 491 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-04 |
Decoding spatiotemporal transcriptional dynamics and epithelial fibroblast crosstalk during gastroesophageal junction development through single cell analysis
2024-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47173-z
PMID:38594232
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学研究胃食管交界处的细胞动态和间质细胞与上皮细胞的相互作用 | 首次揭示了胃食管交界处发育过程中的转录状态和信号通路，以及成纤维细胞与上皮细胞之间的相互作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能对人类的适用性有限 | 探索胃食管交界处的发育过程及其间质细胞与上皮细胞之间的相互作用 | 小鼠的胃食管交界处组织，具体研究细胞的异质性和时空动态 | 数字病理学 | 胃肠道疾病 | 单细胞转录组学、类器官、空间分析 | NA | 转录组数据 | 胎鼠到成年鼠的胃食管交界处组织 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-07 |
OASIS: An interpretable, finite-sample valid alternative to Pearson's X2 for scientific discovery
2024-Apr-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2304671121
PMID:38564640
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研究论文 | 本文开发了一种名为OASIS的统计测试方法，用于处理计数矩阵形式的列联表数据，旨在提供一种计算效率高且对有限样本统计有效的替代方法 | OASIS提供了一种新的测试统计量，该统计量在线性于归一化数据矩阵的同时，通过经典集中不等式提供封闭形式的p值界限，并能解释性地拒绝原假设 | NA | 开发一种新的统计测试方法，以解决现有统计测试在计算效率和统计有效性方面的不足 | 列联表形式的计数矩阵数据 | 统计学 | NA | 统计测试方法 | OASIS | 计数矩阵 | 有限样本 | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-07 |
Tumor and Peritoneum-Associated Macrophage Gene Signature as a Novel Molecular Biomarker in Gastric Cancer
2024-Apr-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25074117
PMID:38612926
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研究论文 | 本文研究了胃癌中肿瘤和腹膜相关巨噬细胞的基因特征作为新型分子生物标志物的作用 | 首次探讨了M2型巨噬细胞在胃癌中的表达与患者生存率的关系，并验证了其在腹膜液中的表达 | 研究样本量相对较小，且仅基于TCGA数据集进行分析 | 探讨胃癌中巨噬细胞的基因特征与患者生存率的关系 | 胃癌患者的肿瘤和腹膜相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 341个TCGA胃癌样本及28个胃癌患者的前瞻性收集腹膜液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-07 |
Boosting Clear Cell Renal Carcinoma-Specific Drug Discovery Using a Deep Learning Algorithm and Single-Cell Analysis
2024-Apr-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25074134
PMID:38612943
|
研究论文 | 本文利用单细胞转录组测序数据和深度学习算法，针对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤微环境进行分析，以发现特定的药物化合物 | 结合深度图神经网络和机器学习算法，从生物活性化合物库中筛选出针对ccRCC的特定化合物 | NA | 发现针对透明细胞肾细胞癌的特定药物化合物，以改善临床治疗效果 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境及其特定药物化合物 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | 深度图神经网络 | 基因表达数据 | 6名患者的单细胞转录组测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal metastatic CLDN4+ cancer cells underlying the recurrence of malignant pleural effusion in patients with advanced non-small-cell lung cancer
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1649
PMID:38629624
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研究论文 | 本研究揭示了在晚期非小细胞肺癌患者中，CLDN4+癌细胞与恶性胸腔积液复发之间的关联 | 首次通过单细胞转录组学方法识别出与复发性恶性胸腔积液相关的CLDN4+转移性癌细胞 | 需要在更大样本量的群体中进一步验证CLDN4的临床价值和其生物功能的机制研究 | 探讨非小细胞肺癌患者中复发性恶性胸腔积液的细胞和基因标志 | 研究对象为16名合并胸腔积液的非小细胞肺癌患者 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 16名非小细胞肺癌患者的胸腔积液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-04 |
Modeling single cell trajectory using forward-backward stochastic differential equations
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012015
PMID:38620017
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研究论文 | 本文提出了一种利用前向-后向随机微分方程建模单细胞发育轨迹的方法 | 结合前向-后向随机微分方程与精细化近似程序，以动态方式建模非线性轨迹 | 现有的SDE方法通常依赖数值近似，可能导致推断不准确，偏离真实轨迹 | 研究单细胞发育轨迹的动态建模 | 单细胞转录组测序数据 | 计算机视觉 | NA | 随机微分方程 | 前向-后向随机微分方程 | 单细胞转录组数据 | 多个scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-07 |
Pericyte signaling via soluble guanylate cyclase shapes the vascular niche and microenvironment of tumors
2024-Apr, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00078-5
PMID:38528180
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了通过特定删除可溶性鸟苷酸环化酶（sGC）的NO受体，研究了周细胞如何影响肿瘤血管微环境和血管生态位 | 首次详细探讨了周细胞在肿瘤血管微环境中的作用，并提出针对周细胞sGC的治疗策略 | 研究主要集中在细胞和分子层面，未来需进一步在动物模型和临床试验中验证 | 阐明周细胞在肿瘤血管微环境中的作用，并探索新的癌症治疗策略 | 周细胞、内皮细胞、癌症相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-07 |
Partial label learning for automated classification of single-cell transcriptomic profiles
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012006
PMID:38578796
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研究论文 | 本文研究了如何利用部分标签学习框架自动分类单细胞转录组数据，并探讨了标签集结构的整合效果 | 提出了利用部分标签学习框架，而不是完全监督的训练数据集，来分类单细胞转录组数据 | 文章未明确提及具体的局限性 | 旨在解决单细胞转录组数据的自动分类问题 | 单细胞转录组数据的分类及其细胞谱系关系的识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNASeq） | SVM, kNN, 基于原型的方法, 逻辑回归, 集成方法 | 转录组数据 | 文章未提供具体的样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-07 |
Cell Heterogeneity Analysis Revealed the Key Role of Fibroblasts in the Magnum Regression of Ducks
2024-Apr-01, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14071072
PMID:38612311
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了鸭子输卵管中段（magnum）在产蛋和停产后细胞异质性的变化 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了鸭子输卵管中段在产蛋和停产后细胞异质性的差异，特别是涉及蛋白质分泌和细胞外基质（ECM）产生的成纤维细胞的变化 | 研究仅限于特定年龄的鸭子，且样本数量有限，可能需要进一步扩大样本范围以验证结果的普遍性 | 探究鸭子输卵管中段在产蛋和停产后分子机制的差异 | 鸭子输卵管中段的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 13,708个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-07 |
Integration analysis of single-cell transcriptome reveals specific monocyte subsets associated with melanoma brain and leptomeningeal metastasis
2024-Apr, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.13710
PMID:38616506
|
研究论文 | 本研究通过整合分析单细胞转录组数据，揭示了与黑色素瘤脑和软脑膜转移相关的特定单核细胞亚群 | 本研究首次详细分析了黑色素瘤脑转移和软脑膜转移中单核细胞亚群的组成和分子表达差异，并发现了与转移相关的特定单核细胞亚群 | NA | 阐明黑色素瘤中枢神经系统转移的病理机制，为开发针对单核细胞或细胞因子的治疗策略提供依据 | 黑色素瘤脑转移和软脑膜转移中的单核细胞亚群 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 涉及血液、原发肿瘤、脑转移和软脑膜转移组织中的单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-04 |
[Current status and prospects of genetic research on IgA nephropathy]
2024-Apr-23, Zhonghua yi xue za zhi
|
评论 | 本文讨论了IgA肾病的遗传研究现状和前景 | 提出了基因组医学时代如何通过全基因组测序和多组学研究寻找IgA肾病的易感基因及靶向药物的见解 | 仅讨论了目前的研究进展，未提供新的实验数据或结果 | 探讨IgA肾病的遗传因素及其在发病机制中的作用 | IgA肾病相关的易感基因和临床表型 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序（WGS），单细胞测序，表达数量性性状位点（eQTL） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-04 |
Evaluation of McCauley et al.: A framework for systematic evaluation of tissue signaling responses by single-cell RNA-seq
2024-Apr-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.03.007
PMID:38636454
|
评论 | 对McCauley等人论文的同行评审过程的单次快照 | 开发了一个系统性评估组织信号响应的框架 | 没有提供关于具体实验数据或结果的详细信息 | 评估组织信号反应的系统性方法 | 人类气道上皮中的信号反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-07 |
Decoding the biology and clinical implication of neutrophils in intracranial aneurysm
2024-Apr, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52014
PMID:38317016
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和外部批量mRNA测序数据，深入探讨了侵入颅内动脉瘤（IA）壁的中性粒细胞的特征和功能异质性 | 首次详细描述了中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和潜在临床意义，揭示了中性粒细胞在IA形成和破裂中的不同亚群及其作用机制 | NA | 阐明中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和临床意义 | 中性粒细胞在颅内动脉瘤中的功能和临床意义 | NA | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA测序数据 | 涉及人和小鼠模型的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-04 |
Set7 Methyltransferase and Phenotypic Switch in Diabetic Glomerular Endothelial Cells
2024-Apr-17, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000345
PMID:38630537
|
研究论文 | 本研究探讨了Set7甲基转移酶在糖尿病肾病（DKD）中对肾小管内皮细胞功能的影响 | 揭示了Set7在糖尿病肾小管内皮细胞表型转变中的调控作用，并表明靶向Set7可能保护肾小管细胞损伤 | 本研究主要在小鼠模型中进行，未来需要更多人类样本的验证 | 研究Set7在糖尿病肾病中对内皮细胞功能的作用 | 以糖尿病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA-seq | 小鼠模型和人类肾脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-07 |
Dynamic Hippo pathway activity underlies mesenchymal differentiation during lung alveolar morphogenesis
2024-Apr-05, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202430
PMID:38602485
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研究论文 | 研究探讨了Hippo信号通路在肺泡形态发生中调节次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）功能的动态变化 | 首次揭示了Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF功能、增殖和时间身份的调节作用 | NA | 研究Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF的调节作用 | 次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）及其在肺泡形态发生中的作用 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 从报告鼠中纯化的SCMF细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of pediatric renal tissues revealed the potential relationship between immunoglobulin A nephropathy and immunoglobulin A vasculitis with nephritis
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1651
PMID:38591641
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-07 |
Treatment resistance in pancreatic and biliary tract cancer: molecular and clinical pharmacology perspectives
2024-Apr, Expert review of clinical pharmacology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/17512433.2024.2319340
PMID:38413373
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研究论文 | 本文综述了胆道癌和胰腺癌治疗抵抗的分子和临床药理学视角，探讨了当前治疗方案及其抵抗机制，并提出了克服这些障碍的策略。 | 本文提出了通过个性化患者方法和人工智能应用来指导有效治疗策略的新思路。 | 目前尚未形成统一的治疗抵抗理论，进展有限。 | 旨在识别和克服胆道癌和胰腺癌治疗抵抗的分子机制，以改善患者治疗效果。 | 胆道癌和胰腺癌的治疗抵抗机制及其克服策略。 | NA | 胆道癌、胰腺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-07 |
Irisin delays the onset of type 1 diabetes in NOD mice by enhancing intestinal barrier
2024-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.130857
PMID:38493812
|
研究论文 | 本研究探讨了irisin激素通过增强结肠肠屏障功能来延缓1型糖尿病（T1D）在NOD小鼠中的发病 | 首次揭示了irisin通过调节AMPK/PI3K/AKT通路和增加MUC3表达来增强结肠肠屏障功能，从而延缓T1D的发病 | NA | 研究irisin是否能通过增强结肠肠屏障来延缓T1D的发病 | 1型糖尿病（T1D）患者和非肥胖糖尿病（NOD）小鼠 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-07 |
Cell Type- and Age-Specific Expression of lncRNAs across Kidney Cell Types
2024-Apr-15, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000354
PMID:38621182
|
研究论文 | 本研究采用靶向单细胞RNA测序方法，分析了不同细胞类型和年龄阶段肾脏细胞中长非编码RNA（lncRNA）的表达情况 | 首次构建了不同细胞类型中lncRNA的转录组图谱，并探讨了lncRNA在肾脏老化中的功能角色 | lncRNA的功能仍不完全清楚，需要进一步的研究来阐明其在细胞分化和稳态中的具体作用 | 揭示lncRNA在肾脏细胞类型和年龄特异性表达中的作用 | 肾脏细胞中的长非编码RNA（lncRNA） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括正常和老龄小鼠的多种组织 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing of virus-specific cellular immune responses in chronic hepatitis B patients
2024-Apr-08, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03187-2
PMID:38589415
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究慢性乙型肝炎患者的HBV特异性细胞免疫反应 | 创建了HBV免疫反应的单细胞RNA测序数据集，有助于更好地理解失调的免疫反应 | NA | 探索慢性乙型肝炎患者中HBV特异性T细胞反应的转录变化 | 慢性乙型肝炎患者和健康对照者的血液及肝脏组织样本 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 21名慢性乙型肝炎患者和10名健康对照者的血液样本，以及5份匹配的肝脏活检样本 | NA | NA | NA | NA |