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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-08-16 |
Single-cell transcriptome analysis reveals characteristic transcription factors in polydactyly
2024-04, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202404_36050
PMID:38708480
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示多指畸形中的特征转录因子及其调控网络 | 首次利用单细胞RNA测序技术分析多指畸形样本,识别出与成纤维细胞和角质形成细胞相关的特定转录因子,并构建了调控网络 | 数据仅来自公共数据库,样本量有限,且未进行实验验证 | 识别多指畸形中的特征转录因子,作为潜在的生物标志物和治疗靶点 | 多指畸形样本中的成纤维细胞和角质形成细胞亚群 | 单细胞转录组学 | 多指畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4个多指畸形样本,共11,806个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据来源于GEO公共数据库 |
| 22 | 2026-08-16 |
Integration of single-cell and RNA-seq data to explore the role of focal adhesion-related genes in osteoporosis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18271
PMID:38534087
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和RNA测序数据,探索黏着斑相关基因在骨质疏松症中的作用,并识别出两个关键基因FAM129A和RNF24 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,系统性地挖掘与黏着斑相关的骨质疏松症枢纽基因,并构建了ceRNA网络、转录因子调控网络及预测模型,同时开展了药物预测和功能验证 | 未提供详细信息 | 挖掘与黏着斑相关的枢纽基因,并研究它们在骨质疏松症中的作用,为治疗和评估提供新见解 | 骨质疏松症患者和小鼠模型,重点关注骨细胞中的黏着斑相关基因 | 基因组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | 列线图(Nomogram) | 基因表达数据、临床数据 | 未提供具体样本数 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-08-13 |
Stimulator of Interferon Genes Pathway Activation through the Controlled Release of STINGel Mediates Analgesia and Anti-Cancer Effects in Oral Squamous Cell Carcinoma
2024-Apr-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12040920
PMID:38672274
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研究论文 | 本研究探讨了STINGel缓释制剂通过激活STING通路在口腔鳞状细胞癌中发挥镇痛和抗肿瘤作用的机制 | 首次发现STINGel通过调控免疫细胞群(增加M1型巨噬细胞和N1型中性粒细胞)及TGF-β信号通路,实现镇痛和抗肿瘤双重效果 | 未明确提及研究的局限性 | 研究STINGel瘤内注射对口腔鳞状细胞癌所致疼痛的影响及其细胞信号机制 | 口腔鳞状细胞癌小鼠模型及疼痛行为学测试 | 癌症免疫治疗与疼痛管理 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种OSCC模型及相应行为学测试样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 单细胞3'转录组测序 |
| 24 | 2026-08-11 |
Autophagy unrelated transcriptional mechanisms of hydroxychloroquine resistance revealed by integrated multi-omics of evolved cancer cells
2024-04, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2024.2402191
PMID:39299930
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研究论文 | 通过综合多组学分析进化癌细胞,揭示了羟氯喹耐药的非自噬转录机制 | 首次结合正向遗传筛选、反向遗传筛选、bulk RNA-seq、外显子组测序和单细胞RNA-seq,识别出羟氯喹耐药主要源于转录可塑性而非自噬或溶酶体途径 | 研究仅在两种细胞系(OVCAR3卵巢癌和CCL218结直肠癌)中进行,可能缺乏广泛代表性;未明确验证所有候选通路在体内的作用 | 探究癌细胞对羟氯喹产生耐药性的分子机制,以优化老药新用在肿瘤治疗中的应用 | OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞 | 基因组学、转录组学、药物耐药性 | 卵巢癌、结直肠癌 | bulk RNA-seq、外显子组测序、单细胞RNA-seq、CRISPR-Cas9文库筛选、活细胞成像及无细胞提取物分析 | 不适用 | 基因组、转录组、单细胞转录组、基因筛选数据 | 两种细胞系(OVCAR3和CCL218),经过15次药物脉冲-追踪(正向筛选)和3次脉冲-追踪(Cas9筛选)的进化细胞群体 | 不适用 | bulk RNA-seq、外显子组测序、单细胞RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 25 | 2026-08-09 |
Recessive variants in MYO1C as a potential novel cause of proteinuric kidney disease
2024-Apr-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4183332/v1
PMID:38659911
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研究论文 | 通过全外显子测序和纯合性定位,在肾病综合征患儿中发现MYO1C基因隐性变异是潜在的新致病原因 | 首次将MYO1C基因隐性变异与儿童肾病综合征相关联,并通过单细胞RNA测序和结构建模揭示其致病机制 | 仅发现两个无关患儿携带变异,样本量小,且缺乏功能实验验证 | 阐明肾病综合征的新型单基因病因 | 1649名肾病综合征患儿 | 基因组学 | 肾病综合征 | 全外显子测序、纯合性定位、单细胞RNA测序、结构建模 | 结构模型(PyMol) | 基因变异数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质结构数据 | 1649名患儿(其中2名携带MYO1C变异) | NA | 全外显子测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-08-08 |
Microglia and macrophages alterations in the CNS during acute SIV infection: a single-cell analysis in rhesus macaques
2024-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588047
PMID:38617282
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析急性SIV感染猕猴大脑中的小胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞的变化,揭示免疫应答和神经退行性关联 | 首次在急性SIV感染阶段对猕猴大脑中的髓系细胞进行单细胞转录组分析,识别出六种小胶质细胞亚群和两种CAM群体,并发现特定基因与神经退行性通路相关 | 样本量有限(每组仅三只猕猴),且仅分析感染后12天的时间点,可能未全面反映急性期动态变化 | 探究急性SIV感染对中枢神经系统中髓系细胞(小胶质细胞和巨噬细胞)反应的影响及其机制 | 恒河猴大脑中的髓系细胞(小胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞) | 单细胞转录组学 | HIV/SIV感染相关神经认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 6只恒河猴(3只感染SIV,3只未感染对照) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 27 | 2026-08-07 |
Pericyte signaling via soluble guanylate cyclase shapes the vascular niche and microenvironment of tumors
2024-Apr, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00078-5
PMID:38528180
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研究论文 | 本研究通过周细胞特异性敲除可溶性鸟苷酸环化酶,结合单细胞RNA测序,探讨周细胞如何影响肿瘤血管微环境及肿瘤微环境,发现其抑制肿瘤生长并增强抗血管生成疗法的效果 | 首次通过周细胞特异性敲除NO受体sGC,揭示周细胞在肿瘤血管微环境中的信号作用,并证明抑制周细胞sGC可提高肿瘤血管对常规抗血管生成治疗的敏感性 | 摘要未提及研究局限性,可能包括模型特异性及临床转化需进一步验证 | 阐明周细胞通过sGC信号调控肿瘤血管微环境及肿瘤微环境的作用,并评估靶向周细胞sGC作为抗血管生成治疗策略的潜力 | 周细胞、内皮细胞、肿瘤相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞测序 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-08-04 |
Histone 3 lysine 9 acetylation-specific reprogramming regulates esophageal squamous cell carcinoma progression and metastasis
2024-04, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00738-y
PMID:38291129
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研究论文 | 本研究通过分析食管鳞状细胞癌患者配对正常、原发肿瘤和转移淋巴结组织的H3K9ac全基因组图谱,揭示了H3K9ac特异性表观遗传重编程在肿瘤进展和转移中的作用 | 首次系统描绘了H3K9ac在食管鳞状细胞癌中的全基因组景观,并发现与H3K27ac不同的H3K9ac特异性重编程模式,且该模式与肿瘤发生和转移密切相关 | 样本量较小,仅来自三名患者;研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内功能验证 | 阐明H3K9ac乙酰化在食管鳞状细胞癌进展和转移中的具体作用及其表观遗传调控机制 | 食管鳞状细胞癌患者的配对正常组织、原发肿瘤组织和转移淋巴结组织 | 表观遗传学 | 食管鳞状细胞癌 | ChIP-seq、RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 3名食管鳞状细胞癌患者的配对组织样本(正常、肿瘤、转移淋巴结) | NA | ChIP-seq、RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-08-04 |
Schwann cell derived pleiotrophin stimulates fibroblast for proliferation and excessive collagen deposition in plexiform neurofibroma
2024-04, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00727-1
PMID:38302728
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示施万细胞来源的多效生长因子(PTN)通过PTN/NCL/PRAS40轴促进神经纤维瘤相关成纤维细胞增殖和胶原沉积的机制 | 首次在丛状神经纤维瘤中阐明施万细胞与成纤维细胞间的PTN/NCL/PRAS40信号轴作用,并通过功能实验验证其调控胶原合成的机制,为靶向治疗提供新思路 | 研究主要基于体外实验和单细胞数据,缺乏体内动物模型验证,且未涉及其他潜在信号通路或细胞类型的相互作用 | 阐明丛状神经纤维瘤中施万细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞间的分子交互机制,并探索潜在治疗靶点 | 人类丛状神经纤维瘤样本中的施万细胞和神经纤维瘤相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型相关丛状神经纤维瘤 | 单细胞RNA测序、共培养模型、重组蛋白实验、CCK8、EdU、Western Blot、ELISA、羟脯氨酸测定、磷酸化激酶阵列、siRNA | NA | 单细胞转录组数据、细胞实验数据 | 人类丛状神经纤维瘤样本(具体数量未在摘要中提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-08-01 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590125
PMID:38712088
|
研究论文 | 构建了结肠衰老过程中组织和细胞时空动态图谱,并开发了新的计算框架cSplotch以解析年龄、区域和性别相关的细胞和分子梯度 | 开发了cSplotch计算框架,利用分层贝叶斯模型和组学特征整合空间转录组和单核RNA测序数据,分析了沿结肠和隐窝轴的细胞及分子梯度,并识别了与衰老相关的多细胞程序 | 未明确提及局限性,但可能包括模型假设和样本覆盖范围的限制 | 研究结肠衰老过程中组织和细胞的时空动态变化,揭示细胞在组织水平病理中的作用 | 小鼠结肠组织,涵盖三个解剖区域和11个年龄组 | 空间转录组学、单细胞转录组学、计算生物学 | 老年性疾病 | 空间转录组学、单核RNA测序 | 分层贝叶斯模型(cSplotch) | 空间转录组数据、单核RNA测序数据、组织学图像 | 约1,500个小鼠肠道组织样本和约400,000个单核RNA-seq谱 | NA | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-07-24 |
Aortic Cellular Heterogeneity in Health and Disease: Novel Insights Into Aortic Diseases From Single-Cell RNA Transcriptomic Data Sets
2024-04, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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综述 | 通过单细胞RNA转录组数据集探讨主动脉细胞异质性在健康和疾病中的新见解 | 利用单细胞RNA测序技术揭示主动脉各细胞类型的异质性及其在健康和疾病中的生物学过程 | NA | 综述单细胞RNA测序在主动脉疾病研究中的最新进展,重点关注细胞异质性 | 主动脉疾病(如动脉粥样硬化、主动脉瘤、主动脉硬化)中的细胞类型和异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-07-05 |
Single-cell RNA sequencing of cells from fresh or frozen tissue reveals a signature of freezing marked by heightened stress and activation
2024-04, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350660
PMID:38304946
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析新鲜或冷冻组织中的细胞,发现冷冻会激活应激和活化相关基因表达 | 首次系统比较新鲜与冷冻组织单细胞RNA测序数据,揭示冷冻过程对细胞转录组的特异性影响模式 | 主要聚焦于T细胞、ILC和NK细胞亚群,其他免疫细胞类型可能具有不同冷冻敏感性 | 评估冷冻保存对单细胞RNA测序结果的影响 | 人类组织中的T细胞、固有淋巴细胞(ILC)和自然杀伤(NK)细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 33 | 2026-07-04 |
Silencing XIST on the future active X: Searching human and bovine preimplantation embryos for the repressor
2024-04, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-022-01115-9
PMID:35585273
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和qRT-PCR技术,研究人类和牛胚胎着床前XIST基因在活性X染色体上的沉默机制 | 首次在人类和牛胚胎中系统检测了XIST在活性X染色体上的表达时间,并确定了DNMT1、UHRF1、SAFB和SAFB2在XIST抑制中的潜在作用 | 仅分析了人类和牛胚胎着床前的特定阶段,未涉及其他哺乳动物或更广泛的发育时期 | 探索活性X染色体免受XIST介导失活的保护机制 | 人类和牛着床前胚胎中XIST的表达调控机制 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序、qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 人类胚胎和牛胚胎的多个发育阶段(4-8细胞期、桑椹胚期、早期囊胚期) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-07-01 |
Decoding the biology and clinical implication of neutrophils in intracranial aneurysm
2024-04, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52014
PMID:38317016
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和批量mRNA测序数据,探索颅内动脉瘤中浸润的中性粒细胞的生物学特性和临床意义 | 首次全面解析颅内动脉瘤中中性粒细胞的功能异质性和转录谱特征,揭示了中性粒细胞在动脉瘤形成和破裂中的不同亚群关联以及潜在致病机制 | 研究基于公开数据集,可能受限于样本异质性和数据来源的偏差,且缺乏直接的功能验证实验 | 探索颅内动脉瘤中中性粒细胞的功能异质性和临床意义,为未来治疗提供依据 | 颅内动脉瘤中浸润的中性粒细胞 | 机器学习 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠颅内动脉瘤样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-06-30 |
Space-feature measures on meshes for mapping spatial transcriptomics
2024-04, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2023.103068
PMID:38176357
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研究论文 | 本文提出了空间-特征测量LDDMM算法,用于将空间转录组数据映射到标准图谱的共同坐标系中 | 首次开发了用于计算微分同胚空间中测地线的空间-特征测量LDDMM算法,扩展了LDDMM算法家族,实现了跨模态的转录组数据与标准图谱的对齐 | 未在文中明确提及 | 实现分子和细胞尺度的空间转录组数据与组织尺度标准图谱的整合对齐 | 小鼠大脑的空间转录组数据 | 计算机视觉 | NA | MERFISH | LDDMM | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | MERFISH | MERFISH显微成像技术 |
| 36 | 2026-06-26 |
Single-Cell Analysis Reveals a Subset of High IL-12p40-Secreting Dendritic Cells within Mouse Bone Marrow-Derived Macrophages Differentiated with M-CSF
2024-04-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300431
PMID:38416039
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现,M-CSF分化的小鼠骨髓源性巨噬细胞(BMDM)中有一小群细胞高分泌IL-12p40,并证实这群细胞具有树突状细胞(DC)特征 | 首次通过分泌分析和单细胞RNA测序揭示M-CSF分化的BMDM中存在一个高表达Il12b的DC样亚群,该亚群在LPS刺激下表现出独特的DC激活程序,不同于BMDM的随机细胞异质性 | 未能在静息状态下通过表面标志物分离该DC样亚群,且研究仅限于体外小鼠模型 | 探究M-CSF分化的骨髓源性巨噬细胞在IL-12产生中的细胞异质性及其与树突状细胞的关系 | 小鼠骨髓源性巨噬细胞及树突状细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序, 分泌分析, 流式细胞术, 报告基因小鼠 | NA | 基因表达数据, 分泌数据 | 小鼠骨髓源性巨噬细胞培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-06-26 |
IDO1 Inhibition Promotes Activation of Tumor-intrinsic STAT3 Pathway and Induces Adverse Tumor-protective Effects
2024-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300545
PMID:38391297
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IDO1抑制剂激活肿瘤内在STAT3通路并导致不利肿瘤保护效应的机制 | 首次利用单细胞RNA测序全面分析IDO1抑制剂对肿瘤微环境的影响,发现其同时激活免疫细胞和诱导M2巨噬细胞浸润及IL-6/JAK2/STAT3通路的意外副作用 | 未明确提及,可能包括实验模型仅涉及小鼠结肠癌细胞系及单一抑制剂类型 | 探究IDO1抑制剂临床失败原因,揭示其对肿瘤微环境的整体影响 | 小鼠结肠癌CT26细胞移植的BALB/C小鼠肿瘤微环境 | 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | BALB/C小鼠移植CT26结肠癌模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-06-20 |
Integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data reveal the significant role of macrophages in lupus nephritis
2024-04-12, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03311-y
PMID:38610007
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研究论文 | 通过整合单细胞及批量转录组数据,揭示巨噬细胞在狼疮肾炎中的重要作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据分析狼疮肾炎中巨噬细胞的表型转变(从炎症巡逻型到吞噬型再到抗原提呈型),并发现LGALS9基因在巨噬细胞中的显著上调及其促炎作用,为治疗提供潜在靶点 | 仅基于公共数据集中LN样本与正常肾组织的转录组数据,且LGALS9功能研究仅限于THP-1细胞系,未在体内动物模型中验证 | 识别狼疮肾炎中异常的免疫细胞组分和信号通路,寻找潜在治疗靶点 | 狼疮肾炎组织样本和正常肾组织 | 数字病理学 | 狼疮肾炎 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 慢病毒介导过表达 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 狼疮肾炎组织样本与正常肾组织(具体数量未在摘要中说明) | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-06-19 |
Epigenetic dysregulation in Alzheimer's disease peripheral immunity
2024-04-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.013
PMID:38340719
|
研究论文 | 利用单细胞测序方法探究阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传和转录变化 | 首次揭示了阿尔茨海默病外周免疫细胞中开放染色质的显著变化,并发现了新的AD特异性RELA转录因子结合位点和与散发性AD风险相关的差异可及染色质区域 | 未提及具体限制 | 探究阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传和转录改变 | 阿尔茨海默病患者的外周免疫细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序,转座酶可及染色质分析,RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-06-19 |
Mechanisms of sex differences in Alzheimer's disease
2024-04-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.024
PMID:38402606
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病中性别差异的机制,探讨了女性患病风险更高的生物学原因 | 综合单细胞RNA测序、代谢组学和多组学分析等先进技术,系统阐述了性激素和性染色体与炎症、代谢及自噬等疾病机制的相互作用 | 未提及具体的研究设计或实验验证,仅基于已有文献总结 | 阐明阿尔茨海默病中性别差异的潜在生物学机制 | 阿尔茨海默病中的男性和女性患者 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,代谢组学,多组学分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |