单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-12-02 |
Fibroblast expression of neurotransmitter receptor HTR2A associates with inflammation in rheumatoid arthritis joint
2024-Apr-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-024-01352-w
PMID:38662111
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研究论文 | 研究神经递质受体HTR2A在类风湿性关节炎（RA）中的表达及其与炎症的关系 | 首次探讨了HTR2A在RA中的表达及其与炎症的关系，并发现miRNAs在调节HTR2A表达中的作用 | 研究主要基于scRNA-seq数据和免疫组化验证，样本量有限，需要进一步的大规模验证 | 探讨神经递质受体HTR2A在RA中的表达及其与炎症的关系，寻找潜在的治疗策略 | 类风湿性关节炎（RA）和骨关节炎（OA）患者的滑膜组织和滑液中的细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化染色、qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫组化图像 | RA和OA患者的滑膜组织样本，以及RA患者滑液中的外泌体样本 |
| 22 | 2024-12-01 |
A Systematic Overview of Single-Cell Transcriptomics Databases, their Use cases, and Limitations
2024-Apr-15, ArXiv
PMID:38699169
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综述 | 本文系统地概述了单细胞转录组学数据库、其应用案例和局限性 | 本文提出了通过用户友好的基于网络的平台来弥合计算科学家和湿实验室科学家之间的差距，以促进跨学科研究 | 本文讨论了构建大规模单细胞RNA测序数据库的技术和方法学挑战 | 本文旨在探讨单细胞RNA测序数据库的利用和局限性，以促进有效利用这些数据进行稳健的发现和识别新的生物学见解 | 本文研究了大规模单细胞RNA测序数据库，并根据其范围和目的进行了分类 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | NA |
| 23 | 2024-11-29 |
Single-Cell Analysis of Rohon-Beard Neurons Implicates Fgf Signaling in Axon Maintenance and Cell Survival
2024-Apr-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1600-23.2024
PMID:38423763
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究斑马鱼幼体阶段的Rohon-Beard感觉神经元，揭示了Fgf信号通路在轴突维持和细胞存活中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术定义了斑马鱼幼体Rohon-Beard神经元的三个主要亚型，并发现Fgf信号通路在维持轴突和细胞存活中的关键作用 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，尚未在哺乳动物中验证结果 | 探讨Rohon-Beard神经元的分子亚型及其在轴突维持和细胞存活中的调控机制 | 斑马鱼幼体阶段的Rohon-Beard感觉神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼幼体阶段的Rohon-Beard神经元 |
| 24 | 2024-11-27 |
To be or not to be - Decoding the Trabecular Meshwork Cell Identity
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.591346
PMID:38746421
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序比较人小梁网细胞培养与组织，探讨细胞身份和可翻译性 | 首次报道了通过单细胞RNA测序比较人小梁网细胞培养与组织的研究方法 | 研究结果从细胞培养到组织研究的翻译仍存在挑战 | 探讨小梁网细胞的身份及其在组织中的可翻译性 | 人小梁网细胞培养与组织 | NA | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 共14个初级人小梁网样本，包括4个青光眼患者样本 |
| 25 | 2024-11-26 |
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA-sequencing
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.23.589797
PMID:38712294
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研究论文 | 本文介绍了一种用于视网膜单细胞RNA测序的样本多重化方法 | 提出了使用胆固醇修饰寡核苷酸进行样本多重化的方法，以提高单细胞RNA测序分析的精度 | NA | 研究视网膜神经节细胞的细胞类型分布和转录组变异 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠视网膜样本 |
| 26 | 2024-11-26 |
Extracellular cancer‑associated fibroblasts: A novel subgroup in the cervical cancer microenvironment that exhibits tumor‑promoting roles and prognosis biomarker functions
2024-Apr, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2024.14300
PMID:38449793
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析宫颈癌微环境中CAF的异质性，并发现了一种新的亚群ecCAFs，具有促肿瘤作用和预后生物标志物功能 | 首次通过单细胞RNA测序将宫颈癌微环境中的CAF分为myCAFs和ecCAFs，并发现ecCAFs具有更强的促肿瘤作用 | 研究样本量较小，仅基于五个宫颈癌样本进行分析 | 评估宫颈癌微环境中CAF的异质性，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 宫颈癌微环境中的CAF及其在肿瘤进展中的作用 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 五个宫颈癌样本 |
| 27 | 2024-11-24 |
The neuroendocrine transition in prostate cancer is dynamic and dependent on ASCL1
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.09.588557
PMID:38645223
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研究论文 | 研究描述了前列腺癌中神经内分泌转变的动态过程及其依赖于ASCL1的分子机制 | 开发了一个多功能平台，用于识别和研究前列腺癌进展不同阶段神经内分泌谱系转化的分子决定因素 | 研究主要集中在小鼠模型和特定基因的缺失上，可能不完全适用于人类疾病 | 揭示前列腺癌中神经内分泌谱系转化的分子机制及其对治疗结果的影响 | 前列腺癌中的神经内分泌转变及其分子机制 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 多重免疫荧光、空间转录组学、PrismSpot | NA | 基因表达数据 | 小鼠前列腺器官样本 |
| 28 | 2024-11-21 |
RNA splicing analysis deciphers developmental hierarchies and reveals therapeutic targets in adult glioma
2024-Apr-25, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173789
PMID:38662454
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研究论文 | 本文通过计算方法分析了成人胶质瘤中的RNA可变剪接（AS），揭示了与神经发育层次相关的预后AS特征，并探讨了其治疗潜力 | 本文首次揭示了AS特征与神经发育层次的关联，并验证了PTBP1作为AS特征的关键调控因子，为胶质瘤治疗提供了新的靶点 | 本文主要依赖于计算分析和体外模型验证，尚未在临床样本中进行全面验证 | 探讨成人胶质瘤中RNA可变剪接的调控机制及其在治疗中的潜在应用 | 成人胶质瘤中的RNA可变剪接及其调控因子 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及大量和单细胞RNA测序数据，具体样本数量未明确提及 |
| 29 | 2024-11-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular landscape of fetal cystic hygroma
2024-04-22, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01859-x
PMID:38650036
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组测序技术揭示了胎儿囊性水囊瘤的细胞和分子景观 | 首次报道了胎儿囊性水囊瘤中单细胞的转录组变化，并揭示了淋巴内皮细胞在其中的富集以及VEGF信号通路的激活 | 本研究仅限于CH患者的淋巴组织，未涵盖其他可能的相关组织或细胞类型 | 探讨胎儿囊性水囊瘤的分子机制，特别是细胞亚群的转录组特征和VEGF信号通路的作用 | 胎儿囊性水囊瘤患者的淋巴组织 | 数字病理学 | 胎儿疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | CH患者和对照捐赠者的淋巴组织样本 |
| 30 | 2024-11-21 |
Revealing Prdx4 as a potential diagnostic and therapeutic target for acute pancreatitis based on machine learning analysis
2024-04-19, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01854-2
PMID:38641608
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研究论文 | 本研究通过机器学习分析揭示了Prdx4作为急性胰腺炎的潜在诊断和治疗靶点 | 首次使用LASSO和SVM-RFE机器学习方法筛选出Prdx4作为急性胰腺炎的潜在生物标志物，并通过免疫组织化学和重组Prdx4治疗验证了其治疗潜力 | 研究样本量较小，且仅限于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探索急性胰腺炎的关键基因，以实现有效的诊断和治疗 | 急性胰腺炎及其相关基因Prdx4 | 机器学习 | 急性胰腺炎 | LASSO, SVM-RFE, ssGSEA, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 1357个差异表达基因, 小鼠胰腺组织样本 |
| 31 | 2024-08-07 |
2024-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.534
PMID:38585235
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研究论文 | 本研究通过诱导实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）模型，探讨了视网膜小胶质细胞在疾病发展中的动态变化及其在调节免疫反应中的作用 | 首次在EAU模型中识别出一种新的炎症亚型视网膜小胶质细胞，并揭示了CD74和CCL5在调节其炎症表型中的作用 | NA | 探讨自身免疫性葡萄膜炎发病机制及寻找潜在治疗策略 | 视网膜免疫细胞及小胶质细胞的动态变化 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 在EAU小鼠模型中，对四个时间点的视网膜免疫细胞进行了单细胞RNA测序 |
| 32 | 2024-11-17 |
Osimertinib in combination with anti-angiogenesis therapy presents a promising option for osimertinib-resistant non-small cell lung cancer
2024-04-24, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03389-w
PMID:38658988
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研究论文 | 本文探讨了奥希替尼联合抗血管生成疗法在奥希替尼耐药的非小细胞肺癌患者中的应用 | 提出了奥希替尼联合抗血管生成疗法作为奥希替尼耐药非小细胞肺癌的新治疗策略 | 研究为回顾性研究，且样本量有限 | 探讨奥希替尼联合抗血管生成疗法在奥希替尼耐药非小细胞肺癌患者中的疗效 | 奥希替尼耐药的非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 111例晚期非小细胞肺癌患者 |
| 33 | 2024-11-13 |
High-Dimensional Single-Cell Multimodal Landscape of Human Carotid Atherosclerosis
2024-04, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320524
PMID:38385291
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研究论文 | 研究通过单细胞多模态分析揭示了人类颈动脉粥样硬化的细胞组成和特征 | 首次全面描述了颈动脉粥样硬化病变中细胞的转录组和表型景观，并开发了用于分离病变中细胞的流式细胞术面板 | NA | 深入了解颈动脉粥样硬化病变中细胞的全面转录组和表型景观 | 颈动脉粥样硬化病变中的细胞类型及其与临床病理生理学的关联 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 21个样本（其中13个有症状） |
| 34 | 2024-11-10 |
High throughput functional profiling of genes at intraocular pressure loci reveals distinct networks for glaucoma
2024-04-18, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae003
PMID:38272457
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研究论文 | 研究通过基因敲除和高通量功能分析，揭示了与青光眼相关基因的网络 | 首次在单细胞水平上通过高通量分析研究了基因敲除对眼内压相关基因的影响，并识别出三个具有相似转录组特征的基因网络 | 研究仅限于特定的细胞系和基因敲除，可能无法完全代表所有青光眼病例 | 旨在识别与原发性开角型青光眼相关的遗传和形态变异 | 原发性开角型青光眼相关的基因和细胞形态 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像和基因表达数据 | 62个基因在55个位点的敲除，包括五个非靶向对照组 |
| 35 | 2024-11-09 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.10.588953
PMID:38645099
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研究论文 | 本文研究了人类特异性增强子在调节神经前体细胞增殖和神经发生能力以及皮质发育中的作用 | 揭示了人类特异性加速区域（HARs）作为关键调控元件在人类大脑皮质扩展和复杂性中的新功能 | NA | 探讨人类特异性增强子在皮质发育中的功能及其对神经前体细胞行为的影响 | 人类特异性增强子、神经前体细胞、皮质发育 | NA | NA | 基因编辑、活体成像、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、图像数据 | 基因编辑的小鼠和灵长类模型、人类和黑猩猩的神经前体细胞及皮质类器官 |
| 36 | 2024-11-08 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-Apr, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在多物种和多发育阶段中研究健康和受损心脏的发现，并提出了一种多物种、多组学的元分析框架，以推动心血管再生新靶点的发现 | 提出了一个多物种、多组学的元分析框架，以推动心血管再生新靶点的发现 | NA | 推动心血管再生新靶点的发现 | 健康和受损心脏的细胞转录组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组 | 多物种和多发育阶段的样本 |
| 37 | 2024-11-08 |
Histone modification-linked prognostic model for ovarian cancer reveals LBX2 as a novel growth promoter
2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18260
PMID:38520216
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白修饰相关基因在卵巢癌患者预后预测中的作用 | 构建了基于组蛋白修饰相关基因的风险评分模型，并发现LBX2作为卵巢癌的新型生长促进因子 | NA | 研究组蛋白修饰相关基因在卵巢癌预后预测中的作用 | 卵巢癌患者的预后预测 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | Lasso回归 | 转录组数据 | 多个队列的bulk RNA-Seq数据和单细胞scRNA-Seq数据 |
| 38 | 2024-11-08 |
Prognostic and immunotherapeutic potential of regulatory T cell-associated signature in ovarian cancer
2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18248
PMID:38520220
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研究论文 | 本文研究了卵巢癌中调节性T细胞相关基因的预后和免疫治疗潜力 | 利用单细胞RNA测序和机器学习算法，开发了一种新的调节性T细胞相关签名（TAS），用于预测卵巢癌患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 探讨调节性T细胞在卵巢癌中的预后和免疫治疗潜力 | 卵巢癌患者的调节性T细胞相关基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林（RSF）和最小绝对收缩与选择算子（LASSO） | 基因表达数据 | 365个调节性T细胞相关基因，其中70个与卵巢癌预后相关 |
| 39 | 2024-11-08 |
Construction of a prognostic model with CAFs for predicting the prognosis and immunotherapeutic response of lung squamous cell carcinoma
2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18262
PMID:38520221
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研究论文 | 构建基于癌症相关成纤维细胞（CAFs）的预测模型，用于预测肺鳞状细胞癌（LUSC）的预后和免疫治疗反应 | 首次基于单细胞RNA测序数据对CAFs进行分类，并开发了一个具有显著预后相关性的预测模型，用于预测LUSC的预后和免疫治疗反应 | NA | 开发一个预测模型，用于评估肺鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 肺鳞状细胞癌（LUSC）患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | NA |
| 40 | 2024-11-07 |
Deciphering the regulatory landscape of murine splenic response to anemic stress at single-cell resolution
2024-04-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023011965
PMID:38315834
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研究论文 | 研究了小鼠脾脏在贫血压力下的单细胞分辨率调控景观 | 发现了早期红系前体细胞在贫血压力下的显著出现，并识别出一种新的标记物CD81用于标记红细胞岛中的中心巨噬细胞 | NA | 探索贫血压力下红系前体细胞的分子机制 | 小鼠脾脏组织中的红系前体细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从接受苯肼和连续放血的小鼠中分离的脾脏组织样本 |