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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Revealing the role of necroptosis microenvironment: FCGBP + tumor-associated macrophages drive primary liver cancer differentiation towards cHCC-CCA or iCCA
2024-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01908-3
PMID:38017206
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了FCGBP+肿瘤相关巨噬细胞通过调控坏死性凋亡微环境驱动原发性肝癌向cHCC-CCA或iCCA分化的机制 | 首次识别FCGBP+SPP1+肿瘤相关巨噬细胞是调控坏死性凋亡微环境的关键细胞,并发现S100A6在癌前细胞向iCCA和cHCC-CCA进展中的重要作用 | 样本量较小(34个单细胞样本和3个空间转录组样本),主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探究坏死性凋亡微环境在原发性肝癌分化中的作用机制 | 原发性肝癌患者组织样本,包括HCC、iCCA和cHCC-CCA | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 免疫组织化学 | Seurat, monocle2, AUCell, geneSwitches, SpaCET, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 34个单细胞样本(4例HCC患者和3例iCCA患者),3个空间转录组样本(各1例HCC、iCCA和cHCC-CCA) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Apoptosis-related prognostic biomarkers and potential targets for acute kidney injury based on machine learning algorithm and in vivo experiments
2024-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01896-4
PMID:37789227
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法和体内实验识别了三个与细胞凋亡相关的急性肾损伤诊断生物标志物 | 首次结合WGCNA、差异表达分析和机器学习算法鉴定出CBFB、EGF和COL1A1三个核心凋亡相关基因作为AKI诊断标志物,并构建了诊断模型 | 研究样本来源和数量未明确说明,诊断模型需要在更大临床样本中进一步验证 | 开发急性肾损伤的精确诊断生物标志物和治疗方法 | 急性肾损伤患者和AKI小鼠模型 | 机器学习 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,差异表达分析,逻辑回归分析,CIBERSORT免疫浸润分析 | 逻辑回归,ROC曲线分析 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Cross-modality mapping using image varifolds to align tissue-scale atlases to molecular-scale measures with application to 2D brain sections
2024-Apr-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47883-4
PMID:38664422
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研究论文 | 开发了一种使用图像变差形式将组织尺度图谱与分子尺度测量对齐的跨模态映射方法 | 提出将空间转录组数据表示为编码位置和高维特征(基因、细胞类型)身份的广义函数,通过LDDMM同时求解坐标的最小化测地线微分同胚和潜在特征密度 | NA | 建立分子尺度转录组学与组织尺度图谱之间的对应关系 | 小鼠脑图谱、基因和细胞转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | LDDMM | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | MERFISH, BARseq | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Respiratory viral infection promotes the awakening and outgrowth of dormant metastatic breast cancer cells in lungs
2024-Apr-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4210090/v1
PMID:38645169
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研究论文 | 本研究揭示呼吸道病毒感染通过IL-6依赖机制唤醒肺内休眠乳腺癌细胞并促进转移灶形成 | 首次证实呼吸道病毒可通过改变肿瘤微环境唤醒休眠癌细胞,并发现CD4 T细胞在维持转移负荷中的新作用 | 主要基于小鼠模型,人类观察数据仅为相关性证据 | 探究呼吸道病毒感染对休眠乳腺癌细胞激活和转移的影响机制 | 小鼠模型中的休眠乳腺癌细胞和人类癌症幸存者 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床观察数据 | 小鼠实验模型及人类癌症幸存者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
ScRNA-seq reveals novel immune-suppressive T cells and investigates CMV-TCR-T cells cytotoxicity against GBM
2024-04-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008967
PMID:38688579
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质母细胞瘤中新型免疫抑制性T细胞,并开发靶向CMV的TCR-T细胞疗法 | 首次在CMV感染的胶质母细胞瘤中发现双阳性CD68+SOX2+肿瘤相关巨噬细胞和FXYD6+ T细胞两种新型免疫细胞亚群,并证实FXYD6+ T细胞是一类新型免疫抑制性T细胞 | NA | 探究巨细胞病毒感染对胶质母细胞瘤免疫微环境的影响,并开发靶向CMV的TCR-T细胞疗法 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织、CMV感染的胶质母细胞瘤免疫微环境 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR/BCR测序,免疫电镜,免疫荧光,微滴数字PCR,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Dysregulation of CD4+ and CD8+ resident memory T, myeloid, and stromal cells in steroid-experienced, checkpoint inhibitor colitis
2024-04-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008628
PMID:38642938
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析免疫检查点抑制剂相关结肠炎的细胞机制,重点关注类固醇治疗患者的免疫细胞和基质细胞变化 | 首次在类固醇治疗过的免疫检查点抑制剂结肠炎患者中系统分析CD4+和CD8+组织驻留记忆T细胞、髓系细胞和基质细胞的失调机制 | 样本主要来自类固醇治疗过的患者,可能影响对疾病原始机制的解读 | 阐明免疫检查点抑制剂相关结肠炎的发病机制,特别是在类固醇治疗背景下的细胞变化 | 免疫检查点抑制剂相关结肠炎患者的结肠活检组织和血液样本 | 单细胞组学 | 免疫相关结肠炎 | 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 主要来自类固醇治疗过的免疫检查点抑制剂结肠炎患者的结肠活检和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Supermultipotency and unpredictability in the developing superior colliculus
2024-04, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2024.03.001
PMID:38514350
|
研究论文 | 通过谱系追踪与单细胞RNA测序技术研究上丘发育过程中祖细胞的多能性和定位模式 | 发现上丘发育过程中存在极端多能性的单个祖细胞,能够生成所有类型的神经元和胶质细胞,且细胞定位呈现非预定模式 | NA | 探索上丘发育过程中祖细胞的分化潜能和细胞定位规律 | 发育中的上丘组织 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
The Extracellular Niche and Tumor Microenvironment Enhance KRAS Inhibitor Efficacy in Pancreatic Cancer
2024-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2504
PMID:38294344
|
研究论文 | 本研究评估KRASG12D抑制剂MRTX1133在胰腺癌治疗中的疗效,并发现细胞外微环境和肿瘤微环境可增强其治疗效果 | 发现ITGB1可作为增强KRAS抑制剂疗效的靶点,揭示3D培养和体内模型中疗效更佳,首次证明KRAS抑制通过调节免疫微环境引发肿瘤消退 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 评估KRAS抑制剂在胰腺癌治疗中的疗效及作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞系、患者来源异种移植模型、同系肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | CRISPR-Cas9筛选、数字空间分析、单细胞测序、多光谱成像 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞测序数据 | PDAC细胞系面板、患者来源异种移植模型、同系肿瘤模型 | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Osteosarcoma Cells Secrete CXCL14 That Activates Integrin α11β1 on Fibroblasts to Form a Lung Metastatic Niche
2024-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1307
PMID:38295227
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤细胞通过分泌CXCL14激活成纤维细胞整合素α11β1形成肺转移生态位的机制 | 首次发现CXCL14通过激活成纤维细胞整合素α11β1促进肺转移生态位形成,并证明靶向该轴可抑制转移 | 研究主要关注初治骨肉瘤样本,未涉及治疗后或复发样本 | 探究骨肉瘤肺转移生态位的形成机制及潜在治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、成纤维细胞、肺转移生态位 | 单细胞生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
NFĸB signaling drives myocardial injury via CCR2+ macrophages in a preclinical model of arrhythmogenic cardiomyopathy
2024-Apr-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172014
PMID:38564300
|
研究论文 | 本研究通过遗传学方法和单细胞RNA测序揭示了NFκB信号在致心律失常性心肌病中通过CCR2+巨噬细胞驱动心肌损伤的机制 | 首次证明心肌细胞中NFκB信号通过招募CCR2+巨噬细胞介导心肌损伤和心律失常,并揭示了心脏细胞间的免疫调节串扰 | 研究基于小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明致心律失常性心肌病中免疫信号在心肌细胞和巨噬细胞中的贡献机制 | Dsg2mut/mut小鼠模型(致心律失常性心肌病模型) | 单细胞组学 | 致心律失常性心肌病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, CITE-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
CNS Resident Innate Immune Cells: Guardians of CNS Homeostasis
2024-Apr-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094865
PMID:38732082
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综述 | 本文聚焦中枢神经系统常驻先天免疫细胞在维持稳态及参与神经炎症和神经退行性疾病中的作用 | 利用单细胞RNA测序等先进技术区分了常驻与浸润免疫细胞,特别是边界相关巨噬细胞的表型谱系 | NA | 探讨中枢神经系统常驻先天免疫细胞在生理稳态和病理状态下的功能 | 中枢神经系统实质和非实质组织(脑膜、血管周隙、脉络丛)中的常驻免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,多参数流式细胞术,质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多参数流式细胞术,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Multi-omics and immunogenomics analysis revealed PFKFB3 as a targetable hallmark and mediates sunitinib resistance in papillary renal cell carcinoma: in silico study with laboratory verification
2024-Apr-15, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01808-5
PMID:38622715
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研究论文 | 通过多组学和免疫基因组学分析揭示PFKFB3作为乳头状肾细胞癌的可靶向特征并介导舒尼替尼耐药性 | 构建了糖酵解-免疫预后指数(GIRPI)特征,首次发现PFKFB3在pRCC中的关键调控作用及其介导舒尼替尼耐药的机制 | 主要为计算机模拟研究,实验室验证有限,需要更多临床样本验证 | 阐明糖酵解特征在乳头状肾细胞癌中的调控功能及治疗抵抗机制 | 乳头状肾细胞癌细胞系和患者数据 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | WGCNA, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, siRNA, 细胞增殖和迁移实验 | 糖酵解-免疫预后指数(GIRPI)模型 | 基因组数据, 转录组数据, 实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
A Path to Persistence after EGFR Inhibition
2024-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0274
PMID:38616658
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研究论文 | 本研究通过患者来源异种移植模型和单细胞RNA测序,揭示了EGFR突变非小细胞肺癌对奥希替尼产生耐受性的机制 | 首次发现神经内分泌谱系转录因子ASCL1介导的药物耐受持久细胞转录簇,并揭示其通过触发上皮-间质转化程序促进药物耐受 | 表型可塑性机制尚未完全阐明,缺乏体内持久性模型 | 研究EGFR突变非小细胞肺癌对酪氨酸激酶抑制剂产生耐受性的分子机制 | EGFR突变非小细胞肺癌患者来源异种移植模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Identification of the role of DAB2 and CXCL8 in uterine spiral artery remodeling in early-onset preeclampsia
2024-Apr-13, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05212-4
PMID:38613672
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现DAB2和CXCL8在早发型子痫前期子宫螺旋动脉重塑中的关键作用 | 首次在单细胞水平揭示DAB2通过CXCL8/PI3K/AKT通路调控绒毛外滋养细胞与蜕膜血管平滑肌细胞间的通讯机制 | 研究主要基于体外细胞模型和胎盘-蜕膜共培养模型,需要进一步体内实验验证 | 探究早发型子痫前期中子宫螺旋动脉异常重塑的分子机制 | 早发型子痫前期患者和对照组的胎盘组织、HTR-8/SVneo细胞、人血管平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序、细胞培养、胎盘-蜕膜共培养模型 | 细胞模型、共培养模型 | 单细胞RNA测序数据、细胞表型数据 | 早发型子痫前期患者和对照组胎盘组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Single cell lineage tracing reveals clonal dynamics of anti-EGFR therapy resistance in triple negative breast cancer
2024-04-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01327-2
PMID:38605363
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研究论文 | 通过单细胞谱系追踪揭示三阴性乳腺癌对抗EGFR治疗耐药性的克隆动态 | 整合细胞条形码和单细胞转录组学重建EGFR扩增TNBC细胞的亚克隆动态,发现罕见的预存耐药亚群 | NA | 阐明三阴性乳腺癌对EGFR靶向治疗反应不一致的机制 | EGFR扩增的三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序, 细胞条形码, 深度学习 | 深度学习 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Sorafenib inhibits ossification of the posterior longitudinal ligament by blocking LOXL2-mediated vascularization
2024-Apr-10, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00327-7
PMID:38594260
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示后纵韧带骨化的分子机制,发现LOXL2通过HIF1A通路调控韧带细胞的内皮样分化,并证实索拉非尼可有效抑制LOXL2介导的血管生成从而阻断骨化进程 | 首次在单细胞分辨率阐明OPLL的细胞演化过程,发现韧带干细胞具有内皮细胞样表型转化能力,并鉴定LOXL2为非酶活性依赖的新型调控因子 | 动物模型结果向临床转化的有效性仍需验证,LOXL2具体作用机制细节需进一步阐明 | 探索后纵韧带骨化的分子机制并寻找潜在治疗策略 | 后纵韧带组织样本、韧带干细胞、动物模型 | 单细胞生物学 | 后纵韧带骨化 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 临床样本和动物模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Drug repositioning for immunotherapy in breast cancer using single-cell analysis
2024-Apr-08, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00359-z
PMID:38589404
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荟萃分析 | 本研究通过单细胞分析探索乳腺癌免疫治疗中的药物重定位策略 | 整合单细胞RNA测序数据与药物重定位方法,提出针对免疫调节肽的精准调控策略 | NA | 开发针对乳腺癌的免疫治疗新策略 | 人类乳腺上皮细胞(恶性与正常) | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 蛋白质水平检测 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Itraconazole inhibits tumor growth via CEBPB-mediated glycolysis in colorectal cancer
2024-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16082
PMID:38278779
|
研究论文 | 本研究揭示抗真菌药物伊曲康唑通过CEBPB介导的糖酵解途径抑制结直肠癌肿瘤生长 | 首次发现伊曲康唑通过CEBPB-ENO1轴调控糖酵解抑制结直肠癌生长,并鉴定CEBPB为伊曲康唑的新靶点 | 研究样本量较小(仅4只小鼠),临床验证数据有限 | 探究伊曲康唑对结直肠癌的抗肿瘤作用机制 | 结直肠癌细胞系、荷瘤小鼠模型和临床患者样本 | 癌症代谢研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、靶向类器官测序 | 细胞系来源异种移植模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 4只小鼠肿瘤样本(治疗组与对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Calcified apoptotic vesicles from PROCR+ fibroblasts initiate heterotopic ossification
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12425
PMID:38594791
|
研究论文 | 本研究首次发现PROCR+成纤维细胞分泌的钙化凋亡囊泡是异位骨化的起始因子 | 首次鉴定钙化凋亡囊泡作为异位骨化的起始因子,并阐明其通过钙富集和胶原结合导致肌腱钙化硬化的机制 | NA | 探究异位骨化的起始因素及其分子机制 | 异位骨化过程中的细胞群体和细胞外基质 | 单细胞转录组学 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Space-feature measures on meshes for mapping spatial transcriptomics
2024-Apr, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2023.103068
PMID:38176357
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研究论文 | 提出空间特征测度LDDMM算法,用于将空间转录组数据映射到标准图谱的通用坐标系中 | 首次在微分同胚空间中计算测地线的算法系列,扩展了LDDMM算法家族以处理带标记粒子的空间特征作用 | NA | 开发空间转录组数据的跨模态配准算法,实现分子和细胞尺度种群在通用坐标系中的统计平均 | 小鼠脑部空间转录组数据 | 计算解剖学 | NA | MERFISH, 空间转录组学 | LDDMM, 空间特征测度LDDMM | 空间基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 自动化显微镜 | MERFISH | NA |