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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Osteosarcoma Cells Secrete CXCL14 That Activates Integrin α11β1 on Fibroblasts to Form a Lung Metastatic Niche
2024-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1307
PMID:38295227
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤细胞通过分泌CXCL14激活成纤维细胞整合素α11β1形成肺转移生态位的机制 | 首次发现CXCL14通过激活成纤维细胞整合素α11β1促进肺转移生态位形成,并证明靶向该轴可抑制转移 | 研究主要关注初治骨肉瘤样本,未涉及治疗后或复发样本 | 探究骨肉瘤肺转移生态位的形成机制及潜在治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、成纤维细胞、肺转移生态位 | 单细胞生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
NFĸB signaling drives myocardial injury via CCR2+ macrophages in a preclinical model of arrhythmogenic cardiomyopathy
2024-Apr-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172014
PMID:38564300
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研究论文 | 本研究通过遗传学方法和单细胞RNA测序揭示了NFκB信号在致心律失常性心肌病中通过CCR2+巨噬细胞驱动心肌损伤的机制 | 首次证明心肌细胞中NFκB信号通过招募CCR2+巨噬细胞介导心肌损伤和心律失常,并揭示了心脏细胞间的免疫调节串扰 | 研究基于小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明致心律失常性心肌病中免疫信号在心肌细胞和巨噬细胞中的贡献机制 | Dsg2mut/mut小鼠模型(致心律失常性心肌病模型) | 单细胞组学 | 致心律失常性心肌病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, CITE-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
CNS Resident Innate Immune Cells: Guardians of CNS Homeostasis
2024-Apr-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094865
PMID:38732082
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综述 | 本文聚焦中枢神经系统常驻先天免疫细胞在维持稳态及参与神经炎症和神经退行性疾病中的作用 | 利用单细胞RNA测序等先进技术区分了常驻与浸润免疫细胞,特别是边界相关巨噬细胞的表型谱系 | NA | 探讨中枢神经系统常驻先天免疫细胞在生理稳态和病理状态下的功能 | 中枢神经系统实质和非实质组织(脑膜、血管周隙、脉络丛)中的常驻免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,多参数流式细胞术,质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多参数流式细胞术,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Multi-omics and immunogenomics analysis revealed PFKFB3 as a targetable hallmark and mediates sunitinib resistance in papillary renal cell carcinoma: in silico study with laboratory verification
2024-Apr-15, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01808-5
PMID:38622715
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研究论文 | 通过多组学和免疫基因组学分析揭示PFKFB3作为乳头状肾细胞癌的可靶向特征并介导舒尼替尼耐药性 | 构建了糖酵解-免疫预后指数(GIRPI)特征,首次发现PFKFB3在pRCC中的关键调控作用及其介导舒尼替尼耐药的机制 | 主要为计算机模拟研究,实验室验证有限,需要更多临床样本验证 | 阐明糖酵解特征在乳头状肾细胞癌中的调控功能及治疗抵抗机制 | 乳头状肾细胞癌细胞系和患者数据 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | WGCNA, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, siRNA, 细胞增殖和迁移实验 | 糖酵解-免疫预后指数(GIRPI)模型 | 基因组数据, 转录组数据, 实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
A Path to Persistence after EGFR Inhibition
2024-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0274
PMID:38616658
|
研究论文 | 本研究通过患者来源异种移植模型和单细胞RNA测序,揭示了EGFR突变非小细胞肺癌对奥希替尼产生耐受性的机制 | 首次发现神经内分泌谱系转录因子ASCL1介导的药物耐受持久细胞转录簇,并揭示其通过触发上皮-间质转化程序促进药物耐受 | 表型可塑性机制尚未完全阐明,缺乏体内持久性模型 | 研究EGFR突变非小细胞肺癌对酪氨酸激酶抑制剂产生耐受性的分子机制 | EGFR突变非小细胞肺癌患者来源异种移植模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Identification of the role of DAB2 and CXCL8 in uterine spiral artery remodeling in early-onset preeclampsia
2024-Apr-13, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05212-4
PMID:38613672
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现DAB2和CXCL8在早发型子痫前期子宫螺旋动脉重塑中的关键作用 | 首次在单细胞水平揭示DAB2通过CXCL8/PI3K/AKT通路调控绒毛外滋养细胞与蜕膜血管平滑肌细胞间的通讯机制 | 研究主要基于体外细胞模型和胎盘-蜕膜共培养模型,需要进一步体内实验验证 | 探究早发型子痫前期中子宫螺旋动脉异常重塑的分子机制 | 早发型子痫前期患者和对照组的胎盘组织、HTR-8/SVneo细胞、人血管平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序、细胞培养、胎盘-蜕膜共培养模型 | 细胞模型、共培养模型 | 单细胞RNA测序数据、细胞表型数据 | 早发型子痫前期患者和对照组胎盘组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Single cell lineage tracing reveals clonal dynamics of anti-EGFR therapy resistance in triple negative breast cancer
2024-04-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01327-2
PMID:38605363
|
研究论文 | 通过单细胞谱系追踪揭示三阴性乳腺癌对抗EGFR治疗耐药性的克隆动态 | 整合细胞条形码和单细胞转录组学重建EGFR扩增TNBC细胞的亚克隆动态,发现罕见的预存耐药亚群 | NA | 阐明三阴性乳腺癌对EGFR靶向治疗反应不一致的机制 | EGFR扩增的三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序, 细胞条形码, 深度学习 | 深度学习 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Sorafenib inhibits ossification of the posterior longitudinal ligament by blocking LOXL2-mediated vascularization
2024-Apr-10, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00327-7
PMID:38594260
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示后纵韧带骨化的分子机制,发现LOXL2通过HIF1A通路调控韧带细胞的内皮样分化,并证实索拉非尼可有效抑制LOXL2介导的血管生成从而阻断骨化进程 | 首次在单细胞分辨率阐明OPLL的细胞演化过程,发现韧带干细胞具有内皮细胞样表型转化能力,并鉴定LOXL2为非酶活性依赖的新型调控因子 | 动物模型结果向临床转化的有效性仍需验证,LOXL2具体作用机制细节需进一步阐明 | 探索后纵韧带骨化的分子机制并寻找潜在治疗策略 | 后纵韧带组织样本、韧带干细胞、动物模型 | 单细胞生物学 | 后纵韧带骨化 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 临床样本和动物模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Drug repositioning for immunotherapy in breast cancer using single-cell analysis
2024-Apr-08, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00359-z
PMID:38589404
|
荟萃分析 | 本研究通过单细胞分析探索乳腺癌免疫治疗中的药物重定位策略 | 整合单细胞RNA测序数据与药物重定位方法,提出针对免疫调节肽的精准调控策略 | NA | 开发针对乳腺癌的免疫治疗新策略 | 人类乳腺上皮细胞(恶性与正常) | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 蛋白质水平检测 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Itraconazole inhibits tumor growth via CEBPB-mediated glycolysis in colorectal cancer
2024-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16082
PMID:38278779
|
研究论文 | 本研究揭示抗真菌药物伊曲康唑通过CEBPB介导的糖酵解途径抑制结直肠癌肿瘤生长 | 首次发现伊曲康唑通过CEBPB-ENO1轴调控糖酵解抑制结直肠癌生长,并鉴定CEBPB为伊曲康唑的新靶点 | 研究样本量较小(仅4只小鼠),临床验证数据有限 | 探究伊曲康唑对结直肠癌的抗肿瘤作用机制 | 结直肠癌细胞系、荷瘤小鼠模型和临床患者样本 | 癌症代谢研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、靶向类器官测序 | 细胞系来源异种移植模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 4只小鼠肿瘤样本(治疗组与对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Calcified apoptotic vesicles from PROCR+ fibroblasts initiate heterotopic ossification
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12425
PMID:38594791
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研究论文 | 本研究首次发现PROCR+成纤维细胞分泌的钙化凋亡囊泡是异位骨化的起始因子 | 首次鉴定钙化凋亡囊泡作为异位骨化的起始因子,并阐明其通过钙富集和胶原结合导致肌腱钙化硬化的机制 | NA | 探究异位骨化的起始因素及其分子机制 | 异位骨化过程中的细胞群体和细胞外基质 | 单细胞转录组学 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Space-feature measures on meshes for mapping spatial transcriptomics
2024-Apr, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2023.103068
PMID:38176357
|
研究论文 | 提出空间特征测度LDDMM算法,用于将空间转录组数据映射到标准图谱的通用坐标系中 | 首次在微分同胚空间中计算测地线的算法系列,扩展了LDDMM算法家族以处理带标记粒子的空间特征作用 | NA | 开发空间转录组数据的跨模态配准算法,实现分子和细胞尺度种群在通用坐标系中的统计平均 | 小鼠脑部空间转录组数据 | 计算解剖学 | NA | MERFISH, 空间转录组学 | LDDMM, 空间特征测度LDDMM | 空间基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 自动化显微镜 | MERFISH | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Comparative single-cell RNA sequencing analysis of immune response to inactivated vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2024-04, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29577
PMID:38572977
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较分析灭活疫苗与自然SARS-CoV-2感染引起的免疫反应差异 | 首次对灭活疫苗和自然感染进行系统性单细胞RNA测序比较分析,揭示了IL-15RA/IL-15受体通路在疫苗加强免疫中的选择性激活作用 | 样本量相对有限(12名疫苗接种者),仅分析了外周血单核细胞 | 比较灭活SARS-CoV-2疫苗与自然感染引起的免疫反应差异 | 12名接种灭活疫苗的个体和COVID-19患者的外周血单核细胞 | 单细胞基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名疫苗接种者和COVID-19患者的系列PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Immune features revealed by single-cell RNA and single-cell TCR/BCR sequencing in patients with rheumatoid arthritis receiving COVID-19 booster vaccination
2024-04, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29573
PMID:38566569
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研究论文 | 通过单细胞RNA和TCR/BCR测序揭示类风湿关节炎患者接种COVID-19加强疫苗后的免疫特征 | 首次在RA患者中结合单细胞RNA测序和单细胞TCR/BCR测序分析COVID-19加强疫苗的免疫反应 | 样本量较小,仅观察了疫苗接种前后两个时间点 | 研究COVID-19加强疫苗对类风湿关节炎患者免疫细胞亚群和免疫反应的影响 | 稳定期类风湿关节炎患者 | 单细胞测序分析 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR/BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫受体序列数据 | 配对的外周血单个核细胞样本(接种前1周和接种后4周) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫组库测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
High-throughput RNA isoform sequencing using programmed cDNA concatenation
2024-Apr, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01815-7
PMID:37291427
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研究论文 | 介绍了一种通过程序化cDNA串联实现高通量RNA异构体测序的新方法MAS-ISO-seq | 通过程序化串联cDNA分子,将长读长测序通量提高15倍以上,单次运行可获得近4000万条cDNA读长 | NA | 开发高通量全长RNA异构体测序技术 | 肿瘤浸润T细胞的转录组 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,长读长测序 | NA | RNA序列数据 | NA | PacBio | 长读长测序,单细胞RNA测序 | Sequel IIe | PacBio Sequel IIe测序仪 |
| 36 | 2025-10-06 |
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: molecular features and clinical significance
2024-04-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01779-3
PMID:38570490
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综述 | 本文系统回顾了乳腺导管原位癌向浸润性乳腺癌进展的分子特征、研究工具及临床管理进展 | 全面整合DCIS向IDC转化的分子机制,系统总结单细胞测序、空间转录组学等新技术在研究中的应用 | 作为综述文章,未包含原始研究数据,主要基于现有文献进行归纳分析 | 深入理解DCIS的生物学特性及其向IDC转化的分子路径,为临床个性化治疗提供依据 | 乳腺导管原位癌(DCIS)和浸润性导管癌(IDC) | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞测序,空间转录组学,人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Autophagy unrelated transcriptional mechanisms of hydroxychloroquine resistance revealed by integrated multi-omics of evolved cancer cells
2024-Apr, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2024.2402191
PMID:39299930
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示癌细胞对羟氯喹耐药的自噬无关转录机制 | 发现羟氯喹耐药主要通过转录可塑性而非自噬途径实现,识别了糖酵解、外泌作用和染色体凝聚/分离等新耐药机制 | 研究仅使用OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞两种细胞系,样本规模有限 | 探究癌细胞对羟氯喹耐药的分子机制 | OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞 | 多组学分析 | 卵巢癌,结直肠癌 | 全基因组筛选,正向遗传筛选,反向遗传筛选,CRISPR-Cas9,RNA-seq,外显子组测序,单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据 | 两种癌细胞系,经过15次药物脉冲追踪处理 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,外显子组测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Marmosets contain multitudes
2024-Apr-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97866
PMID:38661001
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示狨猴携带来自其兄弟姐妹的遗传差异细胞的程度 | 利用单细胞RNA测序技术首次在狨猴中量化了来自兄弟姐妹的遗传嵌合细胞 | NA | 研究狨猴体内遗传嵌合现象 | 狨猴细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Stimulator of Interferon Genes Pathway Activation through the Controlled Release of STINGel Mediates Analgesia and Anti-Cancer Effects in Oral Squamous Cell Carcinoma
2024-Apr-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12040920
PMID:38672274
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研究论文 | 本研究开发了STINGel缓释制剂,通过激活干扰素基因刺激因子通路,在口腔鳞状细胞癌模型中同时实现镇痛和抗癌效果 | 开发了延长STING激动剂可用时间的缓释制剂STINGel,首次系统研究其在口腔鳞癌疼痛管理中的作用机制 | 研究局限于动物模型,尚未进行临床试验验证 | 研究STINGel缓释制剂对口腔鳞状细胞癌疼痛的镇痛作用及其机制 | 口腔鳞状细胞癌动物模型 | 癌症研究 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,行为学检测 | NA | 基因表达数据,行为学数据 | 两种口腔鳞癌模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
BuDDI: BulkDeconvolution withDomainInvariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2024-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.20.549951
PMID:37503097
|
研究论文 | 提出BuDDI方法,通过域适应技术整合单细胞和批量RNA-seq数据来预测细胞类型特异性扰动效应 | 使用变分自编码器学习四个独立潜在空间,能够模拟细胞类型特异性扰动响应,无需单细胞扰动数据训练 | NA | 开发从批量数据推断细胞类型特异性扰动效应的方法 | 单细胞RNA-seq数据和批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |