单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 492 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
Partial label learning for automated classification of single-cell transcriptomic profiles
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012006
PMID:38578796
|
研究论文 | 本文研究了如何利用部分标签学习框架自动分类单细胞转录组数据，并探讨了标签集结构的整合效果 | 提出了利用部分标签学习框架，而不是完全监督的训练数据集，来分类单细胞转录组数据 | 文章未明确提及具体的局限性 | 旨在解决单细胞转录组数据的自动分类问题 | 单细胞转录组数据的分类及其细胞谱系关系的识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNASeq） | SVM, kNN, 基于原型的方法, 逻辑回归, 集成方法 | 转录组数据 | 文章未提供具体的样本数量 |
| 362 | 2024-08-07 |
Calcified apoptotic vesicles from PROCR+ fibroblasts initiate heterotopic ossification
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12425
PMID:38594791
|
研究论文 | 本文研究了异位骨化（HO）的异常形成过程，发现钙化的凋亡小体（apoVs）是HO的启动因子。 | 首次识别出PROCR+成纤维细胞分泌的钙化凋亡小体作为HO的启动因子，并提出其可能作为抑制病理性钙化的治疗靶点。 | NA | 探讨异位骨化的启动因子及其治疗靶点。 | 异位骨化过程中的钙化凋亡小体及其作用机制。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 不同阶段的异位骨化样本 |
| 363 | 2024-08-07 |
Cell Heterogeneity Analysis Revealed the Key Role of Fibroblasts in the Magnum Regression of Ducks
2024-Apr-01, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14071072
PMID:38612311
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了鸭子输卵管中段（magnum）在产蛋和停产后细胞异质性的变化 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了鸭子输卵管中段在产蛋和停产后细胞异质性的差异，特别是涉及蛋白质分泌和细胞外基质（ECM）产生的成纤维细胞的变化 | 研究仅限于特定年龄的鸭子，且样本数量有限，可能需要进一步扩大样本范围以验证结果的普遍性 | 探究鸭子输卵管中段在产蛋和停产后分子机制的差异 | 鸭子输卵管中段的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 13,708个单细胞样本 |
| 364 | 2024-08-07 |
Integration analysis of single-cell transcriptome reveals specific monocyte subsets associated with melanoma brain and leptomeningeal metastasis
2024-Apr, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.13710
PMID:38616506
|
研究论文 | 本研究通过整合分析单细胞转录组数据，揭示了与黑色素瘤脑和软脑膜转移相关的特定单核细胞亚群 | 本研究首次详细分析了黑色素瘤脑转移和软脑膜转移中单核细胞亚群的组成和分子表达差异，并发现了与转移相关的特定单核细胞亚群 | NA | 阐明黑色素瘤中枢神经系统转移的病理机制，为开发针对单核细胞或细胞因子的治疗策略提供依据 | 黑色素瘤脑转移和软脑膜转移中的单核细胞亚群 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 涉及血液、原发肿瘤、脑转移和软脑膜转移组织中的单核细胞 |
| 365 | 2024-08-04 |
[Current status and prospects of genetic research on IgA nephropathy]
2024-Apr-23, Zhonghua yi xue za zhi
|
评论 | 本文讨论了IgA肾病的遗传研究现状和前景 | 提出了基因组医学时代如何通过全基因组测序和多组学研究寻找IgA肾病的易感基因及靶向药物的见解 | 仅讨论了目前的研究进展，未提供新的实验数据或结果 | 探讨IgA肾病的遗传因素及其在发病机制中的作用 | IgA肾病相关的易感基因和临床表型 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序（WGS），单细胞测序，表达数量性性状位点（eQTL） | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-04 |
Evaluation of McCauley et al.: A framework for systematic evaluation of tissue signaling responses by single-cell RNA-seq
2024-Apr-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.03.007
PMID:38636454
|
评论 | 对McCauley等人论文的同行评审过程的单次快照 | 开发了一个系统性评估组织信号响应的框架 | 没有提供关于具体实验数据或结果的详细信息 | 评估组织信号反应的系统性方法 | 人类气道上皮中的信号反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-04 |
Multi-pronged analysis of pediatric low-grade glioma reveals a unique tumor microenvironment associated with BRAF alterations
2024-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588294
PMID:38645202
|
研究论文 | 本研究通过多种方法分析了小儿低级别胶质瘤的肿瘤微环境 | 揭示了与BRAF变异相关的独特肿瘤微环境和免疫细胞异质性 | 尚需进一步研究免疫细胞浸润和肿瘤-免疫相互作用 | 加深对小儿低级别胶质瘤生物学的理解，以识别新型、更有效且毒性较小的治疗方法 | 小儿低级别胶质瘤及其肿瘤微环境的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 细胞, RNA | 小儿低级别胶质瘤样本 |
| 368 | 2024-08-07 |
Decoding the biology and clinical implication of neutrophils in intracranial aneurysm
2024-Apr, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52014
PMID:38317016
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和外部批量mRNA测序数据，深入探讨了侵入颅内动脉瘤（IA）壁的中性粒细胞的特征和功能异质性 | 首次详细描述了中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和潜在临床意义，揭示了中性粒细胞在IA形成和破裂中的不同亚群及其作用机制 | NA | 阐明中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和临床意义 | 中性粒细胞在颅内动脉瘤中的功能和临床意义 | NA | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA测序数据 | 涉及人和小鼠模型的数据集 |
| 369 | 2024-08-04 |
Set7 Methyltransferase and Phenotypic Switch in Diabetic Glomerular Endothelial Cells
2024-Apr-17, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000345
PMID:38630537
|
研究论文 | 本研究探讨了Set7甲基转移酶在糖尿病肾病（DKD）中对肾小管内皮细胞功能的影响 | 揭示了Set7在糖尿病肾小管内皮细胞表型转变中的调控作用，并表明靶向Set7可能保护肾小管细胞损伤 | 本研究主要在小鼠模型中进行，未来需要更多人类样本的验证 | 研究Set7在糖尿病肾病中对内皮细胞功能的作用 | 以糖尿病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA-seq | 小鼠模型和人类肾脏细胞 |
| 370 | 2024-08-07 |
Dynamic Hippo pathway activity underlies mesenchymal differentiation during lung alveolar morphogenesis
2024-Apr-05, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202430
PMID:38602485
|
研究论文 | 研究探讨了Hippo信号通路在肺泡形态发生中调节次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）功能的动态变化 | 首次揭示了Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF功能、增殖和时间身份的调节作用 | NA | 研究Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF的调节作用 | 次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）及其在肺泡形态发生中的作用 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 从报告鼠中纯化的SCMF细胞 |
| 371 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of pediatric renal tissues revealed the potential relationship between immunoglobulin A nephropathy and immunoglobulin A vasculitis with nephritis
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1651
PMID:38591641
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-07 |
Treatment resistance in pancreatic and biliary tract cancer: molecular and clinical pharmacology perspectives
2024-Apr, Expert review of clinical pharmacology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/17512433.2024.2319340
PMID:38413373
|
研究论文 | 本文综述了胆道癌和胰腺癌治疗抵抗的分子和临床药理学视角，探讨了当前治疗方案及其抵抗机制，并提出了克服这些障碍的策略。 | 本文提出了通过个性化患者方法和人工智能应用来指导有效治疗策略的新思路。 | 目前尚未形成统一的治疗抵抗理论，进展有限。 | 旨在识别和克服胆道癌和胰腺癌治疗抵抗的分子机制，以改善患者治疗效果。 | 胆道癌和胰腺癌的治疗抵抗机制及其克服策略。 | NA | 胆道癌、胰腺癌 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-07 |
Irisin delays the onset of type 1 diabetes in NOD mice by enhancing intestinal barrier
2024-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.130857
PMID:38493812
|
研究论文 | 本研究探讨了irisin激素通过增强结肠肠屏障功能来延缓1型糖尿病（T1D）在NOD小鼠中的发病 | 首次揭示了irisin通过调节AMPK/PI3K/AKT通路和增加MUC3表达来增强结肠肠屏障功能，从而延缓T1D的发病 | NA | 研究irisin是否能通过增强结肠肠屏障来延缓T1D的发病 | 1型糖尿病（T1D）患者和非肥胖糖尿病（NOD）小鼠 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 374 | 2024-08-07 |
Cell Type- and Age-Specific Expression of lncRNAs across Kidney Cell Types
2024-Apr-15, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000354
PMID:38621182
|
研究论文 | 本研究采用靶向单细胞RNA测序方法，分析了不同细胞类型和年龄阶段肾脏细胞中长非编码RNA（lncRNA）的表达情况 | 首次构建了不同细胞类型中lncRNA的转录组图谱，并探讨了lncRNA在肾脏老化中的功能角色 | lncRNA的功能仍不完全清楚，需要进一步的研究来阐明其在细胞分化和稳态中的具体作用 | 揭示lncRNA在肾脏细胞类型和年龄特异性表达中的作用 | 肾脏细胞中的长非编码RNA（lncRNA） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括正常和老龄小鼠的多种组织 |
| 375 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing of virus-specific cellular immune responses in chronic hepatitis B patients
2024-Apr-08, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03187-2
PMID:38589415
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究慢性乙型肝炎患者的HBV特异性细胞免疫反应 | 创建了HBV免疫反应的单细胞RNA测序数据集，有助于更好地理解失调的免疫反应 | NA | 探索慢性乙型肝炎患者中HBV特异性T细胞反应的转录变化 | 慢性乙型肝炎患者和健康对照者的血液及肝脏组织样本 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 21名慢性乙型肝炎患者和10名健康对照者的血液样本，以及5份匹配的肝脏活检样本 |
| 376 | 2024-08-04 |
Histone 3 lysine 9 acetylation-specific reprogramming regulates esophageal squamous cell carcinoma progression and metastasis
2024-Apr, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00738-y
PMID:38291129
|
研究论文 | 本研究探讨了H3K9ac在食道鳞状细胞癌（ESCC）进展和转移中的特定作用 | 识别了ESCC中H3K9ac特异性的表观遗传重编程及其与肿瘤发生和转移的关系 | 仅分析了三个ESCC患者的样本，样本量较小 | 揭示H3K9ac在食道鳞状细胞癌进展和转移中的作用 | 食道鳞状细胞癌（ESCC）患者的配对正常组织、原发肿瘤和转移淋巴结组织 | 数字病理 | 食道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 3名食道鳞状细胞癌患者的配对样本 |
| 377 | 2024-08-07 |
Granzyme K- and amphiregulin-expressing cytotoxic T cells and activated extrafollicular B cells are potential drivers of IgG4-related disease
2024-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.11.916
PMID:38092138
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体及B细胞受体测序，全面、无偏倚地观察了IgG4相关疾病中组织浸润的T细胞和B细胞 | 首次揭示了Granzyme K和amphiregulin表达的细胞毒性T细胞及激活的外滤泡B细胞在IgG4相关疾病中的潜在驱动作用 | NA | 探索IgG4相关疾病中组织浸润的T细胞和B细胞的全面、无偏倚的视图 | IgG4相关疾病患者的组织浸润T细胞和B细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 68名IgG4相关疾病患者和30名Sjögren综合征患者 |
| 378 | 2024-08-07 |
Melanoma Derived Exosomes Amplify Radiotherapy Induced Abscopal Effect via IRF7/I-IFN Axis in Macrophages
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304991
PMID:38286661
|
研究论文 | 本研究通过构建携带肿瘤的小鼠模型，探讨了放射治疗（RT）诱导的肿瘤微环境（TME）变化及其对肿瘤远处效应的影响机制 | 首次揭示了肿瘤来源的外泌体通过circPIK3R3/miR-872-3p/IRF7轴促进I型干扰素分泌，增强CD8 T细胞的抗肿瘤免疫反应 | NA | 探究放射治疗诱导的肿瘤远处效应的详细机制 | 肿瘤微环境（TME）及其对肿瘤远处效应的影响 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、荧光原位杂交（FISH） | NA | RNA | 携带肿瘤的小鼠模型 |
| 379 | 2024-08-07 |
Deep Imputation Bi-stochastic Graph Regularized Matrix Factorization for Clustering Single-cell RNA-sequencing Data
2024-Apr-12, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3387911
PMID:38607719
|
research paper | 本文提出了一种新的方法DSINMF，通过深度矩阵分解对单细胞RNA测序数据进行聚类 | DSINMF方法包括特征选择、缺失值插补、降维和深度矩阵分解与双随机图正则化四个步骤，以提高聚类效果 | NA | 探索细胞异质性和功能，辅助识别疾病机制和生物标志物 | 单细胞RNA测序数据 | digital pathology | NA | RNA-seq | CNN | 基因转录组数据 | 九个数据集 |
| 380 | 2024-08-07 |
A specific enterotype derived from gut microbiome of older individuals enables favorable responses to immune checkpoint blockade therapy
2024-Apr-10, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.03.002
PMID:38513657
|
研究论文 | 本研究探讨了老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法的增强敏感性现象，并通过元分析和单细胞RNA测序数据揭示了其潜在机制，特别是与肠道微生物群相关的特定肠型。 | 识别了一种与老年患者免疫疗法效果改善相关的特定肠型，并通过小鼠实验证实了其治疗潜力。 | NA | 探索老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法增强敏感性的机制，并寻找个性化癌症免疫疗法的新途径。 | 老年癌症患者的肠道微生物群及其对免疫疗法的影响。 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 25个中小型试验 |