单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 490 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome atlas in C57BL/6 mice encodes morphological phenotypes in the aging kidneys
2024-Apr-19, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03514-0
PMID:38641839
|
研究论文 | 本研究提供了C57BL/6小鼠在不同发育阶段的肾脏形态和单细胞转录组图谱的综合数据。 | 提供了关于C57BL/6小鼠肾脏在整个发育阶段的详细形态学和单细胞转录组参考标准，有助于生物研究的进一步扩展。 | 缺乏对其他小鼠品系或其它管理条件下的肾脏形态及转录组的比较研究。 | 探究C57BL/6小鼠肾脏在不同发育阶段的形态变化及其单细胞转录组。 | C57BL/6小鼠的肾脏在胚胎到老化过程中的各个阶段。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 肾脏组织数据 | 8组，每组5-6只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-05 |
Membrane to cortex attachment determines different mechanical phenotypes in LGR5+ and LGR5- colorectal cancer cells
2024-Apr-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47227-2
PMID:38637494
|
研究论文 | 本文研究了LGR5+和LGR5-结直肠癌细胞在机械性状上的差异 | 揭示了LGR5+细胞与LGR5-细胞在机械属性上的显著差异及其对转移的潜在影响 | 对不同细胞群体在转移过程中的具体机制尚未深入探讨 | 探讨结直肠癌细胞群体的机械性状如何影响其转移能力 | 分析LGR5+和LGR5-结直肠癌细胞的机械性能和生物学特性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | 来自患者队列的结直肠癌源性类器官样本 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-08-05 |
Establishment of a cholangiocarcinoma risk evaluation model based on mucin expression levels
2024-Apr-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i4.1344
PMID:38660669
|
研究论文 | 本研究建立了一个基于粘蛋白表达水平的胆管癌风险评估模型 | 首次系统性探讨了粘蛋白在胆管癌进展及预后中的作用，建立了风险评估公式 | 尚未完全理解粘蛋白家族如何影响胆管癌的进展和预后 | 研究粘蛋白在胆管癌进展中的作用并建立风险评估模型 | 14个胆管癌样本的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，免疫组化 | LASSO回归 | RNA数据 | 14个胆管癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-05 |
Identification of receptors and factors associated with human coronaviruses in the oral cavity using single-cell RNA sequencing
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28280
PMID:38560173
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了与人类冠状病毒在口腔中相关的受体和因素 | 本研究整合了多个口腔组织的单细胞RNA测序数据，识别了特定细胞簇及SARS-CoV-2和与冠状病毒相关的受体的表达模式 | SCARFs在其他口腔部位的表达模式相对复杂，可能仅与SARS-CoV-2感染特定相关 | 探究四种人类冠状病毒在口腔中的感染机制和靶细胞特征 | 本研究对象为七种人类口腔组织中的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 七种人类口腔组织的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-04 |
Spatial motifs reveal patterns in cellular architecture of complex tissues
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588586
PMID:38645046
|
研究论文 | 空间组织对保证组织的生理功能和癌症等病理状态至关重要 | 提出了一种新方法，通过空间邻域图检测细胞类型的空间模式 | 未提及该方法在其他组织类型或更复杂条件下的适用性 | 旨在识别细胞类型之间的更高阶关联，以理解复杂组织的发育和功能 | 主要研究小鼠视网膜双极细胞和下丘脑前视区域的空间图谱 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 合成数据和空间图谱 | 使用合成数据进行验证，具体样本量未知 | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-05 |
Predictive and Prognostic Biomarkers in Patients With Mycosis Fungoides and Sézary Syndrome (BIO-MUSE): Protocol for a Translational Study
2024-Apr-04, JMIR research protocols
IF:1.4Q3
DOI:10.2196/55723
PMID:38436589
|
研究论文 | 本研究旨在识别与真菌病和塞扎里综合症患者相关的预后生物标志物 | 首次综合分析血液和皮肤中的免疫细胞及微生物环境，以发现潜在的新预后生物标志物 | 由于样本数量尚少，可能影响研究结果的普遍适用性和统计学意义 | 识别与真菌病和塞扎里综合症相关的预后生物标志物 | 真菌病和塞扎里综合症患者的血液和皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，数字空间分析 | NA | 血液和皮肤样本 | 正在招募120名真菌病或塞扎里综合症的成年患者以及20名健康志愿者 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-05 |
Circulating immune cell landscape and T-cell abnormalities in patients with moyamoya disease
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1647
PMID:38566524
|
研究论文 | 本研究揭示了与 moya moya 病相关的循环免疫细胞景观和 T 细胞异常 | 首次全面描绘了 moya moya 病患者的循环免疫细胞的变化及其潜在的免疫失调机制 | 缺乏对其他人群或地域的比较分析，可能限制研究结果的广泛适用性 | 探讨 moya moya 病患者中循环免疫细胞及 T 细胞的变化 | 监测 moya moya 病患者与年龄匹配的健康对照之间的外周血免疫细胞特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序、质谱细胞计数、RNA 测序 | NA | 外周血样本 | 来源于 moya moya 病患者和健康对照的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-04 |
NIFK, a Potential Prognostic and Immunological Biomarker in Pan-- Cancer Analysis, Significantly Regulates Proliferation and Metastasis of Colorectal Cancer
2024-Apr-24, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 该研究系统分析了NIFK在全癌种中的表达及其在结直肠癌中的作用 | 揭示了NIFK在大多数肿瘤中过表达，并显示出显著的预后效能和与免疫特征的相关性 | 目前缺乏对NIFK在其他癌种的系统分析，如在非结直肠癌中的具体作用 | 探讨NIFK作为潜在预后和免疫生物标志物在癌症中的作用 | 研究NIFK在多种癌症中表达、突变及其在结直肠腺癌中的免疫特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 通过TCGA进行的大规模分析，具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-07 |
Identification of CNKSR1 as a biomarker for "cold" tumor microenvironment in lung adenocarcinoma: An integrative analysis based on a novel workflow
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29126
PMID:38628722
|
研究论文 | 本研究通过综合分析，将CNKSR1鉴定为免疫冷型肺腺癌的新型潜在生物标志物，并探讨了其在调节T细胞浸润中的作用。 | 本研究开发了一种新的策略来识别针对免疫冷肿瘤的抗PD1/PD-L1免疫治疗局限性的有希望的生物标志物，并首次将CNKSR1鉴定为免疫冷型肺腺癌的生物标志物。 | NA | 旨在识别对PD1/PD-L1免疫治疗无反应的肺腺癌患者的新型生物标志物，以扩大治疗选择。 | 肺腺癌（LUAD）患者的RNA-seq数据和临床样本。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA-seq | 机器学习方法 | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌RNA-seq数据，并在三个独立的bulk数据集和一个scRNA-seq数据集中进行了验证。 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-04 |
scMoresDB: A comprehensive database of single-cell multi-omics data for human respiratory system
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109567
PMID:38617561
|
研究论文 | 本研究介绍了一个针对人类呼吸系统的单细胞多组学数据库平台 scMoresDB | scMoresDB 提供了一个用户友好的界面，具有跨组学搜索能力和交互式可视化工具 | NA | 创建一个方便的数据共享和综合分析的平台，专注于人类呼吸系统的单细胞多组学数据 | 人类呼吸系统相关的单细胞多组学数据 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-04 |
[Dynamic trajectory and cell communication of different cell clusters in malignant progression of glioblastoma]
2024-Apr-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:38595234
|
研究论文 | 本研究深入探讨了胶质母细胞瘤恶性进展过程中的细胞亚群以及免疫细胞亚群之间的通信网络 | 该研究结合单细胞测序和临床信息，提供了对胶质母细胞瘤动态演变及潜在生物标志物的新见解 | 本研究未提及样本的地区或具体实验方法的局限性 | 探讨胶质母细胞瘤恶性进展中的细胞动态和识别关键风险生物标志物 | 胶质母细胞瘤患者的细胞亚群及免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 27,151个细胞，包括低级别胶质瘤患者的3,881个细胞、新诊断胶质母细胞瘤患者的10,166个细胞以及复发胶质瘤患者的13,104个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-04 |
Spatial and single-cell explorations uncover prognostic significance and immunological functions of mitochondrial calcium uniporter in breast cancer
2024-Apr-17, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03327-z
PMID:38632642
|
研究论文 | 本研究探讨了线粒体钙单元蛋白（MCU）在乳腺癌中的预后意义和免疫功能 | 本研究首次将MCU作为乳腺癌的独立诊断生物标志物，并揭示其与临床状态和总体生存率的相关性 | 该研究的限制在于基于公共数据集，需进一步验证多个独立样本 | 研究MCU在乳腺癌临床病理、肿瘤免疫微环境及精准肿瘤学中的潜在作用 | 分析乳腺癌患者样本中MCU的表达与临床病理特征及预后的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因数据和生物信息学数据 | 59名乳腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-04 |
High-altitude hypoxia exposure inhibits erythrophagocytosis by inducing macrophage ferroptosis in the spleen
2024-Apr-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87496
PMID:38629942
|
研究论文 | 该研究探讨了高海拔缺氧通过诱导脾脏巨噬细胞铁死亡抑制红细胞吞噬作用的机制 | 揭示了高海拔缺氧导致脾脏巨噬细胞铁死亡进而影响红细胞清除的机制 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能无法完全反映人类的情况 | 研究高海拔多血症的机制及其影响 | 小鼠模型和体外脾脏巨噬细胞 | 数字病理学 | 高海拔多血症 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 生物样本 | 小鼠和人类外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-07 |
Characterization of gene regulatory networks underlying key properties in human hematopoietic stem cell ontogeny
2024-Apr-17, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-024-00192-z
PMID:38630195
|
研究论文 | 本研究分析了不同发育阶段人源造血干细胞/祖细胞（HSPCs）的单细胞转录组，并生成了与造血干细胞关键特性相关的高度共调控基因调控网络（GRNs）模块。 | 首次识别了控制淋巴潜能、自我更新及有氧呼吸等关键特性的基因调控网络和关键调控因子，并展示了这些调控因子在体外促进造血干细胞功能的能力。 | NA | 揭示造血干细胞发育过程中特性变化的内在机制，并为体外生成功能齐全的造血干细胞提供指导。 | 人源造血干细胞/祖细胞（HSPCs）在不同发育阶段的单细胞转录组。 | 基因调控 | NA | 单细胞转录组分析 | 基因调控网络（GRNs） | 转录组数据 | 包括卵黄囊（YS）、AGM、胎肝（FL）、脐带血（UCB）和成人外周血动员的HSPCs等多个发育阶段的样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-08-07 |
Improvement of immune dysregulation in individuals with long COVID at 24-months following SARS-CoV-2 infection
2024-Apr-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47720-8
PMID:38632311
|
研究论文 | 本研究探讨了轻至中度长期COVID（LC）患者与年龄和性别匹配的恢复期COVID-19对照组（MC）在24个月内的体液和细胞免疫反应及与健康相关的生活质量指标 | 发现LC参与者在3个月时IgG水平升高，中和能力增强，以及特定CD4 T细胞和PD-1、TIM-3表达增加，但这些差异在24个月时不持续 | 研究仅关注了特定免疫标志物和细胞类型，未全面评估所有免疫相关指标 | 研究长期COVID患者的免疫反应及其与健康相关的生活质量随时间的变化 | 长期COVID患者和恢复期COVID-19患者的免疫反应和生活质量 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞数据 | LC和MC参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq data to construct and validate a cancer-associated fibroblast-related prognostic signature for patients with ovarian cancer
2024-Apr-16, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01399-z
PMID:38627854
|
研究论文 | 建立了基于癌症相关成纤维细胞的卵巢癌预后风险特征 | 开发了一种基于CAF的风险特征，可以准确预测卵巢癌患者的预后 | NA | 基于癌症相关成纤维细胞建立卵巢癌患者的预后风险轮廓 | 卵巢癌患者的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-07 |
Pan-cancer transcriptional atlas of minimal residual disease links DUSP1 to chemotherapy persistence
2024-Apr-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00509-3
PMID:38627863
|
研究论文 | 本研究首次全面分析了多种癌症类型中的最小残留病（MRD），并揭示了DUSP1基因在MRD中的重要作用 | 首次全面分析了跨多种癌症类型的MRD，并发现了DUSP1基因在MRD中的广泛和显著富集 | NA | 全面理解化疗引起的改变，并识别预防和消除MRD的潜在靶点 | 多种癌症类型的最小残留病（MRD） | 数字病理学 | 泛癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包括大量和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals activation of endothelial cell and identifies LHPP as a potential target in ulcerative colitis
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29163
PMID:38601522
|
研究论文 | 本研究探讨了单细胞转录组学在溃疡性结肠炎中的应用，并识别LHPP作为潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示LHPP在溃疡性结肠炎中表达的显著下调及其与STAT3表达水平的反向相关 | 本研究没有涉及LHPP在溃疡性结肠炎患者治疗中实际应用的实验验证 | 研究溃疡性结肠炎病理中的细胞动态和分子机制 | 从溃疡性结肠炎患者中分析的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 研究涉及的样本数量和类型未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-08-04 |
Cathepsin L promotes oesophageal squamous cell carcinoma development and may be associated with tumour-associated macrophages
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29273
PMID:38601581
|
研究论文 | 这篇文章探讨了Cathepsin L（CTSL）在食管鳞状细胞癌（ESCC）发展中的作用及其与肿瘤相关巨噬细胞的关系 | 本研究首次揭示了CTSL与食管鳞状细胞癌的关系，并确认其在免疫微环境中的重要性，特别是与M2型巨噬细胞的相互作用 | 尚未明确CTSL作为肿瘤基因在食管鳞状细胞癌中的确切机制 | 探索CTSL在食管鳞状细胞癌发展中的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 研究对象包括CTSL表达与食管鳞状细胞癌的相关性及其在不同细胞类型中的表现 | 数字病理学 | 食管癌 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据，生物信息数据 | 使用了多种数据来源，如GEO，TCGA和GEPIA的数据，具体样本数量未注明 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-08-04 |
Exploring the immune-inflammatory mechanism of Maxing Shigan Decoction in treating influenza virus A-induced pneumonia based on an integrated strategy of single-cell transcriptomics and systems biology
2024-Apr-15, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01777-9
PMID:38622728
|
研究论文 | 本文探讨了麻杏石甘汤在治疗流感病毒A诱导的肺炎中的免疫-炎症机制 | 研究首次结合单细胞转录组学和系统生物学方法，揭示了麻杏石甘汤的作用机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，临床应用需要进一步验证 | 探究麻杏石甘汤对流感A病毒肺炎的免疫-炎症作用机制 | 以流感A病毒肺炎小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 流感肺炎 | 转录组学、实时荧光定量PCR（RT-PCR）、肠道微生物组和代谢组学 | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 小鼠模型数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |