单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 497 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-04 |
Evaluation of McCauley et al.: A framework for systematic evaluation of tissue signaling responses by single-cell RNA-seq
2024-Apr-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.03.007
PMID:38636454
|
评论 | 对McCauley等人论文的同行评审过程的单次快照 | 开发了一个系统性评估组织信号响应的框架 | 没有提供关于具体实验数据或结果的详细信息 | 评估组织信号反应的系统性方法 | 人类气道上皮中的信号反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-04 |
Multi-pronged analysis of pediatric low-grade glioma reveals a unique tumor microenvironment associated with BRAF alterations
2024-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588294
PMID:38645202
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研究论文 | 本研究通过多种方法分析了小儿低级别胶质瘤的肿瘤微环境 | 揭示了与BRAF变异相关的独特肿瘤微环境和免疫细胞异质性 | 尚需进一步研究免疫细胞浸润和肿瘤-免疫相互作用 | 加深对小儿低级别胶质瘤生物学的理解，以识别新型、更有效且毒性较小的治疗方法 | 小儿低级别胶质瘤及其肿瘤微环境的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 细胞, RNA | 小儿低级别胶质瘤样本 |
| 363 | 2024-08-07 |
Decoding the biology and clinical implication of neutrophils in intracranial aneurysm
2024-Apr, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52014
PMID:38317016
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和外部批量mRNA测序数据，深入探讨了侵入颅内动脉瘤（IA）壁的中性粒细胞的特征和功能异质性 | 首次详细描述了中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和潜在临床意义，揭示了中性粒细胞在IA形成和破裂中的不同亚群及其作用机制 | NA | 阐明中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和临床意义 | 中性粒细胞在颅内动脉瘤中的功能和临床意义 | NA | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA测序数据 | 涉及人和小鼠模型的数据集 |
| 364 | 2024-08-04 |
Set7 Methyltransferase and Phenotypic Switch in Diabetic Glomerular Endothelial Cells
2024-Apr-17, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000345
PMID:38630537
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研究论文 | 本研究探讨了Set7甲基转移酶在糖尿病肾病（DKD）中对肾小管内皮细胞功能的影响 | 揭示了Set7在糖尿病肾小管内皮细胞表型转变中的调控作用，并表明靶向Set7可能保护肾小管细胞损伤 | 本研究主要在小鼠模型中进行，未来需要更多人类样本的验证 | 研究Set7在糖尿病肾病中对内皮细胞功能的作用 | 以糖尿病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA-seq | 小鼠模型和人类肾脏细胞 |
| 365 | 2024-08-07 |
Dynamic Hippo pathway activity underlies mesenchymal differentiation during lung alveolar morphogenesis
2024-Apr-05, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202430
PMID:38602485
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研究论文 | 研究探讨了Hippo信号通路在肺泡形态发生中调节次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）功能的动态变化 | 首次揭示了Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF功能、增殖和时间身份的调节作用 | NA | 研究Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF的调节作用 | 次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）及其在肺泡形态发生中的作用 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 从报告鼠中纯化的SCMF细胞 |
| 366 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of pediatric renal tissues revealed the potential relationship between immunoglobulin A nephropathy and immunoglobulin A vasculitis with nephritis
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1651
PMID:38591641
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-07 |
Treatment resistance in pancreatic and biliary tract cancer: molecular and clinical pharmacology perspectives
2024-Apr, Expert review of clinical pharmacology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/17512433.2024.2319340
PMID:38413373
|
研究论文 | 本文综述了胆道癌和胰腺癌治疗抵抗的分子和临床药理学视角，探讨了当前治疗方案及其抵抗机制，并提出了克服这些障碍的策略。 | 本文提出了通过个性化患者方法和人工智能应用来指导有效治疗策略的新思路。 | 目前尚未形成统一的治疗抵抗理论，进展有限。 | 旨在识别和克服胆道癌和胰腺癌治疗抵抗的分子机制，以改善患者治疗效果。 | 胆道癌和胰腺癌的治疗抵抗机制及其克服策略。 | NA | 胆道癌、胰腺癌 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-07 |
Irisin delays the onset of type 1 diabetes in NOD mice by enhancing intestinal barrier
2024-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.130857
PMID:38493812
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研究论文 | 本研究探讨了irisin激素通过增强结肠肠屏障功能来延缓1型糖尿病（T1D）在NOD小鼠中的发病 | 首次揭示了irisin通过调节AMPK/PI3K/AKT通路和增加MUC3表达来增强结肠肠屏障功能，从而延缓T1D的发病 | NA | 研究irisin是否能通过增强结肠肠屏障来延缓T1D的发病 | 1型糖尿病（T1D）患者和非肥胖糖尿病（NOD）小鼠 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 369 | 2024-08-04 |
Unraveling the Heterogeneity of CD8+ T-Cell Subsets in Liver Cirrhosis: Implications for Disease Progression
2024-Apr-16, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl230345
PMID:38623058
|
研究论文 | 本研究阐明了肝硬化中CD8+ T细胞亚群的异质性及其对疾病进展的影响 | 首次定义了在肝硬化中具有特殊功能的CD8+ T细胞亚群，特别是与免疫失调和疾病进展相关的CXCL13+ Tex细胞 | 研究未明确探讨这些细胞在临床治疗中的实际应用 | 探讨肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 研究了CD8+ T细胞亚群在肝硬化患者中的表达和功能 | 数字病理学 | 肝癌 | 转录组分析和单细胞测序 | NA | RNA-seq数据和单细胞数据 | NA |
| 370 | 2024-08-04 |
Deciphering the prognostic landscape of osteosarcoma: Integrating the roles of hippo pathway genes, programmed cell death, and the tumor immune microenvironment
2024-Apr-15, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24280
PMID:38622820
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研究论文 | 本研究探讨了Hippo信号通路基因在骨肉瘤中的预后价值以及其与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 发现了131个与Hippo通路相关的基因，鉴定了8个与患者预后显著相关的关键基因 | 本研究可能受到样本量和数据集的限制，可能影响结果的普遍性和适用性 | 旨在理解骨肉瘤的分子基础及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 研究对象为骨肉瘤患者及其相关的基因表达数据 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 转录组测序 | 生存分析模型 | 基因表达数据 | 涉及TARGET-OS数据集及GTEx控制样本的分析 |
| 371 | 2024-08-07 |
Cell Type- and Age-Specific Expression of lncRNAs across Kidney Cell Types
2024-Apr-15, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000354
PMID:38621182
|
研究论文 | 本研究采用靶向单细胞RNA测序方法，分析了不同细胞类型和年龄阶段肾脏细胞中长非编码RNA（lncRNA）的表达情况 | 首次构建了不同细胞类型中lncRNA的转录组图谱，并探讨了lncRNA在肾脏老化中的功能角色 | lncRNA的功能仍不完全清楚，需要进一步的研究来阐明其在细胞分化和稳态中的具体作用 | 揭示lncRNA在肾脏细胞类型和年龄特异性表达中的作用 | 肾脏细胞中的长非编码RNA（lncRNA） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括正常和老龄小鼠的多种组织 |
| 372 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing of virus-specific cellular immune responses in chronic hepatitis B patients
2024-Apr-08, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03187-2
PMID:38589415
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究慢性乙型肝炎患者的HBV特异性细胞免疫反应 | 创建了HBV免疫反应的单细胞RNA测序数据集，有助于更好地理解失调的免疫反应 | NA | 探索慢性乙型肝炎患者中HBV特异性T细胞反应的转录变化 | 慢性乙型肝炎患者和健康对照者的血液及肝脏组织样本 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 21名慢性乙型肝炎患者和10名健康对照者的血液样本，以及5份匹配的肝脏活检样本 |
| 373 | 2024-08-04 |
Histone 3 lysine 9 acetylation-specific reprogramming regulates esophageal squamous cell carcinoma progression and metastasis
2024-Apr, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00738-y
PMID:38291129
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研究论文 | 本研究探讨了H3K9ac在食道鳞状细胞癌（ESCC）进展和转移中的特定作用 | 识别了ESCC中H3K9ac特异性的表观遗传重编程及其与肿瘤发生和转移的关系 | 仅分析了三个ESCC患者的样本，样本量较小 | 揭示H3K9ac在食道鳞状细胞癌进展和转移中的作用 | 食道鳞状细胞癌（ESCC）患者的配对正常组织、原发肿瘤和转移淋巴结组织 | 数字病理 | 食道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 3名食道鳞状细胞癌患者的配对样本 |
| 374 | 2024-08-07 |
Granzyme K- and amphiregulin-expressing cytotoxic T cells and activated extrafollicular B cells are potential drivers of IgG4-related disease
2024-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.11.916
PMID:38092138
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体及B细胞受体测序，全面、无偏倚地观察了IgG4相关疾病中组织浸润的T细胞和B细胞 | 首次揭示了Granzyme K和amphiregulin表达的细胞毒性T细胞及激活的外滤泡B细胞在IgG4相关疾病中的潜在驱动作用 | NA | 探索IgG4相关疾病中组织浸润的T细胞和B细胞的全面、无偏倚的视图 | IgG4相关疾病患者的组织浸润T细胞和B细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 68名IgG4相关疾病患者和30名Sjögren综合征患者 |
| 375 | 2024-08-07 |
Melanoma Derived Exosomes Amplify Radiotherapy Induced Abscopal Effect via IRF7/I-IFN Axis in Macrophages
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304991
PMID:38286661
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研究论文 | 本研究通过构建携带肿瘤的小鼠模型，探讨了放射治疗（RT）诱导的肿瘤微环境（TME）变化及其对肿瘤远处效应的影响机制 | 首次揭示了肿瘤来源的外泌体通过circPIK3R3/miR-872-3p/IRF7轴促进I型干扰素分泌，增强CD8 T细胞的抗肿瘤免疫反应 | NA | 探究放射治疗诱导的肿瘤远处效应的详细机制 | 肿瘤微环境（TME）及其对肿瘤远处效应的影响 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、荧光原位杂交（FISH） | NA | RNA | 携带肿瘤的小鼠模型 |
| 376 | 2024-08-07 |
Deep Imputation Bi-stochastic Graph Regularized Matrix Factorization for Clustering Single-cell RNA-sequencing Data
2024-Apr-12, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3387911
PMID:38607719
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research paper | 本文提出了一种新的方法DSINMF，通过深度矩阵分解对单细胞RNA测序数据进行聚类 | DSINMF方法包括特征选择、缺失值插补、降维和深度矩阵分解与双随机图正则化四个步骤，以提高聚类效果 | NA | 探索细胞异质性和功能，辅助识别疾病机制和生物标志物 | 单细胞RNA测序数据 | digital pathology | NA | RNA-seq | CNN | 基因转录组数据 | 九个数据集 |
| 377 | 2024-08-07 |
A specific enterotype derived from gut microbiome of older individuals enables favorable responses to immune checkpoint blockade therapy
2024-Apr-10, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.03.002
PMID:38513657
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研究论文 | 本研究探讨了老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法的增强敏感性现象，并通过元分析和单细胞RNA测序数据揭示了其潜在机制，特别是与肠道微生物群相关的特定肠型。 | 识别了一种与老年患者免疫疗法效果改善相关的特定肠型，并通过小鼠实验证实了其治疗潜力。 | NA | 探索老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法增强敏感性的机制，并寻找个性化癌症免疫疗法的新途径。 | 老年癌症患者的肠道微生物群及其对免疫疗法的影响。 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 25个中小型试验 |
| 378 | 2024-08-05 |
scRNAseq and High-Throughput Spatial Analysis of Tumor and Normal Microenvironment in Solid Tumors Reveal a Possible Origin of Circulating Tumor Hybrid Cells
2024-Apr-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16071444
PMID:38611120
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研究论文 | 利用高通量单细胞和空间转录组学分析肿瘤混合细胞的来源. | 首次识别共表达上皮和巨噬细胞标记的肿瘤混合细胞，并提供了其特征转录组的信息. | 关于循环混合细胞在组织中的来源的研究较少，且基于一两种标记的研究方法有限. | 探讨循环混合细胞的组织来源及其在不同类型癌症中的表现. | 肿瘤混合细胞(THCs)和正常组织中的细胞(NHCs)的转录组特征. | 数字病理学 | 乳腺癌和结肠癌 | 高通量单细胞转录组和空间转录组学 | NA | NA | 涉及乳腺癌和结肠癌的稀有样本 |
| 379 | 2024-08-04 |
Defining T cell receptor repertoires using nanovial-based binding and functional screening
2024-Apr-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320442121
PMID:38536748
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研究论文 | 本文利用纳米瓶进行T细胞受体多样性的定义和筛选 | 提出了一种新颖的纳米瓶技术，可以有效地捕获和激活特定的T细胞，从而链接TCR序列与其靶标 | 对特定抗原的识别和效率可能受到pMHC的选择和设计限制 | 开发一种新的方法来识别和筛选抗原反应性T细胞，以应用于免疫疗法 | 通过纳米瓶捕获并排序反应特定病毒和癌症抗原的T细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA |
| 380 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of cells from fresh or frozen tissue reveals a signature of freezing marked by heightened stress and activation
2024-Apr, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350660
PMID:38304946
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析新鲜和冷冻组织中的细胞，揭示了冷冻标志，表现为应激和激活的基因上调 | 首次揭示了冷冻处理对人类组织T细胞、ILCs和NK细胞的单细胞RNA测序结果的影响，特别是应激和激活相关基因的上调 | NA | 研究冷冻处理对人类组织中细胞的单细胞RNA测序结果的影响 | 人类组织中的T细胞、ILCs和NK细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |