单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal metastatic CLDN4+ cancer cells underlying the recurrence of malignant pleural effusion in patients with advanced non-small-cell lung cancer
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1649
PMID:38629624
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研究论文 | 本研究揭示了在晚期非小细胞肺癌患者中，CLDN4+癌细胞与恶性胸腔积液复发之间的关联 | 首次通过单细胞转录组学方法识别出与复发性恶性胸腔积液相关的CLDN4+转移性癌细胞 | 需要在更大样本量的群体中进一步验证CLDN4的临床价值和其生物功能的机制研究 | 探讨非小细胞肺癌患者中复发性恶性胸腔积液的细胞和基因标志 | 研究对象为16名合并胸腔积液的非小细胞肺癌患者 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 16名非小细胞肺癌患者的胸腔积液样本 |
| 342 | 2024-08-04 |
Modeling single cell trajectory using forward-backward stochastic differential equations
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012015
PMID:38620017
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研究论文 | 本文提出了一种利用前向-后向随机微分方程建模单细胞发育轨迹的方法 | 结合前向-后向随机微分方程与精细化近似程序，以动态方式建模非线性轨迹 | 现有的SDE方法通常依赖数值近似，可能导致推断不准确，偏离真实轨迹 | 研究单细胞发育轨迹的动态建模 | 单细胞转录组测序数据 | 计算机视觉 | NA | 随机微分方程 | 前向-后向随机微分方程 | 单细胞转录组数据 | 多个scRNA-seq数据集 |
| 343 | 2024-08-07 |
High-throughput RNA isoform sequencing using programmed cDNA concatenation
2024-Apr, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01815-7
PMID:37291427
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MAS-ISO-seq的高通量RNA异构体测序技术，通过编程连接cDNA分子以优化长读长测序，显著提高了测序通量 | MAS-ISO-seq技术通过编程连接cDNA，实现了超过15倍的测序通量提升，并能发现更多差异剪接基因 | NA | 开发一种新的RNA异构体测序技术，以提高测序通量和发现差异剪接基因的能力 | 肿瘤浸润T细胞的单细胞RNA测序 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | cDNA读取 | 近4000万cDNA读取每运行 |
| 344 | 2024-08-07 |
Itraconazole inhibits tumor growth via CEBPB-mediated glycolysis in colorectal cancer
2024-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16082
PMID:38278779
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研究论文 | 研究探讨了伊曲康唑通过CEBPB介导的糖酵解抑制结直肠癌肿瘤生长的效果和机制 | 发现了伊曲康唑通过CEBPB-ENO1轴抑制结直肠癌糖酵解和肿瘤生长的新机制 | NA | 探索伊曲康唑在结直肠癌治疗中的潜在疗效及其作用机制 | 结直肠癌肿瘤及其在伊曲康唑处理下的细胞组成和基因表达变化 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四只携带肿瘤的小鼠 |
| 345 | 2024-08-07 |
NAMPT-Driven M2 Polarization of Tumor-Associated Macrophages Leads to an Immunosuppressive Microenvironment in Colorectal Cancer
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303177
PMID:38308188
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研究论文 | 本研究探讨了NAMPT在结直肠癌肿瘤微环境中对肿瘤相关巨噬细胞M2极化的作用及其对免疫抑制微环境的影响 | 首次发现NAMPT在SPP1肿瘤相关巨噬细胞中高表达，并与结直肠癌患者的预后不良相关 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，需进一步临床验证 | 探究NAMPT在结直肠癌肿瘤微环境中对肿瘤相关巨噬细胞的作用及其对患者预后的影响 | NAMPT在肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及结直肠癌患者样本 |
| 346 | 2024-08-07 |
Identification of Potent siRNA Delivery Peptides Using Computer Modeling
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308345
PMID:38311577
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研究论文 | 本文通过计算机建模和单细胞RNA测序（scRNA-seq）的综合程序，筛选出理想的siRNA递送肽 | 开发了一种基于计算机建模和scRNA-seq的综合程序，用于筛选具有理想组装和递送能力的siRNA递送肽 | NA | 开发新的siRNA递送肽，用于RNA干扰（RNAi）疗法 | siRNA递送肽及其在体内的安全性和有效性 | 计算机建模 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 序列数据 | 包含12种氨基酸的肽库 |
| 347 | 2024-08-07 |
Pericyte signaling via soluble guanylate cyclase shapes the vascular niche and microenvironment of tumors
2024-Apr, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00078-5
PMID:38528180
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了通过特定删除可溶性鸟苷酸环化酶（sGC）的NO受体，研究了周细胞如何影响肿瘤血管微环境和血管生态位 | 首次详细探讨了周细胞在肿瘤血管微环境中的作用，并提出针对周细胞sGC的治疗策略 | 研究主要集中在细胞和分子层面，未来需进一步在动物模型和临床试验中验证 | 阐明周细胞在肿瘤血管微环境中的作用，并探索新的癌症治疗策略 | 周细胞、内皮细胞、癌症相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 348 | 2024-08-07 |
Partial label learning for automated classification of single-cell transcriptomic profiles
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012006
PMID:38578796
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研究论文 | 本文研究了如何利用部分标签学习框架自动分类单细胞转录组数据，并探讨了标签集结构的整合效果 | 提出了利用部分标签学习框架，而不是完全监督的训练数据集，来分类单细胞转录组数据 | 文章未明确提及具体的局限性 | 旨在解决单细胞转录组数据的自动分类问题 | 单细胞转录组数据的分类及其细胞谱系关系的识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNASeq） | SVM, kNN, 基于原型的方法, 逻辑回归, 集成方法 | 转录组数据 | 文章未提供具体的样本数量 |
| 349 | 2024-08-07 |
Calcified apoptotic vesicles from PROCR+ fibroblasts initiate heterotopic ossification
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12425
PMID:38594791
|
研究论文 | 本文研究了异位骨化（HO）的异常形成过程，发现钙化的凋亡小体（apoVs）是HO的启动因子。 | 首次识别出PROCR+成纤维细胞分泌的钙化凋亡小体作为HO的启动因子，并提出其可能作为抑制病理性钙化的治疗靶点。 | NA | 探讨异位骨化的启动因子及其治疗靶点。 | 异位骨化过程中的钙化凋亡小体及其作用机制。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 不同阶段的异位骨化样本 |
| 350 | 2024-08-07 |
Cell Heterogeneity Analysis Revealed the Key Role of Fibroblasts in the Magnum Regression of Ducks
2024-Apr-01, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14071072
PMID:38612311
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了鸭子输卵管中段（magnum）在产蛋和停产后细胞异质性的变化 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了鸭子输卵管中段在产蛋和停产后细胞异质性的差异，特别是涉及蛋白质分泌和细胞外基质（ECM）产生的成纤维细胞的变化 | 研究仅限于特定年龄的鸭子，且样本数量有限，可能需要进一步扩大样本范围以验证结果的普遍性 | 探究鸭子输卵管中段在产蛋和停产后分子机制的差异 | 鸭子输卵管中段的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 13,708个单细胞样本 |
| 351 | 2024-08-07 |
Integration analysis of single-cell transcriptome reveals specific monocyte subsets associated with melanoma brain and leptomeningeal metastasis
2024-Apr, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.13710
PMID:38616506
|
研究论文 | 本研究通过整合分析单细胞转录组数据，揭示了与黑色素瘤脑和软脑膜转移相关的特定单核细胞亚群 | 本研究首次详细分析了黑色素瘤脑转移和软脑膜转移中单核细胞亚群的组成和分子表达差异，并发现了与转移相关的特定单核细胞亚群 | NA | 阐明黑色素瘤中枢神经系统转移的病理机制，为开发针对单核细胞或细胞因子的治疗策略提供依据 | 黑色素瘤脑转移和软脑膜转移中的单核细胞亚群 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 涉及血液、原发肿瘤、脑转移和软脑膜转移组织中的单核细胞 |
| 352 | 2024-08-04 |
[Current status and prospects of genetic research on IgA nephropathy]
2024-Apr-23, Zhonghua yi xue za zhi
|
评论 | 本文讨论了IgA肾病的遗传研究现状和前景 | 提出了基因组医学时代如何通过全基因组测序和多组学研究寻找IgA肾病的易感基因及靶向药物的见解 | 仅讨论了目前的研究进展，未提供新的实验数据或结果 | 探讨IgA肾病的遗传因素及其在发病机制中的作用 | IgA肾病相关的易感基因和临床表型 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序（WGS），单细胞测序，表达数量性性状位点（eQTL） | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-04 |
Evaluation of McCauley et al.: A framework for systematic evaluation of tissue signaling responses by single-cell RNA-seq
2024-Apr-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.03.007
PMID:38636454
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评论 | 对McCauley等人论文的同行评审过程的单次快照 | 开发了一个系统性评估组织信号响应的框架 | 没有提供关于具体实验数据或结果的详细信息 | 评估组织信号反应的系统性方法 | 人类气道上皮中的信号反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-04 |
Multi-pronged analysis of pediatric low-grade glioma reveals a unique tumor microenvironment associated with BRAF alterations
2024-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588294
PMID:38645202
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研究论文 | 本研究通过多种方法分析了小儿低级别胶质瘤的肿瘤微环境 | 揭示了与BRAF变异相关的独特肿瘤微环境和免疫细胞异质性 | 尚需进一步研究免疫细胞浸润和肿瘤-免疫相互作用 | 加深对小儿低级别胶质瘤生物学的理解，以识别新型、更有效且毒性较小的治疗方法 | 小儿低级别胶质瘤及其肿瘤微环境的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 细胞, RNA | 小儿低级别胶质瘤样本 |
| 355 | 2024-08-04 |
Restoration of neuronal progenitors by partial reprogramming in the aged neurogenic niche
2024-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00594-3
PMID:38553564
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研究论文 | 这篇文章探讨了部分重编程如何恢复衰老小鼠神经发生区域的神经前体细胞 | 研究首次系统性地使用单细胞转录组学分析部分重编程对衰老小鼠大脑的影响 | 缺乏对部分重编程在不同背景或人类样本中影响的广泛验证 | 探讨部分重编程对衰老脑内神经发生区的影响 | 衰老小鼠的大脑和神经干细胞 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 衰老小鼠的样本，具体数量未说明 |
| 356 | 2024-08-04 |
Air Pollutants and Mortality Risk in Patients with Aortic Dissection: Evidence from a Clinical Cohort, Single-Cell Sequencing, and Proteomics
2024-Apr-16, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.4c00534
PMID:38561599
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研究论文 | 本研究评估了空气污染物与急性主动脉夹层患者死亡风险之间的关联 | 首次通过单细胞测序和蛋白质组学探讨PM2.5引起的不良预后潜在机制 | 缺乏对其他环境因素的综合考虑 | 评估空气污染物对急性主动脉夹层患者死亡风险的影响及机制 | 急性主动脉夹层患者 | 公共卫生 | 心血管疾病 | 单细胞测序，蛋白质组学 | Cox回归模型 | 临床数据，基因组数据 | 1267名急性主动脉夹层患者 |
| 357 | 2024-08-04 |
Single-Cell Analysis Reveals Histone Deacetylation Factor Guide Intercellular Communication of Tumor Microenvironment that Contribute to Colorectal Cancer Progression and Immunotherapy
2024-Apr-18, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-024-10730-8
PMID:38637426
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了组蛋白去乙酰化因子(HDF)在结直肠癌进展及免疫治疗中的作用 | 揭示了HDF相关基因在肿瘤微环境中细胞间通信的分子调控机制，并首次提出了HDF-TME评分对结直肠癌患者预后和免疫治疗效益的预测能力 | 研究主要依赖公共数据库的数据，可能存在数据偏差 | 探讨HDF在结直肠癌肿瘤微环境中的功能及其对免疫治疗的影响 | 结直肠癌(TME)细胞群体，包括基质细胞、巨噬细胞、T淋巴细胞和B淋巴细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用结直肠癌组织转录组和免疫治疗队列的数据，具体样本量未提及 |
| 358 | 2024-08-07 |
Decoding the biology and clinical implication of neutrophils in intracranial aneurysm
2024-Apr, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52014
PMID:38317016
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和外部批量mRNA测序数据，深入探讨了侵入颅内动脉瘤（IA）壁的中性粒细胞的特征和功能异质性 | 首次详细描述了中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和潜在临床意义，揭示了中性粒细胞在IA形成和破裂中的不同亚群及其作用机制 | NA | 阐明中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和临床意义 | 中性粒细胞在颅内动脉瘤中的功能和临床意义 | NA | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA测序数据 | 涉及人和小鼠模型的数据集 |
| 359 | 2024-08-04 |
Set7 Methyltransferase and Phenotypic Switch in Diabetic Glomerular Endothelial Cells
2024-Apr-17, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000345
PMID:38630537
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研究论文 | 本研究探讨了Set7甲基转移酶在糖尿病肾病（DKD）中对肾小管内皮细胞功能的影响 | 揭示了Set7在糖尿病肾小管内皮细胞表型转变中的调控作用，并表明靶向Set7可能保护肾小管细胞损伤 | 本研究主要在小鼠模型中进行，未来需要更多人类样本的验证 | 研究Set7在糖尿病肾病中对内皮细胞功能的作用 | 以糖尿病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA-seq | 小鼠模型和人类肾脏细胞 |
| 360 | 2024-08-07 |
Dynamic Hippo pathway activity underlies mesenchymal differentiation during lung alveolar morphogenesis
2024-Apr-05, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202430
PMID:38602485
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研究论文 | 研究探讨了Hippo信号通路在肺泡形态发生中调节次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）功能的动态变化 | 首次揭示了Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF功能、增殖和时间身份的调节作用 | NA | 研究Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF的调节作用 | 次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）及其在肺泡形态发生中的作用 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 从报告鼠中纯化的SCMF细胞 |