单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 491 篇文献,本页显示第 341 - 360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
341 2024-08-05
Loss of Y in regulatory T lymphocytes in the tumor micro-environment of primary colorectal cancers and liver metastases
2024-04-24, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 该文章研究了原发性结直肠癌和肝转移癌的肿瘤微环境中调节性T淋巴细胞Y染色体缺失的频率和功能影响 首次探讨了肿瘤微环境中浸润性白血球中的Y染色体缺失与结直肠癌的关系 目前仅关注了调节性T淋巴细胞,未能探讨其他类型淋巴细胞的影响 研究肿瘤微环境中Y染色体缺失在结直肠癌发生中的作用 研究对象为血液、肿瘤微环境和非肿瘤组织中的细胞 数字病理学 结直肠癌 scRNA-seq NA 细胞 在肿瘤微环境中调节性T淋巴细胞的Y染色体缺失频率为22% NA NA NA NA
342 2024-08-05
scGAL: unmask tumor clonal substructure by jointly analyzing independent single-cell copy number and scRNA-seq data
2024-Apr-22, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 该文章介绍了一种新型混合模型scGAL,用于推断肿瘤克隆拷贝数亚结构 scGAL结合了自编码器和生成对抗网络,能够联合分析单细胞拷贝数和基因表达数据,克服拷贝数数据中的噪声影响 可能仍受到个别数据集特征和技术限制的影响 准确解码肿瘤克隆拷贝数亚结构以提供癌症的演化机制见解 真实癌症数据集中的单细胞拷贝数和基因表达数据 数字病理学 肿瘤 scDNA-seq 生成对抗网络 拷贝数数据和基因表达数据 三个真实癌症数据集 NA NA NA NA
343 2024-08-05
Discrete-state models identify pathway specific B cell states across diseases and infections at single-cell resolution
2024-04-21, Journal of theoretical biology IF:1.9Q3
研究论文 该文章研究了在健康和疾病状况下B细胞的特定状态。 开发了基于状态的离散模型,利用单细胞RNA测序数据来识别与氧调控通路相关的B细胞状态。 研究仅限于已发布的单细胞RNA测序数据,可能忽略其他重要因素。 理解B细胞在感染、疫苗接种和其他疾病中的状态及其调节方式。 研究不同疾病和感染中的B细胞状态及其转变。 数字病理学 乳腺癌, HIV 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 离散状态模型 基因表达数据 NA NA NA NA NA
344 2024-08-05
YTE-17 inhibits colonic carcinogenesis by resetting antitumor immune response via Wnt5a/JNK mediated metabolic signaling
2024-Apr, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了YTE-17通过Wnt5a/JNK介导的代谢信号通路抑制结肠癌发生的机制 本研究首次揭示YTE-17通过影响肿瘤微环境中的免疫细胞平衡来预防结直肠癌 关于YTE-17在预防结直肠癌的机制了解仍有限 探索YTE-17在结直肠癌预防中的潜在作用 研究对象包括暴露于YTE-17的肠上皮细胞及其在结肠癌模型中的免疫微环境 数字病理学 结肠癌 iTRAQ分析、单细胞RNA测序 参与性癌症模型 组织样本 不同阶段的结肠癌模型样本 NA NA NA NA
345 2024-08-04
Comprehensive analysis of CYBB as a prognostic marker and therapeutic target in glioma: A bioinformatics approach
2024-Apr-30, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本文综合分析了CYBB作为神经胶质瘤的预后标志物和治疗靶点 建立了基于CYBB和线粒体基因的预后模型,揭示其在神经胶质瘤患者预后中的潜在应用 未提及具体的样本数量和研究的局限性 识别新的标志基因并建立预后模型以改善神经胶质瘤的早期诊断和预后判断 研究对象为神经胶质瘤患者及其临床病理特征 数字病理学 神经胶质瘤 单细胞测序,生物信息学分析 10基因预后模型 基因表达数据 7名神经胶质瘤患者的单细胞测序数据 NA NA NA NA
346 2024-08-04
Identifying MS4A6A+ macrophages as potential contributors to the pathogenesis of nonalcoholic fatty liver disease, periodontitis, and type 2 diabetes mellitus
2024-Apr-30, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究识别了MS4A6A+巨噬细胞作为非酒精性脂肪肝病、牙周炎和2型糖尿病发病机制的重要贡献者 首次确定了MS4A6A+巨噬细胞在多种疾病交互作用中的重要性 缺乏临床验证和更大样本量的支持 探讨非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病和牙周炎之间的共同机制 分析与NAFLD、T2DM和PD相关的数据集及其差异表达基因 数字病理学 非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病、牙周炎 单细胞测序、免疫组织化学染色 LASSO算法 基因表达数据 三个疾病相关的数据集中识别了25个共享的差异表达基因 NA NA NA NA
347 2024-08-05
Unravelling immune microenvironment features underlying tumor progression in the single-cell era
2024-Apr-22, Cancer cell international IF:5.3Q1
综述 本综述探讨了单细胞RNA测序(SC-RNA-seq)在肿瘤免疫微环境(TIME)特征解析中的重要性。 强调了SC-RNA-seq在肿瘤发生和进展中揭示TIME细胞和分子变化的新颖性。 未具体提及传统测序方法的局限性细节。 阐明免疫细胞与肿瘤发生和进展之间的关系。 肿瘤免疫微环境中细胞异质性的变化。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA NA NA NA
348 2024-08-05
Single-cell transcriptome atlas in C57BL/6 mice encodes morphological phenotypes in the aging kidneys
2024-Apr-19, BMC nephrology IF:2.2Q2
研究论文 本研究提供了C57BL/6小鼠在不同发育阶段的肾脏形态和单细胞转录组图谱的综合数据。 提供了关于C57BL/6小鼠肾脏在整个发育阶段的详细形态学和单细胞转录组参考标准,有助于生物研究的进一步扩展。 缺乏对其他小鼠品系或其它管理条件下的肾脏形态及转录组的比较研究。 探究C57BL/6小鼠肾脏在不同发育阶段的形态变化及其单细胞转录组。 C57BL/6小鼠的肾脏在胚胎到老化过程中的各个阶段。 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 肾脏组织数据 8组,每组5-6只小鼠 NA NA NA NA
349 2024-08-05
Membrane to cortex attachment determines different mechanical phenotypes in LGR5+ and LGR5- colorectal cancer cells
2024-Apr-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了LGR5+和LGR5-结直肠癌细胞在机械性状上的差异 揭示了LGR5+细胞与LGR5-细胞在机械属性上的显著差异及其对转移的潜在影响 对不同细胞群体在转移过程中的具体机制尚未深入探讨 探讨结直肠癌细胞群体的机械性状如何影响其转移能力 分析LGR5+和LGR5-结直肠癌细胞的机械性能和生物学特性 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA 来自患者队列的结直肠癌源性类器官样本 NA NA NA NA
350 2024-08-04
Identification of cells of leukemic stem cell origin with non-canonical regenerative properties
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究揭示了一种来源于白血病干细胞但具有非典型再生特性的细胞群体 首次识别出具有促进或抑制白血病再生功能的 AML 再生富集细胞(RECs) 尚不清楚 RECs 在白血病复发中的具体机制 研究化疗后的急性髓性白血病(AML)细胞群体的特征和功能 焦点集中在来源于白血病干细胞的 AML 再生富集细胞(RECs) 数字病理学 急性髓性白血病 单细胞转录组测序和空间转录组学 NA 生物样本数据 AML 患者的骨髓样本(具体样本数量未说明) NA NA NA NA
351 2024-08-05
Multicellular ecotypes shape progression of lung adenocarcinoma from ground-glass opacity toward advanced stages
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
研究论文 本文分析了58例肺腺癌患者,以阐明不同临床影像表现之间的异质性 识别了六种肺多细胞生态型(LME),并揭示了其与放射学模式及癌细胞状态的关联 当前对这种异质性的理解仍然有限 探讨肺腺癌的临床放射学表现及其生物特征的异质性 58例肺腺癌患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,全外显子组测序,机器学习 NA 基因组数据 58例肺腺癌患者 NA NA NA NA
352 2024-08-05
Establishment of a cholangiocarcinoma risk evaluation model based on mucin expression levels
2024-Apr-15, World journal of gastrointestinal oncology IF:2.5Q3
研究论文 本研究建立了一个基于粘蛋白表达水平的胆管癌风险评估模型 首次系统性探讨了粘蛋白在胆管癌进展及预后中的作用,建立了风险评估公式 尚未完全理解粘蛋白家族如何影响胆管癌的进展和预后 研究粘蛋白在胆管癌进展中的作用并建立风险评估模型 14个胆管癌样本的单细胞RNA测序数据 数字病理学 胆管癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组化 LASSO回归 RNA数据 14个胆管癌样本 NA NA NA NA
353 2024-08-05
Identification of receptors and factors associated with human coronaviruses in the oral cavity using single-cell RNA sequencing
2024-Apr-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了与人类冠状病毒在口腔中相关的受体和因素 本研究整合了多个口腔组织的单细胞RNA测序数据,识别了特定细胞簇及SARS-CoV-2和与冠状病毒相关的受体的表达模式 SCARFs在其他口腔部位的表达模式相对复杂,可能仅与SARS-CoV-2感染特定相关 探究四种人类冠状病毒在口腔中的感染机制和靶细胞特征 本研究对象为七种人类口腔组织中的单细胞数据 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA RNA序列数据 七种人类口腔组织的单细胞数据 NA NA NA NA
354 2024-08-04
Staphylococcus aureus induces drug resistance in cancer T cells in Sézary syndrome
2024-Apr-11, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究报告了金黄色葡萄球菌及其肠毒素在Sézary综合症患者的恶性T细胞中诱导耐药性 首次揭示了金黄色葡萄球菌肠毒素诱导的抗药机制及其在Sézary综合症中的影响 本研究未涉及多种其他类型的细菌或影响因素 探索金黄色葡萄球菌诱导的药物耐受机制及其在SE综合症中的作用 对来自Sézary综合症患者的恶性T细胞进行研究 数字病理学 皮肤T细胞淋巴瘤 单细胞测序 NA 细胞样本 来自Sézary综合症患者的多个原代恶性T细胞样本 NA NA NA NA
355 2024-08-04
Spatial motifs reveal patterns in cellular architecture of complex tissues
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 空间组织对保证组织的生理功能和癌症等病理状态至关重要 提出了一种新方法,通过空间邻域图检测细胞类型的空间模式 未提及该方法在其他组织类型或更复杂条件下的适用性 旨在识别细胞类型之间的更高阶关联,以理解复杂组织的发育和功能 主要研究小鼠视网膜双极细胞和下丘脑前视区域的空间图谱 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 合成数据和空间图谱 使用合成数据进行验证,具体样本量未知 NA NA NA NA
356 2024-08-05
Predictive and Prognostic Biomarkers in Patients With Mycosis Fungoides and Sézary Syndrome (BIO-MUSE): Protocol for a Translational Study
2024-Apr-04, JMIR research protocols IF:1.4Q3
研究论文 本研究旨在识别与真菌病和塞扎里综合症患者相关的预后生物标志物 首次综合分析血液和皮肤中的免疫细胞及微生物环境,以发现潜在的新预后生物标志物 由于样本数量尚少,可能影响研究结果的普遍适用性和统计学意义 识别与真菌病和塞扎里综合症相关的预后生物标志物 真菌病和塞扎里综合症患者的血液和皮肤样本 数字病理学 皮肤T细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序,数字空间分析 NA 血液和皮肤样本 正在招募120名真菌病或塞扎里综合症的成年患者以及20名健康志愿者 NA NA NA NA
357 2024-08-05
Circulating immune cell landscape and T-cell abnormalities in patients with moyamoya disease
2024-04, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了与 moya moya 病相关的循环免疫细胞景观和 T 细胞异常 首次全面描绘了 moya moya 病患者的循环免疫细胞的变化及其潜在的免疫失调机制 缺乏对其他人群或地域的比较分析,可能限制研究结果的广泛适用性 探讨 moya moya 病患者中循环免疫细胞及 T 细胞的变化 监测 moya moya 病患者与年龄匹配的健康对照之间的外周血免疫细胞特征 数字病理学 NA 单细胞 RNA 测序、质谱细胞计数、RNA 测序 NA 外周血样本 来源于 moya moya 病患者和健康对照的外周血样本 NA NA NA NA
358 2024-08-04
NIFK, a Potential Prognostic and Immunological Biomarker in Pan-- Cancer Analysis, Significantly Regulates Proliferation and Metastasis of Colorectal Cancer
2024-Apr-24, Recent patents on anti-cancer drug discovery IF:2.5Q3
研究论文 该研究系统分析了NIFK在全癌种中的表达及其在结直肠癌中的作用 揭示了NIFK在大多数肿瘤中过表达,并显示出显著的预后效能和与免疫特征的相关性 目前缺乏对NIFK在其他癌种的系统分析,如在非结直肠癌中的具体作用 探讨NIFK作为潜在预后和免疫生物标志物在癌症中的作用 研究NIFK在多种癌症中表达、突变及其在结直肠腺癌中的免疫特征 数字病理学 结直肠癌 单细胞测序 NA 基因组数据 通过TCGA进行的大规模分析,具体样本数量未提供 NA NA NA NA
359 2024-08-07
Identification of CNKSR1 as a biomarker for "cold" tumor microenvironment in lung adenocarcinoma: An integrative analysis based on a novel workflow
2024-Apr-30, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过综合分析,将CNKSR1鉴定为免疫冷型肺腺癌的新型潜在生物标志物,并探讨了其在调节T细胞浸润中的作用。 本研究开发了一种新的策略来识别针对免疫冷肿瘤的抗PD1/PD-L1免疫治疗局限性的有希望的生物标志物,并首次将CNKSR1鉴定为免疫冷型肺腺癌的生物标志物。 NA 旨在识别对PD1/PD-L1免疫治疗无反应的肺腺癌患者的新型生物标志物,以扩大治疗选择。 肺腺癌(LUAD)患者的RNA-seq数据和临床样本。 数字病理学 肺腺癌 RNA-seq 机器学习方法 RNA-seq数据 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌RNA-seq数据,并在三个独立的bulk数据集和一个scRNA-seq数据集中进行了验证。 NA NA NA NA
360 2024-08-04
scMoresDB: A comprehensive database of single-cell multi-omics data for human respiratory system
2024-Apr-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究介绍了一个针对人类呼吸系统的单细胞多组学数据库平台 scMoresDB scMoresDB 提供了一个用户友好的界面,具有跨组学搜索能力和交互式可视化工具 NA 创建一个方便的数据共享和综合分析的平台,专注于人类呼吸系统的单细胞多组学数据 人类呼吸系统相关的单细胞多组学数据 数字病理学 呼吸系统疾病 单细胞测序 NA 多组学数据 NA NA NA NA NA
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