单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 491 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-05 |
Synergistic induction of tertiary lymphoid structures by chemoimmunotherapy in bladder cancer
2024-Apr, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02598-7
PMID:38332180
|
研究论文 | 本文研究了在膀胱癌中，通过化疗和免疫疗法的联合使用促进三级淋巴结构的形成 | 首次系统评估了化疗和免疫疗法对膀胱癌患者免疫反应和淋巴结构成熟的联合效应 | 未提供对其他类型癌症的验证或比较研究 | 探讨其他治疗方式与免疫疗法联合使用以提高膀胱癌患者免疫反应的可能性 | 膀胱癌患者，特别是接受免疫检查点抑制剂治疗的患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | RNA数据 | 包括接受免疫检查点抑制剂和化疗的膀胱癌患者相关样本 | NA | NA | NA | NA |
| 322 | 2024-08-05 |
Comprehensive Analysis of a Dendritic Cell Marker Genes Signature to Predict Prognosis and Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2024-Apr-29, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000521
PMID:38679823
|
研究论文 | 这项研究构建了一种新的树突状细胞标记基因特征，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 提出了一种新的树突细胞标记基因特征，能够独立预测患者预后和免疫治疗效果 | 仅在有限的独立队列中验证了预测能力 | 开发预测肺腺癌预后及其对免疫治疗反应的新方法 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 在训练队列和6个独立队列中涉及到多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-08-05 |
Naive and regulatory B-cell transcription patterns guide the increased risk of papillary thyroid carcinoma in obesity
2024-Apr-28, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
DOI:10.14715/cmb/2024.70.4.19
PMID:38678617
|
研究论文 | 本文探讨了肥胖与乳头状甲状腺癌之间的关系，分析了B细胞转录模式的影响 | 揭示了肥胖人群中B细胞的转录模式与乳头状甲状腺癌风险增加之间的关联 | 尚未明确肥胖相关脂肪因子的具体调控机制 | 探讨肥胖如何增加乳头状甲状腺癌的风险及其相关机制 | 研究肥胖与乳头状甲状腺癌之间的关系及相关B细胞转录模式 | 数字病理学 | 乳头状甲状腺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA序列数据 | 从GEO数据库下载的肥胖和健康人群的皮下脂肪组织RNA序列数据，以及乳头状甲状腺癌的肿瘤组织数据 | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2024-08-04 |
Comprehensiveness cuproptosis related genes study for prognosis and medication sensitiveness across cancers, and validation in prostate cancer
2024-04-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57303-8
PMID:38671021
|
研究论文 | 本研究对铜死亡相关基因（CRGs）在多种癌症中的作用进行了全面调查 | 揭示了CRGs在不同癌症中的预后价值和药物敏感性关联，建立了前列腺癌的预后特征 | 研究中关于CRGs功能的机制仍然模糊，可能需要更多的实验来验证 | 探讨CRGs在各种癌症中的作用及其在前列腺癌中的验证 | 参与分析的26种癌症及前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 26种癌症中的多种样本，以及前列腺癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 325 | 2024-08-05 |
Short-Term Dietary Restriction Potentiates an Anti-Inflammatory Circulating Mucosal-Associated Invariant T-Cell Response
2024-Apr-22, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu16081245
PMID:38674935
|
研究论文 | 这篇文章探讨了短期饮食限制对抗炎症的循环粘膜相关不变T细胞反应的影响 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了短期蛋白-卡路里饮食限制下MAIT细胞的转录组反应，并揭示了与肠道微生物种类变化的关系 | 对短期饮食限制及其对全身免疫影响的理解仍然不足，研究样本仅限于健康志愿者 | 研究短期饮食限制在调节术后炎症中的潜在作用 | 健康志愿者的PBMCs和粪便样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和粪便样本 | 健康志愿者4名，进行为期4天的饮食限制 | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-08-05 |
PPARγ attenuates cellular senescence of alveolar macrophages in asthma-COPD overlap
2024-Apr-20, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02790-6
PMID:38643159
|
研究论文 | 本研究探讨了PPARγ在哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症中的作用。 | 首次揭示了PPARγ在调节与细胞衰老相关的巨噬细胞特征中的重要作用。 | 本研究主要基于公共数据集，临床验证尚需进行。 | 研究PPARγ如何影响哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症中巨噬细胞的衰老。 | 主要关注于哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症患者的肺部单核细胞/巨噬细胞。 | 数字病理学 | 哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、RNA-Seq、CyTOF | NA | RNA，细胞数据 | 通过公共数据集及独立队列研究得到的BALF样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2024-08-05 |
Exploring MiR-484 Regulation by Polyalthia longifolia: A Promising Biomarker and Therapeutic Target in Cervical Cancer through Integrated Bioinformatics and an In Vitro Analysis
2024-Apr-19, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12040909
PMID:38672263
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学和体外分析探讨了MiR-484在宫颈癌中的作用 | 研究首次揭示了MiR-484在宫颈癌中的预后价值和作为治疗靶点的潜力 | 未在临床样本中进行验证 | 探索MiR-484作为宫颈癌的生物标志物和治疗靶点的可能性 | 宫颈癌细胞和相关的生物信息学数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | qRT-PCR和单细胞RNA测序 | 多元Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多种癌症样本和宫颈癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-05 |
Evolutionary and developmental specialization of foveal cell types in the marmoset
2024-Apr-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313820121
PMID:38598343
|
研究论文 | 本文探讨了狨猴中心凹细胞类型的进化与发育特化 | 研究揭示了狨猴以及其他灵长类的中心凹细胞类型的保守细胞结构，并发现了不同区域细胞类型的独特发育轨迹 | 研究对象仅限于狨猴，可能无法完全代表其他灵长类动物的情况 | 探索中心凹的发育、结构和进化 | 普通狨猴的视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 包括新生儿和成人狨猴的视网膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 329 | 2024-08-04 |
Renal Endothelial Single-Cell Transcriptomics Reveals Spatiotemporal Regulation and Divergent Roles of Differential Gene Transcription and Alternative Splicing in Murine Diabetic Nephropathy
2024-Apr-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084320
PMID:38673910
|
研究论文 | 该研究揭示了与糖尿病肾病进展相关的基因转录和选择性剪接的时空调控 | 通过单细胞转录组学方法识别了不同内皮细胞表型及其在疾病进展中的不同作用 | 研究仅使用了小鼠模型，可能无法完全代表人类疾病 | 探索糖尿病肾病中内皮细胞的异质性及其分子机制 | 来自糖尿病小鼠和非糖尿病同窝小鼠的肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | SmartSeq2单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 5464个内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 330 | 2024-08-05 |
Cellular senescence and metabolic reprogramming model based on bulk/single-cell RNA sequencing reveals PTGER4 as a therapeutic target for ccRCC
2024-Apr-11, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12234-5
PMID:38605343
|
研究论文 | 本研究建立了一个基于RNA测序的细胞衰老与代谢重编程模型，并提出了PTGER4作为治疗ccRCC的靶点。 | 首次系统性探讨了与衰老相关的代谢过程变更与ccRCC之间的关系，并开发了一个新模型SeMRM以预测患者的生存率。 | 本研究可能受限于数据集的偏差及其适用性，且缺乏长期跟踪数据验证。 | 研究细胞衰老和代谢重编程在ccRCC中的作用，探讨其潜在的治疗靶点。 | 以ccRCC患者为对象，研究其代谢活动、免疫微环境及治疗反应等。 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | 风险评分模型 (SeMRM) | 基因组数据，临床信息 | 使用了两个ccRCC数据集和一个单细胞数据集，具体样本量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 331 | 2024-08-05 |
Immune Characteristic Genes and Neutrophil Immune Transformation Studies in Severe COVID-19
2024-Apr-04, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12040737
PMID:38674681
|
研究论文 | 本研究识别了六个与 COVID-19 重症相关的免疫特征基因，并探讨了中性粒细胞在重症中的免疫转化。 | 本研究首次确定了 COVID-19 重症的免疫特征基因和关键免疫细胞，以及中性粒细胞的转变机制。 | 本研究的免疫特征基因和细胞机制尚需在更大规模的研究中验证。 | 探讨 COVID-19 重症的免疫病理特征及中性粒细胞的免疫转化过程。 | 研究对象为 COVID-19 重症患者外周血和支气管肺泡灌洗液中的细胞。 | 数字病理学 | COVID-19 | mRNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自 COVID-19 患者的外周血和支气管肺泡灌洗液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-08-04 |
GTADC: A Graph-Based Method for Inferring Cell Spatial Distribution in Cancer Tissues
2024-Apr-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040436
PMID:38672453
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于图的方法GTADC，旨在推断癌症组织中细胞的空间分布。 | GTADC通过利用轮廓得分来捕捉细胞类型内具有显著表达差异的基因，相较于传统方法增强了基因选择的准确性。 | 传统分析方法在处理癌细胞与正常细胞之间的基因表达差异时并不够准确，依赖于统计方法可能无法精确捕捉细胞类型的差异。 | 研究旨在更深入了解早期癌症，并为早期癌症诊断提供潜在支持。 | 研究对象为癌症组织中的细胞，特别是识别不同细胞类型的空间组合。 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学（ST）和单细胞测序（scRNA-seq） | 图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 333 | 2024-08-05 |
Tumor Cell-Derived Complement Component C1r Acts as a Prognostic Biomarker and Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression
2024-Apr-02, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2904138
PMID:38682192
|
研究论文 | 本研究探讨了C1r在食道鳞状细胞癌（ESCC）中的表达模式及其肿瘤促进作用 | C1r被发现不仅作为预后生物标志物，还促进了食道鳞状细胞癌的进展 | 本研究可能未全面揭示C1r其他潜在的肿瘤相关功能 | 旨在调查C1r在食道鳞状细胞癌中的作用及其相关机制 | 食道鳞状细胞癌组织、恶性上皮细胞以及培养的ESCC细胞 | 数字病理学 | 食道癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Western blotting | 无毛小鼠模型 | 组织样本、细胞培养样本 | 样本数量未具体提及，涉及ESCC组织、恶性上皮细胞和小鼠实验 | NA | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the complex cellular niche of pterygium
2024-Apr, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.01.013
PMID:38290663
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了翼状胬肉的复杂细胞环境 | 首次确定了促进翼状胬肉的新的细胞亚群和细胞间相互作用 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行更广泛的临床验证 | 揭示翼状胬肉的病理机制及潜在治疗靶点 | 翼状胬肉患者和正常对照的结膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 45605个细胞来自翼状胬肉患者和正常对照 | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-08-04 |
Pan-cancer analysis implicates novel insights of lactate metabolism into immunotherapy response prediction and survival prognostication
2024-Apr-25, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03042-7
PMID:38664705
|
研究论文 | 该文章探讨了乳酸代谢与免疫治疗反应之间的关系及其在癌症预后中的应用 | 提出了一个与乳酸代谢相关的新标记（LM.SIG），用于预测免疫治疗反应和生存预后 | 研究依赖于公开的转录组数据，可能存在样本选择偏差 | 揭示乳酸代谢对免疫治疗反应的影响并预测癌症患者的生存状况 | 分析接受免疫治疗的癌症患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 40个泛癌症单细胞RNA测序队列和8个免疫治疗转录组队列以及30个TCGA数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 336 | 2024-08-05 |
Loss of Y in regulatory T lymphocytes in the tumor micro-environment of primary colorectal cancers and liver metastases
2024-04-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60049-y
PMID:38658633
|
研究论文 | 该文章研究了原发性结直肠癌和肝转移癌的肿瘤微环境中调节性T淋巴细胞Y染色体缺失的频率和功能影响 | 首次探讨了肿瘤微环境中浸润性白血球中的Y染色体缺失与结直肠癌的关系 | 目前仅关注了调节性T淋巴细胞，未能探讨其他类型淋巴细胞的影响 | 研究肿瘤微环境中Y染色体缺失在结直肠癌发生中的作用 | 研究对象为血液、肿瘤微环境和非肿瘤组织中的细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 在肿瘤微环境中调节性T淋巴细胞的Y染色体缺失频率为22% | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-08-05 |
scGAL: unmask tumor clonal substructure by jointly analyzing independent single-cell copy number and scRNA-seq data
2024-Apr-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10319-w
PMID:38649804
|
研究论文 | 该文章介绍了一种新型混合模型scGAL，用于推断肿瘤克隆拷贝数亚结构 | scGAL结合了自编码器和生成对抗网络，能够联合分析单细胞拷贝数和基因表达数据，克服拷贝数数据中的噪声影响 | 可能仍受到个别数据集特征和技术限制的影响 | 准确解码肿瘤克隆拷贝数亚结构以提供癌症的演化机制见解 | 真实癌症数据集中的单细胞拷贝数和基因表达数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | scDNA-seq | 生成对抗网络 | 拷贝数数据和基因表达数据 | 三个真实癌症数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2024-08-05 |
Discrete-state models identify pathway specific B cell states across diseases and infections at single-cell resolution
2024-04-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2024.111769
PMID:38423206
|
研究论文 | 该文章研究了在健康和疾病状况下B细胞的特定状态。 | 开发了基于状态的离散模型，利用单细胞RNA测序数据来识别与氧调控通路相关的B细胞状态。 | 研究仅限于已发布的单细胞RNA测序数据，可能忽略其他重要因素。 | 理解B细胞在感染、疫苗接种和其他疾病中的状态及其调节方式。 | 研究不同疾病和感染中的B细胞状态及其转变。 | 数字病理学 | 乳腺癌, HIV | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 离散状态模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-08-05 |
YTE-17 inhibits colonic carcinogenesis by resetting antitumor immune response via Wnt5a/JNK mediated metabolic signaling
2024-Apr, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.11.008
PMID:38665223
|
研究论文 | 本研究探讨了YTE-17通过Wnt5a/JNK介导的代谢信号通路抑制结肠癌发生的机制 | 本研究首次揭示YTE-17通过影响肿瘤微环境中的免疫细胞平衡来预防结直肠癌 | 关于YTE-17在预防结直肠癌的机制了解仍有限 | 探索YTE-17在结直肠癌预防中的潜在作用 | 研究对象包括暴露于YTE-17的肠上皮细胞及其在结肠癌模型中的免疫微环境 | 数字病理学 | 结肠癌 | iTRAQ分析、单细胞RNA测序 | 参与性癌症模型 | 组织样本 | 不同阶段的结肠癌模型样本 | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of CYBB as a prognostic marker and therapeutic target in glioma: A bioinformatics approach
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29549
PMID:38655339
|
研究论文 | 本文综合分析了CYBB作为神经胶质瘤的预后标志物和治疗靶点 | 建立了基于CYBB和线粒体基因的预后模型，揭示其在神经胶质瘤患者预后中的潜在应用 | 未提及具体的样本数量和研究的局限性 | 识别新的标志基因并建立预后模型以改善神经胶质瘤的早期诊断和预后判断 | 研究对象为神经胶质瘤患者及其临床病理特征 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞测序，生物信息学分析 | 10基因预后模型 | 基因表达数据 | 7名神经胶质瘤患者的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |