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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-04 |
A Single-cell and Spatial RNA-seq Database for Alzheimer's Disease (ssREAD)
2024-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.08.556944
PMID:37745592
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研究论文 | 本文介绍了针对阿尔茨海默病的单细胞与空间RNA测序数据库ssREAD | 创建了一个用户友好的数据库,整合了广泛的阿尔茨海默病相关数据集,并优化了分析流程 | NA | 建立一个全面的数据库以满足阿尔茨海默病相关数据管理和分析需求 | 阿尔茨海默病相关的单细胞RNA测序和空间转录组研究 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学(ST) | NA | 细胞数据集 | 1,053个样本(277个整合数据集),共计7,332,202个细胞和381个空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 262 | 2024-08-05 |
A multi-organ map of the human immune system across age, sex and ethnicity
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.542671
PMID:38746418
|
研究论文 | 本文创建了一个全面的健康人类免疫系统组成和转录的地图,涵盖不同年龄、性别和种族的免疫细胞分布和互动 | 创新点在于使用了新的多层建模方法来追踪免疫衰老并测试性别和种族的差异 | 尚未提及具体的局限性 | 研究目的在于填补关于人免疫系统在不同人群中分布和交互的知识空白 | 研究对象包括来自45个解剖部位的12,981个单细胞RNA测序样本和2900万细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 多层建模 | 细胞 | 12,981个单细胞RNA测序样本,来自45个不同的解剖部位 | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2024-08-05 |
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2024-Apr-16, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01858-23
PMID:38445887
|
研究论文 | 本研究重新分析了单细胞RNA测序数据,未能支持小鼠非神经节细胞中的疱疹病毒1型潜伏状态 | 提出了原有结论的几项方法论缺陷,挑战了HSV-1可以在免疫细胞中建立潜伏的现有观点 | 使用的方法导致了神经元的严重破坏,干扰了数据的分析 | 研究疱疹病毒1型在小鼠非神经节细胞中是否存在潜伏状态 | 小鼠的免疫细胞和神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-08-04 |
PRKDC-Mediated NHEJ May Play a Crucial Role in Aneuploidy of Chromosome 8-Driven Progression of Ovarian Cancer
2024-Apr-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094825
PMID:38732044
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研究论文 | 本研究探讨了PRKDC介导的非同源末端连接(NHEJ)在卵巢癌染色体8非整倍体进展中的重要作用 | 该研究揭示了剪接的功能分析和非同源末端连接途径如何影响卵巢癌的后期非整倍体特征,具有重要的创新意义 | 该研究的局限性在于缺乏对其他染色体非整倍体的全面分析 | 研究卵巢癌进展中的非整倍体特征及其分子机制 | 卵巢上皮癌中的非整倍体和拷贝数变异 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序和荧光原位杂交(FISH) | NA | 基因组数据 | 使用了癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)中的相关数据 | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptional Profile Construction of Rat Pituitary Glands before and after Sexual Maturation and Identification of Novel Marker Spp1 in Gonadotropes
2024-Apr-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094694
PMID:38731915
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组技术构建了大鼠垂体在性成熟前后的转录谱并识别出新的标记物Spp1。 | 首次研究了性成熟前后大鼠垂体组织的单细胞差异,发现106个差异表达基因并确认Spp1作为新标记物。 | 未涉及不同物种或性别在性成熟前后的细胞差异。 | 探讨性成熟对大鼠垂体细胞转录组特征的影响。 | 大鼠垂体细胞,特别是促性腺细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 266 | 2024-08-04 |
Investigating the basis of lineage decisions and developmental trajectories in the dorsal spinal cord through pseudotime analyses
2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.550380
PMID:37546781
|
研究论文 | 本研究探讨了背侧脊髓内部神经元的发展轨迹和谱系决策的基础 | 开发了一种结合单细胞RNA测序与伪时间分析的资源,以识别影响背侧内部神经元不同谱系的基因 | 对背侧内部神经元产生的分子细节仍不完全 | 探索背侧脊髓内部神经元的命运特征和发育时间 | 小鼠胚胎干细胞衍生的背侧内部神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 267 | 2024-08-05 |
Aberrant follicular regulatory T cells associate with immunoglobulin hyperproduction in nasal polyps with ectopic lymphoid tissues
2024-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.11.913
PMID:38072196
|
研究论文 | 这篇文章探讨了鼻息肉中异位淋巴组织中的卵泡调节性T细胞(TFR细胞)的存在和功能 | 研究首次揭示了鼻息肉中TFR细胞的特征和功能缺失,并表明维生素D治疗可以逆转其抑制功能 | 对TFR细胞在外周病变组织中的作用理解仍然有限 | 调查鼻息肉中TFR细胞的存在、表型和功能 | 鼻息肉中的TFR细胞 | 免疫学 | 鼻息肉 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,流式细胞术,ELISA | NA | 细胞数据 | 从鼻息肉中分离的多种T细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2024-08-04 |
Understanding Spondyloarthritis Pathogenesis: The Promise of Single-Cell Profiling
2024-04, Current rheumatology reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11926-023-01132-7
PMID:38227172
|
review | 本文概述了单细胞分析在脊柱关节炎研究中的最新进展和趋势 | 引入基于测序的方法对RNA、蛋白质或表观遗传修饰进行单细胞分辨率的量化,推动了发现驱动的研究 | 研究仍处于早期阶段,面临高成本和疾病组织样本有限的挑战 | 阐述单细胞分析在脊柱关节炎发病机制研究中的应用 | 主要研究脊柱关节炎相关的细胞状态和治疗反应特征 | NA | 脊柱关节炎 | 单细胞TCR-seq | NA | RNA, 蛋白质, 表观遗传修饰 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-08-04 |
The estrogen signaling pathway reprograms prostate cancer cell metabolism and supports proliferation and disease progression
2024-Apr-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170809
PMID:38625747
|
研究论文 | 这篇文章揭示了雌激素受体α在前列腺癌细胞代谢中的作用,并支持其增殖和疾病进展 | 文章首次表明雌激素受体α在前列腺癌细胞代谢重编程中发挥重要作用,并可能作为治疗靶点 | 雌激素受体α在一半肿瘤中未表达,限制了对其临床相关性的全面理解 | 研究雌激素信号通路对前列腺癌细胞代谢和增殖的影响 | 使用人类前列腺癌组织微阵列和细胞模型研究前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-Seq | NA | 组织样本和细胞模型 | 来自两个前列腺癌组织微阵列的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2024-08-04 |
Cholangiocytes Modulate CD100 Expression in the Liver and Facilitate Pathogenic T-Helper 17 Cell Differentiation
2024-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.11.283
PMID:37995866
|
研究论文 | 这篇文章探讨了胆管细胞如何调节肝脏中CD100的表达并促进致病性T辅助17细胞的分化 | 文章首次表明胆管细胞通过与免疫细胞的交叉对话发挥作用,并强调了其在病理机制中的主动、促炎角色 | 研究主要依赖于特定小鼠模型,可能无法完全反映人类病理过程 | 理解原发性硬化性胆管炎相关的病理机制 | 主要研究胆管细胞与免疫细胞之间的相互作用及其在病理过程中的角色 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 空间转录组学、免疫成像、高维流式细胞术、RNA测序 | 细胞共培养模型 | 组织活检样本和细胞 | 涉及从变异特异性小鼠中提取的脾细胞及患者材料的多种样本 | NA | NA | NA | NA |
| 271 | 2024-08-05 |
PDGFRα+ITGA11+ fibroblasts foster early-stage cancer lymphovascular invasion and lymphatic metastasis via ITGA11-SELE interplay
2024-Apr-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.02.002
PMID:38428409
|
研究论文 | 本研究揭示了PDGFRαITGA11纤维母细胞在早期膀胱癌中的重要作用 | 发现了一种之前未知的PDGFRαITGA11CAFs亚群,与早期膀胱癌中的淋巴血管侵袭和预后不良相关 | 本研究主要集中在早期膀胱癌,可能无法推广到其他类型癌症 | 探讨早期癌症中癌相关纤维母细胞的功能和机制 | 早期膀胱癌中的PDGFRαITGA11CAF亚群 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 缺失小鼠模型 | 临床数据 | 910个病例 | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2024-08-04 |
The guardians of pulmonary harmony: alveolar macrophages orchestrating the symphony of lung inflammation and tissue homeostasis
2024-Apr-30, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0263-2023
PMID:38811033
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综述 | 该文章全面论述了肺泡巨噬细胞在肺部炎症和组织稳态中的重要作用 | 整合了单细胞测序、细胞和组织成像技术等多项最新研究,提供了肺泡巨噬细胞功能可塑性的综合视角 | 未提供具体的实验数据或样本分析结果 | 探讨肺泡巨噬细胞在维持肺部健康和应对疾病环境中的作用 | 主要研究肺泡巨噬细胞及其相应的信号通路和功能特点 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、细胞成像技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 273 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals the Wnt/Ca2+ signaling pathway with inflammation, apoptosis in nucleus pulposus degeneration
2024-Apr-23, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-024-07368-3
PMID:38654287
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研究论文 | 本研究揭示了正常与退变的人类髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的差异表达 | 首次通过单细胞RNA测序分析发现人类退变髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的表达差异 | 研究主要集中在特定人群的细胞,样本的多样性和广泛性可能会影响结果的普适性 | 研究正常与退变髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的表达差异及其机制 | 正常与退变的人类髓核细胞 | 数字病理学 | 脊椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 274 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq of Drosophila miranda testis reveals the evolution and trajectory of germline sex chromosome regulation
2024-Apr, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002605
PMID:38687805
|
研究论文 | 这篇文章揭示了发育中性染色体的调控及其对性染色体结构演化的影响 | 本研究利用D. miranda的年轻性染色体,展示了以前的常染色体是如何获得特定于性染色体的调控程序 | 本研究主要集中在D. miranda的性染色体,可能不适用于其他物种 | 研究性染色体的演变及生殖系调控机制 | 使用单细胞和大规模RNA测序分析D. miranda的生殖细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2024-08-04 |
Studying plant vascular development using single-cell approaches
2024-04, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2024.102526
PMID:38479078
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研究论文 | 研究通过单细胞方法理解植物血管发育 | 总结和反思了最近使用单细胞转录组技术研究血管细胞类型的新进展 | NA | 理解血管细胞发育中的转录调控 | 植物血管细胞及其发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-08-05 |
[Jisuikang formula promotes spinal cord injury repair in rats by activating the YAP/PKM2 signaling axis in astrocytes]
2024-Apr-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
|
研究论文 | 该文章研究了Jisuikang方剂对大鼠脊髓损伤修复的促进作用及其可能机制 | 该研究首次揭示了Jisuikang通过激活PKM2/YAP信号通路促进星形胶质细胞有氧糖酵解,从而加速脊髓损伤修复的作用 | 该研究主要在动物模型中进行,临床应用效果尚需进一步验证 | 探讨Jisuikang方剂在促进脊髓损伤修复中的作用及其机制 | 研究对象为成年SD大鼠,观察其脊髓损伤后的修复情况 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 (细胞、组织) | 30只成年SD大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-08-05 |
The IRG1-itaconate axis protects from cholesterol-induced inflammation and atherosclerosis
2024-Apr-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2400675121
PMID:38564634
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研究论文 | 本研究测试了IRG1-itaconate轴在治疗人类动脉粥样硬化方面的潜力 | 本研究首次揭示了IRG1-itaconate轴在动脉粥样硬化中的免疫调节作用,并且使用4-OI进行补充能够改善淋巴结病变 | 本研究主要集中在小鼠模型和体外实验上,人类临床应用效果需要进一步验证 | 探讨IRG1-itaconate轴作为动脉粥样硬化治疗策略的有效性 | 研究对象包括人类患有动脉粥样硬化的患者及小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和CyTOF | NA | 血液样本 | 本研究使用了心血管疾病患者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2024-08-05 |
Immunological Characteristics of Hepatic Dendritic Cells in Patients and Mouse Model with Liver Echinococcus multilocularis Infection
2024-Apr-25, Tropical medicine and infectious disease
IF:2.8Q1
DOI:10.3390/tropicalmed9050095
PMID:38787028
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研究论文 | 本文探讨了肝脏包虫感染患者和小鼠模型中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 首次系统分析了肝脏树突状细胞亚群在肝脏包虫感染中表现出的免疫表型特征 | 未深入探讨不同小鼠模型对免疫特征的影响 | 研究肝脏包虫感染微环境中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 临床包虫感染患者和小鼠模型中的肝脏树突状细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 组织样本 | 四个包虫感染患者标本和感染小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 279 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a lactate metabolism-related six-gene prognostic signature in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Apr-16, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05723-4
PMID:38627278
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研究论文 | 本文揭示了乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用,并构建了一个可靠的乳酸代谢相关预后标志。 | 文章首次系统性地识别和验证了与乳酸代谢相关的六个基因的预后标志,提供了新思路用于肝内胆管癌的预后评估和治疗。 | 研究对乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学功能的探索仍然有限,需要更多的临床数据来验证。 | 研究目的是明确乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用,开发预后工具。 | 研究对象为肝内胆管癌患者及其相关细胞系。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 高和低乳酸代谢相关基因得分组中的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 280 | 2024-08-04 |
A transcriptomics-based RNAi screen for regulators of meiosis and early stages of oocyte development in Drosophila melanogaster
2024-04-03, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkae028
PMID:38333961
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研究论文 | 该研究通过转录组学方法识别果蝇卵巢中与减数分裂和早期卵母细胞发育相关的调控基因 | 采用转录组学分析结合已发表的单细胞RNA-seq数据,找到2743个共表达基因,其中许多与减数分裂和卵母细胞发育相关 | 研究主要集中在已知的基因上,可能忽略了其他未被充分阐明的基因的功能 | 识别早期卵母细胞发育和减数分裂中涉及的基因 | 以果蝇卵巢为对象,分析早期发育过程中的基因表达与功能 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因组数据 | 分析了3个已发表的单细胞RNA-seq数据集,共测试了526条RNAi线路 | NA | NA | NA | NA |