单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-05 |
Immune Characteristic Genes and Neutrophil Immune Transformation Studies in Severe COVID-19
2024-Apr-04, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12040737
PMID:38674681
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研究论文 | 本研究识别了六个与 COVID-19 重症相关的免疫特征基因，并探讨了中性粒细胞在重症中的免疫转化。 | 本研究首次确定了 COVID-19 重症的免疫特征基因和关键免疫细胞，以及中性粒细胞的转变机制。 | 本研究的免疫特征基因和细胞机制尚需在更大规模的研究中验证。 | 探讨 COVID-19 重症的免疫病理特征及中性粒细胞的免疫转化过程。 | 研究对象为 COVID-19 重症患者外周血和支气管肺泡灌洗液中的细胞。 | 数字病理学 | COVID-19 | mRNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自 COVID-19 患者的外周血和支气管肺泡灌洗液样本 |
| 262 | 2024-08-04 |
GTADC: A Graph-Based Method for Inferring Cell Spatial Distribution in Cancer Tissues
2024-Apr-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040436
PMID:38672453
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图的方法GTADC，旨在推断癌症组织中细胞的空间分布。 | GTADC通过利用轮廓得分来捕捉细胞类型内具有显著表达差异的基因，相较于传统方法增强了基因选择的准确性。 | 传统分析方法在处理癌细胞与正常细胞之间的基因表达差异时并不够准确，依赖于统计方法可能无法精确捕捉细胞类型的差异。 | 研究旨在更深入了解早期癌症，并为早期癌症诊断提供潜在支持。 | 研究对象为癌症组织中的细胞，特别是识别不同细胞类型的空间组合。 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学（ST）和单细胞测序（scRNA-seq） | 图神经网络 | 基因表达数据 | NA |
| 263 | 2024-08-05 |
Tumor Cell-Derived Complement Component C1r Acts as a Prognostic Biomarker and Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression
2024-Apr-02, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2904138
PMID:38682192
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研究论文 | 本研究探讨了C1r在食道鳞状细胞癌（ESCC）中的表达模式及其肿瘤促进作用 | C1r被发现不仅作为预后生物标志物，还促进了食道鳞状细胞癌的进展 | 本研究可能未全面揭示C1r其他潜在的肿瘤相关功能 | 旨在调查C1r在食道鳞状细胞癌中的作用及其相关机制 | 食道鳞状细胞癌组织、恶性上皮细胞以及培养的ESCC细胞 | 数字病理学 | 食道癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Western blotting | 无毛小鼠模型 | 组织样本、细胞培养样本 | 样本数量未具体提及，涉及ESCC组织、恶性上皮细胞和小鼠实验 |
| 264 | 2024-08-05 |
Single-cell insights: pioneering an integrated atlas of chromatin accessibility and transcriptomic landscapes in diabetic cardiomyopathy
2024-Apr-25, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02233-y
PMID:38664790
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病性心肌病中细胞状态和分子变化的复杂性 | 整合了scRNA-seq和scATAC-seq数据，提供了对糖尿病性心肌病进展的单细胞水平理解 | 本研究主要集中在小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 深入了解糖尿病性心肌病(DCM)中的细胞状态和分子特征 | 从WT小鼠和DCM小鼠心脏中提取的单细胞RNA和ATAC数据 | 数字病理学 | 糖尿病性心肌病 | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 单细胞RNA和ATAC数据 | 从10个小鼠心脏提取的单细胞数据 |
| 265 | 2024-08-05 |
[Microglia differential genes and their functions in paraquat-induced Parkinson's disease-like in mice's brains based on single-cell RNA sequencing]
2024-Apr-20, Zhonghua lao dong wei sheng zhi ye bing za zhi = Zhonghua laodong weisheng zhiyebing zazhi = Chinese journal of industrial hygiene and occupational diseases
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研究论文 | 分析了在草甘膦诱导的帕金森病小鼠大脑中小胶质细胞亚群的差异基因及其相关信号通路 | 首次识别了在PQ诱导的PD样小鼠模型中小胶质细胞子群的差异基因及其功能 | 样本量较小，仅有六只小鼠，并且只分析了特定的基因功能 | 阐明草甘膦诱导的小胶质细胞在帕金森病样改变中的作用机制 | 小鼠的脑部小胶质细胞亚群及其差异基因 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六只6周龄的C57BL/6小鼠 |
| 266 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Heterogeneity and Transcriptional Dynamics in Porcine Circulating CD8+ T Cells
2024-Apr-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080692
PMID:38667307
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了猪外周血循环CD8+ T细胞的异质性和转录动态 | 首次揭示了猪外周血中CD8 T细胞亚群的广泛功能异质性和状态转变 | 未详细探讨CD8 T细胞亚群在不同生理或病理条件下的功能 | 研究猪CD8 T细胞的异质性及其转录动态 | 猪外周血中循环CD8 T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从猪外周血中提取的多种细胞类型 |
| 267 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the complex cellular niche of pterygium
2024-Apr, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.01.013
PMID:38290663
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了翼状胬肉的复杂细胞环境 | 首次确定了促进翼状胬肉的新的细胞亚群和细胞间相互作用 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行更广泛的临床验证 | 揭示翼状胬肉的病理机制及潜在治疗靶点 | 翼状胬肉患者和正常对照的结膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 45605个细胞来自翼状胬肉患者和正常对照 |
| 268 | 2024-08-04 |
Pan-cancer analysis implicates novel insights of lactate metabolism into immunotherapy response prediction and survival prognostication
2024-Apr-25, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03042-7
PMID:38664705
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研究论文 | 该文章探讨了乳酸代谢与免疫治疗反应之间的关系及其在癌症预后中的应用 | 提出了一个与乳酸代谢相关的新标记（LM.SIG），用于预测免疫治疗反应和生存预后 | 研究依赖于公开的转录组数据，可能存在样本选择偏差 | 揭示乳酸代谢对免疫治疗反应的影响并预测癌症患者的生存状况 | 分析接受免疫治疗的癌症患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 40个泛癌症单细胞RNA测序队列和8个免疫治疗转录组队列以及30个TCGA数据集 |
| 269 | 2024-08-05 |
Loss of Y in regulatory T lymphocytes in the tumor micro-environment of primary colorectal cancers and liver metastases
2024-04-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60049-y
PMID:38658633
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研究论文 | 该文章研究了原发性结直肠癌和肝转移癌的肿瘤微环境中调节性T淋巴细胞Y染色体缺失的频率和功能影响 | 首次探讨了肿瘤微环境中浸润性白血球中的Y染色体缺失与结直肠癌的关系 | 目前仅关注了调节性T淋巴细胞，未能探讨其他类型淋巴细胞的影响 | 研究肿瘤微环境中Y染色体缺失在结直肠癌发生中的作用 | 研究对象为血液、肿瘤微环境和非肿瘤组织中的细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 在肿瘤微环境中调节性T淋巴细胞的Y染色体缺失频率为22% |
| 270 | 2024-08-04 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals the alterations in epithelial cells during nodular formation in benign prostatic hyperplasia
2024-Apr-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05212-9
PMID:38654277
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研究论文 | 本研究揭示了良性前列腺肥大（BPH）中上皮细胞在结节形成过程中的变化 | 研究首次识别了BE5这一基底上皮细胞亚组，并探讨了其在缺氧诱导的上皮-间充质转化过程中的重要作用 | 技术限制影响了在BPH患者体内进行深入研究 | 探究良性前列腺肥大中结节形成过程中上皮细胞的变化机制 | 良性前列腺肥大患者的上皮细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 生物组织样本 | NA |
| 271 | 2024-08-05 |
An autophagy program that promotes T cell egress from the lymph node controls responses to immune checkpoint blockade
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114020
PMID:38554280
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研究论文 | 本文研究了淋巴结中淋巴内皮细胞如何通过自噬程序促进T细胞从淋巴结的离开。 | 首次系统阐明了淋巴内皮细胞如何调控T细胞动态及其在肿瘤免疫检查点治疗中的作用 | 缺乏在不同免疫监视环境下的系统比较分析 | 探讨淋巴内皮细胞自噬在调控T细胞动态和免疫治疗反应中的角色 | 主要研究淋巴结中的淋巴内皮细胞及其对T细胞行为的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和活体成像 | NA | 生物学数据, RNA测序数据 | 肿瘤引流淋巴结的样本 |
| 272 | 2024-08-05 |
Stem cell-derived vessels-on-chip for cardiovascular disease modeling
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114008
PMID:38536819
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研究论文 | 本文构建了一个基于人类干细胞衍生内皮细胞的微流控血管芯片平台，以模拟心血管疾病 | 该研究首次实现了干细胞衍生内皮细胞的成熟，包括屏障形成、动脉调节和在重力驱动流动下的高水平一氧化氮合成 | 在流动条件下的研究中涉及的样本体积和细胞数量较低 | 研究旨在更好地理解血管功能障碍并指导临床治疗 | 研究对象为人类多能干细胞衍生的内皮细胞，主要用于模拟动脉粥样硬化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、质谱蛋白组学、高分辨率成像 | 微流控芯片 | 细胞、蛋白质组 | 低样本体积和细胞数量的样本 |
| 273 | 2024-08-05 |
scGAL: unmask tumor clonal substructure by jointly analyzing independent single-cell copy number and scRNA-seq data
2024-Apr-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10319-w
PMID:38649804
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研究论文 | 该文章介绍了一种新型混合模型scGAL，用于推断肿瘤克隆拷贝数亚结构 | scGAL结合了自编码器和生成对抗网络，能够联合分析单细胞拷贝数和基因表达数据，克服拷贝数数据中的噪声影响 | 可能仍受到个别数据集特征和技术限制的影响 | 准确解码肿瘤克隆拷贝数亚结构以提供癌症的演化机制见解 | 真实癌症数据集中的单细胞拷贝数和基因表达数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | scDNA-seq | 生成对抗网络 | 拷贝数数据和基因表达数据 | 三个真实癌症数据集 |
| 274 | 2024-08-05 |
Discrete-state models identify pathway specific B cell states across diseases and infections at single-cell resolution
2024-04-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2024.111769
PMID:38423206
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研究论文 | 该文章研究了在健康和疾病状况下B细胞的特定状态。 | 开发了基于状态的离散模型，利用单细胞RNA测序数据来识别与氧调控通路相关的B细胞状态。 | 研究仅限于已发布的单细胞RNA测序数据，可能忽略其他重要因素。 | 理解B细胞在感染、疫苗接种和其他疾病中的状态及其调节方式。 | 研究不同疾病和感染中的B细胞状态及其转变。 | 数字病理学 | 乳腺癌, HIV | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 离散状态模型 | 基因表达数据 | NA |
| 275 | 2024-08-05 |
YTE-17 inhibits colonic carcinogenesis by resetting antitumor immune response via Wnt5a/JNK mediated metabolic signaling
2024-Apr, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.11.008
PMID:38665223
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研究论文 | 本研究探讨了YTE-17通过Wnt5a/JNK介导的代谢信号通路抑制结肠癌发生的机制 | 本研究首次揭示YTE-17通过影响肿瘤微环境中的免疫细胞平衡来预防结直肠癌 | 关于YTE-17在预防结直肠癌的机制了解仍有限 | 探索YTE-17在结直肠癌预防中的潜在作用 | 研究对象包括暴露于YTE-17的肠上皮细胞及其在结肠癌模型中的免疫微环境 | 数字病理学 | 结肠癌 | iTRAQ分析、单细胞RNA测序 | 参与性癌症模型 | 组织样本 | 不同阶段的结肠癌模型样本 |
| 276 | 2024-08-05 |
Supermultipotency and unpredictability in the developing superior colliculus
2024-Apr, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2024.03.001
PMID:38514350
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研究论文 | 这项研究揭示了在发育中的上丘脑中存在的多能性和不可预测性特征 | 发现极具多能性的独立前体细胞能生成所有类型的上丘脑神经元和神经胶质细胞，并以非预定模式定位 | NA | 研究上丘脑发育过程中的细胞行为特征 | 单细胞RNA测序分析的上丘脑前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of CYBB as a prognostic marker and therapeutic target in glioma: A bioinformatics approach
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29549
PMID:38655339
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研究论文 | 本文综合分析了CYBB作为神经胶质瘤的预后标志物和治疗靶点 | 建立了基于CYBB和线粒体基因的预后模型，揭示其在神经胶质瘤患者预后中的潜在应用 | 未提及具体的样本数量和研究的局限性 | 识别新的标志基因并建立预后模型以改善神经胶质瘤的早期诊断和预后判断 | 研究对象为神经胶质瘤患者及其临床病理特征 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞测序，生物信息学分析 | 10基因预后模型 | 基因表达数据 | 7名神经胶质瘤患者的单细胞测序数据 |
| 278 | 2024-08-04 |
Identifying MS4A6A+ macrophages as potential contributors to the pathogenesis of nonalcoholic fatty liver disease, periodontitis, and type 2 diabetes mellitus
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29340
PMID:38644829
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研究论文 | 本研究识别了MS4A6A+巨噬细胞作为非酒精性脂肪肝病、牙周炎和2型糖尿病发病机制的重要贡献者 | 首次确定了MS4A6A+巨噬细胞在多种疾病交互作用中的重要性 | 缺乏临床验证和更大样本量的支持 | 探讨非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病和牙周炎之间的共同机制 | 分析与NAFLD、T2DM和PD相关的数据集及其差异表达基因 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病、牙周炎 | 单细胞测序、免疫组织化学染色 | LASSO算法 | 基因表达数据 | 三个疾病相关的数据集中识别了25个共享的差异表达基因 |
| 279 | 2024-08-05 |
DPSCs regulate epithelial-T cell interactions in oral submucous fibrosis
2024-Apr-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03720-5
PMID:38650025
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研究论文 | 本文研究了牙髓干细胞（DPSCs）如何调节口腔亚粘膜纤维化（OSF）中的上皮细胞-T细胞相互作用。 | 发现了一种独特的上皮细胞群体Epi1.2，具有促炎和促纤维化功能，揭示了它们与T细胞的相互作用在OSF中的重要机制。 | 本研究在探讨OSF的致病机制时仍存在一些不确定性，需要进一步验证和探索。 | 探索口腔亚粘膜纤维化(OSF)的致病机制，并基于此寻找新的治疗选择。 | 研究对象主要是口腔粘膜组织中的单细胞群体，尤其是Epi1.2上皮细胞及其与免疫细胞的相互作用。 | 数字病理学 | 口腔亚粘膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 细胞数据 | 通过人类细胞图谱汇编的数据，以及在动物模型和临床病理切片中的验证 |
| 280 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals segregation of tumor cell states in glioblastoma and marked immunosuppression within the perinecrotic niche
2024-Apr-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01769-0
PMID:38650010
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤细胞状态的分隔和缺血微环境中的明显免疫抑制。 | 利用空间转录组学技术，我们首次展示了胶质母细胞瘤中不同肿瘤细胞状态的空间定位和分隔。 | 研究样本量较小，仅为三名胶质母细胞瘤患者，可能限制了结果的推广性。 | 旨在深入了解胶质母细胞瘤微环境中的肿瘤细胞状态及其空间分布。 | 研究对象为三名胶质母细胞瘤患者的肿瘤微环境和相关细胞状态。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 10x Chromium单细胞RNA测序（snRNA-seq）和空间转录组学数据 | NA | RNA数据 | 3名胶质母细胞瘤患者 |