单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 491 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-04 |
SOX18 meditates the resistance of Bmi1-expressing cells to cetuximab in HNSCC
2024-04, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.14596
PMID:37184032
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研究论文 | 本研究发现了Bmi1表达细胞在cetuximab治疗下的抗药性机制 | 首次揭示了SRY-box转录因子18(SOX18)在HNSCC中促进Bmi1表达细胞对cetuximab抗性的作用 | 研究中未提及相关临床试验或样本的数据 | 探讨SOX18在Bmi1阳性细胞中的调节机制并寻找更好的治疗靶点 | Bmi1表达细胞及其在HNSCC中的作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 免疫组化, 免疫荧光, 西方印迹法 | NA | NA | 使用了Bmi1CreER, RosatdTomato, 和RosaDTA小鼠进行相关研究 | NA | NA | NA | NA |
| 262 | 2024-08-05 |
METTL3-mediated ALDH m6A methylation regulates the malignant behavior of BMI1+ HNSCC stem cells
2024-04, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.14609
PMID:37249063
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研究论文 | 本研究揭示了甲基转移酶样蛋白3（METTL3）对头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）癌症干细胞的影响及其机制 | 首次揭示METTL3通过SOX4调节BMI1+ HNSCC癌症干细胞的恶性行为和细胞分裂通路 | 本研究未详细探讨METTL3在其他癌症类型中的作用 | 研究METTL3对HNSCC癌症干细胞的影响及其机制 | BMI1+ HNSCC癌症干细胞 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、MeRIP测序 | 小鼠模型 | 基因组数据 | 14名HNSCC患者的样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2024-08-04 |
Single Cell Atlas: a single-cell multi-omics human cell encyclopedia
2024-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03246-2
PMID:38641842
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研究论文 | 构建了一个包含人类组织的单细胞多组学地图 | 首次整合五种单细胞组学、空间转录组学和两种体积组学的数据，形成全面的单细胞多组学图谱 | 未提及特定的局限性 | 旨在深入探索健康成人和胎儿组织中的异质细胞群体 | 涉及125个健康成人和胎儿组织的细胞样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 组学数据 | 125个健康成人和胎儿组织 | NA | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-08-04 |
spVC for the detection and interpretation of spatial gene expression variation
2024-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03245-3
PMID:38641849
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研究论文 | 提出了一种基于广义泊松模型的统计方法spVC，用于检测和解释空间基因表达的变异性 | spVC集成了常量和空间变化的协变量效应，克服了现有方法的局限性 | 当前研究未提及样本多样性或样本大小的限制 | 旨在提高对空间基因表达变异性理解的深度和准确性 | 研究针对空间基因表达变异性 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | 广义泊松模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-08-04 |
Powerful and accurate detection of temporal gene expression patterns from multi-sample multi-stage single-cell transcriptomics data with TDEseq
2024-04-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03237-3
PMID:38622747
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为TDEseq的非参数统计方法，旨在从单细胞转录组数据中检测时间基因表达模式 | TDEseq利用平滑样条基函数和分层结构线性加性混合模型，增强了对时间点相关性的处理能力 | NA | 提高在单细胞转录组研究中识别时间基因表达模式的准确性和能力 | 特定细胞类型中的时间表达模式 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 分层结构线性加性混合模型 | 转录组数据 | 分析了四个已发布的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 266 | 2024-08-05 |
Demuxafy: improvement in droplet assignment by integrating multiple single-cell demultiplexing and doublet detection methods
2024-04-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03224-8
PMID:38622708
|
研究论文 | 本研究开发了Demuxafy框架，通过整合多种单细胞去重和双细胞检测方法，提升了单细胞RNA测序中的供体分配和双细胞去除的准确性 | Demuxafy框架通过多个去重和双细胞检测方法的共识交集，显著提高了液滴分配的准确性 | NA | 提高单细胞RNA测序中液滴分配和双细胞去除的准确性 | 液滴，单细胞RNA测序样本 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 液滴 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 267 | 2024-08-05 |
Merit of integrating in situ transcriptomics and anatomical information for cell annotation and lineage construction in single-cell analyses of Populus
2024-04-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03227-5
PMID:38570851
|
研究论文 | 本文强调结合原位转录组学和解剖信息以构建波普勒斯（Populus）单细胞分析中的细胞注释和谱系构建模型的必要性 | 提出了采用原位转录组和解剖信息来改进细胞类型注释和谱系构建的方法 | NA | 研究波普勒斯的单细胞RNA测序中的细胞类型注释和谱系构建 | 四个关于分化木质部分的单细胞RNA测序研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2024-08-05 |
Advances in the role of circulating tumor cell heterogeneity in metastatic small cell lung cancer
2024-Apr, Cancer innovation
DOI:10.1002/cai2.98
PMID:38946931
|
研究论文 | 本文深入探讨了小细胞肺癌中循环肿瘤细胞的异质性及其在诊断和预后中的价值 | 讨论了旋转肿瘤细胞的表型分析如何预测转移性肿瘤的新潜在靶标的诊断意义 | 当前小细胞肺癌的治疗方式变化有限，免疫检查点抑制剂对大多数患者的疗效低 | 研究循环肿瘤细胞在小细胞肺癌转移中的作用及其对患者预后的影响 | 循环肿瘤细胞在小细胞肺癌患者中的异质性 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-08-05 |
Beneficial mechanisms of dimethyl fumarate in autoimmune uveitis: insights from single-cell RNA sequencing
2024-Apr-29, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03096-6
PMID:38684986
|
研究论文 | 该研究探讨了二甲基富马酸酯在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 通过单细胞RNA测序，揭示了DMF在自身免疫性葡萄膜炎中影响免疫细胞渗透的潜在机制 | 当前研究缺乏对DMF在自身免疫性葡萄膜炎中全面作用的深入探索 | 研究DMF在自身免疫性葡萄膜炎中的功能及其潜在机制 | 正常小鼠、实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及DMF处理的实验小鼠 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 正常小鼠、实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠和DMF处理的实验小鼠的颈部引流淋巴结细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2024-08-05 |
Satellite Cell-Derived Exosomes: A Novel Approach to Alleviate Skeletal Muscle Atrophy and Fibrosis
2024-04, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300558
PMID:38329214
|
研究论文 | 这项研究探讨了来自骨骼肌卫星细胞的外泌体在缓解骨骼肌萎缩和纤维化中的作用 | 引入了骨骼肌卫星细胞产生的外泌体作为治疗骨骼肌萎缩和纤维化的新方法 | 缺乏长期疗效的研究数据和在不同动物模型上的验证 | 研究骨骼肌卫星细胞外泌体在治疗骨骼肌萎缩和纤维化中的潜在应用 | Sprague Dawley (SD) 大鼠的去神经骨骼肌 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了去神经的Sprague Dawley (SD) 大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 271 | 2024-08-05 |
Suppression of Type I Interferon Signaling in Myeloid Cells by Autoantibodies in Severe COVID-19 Patients
2024-Apr-22, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-024-01708-7
PMID:38647550
|
研究论文 | 本文研究了自身抗体对一型干扰素信号传导的抑制作用，以及其在重症COVID-19患者中的机制 | 首次揭示了重症COVID-19患者中一型干扰素自身抗体如何通过阻止干扰素与其受体结合来抑制信号传导 | 研究中缺乏对自身抗体对临床特征的具体影响的深入分析 | 探索自身抗体对一型干扰素在COVID-19加重中的作用机制 | 重症和危重症COVID-19患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 血浆样本 | 123名COVID-19患者的血浆 | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2024-08-04 |
Comparative single-cell transcriptomic profile of hybrid immunity induced by adenovirus vector-based COVID-19 vaccines
2024-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00270-x
PMID:38570727
|
研究论文 | 本研究比较了不同COVID-19疫苗诱导的混合免疫的单细胞转录组特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析探讨了不同COVID-19疫苗对B细胞和T细胞亚群的影响 | 样本量相对较小，仅在五个不同组别中进行比较 | 研究不同COVID-19疫苗诱导的免疫应答特征 | 来自疫苗接种者和COVID-19恢复者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 五个不同组别的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 273 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Epstein-Barr Virus-Associated Hemophagocytic Lymphohistiocytosis
2024-Apr-20, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-024-01701-0
PMID:38642164
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序表征EBV-HLH的免疫特征并与EBV-IM进行比较 | 首次详细探讨了IFNγ及其他细胞因子在EBV-HLH中的作用 | 样本数量较少，仅包括三名EBV-HLH患者 | 研究EBV感染引发的EBV-HLH的免疫反应特点 | 三名背景不同的EBV-HLH儿童患者及两名EBV-IM患者 | 数字病理学 | EB病毒相关淋巴组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 五名患者，包括三名EBV-HLH患者和两名EBV-IM患者 | NA | NA | NA | NA |
| 274 | 2024-08-05 |
Overexpressed KCNK1 regulates potassium channels affecting molecular mechanisms and biological pathways in bladder cancer
2024-Apr-30, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01844-1
PMID:38689322
|
研究论文 | 本研究旨在探讨KCNK1在膀胱癌中的表达、分子机制及其生物功能 | 首次揭示KCNK1在膀胱癌中的过表达及其在三维空间中的复杂转录调控网络 | 未在不同种族或其他类型癌症中验证KCNK1的角色 | 研究KCNK1在膀胱癌中的作用及其潜在分子机制 | 膀胱癌患者的KCNK1表达及其与临床特征的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、ChIP-seq、ATAC-seq、ChIA-PET | NA | mRNA、蛋白质、免疫组化数据 | 外部样本1486，内部样本245 | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2024-08-04 |
TGFβ-Responsive Stromal Activation Occurs Early in Serrated Colorectal Carcinogenesis
2024-Apr-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094626
PMID:38731846
|
研究论文 | 该研究揭示了TGFβ激活的基质在锯齿状结直肠癌发生中的作用 | 文章提出了TGFβ依赖的基质激活在锯齿状肿瘤发生早期的关系 | 未提及具体的实验验证或临床相关性 | 阐明TGFβ激活的基质在锯齿状癌发生中的贡献 | 研究对象为39个结直肠癌样本和12个大规模转录组样本，分析其基质细胞的转录特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39个结直肠癌样本和2014个其他样本 | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-08-05 |
Changes in seminal plasma microecological dynamics and the mechanistic impact of core metabolite hexadecanamide in asthenozoospermia patients
2024-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.166
PMID:38882497
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研究论文 | 本研究探讨了在精液微生态动态变化中核心代谢物十六烷酰胺对弱精子症患者的影响 | 揭示了精液中六种微生物属与核心代谢物十六烷酰胺之间的显著关联，及其提高精子活力的潜力 | 尚未清楚微生态与男性不育的直接关系 | 研究精液微生态动态与弱精子症之间的关系 | 弱精子症患者，分为正常、轻度、中度和重度四组 | 数字病理学 | 男性不育症 | 16S rDNA测序和多组学分析 | NA | 精液样本 | 四组弱精子症患者，具体样本量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-08-04 |
A Single-cell and Spatial RNA-seq Database for Alzheimer's Disease (ssREAD)
2024-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.08.556944
PMID:37745592
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研究论文 | 本文介绍了针对阿尔茨海默病的单细胞与空间RNA测序数据库ssREAD | 创建了一个用户友好的数据库，整合了广泛的阿尔茨海默病相关数据集，并优化了分析流程 | NA | 建立一个全面的数据库以满足阿尔茨海默病相关数据管理和分析需求 | 阿尔茨海默病相关的单细胞RNA测序和空间转录组研究 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学（ST） | NA | 细胞数据集 | 1,053个样本（277个整合数据集），共计7,332,202个细胞和381个空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2024-08-05 |
A multi-organ map of the human immune system across age, sex and ethnicity
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.542671
PMID:38746418
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研究论文 | 本文创建了一个全面的健康人类免疫系统组成和转录的地图，涵盖不同年龄、性别和种族的免疫细胞分布和互动 | 创新点在于使用了新的多层建模方法来追踪免疫衰老并测试性别和种族的差异 | 尚未提及具体的局限性 | 研究目的在于填补关于人免疫系统在不同人群中分布和交互的知识空白 | 研究对象包括来自45个解剖部位的12,981个单细胞RNA测序样本和2900万细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 多层建模 | 细胞 | 12,981个单细胞RNA测序样本，来自45个不同的解剖部位 | NA | NA | NA | NA |
| 279 | 2024-08-04 |
PRKDC-Mediated NHEJ May Play a Crucial Role in Aneuploidy of Chromosome 8-Driven Progression of Ovarian Cancer
2024-Apr-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094825
PMID:38732044
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研究论文 | 本研究探讨了PRKDC介导的非同源末端连接（NHEJ）在卵巢癌染色体8非整倍体进展中的重要作用 | 该研究揭示了剪接的功能分析和非同源末端连接途径如何影响卵巢癌的后期非整倍体特征，具有重要的创新意义 | 该研究的局限性在于缺乏对其他染色体非整倍体的全面分析 | 研究卵巢癌进展中的非整倍体特征及其分子机制 | 卵巢上皮癌中的非整倍体和拷贝数变异 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序和荧光原位杂交（FISH） | NA | 基因组数据 | 使用了癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合数据库（GEO）中的相关数据 | NA | NA | NA | NA |
| 280 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptional Profile Construction of Rat Pituitary Glands before and after Sexual Maturation and Identification of Novel Marker Spp1 in Gonadotropes
2024-Apr-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094694
PMID:38731915
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组技术构建了大鼠垂体在性成熟前后的转录谱并识别出新的标记物Spp1。 | 首次研究了性成熟前后大鼠垂体组织的单细胞差异，发现106个差异表达基因并确认Spp1作为新标记物。 | 未涉及不同物种或性别在性成熟前后的细胞差异。 | 探讨性成熟对大鼠垂体细胞转录组特征的影响。 | 大鼠垂体细胞，特别是促性腺细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |