单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analysis reveals the tumour microenvironment in patients with endometrial cancer responding to anti-PD-1 treatment
2024-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1668
PMID:38649737
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-08-04 |
Stratification and prognostic evaluation of breast cancer subtypes defined by obesity-associated genes
2024-Apr-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00988-0
PMID:38676834
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研究论文 | 研究探讨与肥胖相关基因定义的乳腺癌亚型的分层与预后评估 | 识别了七个中心基因作为乳腺癌的分子诊断生物标志物，并提出了通过神经网络模型进行有效的诊断 | 七个中心基因作为预后分子标志物表现不佳，生存预测AUC值大多数低于0.5 | 研究肥胖作为乳腺癌风险因素对其机制的影响 | 1226名乳腺癌患者，其被分为BRCA亚型1和亚型2 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qRT-PCR，RNA转录组数据分析 | 神经网络模型 | 基因表达数据 | 1226名乳腺癌患者 |
| 243 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of metabolomics and transcriptomics to uncover biomarkers in sepsis
2024-04-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59400-0
PMID:38678059
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研究论文 | 利用代谢组学结合RNA测序识别脓毒症患者血液中的生物标志物并发现新的诊断和治疗靶点 | 首次联合应用代谢组学和转录组学，鉴定脓毒症特异性生物标志物和靶基因 | 样本量较小，仅包含16个脓毒症患者和11个系统性炎症反应综合症患者 | 识别脓毒症的生物标志物和潜在靶点 | 脓毒症患者和系统性炎症反应综合症患者的血液样本 | 数字病理学 | 脓毒症 | 液相色谱-质谱联用技术（LC-MS/MS）和RNA测序 | NA | 代谢物和基因数据 | 16个脓毒症患者和11个SIRS患者的血液样本 |
| 244 | 2024-08-04 |
Single-cell analyses reveal transient retinal progenitor cells in the ciliary margin of developing human retina
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47933-x
PMID:38670973
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研究论文 | 本研究提供了对人类视网膜发育过程中视网膜祖细胞的单细胞特征分析 | 本研究展示了在人的视网膜发育过程中，早期视网膜祖细胞的瞬态存在及其向神经祖细胞转变的过程 | 本研究的样本仅限于人类发育到中期的视网膜样本 | 研究视网膜发育过程中视网膜祖细胞的特征及其分化过程 | 视网膜祖细胞及其在视网膜发育过程中的转变 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序与空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 早期眼样本 |
| 245 | 2024-08-04 |
Ptch1 is essential for cochlear marginal cell differentiation and stria vascularis formation
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114083
PMID:38602877
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研究论文 | 本文探讨了Ptch1在耳蜗边缘细胞分化和血管条形成中的重要性 | 发现Ptch1对边缘细胞分化和SV形成至关重要，并揭示了Ptch1-Gli2轴在耳蜗发展中的关键作用 | 未明确提及具体的实验限制或样本限制 | 研究耳蜗非感官上皮细胞的早期特化及其在听力中的作用 | 研究耳蜗边缘细胞及其分化过程 | 数字病理学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | Shh信号突变体 | 基因表达数据 | 涉及的样本数量和类型未明确说明 |
| 246 | 2024-08-05 |
Regulation of muscle hypertrophy through granulin: Relayed communication among mesenchymal progenitors, macrophages, and satellite cells
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114052
PMID:38573860
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研究论文 | 该文章探讨了通过granulin调节肌肉肥大，并分析了间充质祖细胞、巨噬细胞和卫星细胞之间的通讯 | 该研究揭示了granulin在间充质祖细胞、巨噬细胞和MuSC之间的中介通讯在肌肉肥大中的关键作用 | 该研究的局限性在于对肌肉适应的细胞网络理解不足，相较于肌肉再生的研究较少 | 研究肌肉在过载和再生过程中细胞网络的变化及其在肌肉肥大中的调节作用 | 研究对象是过载肌肉和再生肌肉中的细胞组成及其基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 4天过载肌肉和10天再生肌肉 |
| 247 | 2024-08-05 |
MAFB in macrophages regulates cold-induced neuronal density in brown adipose tissue
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113978
PMID:38522069
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子MAFB在冷诱导的棕色脂肪组织中调节巨噬细胞功能的作用 | 揭示了MAFB缺乏与棕色脂肪组织热生热能力下降和神经元密度减少之间的关系 | 缺乏针对其他环境因素的综合分析 | 研究MAFB在巨噬细胞中对棕色脂肪组织中的热生热和神经密度的影响 | 使用巨噬细胞特异性MAFB缺陷小鼠来观察冷环境中的生理变化 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用巨噬细胞特异性MAFB缺陷小鼠，样本数未具体说明 |
| 248 | 2024-08-04 |
Single-Cell DNA Sequencing Reveals an Evolutionary Pattern of CHIP in Transplant Eligible Multiple Myeloma Patients
2024-Apr-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080657
PMID:38667272
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研究论文 | 这篇文章揭示了在符合移植条件的多发性骨髓瘤患者中CHIP的进化模式 | 使用高通量扩增子单细胞DNA测序技术揭示了CHIP的病理突变及其在患者中的选择性扩增 | 研究样本量相对较小，仅涉及12名患者，结果可能不具广泛适用性 | 研究多发性骨髓瘤患者中CHIP的进化模式及其对治疗反应的影响 | 符合自体干细胞移植条件的多发性骨髓瘤患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞DNA测序 | NA | 基因组数据 | 12名多发性骨髓瘤患者的循环CD34+细胞 |
| 249 | 2024-08-05 |
Synergistic induction of tertiary lymphoid structures by chemoimmunotherapy in bladder cancer
2024-Apr, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02598-7
PMID:38332180
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研究论文 | 本文研究了在膀胱癌中，通过化疗和免疫疗法的联合使用促进三级淋巴结构的形成 | 首次系统评估了化疗和免疫疗法对膀胱癌患者免疫反应和淋巴结构成熟的联合效应 | 未提供对其他类型癌症的验证或比较研究 | 探讨其他治疗方式与免疫疗法联合使用以提高膀胱癌患者免疫反应的可能性 | 膀胱癌患者，特别是接受免疫检查点抑制剂治疗的患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | RNA数据 | 包括接受免疫检查点抑制剂和化疗的膀胱癌患者相关样本 |
| 250 | 2024-08-05 |
Comprehensive Analysis of a Dendritic Cell Marker Genes Signature to Predict Prognosis and Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2024-Apr-29, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000521
PMID:38679823
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研究论文 | 这项研究构建了一种新的树突状细胞标记基因特征，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 提出了一种新的树突细胞标记基因特征，能够独立预测患者预后和免疫治疗效果 | 仅在有限的独立队列中验证了预测能力 | 开发预测肺腺癌预后及其对免疫治疗反应的新方法 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 在训练队列和6个独立队列中涉及到多个样本 |
| 251 | 2024-08-04 |
Integrating Bulk RNA and Single-Cell Sequencing Data Unveils Efferocytosis Patterns and ceRNA Network in Ischemic Stroke
2024-Apr-28, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01255-8
PMID:38678526
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研究论文 | 本研究揭示了缺血性中风中凋亡细胞的清除模式和ceRNA网络 | 探索了缺血性中风后大脑中凋亡细胞清除机制及其对炎症和恢复的影响 | 尚未完全阐明凋亡细胞清除的细胞和分子机制 | 研究缺血性中风中炎症与凋亡细胞清除的关系 | 研究中提到的基因及其在缺血性中风中的功能 | 数字病理学 | 缺血性中风 | RNA-seq | MCAO模型 | 基因表达数据 | 涉及多个公开数据集，共计数百个样本 |
| 252 | 2024-08-05 |
Naive and regulatory B-cell transcription patterns guide the increased risk of papillary thyroid carcinoma in obesity
2024-Apr-28, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
DOI:10.14715/cmb/2024.70.4.19
PMID:38678617
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研究论文 | 本文探讨了肥胖与乳头状甲状腺癌之间的关系，分析了B细胞转录模式的影响 | 揭示了肥胖人群中B细胞的转录模式与乳头状甲状腺癌风险增加之间的关联 | 尚未明确肥胖相关脂肪因子的具体调控机制 | 探讨肥胖如何增加乳头状甲状腺癌的风险及其相关机制 | 研究肥胖与乳头状甲状腺癌之间的关系及相关B细胞转录模式 | 数字病理学 | 乳头状甲状腺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA序列数据 | 从GEO数据库下载的肥胖和健康人群的皮下脂肪组织RNA序列数据，以及乳头状甲状腺癌的肿瘤组织数据 |
| 253 | 2024-08-04 |
Comprehensiveness cuproptosis related genes study for prognosis and medication sensitiveness across cancers, and validation in prostate cancer
2024-04-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57303-8
PMID:38671021
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研究论文 | 本研究对铜死亡相关基因（CRGs）在多种癌症中的作用进行了全面调查 | 揭示了CRGs在不同癌症中的预后价值和药物敏感性关联，建立了前列腺癌的预后特征 | 研究中关于CRGs功能的机制仍然模糊，可能需要更多的实验来验证 | 探讨CRGs在各种癌症中的作用及其在前列腺癌中的验证 | 参与分析的26种癌症及前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 26种癌症中的多种样本，以及前列腺癌细胞 |
| 254 | 2024-08-05 |
ATF3 characterizes aggressive drug-tolerant persister cells in HGSOC
2024-Apr-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06674-x
PMID:38658567
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研究论文 | 本文探讨了高等级浆液性卵巢癌中ATF3如何表征具有耐药性的持续存在细胞。 | 本研究首次揭示了ATF3在药物耐受的持续存在细胞中的作用，及其与上皮-间质转化(EMT)标记物的关系。 | 本研究主要基于小样本数据及异种移植模型，需进一步在更大规模的临床研究中验证这些发现。 | 研究高等级浆液性卵巢癌的药物耐受细胞特征和ATF3的作用。 | 治疗前及顺铂耐药性持久细胞的同源克隆，以及卵巢癌患者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 异种移植模型 | 基因表达数据 | 259名卵巢癌患者的TCGA数据，以及来自四名HGSOC患者的单细胞样本 |
| 255 | 2024-08-05 |
Short-Term Dietary Restriction Potentiates an Anti-Inflammatory Circulating Mucosal-Associated Invariant T-Cell Response
2024-Apr-22, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu16081245
PMID:38674935
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研究论文 | 这篇文章探讨了短期饮食限制对抗炎症的循环粘膜相关不变T细胞反应的影响 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了短期蛋白-卡路里饮食限制下MAIT细胞的转录组反应，并揭示了与肠道微生物种类变化的关系 | 对短期饮食限制及其对全身免疫影响的理解仍然不足，研究样本仅限于健康志愿者 | 研究短期饮食限制在调节术后炎症中的潜在作用 | 健康志愿者的PBMCs和粪便样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和粪便样本 | 健康志愿者4名，进行为期4天的饮食限制 |
| 256 | 2024-08-05 |
PPARγ attenuates cellular senescence of alveolar macrophages in asthma-COPD overlap
2024-Apr-20, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02790-6
PMID:38643159
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研究论文 | 本研究探讨了PPARγ在哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症中的作用。 | 首次揭示了PPARγ在调节与细胞衰老相关的巨噬细胞特征中的重要作用。 | 本研究主要基于公共数据集，临床验证尚需进行。 | 研究PPARγ如何影响哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症中巨噬细胞的衰老。 | 主要关注于哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症患者的肺部单核细胞/巨噬细胞。 | 数字病理学 | 哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、RNA-Seq、CyTOF | NA | RNA，细胞数据 | 通过公共数据集及独立队列研究得到的BALF样本数据 |
| 257 | 2024-08-05 |
Exploring MiR-484 Regulation by Polyalthia longifolia: A Promising Biomarker and Therapeutic Target in Cervical Cancer through Integrated Bioinformatics and an In Vitro Analysis
2024-Apr-19, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12040909
PMID:38672263
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学和体外分析探讨了MiR-484在宫颈癌中的作用 | 研究首次揭示了MiR-484在宫颈癌中的预后价值和作为治疗靶点的潜力 | 未在临床样本中进行验证 | 探索MiR-484作为宫颈癌的生物标志物和治疗靶点的可能性 | 宫颈癌细胞和相关的生物信息学数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | qRT-PCR和单细胞RNA测序 | 多元Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多种癌症样本和宫颈癌细胞系 |
| 258 | 2024-08-05 |
Evolutionary and developmental specialization of foveal cell types in the marmoset
2024-Apr-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313820121
PMID:38598343
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研究论文 | 本文探讨了狨猴中心凹细胞类型的进化与发育特化 | 研究揭示了狨猴以及其他灵长类的中心凹细胞类型的保守细胞结构，并发现了不同区域细胞类型的独特发育轨迹 | 研究对象仅限于狨猴，可能无法完全代表其他灵长类动物的情况 | 探索中心凹的发育、结构和进化 | 普通狨猴的视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 包括新生儿和成人狨猴的视网膜细胞 |
| 259 | 2024-08-04 |
Renal Endothelial Single-Cell Transcriptomics Reveals Spatiotemporal Regulation and Divergent Roles of Differential Gene Transcription and Alternative Splicing in Murine Diabetic Nephropathy
2024-Apr-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084320
PMID:38673910
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研究论文 | 该研究揭示了与糖尿病肾病进展相关的基因转录和选择性剪接的时空调控 | 通过单细胞转录组学方法识别了不同内皮细胞表型及其在疾病进展中的不同作用 | 研究仅使用了小鼠模型，可能无法完全代表人类疾病 | 探索糖尿病肾病中内皮细胞的异质性及其分子机制 | 来自糖尿病小鼠和非糖尿病同窝小鼠的肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | SmartSeq2单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 5464个内皮细胞 |
| 260 | 2024-08-05 |
Cellular senescence and metabolic reprogramming model based on bulk/single-cell RNA sequencing reveals PTGER4 as a therapeutic target for ccRCC
2024-Apr-11, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12234-5
PMID:38605343
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研究论文 | 本研究建立了一个基于RNA测序的细胞衰老与代谢重编程模型，并提出了PTGER4作为治疗ccRCC的靶点。 | 首次系统性探讨了与衰老相关的代谢过程变更与ccRCC之间的关系，并开发了一个新模型SeMRM以预测患者的生存率。 | 本研究可能受限于数据集的偏差及其适用性，且缺乏长期跟踪数据验证。 | 研究细胞衰老和代谢重编程在ccRCC中的作用，探讨其潜在的治疗靶点。 | 以ccRCC患者为对象，研究其代谢活动、免疫微环境及治疗反应等。 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | 风险评分模型 (SeMRM) | 基因组数据，临床信息 | 使用了两个ccRCC数据集和一个单细胞数据集，具体样本量未明确说明 |