单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 497 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-05 |
Cell-type-specific and disease-associated expression quantitative trait loci in the human lung
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01702-0
PMID:38548990
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研究论文 | 研究人类肺部特定细胞类型和疾病相关的表达数量性状位点 | 首次在38种细胞类型中绘制了表达数量性状位点(eQTL)，揭示了细胞特异性调控效应 | 研究仅涉及肺纤维化患者和未受影响供体，可能限制了结果的普遍性 | 阐明遗传变异如何影响组织特定基因表达与疾病的机制 | 对66名肺纤维化患者和48名未受影响供体的肺组织进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66名肺纤维化患者和48名未受影响供体 |
| 242 | 2024-08-05 |
Early megakaryocyte lineage-committed progenitors in adult mouse bone marrow
2024-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000187
PMID:38721470
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研究论文 | 本研究首次识别了成年小鼠骨髓中早期巨核细胞谱系承诺前体细胞。 | 本研究提出了一个新的分化模型，表明巨核细胞谱系承诺发生在分化的晚期，而非直接由造血干细胞生成。 | 研究中未能展示MgPs在体内的再生能力，且MgPs在基因表达上表现出转录异质性。 | 研究巨核细胞谱系承诺的前体细胞在小鼠骨髓中的特点及其起源。 | 成年小鼠骨髓中的早期巨核细胞谱系承诺前体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞克隆培养、反转录聚合酶链反应（RT-PCR） | NA | 细胞、基因表达数据 | CD201CD48细胞和CD48细胞 |
| 243 | 2024-08-05 |
Characterization of the malignant cells and microenvironment of infantile fibrosarcoma via single-cell RNA sequencing
2024-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-24-66
PMID:38715675
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了婴儿纤维肉瘤的恶性细胞及其微环境 | 揭示了婴儿纤维肉瘤的普遍转录特征，识别了潜在的新标记物和功能性恶性细胞亚型 | 样本量可能有限，仅来自四名患者，缺乏纵向跟踪数据 | 阐明婴儿纤维肉瘤的转录特征，并探索新的诊断和治疗靶点 | 收集四名患者的婴儿纤维肉瘤新鲜组织样本 | 数字病理学 | 婴儿纤维肉瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 四个患者的组织样本 |
| 244 | 2024-08-05 |
Mechanisms of sex differences in Alzheimer's disease
2024-Apr-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.024
PMID:38402606
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综述 | 这篇文章探讨了阿尔茨海默病中性别差异的机制 | 整合了单细胞RNA测序、代谢组学和多组学分析等先进技术的发现 | NA | 旨在更好地理解阿尔茨海默病的病因和进展中的性别差异 | 主要关注阿尔茨海默病中性别的影响 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 多组学分析 | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-08-05 |
Quantitative Multiplexed Analysis of Indoleamine 2,3-Dioxygenase (IDO) and Arginase-1 (ARG1) Expression and Myeloid Cell Infiltration in Colorectal Cancer
2024-Apr, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100450
PMID:38369188
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研究论文 | 本研究分析了结直肠癌中IDO和ARG1的表达及髓系细胞浸润特征 | 首次使用定制的10重免疫组化检测结合机器学习进行全面表征，揭示了IDO和ARG1在肿瘤微环境中的重要作用 | 对IDO和ARG1在结直肠癌微环境中表达模式的理解仍不完全 | 探讨IDO和ARG1在结直肠癌中的表达及其预后意义 | 对833名结直肠癌患者的髓系细胞和肿瘤细胞进行分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 10重免疫组化检测 | 监督学习 | 细胞RNA测序数据 | 分析了833名结直肠癌患者 |
| 246 | 2024-08-04 |
[Spatial transcriptomics techniques and its applications in plant research]
2024-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230662
PMID:38658142
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综述 | 本文探讨了空间转录组技术在植物研究中的应用 | 总结了空间转录组技术的发展过程及其在植物细胞研究中的进展 | 概述了空间转录组技术在植物应用中面临的挑战 | 探索空间转录组技术在植物中的应用 | 植物细胞的生长、分化、识别及抗逆性 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-08-05 |
Decoding the universal human chromatin landscape through teratoma-based profiling
2024-Apr-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae021
PMID:38281248
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研究论文 | 这项研究通过分析人类多能干细胞生成的畸胎瘤的表观基因组和转录组，探讨人类染色质的普遍特征。 | 文章提出了构建表观遗传特征矩阵的方法，以量化畸胎瘤中的多种细胞群体，并揭示染色质状态的独特特征。 | 研究的局限性未详细说明 | 本研究旨在分析畸胎瘤的表观基因组和转录组，以理解干细胞分化和发育过程。 | 本文的研究对象是人类多能干细胞产生的畸胎瘤。 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq, scRNA-Seq, scATAC-Seq | NA | 转录组, 表观基因组 | NA |
| 248 | 2024-08-05 |
ITGAM: A Pivotal Regulator in Macrophage Dynamics and Cardiac Function During Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Apr, Cureus
DOI:10.7759/cureus.59342
PMID:38711712
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研究论文 | 本研究揭示了在脓毒症诱导的心肌病中ITGAM在巨噬细胞动态和心脏功能中的调节作用 | 识别了ITGAM作为调节巨噬细胞功能的重要分子，并探讨了其在脓毒症诱导的心肌病中的双重作用 | 研究结果显示ITGAM中和抗体的使用虽然改善了心脏功能，但却增加了脓毒症后期的死亡率，反映出其复杂的作用 | 探讨脓毒症诱导的心肌病中的免疫细胞动态和其分子机制 | 主要研究巨噬细胞在脓毒症诱导的心肌病中的行为以及ITGAM和ICAM-1的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 249 | 2024-08-05 |
Lipoxin A 4 /FPR2 signaling mitigates ferroptosis of alveolar epithelial cells via NRF2-dependent pathway during lung ischemia-reperfusion injury
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590127
PMID:38712069
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研究论文 | 本研究探讨了Lipoxin A4对肺缺血再灌注损伤中肺泡上皮细胞铁死亡的保护作用 | 揭示了LxA4/FPR2信号通路通过NRF2依赖性机制减轻肺泡上皮细胞的铁死亡 | 本研究的局限性在于尚未探讨不同类型肺移植患者的普遍适用性 | 研究Lipoxin A4对肺缺血再灌注损伤中铁死亡的保护作用 | 主要研究对象为肺泡II型上皮细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 包括来自肺移植患者的样本，以及WT、Fpr2 -/-和Nrf2 -/-小鼠的样本 |
| 250 | 2024-08-04 |
ALDH2 as an immunological and prognostic biomarker: Insights from pan-cancer analysis
2024-Apr-19, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037820
PMID:38640328
|
研究论文 | 本研究全面评估了ALDH2在全癌症中的重要性 | 首次揭示了ALDH2与多种癌症类型及其免疫微环境的关联 | 尚未深入探讨ALDH2在各癌症类型中的具体机制 | 研究ALDH2在全癌症中的免疫学和预后生物标志物作用 | 分析ALDH2在不同癌症类型中的表达与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、免疫组化染色 | NA | 基因表达数据、组织样本 | 跨16种不同癌症类型的肿瘤及正常组织样本 |
| 251 | 2024-08-04 |
Myeloid-Mas Signaling Modulates Pathogenic Crosstalk among MYC+CD63+ Endothelial Cells, MMP12+ Macrophages, and Monocytes in Acetaminophen-Induced Liver Injury
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306066
PMID:38350725
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研究论文 | 本研究探讨了在乙酰氨基酚诱导的肝损伤中，髓系Mas信号通路对细胞间病理性交互的调节作用 | 首次揭示了髓系Mas在乙酰氨基酚诱导的肝损伤微环境中的作用，提供了细胞间相互作用的新视角 | 未明确Mas在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用机制和细分功能 | 研究髓系Mas信号通路在乙酰氨基酚诱导的肝损伤微环境中的作用 | MYC+CD63+内皮细胞、MMP12+巨噬细胞和单核细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和动态观测成像 | NA | 生物样本 | 来自急性肝衰竭患者的样本 |
| 252 | 2024-08-05 |
Characterization of macrophages in head and neck squamous cell carcinoma and development of MRG-based risk signature
2024-04-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60516-6
PMID:38688945
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研究论文 | 本研究探讨了头颈部鳞状细胞癌中的巨噬细胞特征，并开发了基于MRG的风险标志。 | 首次识别了8个具有预后潜力的巨噬细胞相关基因，并构建了预测模型，探讨了它们在HNSCC中的作用。 | 研究可能未考虑到所有可能影响HNSCC预后的因素，样本量和分类可能存在局限性。 | 研究巨噬细胞在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其与疾病预后的关系。 | 头颈部鳞状细胞癌的患者样本及其巨噬细胞特征。 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | scRNA-seq，bulk RNA-seq | Cox回归模型 | 临床数据，基因表达数据 | 包含特定的HNSCC患者数据，样本量在文中未具体说明 |
| 253 | 2024-08-05 |
Functional specialization of hippocampal somatostatin-expressing interneurons
2024-Apr-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2306382121
PMID:38640347
|
研究论文 | 该文章探讨了海马体中表达生长抑素的GABA能抑制神经元的功能特化。 | 该研究为功能性不同的海马CA1抑制神经元亚群提供了一种新的识别和访问方法，揭示了它们在功能上的多样性。 | 该研究未完全解决神经元的具体功能与其转录组特征之间的联系。 | 研究海马抑制神经元的亚群特征及其功能特化。 | 研究对象为海马CA1区的抑制神经元亚群。 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 四种小鼠模型 |
| 254 | 2024-08-04 |
Spatiotemporal transcriptomic changes of human ovarian aging and the regulatory role of FOXP1
2024-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00607-1
PMID:38594460
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研究论文 | 该研究系统性地表征人类卵巢衰老过程中的时空转录组变化 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法，首次揭示了八种卵巢细胞在衰老过程中的时空分子特征 | 本文对衰老机制的理解仍有限，可能需要更多的实验进行验证 | 旨在全面理解人类卵巢衰老过程中的时空转录组变化 | 研究对象为人类卵巢细胞的岁月变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 255 | 2024-08-04 |
Nanoceria-Mediated Cyclosporin A Delivery for Dry Eye Disease Management through Modulating Immune-Epithelial Crosstalk
2024-Apr-30, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c11514
PMID:38632691
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研究论文 | 本研究开发了一种纳米酶基础的眼药水，用于干眼病的治疗，具有抗氧化和抗炎能力 | 纳米酶修饰的环孢素A递送系统具有双重功能，能够调节免疫-上皮相互作用 | 研究未提及样本的长期效果和临床试验数据 | 探讨干眼病的治疗方法，通过调节免疫与上皮的相互作用 | 面向干眼病的干预治疗，特别是抗氧化和抗炎效果的评估 | 数字病理学 | 干眼病 | 纳米酶载体 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 256 | 2024-08-05 |
Novel Phosphate Transporter-B PvPTB1;1/1;2 Contribute to Efficient Phosphate Uptake and Arsenic Accumulation in As-Hyperaccumulator Pteris vittata
2024-Apr-30, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.3c09335
PMID:38624169
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研究论文 | 本研究揭示了低亲和力磷转运体-B 1家族介导的新型磷/砷运输系统在As-超积累植物中的作用 | 首次在维管植物中识别出两种膜蛋白基因，并确认其在磷摄取和砷积累中的作用 | 未提供关于其他植物转运体的对比分析数据 | 研究磷和砷在As-超积累植物中的摄取机制 | As-超积累植物Pteris vittata及其低亲和力磷转运体-B 1家族 | 植物生理学 | NA | 功能补偿实验和转基因分析 | NA | 基因表达数据和细胞转录组数据 | NA |
| 257 | 2024-08-05 |
Cauchy hyper-graph Laplacian nonnegative matrix factorization for single-cell RNA-sequencing data analysis
2024-Apr-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05797-4
PMID:38684942
|
研究论文 | 本文提出了一种Cauchy超图拉普拉斯非负矩阵分解方法用于单细胞RNA测序数据分析 | 使用Cauchy损失函数替代传统非负矩阵分解中的欧几里得距离，大大降低噪声影响，并结合超图约束。 | 至于模型的训练和优化过程的复杂性，具体应用于更大规模数据时的表现尚未讨论 | 探讨和改善单细胞数据分析中的聚类准确性 | 七个单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 非负矩阵分解 | Cauchy超图拉普拉斯非负矩阵分解 | RNA测序数据 | 七个数据集 |
| 258 | 2024-08-05 |
A novel defined programmed cell death related gene signature for predicting the prognosis of serous ovarian cancer
2024-Apr-29, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01419-y
PMID:38685095
|
研究论文 | 本研究探讨了差异表达的程序性细胞死亡基因在浆液性卵巢癌中的作用及其作为临床预后预测因子的潜力 | 该研究通过单细胞RNA测序鉴定了48个与凋亡信号和氧化应激通路显著相关的差异表达程序性细胞死亡基因，并发现GNA15作为独立预后标志物 | 研究的局限性在于主要依赖于公开数据库的数据，可能存在样本偏差或数据不完整的情况 | 研究旨在探讨程序性细胞死亡基因在浆液性卵巢癌异质性中的贡献以及其作为预后标志的潜力 | 研究对象为浆液性卵巢癌患者的细胞和基因数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | Cox模型 | 基因表达数据 | 研究涉及的样本数量未具体说明，主要利用两组大型社会数据集进行验证 |
| 259 | 2024-08-05 |
scCompressSA: dual-channel self-attention based deep autoencoder model for single-cell clustering by compressing gene-gene interactions
2024-Apr-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10286-2
PMID:38684946
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研究论文 | 提出了一种基于自注意力的深度自编码器模型scCompressSA，用于单细胞聚类，通过压缩基因间相互作用来增强聚类精度 | 该研究提出的双通道自注意力块能够有效整合拓扑特征，从而提高单细胞聚类的准确性 | 对于RNA测序数据的高随机性仍然是细胞类型检测面临的挑战 | 研究单细胞聚类的分子机制并提高细胞类型的检测精度 | 利用scRNA-seq数据中的基因间相互作用来提取特征进行细胞聚类 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度自编码器 | 基因表达数据 | 多个基准scRNA-seq数据集 |
| 260 | 2024-08-04 |
Targeting nucleotide metabolic pathways in colorectal cancer by integrating scRNA-seq, spatial transcriptome, and bulk RNA-seq data
2024-Apr-10, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01356-5
PMID:38594466
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大规模RNA测序数据，对结直肠癌中的核苷酸代谢途径进行分析 | 通过不同的实验方法识别出新的结直肠癌治疗靶点ACO1和CPT2，并建立了以核苷酸代谢相关基因为基础的预后模型 | 研究主要依赖于数据分析和体外实验，临床应用需要进一步验证 | 探索结直肠癌中核苷酸代谢的特征及其对预后的影响 | 结直肠癌（CRC）及其相关的核苷酸代谢基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | 风险预后模型 | 基因表达数据 | 涉及多个结直肠癌样本，具体样本量未详细说明 |