单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 492 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics in MI identify Slc25a4 as a new modulator of mitochondrial malfunction and apoptosis-associated cardiomyocyte subcluster
2024-04-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59975-8
PMID:38654053
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析确定了Slc25a4作为心肌梗死相关线粒体功能障碍和细胞凋亡的调节因子 | 创新性地识别了与心肌梗死后心室重塑密切相关的心肌细胞新亚群C5，以及新标志基因Slc25a4 | 研究限制在于仅使用了GEO数据库中的单细胞数据，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究的目的是确定心肌细胞的转录谱及其在缺氧条件下的异质性 | 研究对象为心肌梗死和假手术组的小鼠心脏中的心肌细胞 | 数字病理学 | 心肌梗死 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 242 | 2024-08-05 |
Schwann cell derived pleiotrophin stimulates fibroblast for proliferation and excessive collagen deposition in plexiform neurofibroma
2024-Apr, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00727-1
PMID:38302728
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研究论文 | 本研究探讨了施旺细胞源性多效素如何刺激成纤维细胞增殖和胶原沉积。 | 提出了PTN/NCL/PRAS40轴在施旺细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞之间相互作用的重要性，提供了新的分子机制见解。 | 本研究的样本基于人类pNF，可能限制了在其他类型神经肿瘤中的适用性。 | 研究施旺细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞之间的相互作用，及其对pNF发展的影响。 | 主要研究对象为来自pNF样本的人类施旺细胞和神经纤维瘤相关成纤维细胞。 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序、功能性实验（如CCK8、EdU等） | NA | 转录组数据、细胞培养实验数据 | NA |
| 243 | 2024-08-05 |
Unveiling the Dynamics behind Glioblastoma Multiforme Single-Cell Data Heterogeneity
2024-Apr-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094894
PMID:38732140
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研究论文 | 本研究揭示了危及生命的多形性胶质母细胞瘤的单细胞数据异质性的动态特征 | 提出了通过随机固定点和吸引子领域的轨迹解释单细胞RNA测序数据的异质性 | 未提到具体的样本数量和实际研究限制 | 研究胶质母细胞瘤的癌症动态及其在单细胞RNA序列数据中的表现 | 聚焦于胶质母细胞瘤的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 随机模拟 | RNA序列数据 | NA |
| 244 | 2024-08-05 |
CNS Resident Innate Immune Cells: Guardians of CNS Homeostasis
2024-Apr-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094865
PMID:38732082
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研究论文 | 该文章探讨了中枢神经系统的常驻先天免疫细胞及其在中枢神经系统稳态和病理性神经炎症中的作用 | 文章创新性地阐述了常驻免疫细胞在多发性硬化的免疫病理中的核心作用 | 文章未提及具体的实验研究或数据支持 | 探讨常驻免疫细胞在中枢神经系统稳态和病理性神经炎症中的作用 | 常驻先天免疫细胞及其表型 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-08-05 |
Identifying Candidate Gene Drivers Associated with Relapse in Pediatric T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Using a Gene Co-Expression Network Approach
2024-Apr-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16091667
PMID:38730619
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研究论文 | 本研究通过基因共表达网络分析识别与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的候选驱动基因。 | 该研究提出了新的潜在复发相关基因，并生成了三种模型基因签名，以识别复发患者。 | 研究中仅使用了三个配对样本，样本数量较小可能影响结果的泛化性。 | 寻找与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的治疗靶点和标志物。 | 重点研究与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的基因。 | 数字病理学 | 儿科T细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | 稀疏部分最小二乘判别分析 | 转录组数据 | 3个配对样本 |
| 246 | 2024-08-05 |
Modification of Seurat v4 for the Development of a Phase Assignment Tool Able to Distinguish between G2 and Mitotic Cells
2024-Apr-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094589
PMID:38731808
|
研究论文 | 本文探讨了改进Seurat v4以开发能够区分G2和有丝分裂细胞的阶段分配工具 | 该研究实现了对G2和M相细胞的区分，有效填补了现有工具的空白 | 尚未评估该工具在其他细胞类型或不同实验条件下的适用性 | 研究旨在开发一种方法，以便在scRNAseq数据集中精确分配细胞周期阶段 | 研究对象为分离的有丝分裂细胞和间期细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用荧光激活细胞分选分离的有丝分裂和间期细胞 |
| 247 | 2024-08-05 |
Gli1+ Progenitors Mediate Glucocorticoid-Induced Osteoporosis In Vivo
2024-Apr-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084371
PMID:38673956
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研究论文 | 本研究探讨了Gli1+前体细胞在糖皮质激素诱导的骨质疏松中的作用 | 首次揭示了Gli1形态骨母细胞亚群在糖皮质激素影响下的反应性及其在骨形成中的潜在作用 | 研究中尚未全面识别所有糖皮质激素诱导骨质疏松的目标细胞群 | 研究糖皮质激素如何通过影响Gli1+前体细胞来诱导骨质疏松 | 研究聚焦于 Gli1+ 骨母细胞亚群及其对糖皮质激素的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-08-04 |
Stigmasterol alleviates neuropathic pain by reducing Schwann cell-macrophage cascade in DRG by modulating IL-34/CSF1R
2024-04, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14657
PMID:38572785
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研究论文 | 本研究探讨了甾醇在治疗神经性疼痛中的潜在治疗应用 | 首先揭示了甾醇通过调节IL-34/CSF1R轴减少Schwann细胞-巨噬细胞级联反应的机制 | 该研究主要集中在动物实验上，尚需在人类中进一步验证 | 研究甾醇在治疗神经性疼痛中的有效性和机制 | 主要针对 male Sprague-Dawley 大鼠进行实验 | 数字病理学 | 神经性疼痛 | 单细胞测序分析，ELISA，免疫组化，西方印迹 | NA | 细胞，血清 | 32只雄性Sprague-Dawley大鼠 |
| 249 | 2024-08-05 |
SUMOylation inhibitors activate anti-tumor immunity by reshaping the immune microenvironment in a preclinical model of hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00880-z
PMID:38055116
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研究论文 | 本文研究了SUMO化抑制剂在肝细胞癌模型中激活抗肿瘤免疫的机制 | 发现SUMO化抑制剂可以通过重塑免疫微环境来改善肝细胞癌的免疫应答 | 该研究限于小鼠模型，尚需在人类肝细胞癌患者中验证有效性 | 探索新的小分子疗法治疗肝细胞癌 | 评估SUMO化抑制剂在预临床小鼠肝细胞癌模型中的应用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、质量细胞术（CyTOF）、流式细胞术和多重免疫荧光（mIF） | NA | 细胞样本 | 使用了多种肝细胞癌小鼠模型进行研究 |
| 250 | 2024-08-05 |
Molecular mechanism analyses of post-traumatic epilepsy and hereditary epilepsy based on 10× single-cell transcriptome sequencing technology
2024-04, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14702
PMID:38572804
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研究论文 | 本研究基于10×单细胞转录组测序技术分析了创伤后癫痫和遗传性癫痫的分子机制 | 首次分析了创伤性颞叶癫痫患者不同细胞中的转录组差异 | 样本量较少，仅包括一名创伤后癫痫患者和一名遗传性癫痫患者 | 研究创伤后癫痫与遗传性癫痫患者在单细胞层面上的不同 | 一名创伤后癫痫患者和一名遗传性癫痫患者的海马组织 | 数字病理学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2个样本（1名创伤后癫痫患者和1名遗传性癫痫患者） |
| 251 | 2024-08-05 |
Molecular Basis of Neuronal and Microglial States in the Aging Brain and Impact on Cerebral Blood Vessels
2024-Apr-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084443
PMID:38674028
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综述 | 本文介绍了神经元和胶质细胞在衰老过程中的变化及其对大脑微环境的影响 | 探讨了单细胞RNA测序和蛋白质组学等技术在研究大脑衰老过程中动态变化的应用 | 未明确指出具体的研究限制 | 理解大脑衰老过程中神经元和胶质细胞的状态变化 | 研究大脑衰老中神经元、胶质细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-08-04 |
Integrating bulk and single-cell sequencing data to construct a Scissor+ dendritic cells prognostic model for predicting prognosis and immune responses in ESCC
2024-Apr-15, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03683-9
PMID:38619620
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研究论文 | 该文章主要构建了一种Scissor+树突状细胞预后模型，以预测食管鳞状细胞癌患者的预后和免疫反应 | 文章首次结合大规模与单细胞测序数据，提供了树突状细胞在食管鳞状细胞癌中的重要性及其子群体的分层 | 文章中未明确提及模型在其他类型癌症中的适用性和泛化能力 | 研究旨在揭示食管鳞状细胞癌中树突状细胞的异质性及其与预后的关系 | 研究对象为60名食管鳞状细胞癌患者的单细胞数据和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | 未适用 | 细胞数据 | 包含60名患者的192,078个单细胞数据 |
| 253 | 2024-08-05 |
Cell-type-specific and disease-associated expression quantitative trait loci in the human lung
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01702-0
PMID:38548990
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研究论文 | 研究人类肺部特定细胞类型和疾病相关的表达数量性状位点 | 首次在38种细胞类型中绘制了表达数量性状位点(eQTL)，揭示了细胞特异性调控效应 | 研究仅涉及肺纤维化患者和未受影响供体，可能限制了结果的普遍性 | 阐明遗传变异如何影响组织特定基因表达与疾病的机制 | 对66名肺纤维化患者和48名未受影响供体的肺组织进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66名肺纤维化患者和48名未受影响供体 |
| 254 | 2024-08-05 |
Early megakaryocyte lineage-committed progenitors in adult mouse bone marrow
2024-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000187
PMID:38721470
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研究论文 | 本研究首次识别了成年小鼠骨髓中早期巨核细胞谱系承诺前体细胞。 | 本研究提出了一个新的分化模型，表明巨核细胞谱系承诺发生在分化的晚期，而非直接由造血干细胞生成。 | 研究中未能展示MgPs在体内的再生能力，且MgPs在基因表达上表现出转录异质性。 | 研究巨核细胞谱系承诺的前体细胞在小鼠骨髓中的特点及其起源。 | 成年小鼠骨髓中的早期巨核细胞谱系承诺前体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞克隆培养、反转录聚合酶链反应（RT-PCR） | NA | 细胞、基因表达数据 | CD201CD48细胞和CD48细胞 |
| 255 | 2024-08-05 |
Characterization of the malignant cells and microenvironment of infantile fibrosarcoma via single-cell RNA sequencing
2024-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-24-66
PMID:38715675
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了婴儿纤维肉瘤的恶性细胞及其微环境 | 揭示了婴儿纤维肉瘤的普遍转录特征，识别了潜在的新标记物和功能性恶性细胞亚型 | 样本量可能有限，仅来自四名患者，缺乏纵向跟踪数据 | 阐明婴儿纤维肉瘤的转录特征，并探索新的诊断和治疗靶点 | 收集四名患者的婴儿纤维肉瘤新鲜组织样本 | 数字病理学 | 婴儿纤维肉瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 四个患者的组织样本 |
| 256 | 2024-08-05 |
Quantitative Multiplexed Analysis of Indoleamine 2,3-Dioxygenase (IDO) and Arginase-1 (ARG1) Expression and Myeloid Cell Infiltration in Colorectal Cancer
2024-Apr, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100450
PMID:38369188
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研究论文 | 本研究分析了结直肠癌中IDO和ARG1的表达及髓系细胞浸润特征 | 首次使用定制的10重免疫组化检测结合机器学习进行全面表征，揭示了IDO和ARG1在肿瘤微环境中的重要作用 | 对IDO和ARG1在结直肠癌微环境中表达模式的理解仍不完全 | 探讨IDO和ARG1在结直肠癌中的表达及其预后意义 | 对833名结直肠癌患者的髓系细胞和肿瘤细胞进行分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 10重免疫组化检测 | 监督学习 | 细胞RNA测序数据 | 分析了833名结直肠癌患者 |
| 257 | 2024-08-04 |
[Spatial transcriptomics techniques and its applications in plant research]
2024-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230662
PMID:38658142
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综述 | 本文探讨了空间转录组技术在植物研究中的应用 | 总结了空间转录组技术的发展过程及其在植物细胞研究中的进展 | 概述了空间转录组技术在植物应用中面临的挑战 | 探索空间转录组技术在植物中的应用 | 植物细胞的生长、分化、识别及抗逆性 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-08-05 |
Decoding the universal human chromatin landscape through teratoma-based profiling
2024-Apr-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae021
PMID:38281248
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研究论文 | 这项研究通过分析人类多能干细胞生成的畸胎瘤的表观基因组和转录组，探讨人类染色质的普遍特征。 | 文章提出了构建表观遗传特征矩阵的方法，以量化畸胎瘤中的多种细胞群体，并揭示染色质状态的独特特征。 | 研究的局限性未详细说明 | 本研究旨在分析畸胎瘤的表观基因组和转录组，以理解干细胞分化和发育过程。 | 本文的研究对象是人类多能干细胞产生的畸胎瘤。 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq, scRNA-Seq, scATAC-Seq | NA | 转录组, 表观基因组 | NA |
| 259 | 2024-08-05 |
ITGAM: A Pivotal Regulator in Macrophage Dynamics and Cardiac Function During Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Apr, Cureus
DOI:10.7759/cureus.59342
PMID:38711712
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研究论文 | 本研究揭示了在脓毒症诱导的心肌病中ITGAM在巨噬细胞动态和心脏功能中的调节作用 | 识别了ITGAM作为调节巨噬细胞功能的重要分子，并探讨了其在脓毒症诱导的心肌病中的双重作用 | 研究结果显示ITGAM中和抗体的使用虽然改善了心脏功能，但却增加了脓毒症后期的死亡率，反映出其复杂的作用 | 探讨脓毒症诱导的心肌病中的免疫细胞动态和其分子机制 | 主要研究巨噬细胞在脓毒症诱导的心肌病中的行为以及ITGAM和ICAM-1的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 260 | 2024-08-05 |
Lipoxin A 4 /FPR2 signaling mitigates ferroptosis of alveolar epithelial cells via NRF2-dependent pathway during lung ischemia-reperfusion injury
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590127
PMID:38712069
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研究论文 | 本研究探讨了Lipoxin A4对肺缺血再灌注损伤中肺泡上皮细胞铁死亡的保护作用 | 揭示了LxA4/FPR2信号通路通过NRF2依赖性机制减轻肺泡上皮细胞的铁死亡 | 本研究的局限性在于尚未探讨不同类型肺移植患者的普遍适用性 | 研究Lipoxin A4对肺缺血再灌注损伤中铁死亡的保护作用 | 主要研究对象为肺泡II型上皮细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 包括来自肺移植患者的样本，以及WT、Fpr2 -/-和Nrf2 -/-小鼠的样本 |