单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 495 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-05 |
Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis
2024-Apr-30, Clinical oral investigations
IF:3.1Q1
DOI:10.1007/s00784-024-05659-6
PMID:38684576
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研究论文 | 本研究识别了导致综合性牙缺失的新型SOX4基因突变 | 首次报告了导致综合性牙缺失的SOX4错义突变 | 研究中可能未充分探索其他潜在的调控机制 | 识别Coffin-Siris综合症中导致牙缺失的致病突变并探索调控机制 | 研究对象为表现出牙缺失的Coffin-Siris综合症患者 | 数字病理学 | 综合性疾病 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 1名中国Coffin-Siris综合症患者 |
| 222 | 2024-08-05 |
Immunological Characteristics of Hepatic Dendritic Cells in Patients and Mouse Model with Liver Echinococcus multilocularis Infection
2024-Apr-25, Tropical medicine and infectious disease
IF:2.8Q1
DOI:10.3390/tropicalmed9050095
PMID:38787028
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研究论文 | 本文探讨了肝脏包虫感染患者和小鼠模型中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 首次系统分析了肝脏树突状细胞亚群在肝脏包虫感染中表现出的免疫表型特征 | 未深入探讨不同小鼠模型对免疫特征的影响 | 研究肝脏包虫感染微环境中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 临床包虫感染患者和小鼠模型中的肝脏树突状细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 组织样本 | 四个包虫感染患者标本和感染小鼠模型 |
| 223 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a lactate metabolism-related six-gene prognostic signature in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Apr-16, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05723-4
PMID:38627278
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研究论文 | 本文揭示了乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用，并构建了一个可靠的乳酸代谢相关预后标志。 | 文章首次系统性地识别和验证了与乳酸代谢相关的六个基因的预后标志，提供了新思路用于肝内胆管癌的预后评估和治疗。 | 研究对乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学功能的探索仍然有限，需要更多的临床数据来验证。 | 研究目的是明确乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用，开发预后工具。 | 研究对象为肝内胆管癌患者及其相关细胞系。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 高和低乳酸代谢相关基因得分组中的患者样本 |
| 224 | 2024-08-04 |
A transcriptomics-based RNAi screen for regulators of meiosis and early stages of oocyte development in Drosophila melanogaster
2024-04-03, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkae028
PMID:38333961
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研究论文 | 该研究通过转录组学方法识别果蝇卵巢中与减数分裂和早期卵母细胞发育相关的调控基因 | 采用转录组学分析结合已发表的单细胞RNA-seq数据，找到2743个共表达基因，其中许多与减数分裂和卵母细胞发育相关 | 研究主要集中在已知的基因上，可能忽略了其他未被充分阐明的基因的功能 | 识别早期卵母细胞发育和减数分裂中涉及的基因 | 以果蝇卵巢为对象，分析早期发育过程中的基因表达与功能 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因组数据 | 分析了3个已发表的单细胞RNA-seq数据集，共测试了526条RNAi线路 |
| 225 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals tumoral microenvironment heterogenicity and hypervascularization in human carotid body tumor
2024-Apr, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31175
PMID:38214142
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研究论文 | 本研究对人类颈动脉体瘤的单细胞转录组进行分析，揭示了肿瘤微环境的异质性和高血管生成特征 | 首次对颈动脉体瘤的单细胞转录组进行全面特征描述，提供了形成机制的新见解 | 尚未提及研究的具体限制 | 解析颈动脉体瘤的微环境组成及分子复杂性 | 人类颈动脉体瘤的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 226 | 2024-08-05 |
DNA G-Quadruplex in NRP1 Promoter Facilitates SARS-CoV-2 Infection
2024-Apr-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084422
PMID:38674009
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研究论文 | 本文探讨了DNA G-四链体在NRP1启动子中的作用如何促进SARS-CoV-2感染。 | 揭示了G-四链体在SARS-CoV-2感染中的新机制，以及其对NRP1表达和病毒进入细胞的重要性。 | 未详细讨论G-四链体干预的潜在效果及其在不同细胞类型中的普适性。 | 研究G-四链体在宿主因子NRP1启动子中的作用及其对SARS-CoV-2感染的影响。 | 重点研究NRP1启动子中的G-四链体，并分析其对SARS-CoV-2感染的促进作用。 | 数字病理学 | NA | 生物信息学、生化分析和生物学测定 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从人类支气管上皮细胞中获得的模拟SARS-CoV-2感染的单细胞数据 |
| 227 | 2024-08-04 |
Upregulation of EMR1 (ADGRE1) by Tumor-Associated Macrophages Promotes Colon Cancer Progression by Activating the JAK2/STAT1,3 Signaling Pathway in Tumor Cells
2024-Apr-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084388
PMID:38673975
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞如何通过激活JAK2/STAT1,3信号通路促进结肠癌的进展。 | 揭示了EMR1在结肠癌中的作用及其与巨噬细胞的信号相互作用的机制。 | 此研究未探讨其他可能的信号通路对结肠癌进展的影响。 | 研究EMR1及其与巨噬细胞的信号相互作用在结肠癌进展中的作用。 | 肿瘤相关巨噬细胞和结肠癌细胞。 | 数字病理学 | 结肠癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | pT3微卫星不稳定结肠癌组织 |
| 228 | 2024-08-05 |
Direct programming of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors with SOX17 and FGF2
2024-Apr-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.006
PMID:38518781
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研究论文 | 本文探讨了转录因子SOX17和FGF2在诱导人类多能干细胞转化为内皮前体的作用 | 发现SOX17的过表达能够显著提高CD34和血管内皮钙粘蛋白（VEC）阳性细胞的比例，从而揭示了SOX17在内皮前体分化中的新功能 | NA | 明确SOX17在内皮前体分化中的作用机制 | 人类多能干细胞及其衍生的内皮前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas13d | NA | 细胞 | 使用诱导的人类多能干细胞系进行实验 |
| 229 | 2024-08-05 |
ENO1 promotes trophoblast invasion regulated by E2F8 in recurrent miscarriage
2024-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302032RR
PMID:38661062
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研究论文 | 本研究探讨了ENO1在复发性流产中通过E2F8调控滋养层细胞侵袭的机制 | 发现ENO1通过E2F8依赖性方式促进滋养层细胞侵袭，为复发性流产的生理机制提供了潜在的新靶点 | 研究主要基于基因表达分析，缺乏临床样本验证和长期跟踪研究 | 探索复发性流产的机制及其与滋养层细胞功能障碍的关系 | 主要研究复发性流产中的外滋养层细胞（EVTs）及其相关基因 | 数字病理学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA测序, 免疫荧光检测, 西方印迹, 染色质免疫沉淀(ChIP), 实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR), 透析实验 | NA | 基因表达数据 | 1724个差异表达基因的分析 |
| 230 | 2024-08-05 |
ptx3a+ fibroblast/epicardial cells provide a transient macrophage niche to promote heart regeneration
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114092
PMID:38607913
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研究论文 | 本文探讨了在再生心脏中参与巨噬细胞修复的细胞间相互作用 | 识别了ptx3a+成纤维细胞/心外膜细胞与巨噬细胞间的强交互，并阐明了其在心脏再生中的重要性 | 未详细研究其他细胞类型对巨噬细胞反应的影响 | 研究巨噬细胞在心脏修复中的微环境 | 关注再生斑马鱼心脏中的巨噬细胞以及其周围的细胞 | 数字病理学 | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了斑马鱼模型进行实验 |
| 231 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing in Organ and Cell Transplantation
2024-Apr-11, Biosensors
DOI:10.3390/bios14040189
PMID:38667182
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在器官和细胞移植中的应用及其潜在影响 | 介绍了单细胞RNA测序如何揭示移植组织转录组以及与移植并发症相关的细胞类型和状态 | 文章未详细讨论单细胞RNA测序技术的挑战和局限性 | 研究单细胞RNA测序在器官和干细胞移植中的应用 | 应用单细胞RNA测序分析被移植组织中的供体和受体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 232 | 2024-08-05 |
Reconstruction Set Test (RESET): A computationally efficient method for single sample gene set testing based on randomized reduced rank reconstruction error
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012084
PMID:38683883
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研究论文 | 本文提出了一种名为重构集测试（RESET）的单样本基因集测试方法 | RESET方法通过随机降秩重构算法提供了一种计算上高效的基因集重要性量化方式 | NA | 研究单样本基因集测试的新方法 | 基因集及其在测量基因值重构中的重要性 | 生物信息学 | NA | 随机降秩重构算法 | NA | scRNA-seq数据 | 真实和模拟的scRNA-seq数据 |
| 233 | 2024-08-04 |
Identification of key molecules in the formation of portal vein tumor thrombus in hepatocellular carcinoma based on single cell transcriptomics and in vitro experiments
2024-Apr-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1589
PMID:38737676
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓形成的关键分子 | 通过单细胞转录组学技术和体外实验，识别了与肝细胞癌PVTT形成相关的关键基因和调控网络 | 研究可能存在样本量小或只依赖于生物信息学分析的局限性 | 探究肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓形成的分子机制及其与免疫浸润的关联 | 识别与PVTT发展相关的基因及其调控miRNA和lncRNA | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，hdWGCNA，高维基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 234 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing Reveals Molecular Expression Differences and Marker Genes in Testes during the Sexual Maturation of Mongolian Horses
2024-Apr-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14091258
PMID:38731262
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研究论文 | 本研究旨在调查蒙古马性成熟过程中睾丸组织形态、基因表达及标记基因的差异 | 通过单细胞转录组测序技术揭示了不同年龄组之间睾丸细胞的显著差异和潜在的性成熟标记基因 | NA | 探索蒙古马的生殖生理及识别性成熟潜在标记 | 对1岁（性未熟）和10岁（性成熟）蒙古马的睾丸组织进行了比较研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 2个年龄组的睾丸组织样本，分别为1岁和10岁 |
| 235 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics in MI identify Slc25a4 as a new modulator of mitochondrial malfunction and apoptosis-associated cardiomyocyte subcluster
2024-04-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59975-8
PMID:38654053
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析确定了Slc25a4作为心肌梗死相关线粒体功能障碍和细胞凋亡的调节因子 | 创新性地识别了与心肌梗死后心室重塑密切相关的心肌细胞新亚群C5，以及新标志基因Slc25a4 | 研究限制在于仅使用了GEO数据库中的单细胞数据，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究的目的是确定心肌细胞的转录谱及其在缺氧条件下的异质性 | 研究对象为心肌梗死和假手术组的小鼠心脏中的心肌细胞 | 数字病理学 | 心肌梗死 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 236 | 2024-08-05 |
Schwann cell derived pleiotrophin stimulates fibroblast for proliferation and excessive collagen deposition in plexiform neurofibroma
2024-Apr, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00727-1
PMID:38302728
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研究论文 | 本研究探讨了施旺细胞源性多效素如何刺激成纤维细胞增殖和胶原沉积。 | 提出了PTN/NCL/PRAS40轴在施旺细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞之间相互作用的重要性，提供了新的分子机制见解。 | 本研究的样本基于人类pNF，可能限制了在其他类型神经肿瘤中的适用性。 | 研究施旺细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞之间的相互作用，及其对pNF发展的影响。 | 主要研究对象为来自pNF样本的人类施旺细胞和神经纤维瘤相关成纤维细胞。 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序、功能性实验（如CCK8、EdU等） | NA | 转录组数据、细胞培养实验数据 | NA |
| 237 | 2024-08-05 |
Unveiling the Dynamics behind Glioblastoma Multiforme Single-Cell Data Heterogeneity
2024-Apr-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094894
PMID:38732140
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研究论文 | 本研究揭示了危及生命的多形性胶质母细胞瘤的单细胞数据异质性的动态特征 | 提出了通过随机固定点和吸引子领域的轨迹解释单细胞RNA测序数据的异质性 | 未提到具体的样本数量和实际研究限制 | 研究胶质母细胞瘤的癌症动态及其在单细胞RNA序列数据中的表现 | 聚焦于胶质母细胞瘤的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 随机模拟 | RNA序列数据 | NA |
| 238 | 2024-08-05 |
CNS Resident Innate Immune Cells: Guardians of CNS Homeostasis
2024-Apr-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094865
PMID:38732082
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研究论文 | 该文章探讨了中枢神经系统的常驻先天免疫细胞及其在中枢神经系统稳态和病理性神经炎症中的作用 | 文章创新性地阐述了常驻免疫细胞在多发性硬化的免疫病理中的核心作用 | 文章未提及具体的实验研究或数据支持 | 探讨常驻免疫细胞在中枢神经系统稳态和病理性神经炎症中的作用 | 常驻先天免疫细胞及其表型 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-08-05 |
Identifying Candidate Gene Drivers Associated with Relapse in Pediatric T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Using a Gene Co-Expression Network Approach
2024-Apr-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16091667
PMID:38730619
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研究论文 | 本研究通过基因共表达网络分析识别与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的候选驱动基因。 | 该研究提出了新的潜在复发相关基因，并生成了三种模型基因签名，以识别复发患者。 | 研究中仅使用了三个配对样本，样本数量较小可能影响结果的泛化性。 | 寻找与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的治疗靶点和标志物。 | 重点研究与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的基因。 | 数字病理学 | 儿科T细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | 稀疏部分最小二乘判别分析 | 转录组数据 | 3个配对样本 |
| 240 | 2024-08-05 |
Modification of Seurat v4 for the Development of a Phase Assignment Tool Able to Distinguish between G2 and Mitotic Cells
2024-Apr-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094589
PMID:38731808
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研究论文 | 本文探讨了改进Seurat v4以开发能够区分G2和有丝分裂细胞的阶段分配工具 | 该研究实现了对G2和M相细胞的区分，有效填补了现有工具的空白 | 尚未评估该工具在其他细胞类型或不同实验条件下的适用性 | 研究旨在开发一种方法，以便在scRNAseq数据集中精确分配细胞周期阶段 | 研究对象为分离的有丝分裂细胞和间期细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用荧光激活细胞分选分离的有丝分裂和间期细胞 |