单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a lactate metabolism-related six-gene prognostic signature in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Apr-16, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05723-4
PMID:38627278
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研究论文 | 本文揭示了乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用，并构建了一个可靠的乳酸代谢相关预后标志。 | 文章首次系统性地识别和验证了与乳酸代谢相关的六个基因的预后标志，提供了新思路用于肝内胆管癌的预后评估和治疗。 | 研究对乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学功能的探索仍然有限，需要更多的临床数据来验证。 | 研究目的是明确乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用，开发预后工具。 | 研究对象为肝内胆管癌患者及其相关细胞系。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 高和低乳酸代谢相关基因得分组中的患者样本 |
| 182 | 2024-08-05 |
Maternal factor Trim75 contributes to zygotic genome activation program in mouse early embryos
2024-Apr-20, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09349-0
PMID:38643284
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研究论文 | 本研究探讨了母体因子Trim75在小鼠早期胚胎的合子基因组激活程序中的作用 | 发现Trim75是小鼠ZGA的重要驱动因子，并可能通过招募EP300和建立H3K27ac来影响ZGA基因的表达 | 研究中对母体因子的探索仍然不够全面，尚需更多研究进行验证 | 阐明母体因子对小鼠合子基因组激活的影响 | 小鼠早期胚胎中的母体因子Trim75 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用已发布的单细胞RNA测序数据，样本量未知 |
| 183 | 2024-08-05 |
Characterizing the T Cell Repertoire in the Proximal Airway in Health and Disease
2024-Apr, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.31088
PMID:37787469
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研究论文 | 本文探讨了气道近端的T细胞受体（TCR）库在健康和疾病中的特征。 | 研究测试了在亚声门狭窄（SGS）患者中T细胞的克隆性及其免疫反应的多样性，提供了健康对照组的比较。 | 数据表明SGS病例的TCR多样性与健康对照组相当，但特定高频克隆型的靶标尚未明确。 | 研究SGS病例中适应性免疫反应的多样性与健康对照的比较。 | SGS（24例）和iLTS（8例）患者与健康对照（7例）的T细胞受体库。 | 数字病理学 | 亚声门狭窄 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因序列 | 39个样本（SGS患者24，iLTS患者8，健康对照7） |
| 184 | 2024-08-04 |
A transcriptomics-based RNAi screen for regulators of meiosis and early stages of oocyte development in Drosophila melanogaster
2024-04-03, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkae028
PMID:38333961
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研究论文 | 该研究通过转录组学方法识别果蝇卵巢中与减数分裂和早期卵母细胞发育相关的调控基因 | 采用转录组学分析结合已发表的单细胞RNA-seq数据，找到2743个共表达基因，其中许多与减数分裂和卵母细胞发育相关 | 研究主要集中在已知的基因上，可能忽略了其他未被充分阐明的基因的功能 | 识别早期卵母细胞发育和减数分裂中涉及的基因 | 以果蝇卵巢为对象，分析早期发育过程中的基因表达与功能 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因组数据 | 分析了3个已发表的单细胞RNA-seq数据集，共测试了526条RNAi线路 |
| 185 | 2024-08-04 |
Integrated analysis highlights the significance role of ITGAL in lung adenocarcinoma
2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18289
PMID:38613346
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研究论文 | 本研究揭示了整合素α L (ITGAL) 在肺腺癌中的生物学功能及其作为预后生物标志物的意义 | 发现ITGAL在肺腺癌患者中是独立的预后预测因子，并抑制肿瘤的恶性进展 | 本研究主要依赖TCGA数据集，可能存在数据的选择偏差 | 探讨ITGAL在肺腺癌中的作用及其临床预后价值 | 研究了肺腺癌样本中ITGAL的表达与临床预后的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序，3D Matrigel培养，BrdU ELISA，伤口愈合迁移实验，细胞粘附实验 | NA | mRNA表达，单细胞测序数据 | 使用TCGA数据集的肺腺癌样本，具体样本数量未提供 |
| 186 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals tumoral microenvironment heterogenicity and hypervascularization in human carotid body tumor
2024-Apr, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31175
PMID:38214142
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研究论文 | 本研究对人类颈动脉体瘤的单细胞转录组进行分析，揭示了肿瘤微环境的异质性和高血管生成特征 | 首次对颈动脉体瘤的单细胞转录组进行全面特征描述，提供了形成机制的新见解 | 尚未提及研究的具体限制 | 解析颈动脉体瘤的微环境组成及分子复杂性 | 人类颈动脉体瘤的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 187 | 2024-08-05 |
DNA G-Quadruplex in NRP1 Promoter Facilitates SARS-CoV-2 Infection
2024-Apr-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084422
PMID:38674009
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研究论文 | 本文探讨了DNA G-四链体在NRP1启动子中的作用如何促进SARS-CoV-2感染。 | 揭示了G-四链体在SARS-CoV-2感染中的新机制，以及其对NRP1表达和病毒进入细胞的重要性。 | 未详细讨论G-四链体干预的潜在效果及其在不同细胞类型中的普适性。 | 研究G-四链体在宿主因子NRP1启动子中的作用及其对SARS-CoV-2感染的影响。 | 重点研究NRP1启动子中的G-四链体，并分析其对SARS-CoV-2感染的促进作用。 | 数字病理学 | NA | 生物信息学、生化分析和生物学测定 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从人类支气管上皮细胞中获得的模拟SARS-CoV-2感染的单细胞数据 |
| 188 | 2024-08-04 |
Upregulation of EMR1 (ADGRE1) by Tumor-Associated Macrophages Promotes Colon Cancer Progression by Activating the JAK2/STAT1,3 Signaling Pathway in Tumor Cells
2024-Apr-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084388
PMID:38673975
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞如何通过激活JAK2/STAT1,3信号通路促进结肠癌的进展。 | 揭示了EMR1在结肠癌中的作用及其与巨噬细胞的信号相互作用的机制。 | 此研究未探讨其他可能的信号通路对结肠癌进展的影响。 | 研究EMR1及其与巨噬细胞的信号相互作用在结肠癌进展中的作用。 | 肿瘤相关巨噬细胞和结肠癌细胞。 | 数字病理学 | 结肠癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | pT3微卫星不稳定结肠癌组织 |
| 189 | 2024-08-05 |
Identification of PPAR-related differentially expressed genes liver hepatocellular carcinoma and construction of a prognostic model based on data analysis and molecular docking
2024-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18304
PMID:38652093
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据探讨肝细胞癌（LIHC）的分子机制并构建预后模型 | 通过分析PPAR相关基因的差异表达，构建了一个基于这8个基因的预后模型，并探索了小分子药物的潜在靶点 | 本研究未提及样本量的具体信息和潜在的临床应用验证 | 探索肝细胞癌的发展分子机制并识别潜在治疗靶点 | 肝细胞癌样本中的PPAR相关基因及其差异表达 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析模型 | 基因表达数据 | NA |
| 190 | 2024-08-05 |
Direct programming of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors with SOX17 and FGF2
2024-Apr-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.006
PMID:38518781
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研究论文 | 本文探讨了转录因子SOX17和FGF2在诱导人类多能干细胞转化为内皮前体的作用 | 发现SOX17的过表达能够显著提高CD34和血管内皮钙粘蛋白（VEC）阳性细胞的比例，从而揭示了SOX17在内皮前体分化中的新功能 | NA | 明确SOX17在内皮前体分化中的作用机制 | 人类多能干细胞及其衍生的内皮前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas13d | NA | 细胞 | 使用诱导的人类多能干细胞系进行实验 |
| 191 | 2024-08-04 |
Redox signalling regulates breast cancer metastasis via phenotypic and metabolic reprogramming due to p63 activation by HIF1α
2024-Apr, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02522-5
PMID:38238426
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研究论文 | 该研究揭示了红氧信号通过HIF1α激活p63来调控乳腺癌转移的机制 | 本研究首次揭示了GPx2敲低引发的表型和代谢重编程如何影响肿瘤细胞亚群及其转录调控因子 | 研究中没有提到具体样本的种类及数量，可能影响结果的广泛性 | 探讨红氧信号在乳腺癌转移过程中的作用及其机制 | 研究对象是PyMT乳腺肿瘤模型中的细胞群体及其肺转移 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 肿瘤细胞转录组数据 | NA |
| 192 | 2024-08-05 |
ENO1 promotes trophoblast invasion regulated by E2F8 in recurrent miscarriage
2024-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302032RR
PMID:38661062
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研究论文 | 本研究探讨了ENO1在复发性流产中通过E2F8调控滋养层细胞侵袭的机制 | 发现ENO1通过E2F8依赖性方式促进滋养层细胞侵袭，为复发性流产的生理机制提供了潜在的新靶点 | 研究主要基于基因表达分析，缺乏临床样本验证和长期跟踪研究 | 探索复发性流产的机制及其与滋养层细胞功能障碍的关系 | 主要研究复发性流产中的外滋养层细胞（EVTs）及其相关基因 | 数字病理学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA测序, 免疫荧光检测, 西方印迹, 染色质免疫沉淀(ChIP), 实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR), 透析实验 | NA | 基因表达数据 | 1724个差异表达基因的分析 |
| 193 | 2024-08-05 |
ptx3a+ fibroblast/epicardial cells provide a transient macrophage niche to promote heart regeneration
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114092
PMID:38607913
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研究论文 | 本文探讨了在再生心脏中参与巨噬细胞修复的细胞间相互作用 | 识别了ptx3a+成纤维细胞/心外膜细胞与巨噬细胞间的强交互，并阐明了其在心脏再生中的重要性 | 未详细研究其他细胞类型对巨噬细胞反应的影响 | 研究巨噬细胞在心脏修复中的微环境 | 关注再生斑马鱼心脏中的巨噬细胞以及其周围的细胞 | 数字病理学 | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了斑马鱼模型进行实验 |
| 194 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing in Organ and Cell Transplantation
2024-Apr-11, Biosensors
DOI:10.3390/bios14040189
PMID:38667182
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在器官和细胞移植中的应用及其潜在影响 | 介绍了单细胞RNA测序如何揭示移植组织转录组以及与移植并发症相关的细胞类型和状态 | 文章未详细讨论单细胞RNA测序技术的挑战和局限性 | 研究单细胞RNA测序在器官和干细胞移植中的应用 | 应用单细胞RNA测序分析被移植组织中的供体和受体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 195 | 2024-08-05 |
Potential Roles of Specific Subclasses of Premotor Interneurons in Spinal Cord Function Recovery after Traumatic Spinal Cord Injury in Adults
2024-Apr-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080652
PMID:38667267
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研究论文 | 本文探讨了特定类型的前运动抑制性神经元在成人创伤性脊髓损伤后的脊髓功能恢复中的潜在作用 | 提出前运动抑制性神经元能够在不同类型的创伤性脊髓损伤后创造新的脊髓内电路 | 目前的研究中缺乏对这些细胞特定身份的明确说明 | 探讨特定抑制性神经元在脊髓功能恢复中的作用 | 聚焦于成人创伤性脊髓损伤后的脊髓内特定亚类神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-05 |
Reconstruction Set Test (RESET): A computationally efficient method for single sample gene set testing based on randomized reduced rank reconstruction error
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012084
PMID:38683883
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研究论文 | 本文提出了一种名为重构集测试（RESET）的单样本基因集测试方法 | RESET方法通过随机降秩重构算法提供了一种计算上高效的基因集重要性量化方式 | NA | 研究单样本基因集测试的新方法 | 基因集及其在测量基因值重构中的重要性 | 生物信息学 | NA | 随机降秩重构算法 | NA | scRNA-seq数据 | 真实和模拟的scRNA-seq数据 |
| 197 | 2024-08-04 |
Identification of key molecules in the formation of portal vein tumor thrombus in hepatocellular carcinoma based on single cell transcriptomics and in vitro experiments
2024-Apr-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1589
PMID:38737676
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓形成的关键分子 | 通过单细胞转录组学技术和体外实验，识别了与肝细胞癌PVTT形成相关的关键基因和调控网络 | 研究可能存在样本量小或只依赖于生物信息学分析的局限性 | 探究肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓形成的分子机制及其与免疫浸润的关联 | 识别与PVTT发展相关的基因及其调控miRNA和lncRNA | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，hdWGCNA，高维基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 198 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing Reveals Molecular Expression Differences and Marker Genes in Testes during the Sexual Maturation of Mongolian Horses
2024-Apr-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14091258
PMID:38731262
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研究论文 | 本研究旨在调查蒙古马性成熟过程中睾丸组织形态、基因表达及标记基因的差异 | 通过单细胞转录组测序技术揭示了不同年龄组之间睾丸细胞的显著差异和潜在的性成熟标记基因 | NA | 探索蒙古马的生殖生理及识别性成熟潜在标记 | 对1岁（性未熟）和10岁（性成熟）蒙古马的睾丸组织进行了比较研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 2个年龄组的睾丸组织样本，分别为1岁和10岁 |
| 199 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics in MI identify Slc25a4 as a new modulator of mitochondrial malfunction and apoptosis-associated cardiomyocyte subcluster
2024-04-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59975-8
PMID:38654053
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析确定了Slc25a4作为心肌梗死相关线粒体功能障碍和细胞凋亡的调节因子 | 创新性地识别了与心肌梗死后心室重塑密切相关的心肌细胞新亚群C5，以及新标志基因Slc25a4 | 研究限制在于仅使用了GEO数据库中的单细胞数据，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究的目的是确定心肌细胞的转录谱及其在缺氧条件下的异质性 | 研究对象为心肌梗死和假手术组的小鼠心脏中的心肌细胞 | 数字病理学 | 心肌梗死 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 200 | 2024-08-05 |
Schwann cell derived pleiotrophin stimulates fibroblast for proliferation and excessive collagen deposition in plexiform neurofibroma
2024-Apr, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00727-1
PMID:38302728
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研究论文 | 本研究探讨了施旺细胞源性多效素如何刺激成纤维细胞增殖和胶原沉积。 | 提出了PTN/NCL/PRAS40轴在施旺细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞之间相互作用的重要性，提供了新的分子机制见解。 | 本研究的样本基于人类pNF，可能限制了在其他类型神经肿瘤中的适用性。 | 研究施旺细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞之间的相互作用，及其对pNF发展的影响。 | 主要研究对象为来自pNF样本的人类施旺细胞和神经纤维瘤相关成纤维细胞。 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序、功能性实验（如CCK8、EdU等） | NA | 转录组数据、细胞培养实验数据 | NA |