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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-11-10 |
High throughput functional profiling of genes at intraocular pressure loci reveals distinct networks for glaucoma
2024-04-18, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae003
PMID:38272457
|
研究论文 | 研究通过基因敲除和高通量功能分析,揭示了与青光眼相关基因的网络 | 首次在单细胞水平上通过高通量分析研究了基因敲除对眼内压相关基因的影响,并识别出三个具有相似转录组特征的基因网络 | 研究仅限于特定的细胞系和基因敲除,可能无法完全代表所有青光眼病例 | 旨在识别与原发性开角型青光眼相关的遗传和形态变异 | 原发性开角型青光眼相关的基因和细胞形态 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像和基因表达数据 | 62个基因在55个位点的敲除,包括五个非靶向对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-11-07 |
Deciphering the regulatory landscape of murine splenic response to anemic stress at single-cell resolution
2024-04-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023011965
PMID:38315834
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研究论文 | 研究了小鼠脾脏在贫血压力下的单细胞分辨率调控景观 | 发现了早期红系前体细胞在贫血压力下的显著出现,并识别出一种新的标记物CD81用于标记红细胞岛中的中心巨噬细胞 | NA | 探索贫血压力下红系前体细胞的分子机制 | 小鼠脾脏组织中的红系前体细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从接受苯肼和连续放血的小鼠中分离的脾脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-10-30 |
scLENS: data-driven signal detection for unbiased scRNA-seq data analysis
2024-Apr-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47884-3
PMID:38678050
|
研究论文 | 本文开发了一种名为scLENS的降维工具,用于无偏差的单细胞RNA测序数据分析 | scLENS通过L2归一化解决了对数归一化过程中的信号失真问题,并利用随机矩阵理论和信号鲁棒性测试实现了数据驱动的信号维度确定 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中的信号失真和用户偏差问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-10-26 |
Senolytic and senomorphic agent procyanidin C1 alleviates structural and functional decline in the aged retina
2024-Apr-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311028121
PMID:38657052
|
研究论文 | 研究了衰老视网膜中细胞衰老负担增加对结构和功能的影响,并验证了原花青素C1(PCC1)的抗衰老和抗衰老细胞特性 | 首次全面描述了PCC1对衰老视网膜的改善作用,并通过单细胞RNA测序揭示了其分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类中验证 | 探讨衰老视网膜中的细胞衰老负担及其治疗潜力 | 衰老视网膜的结构和功能变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-10-24 |
PROSTATE CELL HETEROGENEITY AND CXCL17 UPREGULATION IN MOUSE STEROID HORMONE IMBALANCE
2024-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.24.590980
PMID:38712029
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研究论文 | 研究了在小鼠激素失衡模型中前列腺细胞异质性和CXCL17上调的现象 | 首次在小鼠激素失衡模型中识别出特定的泡沫细胞亚群,并确认了CXCL17在驱动巨噬细胞迁移和腔内定位中的潜在病理作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证结果 | 进一步表征激素失衡模型中前列腺的细胞异质性,并识别招募的泡沫细胞的特定转录组特征 | 小鼠前列腺中的巨噬细胞和泡沫细胞 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6J雄性小鼠,植入睾酮和雌二醇缓释颗粒(T+E2),两周后采集前列腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-10-24 |
Therapeutic Activity of Resolvin D1 (RvD1) in Murine MASH
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590633
PMID:38712196
|
研究论文 | 研究了Resolvin D1 (RvD1)在实验性代谢相关脂肪性肝炎(MASH)小鼠模型中的治疗作用及其机制 | 揭示了RvD1通过抑制Stat1-Cxcl10信号通路减少炎症、缓解内质网应激介导的细胞凋亡以及促进MMP介导的纤维化逆转 | NA | 确定RvD1保护MASH进展的机制 | 实验性MASH小鼠模型中的RvD1治疗效果 | NA | 代谢相关脂肪性肝炎 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括骨髓来源的巨噬细胞(BMDMs)、Kupffer细胞、T细胞和原代肝细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-10-24 |
Long-Term Follow-Up Defines the Population That Benefits from Early Interception in a High-Risk Smoldering Multiple Myeloma Clinical Trial Using the Combination of Ixazomib, Lenalidomide, and Dexamethasone
2024-Apr-19, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.04.19.24306082
PMID:38699307
|
研究论文 | 本研究探讨了伊沙佐米、来那度胺和地塞米松联合治疗高风险冒烟型多发性骨髓瘤(HR-SMM)的长期随访结果,并分析了深度反应对长期预后的影响 | 首次研究了深度反应对HR-SMM患者长期预后的影响,并探讨了基因组改变和20/2/20模型在定义早期治疗受益人群中的作用 | 研究样本量较小,且未探讨所有可能的基因组改变对预后的影响 | 评估伊沙佐米、来那度胺和地塞米松联合治疗HR-SMM的长期疗效和安全性,并探讨深度反应对预后的影响 | 高风险冒烟型多发性骨髓瘤患者 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、全基因组测序 | NA | 基因组数据、单细胞数据 | 55名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-10-24 |
Recessive variants in MYO1C as a potential novel cause of proteinuric kidney disease
2024-Apr-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4183332/v1
PMID:38659911
|
研究论文 | 本文通过全外显子测序和同源性映射,识别了MYO1C基因中的隐性变异作为儿童肾病综合征的新潜在原因 | 首次识别MYO1C基因中的隐性变异作为儿童肾病综合征的新潜在原因 | 研究样本仅限于1649名患有肾病综合征的儿童,可能存在样本偏倚 | 揭示肾病综合征的新的单基因原因 | MYO1C基因中的隐性变异 | NA | 肾病 | 全外显子测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1649名患有肾病综合征的儿童 | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-10-16 |
NSUN2-Mediated m5C Methylation Impairs Endometrial Receptivity
2024-04, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.100327
PMID:38237738
|
研究论文 | 研究NSUN2介导的m5C甲基化对子宫内膜容受性的影响 | 揭示了NSUN2介导的m5C甲基化与反复植入失败之间的复杂调控机制,并提出了潜在的治疗策略 | NA | 探讨NSUN2介导的m5C甲基化在反复植入失败中的作用机制 | NSUN2在子宫内膜中的表达及其对细胞增殖、自噬和胚胎附着的影响 | NA | NA | mC-BS-seq, dot blot assay, BrdU assay, western blotting, real-time reverse-transcription PCR, Cut&Tag, coimmunoprecipitation | NA | RNA, 蛋白质 | 15个人类子宫内膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-10-15 |
Bioinformatics-based diagnosis and evaluation of several pivotal genes and pathways associated with immune infiltration at different time points in spinal cord injury
2024-Apr, Biotechnology & genetic engineering reviews
DOI:10.1080/02648725.2023.2178970
PMID:36841940
|
研究论文 | 本研究利用生物信息学方法分析脊髓损伤后不同时间点的关键基因和信号通路,评估免疫浸润情况 | 首次通过基因表达数据和功能富集分析方法,揭示了脊髓损伤后不同时间点的免疫相关基因和信号通路 | 研究仅基于两个基因表达数据集,样本量有限,可能影响结果的普适性 | 探讨脊髓损伤后不同时间点的免疫相关基因和信号通路,为干预策略提供理论基础 | 脊髓损伤后的关键基因和信号通路 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 两个基因表达数据集(GSE464和GSE45006),分别包含370个和111个共享基因 | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-10-08 |
The interplay of Cxcl10+/Mmp14+ monocytes and Ccl3+ neutrophils proactively mediates silica-induced pulmonary fibrosis
2024-04-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.133713
PMID:38335607
|
研究论文 | 研究揭示了Cxcl10+/Mmp14+单核细胞和Ccl3+中性粒细胞在硅肺纤维化中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出与硅肺纤维化相关的Cxcl10+/Mmp14+单核细胞和Ccl3+中性粒细胞,并提出抗受体-配体对治疗策略 | NA | 探讨硅肺纤维化的分子机制并寻找潜在的治疗策略 | Cxcl10+/Mmp14+单核细胞和Ccl3+中性粒细胞在硅肺纤维化中的作用 | 数字病理学 | 职业病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 硅肺小鼠的肺组织样本和硅肺患者的血清及肺组织切片 | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-10-04 |
Identification of Colorectal Cancer Cell Stemness from Single-Cell RNA Sequencing
2024-04-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-23-0468
PMID:38156967
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别结直肠癌中的癌症干细胞 | 提出了一个单细胞干细胞特征(SCS_sig),能够稳健地识别表达所有标记基因的结直肠癌干细胞 | SCS_sig评分在不同肿瘤间差异较大,反映了结直肠癌转录组的异质性 | 研究结直肠癌中的癌症干细胞及其与复发的关系 | 结直肠癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个原发性结肠肿瘤、9个肝转移肿瘤和11个正常对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-09-27 |
Microglia and macrophages alterations in the CNS during acute SIV infection: a single-cell analysis in rhesus macaques
2024-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588047
PMID:38617282
|
研究论文 | 研究了急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的动态变化 | 样本量较小,仅包括三只感染SIV的猕猴和三只未感染的对照组 | 探讨急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的响应机制 | 急性SIV感染的猕猴中枢神经系统中的微胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三只感染SIV的猕猴和三只未感染的对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-09-25 |
Directed Differentiation of Human Induced Pluripotent Stem Cells to Heart Valve Cells
2024-Apr-30, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文开发了一种高效的方法,通过激活特定的信号通路,将人类诱导多能干细胞(hiPSCs)定向分化为功能性的心脏瓣膜细胞 | 首次报道了一种高效策略,能够生成功能性的hiPSC衍生的瓣膜内皮样细胞和瓣膜间质样细胞,并阐明了分化轨迹和转录动力学 | NA | 解决当前心脏瓣膜疾病研究中高质量同质功能性心脏瓣膜细胞缺乏的问题 | 人类诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化后的心脏瓣膜细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约70% CD144+细胞和30% CD144-细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-08-07 |
Correction: Practical Compass of Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-Apr, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-024-00861-7
PMID:38372900
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-09-19 |
Single-cell transcriptome analysis profiling lymphatic invasion-related TME in colorectal cancer
2024-04-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59656-6
PMID:38632387
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了结直肠癌中淋巴管侵袭相关的肿瘤微环境特征 | 首次建立了基于14个淋巴管侵袭相关特征的LIRS模型,并验证了其在预测预后方面的准确性 | 研究数据主要来自TCGA和GEO数据库,可能存在样本偏倚 | 探讨结直肠癌中淋巴管侵袭的细胞和分子机制,寻找新的治疗靶点和诊断标志物 | 结直肠癌患者的淋巴管侵袭相关肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | LIRS模型 | 转录组数据 | 来自TCGA数据库的结肠腺癌患者数据和来自GEO数据库的三组结直肠癌患者单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-09-19 |
The Web-Based Portal SpatialTME Integrates Histological Images with Single-Cell and Spatial Transcriptomics to Explore the Tumor Microenvironment
2024-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2650
PMID:38315776
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为SpatialTME的网络平台,该平台整合了组织学图像与单细胞和空间转录组学数据,以探索肿瘤微环境 | 开发了一个综合的交互式分析资源,专门用于表征空间肿瘤微环境,并提供了一个用户友好的数据库SpatialTME | NA | 探索肿瘤微环境中的细胞间相互作用及其对肿瘤发展和治疗反应的影响 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | 296个空间转录组学切片,涵盖19种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-09-19 |
Tumor Cell-Intrinsic p38 MAPK Signaling Promotes IL1α-Mediated Stromal Inflammation and Therapeutic Resistance in Pancreatic Cancer
2024-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1200
PMID:38285896
|
研究论文 | 研究探讨了p38 MAPK信号通路在胰腺癌中通过IL1α介导的基质炎症和治疗抗性中的作用 | 首次揭示了肿瘤细胞内在的p38-p65/Sp1-IL1α信号机制,该机制维持基质炎症和CAF激活 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的人体临床验证 | 揭示胰腺癌中p38 MAPK信号通路对IL1α表达的调控机制及其在治疗抗性中的作用 | 胰腺导管腺癌(PDAC)中的p38 MAPK信号通路和IL1α表达 | 癌症研究 | 胰腺癌 | 转录组分析、染色质免疫共沉淀、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了高度纤维化的PDAC小鼠模型PKT进行单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-09-19 |
Th17 Cells Secrete TWEAK to Trigger Epithelial-Mesenchymal Transition and Promote Colorectal Cancer Liver Metastasis
2024-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2123
PMID:38335276
|
研究论文 | 研究揭示了Th17细胞通过分泌TWEAK促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次揭示了Th17细胞通过分泌TWEAK促进肿瘤细胞的上皮-间质转化(EMT),从而促进结直肠癌肝转移 | 研究主要基于小鼠模型和部分患者样本,需要进一步在更大规模的人类样本中验证 | 探讨免疫细胞与肿瘤细胞上皮-间质转化在结直肠癌肝转移中的相互作用 | Th17细胞、TWEAK、Fn14受体、肿瘤细胞 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、CRISPR基因编辑、脂质纳米颗粒封装siRNA | NA | RNA | 130个样本,来自18名同时患有结直肠癌肝转移的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-09-19 |
Big data analytics for MerTK genomics reveals its double-edged sword functions in human diseases
2024-04, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103061
PMID:38341954
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研究论文 | 本文利用大数据分析技术研究了MerTK基因在人类细胞、组织和疾病中的双重作用 | 首次通过大数据分析揭示了MerTK基因在多种人类疾病中的双重作用,并探讨了其在性别差异中的影响 | 研究主要基于现有数据,缺乏对MerTK基因在不同疾病中具体机制的深入实验验证 | 探索MerTK基因在人类细胞、组织和疾病中的生物学功能及其潜在的治疗应用 | MerTK基因在人类细胞、组织和疾病中的表达及其在不同疾病中的作用 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 42,700个样本 | NA | NA | NA | NA |