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当前共找到 491 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-29 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590125
PMID:38712088
|
研究论文 | 本研究通过构建结肠的细胞和空间图谱，揭示了结肠组织在衰老过程中的时空动态变化 | 开发了新的计算框架cSplotch，利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息，建立了与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达层次贝叶斯模型 | 研究仅限于小鼠模型，人类结肠衰老的直接适用性需要进一步验证 | 探究结肠组织结构和分子回路在衰老过程中的时空动态变化 | 小鼠结肠组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约1,500个小鼠肠道组织进行空间转录组分析，约400,000个单核RNA测序图谱 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-12 |
CITEViz: interactively classify cell populations in CITE-Seq via a flow cytometry-like gating workflow using R-Shiny
2024-Apr-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05762-1
PMID:38566005
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研究论文 | 开发了一个名为CITEViz的R-Shiny应用，用于通过流式细胞术样门控工作流程交互式分类CITE-Seq数据中的细胞群体 | 首个能够处理多组学测序数据集并允许用户交互式门控细胞的工具，无需编写冗余代码指定门边界 | 仅适用于经过Seurat处理的CITE-Seq数据，功能相对基础 | 简化CITE-Seq数据中的细胞群体分类流程 | 外周血单个核细胞CITE-Seq数据集 | 生物信息学 | NA | CITE-Seq, 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学, CITE-Seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-12 |
Programmed Death Ligand 1-Expressing Macrophages and Their Protective Role in the Joint During Arthritis
2024-Apr, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42749
PMID:37997621
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研究论文 | 本研究探讨了表达程序性死亡配体1的巨噬细胞在关节炎中对关节的保护作用 | 首次揭示PD-L1+巨噬细胞通过表达MerTK和IL-10在关节炎中发挥保护作用，并在人类和小鼠滑膜中得到验证 | 研究主要基于胶原诱导性关节炎小鼠模型，人类样本验证仍需扩展 | 研究PD-L1在滑膜中的保护作用及其在关节炎中的机制 | 小鼠模型和人类滑膜组织 | 免疫学 | 关节炎 | 流式细胞术, 逆转录聚合酶链反应, 单细胞RNA测序 | 胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠模型和人类滑膜样本（健康个体和类风湿关节炎患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-05 |
Multi-pronged analysis of pediatric low-grade glioma reveals a unique tumor microenvironment associated with BRAF alterations
2024-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588294
PMID:38645202
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和细胞因子分析揭示儿童低级别胶质瘤肿瘤微环境的异质性特征 | 首次采用多组学方法系统分析pLGG肿瘤微环境，发现BRAF基因改变与特定肿瘤免疫表型的关联 | 需要进一步研究免疫细胞浸润和肿瘤-免疫相互作用的机制 | 深入了解儿童低级别胶质瘤生物学特性以开发更有效的治疗方法 | 儿童低级别胶质瘤（pLGG）样本，包括毛细胞星形细胞瘤（PA）和神经节胶质瘤（GG） | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞因子分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of 5-aminolevulinic acid intraoperative labeling specificity for glioblastoma
2024-04-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2023.7.JNS23122
PMID:37773782
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析评估5-氨基乙酰丙酸在胶质母细胞瘤术中标记的特异性 | 首次在单细胞水平验证5-ALA标记胶质瘤细胞的特异性，发现其标记并非仅针对肿瘤细胞 | 需要进一步系统比较5-ALA与其他荧光引导手术替代方案的性能 | 确定5-ALA在胶质母细胞瘤中标记不同细胞类型的特异性 | 人类胶质母细胞瘤手术标本、胶质瘤细胞培养模型、小鼠胶质瘤模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞光学表型与表达测序(SCOPE-seq2)、单细胞RNA测序、细胞培养 | NA | 图像、RNA测序数据 | 人类胶质母细胞瘤手术标本、细胞培养模型、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | SCOPE-seq2（配对单细胞成像和RNA测序方法） |
| 6 | 2025-10-05 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.10.588953
PMID:38645099
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研究论文 | 本研究通过基因组编辑技术揭示了人类特异性增强子HAR对大脑皮层发育的调控机制 | 首次证明人类特异性增强子HAR通过调控WNT信号通路精细调节神经前体细胞的增殖和神经发生能力 | 研究主要依赖动物模型和类器官，与真实人类大脑发育环境存在差异 | 探索人类特异性基因组区域HAR在皮层发育中的功能作用 | 基因组编辑小鼠、灵长类模型、人类和黑猩猩神经前体细胞及皮层类器官 | 发育神经生物学 | NA | 基因组编辑、单细胞RNA测序、活体成像、谱系分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、成像数据 | 多种基因编辑动物模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Human Motor Neurons Elicit Pathological Hallmarks of ALS and Reveal Potential Biomarkers of the Disease in Response to Prolonged IFNγ Exposure
2024-04-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1787-23.2024
PMID:38413232
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研究论文 | 本研究通过长期干扰素-γ处理人源诱导多能干细胞衍生的脊髓运动神经元，揭示了ALS病理特征并发现潜在生物标志物 | 首次证明IFNγ暴露可直接导致TDP-43细胞质聚集和p53通路激活，无需遗传突变或神经胶质细胞参与 | 研究基于体外细胞模型，未在完整生物体系统中验证 | 探究干扰素-γ在肌萎缩侧索硬化发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 人源诱导多能干细胞衍生的脊髓运动神经元 | 神经退行性疾病研究 | 肌萎缩侧索硬化 | 单细胞转录组分析，电生理功能检测 | NA | 转录组数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Rohon-Beard Neurons Implicates Fgf Signaling in Axon Maintenance and Cell Survival
2024-04-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1600-23.2024
PMID:38423763
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼Rohon-Beard神经元，揭示其分为三个亚类并发现Fgf信号通路在轴突维持和细胞存活中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统鉴定斑马鱼Rohon-Beard神经元的分子亚型，并发现Fgf信号通路在感觉神经元维持中的新功能 | 研究主要聚焦斑马鱼幼虫期神经元，成年期神经元的特性尚未探索 | 阐明斑马鱼Rohon-Beard感觉神经元的分子特征和功能调控机制 | 斑马鱼幼虫期Rohon-Beard神经元 | 单细胞转录组学 | 周围神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼幼虫Rohon-Beard神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
SMARCA4 Loss and Mutated β-Catenin Induce Proliferative Lesions in the Murine Embryonic Cerebellum
2024-04-10, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1605-23.2024
PMID:38383496
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型探究SMARCA4缺失和β-连环蛋白突变在小鼠胚胎小脑中诱导增殖性病变的机制 | 首次揭示β-连环蛋白突变单独可导致严重发育表型，并与SMARCA4缺失协同诱导小脑早期祖细胞增殖性病变 | 体外培养中双突变细胞未显示致瘤潜力，提示胚胎微环境对病变发展具有重要作用 | 解析异常WNT信号和SMARCA4缺陷诱导肿瘤发生机制 | 基因工程小鼠模型（BLBP-Cre小鼠） | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | DNA甲基化分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 胚胎期E13.5至E16.5的小鼠小脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analysis reveals the tumour microenvironment in patients with endometrial cancer responding to anti-PD-1 treatment
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1668
PMID:38649737
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Single-molecule RNA-FISH analysis reveals stochasticity in reactivation of latent HIV-1 regulated by Nuclear Orphan Receptors NR4A and cMYC
2024-Apr-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4166090/v1
PMID:38699331
|
研究论文 | 通过单分子RNA-FISH技术研究HIV-1潜伏病毒再激活的随机性及其受核孤儿受体NR4A和cMYC调控的机制 | 首次使用单分子RNA-FISH技术揭示HIV-1前病毒再激活具有细胞间高度变异的随机性特征，并发现cMYC和NR4A3作为调控该过程的外在因子 | 研究主要基于细胞系和有限的原代CD4 T细胞样本，需要更大规模的临床验证 | 研究HIV-1潜伏病毒再激活的机制及其调控因素 | HIV-1潜伏感染的细胞系和艾滋病病毒抑制患者的原代CD4 T细胞 | 分子生物学 | 艾滋病 | 单分子RNA-FISH, FISH-Quant分析, 单细胞RNA-seq | NA | 图像数据, 基因表达数据 | 细胞系和原代CD4 T细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单分子RNA-FISH, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Redox signalling regulates breast cancer metastasis via phenotypic and metabolic reprogramming due to p63 activation by HIF1α
2024-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02522-5
PMID:38238426
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示氧化还原信号通过HIF1α激活p63调控乳腺癌转移的表型和代谢重编程机制 | 首次发现GPx2敲低通过HIF1α-p63轴驱动混合上皮-间质转化状态，揭示其在原发灶和转移灶中不同的代谢适应性 | 研究基于PyMT乳腺肿瘤模型，结果在人类乳腺癌中的普适性需要进一步验证 | 阐明氧化还原信号调控乳腺癌转移的细胞亚群和转录调控机制 | PyMT乳腺肿瘤模型中的肿瘤细胞亚群及其肺转移灶 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | PyMT/GPx2 KD原发肿瘤及配对肺转移灶样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Revealing the role of necroptosis microenvironment: FCGBP + tumor-associated macrophages drive primary liver cancer differentiation towards cHCC-CCA or iCCA
2024-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01908-3
PMID:38017206
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了FCGBP+肿瘤相关巨噬细胞通过调控坏死性凋亡微环境驱动原发性肝癌向cHCC-CCA或iCCA分化的机制 | 首次识别FCGBP+SPP1+肿瘤相关巨噬细胞是调控坏死性凋亡微环境的关键细胞，并发现S100A6在癌前细胞向iCCA和cHCC-CCA进展中的重要作用 | 样本量较小（34个单细胞样本和3个空间转录组样本），主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探究坏死性凋亡微环境在原发性肝癌分化中的作用机制 | 原发性肝癌患者组织样本，包括HCC、iCCA和cHCC-CCA | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 免疫组织化学 | Seurat, monocle2, AUCell, geneSwitches, SpaCET, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 34个单细胞样本（4例HCC患者和3例iCCA患者），3个空间转录组样本（各1例HCC、iCCA和cHCC-CCA） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Apoptosis-related prognostic biomarkers and potential targets for acute kidney injury based on machine learning algorithm and in vivo experiments
2024-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01896-4
PMID:37789227
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法和体内实验识别了三个与细胞凋亡相关的急性肾损伤诊断生物标志物 | 首次结合WGCNA、差异表达分析和机器学习算法鉴定出CBFB、EGF和COL1A1三个核心凋亡相关基因作为AKI诊断标志物，并构建了诊断模型 | 研究样本来源和数量未明确说明，诊断模型需要在更大临床样本中进一步验证 | 开发急性肾损伤的精确诊断生物标志物和治疗方法 | 急性肾损伤患者和AKI小鼠模型 | 机器学习 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，差异表达分析，逻辑回归分析，CIBERSORT免疫浸润分析 | 逻辑回归，ROC曲线分析 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Cross-modality mapping using image varifolds to align tissue-scale atlases to molecular-scale measures with application to 2D brain sections
2024-Apr-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47883-4
PMID:38664422
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研究论文 | 开发了一种使用图像变差形式将组织尺度图谱与分子尺度测量对齐的跨模态映射方法 | 提出将空间转录组数据表示为编码位置和高维特征（基因、细胞类型）身份的广义函数，通过LDDMM同时求解坐标的最小化测地线微分同胚和潜在特征密度 | NA | 建立分子尺度转录组学与组织尺度图谱之间的对应关系 | 小鼠脑图谱、基因和细胞转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | LDDMM | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | MERFISH, BARseq | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Respiratory viral infection promotes the awakening and outgrowth of dormant metastatic breast cancer cells in lungs
2024-Apr-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4210090/v1
PMID:38645169
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研究论文 | 本研究揭示呼吸道病毒感染通过IL-6依赖机制唤醒肺内休眠乳腺癌细胞并促进转移灶形成 | 首次证实呼吸道病毒可通过改变肿瘤微环境唤醒休眠癌细胞，并发现CD4 T细胞在维持转移负荷中的新作用 | 主要基于小鼠模型，人类观察数据仅为相关性证据 | 探究呼吸道病毒感染对休眠乳腺癌细胞激活和转移的影响机制 | 小鼠模型中的休眠乳腺癌细胞和人类癌症幸存者 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床观察数据 | 小鼠实验模型及人类癌症幸存者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
ScRNA-seq reveals novel immune-suppressive T cells and investigates CMV-TCR-T cells cytotoxicity against GBM
2024-04-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008967
PMID:38688579
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质母细胞瘤中新型免疫抑制性T细胞，并开发靶向CMV的TCR-T细胞疗法 | 首次在CMV感染的胶质母细胞瘤中发现双阳性CD68+SOX2+肿瘤相关巨噬细胞和FXYD6+ T细胞两种新型免疫细胞亚群，并证实FXYD6+ T细胞是一类新型免疫抑制性T细胞 | NA | 探究巨细胞病毒感染对胶质母细胞瘤免疫微环境的影响，并开发靶向CMV的TCR-T细胞疗法 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织、CMV感染的胶质母细胞瘤免疫微环境 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR/BCR测序,免疫电镜,免疫荧光,微滴数字PCR,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Dysregulation of CD4+ and CD8+ resident memory T, myeloid, and stromal cells in steroid-experienced, checkpoint inhibitor colitis
2024-04-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008628
PMID:38642938
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析免疫检查点抑制剂相关结肠炎的细胞机制，重点关注类固醇治疗患者的免疫细胞和基质细胞变化 | 首次在类固醇治疗过的免疫检查点抑制剂结肠炎患者中系统分析CD4+和CD8+组织驻留记忆T细胞、髓系细胞和基质细胞的失调机制 | 样本主要来自类固醇治疗过的患者，可能影响对疾病原始机制的解读 | 阐明免疫检查点抑制剂相关结肠炎的发病机制，特别是在类固醇治疗背景下的细胞变化 | 免疫检查点抑制剂相关结肠炎患者的结肠活检组织和血液样本 | 单细胞组学 | 免疫相关结肠炎 | 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 主要来自类固醇治疗过的免疫检查点抑制剂结肠炎患者的结肠活检和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Supermultipotency and unpredictability in the developing superior colliculus
2024-04, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2024.03.001
PMID:38514350
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研究论文 | 通过谱系追踪与单细胞RNA测序技术研究上丘发育过程中祖细胞的多能性和定位模式 | 发现上丘发育过程中存在极端多能性的单个祖细胞，能够生成所有类型的神经元和胶质细胞，且细胞定位呈现非预定模式 | NA | 探索上丘发育过程中祖细胞的分化潜能和细胞定位规律 | 发育中的上丘组织 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
The Extracellular Niche and Tumor Microenvironment Enhance KRAS Inhibitor Efficacy in Pancreatic Cancer
2024-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2504
PMID:38294344
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研究论文 | 本研究评估KRASG12D抑制剂MRTX1133在胰腺癌治疗中的疗效，并发现细胞外微环境和肿瘤微环境可增强其治疗效果 | 发现ITGB1可作为增强KRAS抑制剂疗效的靶点，揭示3D培养和体内模型中疗效更佳，首次证明KRAS抑制通过调节免疫微环境引发肿瘤消退 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 评估KRAS抑制剂在胰腺癌治疗中的疗效及作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞系、患者来源异种移植模型、同系肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | CRISPR-Cas9筛选、数字空间分析、单细胞测序、多光谱成像 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞测序数据 | PDAC细胞系面板、患者来源异种移植模型、同系肿瘤模型 | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |