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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-24 |
Aortic Cellular Heterogeneity in Health and Disease: Novel Insights Into Aortic Diseases From Single-Cell RNA Transcriptomic Data Sets
2024-04, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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综述 | 通过单细胞RNA转录组数据集探讨主动脉细胞异质性在健康和疾病中的新见解 | 利用单细胞RNA测序技术揭示主动脉各细胞类型的异质性及其在健康和疾病中的生物学过程 | NA | 综述单细胞RNA测序在主动脉疾病研究中的最新进展,重点关注细胞异质性 | 主动脉疾病(如动脉粥样硬化、主动脉瘤、主动脉硬化)中的细胞类型和异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-07-05 |
Single-cell RNA sequencing of cells from fresh or frozen tissue reveals a signature of freezing marked by heightened stress and activation
2024-04, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350660
PMID:38304946
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析新鲜或冷冻组织中的细胞,发现冷冻会激活应激和活化相关基因表达 | 首次系统比较新鲜与冷冻组织单细胞RNA测序数据,揭示冷冻过程对细胞转录组的特异性影响模式 | 主要聚焦于T细胞、ILC和NK细胞亚群,其他免疫细胞类型可能具有不同冷冻敏感性 | 评估冷冻保存对单细胞RNA测序结果的影响 | 人类组织中的T细胞、固有淋巴细胞(ILC)和自然杀伤(NK)细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3 | 2026-07-04 |
Silencing XIST on the future active X: Searching human and bovine preimplantation embryos for the repressor
2024-04, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-022-01115-9
PMID:35585273
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和qRT-PCR技术,研究人类和牛胚胎着床前XIST基因在活性X染色体上的沉默机制 | 首次在人类和牛胚胎中系统检测了XIST在活性X染色体上的表达时间,并确定了DNMT1、UHRF1、SAFB和SAFB2在XIST抑制中的潜在作用 | 仅分析了人类和牛胚胎着床前的特定阶段,未涉及其他哺乳动物或更广泛的发育时期 | 探索活性X染色体免受XIST介导失活的保护机制 | 人类和牛着床前胚胎中XIST的表达调控机制 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序、qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 人类胚胎和牛胚胎的多个发育阶段(4-8细胞期、桑椹胚期、早期囊胚期) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-07-01 |
Decoding the biology and clinical implication of neutrophils in intracranial aneurysm
2024-04, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52014
PMID:38317016
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和批量mRNA测序数据,探索颅内动脉瘤中浸润的中性粒细胞的生物学特性和临床意义 | 首次全面解析颅内动脉瘤中中性粒细胞的功能异质性和转录谱特征,揭示了中性粒细胞在动脉瘤形成和破裂中的不同亚群关联以及潜在致病机制 | 研究基于公开数据集,可能受限于样本异质性和数据来源的偏差,且缺乏直接的功能验证实验 | 探索颅内动脉瘤中中性粒细胞的功能异质性和临床意义,为未来治疗提供依据 | 颅内动脉瘤中浸润的中性粒细胞 | 机器学习 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠颅内动脉瘤样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-06-30 |
Space-feature measures on meshes for mapping spatial transcriptomics
2024-04, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2023.103068
PMID:38176357
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研究论文 | 本文提出了空间-特征测量LDDMM算法,用于将空间转录组数据映射到标准图谱的共同坐标系中 | 首次开发了用于计算微分同胚空间中测地线的空间-特征测量LDDMM算法,扩展了LDDMM算法家族,实现了跨模态的转录组数据与标准图谱的对齐 | 未在文中明确提及 | 实现分子和细胞尺度的空间转录组数据与组织尺度标准图谱的整合对齐 | 小鼠大脑的空间转录组数据 | 计算机视觉 | NA | MERFISH | LDDMM | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | MERFISH | MERFISH显微成像技术 |
| 6 | 2026-06-26 |
Single-Cell Analysis Reveals a Subset of High IL-12p40-Secreting Dendritic Cells within Mouse Bone Marrow-Derived Macrophages Differentiated with M-CSF
2024-04-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300431
PMID:38416039
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现,M-CSF分化的小鼠骨髓源性巨噬细胞(BMDM)中有一小群细胞高分泌IL-12p40,并证实这群细胞具有树突状细胞(DC)特征 | 首次通过分泌分析和单细胞RNA测序揭示M-CSF分化的BMDM中存在一个高表达Il12b的DC样亚群,该亚群在LPS刺激下表现出独特的DC激活程序,不同于BMDM的随机细胞异质性 | 未能在静息状态下通过表面标志物分离该DC样亚群,且研究仅限于体外小鼠模型 | 探究M-CSF分化的骨髓源性巨噬细胞在IL-12产生中的细胞异质性及其与树突状细胞的关系 | 小鼠骨髓源性巨噬细胞及树突状细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序, 分泌分析, 流式细胞术, 报告基因小鼠 | NA | 基因表达数据, 分泌数据 | 小鼠骨髓源性巨噬细胞培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-06-26 |
IDO1 Inhibition Promotes Activation of Tumor-intrinsic STAT3 Pathway and Induces Adverse Tumor-protective Effects
2024-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300545
PMID:38391297
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IDO1抑制剂激活肿瘤内在STAT3通路并导致不利肿瘤保护效应的机制 | 首次利用单细胞RNA测序全面分析IDO1抑制剂对肿瘤微环境的影响,发现其同时激活免疫细胞和诱导M2巨噬细胞浸润及IL-6/JAK2/STAT3通路的意外副作用 | 未明确提及,可能包括实验模型仅涉及小鼠结肠癌细胞系及单一抑制剂类型 | 探究IDO1抑制剂临床失败原因,揭示其对肿瘤微环境的整体影响 | 小鼠结肠癌CT26细胞移植的BALB/C小鼠肿瘤微环境 | 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | BALB/C小鼠移植CT26结肠癌模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-06-20 |
Integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data reveal the significant role of macrophages in lupus nephritis
2024-04-12, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03311-y
PMID:38610007
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研究论文 | 通过整合单细胞及批量转录组数据,揭示巨噬细胞在狼疮肾炎中的重要作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据分析狼疮肾炎中巨噬细胞的表型转变(从炎症巡逻型到吞噬型再到抗原提呈型),并发现LGALS9基因在巨噬细胞中的显著上调及其促炎作用,为治疗提供潜在靶点 | 仅基于公共数据集中LN样本与正常肾组织的转录组数据,且LGALS9功能研究仅限于THP-1细胞系,未在体内动物模型中验证 | 识别狼疮肾炎中异常的免疫细胞组分和信号通路,寻找潜在治疗靶点 | 狼疮肾炎组织样本和正常肾组织 | 数字病理学 | 狼疮肾炎 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 慢病毒介导过表达 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 狼疮肾炎组织样本与正常肾组织(具体数量未在摘要中说明) | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-06-19 |
Epigenetic dysregulation in Alzheimer's disease peripheral immunity
2024-04-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.013
PMID:38340719
|
研究论文 | 利用单细胞测序方法探究阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传和转录变化 | 首次揭示了阿尔茨海默病外周免疫细胞中开放染色质的显著变化,并发现了新的AD特异性RELA转录因子结合位点和与散发性AD风险相关的差异可及染色质区域 | 未提及具体限制 | 探究阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传和转录改变 | 阿尔茨海默病患者的外周免疫细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序,转座酶可及染色质分析,RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-06-19 |
Mechanisms of sex differences in Alzheimer's disease
2024-04-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.024
PMID:38402606
|
综述 | 本文综述了阿尔茨海默病中性别差异的机制,探讨了女性患病风险更高的生物学原因 | 综合单细胞RNA测序、代谢组学和多组学分析等先进技术,系统阐述了性激素和性染色体与炎症、代谢及自噬等疾病机制的相互作用 | 未提及具体的研究设计或实验验证,仅基于已有文献总结 | 阐明阿尔茨海默病中性别差异的潜在生物学机制 | 阿尔茨海默病中的男性和女性患者 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,代谢组学,多组学分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-06-17 |
To be or not to be - Decoding the Trabecular Meshwork Cell Identity
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.591346
PMID:38746421
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对比原代人小梁网细胞培养物与组织,解码小梁网细胞身份 | 首次采用单细胞RNA测序方法比较原代hTM细胞培养物与组织中的细胞身份和可翻译性 | 未明确说明局限性 | 揭示原代hTM细胞培养物与组织之间的细胞身份差异及其可翻译性 | 原代人小梁网细胞培养物和小梁网组织 | 单细胞转录组学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14个原代hTM样本,包括4个来自青光眼患者的样本,传代1-4次 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-06-17 |
Opto-combinatorial indexing enables high-content transcriptomics by linking cell images and transcriptomes
2024-04-16, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00866e
PMID:38506394
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研究论文 | 提出一种结合光学索引与单细胞转录组学的综合分析方法,通过细胞与水凝胶珠的光学索引组合实现细胞图像与转录组的链接 | 引入光学组合索引实现高通量成像与单细胞RNA测序的直接关联,无需复杂设备即可进行多路化学转录组学分析 | 未提及方法在异质性组织样本中的适用性或大规模验证的局限性 | 开发一种整合细胞图像与单细胞转录组数据的简单方法,用于揭示细胞表型与基因表达的关系 | 混合物种实验细胞、经电穿孔和脂质体转染标记的细胞、紫杉醇处理的HeLa细胞 | 计算机视觉 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 未明确说明样本数量,涉及混合物种实验和HeLa细胞多浓度处理 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 下一代测序平台用于DNA分子条形码测序 |
| 13 | 2026-06-15 |
Single-cell transcriptome atlas in C57BL/6 mice encodes morphological phenotypes in the aging kidneys
2024-04-19, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03514-0
PMID:38641839
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研究论文 | 构建C57BL/6小鼠不同发育阶段肾脏的单细胞转录组图谱,并关联形态表型 | 首次全面描绘C57BL/6小鼠从胚胎期到衰老期的肾脏形态和单细胞转录组图谱,并揭示肾小球基底膜结节的年龄相关形成机制 | 仅使用C57BL/6单一品系小鼠,可能无法完全代表其他品系或人类肾脏衰老特征 | 提供C57BL/6小鼠肾脏发育的参考标准,并探究衰老相关的形态表型及分子机制 | C57BL/6小鼠肾脏组织(从胚胎18.5天到30月龄) | 数字病理学 | 衰老相关肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 8个年龄组,每组5-6只小鼠,共约48只 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-01 |
Decoding the universal human chromatin landscape through teratoma-based profiling
2024-04-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae021
PMID:38281248
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研究论文 | 本研究通过畸胎瘤分析,整合人类胚胎干细胞来源畸胎瘤的表观基因组和转录组,构建表观遗传特征矩阵,并利用单细胞多组学图谱揭示组织异质性 | 首次构建基于畸胎瘤的全人类染色质图谱,整合单细胞多组学(RNA-Seq和ATAC-Seq)与组织学数字染色工具,实现细胞类型注释和表观遗传景观量化 | 未提及,可能涉及畸胎瘤模型的生理相关性或样本规模限制 | 解析人类畸胎瘤的表观基因组和转录组景观,建立通用性染色质状态模型 | 人类胚胎干细胞来源的畸胎瘤组织及其细胞类型 | 数字病理学, 单细胞组学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq, scATAC-seq, 组织学数字染色 | CNN, 特征矩阵模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 组织学图像 | 基于畸胎瘤样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞多组学平台用于scRNA-Seq和scATAC-Seq分析 |
| 15 | 2026-06-01 |
q-Diffusion leverages the full dimensionality of gene coexpression in single-cell transcriptomics
2024-04-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06104-w
PMID:38565955
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研究论文 | 提出q-diffusion框架,利用单细胞转录组中基因共表达的完整维度,提升数据分析效果 | 首次提出能捕获整个基因库共表达结构的q-diffusion框架,在统计显著性、分类精度和聚类效果上超越现有方法 | 未明确说明局限 | 开发一种能充分利用单细胞RNA测序数据全维度信息的方法,以增强细胞生物学理解 | 转移性结直肠癌患者、外周血单个核细胞(PBMC)、人类皮层组织 | 机器学习 | 转移性结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | q-diffusion | 基因表达数据 | CALGB/SWOG 80405临床试验样本、体外PBMC数据集、Tabula Sapiens人类图谱、空间scRNAseq人皮层组织数据 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-05-31 |
Interferon-α stimulates DExH-box helicase 58 to prevent hepatocyte ferroptosis
2024-04-15, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00524-9
PMID:38622688
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研究论文 | 本研究揭示干扰素-α通过刺激DExH盒螺旋酶58防止肝细胞铁死亡,为肝缺血再灌注损伤提供潜在治疗策略 | 首次发现DHX58作为RNA结合蛋白,通过招募m6A读取器YTHDC2促进GPX4 mRNA翻译,以m6A依赖方式抑制铁死亡,并揭示IFN-α在其中的调控作用 | 未提及具体局限性 | 探究DEAD/DExH盒螺旋酶家族成员在肝缺血再灌注损伤中调控肝细胞铁死亡的机制 | 肝细胞特异性Dhx58敲除小鼠和肝脏I/R损伤模型 | 数字病理学 | 其他疾病(肝缺血再灌注损伤) | 转录组分析、单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀测序、免疫沉淀质谱 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 肝细胞特异性Dhx58敲除小鼠;肝脏I/R损伤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-31 |
The implications of single-cell RNA-seq analysis in prostate cancer: unraveling tumor heterogeneity, therapeutic implications and pathways towards personalized therapy
2024-04-11, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00526-7
PMID:38605399
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示前列腺癌肿瘤异质性、治疗意义及个性化治疗路径中的应用 | 系统总结了单细胞RNA测序与其他单细胞技术在前列腺癌研究中的综合应用,特别是小鼠与人类前列腺癌差异及多组学整合分析 | 单细胞技术在前列腺癌中的应用仍有限,现有研究多集中于特定亚型,未来需扩大样本和数据类型 | 探讨单细胞RNA测序在前列腺癌基础与临床研究中的意义,并为个性化医疗提供新见解 | 前列腺癌肿瘤细胞及微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-05-29 |
Synergistic induction of tertiary lymphoid structures by chemoimmunotherapy in bladder cancer
2024-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02598-7
PMID:38332180
|
research paper | 研究化疗免疫联合疗法在膀胱癌中诱导三级淋巴结构形成的协同作用 | 首次系统揭示免疫治疗和化疗对三级淋巴结构(TLS)形成的各自影响,并证明联合疗法在促进TLS成熟和提高治疗反应率方面具有协同优势 | NA | 探究免疫治疗联合其他治疗方式能否增强免疫反应,从而改善膀胱癌患者的总体缓解率 | 膀胱癌患者的肿瘤组织样本及转录组数据 | machine learning | bladder cancer | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 包括IMvigor 210研究队列和RJBLC-I2N003队列中的膀胱癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-05-20 |
Stimulator of Interferon Genes Pathway Activation through the Controlled Release of STINGel Mediates Analgesia and Anti-Cancer Effects in Oral Squamous Cell Carcinoma
2024-Apr-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12040920
PMID:38672274
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研究论文 | 通过控制释放STINGel激活干扰素基因刺激因子通路在口腔鳞状细胞癌中发挥镇痛和抗癌作用 | 首次研究瘤内注射STINGel对OSCC诱导疼痛的影响,并利用单细胞RNA测序深入解析其镇痛作用的细胞信号级联机制 | 未明确提及限制,但可能包括样本量有限或模型特定性 | 探究STINGel在OSCC中的镇痛和抗肿瘤机制 | 口腔鳞状细胞癌模型及免疫细胞群 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种OSCC模型(口面部癌模型和后爪模型) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 20 | 2026-05-11 |
The role of positional information in determining dermal fibroblast diversity
2024-04, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2024.02.009
PMID:38423396
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综述 | 综述了位置信息在决定真皮成纤维细胞多样性中的作用 | 系统总结了位置信息如何影响成纤维细胞异质性和可塑性,并探讨其在皮肤稳态、伤口愈合、纤维化和癌症中的潜在应用 | 作为综述,缺乏原始实验数据支持,未提供具体机制验证 | 阐明位置信息对真皮成纤维细胞多样性的调控作用及其在皮肤疾病中的意义 | 真皮成纤维细胞及其在皮肤中的异质性和可塑性 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |