单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 492 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-09-18 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.10.588953
PMID:38645099
|
研究论文 | 研究人类特异性增强子HAR.324对WNT信号受体FZD8的调控作用及其在皮质发育中的功能 | 首次通过基因编辑小鼠和灵长类模型证明人类特异性HAR增强子通过调控神经祖细胞增殖能力精细调节皮质发育和连接性 | NA | 探索人类加速区域(HARs)在人类特异性皮质发育中的功能贡献 | 基因编辑小鼠、灵长类模型、人类和黑猩猩神经祖细胞、皮质类器官 | 发育生物学 | NA | 基因编辑、活体成像、谱系分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、成像数据 | 多种基因编辑动物模型和细胞模型（具体数量未明确说明） |
| 2 | 2025-09-05 |
Human Motor Neurons Elicit Pathological Hallmarks of ALS and Reveal Potential Biomarkers of the Disease in Response to Prolonged IFNγ Exposure
2024-04-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1787-23.2024
PMID:38413232
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研究论文 | 研究通过长时间IFNγ暴露诱导人源运动神经元出现ALS病理特征并揭示潜在生物标志物 | 首次证明IFNγ单独暴露可直接引发TDP-43细胞质聚集和p53通路激活，无需遗传突变或神经胶质细胞参与 | 研究基于体外诱导多能干细胞模型，需进一步体内验证 | 探究炎症因子IFNγ在肌萎缩侧索硬化症发病机制中的作用 | 人诱导多能干细胞来源的脊髓运动神经元 | 神经退行性疾病研究 | 肌萎缩侧索硬化症(ALS) | 单细胞转录组分析，电生理功能检测 | NA | 转录组数据，电生理数据 | NA |
| 3 | 2025-09-05 |
Single-Cell Analysis of Rohon-Beard Neurons Implicates Fgf Signaling in Axon Maintenance and Cell Survival
2024-04-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1600-23.2024
PMID:38423763
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示斑马鱼Rohon-Beard神经元分为三个亚类，并发现Fgf信号通路在轴突维持和细胞存活中的关键作用 | 首次在斑马鱼幼虫中通过scRNA-seq鉴定出三种Rohon-Beard神经元亚类，并发现Fgf通路缺陷可导致轴突退化和细胞死亡，且该表型可通过Sarm1缺失挽救 | 研究聚焦斑马鱼幼虫阶段，哺乳动物系统的直接适用性需进一步验证 | 探究Rohon-Beard神经元的分子分类及其维持机制 | 斑马鱼幼虫的Rohon-Beard神经元 | 神经科学 | 周围神经病变 | scRNA-seq, 药理学抑制, 遗传学操作 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼幼虫Rohon-Beard神经元（未注明具体数量） |
| 4 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analysis reveals the tumour microenvironment in patients with endometrial cancer responding to anti-PD-1 treatment
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1668
PMID:38649737
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-08-12 |
ScRNA-seq reveals novel immune-suppressive T cells and investigates CMV-TCR-T cells cytotoxicity against GBM
2024-04-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008967
PMID:38688579
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了新型免疫抑制性T细胞，并研究了CMV-TCR-T细胞对胶质母细胞瘤的细胞毒性 | 发现了两种新型免疫细胞亚群：双阳性CD68+SOX2+肿瘤相关巨噬细胞和FXYD6+ T细胞，并证实FXYD6+ T细胞是一种新型免疫抑制性T细胞 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究CMV感染如何影响GBM肿瘤微环境中的免疫细胞，并开发针对GBM的新型免疫治疗策略 | 胶质母细胞瘤(GBM)患者肿瘤组织和免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | scRNA-seq, 免疫电子显微镜, 免疫荧光, 液滴数字PCR, 单细胞TCR/BCR测序 | 人类来源的GBM小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞互作数据 | CMV感染的GBM患者样本和小鼠模型 |
| 6 | 2025-08-12 |
Dysregulation of CD4+ and CD8+ resident memory T, myeloid, and stromal cells in steroid-experienced, checkpoint inhibitor colitis
2024-04-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008628
PMID:38642938
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research paper | 该研究通过单细胞转录组学和蛋白质组学分析，探讨了类固醇治疗后的检查点抑制剂（CPI）结肠炎中CD4+和CD8+驻留记忆T细胞、骨髓细胞及基质细胞的失调机制 | 研究发现CD4+驻留记忆T细胞和CD8+细胞毒性T细胞在类固醇治疗后的CPI结肠炎中富集，并揭示了基质细胞代谢紊乱对上皮细胞存活和炎症的影响 | 研究样本主要来自类固醇治疗后的患者，可能无法完全代表未接受类固醇治疗的患者情况 | 阐明类固醇治疗后CPI结肠炎的发病机制 | CPI结肠炎患者的结肠活检组织和血液样本 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 主要来自类固醇治疗后的CPI结肠炎患者的结肠活检和血液样本 |
| 7 | 2025-08-12 |
Supermultipotency and unpredictability in the developing superior colliculus
2024-04, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2024.03.001
PMID:38514350
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research paper | 该研究结合谱系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了发育中上丘的意外特征 | 发现上丘发育中极其多能的祖细胞能够生成所有类型的神经元和胶质细胞，且其定位模式非预先确定，展示了上丘发育的高度不可预测性 | NA | 探索发育中上丘的细胞生成模式和机制 | 发育中的上丘(SC) | 发育生物学 | NA | 谱系追踪, scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 8 | 2025-08-06 |
Respiratory viral infection promotes the awakening and outgrowth of dormant metastatic breast cancer cells in lungs
2024-Apr-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4210090/v1
PMID:38645169
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research paper | 该研究揭示了呼吸道病毒感染如何促进休眠的转移性乳腺癌细胞在肺部的苏醒和生长 | 首次展示了流感病毒和SARS-CoV-2感染通过IL-6依赖机制促进乳腺癌休眠细胞苏醒和转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅为观察性研究，需要进一步验证 | 探究呼吸道病毒感染对乳腺癌转移休眠细胞苏醒的影响机制 | 乳腺癌转移休眠细胞(DCC)和呼吸道病毒(流感病毒、SARS-CoV-2) | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠模型 | 基因表达数据和临床观察数据 | 小鼠实验模型和人类观察性数据 |
| 9 | 2025-08-06 |
The Extracellular Niche and Tumor Microenvironment Enhance KRAS Inhibitor Efficacy in Pancreatic Cancer
2024-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2504
PMID:38294344
|
研究论文 | 本研究评估了KRAS抑制剂MRTX1133在胰腺导管腺癌(PDAC)中的疗效，并探讨了肿瘤微环境对治疗效果的影响 | 发现ITGB1可作为增强MRTX1133疗效的靶点，并证明3D细胞培养和体内环境中MRTX1133效果更佳，揭示了KRAS抑制通过调节肿瘤微环境促进免疫反应的机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型，需要进一步临床试验验证 | 开发PDAC新的治疗干预措施 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞系、患者来源的异种移植模型和同基因模型 | 肿瘤治疗 | 胰腺癌 | CRISPR-Cas9功能缺失筛选、数字空间分析、单细胞测序、多光谱成像 | NA | 基因表达数据、影像数据 | 多株PDAC细胞系、患者来源的异种移植模型和同基因模型 |
| 10 | 2025-08-06 |
Osteosarcoma Cells Secrete CXCL14 That Activates Integrin α11β1 on Fibroblasts to Form a Lung Metastatic Niche
2024-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1307
PMID:38295227
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了骨肉瘤细胞通过分泌CXCL14激活成纤维细胞上的整合素α11β1，促进肺转移微环境形成的机制 | 首次发现CXCL14-整合素α11β1轴在骨肉瘤肺转移中的关键作用，并证明靶向该轴可抑制转移 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究骨肉瘤肺转移微环境的形成机制及潜在治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺转移微环境中的成纤维细胞 | 肿瘤微环境 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本量（使用治疗初治骨肉瘤样本） |
| 11 | 2025-08-03 |
NFĸB signaling drives myocardial injury via CCR2+ macrophages in a preclinical model of arrhythmogenic cardiomyopathy
2024-Apr-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172014
PMID:38564300
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research paper | 该研究探讨了NFκB信号在心律失常性心肌病（ACM）中心肌损伤的作用，特别是在Dsg2mut/mut小鼠模型中 | 揭示了NFκB信号通过CCR2+巨噬细胞介导心肌损伤和心律失常的新机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 阐明ACM中心肌损伤的免疫信号机制 | Dsg2mut/mut小鼠模型中的心肌细胞和巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 心律失常性心肌病 | 单细胞RNA-Seq, CITE-Seq | Dsg2mut/mut小鼠模型 | 基因表达数据 | Dsg2mut/mut小鼠的心脏组织 |
| 12 | 2025-07-29 |
Space-feature measures on meshes for mapping spatial transcriptomics
2024-Apr, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2023.103068
PMID:38176357
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研究论文 | 本文提出了一种称为空间特征度量LDDMM的新算法，用于计算微分同胚空间中的测地线，以整合分子和细胞尺度的空间转录组数据 | 首次提出空间特征度量LDDMM算法，扩展了LDDMM算法家族，支持空间特征对标记粒子的作用，并推导出转录组数据与标准图谱的跨模态对齐算法 | 未提及具体样本量或实验验证的详细结果 | 开发算法以实现分子和细胞尺度空间转录组数据的整合与对齐 | 小鼠大脑中的空间转录组数据 | 计算解剖学 | NA | MERFISH | LDDMM | 空间转录组数据 | NA |
| 13 | 2025-07-29 |
Comparative single-cell RNA sequencing analysis of immune response to inactivated vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2024-04, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29577
PMID:38572977
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较分析灭活疫苗与自然SARS-CoV-2感染引起的免疫反应 | 首次对灭活疫苗和自然感染引起的免疫反应进行单细胞RNA测序比较分析，揭示了不同的免疫反应模式和细胞通讯机制 | 样本量较小（12名接种疫苗个体和COVID-19患者），仅分析了PBMC样本 | 比较灭活SARS-CoV-2疫苗和自然感染引起的免疫反应差异 | 12名接种灭活疫苗个体的PBMC样本与COVID-19患者的PBMC样本 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 12名接种疫苗个体和若干COVID-19患者的PBMC样本 |
| 14 | 2025-07-29 |
Immune features revealed by single-cell RNA and single-cell TCR/BCR sequencing in patients with rheumatoid arthritis receiving COVID-19 booster vaccination
2024-04, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29573
PMID:38566569
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞TCR/BCR测序揭示了类风湿关节炎患者在接受COVID-19加强疫苗接种后的免疫特征 | 首次在类风湿关节炎患者中使用单细胞RNA测序和单细胞TCR/BCR测序技术，全面分析了COVID-19加强疫苗接种后的外周免疫反应和TCR/BCR免疫库特征 | 样本量较小，仅包括稳定期的类风湿关节炎患者，且仅观察了疫苗接种前后两个时间点的变化 | 研究COVID-19加强疫苗接种对类风湿关节炎患者免疫细胞亚群及其反应的影响 | 类风湿关节炎患者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞TCR/BCR测序(scTCR/BCR-seq) | NA | 单细胞转录组数据, TCR/BCR序列数据 | 类风湿关节炎患者接种COVID-19加强疫苗前后的配对PBMCs样本 |
| 15 | 2025-07-26 |
High-throughput RNA isoform sequencing using programmed cDNA concatenation
2024-Apr, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01815-7
PMID:37291427
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research paper | 介绍了一种名为MAS-ISO-seq的高通量RNA异构体测序技术，通过编程方式连接cDNA以提高长读长测序的通量 | 提出了一种新的技术MAS-ISO-seq，能够将cDNA编程连接成适合长读长测序的分子，使通量提高了15倍以上 | 未提及具体的技术限制或潜在问题 | 提高RNA异构体测序的通量，以更高效地捕获完整的转录异构体 | 肿瘤浸润T细胞的单细胞RNA测序 | 基因组学 | 肿瘤 | MAS-ISO-seq, 长读长测序 | NA | RNA测序数据 | 未提及具体样本数量，但提到每个测序运行可产生近4000万cDNA读长 |
| 16 | 2025-07-25 |
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: molecular features and clinical significance
2024-04-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01779-3
PMID:38570490
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综述 | 本文综述了导管原位癌（DCIS）向浸润性乳腺癌（IDC）进展的分子特征及其临床意义 | 系统总结了DCIS向IDC转变的关键信号通路、分子特征及肿瘤微环境变化，并探讨了单细胞测序、空间转录组学和人工智能等新技术在研究中的应用 | NA | 深入理解DCIS的生物学特性及其向IDC转变的分子机制，以促进更有效的临床管理 | 导管原位癌（DCIS）和浸润性导管癌（IDC） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、人工智能 | NA | 分子数据、临床数据 | NA |
| 17 | 2025-07-24 |
Autophagy unrelated transcriptional mechanisms of hydroxychloroquine resistance revealed by integrated multi-omics of evolved cancer cells
2024-Apr, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2024.2402191
PMID:39299930
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研究论文 | 通过多组学方法揭示羟基氯喹耐药性的非自噬相关转录机制 | 研究发现羟基氯喹耐药性的主要机制是转录可塑性，而非自噬或溶酶体途径 | 研究仅针对OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞，可能不适用于其他癌症类型 | 探究羟基氯喹耐药性的分子机制 | OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞 | 肿瘤学 | 卵巢癌, 结直肠癌 | RNA-seq, exome-seq, scRNA-seq, CRISPR-Cas9筛选 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 两种癌细胞系（OVCAR3和CCL218） |
| 18 | 2025-07-23 |
Marmosets contain multitudes
2024-Apr-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97866
PMID:38661001
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research paper | 通过单细胞RNA测序揭示狨猴携带来自其兄弟姐妹的遗传差异细胞的程度 | 使用单细胞RNA测序技术首次在狨猴中揭示了其携带兄弟姐妹遗传差异细胞的情况 | NA | 研究狨猴细胞水平的遗传多样性 | 狨猴及其兄弟姐妹的细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 19 | 2025-07-23 |
Stimulator of Interferon Genes Pathway Activation through the Controlled Release of STINGel Mediates Analgesia and Anti-Cancer Effects in Oral Squamous Cell Carcinoma
2024-Apr-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12040920
PMID:38672274
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研究论文 | 研究STINGel（一种缓释STING激动剂配方）在口腔鳞状细胞癌（OSCC）中的镇痛和抗癌效果及其机制 | 开发了STINGel缓释配方，显著增强了STING激动剂的抗肿瘤效果，并首次深入研究了其在OSCC诱导疼痛中的镇痛机制 | 研究仅使用了两种OSCC模型，尚未在更广泛的癌症类型或临床环境中验证 | 探索STINGel在OSCC治疗中的镇痛和抗癌作用机制 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）模型 | 癌症治疗 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | OSCC动物模型 | 基因表达数据、行为学数据 | 两种OSCC模型（口面部癌症模型和后爪模型） |
| 20 | 2025-07-23 |
BuDDI: BulkDeconvolution withDomainInvariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2024-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.20.549951
PMID:37503097
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研究论文 | 提出了一种名为BuDDI的方法，通过域适应技术整合批量样本和单细胞RNA测序数据，以推断细胞类型特异性扰动效应 | 利用变分自编码器(VAE)学习独立的潜在空间，模拟细胞类型特异性扰动响应，无需在训练中使用单细胞扰动数据 | 未明确提及具体的数据规模限制或计算资源需求 | 开发一种方法，将批量样本和单细胞RNA测序数据结合，以研究细胞类型特异性扰动效应 | 批量样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, 域适应技术 | VAE (变分自编码器) | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |