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当前共找到 491 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-01-17 |
Single-Cell Analysis Reveals a Subset of High IL-12p40-Secreting Dendritic Cells within Mouse Bone Marrow-Derived Macrophages Differentiated with M-CSF
2024-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300431
PMID:38416039
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了在小鼠骨髓来源巨噬细胞中，存在一个高分泌IL-12p40的树突状细胞亚群 | 首次在M-CSF分化的巨噬细胞培养物中识别出一个转录独特的DC样亚群，该亚群在LPS刺激下表现出典型的DC激活程序 | 研究基于体外小鼠BMDM培养模型，可能无法完全反映体内情况；且该DC样亚群无法通过表面标记物分离 | 探究巨噬细胞与树突状细胞在先天免疫中的异质性和功能重叠 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）及其中的细胞亚群 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序，微孔分泌检测 | NA | RNA测序数据，基因表达数据 | 小鼠骨髓来源细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-01-14 |
Myeloid-Mas Signaling Modulates Pathogenic Crosstalk among MYC+CD63+ Endothelial Cells, MMP12+ Macrophages, and Monocytes in Acetaminophen-Induced Liver Injury
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306066
PMID:38350725
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和活体成像技术，揭示了骨髓细胞-Mas信号在调节对乙酰氨基酚诱导的肝损伤中MYC+CD63+内皮细胞、MMP12+巨噬细胞和单核细胞之间致病性串扰的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和长时间活体成像，系统解析了骨髓细胞-Mas信号在AILI微环境中的调控机制，并在患者样本中验证了其临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩大规模；Mas信号的具体下游效应分子机制有待进一步阐明 | 阐明对乙酰氨基酚诱导的肝损伤中微环境的细胞互作和分子机制 | Mas1缺陷小鼠和对乙酰氨基酚诱导的肝损伤患者样本 | 单细胞组学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 活体成像 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 影像数据 | Mas1缺陷小鼠模型和急性肝衰竭患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-01-14 |
CIRI-Deep Enables Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Circular RNAs with Deep Learning
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308115
PMID:38308181
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CIRI-deep的深度学习模型，用于在单细胞和空间转录组数据中全面预测环状RNA的调控 | 开发了首个能够处理单细胞和空间转录组数据的深度学习模型，专门用于环状RNA的全面预测和调控分析 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 解决单细胞和空间转录组技术在环状RNA分析中的效率限制，扩展环状RNA研究的应用范围 | 环状RNA及其在单细胞和空间转录组数据中的调控事件 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度学习 | RNA-seq数据 | 基于2500万个高置信度环状RNA调控事件的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-01-14 |
Quantifying Landscape-Flux via Single-Cell Transcriptomics Uncovers the Underlying Mechanism of Cell Cycle
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308879
PMID:38353329
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA速度重建细胞周期的连续向量场，量化单细胞全局非平衡动态景观-通量，揭示细胞周期调控机制 | 首次将景观-通量理论与单细胞转录组数据结合，量化细胞周期启动的基本能量成本，并识别维持细胞周期动力学的关键基因 | 方法主要基于转录组数据，可能未完全捕捉蛋白质水平或其他层面的调控机制 | 理解细胞周期的转录调控机制和驱动力量 | 细胞周期过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 向量场模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-01-14 |
Distribution-Agnostic Deep Learning Enables Accurate Single-Cell Data Recovery and Transcriptional Regulation Interpretation
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307280
PMID:38380499
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研究论文 | 本文提出了一种名为Bis的分布无关深度学习模型，用于准确恢复单细胞RNA测序数据中的缺失基因表达值 | Bis模型基于最优传输的自编码器架构，无需严格数据假设，能捕获复杂数据分布，并通过批量RNA测序数据引导重建以确保表达一致性 | 未明确提及模型在极端稀疏数据或跨物种应用中的局限性 | 开发一种能准确恢复单细胞RNA测序数据中缺失表达值的深度学习模型，以提升下游分析效果 | 单细胞RNA测序数据，包括模拟数据集、真实数据集以及头颈鳞状细胞癌微环境中的罕见细胞亚群 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 基于最优传输的自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-01-14 |
NAMPT-Driven M2 Polarization of Tumor-Associated Macrophages Leads to an Immunosuppressive Microenvironment in Colorectal Cancer
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303177
PMID:38308188
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研究论文 | 本研究探讨了NAMPT在结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞M2极化中的作用及其对免疫抑制微环境的影响 | 首次利用单细胞RNA测序数据揭示NAMPT在SPP1肿瘤相关巨噬细胞中的高表达，并发现其与预后不良相关，同时通过小鼠模型证明NAMPT缺失可改变巨噬细胞极化状态并增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，人类样本验证有限，且NAMPT靶向治疗策略的临床转化潜力尚未在人体试验中证实 | 探究NAMPT在结直肠癌肿瘤微环境中对巨噬细胞极化和免疫调节的作用机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但涉及小鼠模型和人类结直肠癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-01-14 |
Identification of Potent siRNA Delivery Peptides Using Computer Modeling
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308345
PMID:38311577
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研究论文 | 本文介绍了一种基于计算机建模和单细胞RNA测序的筛选程序，用于识别有效的siRNA递送肽 | 结合计算机建模和单细胞RNA测序进行多阶段筛选，以识别具有理想组装、递送能力和体内组织安全性的siRNA递送肽 | NA | 开发基于肽的RNA干扰疗法，用于siRNA递送 | siRNA递送肽 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算机建模 | 序列数据 | 包含12个氨基酸的文库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-01-14 |
Melanoma Derived Exosomes Amplify Radiotherapy Induced Abscopal Effect via IRF7/I-IFN Axis in Macrophages
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304991
PMID:38286661
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研究论文 | 本研究揭示了黑色素瘤来源的外泌体通过circPIK3R3/miR-872-3p/IRF7轴促进巨噬细胞分泌I型干扰素，从而增强放疗诱导的远隔效应 | 首次发现肿瘤来源外泌体携带的circPIK3R3通过调控巨噬细胞IRF7/I-IFN轴介导放疗远隔效应的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究多依赖体外实验 | 探究放疗诱导肿瘤远隔效应的详细分子机制 | 黑色素瘤荷瘤小鼠模型（皮下肿瘤和肺转移灶） | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、荧光素酶报告基因、RNA Pull-down、荧光原位杂交 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据、成像数据、流式数据 | 荷瘤小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-29 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590125
PMID:38712088
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研究论文 | 本研究通过构建结肠的细胞和空间图谱，揭示了结肠组织在衰老过程中的时空动态变化 | 开发了新的计算框架cSplotch，利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息，建立了与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达层次贝叶斯模型 | 研究仅限于小鼠模型，人类结肠衰老的直接适用性需要进一步验证 | 探究结肠组织结构和分子回路在衰老过程中的时空动态变化 | 小鼠结肠组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约1,500个小鼠肠道组织进行空间转录组分析，约400,000个单核RNA测序图谱 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-12 |
CITEViz: interactively classify cell populations in CITE-Seq via a flow cytometry-like gating workflow using R-Shiny
2024-Apr-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05762-1
PMID:38566005
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研究论文 | 开发了一个名为CITEViz的R-Shiny应用，用于通过流式细胞术样门控工作流程交互式分类CITE-Seq数据中的细胞群体 | 首个能够处理多组学测序数据集并允许用户交互式门控细胞的工具，无需编写冗余代码指定门边界 | 仅适用于经过Seurat处理的CITE-Seq数据，功能相对基础 | 简化CITE-Seq数据中的细胞群体分类流程 | 外周血单个核细胞CITE-Seq数据集 | 生物信息学 | NA | CITE-Seq, 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学, CITE-Seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-12 |
Programmed Death Ligand 1-Expressing Macrophages and Their Protective Role in the Joint During Arthritis
2024-Apr, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42749
PMID:37997621
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研究论文 | 本研究探讨了表达程序性死亡配体1的巨噬细胞在关节炎中对关节的保护作用 | 首次揭示PD-L1+巨噬细胞通过表达MerTK和IL-10在关节炎中发挥保护作用，并在人类和小鼠滑膜中得到验证 | 研究主要基于胶原诱导性关节炎小鼠模型，人类样本验证仍需扩展 | 研究PD-L1在滑膜中的保护作用及其在关节炎中的机制 | 小鼠模型和人类滑膜组织 | 免疫学 | 关节炎 | 流式细胞术, 逆转录聚合酶链反应, 单细胞RNA测序 | 胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠模型和人类滑膜样本（健康个体和类风湿关节炎患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-05 |
Multi-pronged analysis of pediatric low-grade glioma reveals a unique tumor microenvironment associated with BRAF alterations
2024-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588294
PMID:38645202
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和细胞因子分析揭示儿童低级别胶质瘤肿瘤微环境的异质性特征 | 首次采用多组学方法系统分析pLGG肿瘤微环境，发现BRAF基因改变与特定肿瘤免疫表型的关联 | 需要进一步研究免疫细胞浸润和肿瘤-免疫相互作用的机制 | 深入了解儿童低级别胶质瘤生物学特性以开发更有效的治疗方法 | 儿童低级别胶质瘤（pLGG）样本，包括毛细胞星形细胞瘤（PA）和神经节胶质瘤（GG） | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞因子分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of 5-aminolevulinic acid intraoperative labeling specificity for glioblastoma
2024-04-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2023.7.JNS23122
PMID:37773782
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析评估5-氨基乙酰丙酸在胶质母细胞瘤术中标记的特异性 | 首次在单细胞水平验证5-ALA标记胶质瘤细胞的特异性，发现其标记并非仅针对肿瘤细胞 | 需要进一步系统比较5-ALA与其他荧光引导手术替代方案的性能 | 确定5-ALA在胶质母细胞瘤中标记不同细胞类型的特异性 | 人类胶质母细胞瘤手术标本、胶质瘤细胞培养模型、小鼠胶质瘤模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞光学表型与表达测序(SCOPE-seq2)、单细胞RNA测序、细胞培养 | NA | 图像、RNA测序数据 | 人类胶质母细胞瘤手术标本、细胞培养模型、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | SCOPE-seq2（配对单细胞成像和RNA测序方法） |
| 14 | 2025-10-05 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.10.588953
PMID:38645099
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研究论文 | 本研究通过基因组编辑技术揭示了人类特异性增强子HAR对大脑皮层发育的调控机制 | 首次证明人类特异性增强子HAR通过调控WNT信号通路精细调节神经前体细胞的增殖和神经发生能力 | 研究主要依赖动物模型和类器官，与真实人类大脑发育环境存在差异 | 探索人类特异性基因组区域HAR在皮层发育中的功能作用 | 基因组编辑小鼠、灵长类模型、人类和黑猩猩神经前体细胞及皮层类器官 | 发育神经生物学 | NA | 基因组编辑、单细胞RNA测序、活体成像、谱系分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、成像数据 | 多种基因编辑动物模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Human Motor Neurons Elicit Pathological Hallmarks of ALS and Reveal Potential Biomarkers of the Disease in Response to Prolonged IFNγ Exposure
2024-04-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1787-23.2024
PMID:38413232
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研究论文 | 本研究通过长期干扰素-γ处理人源诱导多能干细胞衍生的脊髓运动神经元，揭示了ALS病理特征并发现潜在生物标志物 | 首次证明IFNγ暴露可直接导致TDP-43细胞质聚集和p53通路激活，无需遗传突变或神经胶质细胞参与 | 研究基于体外细胞模型，未在完整生物体系统中验证 | 探究干扰素-γ在肌萎缩侧索硬化发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 人源诱导多能干细胞衍生的脊髓运动神经元 | 神经退行性疾病研究 | 肌萎缩侧索硬化 | 单细胞转录组分析，电生理功能检测 | NA | 转录组数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Rohon-Beard Neurons Implicates Fgf Signaling in Axon Maintenance and Cell Survival
2024-04-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1600-23.2024
PMID:38423763
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼Rohon-Beard神经元，揭示其分为三个亚类并发现Fgf信号通路在轴突维持和细胞存活中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统鉴定斑马鱼Rohon-Beard神经元的分子亚型，并发现Fgf信号通路在感觉神经元维持中的新功能 | 研究主要聚焦斑马鱼幼虫期神经元，成年期神经元的特性尚未探索 | 阐明斑马鱼Rohon-Beard感觉神经元的分子特征和功能调控机制 | 斑马鱼幼虫期Rohon-Beard神经元 | 单细胞转录组学 | 周围神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼幼虫Rohon-Beard神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
SMARCA4 Loss and Mutated β-Catenin Induce Proliferative Lesions in the Murine Embryonic Cerebellum
2024-04-10, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1605-23.2024
PMID:38383496
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型探究SMARCA4缺失和β-连环蛋白突变在小鼠胚胎小脑中诱导增殖性病变的机制 | 首次揭示β-连环蛋白突变单独可导致严重发育表型，并与SMARCA4缺失协同诱导小脑早期祖细胞增殖性病变 | 体外培养中双突变细胞未显示致瘤潜力，提示胚胎微环境对病变发展具有重要作用 | 解析异常WNT信号和SMARCA4缺陷诱导肿瘤发生机制 | 基因工程小鼠模型（BLBP-Cre小鼠） | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | DNA甲基化分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 胚胎期E13.5至E16.5的小鼠小脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analysis reveals the tumour microenvironment in patients with endometrial cancer responding to anti-PD-1 treatment
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1668
PMID:38649737
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Single-molecule RNA-FISH analysis reveals stochasticity in reactivation of latent HIV-1 regulated by Nuclear Orphan Receptors NR4A and cMYC
2024-Apr-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4166090/v1
PMID:38699331
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研究论文 | 通过单分子RNA-FISH技术研究HIV-1潜伏病毒再激活的随机性及其受核孤儿受体NR4A和cMYC调控的机制 | 首次使用单分子RNA-FISH技术揭示HIV-1前病毒再激活具有细胞间高度变异的随机性特征，并发现cMYC和NR4A3作为调控该过程的外在因子 | 研究主要基于细胞系和有限的原代CD4 T细胞样本，需要更大规模的临床验证 | 研究HIV-1潜伏病毒再激活的机制及其调控因素 | HIV-1潜伏感染的细胞系和艾滋病病毒抑制患者的原代CD4 T细胞 | 分子生物学 | 艾滋病 | 单分子RNA-FISH, FISH-Quant分析, 单细胞RNA-seq | NA | 图像数据, 基因表达数据 | 细胞系和原代CD4 T细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单分子RNA-FISH, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Redox signalling regulates breast cancer metastasis via phenotypic and metabolic reprogramming due to p63 activation by HIF1α
2024-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02522-5
PMID:38238426
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示氧化还原信号通过HIF1α激活p63调控乳腺癌转移的表型和代谢重编程机制 | 首次发现GPx2敲低通过HIF1α-p63轴驱动混合上皮-间质转化状态，揭示其在原发灶和转移灶中不同的代谢适应性 | 研究基于PyMT乳腺肿瘤模型，结果在人类乳腺癌中的普适性需要进一步验证 | 阐明氧化还原信号调控乳腺癌转移的细胞亚群和转录调控机制 | PyMT乳腺肿瘤模型中的肿瘤细胞亚群及其肺转移灶 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | PyMT/GPx2 KD原发肿瘤及配对肺转移灶样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |