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当前共找到 490 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-11 |
The role of positional information in determining dermal fibroblast diversity
2024-04, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2024.02.009
PMID:38423396
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综述 | 综述了位置信息在决定真皮成纤维细胞多样性中的作用 | 系统总结了位置信息如何影响成纤维细胞异质性和可塑性，并探讨其在皮肤稳态、伤口愈合、纤维化和癌症中的潜在应用 | 作为综述，缺乏原始实验数据支持，未提供具体机制验证 | 阐明位置信息对真皮成纤维细胞多样性的调控作用及其在皮肤疾病中的意义 | 真皮成纤维细胞及其在皮肤中的异质性和可塑性 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-10 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-04, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 本文提出一个多物种、多组学的元分析框架，以促进心血管再生靶点的发现 | 提出基于单细胞RNA测序技术的多物种、多组学元分析框架，整合跨物种、跨发育阶段的心脏健康与损伤研究数据，驱动心血管再生新靶点的发现 | NA | 提出策略性框架以识别促进心血管再生的新靶点 | 健康与受伤心脏的多物种研究，涵盖不同发育阶段 | 机器学习和生物信息学 | 缺血性心脏病 | 单细胞RNA测序 | 元分析框架 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-05-01 |
SUMOylation inhibitors activate anti-tumor immunity by reshaping the immune microenvironment in a preclinical model of hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00880-z
PMID:38055116
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研究论文 | 本文研究了SUMO化抑制剂在肝细胞癌临床前模型中通过重塑免疫微环境激活抗肿瘤免疫的作用机制 | 首次发现SUMO化抑制剂TAK-981和ML-792能通过减少耗竭CD8+T细胞并增强细胞毒性NK细胞、M1巨噬细胞和CTL细胞来重塑肿瘤微环境，同时发现其可通过调节肠道微生物群丰度来恢复抗肿瘤免疫 | 该研究为临床前模型结果，尚未在人体临床试验中验证，其疗效和安全性仍需进一步评估 | 评估SUMO化抑制剂治疗肝细胞癌的效果并探索其免疫调节机制 | 小鼠肝细胞癌皮下模型和原位模型 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、流式细胞术、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式数据 | 小鼠肝细胞癌模型样本（皮下和原位模型） | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | NA | NA |
| 4 | 2026-04-28 |
Inflammatory recruitment of healthy hematopoietic stem and progenitor cells in the acute myeloid leukemia niche
2024-04, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02136-7
PMID:38228679
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研究论文 | 揭示急性髓系白血病微环境中健康造血干细胞和祖细胞被炎症性募集的机制 | 首次证明健康造血干细胞和祖细胞在低白血病浸润时即主动参与骨髓微环境炎症反应，并识别出AML来源的纳米级胞外囊泡是触发该炎症反应的关键因素 | 未明确讨论样本量大小及临床验证结果 | 探究急性髓系白血病微环境中健康造血干细胞和祖细胞是否主动参与炎症传播及其机制 | 急性髓系白血病小鼠模型中的健康造血干细胞和祖细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个独立同源小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals the complex cellular niche of pterygium
2024-04, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.01.013
PMID:38290663
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了翼状胬肉的复杂细胞微环境及潜在发病机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术全面解析翼状胬肉的细胞异质性，发现免疫成纤维细胞、EMT上皮细胞和活化血管内皮细胞等新亚群，并揭示巨噬细胞与ACKR1+活化血管内皮细胞的相互作用在疾病发展中的关键作用 | 需要进一步的体内外实验验证单细胞测序发现的细胞间相互作用机制，且样本量有限 | 探究翼状胬肉的发病机制及潜在治疗靶点 | 翼状胬肉患者及正常对照者的结膜组织细胞 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 45605个细胞（来自翼状胬肉患者和正常对照） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 6 | 2026-04-25 |
spVC for the detection and interpretation of spatial gene expression variation
2024-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03245-3
PMID:38641849
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研究论文 | 提出 spVC 方法，用于检测和解释空间基因表达变异 | 基于广义泊松模型，整合协变量的常数和空间变化效应，提高连续表达模式捕获能力和可解释性 | 未明确提及局限性 | 开发一种统计方法来检测和解释空间转录组数据中的基因表达变异 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 广义泊松模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-04-25 |
[Prediction of prognosis of patients with radical resection of intrahepatic cholangiocarcinoma based on single cell omics]
2024-Apr-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
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研究论文 | 基于单细胞组学分析肝内胆管癌根治术后患者预后预测 | 首次通过单细胞测序整合多个数据集，识别与预后相关的关键上皮细胞亚群，并提出抗氧化型与非抗氧化型的ICC组织分型概念，构建预后预测模型 | 研究为回顾性病例系列，样本量有限，且模型验证仅基于公开数据集，可能需进一步外部验证 | 分析基于单细胞组学的肝内胆管癌根治术后患者预后预测 | 肝内胆管癌患者（46例单细胞测序、100例微阵列数据） | 计算机视觉, 机器学习 | 肝内胆管癌 | 单细胞测序, 微阵列分析, ssGSEA算法, Cox比例风险模型 | Cox比例风险模型 | 单细胞测序数据, 微阵列表达数据 | 46例患者（单细胞测序），100例患者（微阵列数据） | Gene Expression Omnibus数据库, EMBI数据库 | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-24 |
Immune microniches shape intestinal Treg function
2024-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07251-0
PMID:38570678
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研究论文 | 通过活体成像、光激活引导的单细胞RNA测序和空间转录组学，研究了肠道中免疫微环境如何塑造调节性T细胞的功能 | 首次揭示了固有层而非淋巴聚集区是支持效应调节性T细胞功能的关键微环境，并识别了CD206巨噬细胞与效应T细胞之间的耐受性相互作用 | 未说明 | 理解肠道免疫系统中调节性T细胞的空间组织和功能维持机制 | 小鼠肠道组织中对肝螺杆菌有反应的调节性T细胞 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 活体成像、光激活引导单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠肠道样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-04-20 |
Single-cell insights: pioneering an integrated atlas of chromatin accessibility and transcriptomic landscapes in diabetic cardiomyopathy
2024-04-25, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02233-y
PMID:38664790
|
研究论文 | 本研究整合了单细胞RNA测序和ATAC测序数据，揭示了糖尿病心肌病中复杂的细胞状态和分子变化 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，构建了糖尿病心肌病的染色质可及性和转录组景观综合图谱，识别了关键的细胞亚群变化和转录因子 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；样本量相对有限 | 阐明糖尿病心肌病的细胞和分子机制，以发现潜在治疗靶点 | 野生型和糖尿病心肌病小鼠的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞基因表达数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | WT和DCM小鼠的心脏组织样本 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Multiome | 使用Cell Ranger ARC v2.0.1处理10x Multiome文库的单细胞RNA和ATAC数据 |
| 10 | 2026-04-18 |
The impact of package selection and versioning on single-cell RNA-seq analysis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588111
PMID:38617255
|
研究论文 | 本文详细比较了Seurat和Scanpy这两个广泛使用的单细胞RNA测序分析软件包在算法和输出结果上的差异 | 揭示了Seurat和Scanpy在单细胞RNA-seq分析中存在的显著差异，其影响相当于减少5%的测序reads或20%的细胞数量，并强调了软件版本更新对结果的影响 | 研究主要聚焦于Seurat和Scanpy，可能未涵盖所有单细胞分析工具，且差异的生物学意义需进一步验证 | 评估单细胞RNA测序分析中软件包选择和版本控制对结果的影响 | 单细胞RNA测序数据分析软件包（Seurat和Scanpy）及其算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-04-14 |
GTADC: A Graph-Based Method for Inferring Cell Spatial Distribution in Cancer Tissues
2024-04-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040436
PMID:38672453
|
研究论文 | 提出一种基于图深度学习的GTADC方法，用于推断癌症组织中细胞的空间分布 | 利用Silhouette分数精确捕获每种细胞类型内具有显著表达差异的基因，并引入图结构有效整合空间转录组学和单细胞测序数据的空间关系与拓扑结构 | 未明确说明方法在特定癌症类型或数据规模下的验证局限性 | 实现癌症组织中不同细胞类型空间组成的精确解析，以支持早期癌症检测与理解 | 癌症组织中的细胞空间分布与相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学（ST），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基于图的深度学习方法（GTADC） | 空间转录组数据，单细胞基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-04-14 |
Colorectal Cancer-Associated Myofibroblasts Exhibit Enhanced Angiogenin Expression and Signaling via the PLXNB2 Receptor
2024-04, The Journal of surgical research
IF:1.8Q2
DOI:10.1016/j.jss.2023.12.036
PMID:38295715
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了结直肠癌相关肌成纤维细胞中血管生成素及其受体PLXNB2表达上调，并参与肿瘤-基质细胞通讯 | 首次在人类结直肠癌组织中，利用单细胞RNA测序数据定量推断细胞间通讯网络，发现CRC相关肌成纤维细胞特异性上调血管生成素和PLXNB2受体表达 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源为公开数据库和独立数据集，但具体样本数量未明确说明 | 探究血管生成素在人类结直肠癌肿瘤微环境中细胞间通讯的作用 | 人类正常结肠组织和结直肠癌组织中的细胞，特别是肌成纤维细胞和CRC细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | CellChat | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-04-11 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534017
PMID:37034704
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研究论文 | 本文介绍了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架，用于识别细胞类型特异性调控元件及其调控基因 | 开发了一种新方法，通过随机组合多个gRNA并利用单细胞RNA测序分析，系统性地测试CRISPRa对增强子和启动子的扰动效果，实现了细胞类型特异性调控元件的大规模筛选 | 方法可能依赖于细胞特定的染色质景观或额外作用因子，限制了在某些细胞类型中的普适性，且样本规模相对较小 | 旨在识别细胞类型特异性、CRISPRa响应的调控元件，以促进基因治疗中靶向基因激活的gRNA筛选 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因编辑与单细胞组学 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用493个gRNA靶向候选调控元件，在K562细胞和iPSC衍生神经元中进行测试 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-04-09 |
Single-cell multi-ome regression models identify functional and disease-associated enhancers and enable chromatin potential analysis
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01689-8
PMID:38514783
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCARlink的单细胞多组学回归模型，用于预测基因表达并识别功能性和疾病相关的增强子 | 开发了基于正则化泊松回归的基因级调控模型，避免了传统基因-峰相关性分析的局限性，并支持染色质潜力分析 | 未明确提及具体样本量或实验验证的局限性 | 构建单细胞多组学回归模型以识别增强子与靶基因的关联并分析染色质潜力 | 单细胞多组学测序数据（scRNA-seq和scATAC-seq） | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 正则化泊松回归模型 | 单细胞多组学测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-04-07 |
A novel subpopulation of monocytes with a strong interferon signature indicated by SIGLEC-1 is present in patients with in recent-onset type 1 diabetes
2024-04, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06098-4
PMID:38349399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，在成人隐匿性自身免疫性糖尿病和1型糖尿病患者中发现了一群具有强干扰素特征、以SIGLEC-1为标志的新型单核细胞亚群，并探讨了其在疾病发生中的作用 | 首次在1型糖尿病相关患者中鉴定出一个以SIGLEC-1为标志、具有强干扰素特征的新型经典单核细胞亚群，并证实其与疾病活动度相关且能加速NOD小鼠糖尿病发病 | 样本量相对较小（特别是scRNA-seq部分），研究队列主要基于LADA和儿科1型糖尿病患者，结果在更广泛的1型糖尿病群体中的普适性有待进一步验证 | 探索1型糖尿病起始阶段的致病性免疫反应，寻找新的免疫学靶点用于1型糖尿病的预防和治疗 | 成人隐匿性自身免疫性糖尿病患者、成人发病的2型糖尿病患者、健康成人、儿科1型糖尿病患者、健康儿童以及非肥胖糖尿病小鼠的外周血和胰腺组织 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 细胞过继转移实验, 清除实验 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 | 人类：scRNA-seq（4例LADA患者+4例健康对照）；流式验证队列（54例LADA+17例T2D+26例健康成人；15例儿科T1D+15例健康儿童）。小鼠：NOD小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-04-03 |
Staphylococcus aureus induces drug resistance in cancer T cells in Sézary syndrome
2024-04-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021671
PMID:38170178
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研究论文 | 本研究揭示了金黄色葡萄球菌及其肠毒素如何诱导Sézary综合征中恶性T细胞产生药物耐药性 | 首次发现金黄色葡萄球菌肠毒素通过TCR、NF-κB和JAK/STAT信号通路诱导恶性T细胞对多种抗癌药物产生耐药性 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体实验验证；耐药机制的具体分子通路细节仍需深入探索 | 探究金黄色葡萄球菌感染如何导致Sézary综合征患者治疗耐药性 | Sézary综合征患者的原代恶性T细胞和金黄色葡萄球菌肠毒素 | 肿瘤免疫学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 多模态单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 患者原代恶性T细胞样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-04-03 |
Autofluorescence is a biomarker of neural stem cell activation state
2024-Apr-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.02.011
PMID:38521057
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研究论文 | 本文利用自发荧光成像技术，揭示了小鼠神经干细胞静息与激活状态的独特自发荧光特征，并建立了基于自发荧光的细胞状态预测方法 | 首次将自发荧光成像技术应用于神经干细胞状态研究，发现静息神经干细胞中特定溶酶体自发荧光可作为细胞静息程度的梯度标志物 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证；技术依赖特定成像设备，可能限制广泛应用 | 开发一种无标记、活细胞成像方法，以研究神经干细胞从静息到激活状态的转变过程 | 小鼠神经干细胞（包括静息状态和激活状态） | 数字病理学 | NA | 荧光寿命成像（FLIM）、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及小鼠神经干细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-04-01 |
Single-cell analyses reveal transient retinal progenitor cells in the ciliary margin of developing human retina
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47933-x
PMID:38670973
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了人类视网膜发育过程中睫状缘区存在短暂性视网膜祖细胞 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学，首次在人类视网膜发育中鉴定出睫状缘区的短暂性早期视网膜祖细胞，并揭示了其转录和染色质可及性变化 | 研究仅涵盖人类视网膜发育至妊娠中期的阶段，未涉及后期发育或成熟视网膜 | 探究人类视网膜发育过程中视网膜祖细胞的起源、分化和时空分布 | 人类视网膜发育过程中的细胞，特别是睫状缘区的视网膜祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类早期眼样本，涵盖至妊娠中期 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-03-25 |
Identification of cells of leukemic stem cell origin with non-canonical regenerative properties
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101485
PMID:38582086
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，识别了急性髓系白血病中具有非典型再生特性的细胞群——再生富集细胞，并探讨了其在白血病复发中的作用 | 首次揭示了AML中RECs这一新细胞群，它们源自白血病干细胞但缺乏干细胞能力，并通过空间转录组学证实了其与CD34+细胞的邻近关系及对再生的调控作用 | 未明确RECs的具体分子机制，且样本量可能有限，需要进一步验证 | 探究急性髓系白血病化疗后复发细胞的特性及其再生机制 | 急性髓系白血病患者样本中的细胞群体 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间数据 | AML患者队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-03-25 |
Multicellular ecotypes shape progression of lung adenocarcinoma from ground-glass opacity toward advanced stages
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101489
PMID:38554705
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研究论文 | 本研究通过机器学习、单细胞RNA测序和全外显子组测序，分析了58例肺腺癌患者，揭示了与不同影像学模式和癌细胞状态相关的六种肺多细胞生态型 | 首次系统性地将肺腺癌的影像学表现（磨玻璃影与实性结节）与肿瘤微环境中的多细胞生态型、免疫状态及特定驱动基因（如EGFR L858R）联系起来，并发现了CTHCR1成纤维细胞在免疫抑制环境中的关键作用 | 样本量相对有限（58例患者），且研究主要基于特定队列，需要在更大人群和不同种族中进行验证 | 探究肺腺癌从磨玻璃影向晚期进展过程中的肿瘤异质性及微环境演变机制 | 58例肺腺癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据, 基因组数据, 影像数据 | 58例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |