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当前共找到 491 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-25 |
Identification of cells of leukemic stem cell origin with non-canonical regenerative properties
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101485
PMID:38582086
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，识别了急性髓系白血病中具有非典型再生特性的细胞群——再生富集细胞，并探讨了其在白血病复发中的作用 | 首次揭示了AML中RECs这一新细胞群，它们源自白血病干细胞但缺乏干细胞能力，并通过空间转录组学证实了其与CD34+细胞的邻近关系及对再生的调控作用 | 未明确RECs的具体分子机制，且样本量可能有限，需要进一步验证 | 探究急性髓系白血病化疗后复发细胞的特性及其再生机制 | 急性髓系白血病患者样本中的细胞群体 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间数据 | AML患者队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-03-25 |
Multicellular ecotypes shape progression of lung adenocarcinoma from ground-glass opacity toward advanced stages
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101489
PMID:38554705
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研究论文 | 本研究通过机器学习、单细胞RNA测序和全外显子组测序，分析了58例肺腺癌患者，揭示了与不同影像学模式和癌细胞状态相关的六种肺多细胞生态型 | 首次系统性地将肺腺癌的影像学表现（磨玻璃影与实性结节）与肿瘤微环境中的多细胞生态型、免疫状态及特定驱动基因（如EGFR L858R）联系起来，并发现了CTHCR1成纤维细胞在免疫抑制环境中的关键作用 | 样本量相对有限（58例患者），且研究主要基于特定队列，需要在更大人群和不同种族中进行验证 | 探究肺腺癌从磨玻璃影向晚期进展过程中的肿瘤异质性及微环境演变机制 | 58例肺腺癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据, 基因组数据, 影像数据 | 58例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-03-25 |
Single-cell transcriptomics reveal metastatic CLDN4+ cancer cells underlying the recurrence of malignant pleural effusion in patients with advanced non-small-cell lung cancer
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1649
PMID:38629624
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了晚期非小细胞肺癌患者恶性胸腔积液复发中CLDN4阳性转移性癌细胞的作用 | 首次在单细胞水平上识别出与恶性胸腔积液复发相关的CLDN4阳性转移性癌细胞亚群，并揭示了其与细胞迁移、缺氧和血管生成信号通路的关联 | 样本量较小（16例用于单细胞测序），需要更大样本队列验证临床价值，且生物学功能机制有待深入研究 | 探究晚期非小细胞肺癌患者恶性胸腔积液复发的细胞和遗传特征，寻找预测标志物 | 非小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，定量聚合酶链反应 | 生物信息学算法 | 单细胞转录组数据 | 16例患者用于单细胞测序，64例患者用于验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-25 |
Pericyte signaling via soluble guanylate cyclase shapes the vascular niche and microenvironment of tumors
2024-Apr, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00078-5
PMID:38528180
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研究论文 | 本研究通过特异性敲除周细胞中的一氧化氮受体sGC，利用单细胞RNA测序技术，揭示了周细胞如何通过sGC信号通路影响肿瘤血管微环境并抑制肿瘤生长 | 首次在体内特异性靶向周细胞的sGC信号通路，系统揭示了周细胞通过调控内皮细胞-周细胞相互作用及旁分泌信号，重塑肿瘤血管生态位和微环境的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类肿瘤中的普适性仍需进一步验证；sGC信号通路的具体下游效应分子及其在多种肿瘤类型中的作用有待深入探索 | 探究周细胞在肿瘤血管微环境中的作用及其分子机制，评估靶向周细胞sGC作为改善抗血管生成治疗策略的潜力 | 周细胞、内皮细胞、肿瘤相关成纤维细胞、肿瘤相关巨噬细胞及肿瘤血管微环境 | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-03-21 |
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2024-04-16, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01858-23
PMID:38445887
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研究论文 | 本文重新分析了先前关于小鼠非神经元神经节细胞中HSV-1潜伏的单细胞RNA测序数据，并指出该结论基于存在缺陷的数据集 | 通过重新分析scRNA-Seq数据，揭示了非多聚腺苷酸化的HSV-1内含子RNA的检测是由于脱靶引物效应，并发现数据集中存在广泛的神经元破坏和细胞游离RNA污染 | 研究基于对已有数据的再分析，未进行新的实验验证，且主要关注小鼠模型，可能不直接适用于人类 | 验证HSV-1是否能在非神经元细胞中建立潜伏感染，挑战现有关于HSV-1潜伏仅限于神经元的观点 | 小鼠神经节中的细胞，包括神经元和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 疱疹病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 基于先前研究的小鼠神经节细胞scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-13 |
Modulating inflammation with interleukin 37 treatment ameliorates murine Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2024-04, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.12.006
PMID:38158181
|
研究论文 | 本研究探讨了抗炎细胞因子IL37b在治疗常染色体显性多囊肾病（ADPKD）中的潜力，通过基因小鼠模型证明其能减少囊肿负担并促进干扰素信号通路 | 首次揭示IL37b通过促进肾脏驻留巨噬细胞中的干扰素信号通路来抑制ADPKD囊肿形成，为其作为潜在疗法提供了新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床转化效果尚需验证，且未详细探讨IL37b在其他细胞类型中的作用 | 评估IL37b作为ADPKD治疗策略的有效性及其作用机制 | ADPKD基因小鼠模型（包括早期和成年发病型）及肾脏组织 | 数字病理学 | 常染色体显性多囊肾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 基因工程小鼠模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-04 |
Single-cell profile reveals the landscape of cardiac immunity and identifies a cardio-protective Ym-1hi neutrophil in myocardial ischemia-reperfusion injury
2024-04-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.02.003
PMID:38395651
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了心肌缺血再灌注损伤中免疫细胞的动态变化，并鉴定出一种具有心脏保护作用的Ym-1hi中性粒细胞亚型 | 首次在MIRI中通过单细胞测序系统描绘了心脏免疫细胞景观，并发现了一种新型的Ym-1hi中性粒细胞亚型，该亚型具有心脏保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证相对有限 | 探究心肌缺血再灌注损伤中免疫细胞亚型及其动态变化，并鉴定具有保护作用的细胞亚型 | 小鼠心肌组织中的CD45阳性免疫细胞，以及临床患者样本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠心肌组织在六个时间点采集的CD45细胞，以及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-03-02 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590125
PMID:38712088
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研究论文 | 本研究构建了结肠在三个解剖区域和11个年龄组的细胞和空间图谱，结合空间转录组学和单核RNA-seq数据，揭示了结肠衰老过程中的组织和细胞时空动态变化 | 开发了新的计算框架cSplotch，通过利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息，学习与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达的分层贝叶斯模型 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类结肠衰老过程 | 探究结肠衰老过程中组织和细胞的时空动态变化及分子机制 | 小鼠结肠组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学, 单核RNA-seq | 分层贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单核RNA-seq数据 | 约1,500个小鼠肠道组织进行空间转录组学分析，约400,000个单核RNA-seq图谱 | NA | 空间转录组学, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-03-02 |
Bento: a toolkit for subcellular analysis of spatial transcriptomics data
2024-04-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03217-7
PMID:38566187
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研究论文 | 本文介绍了Bento，一个用于亚细胞尺度空间转录组数据分析的Python工具包 | Bento利用单分子信息，首次实现了亚细胞尺度的空间分析，突破了现有方法仅限于多细胞尺度的限制 | NA | 开发一个工具包，用于在亚细胞尺度分析空间转录组数据 | 空间转录组数据，包括MERFISH、seqFISH+、Molecular Cartography和Xenium数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 分子坐标和分割边界数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-02-28 |
Single-cell transcriptome analysis reveals tumoral microenvironment heterogenicity and hypervascularization in human carotid body tumor
2024-04, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31175
PMID:38214142
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人颈动脉体肿瘤，揭示了其微环境异质性和高血管化特征 | 首次对颈动脉体肿瘤进行单细胞转录组分析，识别了16种细胞群并阐明了内皮细胞、巨噬细胞和神经元细胞在肿瘤形成中的新机制 | NA | 定义导致颈动脉体肿瘤高血管化和慢性增生的细胞类型 | 人颈动脉体肿瘤样本 | 数字病理学 | 颈动脉体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-02-27 |
Bulk and single-cell transcriptome datasets of the mouse fetal and adult rete ovarii and surrounding tissues
2024-04-13, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03227-x
PMID:38615064
|
研究论文 | 本研究提供了小鼠胎儿和成年卵巢网及其周围组织的批量、单细胞和细胞核水平转录组数据集，以揭示卵巢网在卵巢稳态和生理反应中的潜在功能 | 首次利用Pax8-rtTA; Tre-H2B-GFP小鼠模型对卵巢网的三个区域进行转录组分析，整合了批量、单细胞和细胞核水平的数据 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类，且卵巢网的具体功能机制仍需进一步验证 | 探索卵巢网在卵巢发育、女性成熟和成年生育力中的角色 | 小鼠胎儿和成年卵巢网组织，包括卵巢内网、卵巢外网和连接网三个区域 | 数字病理学 | NA | 转录组分析，包括批量、单细胞和细胞核水平测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-02-27 |
Single-cell RNA-sequencing of virus-specific cellular immune responses in chronic hepatitis B patients
2024-04-08, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03187-2
PMID:38589415
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了慢性乙型肝炎患者中病毒特异性细胞免疫反应的转录组特征 | 创建了首个包含HBV特异性T细胞、非初始T细胞和PD1 T细胞的单细胞转录组数据集，并同时分析了血液和肝脏组织样本 | 样本量相对有限（21名患者和10名健康对照），且肝脏活检样本仅来自5名患者的匹配子集 | 深入理解慢性乙型肝炎中失调的免疫反应机制，特别是T细胞功能异常的表型 | 慢性乙型肝炎患者和健康对照者的免疫细胞，包括HBV特异性T细胞、非初始T细胞和PD1 T细胞 | 单细胞组学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21名慢性乙型肝炎患者和10名健康对照者，包含5名患者的匹配肝脏活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10X Genomics平台（用于186,123个细胞）和全长Smart-seq2协议（用于1,069个细胞） |
| 13 | 2026-02-27 |
SOXC are critical regulators of adult bone mass
2024-Apr-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47413-2
PMID:38580651
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型和单细胞转录组学揭示了SOXC转录因子（特别是SOX4）在调控成年骨量中的关键作用，包括促进骨吸收和抑制骨形成 | 首次明确了SOXC转录因子在成年骨量调控中的冗余和特异性作用，特别是SOX4在调节骨吸收与骨形成平衡中的主导角色，并通过单细胞转录组学揭示了其分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证；单细胞转录组学数据仅提供了表达谱，功能验证有待深入 | 探究SOXC转录因子如何调控成年骨量，并阐明其分子机制 | 小鼠模型（SOXC功能缺失和功能获得模型）以及Lepr间充质细胞 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-02-27 |
Cellular atlas of the human ovary using morphologically guided spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7506
PMID:38578993
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研究论文 | 本研究通过形态学引导的空间转录组学和单细胞测序技术，构建了人类卵巢的细胞图谱 | 结合空间转录组学和单细胞测序，首次在人类卵巢中揭示了卵泡发育的分子程序及激素和细胞外基质重塑活动的空间变异 | 样本量较小，仅涉及少数绝经前捐赠者，可能限制了结果的普适性 | 研究卵巢的功能单元和细胞间空间相互作用，以增进对生育和内分泌健康的理解 | 人类卵巢组织，包括卵母细胞、卵泡膜细胞、颗粒细胞等细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，空间位置数据 | 来自5名捐赠者的卵巢组织，包括257个区域的空间转录组数据和21,198个细胞的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-02-27 |
Insights for disease modeling from single-cell transcriptomics of iPSC-derived Ngn2-induced neurons and astrocytes across differentiation time and co-culture
2024-Apr-02, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01867-4
PMID:38566045
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，研究了iPSC衍生的Ngn2诱导神经元和星形胶质细胞在分化时间和共培养条件下的同质性、相似性及其在神经精神疾病建模中的应用 | 结合公共单细胞RNA-seq数据和体内发育脑数据，首次系统评估了hiPSC-N和hiPSC-A的谱系起源、成熟度及共培养效应，并构建了集成网络资源平台 | 研究揭示了细胞模型的异质性和局限性，可能不完全模拟体内复杂环境，需进一步优化 | 评估iPSC衍生神经元和星形胶质细胞模型在神经精神疾病研究中的适用性和优化策略 | 人诱导多能干细胞衍生的Ngn2诱导神经元(hiPSC-N)和星形胶质细胞(hiPSC-A) | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-01-17 |
Single-Cell Analysis Reveals a Subset of High IL-12p40-Secreting Dendritic Cells within Mouse Bone Marrow-Derived Macrophages Differentiated with M-CSF
2024-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300431
PMID:38416039
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了在小鼠骨髓来源巨噬细胞中，存在一个高分泌IL-12p40的树突状细胞亚群 | 首次在M-CSF分化的巨噬细胞培养物中识别出一个转录独特的DC样亚群，该亚群在LPS刺激下表现出典型的DC激活程序 | 研究基于体外小鼠BMDM培养模型，可能无法完全反映体内情况；且该DC样亚群无法通过表面标记物分离 | 探究巨噬细胞与树突状细胞在先天免疫中的异质性和功能重叠 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）及其中的细胞亚群 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序，微孔分泌检测 | NA | RNA测序数据，基因表达数据 | 小鼠骨髓来源细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-01-14 |
Myeloid-Mas Signaling Modulates Pathogenic Crosstalk among MYC+CD63+ Endothelial Cells, MMP12+ Macrophages, and Monocytes in Acetaminophen-Induced Liver Injury
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306066
PMID:38350725
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和活体成像技术，揭示了骨髓细胞-Mas信号在调节对乙酰氨基酚诱导的肝损伤中MYC+CD63+内皮细胞、MMP12+巨噬细胞和单核细胞之间致病性串扰的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和长时间活体成像，系统解析了骨髓细胞-Mas信号在AILI微环境中的调控机制，并在患者样本中验证了其临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩大规模；Mas信号的具体下游效应分子机制有待进一步阐明 | 阐明对乙酰氨基酚诱导的肝损伤中微环境的细胞互作和分子机制 | Mas1缺陷小鼠和对乙酰氨基酚诱导的肝损伤患者样本 | 单细胞组学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 活体成像 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 影像数据 | Mas1缺陷小鼠模型和急性肝衰竭患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-01-14 |
CIRI-Deep Enables Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Circular RNAs with Deep Learning
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308115
PMID:38308181
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CIRI-deep的深度学习模型，用于在单细胞和空间转录组数据中全面预测环状RNA的调控 | 开发了首个能够处理单细胞和空间转录组数据的深度学习模型，专门用于环状RNA的全面预测和调控分析 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 解决单细胞和空间转录组技术在环状RNA分析中的效率限制，扩展环状RNA研究的应用范围 | 环状RNA及其在单细胞和空间转录组数据中的调控事件 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度学习 | RNA-seq数据 | 基于2500万个高置信度环状RNA调控事件的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-01-14 |
Quantifying Landscape-Flux via Single-Cell Transcriptomics Uncovers the Underlying Mechanism of Cell Cycle
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308879
PMID:38353329
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA速度重建细胞周期的连续向量场，量化单细胞全局非平衡动态景观-通量，揭示细胞周期调控机制 | 首次将景观-通量理论与单细胞转录组数据结合，量化细胞周期启动的基本能量成本，并识别维持细胞周期动力学的关键基因 | 方法主要基于转录组数据，可能未完全捕捉蛋白质水平或其他层面的调控机制 | 理解细胞周期的转录调控机制和驱动力量 | 细胞周期过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 向量场模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-01-14 |
Distribution-Agnostic Deep Learning Enables Accurate Single-Cell Data Recovery and Transcriptional Regulation Interpretation
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307280
PMID:38380499
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研究论文 | 本文提出了一种名为Bis的分布无关深度学习模型，用于准确恢复单细胞RNA测序数据中的缺失基因表达值 | Bis模型基于最优传输的自编码器架构，无需严格数据假设，能捕获复杂数据分布，并通过批量RNA测序数据引导重建以确保表达一致性 | 未明确提及模型在极端稀疏数据或跨物种应用中的局限性 | 开发一种能准确恢复单细胞RNA测序数据中缺失表达值的深度学习模型，以提升下游分析效果 | 单细胞RNA测序数据，包括模拟数据集、真实数据集以及头颈鳞状细胞癌微环境中的罕见细胞亚群 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 基于最优传输的自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |