单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2024-08-29	Unbiased Single-Cell Sequencing of Hematopoietic and Immune Cells from Aplastic Anemia Reveals the Contributors of Hematopoiesis Failure and Dysfunctional Immune Regulation 2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202304539 PMID:38145351	研究论文	本研究通过无偏差的单细胞RNA测序技术，构建了再生障碍性贫血患者的细胞图谱和微环境相互作用，揭示了造血功能衰竭和免疫调节功能障碍的贡献者。	发现了新的KIR CD8调节性T细胞亚群，并揭示了其参与免疫稳态的机制，以及铁死亡在造血干细胞破坏中的作用。	NA	揭示再生障碍性贫血的造血功能衰竭和免疫调节功能障碍的机制。	再生障碍性贫血患者的造血和免疫细胞。	数字病理学	血液疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq	NA
142	2024-08-29	Targeting the cGAS-STING Pathway Inhibits Peripheral T-cell Lymphoma Progression and Enhances the Chemotherapeutic Efficacy 2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202306092 PMID:38145335	研究论文	本研究探讨了cGAS-STING通路在周围T细胞淋巴瘤（PTCL）进展中的作用及其机制	发现cGAS抑制剂能抑制肿瘤生长并损害DNA损伤修复，CLK1抑制能增强对cGAS抑制剂的敏感性	NA	研究cGAS-STING通路在PTCL中的作用，以优化治疗策略	周围T细胞淋巴瘤（PTCL）	NA	淋巴瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
143	2024-08-20	TDP-43 was Involved in Radiation-induced Neuronal Damage and May Not Through the BDNF/TrkB Pathway 2024-03-01, Radiation research IF:2.5Q2 DOI:10.1667/RADE-23-00168.1 PMID:38235539	研究论文	本研究探讨了TDP-43在辐射诱导的海马损伤中的作用，并评估了BDNF/TrkB通路是否参与此过程。	首次揭示了TDP-43在辐射诱导的神经元损伤中的作用，并发现BDNF/TrkB信号通路可能不参与此过程。	研究主要基于动物模型和体外细胞实验，需要进一步的人体研究来验证结果。	探究TDP-43在辐射诱导的认知功能障碍中的作用及其与BDNF/TrkB通路的关系。	辐射诱导认知功能障碍的大鼠模型及体外神经元细胞。	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	大鼠海马组织及体外神经元细胞
144	2024-08-18	Heterogeneity and tumoral origin of medulloblastoma in the single-cell era 2024-03, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-024-02967-9 PMID:38355808	综述	本文综述了髓母细胞瘤的细胞异质性和肿瘤起源在单细胞技术时代的最新进展	利用单细胞RNA测序技术揭示了髓母细胞瘤各亚型的肿瘤内异质性和肿瘤起源，这是传统技术未能揭示的	NA	理解髓母细胞瘤的肿瘤发生和复发的机制	髓母细胞瘤的细胞异质性、细胞起源及肿瘤微环境内的相互作用网络	数字病理学	儿童脑肿瘤	单细胞RNA测序	NA	细胞数据	NA
145	2024-08-18	Single-Cell Transcriptomics Reveals Pre-existing COVID-19 Vulnerability Factors in Lung Cancer Patients 2024-03-01, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-23-0692 PMID:38063850	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序数据，分析了COVID-19和肺癌患者的细胞变化，揭示了肺癌患者对COVID-19易感性的分子机制	首次通过单细胞转录组学揭示了肺癌患者中COVID-19易感性的预存因素，包括上调的TMPRSS2表达、增强的巨噬细胞炎症反应、增加的T细胞反应抑制和升高的纤维化风险	研究仅限于特定的肺癌类型和COVID-19患者，可能需要进一步研究以验证这些发现在更广泛人群中的适用性	探讨肺癌患者对COVID-19易感性的分子机制	COVID-19、肺腺癌、小细胞肺癌患者及正常肺组织的单细胞RNA测序数据	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	涉及COVID-19、肺腺癌、小细胞肺癌患者及正常肺组织的单细胞RNA测序数据
146	2024-08-18	Single-Cell RNA-Seq Analysis of Patient Myeloid-Derived Suppressor Cells and the Response to Inhibition of Bruton's Tyrosine Kinase 2024-03-01, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-22-0572 PMID:38015751	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术分析了患者髓源抑制细胞（MDSC）对Bruton酪氨酸激酶（BTK）抑制剂ibrutinib的反应	首次使用单细胞RNA测序技术研究ibrutinib对不同癌症类型患者MDSC基因表达的影响	研究仅限于体外实验，且样本量较小	探讨BTK抑制剂ibrutinib对患者MDSC基因表达的影响及其在免疫治疗中的潜在作用	不同癌症类型患者的髓源抑制细胞（MDSC）	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	来自乳腺癌、黑色素瘤和头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的MDSC样本，以及体外培养的黑色素瘤患者MDSC样本
147	2024-08-16	Primary nasal viral infection rewires the tissue-scale memory response 2024-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.05.11.539887 PMID:38562902	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了小鼠鼻黏膜在初次和再次流感感染前后的细胞变化，揭示了组织层面记忆反应的重塑	首次详细描述了初次感染后鼻黏膜中细胞类型、亚型和状态的逐步变化，以及再次感染时加速和协调的髓样和淋巴样细胞反应	NA	探讨初次病毒感染如何塑造组织层面的记忆反应，为鼻靶向治疗和疫苗的合理设计提供依据	小鼠鼻黏膜在初次和再次流感感染前后的细胞变化	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	三个不同区域的鼻黏膜样本，包括初次和再次流感感染前后的样本
148	2024-08-14	Age-related dysregulation of the retinal transcriptome in African turquoise killifish 2024-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.02.21.581372 PMID:38559206	研究论文	研究使用非洲蓝绿杀鱼作为模型，通过批量和单细胞RNA测序分析不同年龄组的视网膜转录组变化，揭示与年龄相关的视网膜退行性病变和视觉下降的分子机制	首次在非洲蓝绿杀鱼模型中结合批量和单细胞RNA测序技术，揭示了视网膜细胞类型特异性基因表达的变化，以及与年龄相关的分子通路变化	研究主要集中在分子层面，未来研究需要进一步验证这些分子变化如何影响视网膜的生理功能	探究年龄对视网膜稳态的生理和分子影响，以及这些变化如何导致视觉下降和相关疾病	非洲蓝绿杀鱼的视网膜	数字病理学	视网膜疾病	RNA测序	NA	转录组数据	三个年龄组（6周、12周和18周）的非洲蓝绿杀鱼视网膜样本
149	2024-08-09	Single-cell RNA-seq revealed heterogeneous responses and functional differentiation of hemocytes against white spot syndrome virus infection in Litopenaeus vannamei 2024-Mar-19, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.01805-23 PMID:38323810	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了白斑综合症病毒（WSSV）感染的南美白对虾血细胞的转录组图谱，并与健康血细胞的数据进行对比，揭示了血细胞在抗病毒免疫反应中的异质性响应和功能分化	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了南美白对虾血细胞在WSSV感染后的异质性响应和功能分化过程	NA	探究南美白对虾血细胞在白斑综合症病毒感染后的免疫响应和功能分化	南美白对虾的血细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	健康和WSSV感染的血细胞共16个转录不同的细胞簇
150	2024-08-09	TREX1 is required for microglial cholesterol homeostasis and oligodendrocyte terminal differentiation in human neural assembloids 2024-03, Molecular psychiatry IF:9.6Q1 DOI:10.1038/s41380-023-02348-w PMID:38129659	研究论文	研究探讨了TREX1基因在人神经集合体中对小胶质细胞胆固醇稳态和少突胶质细胞终末分化的作用	首次揭示了TREX1在人小胶质细胞中的功能，包括影响胆固醇代谢和少突胶质细胞的分化	NA	探究TREX1基因在人小胶质细胞生物学中的作用及其对神经发育和疾病的影响	人胚胎干细胞衍生的工程化小胶质细胞样细胞、集合体中的小胶质细胞和少突胶质细胞	NA	Aicardi-Goutières综合征	单细胞转录组学、光学和透射电子显微镜	NA	转录组数据	三个月大的集合体
151	2024-08-08	Enhancing the efficacy of vaccinia-based oncolytic virotherapy by inhibiting CXCR2-mediated MDSC trafficking 2024-03-29, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiad150 PMID:38066571	研究论文	研究通过抑制CXCR2介导的MDSC迁移，增强基于牛痘的溶瘤病毒疗法的疗效	首次证实CXCR2作为治疗靶点，通过特异性小分子抑制剂阻断PMN-MDSC迁移，增强溶瘤病毒疗法的抗肿瘤效果	NA	探索通过抑制CXCR2介导的MDSC迁移，提高溶瘤病毒疗法的抗肿瘤效果	牛痘病毒疗法在恶性间皮瘤模型中的应用及MDSC在肿瘤微环境中的作用	NA	恶性间皮瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	3个同基因癌症模型
152	2024-08-08	Tumor-infiltrating γδ T cells as targets of immune checkpoint blockade in melanoma 2024-03-29, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiae023 PMID:38324004	研究论文	本研究分析了黑色素瘤中肿瘤浸润性γδ T细胞与免疫检查点受体之间的关联，旨在开发创新的联合免疫治疗策略。	研究揭示了γδ T细胞在黑色素瘤免疫反应中的潜在作用，并发现ICI治疗对不同γδ T细胞亚群的影响存在差异。	NA	探索γδ T细胞与免疫检查点受体在黑色素瘤中的相互作用，以开发新的治疗策略。	γδ T细胞、免疫检查点受体、黑色素瘤。	免疫学	黑色素瘤	流式细胞术、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	涉及黑色素瘤患者的临床样本
153	2024-08-08	Single-cell RNA sequencing reveals recruitment of the M2-like CCL8high macrophages in Lewis lung carcinoma-bearing mice following hypofractionated radiotherapy 2024-03-25, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05118-6 PMID:38528587	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了在小鼠Lewis肺癌模型中，经过低分割放疗后，M2样CCL8高表达巨噬细胞的招募情况	首次揭示了低分割放疗通过上调免疫抑制基因，促进CCL8高表达巨噬细胞的浸润和重编程，从而形成免疫抑制的肿瘤微环境	NA	探究肿瘤相关巨噬细胞在放疗后的重编程机制及其对肿瘤微环境的影响	小鼠Lewis肺癌模型中的肿瘤相关巨噬细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
154	2024-08-08	Immunological profile of lactylation-related genes in Crohn's disease: a comprehensive analysis based on bulk and single-cell RNA sequencing data 2024-03-23, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05092-z PMID:38521905	研究论文	本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，探讨了乳酸化相关基因在克罗恩病中的免疫学特征	首次系统分析了乳酸化相关基因在克罗恩病发病机制中的作用，并利用单细胞测序数据揭示了不同免疫细胞中乳酸化水平的差异	研究仅基于公开数据库中的数据，未涉及临床样本的直接验证	探讨乳酸化相关基因在克罗恩病中的免疫学特征及其在疾病发病机制中的作用	克罗恩病患者肠道中的乳酸化相关基因及其在免疫细胞中的表达	数字病理学	克罗恩病	RNA测序	NA	RNA	使用了三个克罗恩病相关的数据集（GSE16879, GSE75214, 和 GSE112366）
155	2024-08-08	Potential anti-tumor effects of regulatory T cells in the tumor microenvironment: a review 2024-03-20, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05104-y PMID:38509593	综述	本文综述了调节性T细胞（Tregs）在肿瘤微环境中的潜在抗肿瘤作用	Tregs在肿瘤微环境中展现出显著的可塑性和功能多样性，不仅支持肿瘤进展，还表现出抗肿瘤活性	NA	总结Tregs的潜在抗肿瘤作用，并强调其在肿瘤治疗策略中的重要性	调节性T细胞（Tregs）及其在肿瘤微环境中的功能	NA	恶性肿瘤	单细胞RNA测序（ScRNA-seq）	NA	RNA	NA
156	2024-08-08	Investigation of the acute pathogenesis of spondyloarthritis/HLA-B27-associated anterior uveitis based on genome-wide association analysis and single-cell transcriptomics 2024-03-12, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05077-y PMID:38475831	研究论文	本研究通过全基因组关联分析和单细胞转录组学探讨了脊柱关节病/HLA-B27相关急性前葡萄膜炎的急性发病机制	本研究首次揭示了AIF1在脊柱关节病/HLA-B27相关急性前葡萄膜炎发病机制中的关键作用，并发现髓样细胞向DC分化及AIF1水平下降在此过程中的重要性	NA	探讨脊柱关节病/HLA-B27相关急性前葡萄膜炎的急性发病机制，以期为有效预防和治疗提供进一步的理解	脊柱关节病/HLA-B27相关急性前葡萄膜炎的发病机制	数字病理学	脊柱关节病	孟德尔随机化分析、单细胞转录组分析	NA	基因组数据、转录组数据	使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的前葡萄膜炎数据集
157	2024-08-07	General Capillary Endothelial Cells Undergo Reprogramming into Arterial Endothelial Cells in Pulmonary Hypertension through HIF-2α/Notch4 Pathway 2024-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.02.13.580227 PMID:38464011	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学分析、RNASCOPE和免疫染色分析，揭示了肺动脉高压（PAH）中肺毛细血管内皮细胞（ECs）向动脉内皮细胞的转变过程，并确定了HIF-2α/Notch4通路在此过程中的作用	首次通过单细胞RNA测序和遗传操作证明了肺毛细血管内皮细胞在肺动脉高压发展过程中向动脉内皮细胞的转变，并揭示了HIF-2α/Notch4通路在此过程中的关键作用	NA	探究肺动脉高压中肺毛细血管内皮细胞向动脉内皮细胞转变的机制	肺动脉高压患者的肺毛细血管内皮细胞和动脉内皮细胞	数字病理学	肺动脉高压	单细胞RNA测序，空间转录组学分析，RNASCOPE，免疫染色	NA	RNA序列	人类PAH患者和肺动脉高压（PH）小鼠的样本
158	2024-08-07	Exploring wound management in dental pulp: Utilizing single-cell RNA sequencing for global transcriptomic analysis in healthy and inflamed pulpal tissues 2024-Mar, International wound journal IF:2.6Q1 DOI:10.1111/iwj.14804 PMID:38385817	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析健康和炎症牙髓组织的转录组景观，探讨牙髓损伤修复过程中的细胞和分子机制	本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了牙髓损伤修复过程中细胞成分的变化和关键基因的表达增加，为牙髓病理学和再生医学提供了新的见解	NA	研究牙髓损伤修复过程中的信号传导、细胞反应和细胞外基质动态相互作用	健康和炎症状态下的牙髓组织	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组	50名患者的样本
159	2024-08-07	Evaluating the role of wound-healing genes in conjunction with stool routine and serum tumor markers for colorectal cancer diagnosis and prognostic implications 2024-Mar, International wound journal IF:2.6Q1 DOI:10.1111/iwj.14768 PMID:38446012	研究论文	本研究探讨了粪便常规检查与血清肿瘤标志物联合检测在结直肠癌诊断中的临床应用价值，并分析了伤口愈合基因在疾病进展中的潜在作用	本研究首次将粪便常规检查与血清肿瘤标志物联合使用，提高了结直肠癌诊断的准确性，并探讨了伤口愈合基因在疾病进展中的作用	研究样本量较小，仅包括56名结直肠癌患者和56名健康对照，可能影响结果的普遍性	旨在提高结直肠癌的早期检测和诊断准确性，并探讨伤口愈合基因在疾病进展中的作用	结直肠癌患者和健康对照组的粪便及血清样本	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	生物标志物数据	56名结直肠癌患者和56名健康对照
160	2024-08-05	scCRT: a contrastive-based dimensionality reduction model for scRNA-seq trajectory inference 2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae204 PMID:38701412	研究论文	提出了一种用于轨迹推断的新型降维模型scCRT，以提高单细胞RNA测序的分析性能	scCRT模型结合了细胞级和聚类级对比模块，以利用先前信息学习准确的细胞表示	模型依赖于先前的细胞状态信息，可能对数据的依赖性较强	旨在提高单细胞RNA测序中轨迹推断的准确性和效率	研究对象为单细胞RNA测序数据集	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	对比学习模型	数据集	共有135个数据集，包括54个真实数据集和81个合成数据集