单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 549 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-04 |
EHMT2 Inactivation in Pancreatic Epithelial Cells Shapes the Transcriptional Landscape and Inflammation Response of the Whole Pancreas
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.584700
PMID:38529489
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研究论文 | 本研究阐明了EHMT2在维持胰腺转录组和炎症反应中的关键作用 | 揭示了EHMT2失活如何重塑局部环境并影响胰腺的炎症反应 | 未提及具体样本数量和研究范围的局限性 | 探讨EHMT2在胰腺炎症中的功能影响 | 采用条件性敲除小鼠模型研究胰腺外分泌细胞中的EHMT2 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq、数字细胞学解卷积、空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 条件性敲除动物的胰腺组织样本 |
| 122 | 2024-08-04 |
Synovial Tissue Insights into Heterogeneity of Rheumatoid Arthritis
2024-03, Current rheumatology reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11926-023-01129-2
PMID:38157158
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综述 | 该文章回顾了类风湿关节炎（RA）相关的滑膜组织异质性研究 | 文章创新性地探讨了单细胞RNA测序和空间转录组学在揭示RA滑膜细胞和分子异质性中的应用 | 未提供关于数据集样本大小和具体研究方法的详细信息 | 旨在深入理解类风湿关节炎的细胞和分子异质性 | 重点研究滑膜组织中的不同细胞群体及其相关的生物机制 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、机器学习 | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-05 |
A transcription factor atlas of stem cell fate in planarians
2024-Mar-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113843
PMID:38401119
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研究论文 | 本研究构建了一种平板虫干细胞命运的转录因子图谱 | 识别了与多种新基础细胞类型相关的转录因子表达特征 | 关于命运选择在不同细胞类型之间如何分布仍然不清楚 | 探究平板虫干细胞的命运选择及其转录因子表达 | 平板虫Schmidtea mediterranea中的干细胞和其后代细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了来自S/G/M阶段的干细胞和其后代细胞的样本 |
| 124 | 2024-08-05 |
WNT-inhibitory factor 1-mediated glycolysis protects photoreceptor cells in diabetic retinopathy
2024-03-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05046-5
PMID:38448948
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研究论文 | 本研究探讨了WIF1在糖尿病视网膜病变中对光感受器功能的影响 | 揭示了WIF1通过抑制经典Wnt信号通路来保护视网膜光感受器细胞，减少氧化应激 | 研究中仅使用了C57BL/KsJ-db/db小鼠模型，缺乏其他动物模型的验证 | 研究WIF1在糖尿病视网膜病变中对光感受器细胞的保护机制 | C57BL/KsJ-db/db小鼠及661 W细胞作为糖尿病视网膜病变的体内和体外模型 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序、光学相干断层扫描、透射电子显微镜 | NA | 细胞、组织样本 | 12周龄C57BL/KsJ-db/db小鼠和661 W细胞 |
| 125 | 2024-08-05 |
Prediction model for EBV infection following HLA haploidentical matched hematopoietic stem cell transplantation
2024-03-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05042-9
PMID:38448996
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研究论文 | 该文章提出了一种预测在HLA半相合造血干细胞移植后EBV感染的评分模型 | 创新点在于提出了一个有效的EBV再激活预测评分系统，并利用单细胞RNA测序分析探讨了年龄对免疫细胞和病毒感染的影响 | 本研究的局限性在于样本数量和适用性尚需进一步验证 | 研究的目的是开发和验证一项用于预测HLA半相合造血干细胞移植后EBV感染风险的评分系统 | 研究对象为466名接受HLA半相合造血干细胞移植的患者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多变量逻辑回归模型 | 临床数据和RNA测序数据 | 466名接受HLA半相合造血干细胞移植的患者 |
| 126 | 2024-08-05 |
Inositol phosphatase INPP4B sustains ILC1s and intratumoral NK cells through an AKT-driven pathway
2024-Mar-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230124
PMID:38197946
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研究论文 | 本文确定了肌醇多磷酸酯酶INPP4B是组织驻留的ILC1s和肿瘤内NK细胞的标志特征 | 发现INPP4B是组织驻留的ILC1s和肿瘤内NK细胞的创新调节因子 | 没有提及具体的局限性 | 研究INPP4B在组织驻留ILC1s和NK细胞中的作用 | ILC1s和NK细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | scRNA-seq | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-05 |
CDSKNNXMBD: a novel clustering framework for large-scale single-cell data based on a stable graph structure
2024-03-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05009-w
PMID:38433205
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研究论文 | 提出了一种基于稳定图结构的单细胞聚类框架，能够高效准确地处理大规模单细胞转录组测序数据 | CDSKNNXMBD集成了分区聚类算法和社区检测算法，提供了一种新的聚类方法 | 具体的限制未在摘要中提及 | 提高对大规模和不平衡单细胞数据的处理能力 | 从人类胎儿地图上分析的15种组织的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组测序数据 | 1.46百万单细胞 |
| 128 | 2024-08-04 |
Cell specification and functional interactions in the pig blastocyst inferred from single-cell transcriptomics and uterine fluids proteomics
2024-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110780
PMID:38211822
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和子宫液体蛋白组学探讨了猪囊胚的细胞特征和功能相互作用 | 发现了两种之前未知的滋养外胚层亚群，包括可能代表祖细胞的LRP2表达细胞和与Rauber层相关的表达凋亡标志物的细胞 | 目前未提及本文的具体局限性 | 旨在深入理解猪囊胚在早期和孵化阶段的生物学特性 | 研究对象为早期和孵化的囊胚、球形和卵形胚胎及对应的子宫液体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质组学 | NA | RNA和蛋白质数据 | 大规模单细胞RNAseq数据集和对应的蛋白质组学数据集 |
| 129 | 2024-08-05 |
A risk-reward examination of sample multiplexing reagents for single cell RNA-Seq
2024-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110793
PMID:38220132
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研究论文 | 本研究比较了不同的样本复用试剂对单细胞RNA测序的影响 | 提出通过优化实验室工作流程和选择合适的复用试剂提升单细胞RNA测序的性能 | 研究中不同样本类型的信噪比问题影响了数据质量 | 旨在提高单细胞RNA测序实验的准确性和成本效益 | 研究对象包括人外周血单核细胞、鼠胚胎脑和患者来源的异种移植物 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | NA | 包括人PBMC、鼠脑和患者来源的异种移植物等多种样本类型 |
| 130 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome characteristics of testicular terminal epithelium lineages during aging in the Drosophila
2024-03, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14057
PMID:38044573
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研究论文 | 本研究对果蝇睾丸终末上皮细胞在衰老过程中的转录组特征进行了单细胞RNA测序分析 | 首次定义了以金属硫蛋白A为标志物的终末上皮群体，并细分为六个新的亚细胞群体 | 关于终末上皮的功能多样性和调控机制仍然了解不足 | 探讨衰老过程中果蝇睾丸终末上皮细胞的转录组特征及其功能 | 果蝇睾丸终末上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2天、10天和40天的果蝇样本 |
| 131 | 2024-08-05 |
Imbalance of programmed cell death patterns mediated by dendritic cell subsets in systemic lupus erythematosus and lupus nephritis
2024-Mar-28, Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences
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研究论文 | 本研究探讨了系统性红斑狼疮(SLE)和狼疮性肾炎(LN)中免疫细胞死亡模式的异常。 | 研究首次揭示了CLEC9A+cDC1在SLE和LN中细胞死亡模式失衡中的作用。 | 该研究的样本大小及其代表性可能限制其结果的普适性。 | 研究SLE和LN中免疫细胞死亡模式与疾病的关联。 | 研究对象为系统性红斑狼疮患者及狼疮性肾炎患者的免疫细胞。 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 大规模RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 涵盖了SLE和LN患者的外周血单核细胞及肾脏组织样本 |
| 132 | 2024-08-04 |
scDrugPrio: a framework for the analysis of single-cell transcriptomics to address multiple problems in precision medicine in immune-mediated inflammatory diseases
2024-03-20, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01314-7
PMID:38509600
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研究论文 | 该文章提出了一个计算框架scDrugPrio，用于分析单细胞转录组数据，以提高免疫介导炎症疾病的药物优先选择和再利用 | scDrugPrio集成了细胞类型特异性的表达变化、改变的细胞间相互作用和药物性质，以选择和排名数千种药物 | 尽管适用于小鼠模型，但在相同诊断的患者中发现了显著的细胞和基因表达差异，可能导致对治疗反应的个体差异 | 研究免疫介导炎症疾病中的药物优先选择和个性化治疗 | 对不同患者的单细胞RNA测序数据进行分析，比较药物预测的变异性 | 数字病理学 | 免疫介导炎症疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 网络模型 | 基因表达数据 | 十一名克罗恩病患者的单细胞RNA测序数据 |
| 133 | 2024-08-04 |
ALKBH5-mediated m6A modification of IL-11 drives macrophage-to-myofibroblast transition and pathological cardiac fibrosis in mice
2024-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46357-x
PMID:38443404
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研究论文 | 本研究揭示了ALKBH5介导的m6A修饰如何驱动小鼠心脏巨噬细胞向肌成纤维细胞的转变及病理性心脏纤维化 | 本研究首次揭示了ALKBH5在心脏巨噬细胞转变和心脏纤维化中的作用机制，并识别了IL-11 mRNA作为ALKBH5介导的m6A去甲基化的靶标 | 本研究的结果主要基于小鼠模型，可能在临床应用上需要进一步验证 | 研究心脏巨噬细胞转变和心脏纤维化过程中ALKBH5的作用 | 心脏巨噬细胞及其在高血压诱导的病理条件下的转变 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、旁体共生技术 | NA | mRNA | 小鼠模型 |
| 134 | 2024-08-04 |
scRNA-seq Reveals Novel Genetic Pathways and Sex Chromosome Regulation in Tribolium Spermatogenesis
2024-03-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evae059
PMID:38513111
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研究论文 | 该研究揭示了赤面粉甲虫中生殖细胞发生的新遗传通路和性染色体调控机制 | 首次展示了棉果科昆虫中生殖细胞发生的特异性标记和分子通路 | 研究主要集中在非模式生物，可能缺乏与已知编码分子的直接比较 | 探索赤面粉甲虫的生殖细胞发生过程及其分子基础 | 研究对象为赤面粉甲虫的成年雄性睾丸中的细胞群体 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雄性赤面粉甲虫的睾丸样本 |
| 135 | 2024-08-05 |
Exploration of signature based on T cell-related genes in stomach adenocarcinoma by analysis of single cell sequencing data
2024-03-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205687
PMID:38536020
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研究论文 | 本文研究了基于T细胞相关基因的胃腺癌特征。 | 创新点在于成功构建了基于T细胞相关基因的预后模型，并揭示了风险评分与免疫状态的差异。 | 本文未提及样本规模或具体实验设计的限制。 | 该研究的目的是探讨胃腺癌中T细胞相关基因的表达特征及其与预后的关系。 | 研究对象为胃癌患者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | NA |
| 136 | 2024-08-04 |
Identification and validation of ferroptosis-related gene SLC2A1 as a novel prognostic biomarker in AKI
2024-03-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205669
PMID:38517368
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研究论文 | 本研究确定和验证了与铁死亡相关的基因SLC2A1在急性肾损伤中的新型预后生物标志物 | 首次确定SLC2A1作为急性肾损伤的诊断生物标志物，并探讨其在急性肾损伤进程中的作用 | 可能未能包括所有潜在的 ferroptosis 相关基因和其在不同背景下的作用 | 探讨与急性肾损伤相关的潜在铁死亡相关基因 | 急性肾损伤中的 ferroptosis 相关基因 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 生物信息学，Western blot，免疫组化（ICH），转染实验 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及的样本数量和类型未明确说明 |
| 137 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a novel signature based on macrophage marker genes for predicting prognosis and drug response in kidney renal clear cell carcinoma by integrated analysis of single cell and bulk RNA sequencing
2024-03-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205671
PMID:38517387
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研究论文 | 本研究首次基于巨噬细胞标记基因开发并验证了一个预测肾透明细胞癌患者整体生存率的模型 | 通过分析单细胞和整体RNA测序数据，识别并验证了244个巨噬细胞标记基因并建立了五基因预后签名 | 本文未提供巨噬细胞标记基因的临床相关性的详细信息 | 旨在探索巨噬细胞标记基因在肾透明细胞癌中的预后和药物反应预测能力 | 主要针对肾透明细胞癌（KIRC）患者进行研究 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因组数据 | NA |
| 138 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveal the characteristics of disulfidptosis and a prognostic signature in BLCA
2024-03-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205686
PMID:38507521
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研究论文 | 本文研究了与膀胱癌（BLCA）相关的二巯基凋亡特征及其预后标志。 | 本文首次构建了与二巯基凋亡相关的风险评分标志，并验证其在膀胱癌预后中的有效性。 | 本文限于具体的样本类型和数量，可能影响结果的普遍性。 | 探究二巯基凋亡在膀胱癌中的生物机制及其预后意义。 | 研究对象为膀胱癌患者中的二巯基凋亡相关基因及其表达模式。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和常规RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究中分析了膀胱癌组织及相邻正常组织样本中的十个核心二巯基凋亡相关基因 |
| 139 | 2024-08-05 |
Single cell RNA-seq identifies a FOS/JUN-related monocyte signature associated with clinical response of heart failure patients with mesenchymal stem cell therapy
2024-03-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205670
PMID:38517374
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别与心力衰竭患者干细胞治疗临床反应相关的FOS/JUN相关单核细胞特征。 | 首次发现与MSC治疗反应相关的CD14单核细胞亚群，并构建了基于单核细胞的预测模型。 | 样本量较小，仅涉及4名心力衰竭患者，可能影响研究结果的广泛适用性。 | 研究MSC治疗对心力衰竭患者的影响及相关生物标志物。 | 4名心力衰竭患者在MSC治疗前后的单核细胞样本。 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | 生物样本数据 | 4名心力衰竭患者 |
| 140 | 2024-08-04 |
Integrated single-cell sequencing, spatial transcriptome sequencing and bulk RNA sequencing highlights the molecular characteristics of parthanatos in gastric cancer
2024-03-18, Aging
DOI:10.18632/aging.205658
PMID:38499384
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研究论文 | 本研究首次揭示了胃癌中parthanatos的单细胞和空间转录组学的分子特征 | 提出新的基于parthanatos信号的模型，用于区分个体异质性和预测胃癌患者的临床结果 | 研究中可能存在的特定肿瘤微环境复杂性和样本数量的限制未被详细讨论 | 探讨parthanatos在胃癌中的分子特征及其在临床结果中的应用 | 胃癌患者的肿瘤细胞及其微环境中的不同细胞类型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、空间转录组测序和大宗RNA测序 | NA | 组学数据 | NA |