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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-07 |
Pharmacological suppression of the OTUD4/CD73 proteolytic axis revives antitumor immunity against immune-suppressive breast cancers
2024-Mar-26, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176390
PMID:38530357
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现OTUD4/CD73蛋白水解轴是治疗免疫抑制性三阴性乳腺癌的潜在靶点,并开发了特异性抑制剂ST80 | 首次揭示OTUD4通过去泛素化稳定CD73的机制,开发了特异性抑制剂ST80,并证明其能增强抗PD-L1疗法的效果 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行人体临床试验 | 开发针对免疫抑制性乳腺癌的新型免疫治疗策略 | 三阴性乳腺癌(TNBC)及其肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 多组学分析,空间转录组学,实验验证 | NA | 多组学数据,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 122 | 2025-10-07 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels the molecular feature of M2 macrophages of head and neck squamous cell carcinoma
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18083
PMID:38393307
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq分析头颈鳞状细胞癌中M2巨噬细胞的分子特征 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建M2巨噬细胞相关特征模型,并鉴定FCGR2A作为潜在免疫治疗靶点 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明M2肿瘤相关巨噬细胞在头颈鳞状细胞癌中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者和肿瘤微环境中的M2巨噬细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | Consensus Clustering, 特征模型 | 基因表达谱, 临床数据 | TCGA数据库HNSC患者数据 + GSE139324单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-10-07 |
A Foundation Model for Cell Segmentation
2024-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.17.567630
PMID:38045277
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研究论文 | 提出了一种名为CellSAM的基础模型,用于实现跨多种细胞成像数据的通用细胞分割 | 基于Segment Anything Model开发了提示工程方法,结合自动细胞检测器CellFinder,实现了在哺乳动物细胞、酵母和细菌等多种成像模态下的通用细胞分割 | NA | 开发一个能够跨不同细胞成像领域通用的基础细胞分割模型 | 哺乳动物细胞(组织和细胞培养)、酵母和细菌的成像数据 | 计算机视觉 | NA | 深度学习,提示工程 | 基础模型,目标检测器,Segment Anything Model | 细胞成像数据 | NA | NA | 空间转录组学,细胞追踪 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-07 |
[Analysis of the types and functions of CD34+ cells in full-thickness skin defect wounds of normal mice and diabetic mice by single-cell RNA sequencing]
2024-Mar-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析正常小鼠和糖尿病小鼠全层皮肤缺损创面中CD34+细胞的类型和功能 | 首次使用CD34细胞谱系示踪小鼠结合单细胞RNA测序技术,系统比较了正常和糖尿病小鼠创面愈合过程中CD34+细胞的异质性和功能差异 | 样本量较小(对照组3只,糖尿病组2只),仅观察了伤后第4天的时间点 | 探究CD34+细胞在正常和糖尿病小鼠皮肤创面愈合过程中的细胞类型和功能差异 | CD34细胞谱系示踪小鼠(正常组和糖尿病模型组) | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选 | Seurat 4.0.2 | 单细胞RNA测序数据 | 6只CD34细胞谱系示踪小鼠(3只对照组,2只糖尿病组用于单细胞测序) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-07 |
CD7 activation regulates cytotoxicity-driven pathology in systemic sclerosis, yielding a target for selective cell depletion
2024-Mar-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224827
PMID:38123919
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术发现CD7激活调控系统性硬化症中细胞毒性驱动的病理过程,并验证了靶向CD7的选择性细胞清除策略 | 首次揭示CD7在系统性硬化症中作为共刺激分子调控细胞毒性T细胞和NK细胞的致病作用,并证明靶向CD7的选择性细胞清除可改善疾病表现 | 样本量相对有限(165例患者),临床验证仅基于单个同情用药案例 | 探究系统性硬化症中细胞毒性细胞的调控机制及潜在治疗靶点 | 系统性硬化症患者和健康对照者的皮肤和血液样本 | 免疫学 | 系统性硬化症 | 单细胞转录组学, 流式细胞术, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 图像数据 | 165例系统性硬化症患者和80例健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-07 |
Ibudilast Protects Retinal Bipolar Cells from Excitotoxic Retinal Damage and Activates the mTOR Pathway
2024-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585556
PMID:38562805
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研究论文 | 本研究探讨了伊布地司特在兴奋性毒性视网膜损伤模型中对视网膜神经元的保护作用及其作用机制 | 首次发现伊布地司特通过激活mTOR通路保护视网膜双极细胞,并揭示双极细胞与穆勒胶质细胞之间的旁分泌信号交流在神经保护中的重要作用 | 研究仅使用鸡视网膜损伤模型,mTOR抑制剂雷帕霉素未能减少细胞死亡,机制尚未完全阐明 | 研究伊布地司特对视网膜神经元的保护作用及其分子机制 | 鸡视网膜神经元,特别是双极细胞和穆勒胶质细胞 | 神经科学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序,光谱域光学相干断层扫描,视网膜电图,TUNEL检测 | NA | 基因表达数据,影像数据,电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-10-07 |
Identification of potential immunologic resilience in the healing process of diabetic foot ulcers
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14465
PMID:37926487
|
研究论文 | 通过生物信息学和单细胞RNA测序分析糖尿病足溃疡愈合过程中的免疫学特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示CD8 T细胞在糖尿病足溃疡愈合过程中的关键作用,并识别出与免疫恢复相关的基因模块 | 依赖公共数据库数据,样本来源可能有限;需要进一步实验验证关键基因的功能机制 | 探索糖尿病足溃疡愈合过程中的免疫学机制 | 糖尿病足溃疡患者的基因表达数据和细胞群体 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术, 生物信息学分析 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-10-07 |
Modeling primitive and definitive erythropoiesis with induced pluripotent stem cells
2024-03-26, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023011708
PMID:38290102
|
研究论文 | 利用诱导多能干细胞建模原始和终末红细胞生成过程 | 首次通过同源基因背景的iPSCs直接比较原始和终末红细胞的差异,并利用KLF1突变模型验证终末红细胞特异性表型变化 | 研究主要基于体外分化系统,可能与体内真实发育环境存在差异 | 比较原始和终末红细胞生成的功能特性和分子机制差异 | 人诱导多能干细胞分化的红细胞和胎儿肝脏来源的红细胞 | 干细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-10-07 |
Investigating adverse genomic and regulatory changes caused by replacement of the full-length CFTR cDNA using Cas9 and AAV
2024-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102134
PMID:38384445
|
研究论文 | 评估使用Cas9和AAV替换CFTR全长cDNA引起的基因组和调控变化的安全性 | 首次全面评估CFTR基因替换策略的基因组安全性,结合CAST-seq、ATAC-seq和scRNA-seq多组学分析 | 研究样本量有限,主要关注特定基因座的变化,长期安全性仍需验证 | 评估基于Cas9和AAV的CFTR基因替换治疗策略的安全性 | 囊性纤维化患者的气道基底干细胞 | 基因编辑 | 囊性纤维化 | CRISPR-Cas9基因编辑, AAV载体, CAST-seq, ATAC-seq, scRNA-seq | NA | 基因组测序数据, 表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 130 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals the transcriptional alterations in the submandibular glands of aged mice
2024-03, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2023.12.002
PMID:38142941
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析老年小鼠颌下腺的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示老年小鼠颌下腺不同细胞类型的基因表达变化,特别是细胞衰老标志物和MHC I类分子的表达变化 | 研究仅针对小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;样本量未明确说明 | 阐明衰老相关唾液腺变化的分子机制 | 成年和老年小鼠的颌下腺组织 | 单细胞组学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年和老年小鼠颌下腺(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2025-10-07 |
Transcript-specific enrichment enables profiling rare cell states via scRNA-seq
2024-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.27.587039
PMID:38586040
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研究论文 | 开发了一种名为PERFF-seq的可扩展方法,通过RNA流式荧光原位杂交技术实现基于特定RNA转录本的稀有细胞亚群富集和单细胞RNA测序分析 | 提出了基于RNA转录本的细胞富集方法,克服了传统流式分选依赖细胞表面蛋白标记和高质量抗体的限制,特别适用于需要分离细胞核的组织样本 | 方法在新鲜冷冻和FFPE脑组织样本中验证,但在其他组织类型中的应用效果需要进一步验证 | 开发能够富集表达特定标记转录本的稀有细胞群并进行单细胞RNA测序分析的技术 | 免疫细胞群体和脑组织样本中的细胞核 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA流式荧光原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 141,227个免疫细胞和29,522个脑组织细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2024-08-07 |
Correction to: Adjustment of scRNA-seq data to improve cell-type decomposition of spatial transcriptomics
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae155
PMID:38581651
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2025-10-07 |
Cell-cell communication and initial population composition shape the structure of potato spindle tuber viroid quasispecies
2024-Mar-29, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae012
PMID:38252648
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研究论文 | 本研究探讨细胞间通讯和初始种群组成如何影响马铃薯纺锤块茎类病毒准种结构的形成 | 首次通过比较缺乏胞间连丝的成熟保卫细胞和离体培养的叶肉原生质体,揭示细胞间通讯对类病毒准种结构的影响 | 研究仅针对马铃薯纺锤块茎类病毒中间株系,结果可能不适用于其他类病毒或病毒 | 阐明类病毒准种结构的形成机制 | 马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)及其变异体 | 植物病理学 | 植物病毒感染 | 单细胞测序,共感染实验 | NA | 基因组序列数据 | 番茄植株的保卫细胞和叶肉原生质体 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2025-10-07 |
Differentiation route determines the functional outputs of adult megakaryopoiesis
2024-03-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.02.006
PMID:38447571
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研究论文 | 本研究通过命运示踪系统比较了巨核细胞生成的两种分化途径的功能差异 | 首次开发命运示踪系统区分巨核细胞的直接和逐步分化途径,并揭示它们产生功能不同的巨核细胞亚群 | NA | 探究巨核细胞生成的两种分化途径的功能重要性 | 成年小鼠的巨核细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 命运示踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-07 |
Brooklyn plots to identify co-expression dysregulation in single cell sequencing
2024-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad112
PMID:38213836
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研究论文 | 开发了一种名为'布鲁克林图'的软件工具,用于检测单细胞RNA测序数据中染色体相邻基因共表达的全局变化 | 首次提出使用布鲁克林图检测单细胞测序数据中基因组相关相邻基因共表达的非随机性变化 | 方法主要针对单细胞数据集,在批量数据集中可能无法观察到相同的转录爆发模式 | 识别人类疾病中开放染色质区域改变导致的基因共表达失调 | 扩张型心肌病心肌细胞及其他细胞类型的单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序分析 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | 统计分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-10-07 |
Adipose stem cells control obesity-induced T cell infiltration into adipose tissue
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113963
PMID:38492218
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪干细胞通过CCL5调控肥胖诱导的T细胞向白色脂肪组织浸润的机制 | 首次发现脂肪干细胞在肥胖早期通过肿瘤坏死因子α/核因子κB通路诱导CCL5表达,从而驱动T细胞向脂肪组织浸润 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肥胖诱导T细胞向白色脂肪组织浸润的机制 | 小鼠脂肪干细胞和T细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖相关炎症 | 单细胞RNA测序,细胞移植,骨髓移植 | NA | 单细胞转录组数据 | 肥胖小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-10-07 |
Unique Spatial Transcriptomic Profiling of the Murine Femoral Fracture Callus: A Preliminary Report
2024-03-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13060522
PMID:38534368
|
研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术首次对小鼠股骨骨折骨痂进行空间完整的基因表达特征分析 | 首次应用Visium CytAssist空间转录组学平台对骨科损伤骨折愈合模型进行空间完整的基因表达变化表征 | 初步研究报告,样本量有限,需要进一步验证 | 研究转移性乳腺癌对骨折愈合的影响机制 | BALB/c小鼠骨折骨痂组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌骨转移 | 空间转录组学 | 无监督聚类,组织学注释 | 空间基因表达数据 | BALB/c小鼠(含/不含MDA-MB-231转移性乳腺癌细胞) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组学平台 |
| 138 | 2025-10-07 |
The cell-type-specific spatial organization of the anterior thalamic nuclei of the mouse brain
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113842
PMID:38427564
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研究论文 | 本研究通过整合多种技术揭示了小鼠前丘脑核团的细胞类型组成和空间组织原则 | 首次在单细胞和空间分辨率水平绘制了前丘脑核团的细胞类型组成,发现了离散和连续的空间组织模式 | 研究仅限于小鼠模型,人类或其他物种的适用性需要进一步验证 | 解析前丘脑核团的细胞类型组成和空间组织结构 | 小鼠前丘脑核团 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 139 | 2025-10-07 |
Single-cell spatial transcriptomic and translatomic profiling of dopaminergic neurons in health, aging, and disease
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113784
PMID:38386560
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研究论文 | 通过单细胞空间转录组和多巴胺能神经元翻译组分析,研究健康、衰老和疾病状态下小鼠大脑多巴胺能神经元的表达特征 | 首次结合单细胞空间转录组和多巴胺能神经元翻译组分析,在空间背景下深度表征多巴胺能神经元特征,并识别出CASR作为多巴胺能钙处理的调节因子 | 研究基于帕金森病转基因小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究大脑多巴胺能神经元在健康、衰老和疾病状态下的空间基因表达特征 | 年轻和年老小鼠大脑中的多巴胺能神经元及其他27种细胞类型 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 单细胞空间转录组学, 翻译组分析 | NA | 空间基因表达数据 | 年轻和年老小鼠大脑样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-07 |
A molecular atlas of adult C. elegans motor neurons reveals ancient diversity delineated by conserved transcription factor codes
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113857
PMID:38421866
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了成年秀丽隐杆线虫运动神经元的全面分子图谱,揭示了由保守转录因子编码定义的神经元多样性 | 首次系统描绘成年线虫运动神经元分子图谱,发现同源域转录因子组合编码在不同物种间保守地定义运动神经元多样性 | 研究主要聚焦线虫模型,在哺乳动物中的验证仍需进一步扩展 | 解析成年动物运动神经元的分子组成特征和组织原则 | 成年秀丽隐杆线虫运动神经元 | 单细胞基因组学 | 运动神经元疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13,200个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |