单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 540 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-11-07 |
Gastrulation-stage gene expression in Nipbl+/- mouse embryos foreshadows the development of syndromic birth defects
2024-Mar-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4239
PMID:38507484
|
研究论文 | 研究了Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成阶段的基因表达，揭示了与Cornelia de Lange综合征相关的出生缺陷的早期迹象 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成和早期心脏新月阶段的基因表达变化，发现了与出生缺陷相关的基因表达失调和谱系分配错误 | NA | 探讨Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成阶段的基因表达变化及其与出生缺陷的关系 | Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成和早期心脏新月阶段的基因表达 | NA | 遗传性出生缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和Nipbl+/-小鼠胚胎 |
| 102 | 2024-11-07 |
Expansion of memory Vδ2 T cells following SARS-CoV-2 vaccination revealed by temporal single-cell transcriptomics
2024-Mar-20, NPJ vaccines
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41541-024-00853-9
PMID:38509155
|
研究论文 | 研究了mRNA SARS-CoV-2疫苗接种后Vδ2 T细胞的分子变化 | 揭示了第二次疫苗接种后Vδ2 T细胞的记忆特征，并通过体外实验验证了其效应功能 | NA | 探讨mRNA SARS-CoV-2疫苗接种后Vδ2 T细胞的免疫反应变化 | Vδ2 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序和γδ-TCR测序 | NA | RNA | 纵向研究中的多个时间点样本 |
| 103 | 2024-11-07 |
Intestinal epithelial adaptations to vertical sleeve gastrectomy defined at single-cell resolution
2024-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110805
PMID:38309446
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，探讨了垂直袖状胃切除术（VSG）对小肠上皮细胞的影响 | 首次在单细胞分辨率下定义了VSG对小肠上皮细胞的适应性变化，并揭示了VSG恢复高脂饮食扰动的细胞类型特异性基因和通路 | 研究基于小鼠模型，结果的临床相关性需进一步验证 | 探讨垂直袖状胃切除术（VSG）对小肠上皮细胞的分子和细胞水平的影响 | 小肠上皮细胞及其在VSG后的适应性变化 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 104 | 2024-11-07 |
YAP induces a neonatal-like pro-renewal niche in the adult heart
2024-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00428-w
PMID:38510108
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研究论文 | 研究探讨了YAP激活在成年心脏中诱导新生儿样再生微环境的作用 | 发现YAP激活可以重建心肌梗死后心脏的微环境，并诱导心脏再生 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类心脏中验证 | 研究YAP激活在成年心脏中的再生潜力及其微环境重建机制 | 成年表达YAP5SA的心肌细胞和心脏微环境 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠和人类心脏样本 |
| 105 | 2024-11-06 |
Identification of estrogen response-associated STRA6+ granulosa cells within high-grade serous ovarian carcinoma by single-cell sequencing
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27790
PMID:38509903
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了高级别浆液性卵巢癌中的细胞异质性，并识别出与雌激素反应相关的STRA6+颗粒细胞 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中发现STRA6+颗粒细胞，并揭示其通过雌激素反应促进肿瘤生长的潜力 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的实验验证 | 揭示高级别浆液性卵巢癌中的细胞异质性，并探索潜在的治疗靶点 | 高级别浆液性卵巢癌中的细胞亚群及其生物学功能 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 高级别浆液性卵巢癌的单细胞RNA测序数据 |
| 106 | 2024-11-06 |
Cellular heterogeneity and dynamics of the human uterus in healthy premenopausal women
2024-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.07.583985
PMID:38559249
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研究论文 | 本文应用单细胞RNA测序技术分析了5名健康育龄女性子宫内膜和子宫肌层的细胞异质性和动态变化 | 本文构建了一个包含超过167,000个细胞的正常子宫细胞图谱，并提出了一个包含39个子类型的共识注释系统 | 本文仅分析了健康育龄女性的子宫细胞，未涉及其他年龄段或疾病状态 | 研究健康育龄女性子宫的细胞异质性和动态变化 | 子宫内膜和子宫肌层的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名健康育龄女性 |
| 107 | 2024-11-06 |
In situ tissue profile of rat trigeminal nerve in trigeminal neuralgia using spatial transcriptome sequencing
2024-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001110
PMID:38270619
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研究论文 | 本研究通过空间转录组测序技术分析了三叉神经痛大鼠模型中三叉神经组织的细胞间相互作用 | 揭示了三叉神经节对施万细胞脱髓鞘和再髓鞘化反应的影响机制，并发现了新的重要靶基因和调控通路 | NA | 探讨三叉神经痛中不同类型细胞间的相互作用，特别是脱髓鞘对三叉神经节的影响及其内在机制 | 三叉神经痛大鼠模型的三叉神经组织 | NA | 三叉神经痛 | 空间转录组测序 | NA | 基因表达矩阵 | 三叉神经痛大鼠模型的三叉神经组织样本 |
| 108 | 2024-11-04 |
Integration of scRNA-seq data by disentangled representation learning with condition domain adaptation
2024-Mar-16, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05706-9
PMID:38493095
|
研究论文 | 提出了一种名为scDisco的单细胞RNA测序数据整合方法，通过解耦表示学习和条件域适应策略来减少批次效应并分离生物效应和条件特异性效应 | scDisco通过条件特异性域适应网络和条件特异性批量归一化层，成功解耦生物效应和条件特异性效应，并增强条件特异性表示 | NA | 加速在不同生物条件下系统差异的探索 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 109 | 2024-11-04 |
OralExplorer: a web server for exploring the mechanisms of oral inflammatory diseases
2024-03-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05019-8
PMID:38491529
|
研究论文 | 开发了一个名为OralExplorer的网络工具，用于探索口腔炎症性疾病的机制 | 整合了公开的口腔炎症性疾病数据，并提供全面的在线生物信息学分析 | NA | 解决口腔炎症性疾病数据未充分利用的问题，探索其分子机制 | 口腔炎症性疾病及其相关数据 | 生物信息学 | 口腔炎症性疾病 | qPCR, IHC | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 35个相关数据集，涵盖6种主要疾病类型和901个样本 |
| 110 | 2024-11-04 |
In vivo CRISPR screening directly targeting testicular cells
2024-Mar-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100510
PMID:38447574
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研究论文 | 本文开发了一种体内CRISPR筛选方法，通过靶向睾丸细胞来识别影响精子发生的关键基因 | 首次将体外CRISPR筛选方法应用于体内，成功识别了影响精子发生的Rd3基因，并开发了Hub-Explorer工具来分析细胞类型特异性信号通路 | NA | 研究CRISPR-Cas9在体内筛选中的应用，识别影响精子发生的分子机制 | 睾丸细胞和精子发生过程 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | NA |
| 111 | 2024-11-04 |
Proteomic analysis of ascitic extracellular vesicles describes tumour microenvironment and predicts patient survival in ovarian cancer
2024-Mar, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12420
PMID:38490958
|
研究论文 | 本文通过质谱分析腹水外泌体中的蛋白质，描述了卵巢癌的肿瘤微环境并预测患者生存 | 本文首次定义了卵巢癌腹水外泌体的核心蛋白质组，并发现这些外泌体主要来源于非恶性细胞类型，如巨噬细胞和成纤维细胞 | NA | 研究卵巢癌腹水外泌体的蛋白质组成及其在肿瘤微环境中的作用，并评估其对患者生存的预测潜力 | 卵巢癌患者的腹水外泌体及其蛋白质组成 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 质谱分析 | NA | 蛋白质 | NA |
| 112 | 2024-10-30 |
Proneural-mesenchymal antagonism dominates the patterns of phenotypic heterogeneity in glioblastoma
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109184
PMID:38433919
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研究论文 | 研究探讨了胶质母细胞瘤（GBM）表型异质性的分子亚型及其相互关系 | 通过基因和基因签名的成对相关性分析，揭示了GBM中proneural和mesenchymal亚型之间的主要对抗关系，并提出了重新思考GBM表型特征化的建议 | NA | 探讨胶质母细胞瘤表型异质性的分子亚型及其相互关系 | 胶质母细胞瘤（GBM）的表型异质性及其分子亚型 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过100个单细胞和bulk转录组数据集 |
| 113 | 2024-10-30 |
A mouse model of Zhu-Tokita-Takenouchi-Kim syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis
2024-Mar-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175053
PMID:38290089
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研究论文 | 本文开发了一种Zhu-Tokita-Takenouchi-Kim综合征的小鼠模型，揭示了SON基因在器官发育和造血中的不可或缺的作用 | 首次建立了Zhu-Tokita-Takenouchi-Kim综合征的小鼠模型，并揭示了SON基因在器官发育和造血中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 研究SON基因在器官发育和造血中的作用，并开发一种罕见疾病的研究工具 | Zhu-Tokita-Takenouchi-Kim综合征的小鼠模型及其在器官发育和造血中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | Son+/−小鼠 |
| 114 | 2024-10-30 |
Unraveling the role of M1 macrophage and CXCL9 in predicting immune checkpoint inhibitor efficacy through multicohort analysis and single-cell RNA sequencing
2024-Mar, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.471
PMID:38434763
|
研究论文 | 研究探讨了M1巨噬细胞和CXCL9在预测免疫检查点抑制剂疗效中的作用，通过多队列分析和单细胞RNA测序进行了综合分析 | 开发了一种基于M1巨噬细胞、CXCL9和APOBEC3G相关基因的多层次注意力图神经网络模型，用于预测免疫检查点抑制剂的疗效 | NA | 探讨M1巨噬细胞和CXCL9在预测免疫检查点抑制剂疗效中的作用 | M1巨噬细胞、CXCL9和APOBEC3G在免疫检查点抑制剂疗效预测中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多层次注意力图神经网络 | 基因表达数据 | 多队列样本 |
| 115 | 2024-10-29 |
Single-cell transcriptomics reveal the remodeling landscape of bladder in patients with obstruction-induced detrusor underactivity
2024-Mar, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.490
PMID:38414668
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组测序揭示了膀胱在阻塞性逼尿肌活动低下患者中的重塑景观 | 首次构建了阻塞性逼尿肌活动低下的单细胞图谱，揭示了细胞异质性和功能变化 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 揭示逼尿肌活动低下的潜在病理生理机制 | 膀胱功能障碍患者的膀胱细胞 | 数字病理学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 69,973个细胞，包括5个对照组和9个患者组 |
| 116 | 2024-10-28 |
Pan-cancer analysis of ABCC1 as a potential prognostic and immunological biomarker
2024-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101882
PMID:38290247
|
研究论文 | 本文研究了ABCC1在多种癌症中的表达及其作为预后和免疫生物标志物的潜力 | 首次全面分析了ABCC1在癌症免疫浸润和泛癌预后中的作用 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，缺乏临床试验验证 | 探讨ABCC1在癌症中的表达及其对预后和免疫反应的影响 | ABCC1在不同癌症类型中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多种癌症类型的TCGA数据和GEO数据库中的肝细胞癌scRNA-seq数据 |
| 117 | 2024-10-24 |
Regional analysis to delineate intrasample heterogeneity with RegionalST
2024-03-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae186
PMID:38579257
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RegionalST的计算方法，用于量化细胞类型混合和相互作用，识别感兴趣的子区域，并首次进行跨区域的细胞类型特异性差异分析 | 首次提出了一种能够利用跨区域信息并提高空间分辨率的计算方法RegionalST | NA | 解决当前技术在利用跨区域信息和空间分辨率方面的不足，以更好地阐明组织异质性 | 空间转录组数据中的细胞类型混合、相互作用和组织异质性 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 118 | 2024-10-20 |
SSR1 and CKAP4 as potential biomarkers for intervertebral disc degeneration based on integrated bioinformatics analysis
2024-Mar, JOR spine
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/jsp2.1309
PMID:38222802
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，鉴定了SSR1和CKAP4作为椎间盘退变潜在的生物标志物，并在体外进行了验证 | 本研究首次通过综合生物信息学方法鉴定了SSR1和CKAP4作为椎间盘退变的潜在生物标志物，并在体外实验中验证了其诊断价值 | 本研究的样本量较小，且仅限于人类椎间盘组织，未来需要更大规模和多样本的验证 | 鉴定椎间盘退变的潜在生物标志物并验证其诊断价值 | 椎间盘退变相关的关键基因和潜在生物标志物 | 生物信息学 | 脊柱疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、MCODE、LASSO算法、ROC曲线、免疫浸润分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 30个人类椎间盘样本 |
| 119 | 2024-10-14 |
Utilization of an Artery-on-a-Chip to Unravel Novel Regulators and Therapeutic Targets in Vascular Diseases
2024-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202302907
PMID:37797407
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研究论文 | 本研究利用器官芯片技术开发了一种体外中大型动脉模型，旨在重现动脉壁结构和影响管腔细胞的血液动力学力 | 首次使用动脉芯片模型来揭示剪切应力调节的新基因，并将其应用于药物测试 | NA | 揭示血管疾病中的新调节因子和治疗靶点 | 中大型动脉的结构和功能 | 生物医学工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括患病和非患病（内部对照）血管区域的患者样本 |
| 120 | 2024-10-08 |
A TGF-β-dominant chemoresistant phenotype of hepatoblastoma associated with aflatoxin exposure in children
2024-03-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000534
PMID:37459556
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研究论文 | 本文研究了儿童肝母细胞瘤（HB）中与黄曲霉素暴露相关的TGF-β主导的化疗耐药表型 | 首次定义了HB的四种转录亚型，并发现S2A亚型是一种新的化疗耐药亚型，与TGF-β上调和黄曲霉素暴露相关 | NA | 探讨黄曲霉素与肝母细胞瘤化疗耐药性的关系 | 肝母细胞瘤（HB）样本及其化疗耐药性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、全外显子测序、批量RNA测序 | NA | RNA | 180个HB样本 |