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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing comparison of the human metastatic prostate spine tumor microenvironment
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102805
PMID:38341849
|
研究论文 | 本文开发了一种从前列腺癌患者临床样本中处理脊柱转移瘤单细胞RNA测序的实验室方案 | 建立了手术室到实验室的单细胞处理流程,专门针对脊柱转移瘤组织异质性高的挑战 | 仅基于单一前列腺癌患者样本,样本量有限 | 开发脊柱转移瘤单细胞测序分析方案,识别预后标志物和治疗靶点 | 前列腺癌脊柱转移患者的临床组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例前列腺癌脊柱转移患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Protocol to study the inheritance and propagation of non-genetically encoded states using barcode decay lineage tracing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102809
PMID:38180835
|
研究论文 | 提出一种结合条形码衰减谱系追踪和单细胞转录组分析的实验方案 | 开发BdLT-Seq技术,能够在保持同源性的同时定向评估克隆演化,比较同源细胞谱系间的非遗传分子特征 | NA | 研究非遗传编码状态的遗传和传播机制 | 细胞谱系 | 单细胞分析 | NA | 条形码衰减谱系追踪,单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Protocol to analyze immune cells in the tumor microenvironment by transcriptome using machine learning
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102684
PMID:38219153
|
研究论文 | 提出一种基于机器学习的肿瘤微环境免疫细胞转录组分析方案 | 整合单细胞RNA测序与机器学习方法,系统分析肿瘤微环境中免疫细胞的表型变化、分化轨迹和浸润过程 | NA | 开发肿瘤微环境免疫细胞分析流程,识别潜在药物靶点 | 肿瘤微环境中的免疫细胞,特别是单核吞噬细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 批量RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals intratumoral heterogeneity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24048
PMID:38133212
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌肿瘤内异质性并建立预后模型 | 首次在单细胞水平系统解析肺腺癌肿瘤内异质性,发现B细胞显著招募现象,建立跨队列验证的预后模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索肺腺癌肿瘤内异质性及其临床意义 | 肺腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | TCGA-LUAD(n=503), GSE68465(n=442), GSE72094(n=398), GSE26939(n=115) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-05-08 |
Single-cell Transcriptome Analysis Identifies Senescent Osteocytes as Contributors to Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis
2024-Mar-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4047486/v1
PMID:38558984
|
research paper | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了衰老骨细胞在乳腺癌骨转移中促进骨破坏的作用 | 首次发现乳腺癌骨转移中的骨细胞会提前衰老并表现出独特的衰老相关分泌表型(SASP),促进骨破坏 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究乳腺癌骨转移中骨微环境重编程对骨细胞的影响 | 乳腺癌骨转移中的骨细胞 | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing, multiplex hybridization, AI-assisted analysis | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和乳腺癌骨转移患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-Mar-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2025-10-07 |
Spinster homolog 2 reduces malignancies of glioblastoma via PTEN/PI3K/AKT pathway
2024-03, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.2785
PMID:37728571
|
研究论文 | 本研究探讨SPNS2通过PTEN/PI3K/AKT通路抑制胶质母细胞瘤恶性进展的分子机制 | 首次揭示SPNS2在胶质母细胞瘤中的抑癌功能及其通过PTEN/PI3K/AKT通路调控肿瘤恶性进展和免疫浸润的新机制 | 未明确SPNS2调控PTEN/PI3K/AKT通路的具体分子机制,缺乏临床样本验证 | 探究SPNS2在胶质母细胞瘤中的生物学功能和分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系和体内移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞测序, 基因富集分析, 细胞功能实验, 体内移植瘤实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 利用TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-07 |
Genetic lineage tracing identifies adaptive mechanisms of pancreatic islet β cells in various mouse models of diabetes with distinct age of initiation
2024-03, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2372-y
PMID:37930473
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研究论文 | 通过遗传谱系追踪技术研究不同糖尿病模型中胰岛β细胞的适应性机制 | 首次在不同年龄启动的糖尿病模型中系统比较β细胞的命运转变机制,发现STZ和HFD模型中β细胞采用不同的再生策略 | 研究仅限于小鼠模型,人类糖尿病中的类似机制需要进一步验证 | 阐明在T1D和T2D发病过程中胰岛β细胞应对胰岛素短缺的适应性机制 | 糖尿病小鼠模型中的胰岛β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 遗传谱系追踪, 单细胞RNA测序 | Cre-LoxP系统 | 单细胞转录组数据 | 多种糖尿病小鼠模型(STZ诱导和HFD诱导) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-07 |
A Panoramic View of Cell Population Dynamics in Mammalian Aging
2024-Mar-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.01.583001
PMID:38496474
|
研究论文 | 通过构建包含2000多万个细胞的小鼠单细胞转录组图谱,全面揭示哺乳动物衰老过程中的细胞群体动态变化 | 首次提供了跨器官、生命周期、性别和基因型的全景式细胞群体动态视图,识别了200多个与衰老相关的细胞群体变化 | 研究局限于小鼠模型,人类组织的验证仍需进一步研究 | 阐明哺乳动物全身衰老相关的细胞群体动态变化 | 小鼠多种器官组织在不同生命阶段、性别和基因型的细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 623个小鼠组织样本,超过2000万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-10-07 |
Exploring wound management in dental pulp: Utilizing single-cell RNA sequencing for global transcriptomic analysis in healthy and inflamed pulpal tissues
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14804
PMID:38385817
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析健康和炎症牙髓组织的转录组景观,探索牙髓伤口愈合的细胞和分子机制 | 首次在牙髓研究中应用单细胞RNA测序技术揭示龋齿条件下细胞组成变化和细胞间相互作用网络 | 样本量相对有限,仅包含50例患者样本 | 研究牙髓伤口愈合过程中信号级联、细胞反应和细胞外基质动力学的复杂相互作用 | 人类牙髓组织(健康和炎症状态) | 单细胞组学 | 牙髓疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 50例患者牙髓组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-10-07 |
Evaluating the role of wound-healing genes in conjunction with stool routine and serum tumor markers for colorectal cancer diagnosis and prognostic implications
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14768
PMID:38446012
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研究论文 | 本研究评估粪便常规检查联合血清肿瘤标志物检测在结直肠癌诊断中的临床应用价值 | 首次将伤口愈合基因(VEGFA、TP53、TGFA)与粪便常规和血清肿瘤标志物结合用于结直肠癌诊断和预后评估 | 样本量较小(仅56例患者),需要更大规模研究验证结果 | 探索结直肠癌的新型诊断和预后评估方法 | 结直肠癌患者和健康对照者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 临床数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 56例结直肠癌患者和56例健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-07 |
De novo antibody discovery in human blood from full-length single B cell transcriptomics and matching haplotyped-resolved germline assemblies
2024-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.26.586834
PMID:38585716
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组测序和单倍型解析的种系基因组组装,从人血液中发现了新的抗体 | 首次将单倍型解析的种系免疫球蛋白位点组装与单B细胞全长转录组测序相结合,能够完全解析母源和父源对种系V、D、J基因库的贡献 | 研究仅针对麻疹、腮腺炎和风疹疫苗接种后的B细胞反应,样本来源和免疫挑战类型有限 | 理解种系免疫球蛋白单倍型如何影响表达的抗体库 | 人类B细胞及其表达的抗体 | 免疫基因组学 | 传染病 | 单细胞全长转录组测序, 基因组测序, 单倍型组装 | NA | 基因组序列, 转录组序列 | 来自同一供体的B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-07 |
Clearance of VWF by hepatic macrophages is critical for the protective effect of ADAMTS13 in sickle cell anemia mice
2024-03-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021583
PMID:38142410
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研究论文 | 本研究揭示了肝巨噬细胞通过清除ADAMTS13切割的VWF在镰状细胞贫血中的保护作用机制 | 首次发现Clec4f+Marcohigh巨噬细胞亚群以去唾液酸化依赖方式清除VWF,并证明巨噬细胞介导的VWF清除对ADAMTS13保护效应至关重要 | 研究仅在镰状细胞贫血小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 阐明肝巨噬细胞在镰状细胞贫血病理机制中的作用及ADAMTS13的保护机制 | 镰状细胞贫血小鼠模型及其肝巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | 镰状细胞贫血小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-07 |
A revised conceptual framework for mouse vomeronasal pumping and stimulus sampling
2024-03-25, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.01.036
PMID:38320553
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研究论文 | 本研究通过多学科方法重新探讨小鼠犁鼻器刺激采样机制,提出修正的泵送概念框架 | 发现小鼠犁鼻器侧部主要由平滑肌组成,识别出两种具有不同特性和功能的平滑肌纤维亚型,揭示了新的刺激采样机制 | 研究主要聚焦于小鼠模型,结果向其他物种的普适性需要进一步验证 | 阐明犁鼻器的物理机械功能和刺激采样基本原理 | 小鼠犁鼻器组织 | 神经生物学 | NA | 单细胞转录组学、药理学分析、2D/3D断层扫描 | NA | 解剖学数据、组织学数据、生理学数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-10-07 |
Age-associated CD4+ T cells with B cell-promoting functions are regulated by ZEB2 in autoimmunity
2024-03-29, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk1643
PMID:38330141
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研究论文 | 本研究鉴定了一种随年龄增长而扩增的CD4+ T细胞新亚群——年龄相关T辅助细胞(TA细胞),并揭示了其在自身免疫疾病中的作用机制 | 首次发现并命名了年龄相关的CXCR3CD4效应记忆T细胞亚群(TA细胞),揭示了其同时具有细胞毒性和B细胞辅助功能的双重特性,并证明ZEB2转录因子调控这些功能 | 样本量相对有限(354例),且主要基于流式细胞术和bulk RNA测序技术,可能需要单细胞水平的功能验证 | 探究衰老与自身免疫疾病之间的关联机制 | 354名自身免疫疾病患者和健康对照者的CD4 T细胞亚群 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 354例(自身免疫疾病患者和健康对照) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-07 |
Clonal differences underlie variable responses to sequential and prolonged treatment
2024-Mar-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.01.011
PMID:38401539
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和条形码技术追踪耐药克隆在连续治疗过程中的变化,揭示了克隆间基因表达差异导致的不同治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序与克隆条形码技术,系统追踪耐药克隆在连续和长期治疗过程中的命运差异 | 未明确说明研究涉及的癌症类型和具体样本数量 | 探究癌症细胞克隆差异如何影响连续治疗反应,为靶向最侵袭性耐药克隆的优化治疗策略提供依据 | 癌症细胞克隆 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 克隆条形码 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-07 |
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotype and phenotype in chronic lymphocytic leukemia
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.15.585298
PMID:38559060
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研究论文 | 本研究利用长读长单细胞RNA测序技术研究慢性淋巴细胞白血病中癌症亚克隆的基因型和表型特征 | 首次将长读长单细胞RNA测序技术应用于研究BTK抑制剂治疗中出现的突变亚克隆,能够更全面地分析转录本覆盖度 | 研究样本量较小(仅6名患者),且仅在部分患者中观察到突变亚克隆的转录组差异 | 探究BTK抑制剂治疗中突变亚克隆的扩张机制和转录组特征 | 慢性淋巴细胞白血病患者中的癌症亚克隆 | 单细胞测序 | 慢性淋巴细胞白血病 | 长读长单细胞RNA测序,bulk DNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,DNA测序数据 | 6名获得BTK抑制剂治疗期间出现突变的CLL患者 | NA | 单细胞RNA测序,长读长测序 | MAS-seq | 长读长单细胞RNA测序技术 |
| 98 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of the human parasite Schistosoma mansoni first intra-molluscan stage reveals tentative tegumental and stem-cell regulators
2024-03-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-55790-3
PMID:38472267
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术研究曼氏血吸虫在螺蛳宿主内发育早期的细胞类型和分子调控机制 | 首次对曼氏血吸虫母胞蚴阶段进行单细胞转录组分析,识别了六个细胞簇并预测了关键转录因子 | 研究聚焦于早期发育阶段,对后续发育阶段的分子机制了解仍然有限 | 阐明曼氏血吸虫在中间宿主螺蛳体内发育的细胞和分子机制 | 曼氏血吸虫母胞蚴阶段的单细胞 | 单细胞生物学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 曼氏血吸虫母胞蚴单细胞悬液 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的10x Genomics Chromium平台 |
| 99 | 2025-10-07 |
Reciprocal regulation of SIRT1 and AMPK by Ginsenoside compound K impedes the conversion from plasma cells to mitigate for podocyte injury in MRL/lpr mice in a B cell-specific manner
2024-Mar, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2023.11.006
PMID:38465215
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研究论文 | 本研究揭示人参皂苷化合物K通过SIRT1和AMPK的相互调节机制,以B细胞特异性方式缓解狼疮肾炎小鼠的足细胞损伤 | 首次发现人参皂苷CK通过调节B细胞亚群中SIRT1和AMPK的协同作用,抑制浆细胞转化,从而减轻免疫复合物沉积 | 研究仅限于MRL/lpr小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探讨人参皂苷CK在狼疮肾炎中对B细胞亚群和足细胞保护的作用机制 | 雌性MRL/lpr狼疮易感小鼠 | 分子生物学 | 狼疮肾炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、代谢组学分析、免疫印迹、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、蛋白质数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-07 |
Tetrahedral DNA loaded siCCR2 restrains M1 macrophage polarization to ameliorate pulmonary fibrosis in chemoradiation-induced murine model
2024-Mar-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.01.022
PMID:38273656
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研究论文 | 本研究开发了一种新型小鼠肺纤维化模型,并验证了通过四面体DNA递送siCCR2抑制M1巨噬细胞极化治疗肺纤维化的新策略 | 整合博来霉素气管给药和胸部照射建立持续性肺泡炎介导的纤维化小鼠模型;首次揭示CCL2/CCR2轴驱动M1巨噬细胞极化的关键作用;开发了多粘性末端四面体框架核酸结合四联ccr2-siRNA的新型治疗平台 | 动物模型仍需进一步验证与人类IPF的相似性;治疗策略的长期安全性和有效性需要更多研究 | 探索肺纤维化发病机制并开发新型治疗策略 | 小鼠模型和人类IPF患者 | 分子生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,基因沉默技术 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,病理数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |