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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Deep-qGFP: A Generalist Deep Learning Assisted Pipeline for Accurate Quantification of Green Fluorescent Protein Labeled Biological Samples in Microreactors
2024-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301293
PMID:38010980
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研究论文 | 提出一种深度学习辅助的自动化流程Deep-qGFP,用于精确量化绿色荧光蛋白标记的微反应器 | 首个无需迁移学习或重新训练即可应用于多种数字PCR和单细胞测序平台的一体化图像分析算法 | NA | 开发自动化GFP标记生物样本的绝对定量方法 | GFP标记的微反应器(液滴式、微孔式、琼脂糖式) | 计算机视觉 | NA | 荧光显微镜成像 | 深度学习 | 图像 | 10张图像中的2000多个微反应器 | NA | 数字PCR, 单细胞测序 | NA | 液滴数字PCR, 微孔数字PCR, 琼脂糖数字PCR, 液滴单细胞测序 |
| 82 | 2025-10-06 |
CFTR expression in human salivary gland acinar cells
2024-03-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00549.2023
PMID:38284125
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研究论文 | 本研究通过免疫定位和单细胞RNA测序分析证实CFTR在人类唾液腺腺泡细胞中的表达 | 首次在人类唾液腺腺泡细胞中发现功能性CFTR表达,挑战了CFTR仅存在于导管细胞的传统模型 | 研究样本量有限,仅针对颌下腺和腮腺进行研究 | 探究CFTR在人类唾液腺组织中的表达模式和功能 | 人类颌下腺和腮腺组织 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 免疫定位,单细胞RNA测序,胶原酶消化,电生理记录 | NA | 基因表达数据,蛋白质定位数据,电生理数据 | 人类颌下腺和腮腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Oscillatory differentiation dynamics fundamentally restricts the resolution of pseudotime reconstruction algorithms
2024-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2023.0537
PMID:38503342
|
研究论文 | 本文从理论上证明细胞分化过程中的振荡动态对伪时间重建算法的分辨率存在固有约束 | 首次揭示振荡性分化动态对轨迹重建质量的内在限制,即使在理想无噪声数据条件下 | 理论研究,尚未进行实验验证 | 探讨细胞分化轨迹重建算法的理论限制 | 细胞分化过程和伪时间重建算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Adipose tissue macrophage dysfunction is associated with a breach of vascular integrity in NASH
2024-03, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.10.039
PMID:37977244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非酒精性脂肪肝病中脂肪组织巨噬细胞亚群的异质性及其与血管完整性破坏的关联 | 首次在人类内脏脂肪组织中描述了骨髓细胞景观,发现了非酒精性脂肪性肝炎特异性的巨噬细胞转录变化 | 样本量相对有限,机制研究仍需进一步验证 | 评估非酒精性脂肪肝病队列中脂肪组织巨噬细胞的异质性 | 瘦型和肥胖患者的内脏脂肪组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,免疫荧光 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 包含瘦型和肥胖患者的队列(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Single-cell assessment of primary and stem cell-derived human trophoblast organoids as placenta-modeling platforms
2024-03-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.023
PMID:38359834
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学评估源自原代滋养层细胞和滋养层干细胞的类器官作为胎盘建模平台的准确性 | 首次系统比较原代滋养层细胞和干细胞来源的滋养层类器官在重现体内发育轨迹方面的差异,发现干细胞来源类器官中存在体内几乎不存在的扩展祖细胞状态 | 发现当前滋养层类器官平台在细胞组成、分化和转录调控方面存在一定程度的不匹配 | 评估不同来源的滋养层类器官作为胎盘研究模型的准确性 | 人类滋养层干细胞和原代滋养层细胞来源的类器官 | 单细胞生物学 | 胎盘发育相关疾病 | 单细胞转录组学 | 类器官模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Construction of single-cell cross-species chromatin accessibility landscapes with combinatorial-hybridization-based ATAC-seq
2024-03-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.015
PMID:38330939
|
研究论文 | 开发了一种基于组合杂交的单细胞ATAC测序方法,构建了跨物种染色质可及性图谱 | 开发了名为CH-ATAC-seq的新型单细胞ATAC测序方法,首次实现了斑马鱼、果蝇和蚯蚓等非哺乳动物物种的单细胞染色质可及性图谱构建 | NA | 探索脊椎动物和无脊椎动物间保守的调控程序 | 斑马鱼、果蝇、蚯蚓、人类、猴子和小鼠的细胞 | 表观基因组学 | NA | 单细胞ATAC测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据 | 约80万个细胞类型特异性cCREs,152种主要细胞类型 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 组合杂交单细胞ATAC测序(CH-ATAC-seq) |
| 87 | 2025-10-06 |
Wnt dose escalation during the exit from pluripotency identifies tranilast as a regulator of cardiac mesoderm
2024-03-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.019
PMID:38354738
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研究论文 | 本研究通过Wnt信号剂量梯度实验结合单细胞RNA测序,发现曲尼司特可协同激活Wnt信号促进心脏谱系分化 | 建立整合实验数据集、预测模型和小分子数据库的工作流程,首次发现曲尼司特对心脏中胚层分化的调控作用 | 仅使用hiPSC和鹌鹑胚胎验证,尚未在更复杂的哺乳动物模型中进行测试 | 探索Wnt信号在干细胞分化过程中的分子调控机制 | 人诱导多能干细胞(hiPSC)和鹌鹑胚胎 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 多元回归模型, 体外分化分析, 体内胚胎分析 | 多元回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Protocol to study the inheritance and propagation of non-genetically encoded states using barcode decay lineage tracing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102809
PMID:38180835
|
研究论文 | 提出一种结合条形码衰减谱系追踪和单细胞转录组分析的实验方案 | 开发BdLT-Seq技术,能够在保持同源性的同时定向评估克隆演化,比较同源细胞谱系间的非遗传分子特征 | NA | 研究非遗传编码状态的遗传和传播机制 | 细胞谱系 | 单细胞分析 | NA | 条形码衰减谱系追踪,单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Protocol to analyze immune cells in the tumor microenvironment by transcriptome using machine learning
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102684
PMID:38219153
|
研究论文 | 提出一种基于机器学习的肿瘤微环境免疫细胞转录组分析方案 | 整合单细胞RNA测序与机器学习方法,系统分析肿瘤微环境中免疫细胞的表型变化、分化轨迹和浸润过程 | NA | 开发肿瘤微环境免疫细胞分析流程,识别潜在药物靶点 | 肿瘤微环境中的免疫细胞,特别是单核吞噬细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 批量RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals intratumoral heterogeneity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24048
PMID:38133212
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌肿瘤内异质性并建立预后模型 | 首次在单细胞水平系统解析肺腺癌肿瘤内异质性,发现B细胞显著招募现象,建立跨队列验证的预后模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索肺腺癌肿瘤内异质性及其临床意义 | 肺腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | TCGA-LUAD(n=503), GSE68465(n=442), GSE72094(n=398), GSE26939(n=115) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-05-08 |
Single-cell Transcriptome Analysis Identifies Senescent Osteocytes as Contributors to Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis
2024-Mar-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4047486/v1
PMID:38558984
|
research paper | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了衰老骨细胞在乳腺癌骨转移中促进骨破坏的作用 | 首次发现乳腺癌骨转移中的骨细胞会提前衰老并表现出独特的衰老相关分泌表型(SASP),促进骨破坏 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究乳腺癌骨转移中骨微环境重编程对骨细胞的影响 | 乳腺癌骨转移中的骨细胞 | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing, multiplex hybridization, AI-assisted analysis | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和乳腺癌骨转移患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-Mar-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2025-10-07 |
Spinster homolog 2 reduces malignancies of glioblastoma via PTEN/PI3K/AKT pathway
2024-03, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.2785
PMID:37728571
|
研究论文 | 本研究探讨SPNS2通过PTEN/PI3K/AKT通路抑制胶质母细胞瘤恶性进展的分子机制 | 首次揭示SPNS2在胶质母细胞瘤中的抑癌功能及其通过PTEN/PI3K/AKT通路调控肿瘤恶性进展和免疫浸润的新机制 | 未明确SPNS2调控PTEN/PI3K/AKT通路的具体分子机制,缺乏临床样本验证 | 探究SPNS2在胶质母细胞瘤中的生物学功能和分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系和体内移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞测序, 基因富集分析, 细胞功能实验, 体内移植瘤实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 利用TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-07 |
Genetic lineage tracing identifies adaptive mechanisms of pancreatic islet β cells in various mouse models of diabetes with distinct age of initiation
2024-03, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2372-y
PMID:37930473
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研究论文 | 通过遗传谱系追踪技术研究不同糖尿病模型中胰岛β细胞的适应性机制 | 首次在不同年龄启动的糖尿病模型中系统比较β细胞的命运转变机制,发现STZ和HFD模型中β细胞采用不同的再生策略 | 研究仅限于小鼠模型,人类糖尿病中的类似机制需要进一步验证 | 阐明在T1D和T2D发病过程中胰岛β细胞应对胰岛素短缺的适应性机制 | 糖尿病小鼠模型中的胰岛β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 遗传谱系追踪, 单细胞RNA测序 | Cre-LoxP系统 | 单细胞转录组数据 | 多种糖尿病小鼠模型(STZ诱导和HFD诱导) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-07 |
A Panoramic View of Cell Population Dynamics in Mammalian Aging
2024-Mar-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.01.583001
PMID:38496474
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研究论文 | 通过构建包含2000多万个细胞的小鼠单细胞转录组图谱,全面揭示哺乳动物衰老过程中的细胞群体动态变化 | 首次提供了跨器官、生命周期、性别和基因型的全景式细胞群体动态视图,识别了200多个与衰老相关的细胞群体变化 | 研究局限于小鼠模型,人类组织的验证仍需进一步研究 | 阐明哺乳动物全身衰老相关的细胞群体动态变化 | 小鼠多种器官组织在不同生命阶段、性别和基因型的细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 623个小鼠组织样本,超过2000万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-10-07 |
Exploring wound management in dental pulp: Utilizing single-cell RNA sequencing for global transcriptomic analysis in healthy and inflamed pulpal tissues
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14804
PMID:38385817
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析健康和炎症牙髓组织的转录组景观,探索牙髓伤口愈合的细胞和分子机制 | 首次在牙髓研究中应用单细胞RNA测序技术揭示龋齿条件下细胞组成变化和细胞间相互作用网络 | 样本量相对有限,仅包含50例患者样本 | 研究牙髓伤口愈合过程中信号级联、细胞反应和细胞外基质动力学的复杂相互作用 | 人类牙髓组织(健康和炎症状态) | 单细胞组学 | 牙髓疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 50例患者牙髓组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2025-10-07 |
Evaluating the role of wound-healing genes in conjunction with stool routine and serum tumor markers for colorectal cancer diagnosis and prognostic implications
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14768
PMID:38446012
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研究论文 | 本研究评估粪便常规检查联合血清肿瘤标志物检测在结直肠癌诊断中的临床应用价值 | 首次将伤口愈合基因(VEGFA、TP53、TGFA)与粪便常规和血清肿瘤标志物结合用于结直肠癌诊断和预后评估 | 样本量较小(仅56例患者),需要更大规模研究验证结果 | 探索结直肠癌的新型诊断和预后评估方法 | 结直肠癌患者和健康对照者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 临床数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 56例结直肠癌患者和56例健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-07 |
De novo antibody discovery in human blood from full-length single B cell transcriptomics and matching haplotyped-resolved germline assemblies
2024-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.26.586834
PMID:38585716
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组测序和单倍型解析的种系基因组组装,从人血液中发现了新的抗体 | 首次将单倍型解析的种系免疫球蛋白位点组装与单B细胞全长转录组测序相结合,能够完全解析母源和父源对种系V、D、J基因库的贡献 | 研究仅针对麻疹、腮腺炎和风疹疫苗接种后的B细胞反应,样本来源和免疫挑战类型有限 | 理解种系免疫球蛋白单倍型如何影响表达的抗体库 | 人类B细胞及其表达的抗体 | 免疫基因组学 | 传染病 | 单细胞全长转录组测序, 基因组测序, 单倍型组装 | NA | 基因组序列, 转录组序列 | 来自同一供体的B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-07 |
Clearance of VWF by hepatic macrophages is critical for the protective effect of ADAMTS13 in sickle cell anemia mice
2024-03-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021583
PMID:38142410
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研究论文 | 本研究揭示了肝巨噬细胞通过清除ADAMTS13切割的VWF在镰状细胞贫血中的保护作用机制 | 首次发现Clec4f+Marcohigh巨噬细胞亚群以去唾液酸化依赖方式清除VWF,并证明巨噬细胞介导的VWF清除对ADAMTS13保护效应至关重要 | 研究仅在镰状细胞贫血小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 阐明肝巨噬细胞在镰状细胞贫血病理机制中的作用及ADAMTS13的保护机制 | 镰状细胞贫血小鼠模型及其肝巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | 镰状细胞贫血小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-07 |
A revised conceptual framework for mouse vomeronasal pumping and stimulus sampling
2024-03-25, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.01.036
PMID:38320553
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研究论文 | 本研究通过多学科方法重新探讨小鼠犁鼻器刺激采样机制,提出修正的泵送概念框架 | 发现小鼠犁鼻器侧部主要由平滑肌组成,识别出两种具有不同特性和功能的平滑肌纤维亚型,揭示了新的刺激采样机制 | 研究主要聚焦于小鼠模型,结果向其他物种的普适性需要进一步验证 | 阐明犁鼻器的物理机械功能和刺激采样基本原理 | 小鼠犁鼻器组织 | 神经生物学 | NA | 单细胞转录组学、药理学分析、2D/3D断层扫描 | NA | 解剖学数据、组织学数据、生理学数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |