单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-05-11	Single-cell transcriptome analysis reveals intratumoral heterogeneity in lung adenocarcinoma 2024-Mar, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24048 PMID:38133212	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌的瘤内异质性	利用单细胞RNA测序技术深入分析肺腺癌的瘤内异质性，并开发了一个在多队列中表现良好的预后模型	研究依赖于公开数据集，可能无法涵盖所有临床情境	探索肺腺癌的瘤内异质性并开发预后模型	肺腺癌患者	数字病理	肺腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	预后模型	转录组数据	来自TCGA-LUAD (n=503)、GSE68465 (n=442)、GSE72094 (n=398)和GSE26939 (n=115)数据集的总计1458个样本
62	2025-05-08	Single-cell Transcriptome Analysis Identifies Senescent Osteocytes as Contributors to Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis 2024-Mar-14, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-4047486/v1 PMID:38558984	research paper	该研究通过单细胞转录组分析揭示了衰老骨细胞在乳腺癌骨转移中促进骨破坏的作用	首次发现乳腺癌骨转移中的骨细胞会提前衰老并表现出独特的衰老相关分泌表型(SASP)，促进骨破坏	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究乳腺癌骨转移中骨微环境重编程对骨细胞的影响	乳腺癌骨转移中的骨细胞	digital pathology	breast cancer	single-cell RNA sequencing, multiplex hybridization, AI-assisted analysis	NA	RNA-seq数据	小鼠模型和乳腺癌骨转移患者样本
63	2025-04-26	Spinster homolog 2 reduces malignancies of glioblastoma via PTEN/PI3K/AKT pathway 2024-03, IUBMB life IF:3.7Q2 DOI:10.1002/iub.2785 PMID:37728571	research paper	该研究探讨了Spinster homolog 2 (SPNS2)在胶质母细胞瘤(GBM)中的生物学功能和分子作用，发现SPNS2通过抑制PTEN/PI3K/AKT通路抑制GBM细胞的恶性进展、干细胞性和免疫浸润	首次揭示了SPNS2在GBM中的抑癌作用及其通过PTEN/PI3K/AKT通路的分子机制，并发现SPNS2与肿瘤免疫浸润的相关性	研究主要基于体外实验和生物信息学分析，需要更多体内实验验证	探究SPNS2在胶质母细胞瘤中的生物学功能和分子机制	胶质母细胞瘤细胞	肿瘤生物学	胶质母细胞瘤	RNA测序、单细胞测序、生物信息学分析	NA	基因表达数据、临床数据	TCGA和CGGA数据库中的胶质瘤样本
64	2025-04-24	Genetic lineage tracing identifies adaptive mechanisms of pancreatic islet β cells in various mouse models of diabetes with distinct age of initiation 2024-03, Science China. Life sciences DOI:10.1007/s11427-022-2372-y PMID:37930473	research paper	该研究通过遗传谱系追踪技术，探索了不同年龄启动的糖尿病小鼠模型中胰岛β细胞的适应性机制	首次在不同年龄启动的T1D和T2D小鼠模型中系统比较了β细胞的命运转变机制，并揭示了线粒体功能、染色质修饰等关键通路在β细胞动态转变中的作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	阐明糖尿病发病过程中胰岛β细胞的适应性机制	糖尿病小鼠模型的胰岛β细胞	分子生物学	糖尿病	遗传谱系追踪技术、scRNA-seq	Cre-LoxP系统	基因表达数据	多种糖尿病小鼠模型（HFD和STZ处理）
65	2025-04-23	A Panoramic View of Cell Population Dynamics in Mammalian Aging 2024-Mar-05, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.01.583001 PMID:38496474	research paper	该研究通过单细胞转录组图谱PanSci，分析了623个小鼠组织样本中的2000多万个细胞，揭示了哺乳动物衰老过程中细胞群体动态的全景视图	创建了一个全面的单细胞转录组图谱，识别了3000多个独特的细胞状态和200多个与衰老相关的细胞群体，揭示了细胞动态的时间结构和器官特异性变化	研究仅基于小鼠模型，可能不完全适用于人类衰老过程	阐明衰老过程中全身细胞群体动态的变化	小鼠组织样本中的细胞群体	生物信息学	衰老相关疾病	单细胞转录组测序	NA	单细胞RNA测序数据	623个小鼠组织样本，超过2000万个细胞
66	2025-04-20	Exploring wound management in dental pulp: Utilizing single-cell RNA sequencing for global transcriptomic analysis in healthy and inflamed pulpal tissues 2024-Mar, International wound journal IF:2.6Q1 DOI:10.1111/iwj.14804 PMID:38385817	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，探索了健康与炎症牙髓组织在伤口愈合过程中的转录组学变化	首次在牙髓伤口管理中应用单细胞RNA测序技术，揭示了炎症条件下细胞组成和基因表达的显著变化	样本量相对较小（50例患者），且仅关注了牙髓组织，未考虑其他口腔组织的影响	研究牙髓伤口愈合过程中信号级联、细胞反应和细胞外基质动态的复杂相互作用	健康与炎症状态的人类牙髓组织	数字病理	牙科疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	50例患者的牙髓组织样本
67	2025-04-20	Evaluating the role of wound-healing genes in conjunction with stool routine and serum tumor markers for colorectal cancer diagnosis and prognostic implications 2024-Mar, International wound journal IF:2.6Q1 DOI:10.1111/iwj.14768 PMID:38446012	研究论文	本研究探讨了伤口愈合基因与粪便常规和血清肿瘤标志物在结直肠癌诊断和预后中的联合应用价值	结合粪便常规和血清肿瘤标志物提高了结直肠癌的诊断准确性，并探索了伤口愈合基因在疾病进展中的潜在作用	样本量较小（56例结直肠癌患者和56例健康对照）	评估伤口愈合基因与粪便常规和血清肿瘤标志物在结直肠癌诊断和预后中的联合应用价值	结直肠癌患者和健康对照	数字病理学	结直肠癌	生物信息学分析、单细胞RNA测序	NA	临床信息、粪便样本、血清样本、RNA测序数据	56例结直肠癌患者和56例健康对照
68	2025-04-16	De novo antibody discovery in human blood from full-length single B cell transcriptomics and matching haplotyped-resolved germline assemblies 2024-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.26.586834 PMID:38585716	研究论文	该研究通过结合基因组测序和单细胞转录组测序，探索了人类B细胞中抗体多样性的形成机制	首次将单细胞转录组测序与匹配的单倍型解析的种系组装相结合，用于新抗体的发现	研究仅针对MMR疫苗接种后的B细胞，可能无法全面反映所有免疫挑战下的抗体多样性	理解种系IG单倍型如何影响表达的抗体库	人类B细胞及其表达的抗体	基因组学	麻疹	单细胞转录组测序, 基因组测序	NA	基因组数据, 转录组数据	来自同一供体的B细胞
69	2025-04-01	Gsα Regulates Macrophage Foam Cell Formation During Atherosclerosis 2024-Mar-29, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323156 PMID:38375634	研究论文	本研究探讨了Gsα在动脉粥样硬化过程中对巨噬细胞泡沫细胞形成的调控作用	揭示了Gsα通过激活cAMP反应元件结合蛋白的转录活性，增加CD36和SR-A1的表达，从而促进脂质摄取和泡沫细胞形成的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化仍需进一步验证	阐明Gsα在动脉粥样硬化发展中的具体作用机制	巨噬细胞和动脉粥样硬化斑块	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞测序、批量测序、免疫荧光、cAMP测量、骨髓移植、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测	巨噬细胞特异性Gsα敲除小鼠模型	基因表达数据、蛋白质活性数据、影像数据	小鼠模型和人类斑块巨噬细胞样本
70	2025-03-30	Clearance of VWF by hepatic macrophages is critical for the protective effect of ADAMTS13 in sickle cell anemia mice 2024-03-28, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2023021583 PMID:38142410	研究论文	本研究探讨了肝巨噬细胞在镰状细胞贫血（SCA）中的作用，特别是Clec4f+Marcohigh巨噬细胞亚群在清除ADAMTS13切割的VWF和镰状红细胞中的关键作用	首次揭示了Clec4f+Marcohigh巨噬细胞亚群通过去唾液酸化依赖的方式清除VWF，并证实了巨噬细胞介导的VWF清除对ADAMTS13保护效应的必要性	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类SCA患者中验证	阐明肝巨噬细胞在SCA病理机制中的作用及其与ADAMTS13保护效应的关系	镰状细胞贫血小鼠模型中的肝巨噬细胞	血液病学	镰状细胞贫血	单细胞RNA测序、空间转录组学、多重误差稳健荧光原位杂交	小鼠疾病模型	基因表达数据、空间分布数据	未明确说明样本数量，使用SCA小鼠模型
71	2025-03-27	A revised conceptual framework for mouse vomeronasal pumping and stimulus sampling 2024-03-25, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2024.01.036 PMID:38320553	research paper	本文重新审视了小鼠犁鼻器刺激采样的经典血管运动泵假说，并提出了一个修订的概念框架	发现了犁鼻器平滑肌组织的两个亚群，具有不同的结构和收缩特性，揭示了新的功能模式	研究仅针对小鼠犁鼻器，结果可能不适用于其他哺乳动物	探究犁鼻器的物理机械功能和刺激采样机制	小鼠犁鼻器	生理学	NA	解剖学、组织学、生理学方法、单细胞转录组学、药理学分析、2D/3D断层扫描	NA	解剖数据、生理数据、转录组数据、影像数据	NA
72	2025-03-23	Age-associated CD4+ T cells with B cell-promoting functions are regulated by ZEB2 in autoimmunity 2024-03-29, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk1643 PMID:38330141	研究论文	本文通过流式细胞术和批量RNA测序分析了354名自身免疫性疾病患者和健康对照的CD4 T细胞亚群，发现了一种随着年龄增长而扩增的CXCR3CD4效应记忆T细胞亚群，命名为'年龄相关T辅助细胞（TA细胞）'	发现了一种新的年龄相关T细胞亚群（TA细胞），并揭示了其在自身免疫性疾病中的作用及其调控机制	研究主要基于流式细胞术和RNA测序，未涉及功能验证实验	探讨年龄与自身免疫性疾病之间的关系	354名自身免疫性疾病患者和健康对照的CD4 T细胞亚群	免疫学	自身免疫性疾病	流式细胞术，批量RNA测序，单细胞RNA测序	NA	细胞数据，RNA测序数据	354名患者和健康对照
73	2025-03-22	Clonal differences underlie variable responses to sequential and prolonged treatment 2024-Mar-20, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.01.011 PMID:38401539	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和条形码技术追踪了癌症细胞在长期和连续治疗中的抗性克隆，揭示了克隆间基因表达状态的差异如何影响对后续治疗的反应	结合单细胞RNA测序和条形码技术，首次系统地追踪了抗性克隆在长期和连续治疗中的命运，并识别了预测克隆存活的基因表达状态	研究主要基于实验室环境下的细胞模型，未涉及体内肿瘤微环境的复杂性	探究癌症细胞克隆间基因表达差异如何影响对连续或长期治疗的反应，并寻找预测克隆存活的基因表达状态	癌症细胞及其抗性克隆	癌症生物学	癌症	单细胞RNA测序，条形码技术	NA	单细胞RNA测序数据	未明确说明具体样本数量，但涉及多个抗性克隆的追踪和分析
74	2025-03-21	Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotype and phenotype in chronic lymphocytic leukemia 2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.15.585298 PMID:38559060	研究论文	本研究利用长读长单细胞RNA测序技术，探讨了慢性淋巴细胞白血病（CLL）中癌症亚克隆的基因型和表型特征	采用MAS-seq长读长单细胞RNA测序技术，显著提高了转录本的覆盖范围，并扩展了可用于将细胞与癌症亚克隆关联的信息突变集	研究样本量较小，仅涉及六名CLL患者	研究CLL亚克隆中是否存在额外的驱动突变加速亚克隆扩展，以及突变亚克隆是否表现出与其他癌症亚克隆不同的转录组行为	慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者	数字病理学	慢性淋巴细胞白血病	长读长单细胞RNA测序（MAS-seq）	NA	RNA测序数据	六名CLL患者
75	2025-03-20	Ibudilast Protects Retinal Bipolar Cells from Excitotoxic Retinal Damage and Activates the mTOR Pathway 2024-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.18.585556 PMID:38562805	研究论文	本研究探讨了Ibudilast在保护视网膜双极细胞免受兴奋性毒性视网膜损伤中的作用，并激活了mTOR通路	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了Ibudilast在视网膜损伤中的神经保护机制，并发现其通过激活mTOR通路发挥作用	研究主要基于鸡的兴奋性毒性视网膜损伤模型，尚未在人体中进行验证	研究Ibudilast在保护视网膜神经元免受兴奋性毒性损伤中的作用及其机制	视网膜双极细胞和Müller胶质细胞	神经科学	视网膜疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	鸡的兴奋性毒性视网膜损伤模型
76	2025-03-13	Single-cell transcriptomics of the human parasite Schistosoma mansoni first intra-molluscan stage reveals tentative tegumental and stem-cell regulators 2024-03-12, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-55790-3 PMID:38472267	研究论文	本文通过单细胞转录组学技术研究了人类寄生虫曼氏血吸虫在软体动物宿主内的第一阶段发育，揭示了可能的表皮和干细胞调控因子	首次使用单细胞转录组学技术对曼氏血吸虫在软体动物宿主内的发育阶段进行详细分析，识别了六个细胞群及其关键生物过程	研究局限于曼氏血吸虫的特定发育阶段，未涵盖整个生命周期	探索曼氏血吸虫在软体动物宿主内发育阶段的细胞和分子机制	曼氏血吸虫的母孢子囊	单细胞转录组学	血吸虫病	10X Genomics Chromium平台	NA	单细胞RNA测序数据	曼氏血吸虫母孢子囊的单细胞悬浮液
77	2025-03-11	Reciprocal regulation of SIRT1 and AMPK by Ginsenoside compound K impedes the conversion from plasma cells to mitigate for podocyte injury in MRL/lpr mice in a B cell-specific manner 2024-Mar, Journal of ginseng research IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.jgr.2023.11.006 PMID:38465215	研究论文	本研究探讨了人参皂苷化合物K（CK）通过调节SIRT1和AMPK在MRL/lpr小鼠中抑制B细胞向浆细胞转化，从而减轻肾小球足细胞损伤的机制	揭示了CK通过激活B细胞特异性SIRT1和AMPK，阻碍肾B细胞向浆细胞转化，从而减轻系统性炎症和免疫复合物沉积的创新机制	研究仅限于MRL/lpr小鼠模型，未在人类患者中进行验证	探讨CK在狼疮性肾炎（LN）中通过调节B细胞亚群减轻肾小球足细胞损伤的机制	MRL/lpr小鼠	生物医学	狼疮性肾炎	单细胞RNA测序、流式细胞术、代谢组学分析、免疫印迹和免疫荧光检测	NA	RNA测序数据、代谢物数据、免疫印迹和免疫荧光图像	雌性MRL/lpr小鼠
78	2025-03-08	Tetrahedral DNA loaded siCCR2 restrains M1 macrophage polarization to ameliorate pulmonary fibrosis in chemoradiation-induced murine model 2024-Mar-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2024.01.022 PMID:38273656	研究论文	本文通过整合博来霉素气管内给药和胸部照射，构建了一种模拟特发性肺纤维化（IPF）临床特征的鼠模型，揭示了CCL2/CCR2轴在驱动M1巨噬细胞极化中的决定性作用，并开发了一种新型的FNA-siCCR2治疗策略	构建了一种新的IPF鼠模型，揭示了M1巨噬细胞在IPF中的关键作用，并开发了FNA-siCCR2作为潜在的治疗策略	研究主要基于鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	研究特发性肺纤维化（IPF）的发病机制及潜在治疗方法	鼠模型和IPF患者	数字病理学	肺纤维化	scRNA-seq	鼠模型	基因表达数据	鼠模型和IPF患者的scRNA-seq数据
79	2025-03-05	Single-cell transcriptome analysis upon ECM-remodeling meningioma cells 2024-Mar-16, Neurosurgical review IF:2.5Q1 DOI:10.1007/s10143-024-02349-5 PMID:38491247	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了ECM重塑脑膜瘤细胞的转录组特征和生物学特性	首次在单细胞水平上对ECM重塑脑膜瘤细胞进行了全面的转录组分析，揭示了其与细胞粘附和细胞外基质组织相关的基因表达特征	研究样本量未明确说明，可能限制了结果的普遍性	研究ECM重塑脑膜瘤细胞的转录组特征和生物学特性	脑膜瘤细胞	数字病理学	脑膜瘤	单细胞RNA测序（ScRNA-seq）	NA	RNA测序数据	未明确说明
80	2025-03-03	Synovial Tissue Insights into Heterogeneity of Rheumatoid Arthritis 2024-03, Current rheumatology reports IF:5.7Q1 DOI:10.1007/s11926-023-01129-2 PMID:38157158	综述	本文综述了类风湿性关节炎（RA）在滑膜组织中的异质性研究进展，包括单细胞RNA测序技术的应用和最新研究成果	通过单细胞RNA测序技术揭示了RA滑膜组织中与疾病相关的细胞群体，如外周辅助T细胞、自身免疫相关B细胞（ABCs）和NOTCH3+亚层成纤维细胞	NA	探讨类风湿性关节炎在滑膜组织中的细胞和分子异质性，以优化患者护理和治疗效果	类风湿性关节炎患者的滑膜组织	生物医学	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序、空间转录组学、机器学习	NA	RNA测序数据	NA