单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 534 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Protocol for inferring epithelial-to-mesenchymal transition trajectories from single-cell RNA sequencing data using R
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102819
PMID:38183653
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研究论文 | 介绍了一个名为COMET的R软件包，用于从单细胞RNA测序数据推断上皮-间质转化轨迹和状态间转换率 | 开发了首个专门用于推断EMT轨迹和计算状态间转换率的R软件包 | NA | 开发计算工具来研究上皮-间质转化过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 连续时间马尔可夫链 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Establishing a 3D culture system for early organogenesis of monkey embryos ex vivo and single-cell transcriptome analysis of cultured embryos
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102835
PMID:38224493
|
研究论文 | 建立食蟹猴胚胎体外3D培养系统并进行单细胞转录组分析 | 开发了能够在体外培养猴胚胎至受精后25天的3D培养系统，揭示了原肠胚形成和早期器官发生的关键发育事件 | NA | 建立灵长类胚胎体外培养平台以研究早期胚胎发育 | 食蟹猴胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫荧光分析，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Protocol for optimized dissociation of human scalp tissue for hair follicle transcriptomics by scRNA-seq
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102848
PMID:38319786
|
研究论文 | 本文介绍了一种优化的人头皮组织解离方案，用于通过单细胞RNA测序研究毛囊转录组学 | 开发了针对人类头皮组织的高质量单细胞悬液制备优化方案 | NA | 优化人类头皮组织解离方法以获得高质量单细胞悬液 | 人类头皮组织和毛囊 | 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
Protocol for functional profiling of patient-derived organoids for precision oncology
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102887
PMID:38367233
|
研究论文 | 本文提出了一套用于功能精准肿瘤学的患者来源类器官功能分析方案 | 开发了涵盖患者来源结直肠类器官生成培养、肿瘤浸润淋巴细胞扩增和外周血单核细胞分离培养的完整实验流程 | NA | 建立用于精准肿瘤治疗的功能分析实验方案 | 结直肠癌患者来源的类器官、肿瘤浸润淋巴细胞和外周血单核细胞 | 精准医学 | 结直肠癌 | RNA测序、全外显子组测序、单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveal neuron-astrocyte synergy in long-term memory
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07011-6
PMID:38326616
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学揭示了基底外侧杏仁核在长期记忆形成中神经元与星形胶质细胞的协同作用 | 首次结合单细胞RNA测序和单分子空间转录组学技术，在完整脑切片中绘制了长期记忆痕迹的空间图谱，发现特定神经元亚群与邻近星形胶质细胞的相互作用对长期记忆编码至关重要 | NA | 阐明基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子结构 | 小鼠基底外侧杏仁核的神经元和星形胶质细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
Recent advances in cancer-associated fibroblast: Biomarkers, signaling pathways, and therapeutic opportunities
2024-Mar-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003031
PMID:38420743
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综述 | 本文总结了癌症相关成纤维细胞(CAFs)的研究进展，重点关注其表型和功能异质性、特定信号通路及靶向治疗策略 | 系统梳理了CAFs的异质性特征及其在肿瘤微环境中的多重功能，并总结了靶向CAFs的临床试验现状 | CAFs在肿瘤微环境中的复杂性尚未完全阐明，现有靶向CAFs的临床试验结果大多不理想 | 探讨癌症相关成纤维细胞在肿瘤发生发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 基因工程小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
MSX1+PDGFRAlow limb mesenchyme-like cells as an efficient stem cell source for human cartilage regeneration
2024-03-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.001
PMID:38428414
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了具有显著骨软骨再生能力的MSX1间充质祖细胞，并开发了从人多能干细胞生成MSX1+PDGFRAlow肢体间充质样细胞的方法 | 首次发现MSX1间充质祖细胞中PDGFRA亚群具有最强的骨软骨再生能力，并成功从人多能干细胞生成功能相似的肢体间充质样细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞在人体内的长期安全性和有效性仍需验证 | 寻找用于人类软骨再生的高效干细胞来源 | MSX1间充质祖细胞及其PDGFRA亚群，人多能干细胞衍生的肢体间充质样细胞 | 再生医学 | 骨关节疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Activated mesenchymal stem/stromal cells promote myeloid cell differentiation via CCL2/CCR2 signaling
2024-03-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.002
PMID:38428413
|
研究论文 | 本研究揭示了间充质干细胞通过CCL2/CCR2信号通路促进髓系细胞分化的机制 | 首次发现PDGFRαSca-1阳性MSCs在LPS刺激下分泌CCL2，并通过该信号通路调控髓系细胞分化命运 | 主要基于小鼠模型研究，人类骨髓细胞的验证数据相对有限 | 探究间充质干细胞对造血干细胞/祖细胞分化的影响机制 | 小鼠间充质干细胞、造血干细胞/祖细胞、人类骨髓细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
ER stress and lipid imbalance drive diabetic embryonic cardiomyopathy in an organoid model of human heart development
2024-03-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.01.003
PMID:38335962
|
研究论文 | 利用人类心脏类器官模型研究糖尿病胚胎心肌病的发病机制 | 首次使用先进的人类心脏类器官系统模拟胚胎心脏发育过程，揭示内质网应激和脂质代谢失衡在糖尿病胚胎心肌病中的关键作用 | 基于类器官模型的研究结果仍需在真实人类胚胎组织中验证 | 探究糖尿病对胚胎心脏发育的影响机制 | 人类心脏类器官 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序, 脂质组学, 成像技术 | 类器官模型 | 基因表达数据, 脂质组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Gsα Regulates Macrophage Foam Cell Formation During Atherosclerosis
2024-Mar-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323156
PMID:38375634
|
研究论文 | 本研究揭示了Gsα在动脉粥样硬化中通过调控巨噬细胞泡沫细胞形成的作用机制 | 首次发现Gsα在动脉粥样硬化斑块巨噬细胞中表达上调，并阐明了其通过cAMP-CREB信号通路促进CD36和SR-A1表达，从而增强脂质摄取和泡沫细胞形成的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步开展 | 探究Gsα在动脉粥样硬化发生发展中的具体作用机制 | 巨噬细胞、小鼠动脉粥样硬化模型、人类动脉粥样硬化斑块样本 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫荧光、cAMP检测、骨髓移植、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测 | 巨噬细胞特异性Gsα敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞功能数据 | 小鼠模型和人类斑块样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
A transcription factor atlas of stem cell fate in planarians
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113843
PMID:38401119
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统绘制了涡虫干细胞命运选择的转录因子图谱 | 首次系统性地绘制了完整成年生物体中大多数细胞类型的干细胞命运及其相关转录因子表达特征图谱 | NA | 揭示涡虫干细胞命运选择的调控机制 | 地中海涡虫(Schmidtea mediterranea)的干细胞(neoblasts)及其有丝分裂后子代细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
CD38-RyR2 axis-mediated signaling impedes CD8+ T cell response to anti-PD1 therapy in cancer
2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315989121
PMID:38451948
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研究论文 | 本研究揭示了CD38-RyR2信号轴通过调控钙离子水平和AKT活性导致CD8+ T细胞终末耗竭，从而阻碍抗PD1疗法效果的分子机制 | 首次发现CD38通过激活RyR2钙通道升高细胞内钙水平，诱导慢性AKT活化并抑制TCF1表达，从而驱动CD8+ T细胞终末耗竭的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类临床试验中验证 | 探究CD8+ T细胞对抗PD1疗法产生抵抗的分子机制 | CD8+ T细胞，特别是肿瘤内和体外慢性刺激的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
JAK/STAT3 represents a therapeutic target for colorectal cancer patients with stromal-rich tumors
2024-Mar-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02958-4
PMID:38424636
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研究论文 | 本研究探讨JAK/STAT3信号通路在结直肠癌中的治疗潜力，特别是在富含基质的肿瘤中 | 首次系统评估JAK抑制剂在不同结直肠癌模型中的疗效，并通过空间转录组学揭示JAK/STAT3信号异常与肿瘤微环境的空间依赖性基因表达关系 | 研究主要基于临床前模型和回顾性队列，需要前瞻性临床试验验证 | 评估JAK/STAT3抑制在结直肠癌中的治疗效果并确定其预后价值 | 结直肠癌细胞系、小鼠模型类器官、患者来源类器官和三个独立CRC患者队列 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学染色、突变分析、bulk RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据、空间转录组数据 | 三个独立CRC患者队列（包括TransSCOT临床试验队列） | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | NanoString GeoMx空间转录组学平台 |
| 74 | 2025-10-06 |
Deep-qGFP: A Generalist Deep Learning Assisted Pipeline for Accurate Quantification of Green Fluorescent Protein Labeled Biological Samples in Microreactors
2024-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301293
PMID:38010980
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研究论文 | 提出一种深度学习辅助的自动化流程Deep-qGFP，用于精确量化绿色荧光蛋白标记的微反应器 | 首个无需迁移学习或重新训练即可应用于多种数字PCR和单细胞测序平台的一体化图像分析算法 | NA | 开发自动化GFP标记生物样本的绝对定量方法 | GFP标记的微反应器（液滴式、微孔式、琼脂糖式） | 计算机视觉 | NA | 荧光显微镜成像 | 深度学习 | 图像 | 10张图像中的2000多个微反应器 | NA | 数字PCR, 单细胞测序 | NA | 液滴数字PCR, 微孔数字PCR, 琼脂糖数字PCR, 液滴单细胞测序 |
| 75 | 2025-10-06 |
CFTR expression in human salivary gland acinar cells
2024-03-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00549.2023
PMID:38284125
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研究论文 | 本研究通过免疫定位和单细胞RNA测序分析证实CFTR在人类唾液腺腺泡细胞中的表达 | 首次在人类唾液腺腺泡细胞中发现功能性CFTR表达，挑战了CFTR仅存在于导管细胞的传统模型 | 研究样本量有限，仅针对颌下腺和腮腺进行研究 | 探究CFTR在人类唾液腺组织中的表达模式和功能 | 人类颌下腺和腮腺组织 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 免疫定位，单细胞RNA测序，胶原酶消化，电生理记录 | NA | 基因表达数据，蛋白质定位数据，电生理数据 | 人类颌下腺和腮腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
Oscillatory differentiation dynamics fundamentally restricts the resolution of pseudotime reconstruction algorithms
2024-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2023.0537
PMID:38503342
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研究论文 | 本文从理论上证明细胞分化过程中的振荡动态对伪时间重建算法的分辨率存在固有约束 | 首次揭示振荡性分化动态对轨迹重建质量的内在限制，即使在理想无噪声数据条件下 | 理论研究，尚未进行实验验证 | 探讨细胞分化轨迹重建算法的理论限制 | 细胞分化过程和伪时间重建算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
Adipose tissue macrophage dysfunction is associated with a breach of vascular integrity in NASH
2024-03, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.10.039
PMID:37977244
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非酒精性脂肪肝病中脂肪组织巨噬细胞亚群的异质性及其与血管完整性破坏的关联 | 首次在人类内脏脂肪组织中描述了骨髓细胞景观，发现了非酒精性脂肪性肝炎特异性的巨噬细胞转录变化 | 样本量相对有限，机制研究仍需进一步验证 | 评估非酒精性脂肪肝病队列中脂肪组织巨噬细胞的异质性 | 瘦型和肥胖患者的内脏脂肪组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，免疫荧光 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 包含瘦型和肥胖患者的队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Single-cell assessment of primary and stem cell-derived human trophoblast organoids as placenta-modeling platforms
2024-03-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.023
PMID:38359834
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研究论文 | 通过单细胞转录组学评估源自原代滋养层细胞和滋养层干细胞的类器官作为胎盘建模平台的准确性 | 首次系统比较原代滋养层细胞和干细胞来源的滋养层类器官在重现体内发育轨迹方面的差异，发现干细胞来源类器官中存在体内几乎不存在的扩展祖细胞状态 | 发现当前滋养层类器官平台在细胞组成、分化和转录调控方面存在一定程度的不匹配 | 评估不同来源的滋养层类器官作为胎盘研究模型的准确性 | 人类滋养层干细胞和原代滋养层细胞来源的类器官 | 单细胞生物学 | 胎盘发育相关疾病 | 单细胞转录组学 | 类器官模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Construction of single-cell cross-species chromatin accessibility landscapes with combinatorial-hybridization-based ATAC-seq
2024-03-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.015
PMID:38330939
|
研究论文 | 开发了一种基于组合杂交的单细胞ATAC测序方法，构建了跨物种染色质可及性图谱 | 开发了名为CH-ATAC-seq的新型单细胞ATAC测序方法，首次实现了斑马鱼、果蝇和蚯蚓等非哺乳动物物种的单细胞染色质可及性图谱构建 | NA | 探索脊椎动物和无脊椎动物间保守的调控程序 | 斑马鱼、果蝇、蚯蚓、人类、猴子和小鼠的细胞 | 表观基因组学 | NA | 单细胞ATAC测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据 | 约80万个细胞类型特异性cCREs，152种主要细胞类型 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 组合杂交单细胞ATAC测序(CH-ATAC-seq) |
| 80 | 2025-10-06 |
Wnt dose escalation during the exit from pluripotency identifies tranilast as a regulator of cardiac mesoderm
2024-03-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.019
PMID:38354738
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研究论文 | 本研究通过Wnt信号剂量梯度实验结合单细胞RNA测序，发现曲尼司特可协同激活Wnt信号促进心脏谱系分化 | 建立整合实验数据集、预测模型和小分子数据库的工作流程，首次发现曲尼司特对心脏中胚层分化的调控作用 | 仅使用hiPSC和鹌鹑胚胎验证，尚未在更复杂的哺乳动物模型中进行测试 | 探索Wnt信号在干细胞分化过程中的分子调控机制 | 人诱导多能干细胞(hiPSC)和鹌鹑胚胎 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 多元回归模型, 体外分化分析, 体内胚胎分析 | 多元回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |