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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Poor clinical outcomes and immunoevasive contexture in CD161+CD8+ T cells barren human pancreatic cancer
2024-03-26, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008694
PMID:38531664
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研究论文 | 本研究探讨了CD161+CD8+ T细胞在胰腺导管腺癌中的预后价值和分子特征 | 首次系统评估CD161+CD8+ T细胞在PDAC中的临床意义,发现其与生存期和治疗反应的相关性,并鉴定其为具有细胞毒性和免疫检查点分子特征的特殊T细胞亚型 | 需要进一步研究验证其在风险分层和治疗策略优化中的作用 | 阐明CD161+CD8+ T细胞在胰腺导管腺癌中的预后价值和分子特征 | 186例经根治性切除的胰腺导管腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、临床数据、分子数据 | 186例PDAC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
Maximum Likelihood Inference of Time-scaled Cell Lineage Trees with Mixed-type Missing Data
2024-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.05.583638
PMID:38496496
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研究论文 | 提出一种用于动态谱系追踪数据的最大似然推断方法,能够从CRISPR诱导的突变中准确推断细胞谱系树 | 开发了概率混合型缺失(PMM)模型和LAML算法,专门处理CRISPR谱系追踪数据的三个独特特征:基因组位置的单次编辑、突变率随时间衰减、高比例的可遗传和非可遗传缺失数据 | 在存在可遗传缺失数据的情况下需要采用块坐标上升方法,计算效率可能受限 | 解决动态谱系追踪中的细胞谱系树推断问题 | 细胞谱系树、CRISPR诱导的突变数据 | 计算生物学 | 肺腺癌 | CRISPR基因组编辑、单细胞测序 | 概率混合型缺失(PMM)模型、期望最大化(EM)算法 | 基因突变数据、基因表达数据 | 小鼠肺腺癌模型数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Molecular assessment of intratumoral immune cell subsets and potential mechanisms of resistance to odronextamab, a CD20×CD3 bispecific antibody, in patients with relapsed/refractory B-cell non-Hodgkin lymphoma
2024-03-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008338
PMID:38519055
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研究论文 | 评估肿瘤内免疫细胞亚群特征及odronextamab耐药机制的研究 | 首次系统分析CD20×CD3双特异性抗体odronextamab在B细胞非霍奇金淋巴瘤中的分子作用机制和耐药性 | 样本量有限,主要基于观察性数据 | 探索odronextamab在复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的生物标志物和耐药机制 | 复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者 | 肿瘤免疫学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 免疫组织化学,流式细胞术,单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | 分子生物学数据,临床数据 | ELM-1研究中的患者队列 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
Mefloquine enhances the efficacy of anti-PD-1 immunotherapy via IFN-γ-STAT1-IRF1-LPCAT3-induced ferroptosis in tumors
2024-03-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008554
PMID:38471712
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研究论文 | 本研究揭示甲氟喹通过IFN-γ-STAT1-IRF1-LPCAT3信号通路诱导铁死亡,增强抗PD-1免疫疗法对黑色素瘤和肺癌的疗效 | 首次发现甲氟喹通过激活IFN-γ-STAT1-IRF1信号通路上调LPCAT3表达诱导铁死亡,并证实LPCAT3表达与抗PD-1免疫疗法疗效正相关 | 研究主要聚焦于黑色素瘤和肺癌,未涉及其他肿瘤类型;机制研究主要在细胞和动物模型中进行 | 探究甲氟喹增强抗PD-1免疫疗法疗效的分子机制 | 黑色素瘤和肺癌细胞系及动物模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤,肺癌 | RNA测序,实时定量PCR,蛋白质印迹,染色质免疫沉淀,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞测序数据 | 细胞系实验和动物模型,包含临床患者转录组和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Endocrine islet β-cell subtypes with differential function are derived from biochemically distinct embryonic endocrine islet progenitors that are regulated by maternal nutrients
2024-Mar-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946483/v1
PMID:38496675
|
研究论文 | 本研究通过细胞谱系追踪和单细胞分析揭示了胚胎内分泌胰岛前体细胞如何产生功能不同的β细胞亚型 | 首次发现胚胎胰岛前体细胞具有不同的基因表达和DNA甲基化特征,这些特征决定了成年后β细胞的功能差异和稳定性 | 研究主要在小鼠模型中进行,人类样本验证相对有限 | 探索胰岛β细胞异质性形成机制及其与糖尿病发生的关系 | 小鼠胚胎胰岛前体细胞和成年β细胞,以及人类胰岛细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 组合细胞谱系追踪,单细胞RNA测序,DNA甲基化分析 | NA | 单细胞转录组数据,DNA甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Improved therapeutic consistency and efficacy of CD317+ MSCs through stabilizing TSG6 by PTX3
2024-03-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03706-3
PMID:38539221
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CD317+ MSC亚群具有增强的免疫抑制活性,其比例与MSC治疗效果一致性密切相关 | 首次揭示CD317+ MSC亚群通过PTX3稳定TSG6蛋白的机制改善治疗一致性 | 未明确PTX3稳定TSG6的具体分子机制 | 研究MSC异质性和治疗不一致性的原因及解决方案 | 人间充质干细胞(MSCs)及其CD317+亚群 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同批次培养基扩增的MSCs | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
Short cell cycle duration is a phenotype of human epidermal stem cells
2024-03-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03670-y
PMID:38475896
|
研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单细胞RNA测序发现人类表皮干细胞具有较短的细胞周期持续时间 | 挑战了干细胞分裂缓慢的传统观点,发现表皮干细胞比更分化的祖细胞具有更短的细胞周期 | 研究仅限于体外培养的人类角质形成细胞,未涉及体内环境验证 | 探究人类表皮干细胞的细胞周期特征和增殖行为 | 人类角质形成细胞,包括干细胞和祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 活细胞成像,单细胞RNA测序 | NA | 图像数据,基因表达数据 | 原代培养的人类角质形成细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Temporal Single-Cell Sequencing Analysis Reveals That GPNMB-Expressing Macrophages Potentiate Muscle Regeneration
2024-Mar-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4108866/v1
PMID:38585871
|
研究论文 | 本研究通过时序单细胞测序分析揭示了表达GPNMB的巨噬细胞在促进肌肉再生中的关键作用 | 首次通过时序单细胞RNA测序识别了表达GPNMB的独特巨噬细胞亚群,并证明其在肌肉再生中的直接功能作用 | 巨噬细胞表型多样性和特化亚群向消退期巨噬细胞转化的机制仍需进一步研究 | 探究巨噬细胞在骨骼肌修复过程中的表型多样性和功能作用 | 骨骼肌损伤模型中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肌肉损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同时间点的骨骼肌单个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Toolkit for mapping the clonal landscape of tumor-infiltrating B cells
2024-03, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2024.101864
PMID:38301345
|
综述 | 本文概述了用于绘制肿瘤浸润B细胞克隆景观的工具包,包括现有技术总结及其在B细胞研究中的应用 | 首次系统整合单细胞多组学、B细胞特异性鉴定和B细胞受体深度分析技术,提出综合研究肿瘤微环境中B细胞克隆功能的新范式 | 主要基于现有技术综述,缺乏原始实验数据验证 | 提升对肿瘤微环境中B细胞行为的理解和管理能力 | 肿瘤浸润B细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学、基因组学、蛋白质组学、B细胞受体谱分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
Glutamine antagonist DRP-104 suppresses tumor growth and enhances response to checkpoint blockade in KEAP1 mutant lung cancer
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9859
PMID:38536921
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研究论文 | 本研究探讨谷氨酰胺拮抗剂DRP-104在KEAP1突变肺癌中抑制肿瘤生长并增强免疫检查点阻断疗效的作用机制 | 首次揭示DRP-104通过抑制谷氨酰胺依赖性核苷酸合成和促进抗肿瘤T细胞反应的双重机制治疗KEAP1突变肺癌 | 研究基于临床前动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对KEAP1突变肺癌的靶向治疗方法 | KEAP1突变肺癌的临床前模型 | 癌症代谢与免疫治疗 | 肺癌 | 多模态单细胞测序,离体功能实验 | NA | 单细胞测序数据,功能实验数据 | 患者来源异种移植模型和抗原性原位肺癌模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
Spatially resolved single-cell atlas of ascidian endostyle provides insight into the origin of vertebrate pharyngeal organs
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi9035
PMID:38552007
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研究论文 | 本研究通过构建海鞘内柱的空间分辨单细胞图谱,探索脊椎动物咽部器官的进化起源 | 首次构建海鞘内柱的空间分辨单细胞图谱,发现血淋巴区域的混合祖先结构及与脊椎动物毛细胞相似的细胞群 | 研究主要基于海鞘模型,在脊椎动物中的直接证据仍需进一步验证 | 探究脊椎动物咽部器官的进化起源 | 海鞘内柱(咽部器官) | 空间转录组学 | NA | Stereo-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
Multiple parallel cell lineages in the developing mammalian cerebral cortex
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn9998
PMID:38536915
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和条形码谱系追踪技术揭示了哺乳动物大脑皮层发育中存在的多平行细胞谱系 | 发现了多个顶端放射状胶质细胞类别启动平行谱系,这些平行谱系在脑回和脑沟中重复存在且在雪貂和人类中保守 | 研究未涉及小鼠模型中的类似机制,限制了跨物种比较的全面性 | 探究具有扩展生发区和折叠皮层的物种中皮质神经发生的细胞谱系机制 | 雪貂和人类大脑皮层生发区的祖细胞和神经元 | 发育生物学 | 大脑皮质畸形 | 单细胞RNA测序, 条形码谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 谱系追踪数据 | 雪貂和人类大脑皮层生发区单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
Gastrulation-stage gene expression in Nipbl+/- mouse embryos foreshadows the development of syndromic birth defects
2024-03-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4239
PMID:38507484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Nipbl+/-小鼠胚胎原肠胚期的基因表达变化,揭示了Cornelia de Lange综合征出生缺陷的早期发育机制 | 首次在原肠胚期和早期心新月阶段发现Nipbl缺陷导致的胚层细胞比例异常和基因表达失调,建立了Nipbl缺陷与谱系分配错误之间的联系 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;样本数量未明确说明 | 探究Nipbl单倍体不足如何导致胚胎发育异常和出生缺陷 | 野生型和Nipbl+/-小鼠胚胎 | 发育生物学 | Cornelia de Lange综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-06 |
Kidins220 and Aiolos promote thymic iNKT cell development by reducing TCR signals
2024-03-15, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj2802
PMID:38489359
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研究论文 | 本研究揭示了支架蛋白Kidins220通过调控TCR信号强度在iNKT细胞发育中的双重作用机制 | 首次发现Kidins220在iNKT细胞发育不同阶段对TCR信号具有双向调控作用,并鉴定出转录因子Aiolos是其下游效应因子 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类细胞中验证;具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究Kidins220在iNKT细胞发育过程中的功能及其调控TCR信号的分子机制 | 小鼠胸腺iNKT细胞和常规T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 基因敲除技术 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | T细胞特异性Kidins220敲除小鼠和Aiolos敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
Single-cell nanobiopsy enables multigenerational longitudinal transcriptomics of cancer cells
2024-03-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl0515
PMID:38446884
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研究论文 | 本研究开发了一种基于扫描离子电导显微镜的单细胞纳米活检平台,能够对单个癌细胞及其后代进行多代纵向转录组分析 | 首次实现了从单个活细胞及其后代进行多代纵向细胞质采样和转录组分析,突破了传统单细胞RNA测序需要细胞裂解的局限 | 目前仅在体外胶质母细胞瘤细胞中进行了概念验证,尚未在体内或临床样本中应用 | 开发能够追踪单个癌细胞动态转录组变化的技术平台 | 胶质母细胞瘤(GBM)脑肿瘤细胞 | 单细胞分析技术 | 脑癌 | 扫描离子电导显微镜(SICM), 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 体外培养的胶质母细胞瘤细胞,观察时间超过72小时 | NA | 单细胞RNA-seq, 纵向采样技术 | 纳米活检平台 | 基于扫描离子电导显微镜(SICM)的纳米活检平台,支持外源分子注射和多代纵向细胞质采样 |
| 56 | 2025-10-06 |
Human surface ectoderm and amniotic ectoderm are sequentially specified according to cellular density
2024-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh7748
PMID:38427729
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研究论文 | 本研究开发了人类多能干细胞模型,揭示了羊膜外胚层和表面外胚层根据细胞密度顺序分化的机制 | 首次提出人类羊膜外胚层和表面外胚层沿着共同的非神经外胚层轨迹基于细胞密度进行分化的新机制 | 研究基于体外干细胞模型,可能与体内实际发育过程存在差异 | 研究人类羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制 | 人类多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
Protocol to dissect and dissociate the mouse brainstem for single-cell RNA-seq applications
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102908
PMID:38461411
|
研究论文 | 提出一种用于小鼠脑干单细胞RNA测序的解剖、解离和冷冻保存实验方案 | 针对小脑干结构开发了允许异步样本收集和下游处理的实验流程 | 仅在新生小鼠和特定脑区进行验证,尚未在其他脑区广泛测试 | 开发适用于小脑结构单细胞RNA测序的样本制备方法 | 新生小鼠脑干组织,特别是preBötzinger复合体 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 新生小鼠脑干样本 | NA | 单细胞RNA-seq | SmartSeq3 | SmartSeq3 cDNA文库制备 |
| 58 | 2025-10-06 |
Protocol for acquiring high-quality fresh mouse lung spatial transcriptomics data
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102825
PMID:38280199
|
研究论文 | 本文提出了一种获取高质量新鲜小鼠肺组织空间转录组数据的实验方案 | 针对肺组织肺泡空腔导致切片困难的问题,开发了专门的肺灌注和冷冻切片方法 | NA | 建立高质量小鼠肺组织空间转录组数据的获取方法 | 小鼠肺组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
An optimized protocol for isolation of murine pancreatic single cells with high yield and purity
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102836
PMID:38219150
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研究论文 | 介绍一种从小鼠胰腺快速分离高质量单细胞的优化方案 | 通过优化解剖顺序、酶组成和操作流程,显著减少消化酶对胰腺外分泌细胞的损伤 | NA | 开发高效的小鼠胰腺单细胞分离方法 | 小鼠胰腺组织 | 单细胞技术 | NA | 单细胞分离技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
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研究论文 | 开发了一种用于人和小鼠脂肪组织单核RNA测序的流程,整合流式细胞术进行质量控制 | 结合流式细胞术进行质量控制、计数和精确核池分配,可直接加载到10x Chromium控制器 | NA | 解决脂肪组织单细胞RNA测序中脂肪细胞大小、易碎性和商业试剂盒成本高的问题 | 人和小鼠的脂肪组织 | 单细胞测序 | NA | 单核RNA测序, 流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单核RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium控制器 |