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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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501 | 2024-08-07 |
Integration of human organoids single-cell transcriptomic profiles and human genetics repurposes critical cell type-specific drug targets for severe COVID-19
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13558
PMID:37807299
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研究论文 | 本文构建了一个计算框架,整合了人类类器官单细胞转录组数据、全基因组关联研究统计数据、表达数量性状位点以及基因-药物相互作用数据,以识别与COVID-19严重性相关的关键细胞群体和药物靶点 | 本文创新性地利用人类类器官单细胞转录组数据和遗传学数据,重新定位了针对COVID-19的细胞类型特异性药物靶点 | NA | 识别与COVID-19严重性相关的细胞类型特异性药物靶点,以促进开发有效的治疗方法 | 人类类器官中的39种细胞类型及其与COVID-19严重性的关联 | 基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算框架 | 转录组数据 | 八种类器官中的39种细胞类型 |
502 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing gene signatures for classifying and scoring exhausted CD8+ T cells in B-cell acute lymphoblastic leukaemia
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13583
PMID:38030593
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
503 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals peripheral blood leukocyte responses to spinal cord injury in mice with humanised immune systems
2024-Mar-01, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03048-0
PMID:38429643
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研究论文 | 本研究利用人源化免疫系统的小鼠模型和单细胞RNA测序技术,探讨了人免疫细胞在脊髓损伤后的反应和变化 | 首次在人源化小鼠模型中使用单细胞RNA测序技术研究脊髓损伤后免疫细胞的反应和变化 | 研究仅限于特定的人源化小鼠模型,可能不完全代表人类脊髓损伤后的免疫反应 | 深入研究脊髓损伤后免疫抑制综合征(SCI-IDS)以及人白细胞在损伤部位的迁移和变化 | 人源化NSG-SGM3小鼠脊髓损伤后的免疫细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 11种人免疫细胞(亚)类型或状态 |
504 | 2024-08-07 |
Traditional Chinese Medicine Shi-Bi-Man ameliorates psoriasis via inhibiting IL-23/Th17 axis and CXCL16-mediated endothelial activation
2024-Mar-01, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-024-00907-z
PMID:38429819
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研究论文 | 研究中药石壁曼通过抑制IL-23/Th17轴和CXCL16介导的内皮细胞活化来改善银屑病的作用机制 | 首次探讨了石壁曼通过抑制IL-23/Th17细胞轴和CXCL16表达来减轻银屑病样皮肤炎症的作用 | 研究仅在动物模型中进行,需要进一步的人体临床试验验证 | 寻找银屑病的新治疗策略并探究其作用机制 | 石壁曼对银屑病样皮肤炎症的影响及其分子机制 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 反转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR) | NA | 细胞 | 使用咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型 |
505 | 2024-08-05 |
Development of a novel head and neck squamous cell carcinoma prognostic signature by bulk/single-cell sequencing data integration
2024-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.14443
PMID:36398480
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研究论文 | 本研究旨在为头颈鳞状细胞癌(HNSCC)开发一种新的预后标志物 | 通过整合单细胞和大规模转录组数据,识别与不良预后相关的特定癌细胞亚群,并开发了一种包含六个基因的新预后标志物 | 独立验证仅在我们的患者队列中进行,可能需要更广泛的样本验证 | 识别与癌症不良预后相关的细胞亚群并开发预后签名 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的特定癌细胞亚群 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | NA |
506 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics dissects premalignant progression in proliferative verrucous leukoplakia
2024-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.14347
PMID:35950708
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组技术剖析了增生性疣状白斑(PVL)的前恶性进展 | 首次描绘了PVL的细胞景观,发现了两个新的细胞亚型(INSR+内皮细胞和ASPN+成纤维细胞)在微环境重塑中的关键作用 | 研究仅基于三个活检样本,可能无法全面代表PVL进展的所有特征 | 旨在勾勒PVL进展过程中的分子特征变化及关键细胞亚型 | 研究对象为三份来自大面积PVL病变的活检样本 | 数字病理学 | 前恶性病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自一个大PVL病变的三个活检样本,共27,611个细胞 |
507 | 2024-08-07 |
Microglia-endothelial cross-talk regulates diabetes-induced retinal vascular dysfunction through remodeling inflammatory microenvironment
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109145
PMID:38414848
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病视网膜病变中微胶质细胞和内皮细胞的转录组特征,并探讨了它们之间的相互作用及其在炎症反应和血管发育中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了糖尿病视网膜病变中微胶质细胞和内皮细胞的亚群及其相互作用,特别是在CSF1和CSF1R信号通路中的作用 | NA | 阐明糖尿病诱导的视网膜血管功能障碍中微胶质细胞和内皮细胞之间的相互作用及其在炎症微环境重塑中的作用 | 微胶质细胞和内皮细胞在糖尿病视网膜病变中的相互作用及其分子机制 | NA | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
508 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Transcriptomics Revealed HCMV IE2-Related Microglia Responses in Alzheimer's-Like Disease in Transgenic Mice
2024-Mar, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03553-y
PMID:37700217
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研究论文 | 本文研究了人类巨细胞病毒IE2蛋白如何促进小胶质细胞激活,从而导致类似阿尔茨海默病的疾病。 | 建立了IE2转基因小鼠模型,揭示HCMV IE2对小胶质细胞的激活作用及其与阿尔茨海默病的关系 | 研究主要集中在转基因小鼠模型,可能未能全面反映人类AD的复杂性 | 探讨HCMV IE2蛋白与阿尔茨海默病之间的关系及其机制 | 转基因小鼠,特别是表达IE2蛋白的小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 基因表达数据 | IE2转基因小鼠的脑组织样本 |
509 | 2024-08-07 |
Deciphering Oligodendrocyte Lineages in the Human Fetal Central Nervous System Using Single-Cell RNA Sequencing
2024-Mar, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03661-9
PMID:37775719
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了人类胎儿中枢神经系统中三个区域(纹状体、脑干和脊髓)的少突胶质细胞发育过程 | 发现了多个少突胶质细胞前体细胞(OPCs)的谱系,并描绘了这三个中枢神经系统区域中少突胶质细胞分化的不同发育轨迹 | NA | 揭示人类胎儿中枢神经系统中少突胶质细胞谱系的分子异质性 | 人类胎儿中枢神经系统中的少突胶质细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从妊娠第8周到第12周的人类胎儿中枢神经系统样本 |
510 | 2024-08-04 |
Unveiling the oncogenic role of CLDN11-secreting fibroblasts in gastric cancer peritoneal metastasis through single-cell sequencing and experimental approaches
2024-Mar-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111647
PMID:38335659
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研究论文 | 本研究探讨了纤维母细胞在胃癌腹膜转移中的作用 | 揭示了CXCR7阳性纤维母细胞通过CLDN11在胃癌腹膜转移中的致癌角色 | 本研究主要基于公用数据库数据,可能存在样本偏倚 | 研究胃癌腹膜转移中纤维母细胞的作用 | 研究了来自腹膜转移和胃癌组织的纤维母细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 从腹膜转移和胃癌组织提取的多个样本 |
511 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing highlights epithelial and microenvironmental heterogeneity in malignant progression of pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Mar-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216607
PMID:38246225
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研究论文 | 本文揭示了胰腺导管腺癌进展中上皮和微环境的异质性 | 采用单细胞RNA测序技术,识别了不同类型的细胞,并揭示了与癌症发展相关的新的细胞通路和预后标志物 | 样本数量有限,仅基于五个病例,可能不完全代表所有患者的情况 | 探索从良性胰腺内乳头状粘液瘤(IPMN)到侵袭性胰腺导管腺癌(PDAC)进展中的细胞异质性 | 研究了来自三例高等级IPMN和两例IPMN衍生PDAC的35,693个单细胞的转录组数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 来自五个手术切除病例的35,693个细胞 |
512 | 2024-08-04 |
Empagliflozin attenuates inflammation levels in autoimmune myocarditis through the STAT3 pathway and macrophage phenotype transformation
2024-Mar, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.02.006
PMID:38354482
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研究论文 | 本研究探讨了SGLT-2抑制剂empagliflozin在自身免疫性心肌炎中的抗炎作用及其分子机制 | 发现empagliflozin通过STAT3通路和巨噬细胞表型转化降低自身免疫性心肌炎的炎症水平 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能无法完全反映人类的临床情况 | 探索empagliflozin在自身免疫性心肌炎中的抗炎机制 | 实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型及体外巨噬细胞实验 | 数字病理学 | 自身免疫性心肌炎 | HE染色、Sirius红染色、Masson染色、西方印迹、ELISA、免疫荧光染色、逆转录PCR | NA | 基因组空间事件数据集、单细胞测序结果 | 未具体说明样本数量,但使用了小鼠模型和体外细胞实验 |
513 | 2024-08-04 |
High-throughput omics technologies in inflammatory bowel disease
2024-Mar-01, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2024.117828
PMID:38355001
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综述 | 该文章综述了高通量组学技术在炎症性肠病中的应用和进展 | 文章强调了高通量技术在炎症性肠病研究中的重要性和最新进展 | 需要更标准化的方法和大规模数据集处理以实现个体化医学的目标 | 阐明高通量技术在炎症性肠病病理机制研究中的应用 | 高通量技术在炎症性肠病的基因组学、转录组学、蛋白组学和代谢组学等领域的应用 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 高通量组学技术 | NA | 大数据 | NA |
514 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Coronary Heterogeneity and Identifies CD133+TRPV4high Endothelial Subpopulation in Regulating Flow-Induced Vascular Tone in Mice
2024-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319516
PMID:38269590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了冠状动脉内皮细胞的异质性并确定了CD133+TRPV4high内皮亚群在调节流动诱导的血管张力中的作用 | 该研究发现了冠状动脉内皮细胞的异质性,并首次识别了CD133+TRPV4high内皮亚群在调节冠状动脉血流中的重要性 | 本研究仅在小鼠模型中进行,可能无法完全适用于人类冠状动脉内皮细胞的研究 | 研究冠状动脉内皮细胞的异质性及其对血流的反应 | 研究对象为小鼠冠状动脉内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 31,962个细胞 |
515 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals transdifferentiation of parathyroid chief cells into oxyphil cells in patients with uremic secondary hyperparathyroidism
2024-Mar, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.11.027
PMID:38142040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中甲状旁腺主细胞向嗜酸细胞转分化的现象 | 首次建立了人类甲状旁腺的转录组图谱,并发现了与尿毒症环境相关的线粒体逐渐富集的主细胞向嗜酸细胞转分化的机制 | NA | 探究尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中嗜酸细胞的起源及其转分化机制 | 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者的甲状旁腺结节 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三名尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者的甲状旁腺混合结节 |
516 | 2024-08-07 |
Advanced insights on tumor-associated macrophages revealed by single-cell RNA sequencing: The intratumor heterogeneity, functional phenotypes, and cellular interactions
2024-Mar-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216610
PMID:38244910
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示肿瘤相关巨噬细胞的肿瘤内异质性、功能表型和细胞相互作用方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术深入分析肿瘤相关巨噬细胞的异质性和功能表型,为优化新型治疗策略提供依据 | NA | 深入理解肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的作用 | 肿瘤相关巨噬细胞的表型和功能变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
517 | 2024-08-07 |
scRNA-seq of colorectal cancer shows regional immune atlas with the function of CD20+ B cells
2024-Mar-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216664
PMID:38253219
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研究论文 | 本研究通过分析来自结直肠癌(CRC)和配对正常组织的39,484个单细胞转录数据,揭示了CRC不同区域的免疫特征,特别是B细胞的功能。 | 发现了CRC不同区域的免疫细胞浸润显著不同,特别是CD20 B细胞与患者预后的关联,以及它们在肿瘤杀伤活性中的作用。 | NA | 旨在表征结直肠癌不同区域的免疫景观,并寻找潜在的治疗靶点。 | 结直肠癌(CRC)及其配对正常组织。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 转录数据 | 39,484个单细胞转录数据来自19个CRC样本和配对正常组织 |
518 | 2024-08-07 |
Cinchophen induces RPA1 related DNA damage and apoptosis to impair ENS development of zebrafish
2024-Mar-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116032
PMID:38306819
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研究论文 | 研究探讨了非甾体抗炎药辛可芬对斑马鱼肠道神经系统发育的影响及其分子机制 | 首次证实辛可芬通过诱导RPA1相关的DNA损伤和细胞凋亡,损害斑马鱼的肠道神经系统发育 | NA | 探究辛可芬对斑马鱼肠道神经系统发育的影响及其分子机制 | 斑马鱼的肠道神经系统 | 数字病理学 | 先天性神经嵴病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
519 | 2024-08-07 |
2-bromoacetamide exposure impairs oocyte maturation in mice and humans primarily via disrupting the cytoskeleton
2024-Mar-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116105
PMID:38364760
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研究论文 | 研究探讨了2-溴乙酰胺(BAcAm)对小鼠和人类卵母细胞成熟的影响,发现BAcAm通过破坏细胞骨架主要干扰卵母细胞成熟 | 首次全面展示了BAcAm对卵母细胞成熟的毒性影响 | 研究主要基于体外培养系统,可能与体内环境存在差异 | 探究BAcAm对哺乳动物卵母细胞质量的毒性效应 | 小鼠和人类的卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠卵母细胞中识别了605个差异表达基因,其中366个上调,239个下调 |
520 | 2024-08-07 |
Advancing parathyroid anatomy understanding through single-cell RNA sequencing in uremic secondary hyperparathyroidism
2024-Mar, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.12.005
PMID:38388141
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症中甲状旁腺的细胞动态变化 | 利用单细胞RNA测序揭示了主细胞和高嗜酸细胞的分化过程,挑战了传统观点 | NA | 通过单细胞RNA测序技术深入理解甲状旁腺的解剖结构 | 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症中的甲状旁腺细胞 | 数字病理学 | 尿毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |