单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 535 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of Drosophila trachea reveals glycosylation-mediated Notch signaling in cell fate specification
2024-Mar-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46455-w
PMID:38448482
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了果蝇气管系统的细胞图谱，揭示了糖基化介导的Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 首次提供了果蝇气管系统的全面单细胞转录组图谱，并发现了糖基化对Notch信号在细胞命运决定中的响应 | NA | 探究果蝇气管系统的管状形态发生程序 | 果蝇气管系统的细胞类型和Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 9种主要亚型的气管细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 482 | 2024-08-07 |
MSCsDB: a database of single-cell transcriptomic profiles and in-depth comprehensive analyses of human mesenchymal stem cells
2024-Mar-06, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00496-5
PMID:38449024
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研究论文 | 介绍了一个名为MSCsDB的数据库，该数据库整合了人类间充质干细胞的单细胞转录组数据，并提供深度综合分析 | MSCsDB数据库提供了一个一站式交互查询平台，支持调控子活动、基因本体富集、特征基因可视化和转录因子调控子分析，并开发了专门模块评估MSC质量 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术深入研究间充质干细胞的异质性，并提供一个系统分析已发表数据集的平台 | 人类间充质干细胞的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括来自26个受试者的5个组织中的470,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 483 | 2024-08-07 |
Ezrin's role in gastric cancer progression: Implications for immune microenvironment modulation and therapeutic potential
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27155
PMID:38449647
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组技术分析胃癌细胞系MKN-45和HGC-27之间的差异表达蛋白，筛选出ezrin作为目标蛋白，并探讨了ezrin表达水平与免疫微环境和基因组变化之间的关系。 | 首次探讨了ezrin在胃癌中的免疫调节作用及其与基因组不稳定性的关系，并预测了ezrin与免疫治疗和化疗敏感性的关联。 | 研究主要基于细胞系和数据库分析，未来需要更多临床样本验证ezrin在胃癌中的作用。 | 阐明ezrin在胃癌中的预后、免疫学和治疗价值。 | 胃癌细胞系MKN-45和HGC-27，以及TCGA和GEO数据库中的患者信息。 | 数字病理学 | 胃癌 | 蛋白质组技术 | NA | 蛋白质数据 | 涉及胃癌细胞系和数据库中的患者信息 | NA | NA | NA | NA |
| 484 | 2024-08-07 |
Bulk anda single-cell transcriptome profiling reveals the molecular characteristics of T cell-mediated tumor killing in pancreatic cancer
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27216
PMID:38449660
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞转录组分析，揭示了胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子特征 | 开发了TRGscore评分系统，有效预测胰腺癌患者对化疗或免疫治疗的反应及总体生存率 | NA | 探索胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子机制，并识别可能从免疫检查点阻断治疗中获益的患者亚群 | 胰腺癌患者的T细胞介导的肿瘤杀伤机制 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及胰腺癌患者的样本，分为两个亚群进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 485 | 2024-08-07 |
Loss of chromosome Y in regulatory T cells
2024-Mar-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10168-7
PMID:38443832
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研究论文 | 研究探讨了染色体Y在调节性T细胞中的缺失情况及其对T淋巴细胞分化的影响 | 首次发现调节性T细胞中染色体Y的缺失显著增加，并影响淋巴细胞分化 | 研究样本量有限，需要进一步的大规模研究验证 | 探究染色体Y在特定CD4+ T淋巴细胞亚群中的缺失情况及其对疾病风险的影响 | 调节性T细胞及其他T淋巴细胞亚群 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 23个PBMC样本和32个CD4+ T淋巴细胞富集样本 | NA | NA | NA | NA |
| 486 | 2024-08-07 |
Targeted knockdown of PGAM5 in synovial macrophages efficiently alleviates osteoarthritis
2024-Mar-04, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00318-8
PMID:38433252
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研究论文 | 本研究探讨了磷酸甘油酸变位酶5（PGAM5）在滑膜巨噬细胞中的作用及其对骨关节炎（OA）的影响 | 首次发现PGAM5在OA滑膜巨噬细胞中的显著增加，并通过条件性敲除PGAM5减轻OA症状，促进软骨细胞的合成代谢 | NA | 研究PGAM5在滑膜巨噬细胞中的作用，探索其作为治疗骨关节炎的新策略 | 骨关节炎（OA）中的滑膜巨噬细胞和软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类样本的组织学分析和鼠模型的单细胞RNA测序结果 | NA | NA | NA | NA |
| 487 | 2024-08-04 |
Detecting horizontal gene transfer with metagenomics co-barcoding sequencing
2024-Mar-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03602-23
PMID:38315121
|
研究论文 | 本文开发了一种新的元基因组共条形码测序系统，以检测水平基因转移 (HGT) | 引入了元基因组共条形码测序（MECOS），实现了长DNA片段提取和综合生物信息学管道 | 传统方法如短读长程元基因组测序和单细胞测序存在片段短、输入DNA量大、测序成本高等限制 | 旨在揭示微生物群落中水平基因转移的机制 | 研究对象为人类和小鼠的肠道微生物群落 | 数字病理学 | NA | 元基因组共条形码测序 | NA | DNA序列 | 超过3000个HGT块，涉及约6000个基因和100个分类组 | NA | NA | NA | NA |
| 488 | 2024-08-07 |
Identification and validation of RNA-binding protein SLC3A2 regulates melanocyte ferroptosis in vitiligo by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2024-Mar-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10147-y
PMID:38438962
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别并验证了RNA结合蛋白SLC3A2调控黑色素细胞铁死亡在白癜风中的作用。 | 首次确定了与白癜风相关的RNA结合蛋白基因及其潜在的发病机制，特别是在黑色素细胞中SLC3A2的下调促进铁死亡的作用。 | 研究主要集中在细胞实验层面，未来需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 揭示白癜风的发病机制，特别是RNA结合蛋白在其中的作用。 | 白癜风患者的不同细胞亚群及其RNA结合蛋白基因。 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 14种不同细胞类型，28种细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 489 | 2024-08-04 |
Domain generalization enables general cancer cell annotation in single-cell and spatial transcriptomics
2024-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46413-6
PMID:38431724
|
研究论文 | 该文章介绍了一种基于领域泛化的深度学习算法Cancer-Finder，能够快速识别恶性细胞 | 提出了一种新的算法Cancer-Finder，具有95.16%的准确率并能跨多个数据集进行恶性细胞标注 | 目前研究未提及该算法在其他类型癌症样本上的表现 | 研究旨在提高单细胞和空间转录组数据中恶性细胞的注释准确性 | 研究对象为清晰细胞肾细胞癌的空间转录组样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序和空间转录组测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | 5个清晰细胞肾细胞癌的空间转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 490 | 2024-08-04 |
Exercise potentially prevents colorectal cancer liver metastases by suppressing tumor epithelial cell stemness via RPS4X downregulation
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26604
PMID:38439884
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研究论文 | 本研究探讨了运动通过下调RPS4X抑制结直肠癌肝转移的机制 | 研究首次揭示了运动通过调节RPS4X表达来抑制结直肠癌的干性和转移风险 | 该研究主要依赖于生物信息学分析和实验验证，临床数据的验证尚未充分 | 研究运动对结直肠癌肝转移的影响及其机制 | 重点研究结直肠癌的上皮细胞及其干性标志物 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序分析、肿瘤微阵列、细胞/动物实验 | NA | 基因表达数据 | 19331个样本，涉及多种癌症数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 491 | 2024-08-07 |
CD169+ classical monocyte as an important participant in Graves' ophthalmopathy through CXCL12-CXCR4 axis
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109213
PMID:38439953
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序和多平台分析，探讨了CD169经典单核细胞在Graves眼病中的作用及其通过CXCL12-CXCR4轴的机制 | 首次揭示了CD169经典单核细胞在Graves眼病中的临床意义及其分化为CD169巨噬细胞促进炎症、脂肪生成和纤维化的作用 | 需要进一步研究针对循环中单核细胞和CXCL12-CXCR4轴的治疗策略 | 探究Graves眼病的病理机制及其潜在的治疗靶点 | Graves病和Graves眼病患者 | NA | Graves眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括Graves病和Graves眼病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 492 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling implicates the psychological stress-induced disruption of spermatogenesis
2024-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102158
PMID:38439912
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了心理压力对大鼠精子发生的影响，揭示了心理压力导致的细胞和分子层面的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了心理压力对精子发生的细胞和分子机制的影响 | 研究仅限于大鼠模型，未来需要进一步在其他物种中验证这些发现 | 揭示心理压力如何通过细胞和分子机制影响精子发生 | 心理压力对大鼠精子发生的影响 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,744个睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 493 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals epithelial cells driving brain metastasis in lung adenocarcinoma
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109258
PMID:38433899
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌脑转移的上皮细胞角色 | 发现了一种与脑转移相关的上皮细胞群体，这些细胞在脑转移中发挥重要作用 | 缺乏直接证据证明脑转移病灶与淋巴结转移病灶之间的关联 | 阐明肺腺癌脑转移的细胞起源及其驱动因素 | 主要研究肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本中的细胞组成 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 涉及的样本包括初级肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本 | NA | NA | NA | NA |
| 494 | 2024-08-04 |
Targeting ERBB2 and PIK3R1 as a therapeutic strategy for dilated cardiomyopathy: A single-cell sequencing and mendelian randomization analysis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e25572
PMID:38434379
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研究论文 | 这篇文章探讨了靶向ERBB2和PIK3R1作为扩张型心肌病的治疗策略。 | 文章创新地结合了单细胞测序和孟德尔随机化分析来识别药物可治疗的基因。 | 文章未能找到ERBB2的药物激动剂，并且对PIK3R1和心力衰竭的因果关系的探讨有限。 | 本研究旨在识别并验证扩张型心肌病中药物可治疗的基因，并分析其与心力衰竭的因果关系。 | 研究对象是扩张型心肌病中与心力衰竭相关的基因。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 四个微阵列表达谱数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 495 | 2024-08-07 |
Bioinformatics analysis of MMP14+ myeloid cells affecting endothelial-mesenchymal transformation and immune microenvironment in glioma
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26859
PMID:38434278
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了MMP14+髓系细胞在胶质瘤中影响内皮间质转化和免疫微环境的作用 | 识别MMP14为独立的预后标志物，并发现其通过CCL信号通路介导免疫抑制，为胶质瘤治疗提供了新的策略 | NA | 探讨MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的作用及其对治疗策略的影响 | MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的功能及其对内皮间质转化和免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 收集了六个批量RNA数据集和一个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 496 | 2024-08-04 |
The detection of Gper1 as an important gene promoting jawbone regeneration in the context of estrogen deficiency
2024-03, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2023.116990
PMID:38141748
|
研究论文 | 本研究揭示了Gper1在雌激素缺乏背景下促进下颌骨再生的重要性 | 探讨了Gper1如何通过cAMP/PKA/pCREB信号通路促进下颌骨再生 | 研究主要基于动物模型，临床应用的相关性尚需进一步验证 | 研究雌激素缺乏条件下维持骨再生的机制 | 分析接受拔牙手术的女性患者及雌激素缺乏的大鼠模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、定量PCR、免疫组织化学等 | NA | 临床病例数据及动物实验数据 | 1102名女性患者及雌激素缺乏的大鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 497 | 2024-08-04 |
Understanding Mechanisms of Response to CAR T-cell Therapy through Single-Cell Sequencing: Insights and Challenges
2024-Mar-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0212
PMID:38324393
|
研究论文 | 本文章讨论了单细胞RNA测序在理解CAR T细胞疗法分子特征中的应用及其面临的挑战 | 采用单细胞RNA测序技术，揭示了与临床结果相关的CAR T细胞的分子特征 | 在解释这种复杂数据类型时存在挑战 | 旨在理解CAR T细胞疗法的反应机制 | 研究重点是CAR T细胞的分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 498 | 2024-08-07 |
NLRP3 Inhibition Leads to Impaired Mucosal Fibroblast Function in Patients with Inflammatory Bowel Diseases
2024-Mar-01, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjad164
PMID:37748021
|
研究论文 | 研究NLRP3炎症小体在炎症性肠病（IBD）中黏膜炎症和纤维化形成中的作用及其抑制效果 | 首次详细研究了NLRP3炎症小体在IBD患者中黏膜炎症和纤维化过程中的表达和功能，并探讨了NLRP3抑制剂对肠道纤维细胞增殖和胶原蛋白产生的影响 | 研究主要集中在NLRP3炎症小体的抑制作用上，未涉及其他可能的炎症途径或治疗方法 | 探讨NLRP3炎症小体在炎症性肠病中的作用及其抑制剂的治疗潜力 | 炎症性肠病患者的黏膜免疫细胞和纤维细胞 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序和微阵列分析 | NA | RNA | 来自炎症性肠病患者的肠道黏膜免疫细胞和纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 499 | 2024-08-07 |
Dissecting the immune discrepancies in mouse liver allograft tolerance and heart/kidney allograft rejection
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13555
PMID:37748771
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研究论文 | 本文构建了小鼠肝、心和肾同种异体移植模型，并利用单细胞RNA测序技术分析了66,393个细胞，以描述器官移植早期阶段的细胞组成和免疫细胞相互作用，同时通过批量RNA测序分析了移植后第7天至第60天的转录组动态变化。 | 首次详细描述了小鼠肝移植耐受与心/肾移植排斥反应中细胞组成和免疫细胞相互作用的差异，并揭示了Kupffer细胞和巨噬细胞在耐受诱导中的协同功能。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 深入理解实体器官移植中的耐受和排斥机制。 | 小鼠肝、心和肾同种异体移植模型中的细胞组成和免疫细胞相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列 | 66,393个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2024-08-07 |
Integration of human organoids single-cell transcriptomic profiles and human genetics repurposes critical cell type-specific drug targets for severe COVID-19
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13558
PMID:37807299
|
研究论文 | 本文构建了一个计算框架，整合了人类类器官单细胞转录组数据、全基因组关联研究统计数据、表达数量性状位点以及基因-药物相互作用数据，以识别与COVID-19严重性相关的关键细胞群体和药物靶点 | 本文创新性地利用人类类器官单细胞转录组数据和遗传学数据，重新定位了针对COVID-19的细胞类型特异性药物靶点 | NA | 识别与COVID-19严重性相关的细胞类型特异性药物靶点，以促进开发有效的治疗方法 | 人类类器官中的39种细胞类型及其与COVID-19严重性的关联 | 基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 计算框架 | 转录组数据 | 八种类器官中的39种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |