单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
481	2024-08-04	Targeting ERBB2 and PIK3R1 as a therapeutic strategy for dilated cardiomyopathy: A single-cell sequencing and mendelian randomization analysis 2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e25572 PMID:38434379	研究论文	这篇文章探讨了靶向ERBB2和PIK3R1作为扩张型心肌病的治疗策略。	文章创新地结合了单细胞测序和孟德尔随机化分析来识别药物可治疗的基因。	文章未能找到ERBB2的药物激动剂，并且对PIK3R1和心力衰竭的因果关系的探讨有限。	本研究旨在识别并验证扩张型心肌病中药物可治疗的基因，并分析其与心力衰竭的因果关系。	研究对象是扩张型心肌病中与心力衰竭相关的基因。	数字病理学	心血管疾病	单细胞测序	NA	基因表达数据	四个微阵列表达谱数据集
482	2024-08-07	Bioinformatics analysis of MMP14+ myeloid cells affecting endothelial-mesenchymal transformation and immune microenvironment in glioma 2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26859 PMID:38434278	研究论文	本研究通过生物信息学分析探讨了MMP14+髓系细胞在胶质瘤中影响内皮间质转化和免疫微环境的作用	识别MMP14为独立的预后标志物，并发现其通过CCL信号通路介导免疫抑制，为胶质瘤治疗提供了新的策略	NA	探讨MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的作用及其对治疗策略的影响	MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的功能及其对内皮间质转化和免疫微环境的影响	数字病理学	脑瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	收集了六个批量RNA数据集和一个单细胞RNA测序数据集
483	2024-08-04	Shotgun lipidomics of human subretinal fluids under rod-dominant retina reveals cone-dominated lipids 2024-Mar, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2024.109807 PMID:38278468	研究论文	本研究利用质谱技术分析视网膜脱离患者的次视网膜液体脂质组成	首次揭示在杆细胞主导的视网膜下，锥细胞主导的脂质在次视网膜液体中的存在	样本量仅限于两位患者，可能影响结果的普遍性	探究次视网膜液体中脂质的组成及其潜在生理意义	研究了来自两位视网膜脱离患者的次视网膜液体样本	数字病理学	视网膜疾病	质谱法	NA	生物分子数据	2个样本来自2位患者
484	2024-08-04	The detection of Gper1 as an important gene promoting jawbone regeneration in the context of estrogen deficiency 2024-03, Bone IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.bone.2023.116990 PMID:38141748	研究论文	本研究揭示了Gper1在雌激素缺乏背景下促进下颌骨再生的重要性	探讨了Gper1如何通过cAMP/PKA/pCREB信号通路促进下颌骨再生	研究主要基于动物模型，临床应用的相关性尚需进一步验证	研究雌激素缺乏条件下维持骨再生的机制	分析接受拔牙手术的女性患者及雌激素缺乏的大鼠模型	数字病理学	NA	单细胞测序、定量PCR、免疫组织化学等	NA	临床病例数据及动物实验数据	1102名女性患者及雌激素缺乏的大鼠模型
485	2024-08-07	Genetic lineage tracing identifies adaptive mechanisms of pancreatic islet β cells in various mouse models of diabetes with distinct age of initiation 2024-Mar, Science China. Life sciences DOI:10.1007/s11427-022-2372-y PMID:37930473	research paper	本研究利用Cre-LoxP系统在不同年龄诱导的糖尿病小鼠模型中，通过单细胞RNA测序探索胰腺β细胞的命运转变及其分子机制	首次揭示了在不同糖尿病模型中，胰腺β细胞通过去分化、转分化和自我复制等机制适应性再生，并明确了关键的分子途径	研究仅限于小鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现	探究胰腺β细胞在不同糖尿病模型中的适应性机制及其分子基础	胰腺β细胞在不同糖尿病小鼠模型中的命运转变	digital pathology	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多个糖尿病小鼠模型中的胰腺β细胞
486	2024-08-07	Allosteric inhibitor of SHP2 enhances macrophage endocytosis and bacteria elimination by increasing caveolae activation and protects against bacterial sepsis 2024-Mar, Pharmacological research IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.phrs.2024.107096 PMID:38320736	研究论文	本文研究了SHP2别构抑制剂通过增强巨噬细胞的胞吞作用和细菌清除能力，从而保护机体免受细菌性脓毒症的影响	发现SHP2别构抑制剂能有效维持巨噬细胞中Cav-1的磷酸化，增强其胞吞作用和细菌清除能力	NA	探讨SHP2别构抑制剂在细菌性脓毒症中的治疗潜力	巨噬细胞的胞吞作用和细菌清除能力	NA	细菌性脓毒症	单细胞RNA测序和批量RNA测序	NA	RNA	NA
487	2024-08-04	Single-cell and spatial transcriptomics reveals that PTPRG activates the m6A methyltransferase VIRMA to block mitophagy-mediated neuronal death in Alzheimer's disease 2024-Mar, Pharmacological research IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.phrs.2024.107098 PMID:38325728	研究论文	本研究揭示了PTPRG通过激活m6A甲基转移酶VIRMA来阻止阿尔茨海默病中的线粒体自噬介导的神经元死亡	首次展示PTPRG在阿尔茨海默病进展中的作用，并揭示其通过VIRMA和PRKN相互作用影响神经元存活的机制	样本主要集中于特定的大脑区域，可能无法全面代表阿尔茨海默病的复杂病理	阐明阿尔茨海默病中神经元死亡的机制，以帮助开发有效的治疗方法	85个阿尔茨海默病样本和83个对照样本的单细胞RNA测序数据	数字病理	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序, 时空转录组学	5×FAD小鼠模型	基因表达数据	85个阿尔茨海默病样本和83个对照样本，以及6只App AD小鼠和6只对照C57Bl/6 J小鼠的空间转录组数据
488	2024-08-04	Understanding Mechanisms of Response to CAR T-cell Therapy through Single-Cell Sequencing: Insights and Challenges 2024-Mar-01, Blood cancer discovery IF:11.5Q1 DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0212 PMID:38324393	研究论文	本文章讨论了单细胞RNA测序在理解CAR T细胞疗法分子特征中的应用及其面临的挑战	采用单细胞RNA测序技术，揭示了与临床结果相关的CAR T细胞的分子特征	在解释这种复杂数据类型时存在挑战	旨在理解CAR T细胞疗法的反应机制	研究重点是CAR T细胞的分子特征	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NA
489	2024-08-04	Mutual Regulation of Transcriptomes between Murine Pneumocytes and Fibroblasts Mediates Alveolar Regeneration in Air-Liquid Interface Cultures 2024-Mar, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2023-0078OC PMID:38051640	研究论文	该文章分析了肺成纤维细胞与肺上皮细胞在再生过程中的相互作用	通过单细胞转录组学揭示了成纤维细胞与肺泡上皮细胞之间的调节循环	本研究的局限性未在摘要中详细说明	阐明成纤维细胞和肺上皮细胞在再生过程中的相互作用	研究了小鼠肺泡 II 型细胞和成纤维细胞的相互作用	数字病理学	慢性肺病	单细胞转录组学	NA	NA	NA
490	2024-08-07	NLRP3 Inhibition Leads to Impaired Mucosal Fibroblast Function in Patients with Inflammatory Bowel Diseases 2024-Mar-01, Journal of Crohn's & colitis DOI:10.1093/ecco-jcc/jjad164 PMID:37748021	研究论文	研究NLRP3炎症小体在炎症性肠病（IBD）中黏膜炎症和纤维化形成中的作用及其抑制效果	首次详细研究了NLRP3炎症小体在IBD患者中黏膜炎症和纤维化过程中的表达和功能，并探讨了NLRP3抑制剂对肠道纤维细胞增殖和胶原蛋白产生的影响	研究主要集中在NLRP3炎症小体的抑制作用上，未涉及其他可能的炎症途径或治疗方法	探讨NLRP3炎症小体在炎症性肠病中的作用及其抑制剂的治疗潜力	炎症性肠病患者的黏膜免疫细胞和纤维细胞	NA	炎症性肠病	单细胞RNA测序和微阵列分析	NA	RNA	来自炎症性肠病患者的肠道黏膜免疫细胞和纤维细胞
491	2024-08-07	Dissecting the immune discrepancies in mouse liver allograft tolerance and heart/kidney allograft rejection 2024-Mar, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13555 PMID:37748771	研究论文	本文构建了小鼠肝、心和肾同种异体移植模型，并利用单细胞RNA测序技术分析了66,393个细胞，以描述器官移植早期阶段的细胞组成和免疫细胞相互作用，同时通过批量RNA测序分析了移植后第7天至第60天的转录组动态变化。	首次详细描述了小鼠肝移植耐受与心/肾移植排斥反应中细胞组成和免疫细胞相互作用的差异，并揭示了Kupffer细胞和巨噬细胞在耐受诱导中的协同功能。	研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。	深入理解实体器官移植中的耐受和排斥机制。	小鼠肝、心和肾同种异体移植模型中的细胞组成和免疫细胞相互作用。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序, 批量RNA测序	NA	RNA序列	66,393个细胞
492	2024-08-07	Integration of human organoids single-cell transcriptomic profiles and human genetics repurposes critical cell type-specific drug targets for severe COVID-19 2024-Mar, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13558 PMID:37807299	研究论文	本文构建了一个计算框架，整合了人类类器官单细胞转录组数据、全基因组关联研究统计数据、表达数量性状位点以及基因-药物相互作用数据，以识别与COVID-19严重性相关的关键细胞群体和药物靶点	本文创新性地利用人类类器官单细胞转录组数据和遗传学数据，重新定位了针对COVID-19的细胞类型特异性药物靶点	NA	识别与COVID-19严重性相关的细胞类型特异性药物靶点，以促进开发有效的治疗方法	人类类器官中的39种细胞类型及其与COVID-19严重性的关联	基因组学	COVID-19	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	计算框架	转录组数据	八种类器官中的39种细胞类型
493	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing gene signatures for classifying and scoring exhausted CD8+ T cells in B-cell acute lymphoblastic leukaemia 2024-Mar, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13583 PMID:38030593	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
494	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing reveals peripheral blood leukocyte responses to spinal cord injury in mice with humanised immune systems 2024-Mar-01, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03048-0 PMID:38429643	研究论文	本研究利用人源化免疫系统的小鼠模型和单细胞RNA测序技术，探讨了人免疫细胞在脊髓损伤后的反应和变化	首次在人源化小鼠模型中使用单细胞RNA测序技术研究脊髓损伤后免疫细胞的反应和变化	研究仅限于特定的人源化小鼠模型，可能不完全代表人类脊髓损伤后的免疫反应	深入研究脊髓损伤后免疫抑制综合征（SCI-IDS）以及人白细胞在损伤部位的迁移和变化	人源化NSG-SGM3小鼠脊髓损伤后的免疫细胞	数字病理学	脊髓损伤	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	基因表达数据	11种人免疫细胞（亚）类型或状态
495	2024-08-07	Traditional Chinese Medicine Shi-Bi-Man ameliorates psoriasis via inhibiting IL-23/Th17 axis and CXCL16-mediated endothelial activation 2024-Mar-01, Chinese medicine IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s13020-024-00907-z PMID:38429819	研究论文	研究中药石壁曼通过抑制IL-23/Th17轴和CXCL16介导的内皮细胞活化来改善银屑病的作用机制	首次探讨了石壁曼通过抑制IL-23/Th17细胞轴和CXCL16表达来减轻银屑病样皮肤炎症的作用	研究仅在动物模型中进行，需要进一步的人体临床试验验证	寻找银屑病的新治疗策略并探究其作用机制	石壁曼对银屑病样皮肤炎症的影响及其分子机制	NA	银屑病	单细胞RNA测序, 免疫荧光, 反转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)	NA	细胞	使用咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型
496	2024-08-05	Development of a novel head and neck squamous cell carcinoma prognostic signature by bulk/single-cell sequencing data integration 2024-Mar, Oral diseases IF:2.9Q1 DOI:10.1111/odi.14443 PMID:36398480	研究论文	本研究旨在为头颈鳞状细胞癌(HNSCC)开发一种新的预后标志物	通过整合单细胞和大规模转录组数据，识别与不良预后相关的特定癌细胞亚群，并开发了一种包含六个基因的新预后标志物	独立验证仅在我们的患者队列中进行，可能需要更广泛的样本验证	识别与癌症不良预后相关的细胞亚群并开发预后签名	头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的特定癌细胞亚群	数字病理学	头颈癌	RNA测序	Cox回归模型	转录组数据	NA
497	2024-08-05	Single-cell transcriptomics dissects premalignant progression in proliferative verrucous leukoplakia 2024-Mar, Oral diseases IF:2.9Q1 DOI:10.1111/odi.14347 PMID:35950708	研究论文	该研究利用单细胞转录组技术剖析了增生性疣状白斑（PVL）的前恶性进展	首次描绘了PVL的细胞景观，发现了两个新的细胞亚型（INSR+内皮细胞和ASPN+成纤维细胞）在微环境重塑中的关键作用	研究仅基于三个活检样本，可能无法全面代表PVL进展的所有特征	旨在勾勒PVL进展过程中的分子特征变化及关键细胞亚型	研究对象为三份来自大面积PVL病变的活检样本	数字病理学	前恶性病变	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	来自一个大PVL病变的三个活检样本，共27,611个细胞
498	2024-08-07	Microglia-endothelial cross-talk regulates diabetes-induced retinal vascular dysfunction through remodeling inflammatory microenvironment 2024-Mar-15, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.109145 PMID:38414848	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病视网膜病变中微胶质细胞和内皮细胞的转录组特征，并探讨了它们之间的相互作用及其在炎症反应和血管发育中的作用	首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了糖尿病视网膜病变中微胶质细胞和内皮细胞的亚群及其相互作用，特别是在CSF1和CSF1R信号通路中的作用	NA	阐明糖尿病诱导的视网膜血管功能障碍中微胶质细胞和内皮细胞之间的相互作用及其在炎症微环境重塑中的作用	微胶质细胞和内皮细胞在糖尿病视网膜病变中的相互作用及其分子机制	NA	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
499	2024-08-04	Single-Cell RNA Sequencing Transcriptomics Revealed HCMV IE2-Related Microglia Responses in Alzheimer's-Like Disease in Transgenic Mice 2024-Mar, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-023-03553-y PMID:37700217	研究论文	本文研究了人类巨细胞病毒IE2蛋白如何促进小胶质细胞激活，从而导致类似阿尔茨海默病的疾病。	建立了IE2转基因小鼠模型，揭示HCMV IE2对小胶质细胞的激活作用及其与阿尔茨海默病的关系	研究主要集中在转基因小鼠模型，可能未能全面反映人类AD的复杂性	探讨HCMV IE2蛋白与阿尔茨海默病之间的关系及其机制	转基因小鼠，特别是表达IE2蛋白的小鼠	数字病理学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序	转基因小鼠	基因表达数据	IE2转基因小鼠的脑组织样本
500	2024-08-07	Deciphering Oligodendrocyte Lineages in the Human Fetal Central Nervous System Using Single-Cell RNA Sequencing 2024-Mar, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-023-03661-9 PMID:37775719	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术探索了人类胎儿中枢神经系统中三个区域（纹状体、脑干和脊髓）的少突胶质细胞发育过程	发现了多个少突胶质细胞前体细胞（OPCs）的谱系，并描绘了这三个中枢神经系统区域中少突胶质细胞分化的不同发育轨迹	NA	揭示人类胎儿中枢神经系统中少突胶质细胞谱系的分子异质性	人类胎儿中枢神经系统中的少突胶质细胞及其前体细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	从妊娠第8周到第12周的人类胎儿中枢神经系统样本