单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
461	2024-08-07	β-cell Jagged1 is sufficient but not necessary for islet Notch activity and insulin secretory defects in obese mice 2024-Mar, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2024.101894 PMID:38311286	研究论文	研究探讨了肥胖小鼠β细胞中Jagged1对Notch信号活性和胰岛素分泌缺陷的影响	首次证明了β细胞中Jagged1的表达与肥胖小鼠的Notch信号活性和胰岛素分泌缺陷有关	遗传缺失功能实验表明β细胞可能不是Jagged1信号的来源	探究Jagged1在肥胖小鼠β细胞中的作用及其对Notch信号和胰岛素分泌的影响	肥胖小鼠和高脂饮食喂养的小鼠的β细胞	生物医学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA	包括高脂饮食喂养的小鼠、瘦素受体缺陷小鼠以及糖尿病患者和非糖尿病患者的胰岛
462	2024-08-07	Fallopian tube single cell analysis reveals myeloid cell alterations in high-grade serous ovarian cancer 2024-Mar-15, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.108990 PMID:38384837	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析输卵管和高度浆液性卵巢癌组织，揭示了免疫和基质细胞的转录多样性及其在肿瘤进展中的作用	首次综合分析了人类输卵管单细胞RNA测序数据和高度浆液性卵巢癌相关组织，发现了输卵管中丰富的单核细胞，并揭示了单核细胞和巨噬细胞在肿瘤和正常组织中的特定交互作用和功能通路	NA	探索高度浆液性卵巢癌早期检测标志物的发现	输卵管和高度浆液性卵巢癌组织中的免疫和基质细胞	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	涉及两个独立队列的输卵管和高度浆液性卵巢癌相关组织
463	2024-08-04	Single cell transcriptome analysis of the THY-Tau22 mouse model of Alzheimer's disease reveals sex-dependent dysregulations 2024-Mar-07, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-024-01885-9 PMID:38453894	研究论文	本文通过单细胞转录组分析THY-Tau22阿尔茨海默病小鼠模型，揭示了与性别相关的失调现象。	研究首次深入探讨了阿尔茨海默病中早期分子变化的性别依赖性，并识别了关键的调控因子。	研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性。	旨在探讨阿尔茨海默病的早期分子变化及其性别差异。	研究对象是THY-Tau22阿尔茨海默病小鼠模型。	数字病理学	阿尔茨海默病	单细胞RNA-seq	NA	转录组数据	THY-Tau22小鼠模型的样本量NA
464	2024-08-04	Tissue-resident memory T cell signatures from single-cell analysis associated with better melanoma prognosis 2024-Mar-15, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.109277 PMID:38455971	研究论文	本研究系统性地探讨了组织驻留记忆T细胞与黑色素瘤肿瘤免疫微环境之间的关系	提出了基于T细胞浸润的22基因风险评分，以有效分类黑色素瘤患者的生存风险	NA	阐明组织驻留记忆T细胞在黑色素瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其与患者生存的关系	黑色素瘤患者的组织驻留记忆T细胞	数字病理学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	机器学习模型	基因表达数据	多个临床单细胞RNA-seq数据集
465	2024-08-07	Synaptic endocytosis in adult adipose stromal cell-derived neurons 2024-03-15, Brain research IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.brainres.2023.148746 PMID:38184164	研究论文	本研究探讨了从脂肪来源的间充质干细胞（ADSCs）衍生的神经元中的突触内吞作用	首次研究了从ADSCs衍生的神经元中的内吞功能	NA	旨在检查从ADSCs衍生的神经元中的突触内吞作用	从ADSCs衍生的神经元中的突触内吞作用	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	蛋白质和量子点	NA
466	2024-08-07	A single-cell atlas of Drosophila trachea reveals glycosylation-mediated Notch signaling in cell fate specification 2024-Mar-06, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-46455-w PMID:38448482	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术构建了果蝇气管系统的细胞图谱，揭示了糖基化介导的Notch信号在细胞命运决定中的作用	首次提供了果蝇气管系统的全面单细胞转录组图谱，并发现了糖基化对Notch信号在细胞命运决定中的响应	NA	探究果蝇气管系统的管状形态发生程序	果蝇气管系统的细胞类型和Notch信号在细胞命运决定中的作用	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组	9种主要亚型的气管细胞
467	2024-08-07	MSCsDB: a database of single-cell transcriptomic profiles and in-depth comprehensive analyses of human mesenchymal stem cells 2024-Mar-06, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1 DOI:10.1186/s40164-024-00496-5 PMID:38449024	研究论文	介绍了一个名为MSCsDB的数据库，该数据库整合了人类间充质干细胞的单细胞转录组数据，并提供深度综合分析	MSCsDB数据库提供了一个一站式交互查询平台，支持调控子活动、基因本体富集、特征基因可视化和转录因子调控子分析，并开发了专门模块评估MSC质量	NA	旨在通过单细胞RNA测序技术深入研究间充质干细胞的异质性，并提供一个系统分析已发表数据集的平台	人类间充质干细胞的单细胞转录组数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	包括来自26个受试者的5个组织中的470,000个细胞
468	2024-08-07	Diacylglycerols and Lysophosphatidic Acid, Enriched on Lipoprotein(a), Contribute to Monocyte Inflammation 2024-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319937 PMID:38269588	研究论文	研究探讨了脂蛋白(a)（Lp[a]）中富含的二酰甘油（DGs）和溶血磷脂酸（LPA）对单核细胞炎症的贡献	首次揭示了Lp(a)中DGs和LPA对单核细胞炎症的影响，并发现这种炎症部分依赖于NLRP3炎症小体	研究主要集中在体外实验和部分临床样本分析，需要进一步的临床研究来验证这些发现	探讨Lp(a)中其他促炎介质对动脉粥样硬化的影响	脂蛋白(a)（Lp[a]）及其相关脂质对单核细胞炎症的影响	心血管疾病	心血管疾病	脂质组学、RNA测序、ELISA、Western blot、免疫荧光染色、单细胞RNA测序	NA	血液样本、细胞样本	健康个体13人，高Lp(a)水平个体12人，心血管疾病患者若干
469	2024-08-07	Human surface ectoderm and amniotic ectoderm are sequentially specified according to cellular density 2024-Mar, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adh7748 PMID:38427729	研究论文	本文通过建立人类多能干细胞模型，研究了羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制	首次提出人类羊膜外胚层和表面外胚层是根据细胞密度沿着共同非神经外胚层轨迹指定的	NA	探究人类羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制	人类羊膜外胚层和表面外胚层	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞	NA
470	2024-08-07	Ezrin's role in gastric cancer progression: Implications for immune microenvironment modulation and therapeutic potential 2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27155 PMID:38449647	研究论文	本研究通过蛋白质组技术分析胃癌细胞系MKN-45和HGC-27之间的差异表达蛋白，筛选出ezrin作为目标蛋白，并探讨了ezrin表达水平与免疫微环境和基因组变化之间的关系。	首次探讨了ezrin在胃癌中的免疫调节作用及其与基因组不稳定性的关系，并预测了ezrin与免疫治疗和化疗敏感性的关联。	研究主要基于细胞系和数据库分析，未来需要更多临床样本验证ezrin在胃癌中的作用。	阐明ezrin在胃癌中的预后、免疫学和治疗价值。	胃癌细胞系MKN-45和HGC-27，以及TCGA和GEO数据库中的患者信息。	数字病理学	胃癌	蛋白质组技术	NA	蛋白质数据	涉及胃癌细胞系和数据库中的患者信息
471	2024-08-07	Bulk anda single-cell transcriptome profiling reveals the molecular characteristics of T cell-mediated tumor killing in pancreatic cancer 2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27216 PMID:38449660	研究论文	本文通过批量和单细胞转录组分析，揭示了胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子特征	开发了TRGscore评分系统，有效预测胰腺癌患者对化疗或免疫治疗的反应及总体生存率	NA	探索胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子机制，并识别可能从免疫检查点阻断治疗中获益的患者亚群	胰腺癌患者的T细胞介导的肿瘤杀伤机制	数字病理学	胰腺癌	转录组分析	NA	基因表达数据	涉及胰腺癌患者的样本，分为两个亚群进行分析
472	2024-08-04	Single-cell nanobiopsy enables multigenerational longitudinal transcriptomics of cancer cells 2024-Mar-08, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adl0515 PMID:38446884	研究论文	本文介绍了一种单细胞纳米活检平台，可实时分析癌细胞的转录组	提出了一种基于扫描离子导电显微镜的纳米活检技术，能够在单细胞及其后代中进行多代纵向细胞质采样	该方法的应用仅限于体外实验，尚未在体内验证其有效性	探讨单细胞癌细胞的动态转录组变化及其在治疗反应中的角色	单个胶质母细胞瘤（GBM）脑肿瘤细胞	数字病理学	脑癌	扫描离子导电显微镜（SICM）	NA	转录组数据	单个胶质母细胞瘤细胞的多次样本
473	2024-08-07	Prediction of tumor-reactive T cell receptors from scRNA-seq data for personalized T cell therapy 2024-Mar-07, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-024-02161-y PMID:38454173	研究论文	本文介绍了一种名为PredicTCR的机器学习分类器，用于从单细胞RNA测序数据中识别肿瘤反应性T细胞受体，以加速个性化T细胞疗法的制造	PredicTCR能够以抗原未知的方式识别肿瘤反应性TILs，相比之前的基因集富集方法，提高了特异性和敏感性	NA	开发一种新的方法来预测肿瘤反应性T细胞受体，以支持个性化T细胞疗法	肿瘤反应性T细胞受体	机器学习	NA	scRNA-seq	机器学习分类器	RNA测序数据	来自多种癌症的TILs
474	2024-08-07	Loss of chromosome Y in regulatory T cells 2024-Mar-05, BMC genomics IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12864-024-10168-7 PMID:38443832	研究论文	研究探讨了染色体Y在调节性T细胞中的缺失情况及其对T淋巴细胞分化的影响	首次发现调节性T细胞中染色体Y的缺失显著增加，并影响淋巴细胞分化	研究样本量有限，需要进一步的大规模研究验证	探究染色体Y在特定CD4+ T淋巴细胞亚群中的缺失情况及其对疾病风险的影响	调节性T细胞及其他T淋巴细胞亚群	免疫学	癌症	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	23个PBMC样本和32个CD4+ T淋巴细胞富集样本
475	2024-08-07	Targeted knockdown of PGAM5 in synovial macrophages efficiently alleviates osteoarthritis 2024-Mar-04, Bone research IF:14.3Q1 DOI:10.1038/s41413-024-00318-8 PMID:38433252	研究论文	本研究探讨了磷酸甘油酸变位酶5（PGAM5）在滑膜巨噬细胞中的作用及其对骨关节炎（OA）的影响	首次发现PGAM5在OA滑膜巨噬细胞中的显著增加，并通过条件性敲除PGAM5减轻OA症状，促进软骨细胞的合成代谢	NA	研究PGAM5在滑膜巨噬细胞中的作用，探索其作为治疗骨关节炎的新策略	骨关节炎（OA）中的滑膜巨噬细胞和软骨细胞	数字病理学	骨关节炎	单细胞RNA测序	NA	RNA	人类样本的组织学分析和鼠模型的单细胞RNA测序结果
476	2024-08-04	Drug resistance mechanisms in dopamine agonist-resistant prolactin pituitary neuroendocrine tumors and exploration for new drugs 2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2024.101056 PMID:38277755	研究论文	本研究探讨了耐多巴胺激动剂的泌乳素瘤中的耐药机制，并探索了新的潜在药物。	本研究首次发现耐多巴胺激动剂的泌乳素瘤与Focal Adhesion信号通路的上调相关，并筛选出了新药Genistein作为潜在的有效治疗药物。	研究主要集中在小样本量的组织模型和细胞系上，可能影响结果的普适性。	调查泌乳素瘤中的多巴胺激动剂耐药机制并识别新的潜在有效药物。	研究对象为27例耐多巴胺激动剂的泌乳素瘤和10例敏感泌乳素瘤的病例。	数字病理学	泌乳素瘤	转录组测序和单细胞测序	类器官模型	组织样本和细胞系	27例耐药泌乳素瘤，10例敏感泌乳素瘤，3例耐药和3例敏感的单细胞
477	2024-08-07	Single-cell analysis reveals the transcriptional alterations in the submandibular glands of aged mice 2024-Mar, Journal of oral biosciences IF:2.6Q1 DOI:10.1016/j.job.2023.12.002 PMID:38142941	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析了老年小鼠下颌下腺中每个细胞类型的基因表达变化	首次通过单细胞RNA测序揭示了老年小鼠下颌下腺中特定细胞类型的转录变化	NA	阐明老年小鼠下颌下腺中基因表达变化的精确分子机制	老年小鼠下颌下腺中的细胞类型及其基因表达	数字病理学	老年疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	成年和老年小鼠的下颌下腺细胞
478	2024-08-07	MAFF confers vulnerability to cisplatin-based and ionizing radiation treatments by modulating ferroptosis and cell cycle progression in lung adenocarcinoma 2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2024.101057 PMID:38266355	研究论文	本研究探讨了MAFF在肺腺癌中的作用及其对顺铂和电离辐射治疗的影响	首次揭示了MAFF通过调节铁死亡和细胞周期进程影响肺腺癌对顺铂和电离辐射治疗的敏感性	NA	研究MAFF在肺腺癌中的作用及其对化疗和放疗的影响	肺腺癌细胞和肿瘤模型	数字病理学	肺癌	CRISPR筛选、单细胞RNA测序、RNA和ChIP测序	NA	RNA	细胞和小鼠模型
479	2024-08-07	The role of histone H1.2 in pancreatic cancer metastasis and chemoresistance 2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2023.101027 PMID:38290407	研究论文	本研究探讨了胰腺癌（PC）中的化学耐药性和肿瘤转移之间的联系及其分子和细胞机制	构建并验证了一个转移和化学耐药性特征（MCS）评分系统，并发现H1-2的高表达与化学耐药性和上皮-间质转化（EMT）相关	NA	探索胰腺癌中化学耐药性和肿瘤转移之间的联系及其可能的分子和细胞机制	胰腺癌的化学耐药性和肿瘤转移	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
480	2024-08-07	Single-cell transcriptome analysis reveals the association between histone lactylation and cisplatin resistance in bladder cancer 2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2024.101059 PMID:38295753	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了组蛋白乳酸化与膀胱癌顺铂耐药性的关联	首次发现H3赖氨酸18乳酸化（H3K18la）在顺铂耐药膀胱癌细胞中的重要作用，并通过靶向抑制H3K18la恢复了顺铂敏感性	NA	探讨膀胱癌顺铂耐药的机制，并寻找新的干预靶点	膀胱癌顺铂耐药细胞及组蛋白乳酸化	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	特定数量的膀胱癌细胞