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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-08-07 |
Deciphering the molecular regulatory of RAB32/GPRC5A axis in chronic obstructive pulmonary disease
2024-Mar-06, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02724-2
PMID:38448858
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研究论文 | 本研究通过多种生物信息学挖掘和实验验证,探讨了RAB32在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的分子调控机制,并识别了GPRC5A作为与RAB32相互作用的潜在分子。 | 本研究首次详细探讨了RAB32与GPRC5A在COPD中的相互作用及其在肺组织中的共定位,为COPD的机制研究提供了新的视角。 | 研究主要基于生物信息学分析和实验室检测,未来需要更多的临床数据和实验验证来进一步证实这些发现。 | 旨在揭示RAB32在COPD中的分子调控轴及其与GPRC5A的相互作用。 | RAB32在COPD中的分子调控机制及其与GPRC5A的相互作用。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RT-qPCR, 免疫荧光, WGCNA, mfuzz聚类, Spearman相关分析 | NA | RNA序列, 蛋白质 | 从中山医院收集的肺组织手术样本,以及来自Gene Expression Omnibus (GEO)的四个COPD微阵列数据集和GSE173896数据集的COPD相关上皮细胞scRNA-seq数据。 | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2024-08-04 |
Integrated single-nuclei and spatial transcriptomic analysis reveals propagation of early acute vein harvest and distension injury signaling pathways following arterial implantation
2024-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.31.564995
PMID:37961724
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示了静脉移植物收获和扩张后信号通路的传播。 | 首次应用单核RNA测序和空间转录组学分析研究静脉病理,提供了对静脉移植物损伤响应的深入理解。 | 使用的模型数量有限,仅包含4个犬模型,可能限制结果的广泛适用性。 | 揭示静脉移植物收获和移植后的响应,识别导致移植物失败的关键不适应性通路。 | 研究对象为犬模型中的静脉移植物,重点关注其在收获和扩张后的基因组效应。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学(ST) | 犬模型 | 基因组数据 | 4个犬模型的静脉移植物样本 | NA | NA | NA | NA |
| 463 | 2024-08-07 |
S100A9+CD14+ monocytes contribute to anti-PD-1 immunotherapy resistance in advanced hepatocellular carcinoma by attenuating T cell-mediated antitumor function
2024-Mar-08, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02985-1
PMID:38454445
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研究论文 | 本研究探讨了S100A9+CD14+单核细胞在晚期肝细胞癌患者中通过减弱T细胞介导的抗肿瘤功能,促进对PD-1免疫疗法的抵抗作用 | 本研究首次揭示了S100A9+CD14+单核细胞作为预测免疫检查点抑制剂治疗效果的生物标志物,并提出了通过抑制S100A9来增强免疫疗法效果的新策略 | NA | 旨在探索晚期肝细胞癌患者接受PD-1单药治疗前可预测治疗效果的外周生物标志物,并阐明免疫检查点阻断抵抗的分子机制 | 晚期肝细胞癌患者及其对PD-1免疫疗法的反应 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 晚期肝细胞癌患者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling identifies IL1Bhi macrophages associated with inflammation in PD-1 inhibitor-induced inflammatory arthritis
2024-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46195-x
PMID:38453911
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎(PD-1-IA)和类风湿性关节炎(RA)患者的外周血和滑液中的CD45细胞,发现PD-1-IA中IL1B髓系细胞的显著扩张及其与耗竭的CD8 T细胞的相互作用。 | 首次揭示了PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎中IL1B髓系细胞的扩张及其与耗竭CD8 T细胞的相互作用,为该疾病的治疗提供了新的潜在靶点。 | 研究仅限于外周血和滑液样本,未涉及其他组织或器官,可能限制了对疾病机制的全面理解。 | 探讨PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎与类风湿性关节炎在细胞和分子水平上的差异。 | PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎和类风湿性关节炎患者的外周血和滑液中的CD45细胞。 | 数字病理学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎和类风湿性关节炎患者的外周血和滑液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics data and analytical methods: An updated perspective
2024-Mar, Drug discovery today
IF:6.5Q1
DOI:10.1016/j.drudis.2024.103889
PMID:38244672
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综述 | 本文讨论了空间转录组学的数据库和基于深度学习的空间转录组数据分析模型 | 本文为空间转录组学领域的分析方法提供了更新的视角,强调了AI技术的整合 | 尽管在ST数据分析技术方面取得了显著进展,但模型的生物学相关性仍需提升 | 研究空间转录组学数据分析方法及其在生物医学中的应用 | 空间转录组学相关的数据库和深度学习模型 | 数字病理学 | NA | 高分辨率成像与转录组学 | 深度学习模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-08-04 |
Construction and analysis of a joint diagnostic model of machine learning for cryptorchidism based on single-cell sequencing
2024-Mar, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.2316
PMID:38459615
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的隐睾诊断模型,并确定了与隐睾相关的新生物标志物 | 创新点在于利用人工神经网络构建隐睾的新型诊断模型,并通过单细胞测序分析验证中心基因 | 未提及此模型在临床应用中的局限性 | 研究的目的是开发隐睾的新诊断模型并识别新的生物标志物 | 研究对象为隐睾患者的RNA测序数据 | 数字病理学 | 隐睾 | RNA测序 | 人工神经网络 | 基因表达数据 | 样本来源于南通大学医院和基因表达综合数据库(GEO) | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2024-08-07 |
Staphylococcus aureus lysate induces an IgE response via memory B cells in nasal polyps
2024-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.10.033
PMID:38056634
|
研究论文 | 研究探讨了金黄色葡萄球菌裂解物在慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)中诱导IgE合成的机制 | 首次揭示了金黄色葡萄球菌通过IgE阴性记忆B细胞在CRSwNP患者中诱导IgE反应的机制 | NA | 研究金黄色葡萄球菌是否能在CRSwNP中诱导异常IgE合成及其潜在机制 | 金黄色葡萄球菌裂解物对CRSwNP中IgE合成的影响及机制 | NA | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | ELISA, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 定量逆转录PCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-08-07 |
Altered tumor signature and T-cell profile after chemotherapy reveal new therapeutic opportunities in high-grade serous ovarian carcinoma
2024-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16074
PMID:38226451
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术,探讨了高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)患者在接受化疗后肿瘤标志物和T细胞谱的变化 | 揭示了化疗后肿瘤标志物和T细胞谱的显著变化,为克服治疗抵抗提供了新的治疗策略线索 | NA | 理解并解决高级别浆液性卵巢癌患者化疗抵抗的问题 | 高级别浆液性卵巢癌患者的组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-08-07 |
Fallopian tube single cell analysis reveals myeloid cell alterations in high-grade serous ovarian cancer
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108990
PMID:38384837
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析输卵管和高度浆液性卵巢癌组织,揭示了免疫和基质细胞的转录多样性及其在肿瘤进展中的作用 | 首次综合分析了人类输卵管单细胞RNA测序数据和高度浆液性卵巢癌相关组织,发现了输卵管中丰富的单核细胞,并揭示了单核细胞和巨噬细胞在肿瘤和正常组织中的特定交互作用和功能通路 | NA | 探索高度浆液性卵巢癌早期检测标志物的发现 | 输卵管和高度浆液性卵巢癌组织中的免疫和基质细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及两个独立队列的输卵管和高度浆液性卵巢癌相关组织 | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2024-08-04 |
Single cell transcriptome analysis of the THY-Tau22 mouse model of Alzheimer's disease reveals sex-dependent dysregulations
2024-Mar-07, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-024-01885-9
PMID:38453894
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析THY-Tau22阿尔茨海默病小鼠模型,揭示了与性别相关的失调现象。 | 研究首次深入探讨了阿尔茨海默病中早期分子变化的性别依赖性,并识别了关键的调控因子。 | 研究主要集中于小鼠模型,可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性。 | 旨在探讨阿尔茨海默病的早期分子变化及其性别差异。 | 研究对象是THY-Tau22阿尔茨海默病小鼠模型。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | THY-Tau22小鼠模型的样本量NA | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-08-04 |
Tissue-resident memory T cell signatures from single-cell analysis associated with better melanoma prognosis
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109277
PMID:38455971
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研究论文 | 本研究系统性地探讨了组织驻留记忆T细胞与黑色素瘤肿瘤免疫微环境之间的关系 | 提出了基于T细胞浸润的22基因风险评分,以有效分类黑色素瘤患者的生存风险 | NA | 阐明组织驻留记忆T细胞在黑色素瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其与患者生存的关系 | 黑色素瘤患者的组织驻留记忆T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个临床单细胞RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2024-08-07 |
Synaptic endocytosis in adult adipose stromal cell-derived neurons
2024-03-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2023.148746
PMID:38184164
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研究论文 | 本研究探讨了从脂肪来源的间充质干细胞(ADSCs)衍生的神经元中的突触内吞作用 | 首次研究了从ADSCs衍生的神经元中的内吞功能 | NA | 旨在检查从ADSCs衍生的神经元中的突触内吞作用 | 从ADSCs衍生的神经元中的突触内吞作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 蛋白质和量子点 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of Drosophila trachea reveals glycosylation-mediated Notch signaling in cell fate specification
2024-Mar-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46455-w
PMID:38448482
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了果蝇气管系统的细胞图谱,揭示了糖基化介导的Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 首次提供了果蝇气管系统的全面单细胞转录组图谱,并发现了糖基化对Notch信号在细胞命运决定中的响应 | NA | 探究果蝇气管系统的管状形态发生程序 | 果蝇气管系统的细胞类型和Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | 9种主要亚型的气管细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2024-08-07 |
MSCsDB: a database of single-cell transcriptomic profiles and in-depth comprehensive analyses of human mesenchymal stem cells
2024-Mar-06, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00496-5
PMID:38449024
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研究论文 | 介绍了一个名为MSCsDB的数据库,该数据库整合了人类间充质干细胞的单细胞转录组数据,并提供深度综合分析 | MSCsDB数据库提供了一个一站式交互查询平台,支持调控子活动、基因本体富集、特征基因可视化和转录因子调控子分析,并开发了专门模块评估MSC质量 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术深入研究间充质干细胞的异质性,并提供一个系统分析已发表数据集的平台 | 人类间充质干细胞的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 包括来自26个受试者的5个组织中的470,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2024-08-07 |
Ezrin's role in gastric cancer progression: Implications for immune microenvironment modulation and therapeutic potential
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27155
PMID:38449647
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组技术分析胃癌细胞系MKN-45和HGC-27之间的差异表达蛋白,筛选出ezrin作为目标蛋白,并探讨了ezrin表达水平与免疫微环境和基因组变化之间的关系。 | 首次探讨了ezrin在胃癌中的免疫调节作用及其与基因组不稳定性的关系,并预测了ezrin与免疫治疗和化疗敏感性的关联。 | 研究主要基于细胞系和数据库分析,未来需要更多临床样本验证ezrin在胃癌中的作用。 | 阐明ezrin在胃癌中的预后、免疫学和治疗价值。 | 胃癌细胞系MKN-45和HGC-27,以及TCGA和GEO数据库中的患者信息。 | 数字病理学 | 胃癌 | 蛋白质组技术 | NA | 蛋白质数据 | 涉及胃癌细胞系和数据库中的患者信息 | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-08-07 |
Bulk anda single-cell transcriptome profiling reveals the molecular characteristics of T cell-mediated tumor killing in pancreatic cancer
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27216
PMID:38449660
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞转录组分析,揭示了胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子特征 | 开发了TRGscore评分系统,有效预测胰腺癌患者对化疗或免疫治疗的反应及总体生存率 | NA | 探索胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子机制,并识别可能从免疫检查点阻断治疗中获益的患者亚群 | 胰腺癌患者的T细胞介导的肿瘤杀伤机制 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及胰腺癌患者的样本,分为两个亚群进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2024-08-07 |
Loss of chromosome Y in regulatory T cells
2024-Mar-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10168-7
PMID:38443832
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研究论文 | 研究探讨了染色体Y在调节性T细胞中的缺失情况及其对T淋巴细胞分化的影响 | 首次发现调节性T细胞中染色体Y的缺失显著增加,并影响淋巴细胞分化 | 研究样本量有限,需要进一步的大规模研究验证 | 探究染色体Y在特定CD4+ T淋巴细胞亚群中的缺失情况及其对疾病风险的影响 | 调节性T细胞及其他T淋巴细胞亚群 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 23个PBMC样本和32个CD4+ T淋巴细胞富集样本 | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2024-08-07 |
Targeted knockdown of PGAM5 in synovial macrophages efficiently alleviates osteoarthritis
2024-Mar-04, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00318-8
PMID:38433252
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研究论文 | 本研究探讨了磷酸甘油酸变位酶5(PGAM5)在滑膜巨噬细胞中的作用及其对骨关节炎(OA)的影响 | 首次发现PGAM5在OA滑膜巨噬细胞中的显著增加,并通过条件性敲除PGAM5减轻OA症状,促进软骨细胞的合成代谢 | NA | 研究PGAM5在滑膜巨噬细胞中的作用,探索其作为治疗骨关节炎的新策略 | 骨关节炎(OA)中的滑膜巨噬细胞和软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类样本的组织学分析和鼠模型的单细胞RNA测序结果 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2024-08-04 |
Detecting horizontal gene transfer with metagenomics co-barcoding sequencing
2024-Mar-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03602-23
PMID:38315121
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研究论文 | 本文开发了一种新的元基因组共条形码测序系统,以检测水平基因转移 (HGT) | 引入了元基因组共条形码测序(MECOS),实现了长DNA片段提取和综合生物信息学管道 | 传统方法如短读长程元基因组测序和单细胞测序存在片段短、输入DNA量大、测序成本高等限制 | 旨在揭示微生物群落中水平基因转移的机制 | 研究对象为人类和小鼠的肠道微生物群落 | 数字病理学 | NA | 元基因组共条形码测序 | NA | DNA序列 | 超过3000个HGT块,涉及约6000个基因和100个分类组 | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-08-07 |
Identification and validation of RNA-binding protein SLC3A2 regulates melanocyte ferroptosis in vitiligo by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2024-Mar-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10147-y
PMID:38438962
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据,识别并验证了RNA结合蛋白SLC3A2调控黑色素细胞铁死亡在白癜风中的作用。 | 首次确定了与白癜风相关的RNA结合蛋白基因及其潜在的发病机制,特别是在黑色素细胞中SLC3A2的下调促进铁死亡的作用。 | 研究主要集中在细胞实验层面,未来需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 揭示白癜风的发病机制,特别是RNA结合蛋白在其中的作用。 | 白癜风患者的不同细胞亚群及其RNA结合蛋白基因。 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq),批量RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | 14种不同细胞类型,28种细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |