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当前共找到 534 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-08-04 |
Highly sensitive spatial transcriptomics using FISHnCHIPs of multiple co-expressed genes
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46669-y
PMID:38491027
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FISHnCHIPs的技术，用于高度灵敏的细胞类型和基因表达程序的原位剖析 | FISHnCHIPs能够同时成像~2-35个共同表达的基因，具有~2-20倍于单基因FISH的灵敏度 | 未在摘要中提到具体的局限性 | 旨在提高组织样本的空间转录组学分析的灵敏度 | 涉及鼠类肾脏和脑部的组织样本，以及人类结直肠癌活检样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | FISH | NA | 组织样本 | 分析了多个鼠类样本和一个人类活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 442 | 2024-08-07 |
Autophagy regulates the maturation of hematopoietic precursors in the embryo
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46453-y
PMID:38490977
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研究论文 | 本文研究了自噬在胚胎造血前体细胞成熟过程中的作用 | 首次揭示了自噬在胚胎造血前体细胞成熟中的作用，并探讨了自噬相关基因Atg5在血管内皮细胞中的缺失对内皮到造血转变的影响 | NA | 理解调控胚胎造血干细胞发育的机制，促进其再生 | 胚胎造血前体细胞和造血干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LC3-RFP-EGFP小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 443 | 2024-08-07 |
Histone Trimethylations and HDAC5 Regulate Spheroid Subpopulation and Differentiation Signaling of Human Adipose-Derived Stem Cells
2024-Mar-15, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad090
PMID:38173411
|
研究论文 | 本文研究了人类脂肪干细胞（ASCs）球状体形成的表观遗传调控及其信号协调机制 | 发现了H3K4me3、H3K9me3和HDAC5在干细胞命运和定向分化中的关键作用 | NA | 揭示ASCs球状体形成的细胞命运和分化机制 | 人类脂肪干细胞（ASCs）及其球状体 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用10x Genomics平台分析了ASCs球状体 | NA | NA | NA | NA |
| 444 | 2024-08-04 |
TISSUE: uncertainty-calibrated prediction of single-cell spatial transcriptomics improves downstream analyses
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02184-y
PMID:38347138
|
研究论文 | 本文提出了一种新框架TISSUE，用于评估空间基因表达预测的不确定性，改善下游分析 | TISSUE框架利用保形推断提供良好校准的预测区间，并减少差异基因表达分析中的假发现率 | 未提及具体的局限性 | 提高单细胞空间转录组学预测的准确性及其下游分析 | 对小鼠成年人侧脑室区域的MERFISH空间转录组数据进行分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 11个基准数据集及一个小鼠数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 445 | 2024-08-04 |
Correcting PCR amplification errors in unique molecular identifiers to generate accurate numbers of sequencing molecules
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02168-y
PMID:38317008
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研究论文 | 本研究探讨了PCR扩增误差对RNA分子绝对计数的准确性影响。 | 研究展示了一种使用同聚三聚体核苷酸块合成唯一分子标识符的方法，以纠正PCR错误并实现精确计数。 | 研究未提及样本数量及多样性限制。 | 探讨PCR扩增误差对RNA分子计数准确性的影响。 | 研究对象为RNA分子及其测序数据。 | 数字病理 | NA | PCR | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 446 | 2024-08-04 |
In situ single-cell profiling sheds light on IFI27 localisation during SARS-CoV-2 infection
2024-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105016
PMID:38377798
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组技术描绘了SARS-CoV-2感染期间的免疫反应 | 首次识别了在感染部位M1巨噬细胞中IFI27的高表达 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染下的免疫反应 | 感染部位的M1巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞空间转录组技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 447 | 2024-08-07 |
Amphiregulin switches progenitor cell fate for lineage commitment during gastric mucosal regeneration
2024-Mar-14, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.03.009
PMID:38492892
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研究论文 | 研究胃黏膜再生过程中，Amphiregulin如何调控前体细胞的谱系承诺 | 首次揭示了Amphiregulin在胃黏膜再生中对前体细胞谱系承诺的调控作用 | NA | 探讨胃黏膜损伤后前体细胞微环境的调控机制 | 胃黏膜中的Isthmic前体细胞及其在再生过程中的谱系承诺 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胃黏膜上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 448 | 2024-08-04 |
BANKSY unifies cell typing and tissue domain segmentation for scalable spatial omics data analysis
2024-Mar, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01664-3
PMID:38413725
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研究论文 | 本研究提出了一种名为BANKSY的算法，用于统一细胞类型和组织区域的空间聚类问题 | 通过将细胞嵌入到自身和局部邻域转录组的乘积空间中，BANKSY提供了一种新的空间特征增强策略，显著提高了任务性能 | NA | 研究旨在提供一种准确且可扩展的框架，以分析空间分辨的组学数据 | 主要研究对象为细胞类型和组织域在空间组学数据中的聚类 | 数字病理学 | NA | RNA测序，蛋白质成像 | NA | RNA和蛋白质图像数据 | 数百万个细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2024-08-07 |
The platelet-related genes associated with the prognosis of HCC by regulating cycling T cell and prolif-TAMs
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26798
PMID:38486758
|
研究论文 | 本研究通过TCGA和ICGC数据库分析了92个与肝细胞癌（HCC）相关的差异表达的血小板相关基因（PRGs），并开发了PRGs预后标志物，揭示了这些基因在HCC中的潜在机制。 | 首次详细探讨了血小板相关基因在HCC中的预后价值及其对免疫微环境的调控作用。 | 研究主要基于数据库分析，需要进一步的实验验证。 | 构建与HCC相关的血小板相关基因风险标志物，并揭示其调控免疫微环境的潜在机制。 | 血小板相关基因在HCC中的表达及其预后价值。 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 92个差异表达的血小板相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2024-08-04 |
Single-cell division tracing and transcriptomics reveal cell types and differentiation paths in the regenerating lung
2024-Mar-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46469-4
PMID:38472236
|
研究论文 | 本研究结合小鼠模型和单细胞转录组学，揭示了再生肺的细胞类型和分化路径 | 首次展示了Krt13基底细胞与Krt15俱乐部细胞之间的中间细胞状态，并揭示了腺泡细胞作为积极分裂的前体细胞 | 未提及具体的样本数量和实验限制 | 理解肺上皮再生中的分子和细胞过程，以促进肺疾病的治疗方法发展 | 特定上皮细胞类型的损伤小鼠模型，细胞分裂功能标记细胞和单细胞转录组学 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2024-08-07 |
Combined IL6 and CCR2 blockade potentiates antitumor activity of NK cells in HPV-negative head and neck cancer
2024-Mar-12, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03002-1
PMID:38468260
|
研究论文 | 本研究探讨了在HPV阴性的头颈部鳞状细胞癌中，联合阻断IL6和CCR2通路对NK细胞抗肿瘤活性的增强作用 | 首次展示了在HPV阴性的头颈部鳞状细胞癌中，通过联合阻断IL6和CCR2通路可以有效增强NK细胞的抗肿瘤活性 | NA | 探索增强NK细胞在HPV阴性头颈部鳞状细胞癌中的抗肿瘤活性的新治疗方法 | HPV阴性的头颈部鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用了HPV阳性和阴性的头颈部鳞状细胞癌细胞系及同种异体小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2024-08-07 |
Decoding gene regulatory circuitry underlying TNBC chemoresistance reveals biomarkers for therapy response and therapeutic targets
2024-Mar-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00529-6
PMID:38472332
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据，揭示了三阴性乳腺癌（TNBC）化疗耐药性的基因调控机制，并发现了潜在的治疗反应生物标志物和治疗靶点 | 本研究首次通过单细胞转录组数据和全基因组H3K27ac标记映射，揭示了TNBC化疗耐药性的表观遗传和转录因子网络 | NA | 揭示三阴性乳腺癌化疗耐药性的分子机制，并发现新的治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者及其化疗耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals critical modulators of extracellular matrix of penile cavernous cells in erectile dysfunction
2024-03-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-56428-0
PMID:38467692
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研究论文 | 这项研究揭示了勃起功能障碍（ED）中阴茎海绵细胞外基质的关键调节因子 | 该研究首次利用单细胞RNA测序描绘了ED中阴茎海绵细胞的转录组图谱，并揭示了细胞与细胞之间的相互作用 | 该研究可能未能完全阐明所有细胞类型之间的相互作用和复杂性 | 研究ED与细胞外基质（ECM）之间的关系 | 分析ED与非ED样本中82,554个海绵单细胞的转录组特征 | 数字病理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 82,554个海绵单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 454 | 2024-08-04 |
Combinatorial expression of γ-protocadherins regulates synaptic connectivity in the mouse neocortex
2024-Mar-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89532
PMID:38470230
|
研究论文 | 本文研究了γ-protocadherins在小鼠新皮层突触连接中的作用 | 识别了组合性γ-protocadherin表达在突触连接中的关键角色 | 尚未探讨如何在其他类型神经元中应用这一发现 | 探讨突触形成过程中的连接选择机制 | 小鼠新皮层中的神经元 | 数字病理学 | NA | 5'端单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 455 | 2024-08-04 |
Differentiation is accompanied by a progressive loss in transcriptional memory
2024-Mar-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01846-9
PMID:38468285
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞分化过程中的转录记忆丧失与基因表达变异之间的关系 | 首次提供了关于相同细胞在分化早期阶段转录组分化速度的实验数据 | 研究主要集中在两种分化生物系统，可能限制了广泛应用性 | 研究细胞分化过程中转录记忆如何随着细胞分裂而丧失 | 人CD34+细胞和T2EC鸡初级红细胞前体 | 数字病理学 | NA | scRT-qPCR和scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 相关细胞的转录组，包含一代和二代细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 456 | 2024-08-04 |
Principled and interpretable alignability testing and integration of single-cell data
2024-Mar-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313719121
PMID:38416677
|
研究论文 | 该文章提出了一种可解释的单细胞数据对齐测试和集成的方法。 | 文章创新性地提出了SMAI框架，提供了严谨的统计检验以评估单细胞数据集的对齐能力，并保持数据结构的完整性。 | 现有方法缺乏对高维单细胞数据集是否可对齐的严格统计检验，并且在对齐过程中可能会严重扭曲数据。 | 研究旨在改进单细胞数据集成的方法，以提高分析的可靠性和可解释性。 | 本研究的对象是不同的单细胞数据集，包括真实和模拟的基准数据集。 | 数字病理学 | NA | 统计检验 | 谱流形对齐与推断框架 | 单细胞数据 | 多种真实和模拟的基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 457 | 2024-08-07 |
Adipocyte Precursor-Derived NRG1 Promotes Resistance to FGFR Inhibition in Urothelial Carcinoma
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1398
PMID:38175774
|
研究论文 | 本文研究了脂肪细胞前体衍生的NRG1如何促进尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗 | 发现脂肪细胞前体通过旁分泌方式促进对erdafitinib的抵抗，并揭示了NRG1通过激活ERBB3信号传导介导的抵抗机制 | NA | 探讨尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗机制 | 尿路上皮癌及其对FGFR抑制剂的抵抗 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 458 | 2024-08-07 |
Adipose Stromal Cell-Derived Cancer-Associated Fibroblasts Suppress FGFR Inhibitor Efficacy
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3904
PMID:38437636
|
研究论文 | 研究揭示了脂肪组织中的前体细胞通过分泌神经调节蛋白1（NRG1）激活HER3信号通路，导致尿路上皮癌对FGFR抑制剂erdafitinib产生耐药性 | 发现NRG1介导的FGFR抑制剂耐药性可通过pertuzumab抗体进行干预 | NA | 探讨脂肪组织来源的细胞如何影响癌症治疗效果 | 脂肪组织中的前体细胞及其在癌症治疗中的作用 | NA | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 459 | 2024-08-07 |
Deciphering the molecular and clinical characteristics of TREM2, HCST, and TYROBP in cancer immunity: A comprehensive pan-cancer study
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26993
PMID:38468942
|
研究论文 | 本研究全面分析了TREM2、HCST和TYROBP在多种癌症中的分子和临床特征，探讨了它们在肿瘤免疫治疗中的作用 | 首次进行了TREM2、HCST和TYROBP的泛癌分析，揭示了它们在免疫相关通路和巨噬细胞分化中的关键作用，并探讨了它们作为免疫治疗标志物的潜力 | NA | 探讨TREM2、HCST和TYROBP在肿瘤免疫治疗中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | TREM2、HCST和TYROBP在多种癌症中的分子和临床特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | mRNA表达数据 | 多种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 460 | 2024-08-07 |
A gene signature linked to fibroblast differentiation for prognostic prediction of mesothelioma
2024-Mar-10, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01180-7
PMID:38462627
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研究论文 | 本研究旨在通过分析与成纤维细胞分化相关的基因集，开发一种新的恶性间皮瘤分类和预后预测模型 | 本研究首次识别了六种成纤维细胞亚型和三种分化状态，并基于这些发现提出了新的分类和预后模型 | 研究结果需要在更多的临床样本中进行验证 | 开发一种新的恶性间皮瘤分类和预后预测模型 | 恶性间皮瘤的成纤维细胞分化相关基因 | 数字病理学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了来自NCBI-GEO, TCGA和MET-500数据库的数据，包括单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和骨转移肿瘤的RNA测序信息 | NA | NA | NA | NA |