单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 535 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals critical modulators of extracellular matrix of penile cavernous cells in erectile dysfunction
2024-03-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-56428-0
PMID:38467692
|
研究论文 | 这项研究揭示了勃起功能障碍（ED）中阴茎海绵细胞外基质的关键调节因子 | 该研究首次利用单细胞RNA测序描绘了ED中阴茎海绵细胞的转录组图谱，并揭示了细胞与细胞之间的相互作用 | 该研究可能未能完全阐明所有细胞类型之间的相互作用和复杂性 | 研究ED与细胞外基质（ECM）之间的关系 | 分析ED与非ED样本中82,554个海绵单细胞的转录组特征 | 数字病理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 82,554个海绵单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 442 | 2024-08-04 |
Combinatorial expression of γ-protocadherins regulates synaptic connectivity in the mouse neocortex
2024-Mar-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89532
PMID:38470230
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研究论文 | 本文研究了γ-protocadherins在小鼠新皮层突触连接中的作用 | 识别了组合性γ-protocadherin表达在突触连接中的关键角色 | 尚未探讨如何在其他类型神经元中应用这一发现 | 探讨突触形成过程中的连接选择机制 | 小鼠新皮层中的神经元 | 数字病理学 | NA | 5'端单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 443 | 2024-08-04 |
Differentiation is accompanied by a progressive loss in transcriptional memory
2024-Mar-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01846-9
PMID:38468285
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研究论文 | 本研究探讨了细胞分化过程中的转录记忆丧失与基因表达变异之间的关系 | 首次提供了关于相同细胞在分化早期阶段转录组分化速度的实验数据 | 研究主要集中在两种分化生物系统，可能限制了广泛应用性 | 研究细胞分化过程中转录记忆如何随着细胞分裂而丧失 | 人CD34+细胞和T2EC鸡初级红细胞前体 | 数字病理学 | NA | scRT-qPCR和scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 相关细胞的转录组，包含一代和二代细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 444 | 2024-08-04 |
Principled and interpretable alignability testing and integration of single-cell data
2024-Mar-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313719121
PMID:38416677
|
研究论文 | 该文章提出了一种可解释的单细胞数据对齐测试和集成的方法。 | 文章创新性地提出了SMAI框架，提供了严谨的统计检验以评估单细胞数据集的对齐能力，并保持数据结构的完整性。 | 现有方法缺乏对高维单细胞数据集是否可对齐的严格统计检验，并且在对齐过程中可能会严重扭曲数据。 | 研究旨在改进单细胞数据集成的方法，以提高分析的可靠性和可解释性。 | 本研究的对象是不同的单细胞数据集，包括真实和模拟的基准数据集。 | 数字病理学 | NA | 统计检验 | 谱流形对齐与推断框架 | 单细胞数据 | 多种真实和模拟的基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 445 | 2024-08-07 |
Adipocyte Precursor-Derived NRG1 Promotes Resistance to FGFR Inhibition in Urothelial Carcinoma
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1398
PMID:38175774
|
研究论文 | 本文研究了脂肪细胞前体衍生的NRG1如何促进尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗 | 发现脂肪细胞前体通过旁分泌方式促进对erdafitinib的抵抗，并揭示了NRG1通过激活ERBB3信号传导介导的抵抗机制 | NA | 探讨尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗机制 | 尿路上皮癌及其对FGFR抑制剂的抵抗 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 446 | 2024-08-07 |
Adipose Stromal Cell-Derived Cancer-Associated Fibroblasts Suppress FGFR Inhibitor Efficacy
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3904
PMID:38437636
|
研究论文 | 研究揭示了脂肪组织中的前体细胞通过分泌神经调节蛋白1（NRG1）激活HER3信号通路，导致尿路上皮癌对FGFR抑制剂erdafitinib产生耐药性 | 发现NRG1介导的FGFR抑制剂耐药性可通过pertuzumab抗体进行干预 | NA | 探讨脂肪组织来源的细胞如何影响癌症治疗效果 | 脂肪组织中的前体细胞及其在癌症治疗中的作用 | NA | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 447 | 2024-08-07 |
Deciphering the molecular and clinical characteristics of TREM2, HCST, and TYROBP in cancer immunity: A comprehensive pan-cancer study
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26993
PMID:38468942
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研究论文 | 本研究全面分析了TREM2、HCST和TYROBP在多种癌症中的分子和临床特征，探讨了它们在肿瘤免疫治疗中的作用 | 首次进行了TREM2、HCST和TYROBP的泛癌分析，揭示了它们在免疫相关通路和巨噬细胞分化中的关键作用，并探讨了它们作为免疫治疗标志物的潜力 | NA | 探讨TREM2、HCST和TYROBP在肿瘤免疫治疗中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | TREM2、HCST和TYROBP在多种癌症中的分子和临床特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | mRNA表达数据 | 多种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 448 | 2024-08-07 |
A gene signature linked to fibroblast differentiation for prognostic prediction of mesothelioma
2024-Mar-10, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01180-7
PMID:38462627
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研究论文 | 本研究旨在通过分析与成纤维细胞分化相关的基因集，开发一种新的恶性间皮瘤分类和预后预测模型 | 本研究首次识别了六种成纤维细胞亚型和三种分化状态，并基于这些发现提出了新的分类和预后模型 | 研究结果需要在更多的临床样本中进行验证 | 开发一种新的恶性间皮瘤分类和预后预测模型 | 恶性间皮瘤的成纤维细胞分化相关基因 | 数字病理学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了来自NCBI-GEO, TCGA和MET-500数据库的数据，包括单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和骨转移肿瘤的RNA测序信息 | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2024-08-07 |
Knocking down of Xkr8 enhances chemotherapy efficacy through modulating tumor immune microenvironment
2024-Mar-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.03.011
PMID:38471639
|
研究论文 | 本研究评估了通过调节肿瘤免疫微环境来增强化疗效果的策略，特别是通过敲低Xkr8与化疗联合治疗的效果。 | 本研究首次通过深度单细胞RNA测序揭示了Xkr8敲低如何影响肿瘤免疫微环境，并展示了其在增强化疗疗效中的应用。 | NA | 探讨Xkr8敲低与化疗联合治疗在增强抗肿瘤免疫反应和克服化疗免疫抵抗中的作用。 | Xkr8基因、化疗药物与肿瘤免疫微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals diverse B cell phenotypes in patients with anti-NMDAR encephalitis
2024-Mar, Psychiatry and clinical neurosciences
IF:5.0Q1
DOI:10.1111/pcn.13627
PMID:38063052
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、单细胞B细胞受体测序等技术，分析了抗NMDAR脑炎患者与对照组的B细胞表型差异 | 首次详细描述了抗NMDAR脑炎患者脑脊液和外周血中B细胞亚群的组成和转录组特征，并发现非DN细胞在体外能分化为DN细胞和抗体分泌细胞 | 需要进一步研究DN细胞亚群对抗NMDAR脑炎中NR1-IgG抗体产生的潜在贡献 | 探讨抗NMDAR脑炎患者B细胞亚群的表型特征 | 抗NMDAR脑炎患者和对照组的B细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞B细胞受体测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附测定 | NA | RNA, B细胞受体序列, 细胞 | 抗NMDAR脑炎患者和对照组的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2024-08-04 |
Integrated profiling identifies ferredoxin 1 as an immune-related biomarker of malignant phenotype in glioma
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26976
PMID:38463788
|
研究论文 | 本研究发现Ferredoxin 1 (FDX1)作为胶质瘤恶性表型的免疫相关生物标志物 | 揭示了FDX1在胶质瘤预后和肿瘤免疫浸润中的重要作用，尤其是与免疫相关信号通路的关联 | 对于FDX1在胶质瘤中的作用机制尚未进行深入的机制研究 | 探讨FDX1在胶质瘤中的预后意义及其与免疫细胞浸润的关系 | 胶质瘤样本及其临床病理特征 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 组织微阵列 (TMA) 和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 胶质瘤样本数量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2024-08-04 |
CLEC4E upregulation in gastric cancer: A potential therapeutic target correlating with tumor-associated macrophages
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27172
PMID:38463883
|
研究论文 | 本研究探讨了CLEC4E在胃癌中上调的作用及其与肿瘤相关巨噬细胞的关联 | 该研究首次揭示了CLEC4E在胃癌中的高表达与不良预后之间的关系，且CLEC4E可作为潜在的治疗靶点 | 该研究的局限性在于实验主要集中于体外研究，临床应用的验证尚需进一步的研究 | 研究CLEC4E在胃癌中的表达及其可能的治疗靶点 | 研究对象为胃癌样本及肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 人类胃癌样本及共培养模型 | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct transcriptomic profiles and evolutionary patterns in lung cancer brain metastasis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27071
PMID:38463784
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺癌脑转移的转录组特征和进化模式 | 揭示了脑转移肿瘤相较于淋巴结和原发肿瘤的更大转录组变化，并发现了特定的配体-受体对 | NA | 阐明肺癌脑转移的潜在机制并描述其转录组景观，以开发治疗干预措施 | 肺癌脑转移的转录组特征和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个不同的肺癌转移单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 454 | 2024-08-07 |
CDKN1A regulation on chondrogenic differentiation of human chondrocytes in osteoarthritis through single-cell and bulk sequencing analysis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27466
PMID:38463824
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量测序分析，验证了CDKN1A基因在骨关节炎（OA）中软骨细胞软骨形成分化的作用 | 首次结合单细胞和批量测序方法，探讨CDKN1A在OA软骨细胞软骨形成分化中的作用 | NA | 验证CDKN1A在OA软骨细胞软骨形成分化中的作用 | 人软骨细胞在骨关节炎中的软骨形成分化 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的三个RNA-seq数据集（GSE114007, GSE55235, GSE152805） | NA | NA | NA | NA |
| 455 | 2024-08-04 |
Interrogations of single-cell RNA splicing landscapes with SCASL define new cell identities with physiological relevance
2024-Mar-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46480-9
PMID:38461306
|
研究论文 | 本研究介绍了SCASL方法，以探讨单细胞RNA剪接的异质性并确定新的细胞身份 | SCASL方法解决了单细胞RNA剪接数据的偏见和稀疏覆盖问题，并提供了细胞身份分类的新方案 | 该方法的局限性尚未明确提及 | 研究单细胞RNA剪接的异质性及其与生理过程的关系 | 利用SCASL方法分析三阴性乳腺癌的潜在癌前和早期肿瘤阶段的细胞群体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用之前发布的数据集作为例子 | NA | NA | NA | NA |
| 456 | 2024-08-04 |
Transcriptome and single-cell transcriptomics reveal prognostic value and potential mechanism of anoikis in skin cutaneous melanoma
2024-Mar-09, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-024-00926-0
PMID:38460046
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研究论文 | 本文探讨了皮肤黑色素瘤中anoikis的预后价值和作用机制 | 建立了一种基于anoikis的新分类系统，并发现FASLG基因在耗竭的CD8(+) T细胞中的高表达与预后相关 | 样本量和临床数据的局限性可能影响结果的普适性 | 研究anoikis在皮肤黑色素瘤中的预后价值及其作用机制 | 研究对象为皮肤黑色素瘤的样本，特别是与anoikis相关的基因 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 457 | 2024-08-07 |
[Analysis of the differences in the characteristics of mesenchymal stem cells derived from jaw and long bones based on single-cell RNA-sequencing]
2024-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 研究下颌骨和大腿骨骨髓细胞组成，分析这两种组织来源的间充质干细胞（MSCs）的异质性，探讨不同来源骨MSCs功能特性的差异 | 使用单细胞RNA测序技术分析下颌骨和大腿骨骨髓细胞组成，揭示了下颌骨来源的MSCs（M-MSCs）和大腿骨来源的MSCs（F-MSCs）在基因表达模式和上调信号通路上的显著差异 | NA | 探索不同来源骨MSCs功能特性的差异 | 下颌骨和大腿骨来源的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 下颌骨和大腿骨的骨髓细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 458 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome reveals a novel mechanism of C-Kit+-liver sinusoidal endothelial cells in NASH
2024-Mar-09, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01215-7
PMID:38461242
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了C-Kit+肝窦内皮细胞在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的新型机制 | 发现了C-Kit+肝窦内皮细胞在NASH中的异质性和复杂性，并确认了其通过恢复Pink1相关线粒体自噬来促进NASH进展的作用 | NA | 理解肝窦内皮细胞（LSECs）如何响应非酒精性脂肪性肝炎（NASH） | C-Kit+肝窦内皮细胞的功能及其在NASH中的作用 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 来自对照组和MCD饮食喂养小鼠的肝脏单个LSEC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 459 | 2024-08-04 |
scFSNN: a feature selection method based on neural network for single-cell RNA-seq data
2024-Mar-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10160-1
PMID:38459442
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研究论文 | 提出了一种基于神经网络的特征选择方法scFSNN，用于单细胞RNA测序数据的分类问题 | scFSNN可以在模型训练过程中自动选择特征并控制假发现率，还能够自适应确定要消除的特征数量 | NA | 解决单细胞RNA测序数据的分类问题 | 单细胞RNA测序数据中的基因特征 | 机器学习 | NA | NA | 神经网络 | 基因表达数据 | 进行了广泛的模拟和真实数据研究 | NA | NA | NA | NA |
| 460 | 2024-08-07 |
Integrated analysis reveals FLI1 regulates the tumor immune microenvironment via its cell-type-specific expression and transcriptional regulation of distinct target genes of immune cells in breast cancer
2024-Mar-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10174-9
PMID:38448802
|
研究论文 | 本文通过综合分析揭示了FLI1在乳腺癌中通过其细胞类型特异性表达和转录调控免疫细胞的不同靶基因来调节肿瘤免疫微环境 | 本文通过SMR分析和ncRNA网络构建，以及单细胞RNA测序数据的整合分析，验证了FLI1甲基化到基因表达再到乳腺癌发生的因果途径，并构建了以FLI1为中心的ceRNA网络 | NA | 探讨FLI1在乳腺癌中的具体作用及其在免疫调节中的角色 | FLI1在乳腺癌中的表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | GWAS, eQTLs, mQTLs, scRNA-seq | NA | 基因组数据, 表达数据, 甲基化数据, 单细胞RNA测序数据 | 使用乳腺癌基因组关联研究总结数据，血液中的表达数量性状位点和DNA甲基化数量性状位点，以及一系列的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |