单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 549 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-07 |
Decoding gene regulatory circuitry underlying TNBC chemoresistance reveals biomarkers for therapy response and therapeutic targets
2024-Mar-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00529-6
PMID:38472332
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据，揭示了三阴性乳腺癌（TNBC）化疗耐药性的基因调控机制，并发现了潜在的治疗反应生物标志物和治疗靶点 | 本研究首次通过单细胞转录组数据和全基因组H3K27ac标记映射，揭示了TNBC化疗耐药性的表观遗传和转录因子网络 | NA | 揭示三阴性乳腺癌化疗耐药性的分子机制，并发现新的治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者及其化疗耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 422 | 2024-08-04 |
Mefloquine enhances the efficacy of anti-PD-1 immunotherapy via IFN-γ-STAT1-IRF1-LPCAT3-induced ferroptosis in tumors
2024-Mar-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008554
PMID:38471712
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研究论文 | 本研究探讨了美氟喹如何通过IFN-γ-STAT1-IRF1-LPCAT3诱导肿瘤中的铁死亡来增强抗PD-1免疫疗法的疗效 | 发现美氟喹通过激活IFN-γ诱导的STAT1-IRF1信号通路来调节LPCAT3的表达，这一机制尚未被阐明 | 本研究未提供不同肿瘤类型的广泛比较数据 | 探讨美氟喹增强抗PD-1免疫疗法的机制 | 研究对象包括黑色素瘤和肺癌细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤与肺癌 | RNA测序、实时定量PCR、蛋白质印迹、染色质免疫沉淀-qPCR | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 临床数据分析涉及黑色素瘤患者与对照个体，具体样本大小未明确 |
| 423 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals critical modulators of extracellular matrix of penile cavernous cells in erectile dysfunction
2024-03-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-56428-0
PMID:38467692
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研究论文 | 这项研究揭示了勃起功能障碍（ED）中阴茎海绵细胞外基质的关键调节因子 | 该研究首次利用单细胞RNA测序描绘了ED中阴茎海绵细胞的转录组图谱，并揭示了细胞与细胞之间的相互作用 | 该研究可能未能完全阐明所有细胞类型之间的相互作用和复杂性 | 研究ED与细胞外基质（ECM）之间的关系 | 分析ED与非ED样本中82,554个海绵单细胞的转录组特征 | 数字病理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 82,554个海绵单细胞 |
| 424 | 2024-08-07 |
Tetrahedral DNA loaded siCCR2 restrains M1 macrophage polarization to ameliorate pulmonary fibrosis in chemoradiation-induced murine model
2024-Mar-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.01.022
PMID:38273656
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研究论文 | 本文通过结合化学疗法和放射疗法，构建了一种模拟人类特发性肺纤维化（IPF）的小鼠模型，并研究了四面体DNA负载的siCCR2对M1巨噬细胞极化的抑制作用，从而减轻肺纤维化。 | 本文首次合成了带有四重ccr2-siRNA的四面体框架核酸（FNA-siCCR2），成功阻止了IPF小鼠模型中巨噬细胞在肺实质的积累，从而防止了肌成纤维细胞的激活和疾病的进展。 | 本文的局限性在于缺乏适当的动物模型，导致对巨噬细胞连续极化的研究不足。 | 研究旨在开发一种新的IPF小鼠模型，揭示M1巨噬细胞作为潜在的治疗靶点，并建立使用FNA-siCCR2的新治疗策略。 | 研究对象包括特发性肺纤维化（IPF）、M1巨噬细胞、肌成纤维细胞和四面体DNA负载的siCCR2。 | NA | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | RNA | 小鼠模型和IPF患者 |
| 425 | 2024-08-07 |
Gasdermin E promotes translocation of p65 and c-jun into nucleus in keratinocytes for progression of psoriatic skin inflammation
2024-Mar-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06545-5
PMID:38429278
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研究论文 | 本文研究了Gasdermin E (GSDME)在角质形成细胞中通过促进p65和c-jun的核转位，参与银屑病皮肤炎症进展的作用。 | 首次揭示了GSDME在角质形成细胞中通过非焦亡途径促进p65和c-jun的核转位，参与银屑病的发病和进展。 | NA | 探讨GSDME在银屑病皮肤炎症中的作用及其潜在的分子机制。 | 角质形成细胞中的GSDME及其在银屑病中的作用。 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 使用了GEO数据库中的数据集，以及咪喹莫特(IMQ)诱导的银屑病样皮肤病小鼠模型。 |
| 426 | 2024-08-04 |
Combinatorial expression of γ-protocadherins regulates synaptic connectivity in the mouse neocortex
2024-Mar-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89532
PMID:38470230
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研究论文 | 本文研究了γ-protocadherins在小鼠新皮层突触连接中的作用 | 识别了组合性γ-protocadherin表达在突触连接中的关键角色 | 尚未探讨如何在其他类型神经元中应用这一发现 | 探讨突触形成过程中的连接选择机制 | 小鼠新皮层中的神经元 | 数字病理学 | NA | 5'端单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-08-04 |
Differentiation is accompanied by a progressive loss in transcriptional memory
2024-Mar-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01846-9
PMID:38468285
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研究论文 | 本研究探讨了细胞分化过程中的转录记忆丧失与基因表达变异之间的关系 | 首次提供了关于相同细胞在分化早期阶段转录组分化速度的实验数据 | 研究主要集中在两种分化生物系统，可能限制了广泛应用性 | 研究细胞分化过程中转录记忆如何随着细胞分裂而丧失 | 人CD34+细胞和T2EC鸡初级红细胞前体 | 数字病理学 | NA | scRT-qPCR和scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 相关细胞的转录组，包含一代和二代细胞 |
| 428 | 2024-08-07 |
Rejuvenated iPSC-derived GD2-directed CART Cells Harbor Robust Cytotoxicity Against Small Cell Lung Cancer
2024-Mar-11, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0259
PMID:38380966
|
研究论文 | 本文研究了通过引入GD2-CAR到诱导多能干细胞（iPSC）衍生的 rejuvenated 细胞毒性T淋巴细胞（GD2-CARrejT）来增强针对小细胞肺癌（SCLC）的GD2-CART细胞的细胞毒性。 | 本文创新性地使用iPSC衍生的 rejuvenated 细胞毒性T淋巴细胞（GD2-CARrejT），其在体外和体内对SCLC细胞的细胞毒性显著强于传统的GD2-CART细胞。 | NA | 旨在增强GD2-CART细胞对小细胞肺癌的细胞毒性。 | 研究对象为小细胞肺癌（SCLC）细胞和GD2-CART细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CAR T细胞 | RNA | NA |
| 429 | 2024-08-04 |
Principled and interpretable alignability testing and integration of single-cell data
2024-Mar-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313719121
PMID:38416677
|
研究论文 | 该文章提出了一种可解释的单细胞数据对齐测试和集成的方法。 | 文章创新性地提出了SMAI框架，提供了严谨的统计检验以评估单细胞数据集的对齐能力，并保持数据结构的完整性。 | 现有方法缺乏对高维单细胞数据集是否可对齐的严格统计检验，并且在对齐过程中可能会严重扭曲数据。 | 研究旨在改进单细胞数据集成的方法，以提高分析的可靠性和可解释性。 | 本研究的对象是不同的单细胞数据集，包括真实和模拟的基准数据集。 | 数字病理学 | NA | 统计检验 | 谱流形对齐与推断框架 | 单细胞数据 | 多种真实和模拟的基准数据集 |
| 430 | 2024-08-07 |
Adipocyte Precursor-Derived NRG1 Promotes Resistance to FGFR Inhibition in Urothelial Carcinoma
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1398
PMID:38175774
|
研究论文 | 本文研究了脂肪细胞前体衍生的NRG1如何促进尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗 | 发现脂肪细胞前体通过旁分泌方式促进对erdafitinib的抵抗，并揭示了NRG1通过激活ERBB3信号传导介导的抵抗机制 | NA | 探讨尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗机制 | 尿路上皮癌及其对FGFR抑制剂的抵抗 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 431 | 2024-08-07 |
Adipose Stromal Cell-Derived Cancer-Associated Fibroblasts Suppress FGFR Inhibitor Efficacy
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3904
PMID:38437636
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研究论文 | 研究揭示了脂肪组织中的前体细胞通过分泌神经调节蛋白1（NRG1）激活HER3信号通路，导致尿路上皮癌对FGFR抑制剂erdafitinib产生耐药性 | 发现NRG1介导的FGFR抑制剂耐药性可通过pertuzumab抗体进行干预 | NA | 探讨脂肪组织来源的细胞如何影响癌症治疗效果 | 脂肪组织中的前体细胞及其在癌症治疗中的作用 | NA | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 432 | 2024-08-07 |
Molecular and Spatial Signatures of Mouse Embryonic Endothelial Cells at Single-Cell Resolution
2024-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323956
PMID:38348657
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和多重错误鲁棒荧光原位杂交技术，研究了小鼠胚胎内皮细胞在单细胞分辨率下的分子和空间特征。 | 首次在单细胞分辨率下绘制了胚胎内皮细胞异质性的时空图，并揭示了内皮细胞多样性源于组织起源和血管床位置的双重影响。 | NA | 研究胚胎血管系统发育过程中内皮细胞异质性的建立，特别是动脉和静脉内皮细胞的特化。 | 小鼠胚胎内皮细胞及其前体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 转录组 | 7682个E9.5至E15.5的内皮细胞，15448个内皮细胞的空间转录组分析 |
| 433 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the links between the metabolic heterogeneity and cell identity in NBM and AML
2024-Mar, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19233
PMID:38009537
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 434 | 2024-08-04 |
Exploration of immune cell heterogeneity by single-cell RNA sequencing and identification of secretory leukocyte protease inhibitor as an oncogene in pancreatic cancer
2024-Mar-13, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24200
PMID:38476085
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索胰腺癌的免疫细胞异质性，并确定分泌性白细胞蛋白酶抑制因子作为一种癌基因。 | 本研究通过发现胰腺癌微环境中八种细胞亚群及其异质性，并识别SLPI为潜在的治疗靶点，具有创新性。 | 研究中未提及样本的临床特征及长期随访数据的相关性。 | 本研究旨在理解胰腺癌的肿瘤微环境及其细胞异质性。 | 研究对象为胰腺癌患者的肿瘤微环境中的细胞亚群。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 435 | 2024-08-07 |
Prediction of potential targets and toxicological insights of Astragalus in liver cancer based on network pharmacology: Integrating systems biology, drug interaction networks, and toxicological perspectives
2024-Mar-13, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24189
PMID:38476113
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研究论文 | 本研究利用网络药理学方法探讨黄芪在肝癌治疗中的潜在靶点和毒理学见解 | 本研究通过网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接等先进技术，深入分析了黄芪在肝癌治疗中的分子和细胞机制 | NA | 探索黄芪作为肝癌治疗新疗法的潜在靶点和毒理学见解 | 黄芪在肝癌治疗中的作用及其分子和细胞机制 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq | UMAP, tSNE | 基因表达数据 | 涉及20个上调基因和20个下调基因的样本 |
| 436 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic sequencing identifies subcutaneous patient-derived xenograft recapitulated medulloblastoma
2024-Mar-13, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12399
PMID:38477441
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序比较了皮下患者源性异种移植（sPDX）、颅内患者源性异种移植（iPDX）和遗传工程小鼠模型（GEMM）在髓母细胞瘤（MB）中的重现性 | 首次在单细胞水平上比较了髓母细胞瘤的实验模型，为不同研究目的的模型选择提供了有价值的见解 | NA | 比较不同模型在髓母细胞瘤中的重现性，以促进肿瘤发生机制的研究 | 髓母细胞瘤（MB）的皮下患者源性异种移植（sPDX）、颅内患者源性异种移植（iPDX）和遗传工程小鼠模型（GEMM） | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从六名患者中获得了初级人类音猬因子（SHH）和3组（G3）MB样本，每个患者样本分别开发了两个sPDX和iPDX模型，还包括三个Patch+/- GEMM模型进行测序 |
| 437 | 2024-08-07 |
Deciphering the molecular and clinical characteristics of TREM2, HCST, and TYROBP in cancer immunity: A comprehensive pan-cancer study
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26993
PMID:38468942
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研究论文 | 本研究全面分析了TREM2、HCST和TYROBP在多种癌症中的分子和临床特征，探讨了它们在肿瘤免疫治疗中的作用 | 首次进行了TREM2、HCST和TYROBP的泛癌分析，揭示了它们在免疫相关通路和巨噬细胞分化中的关键作用，并探讨了它们作为免疫治疗标志物的潜力 | NA | 探讨TREM2、HCST和TYROBP在肿瘤免疫治疗中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | TREM2、HCST和TYROBP在多种癌症中的分子和临床特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | mRNA表达数据 | 多种癌症类型 |
| 438 | 2024-08-07 |
A gene signature linked to fibroblast differentiation for prognostic prediction of mesothelioma
2024-Mar-10, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01180-7
PMID:38462627
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研究论文 | 本研究旨在通过分析与成纤维细胞分化相关的基因集，开发一种新的恶性间皮瘤分类和预后预测模型 | 本研究首次识别了六种成纤维细胞亚型和三种分化状态，并基于这些发现提出了新的分类和预后模型 | 研究结果需要在更多的临床样本中进行验证 | 开发一种新的恶性间皮瘤分类和预后预测模型 | 恶性间皮瘤的成纤维细胞分化相关基因 | 数字病理学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了来自NCBI-GEO, TCGA和MET-500数据库的数据，包括单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和骨转移肿瘤的RNA测序信息 |
| 439 | 2024-08-07 |
Knocking down of Xkr8 enhances chemotherapy efficacy through modulating tumor immune microenvironment
2024-Mar-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.03.011
PMID:38471639
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研究论文 | 本研究评估了通过调节肿瘤免疫微环境来增强化疗效果的策略，特别是通过敲低Xkr8与化疗联合治疗的效果。 | 本研究首次通过深度单细胞RNA测序揭示了Xkr8敲低如何影响肿瘤免疫微环境，并展示了其在增强化疗疗效中的应用。 | NA | 探讨Xkr8敲低与化疗联合治疗在增强抗肿瘤免疫反应和克服化疗免疫抵抗中的作用。 | Xkr8基因、化疗药物与肿瘤免疫微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 440 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals diverse B cell phenotypes in patients with anti-NMDAR encephalitis
2024-Mar, Psychiatry and clinical neurosciences
IF:5.0Q1
DOI:10.1111/pcn.13627
PMID:38063052
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、单细胞B细胞受体测序等技术，分析了抗NMDAR脑炎患者与对照组的B细胞表型差异 | 首次详细描述了抗NMDAR脑炎患者脑脊液和外周血中B细胞亚群的组成和转录组特征，并发现非DN细胞在体外能分化为DN细胞和抗体分泌细胞 | 需要进一步研究DN细胞亚群对抗NMDAR脑炎中NR1-IgG抗体产生的潜在贡献 | 探讨抗NMDAR脑炎患者B细胞亚群的表型特征 | 抗NMDAR脑炎患者和对照组的B细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞B细胞受体测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附测定 | NA | RNA, B细胞受体序列, 细胞 | 抗NMDAR脑炎患者和对照组的样本 |