单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 537 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-07 |
Tumor-infiltrating CD8+ sub-populations in primary and recurrent glioblastoma: An in-silico study
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27329
PMID:38495199
|
研究论文 | 研究分析了原发性和复发性胶质母细胞瘤中肿瘤浸润性CD8+ T细胞的亚群，并探讨了其在肿瘤微环境中的作用 | 提供了原发性和复发性胶质母细胞瘤中CD8+ TILs亚群的详细图谱，为未来的精准免疫治疗提供了概念验证 | NA | 研究CD8+ TILs亚群在原发性和复发性胶质母细胞瘤中的分布及其在肿瘤微环境中的作用 | 原发性和复发性胶质母细胞瘤中的肿瘤浸润性CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 402 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes reveal the heterogeneity and microenvironment of vestibular schwannoma
2024-03-04, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad201
PMID:37862593
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了前庭神经鞘瘤的异质性和微环境 | 首次在单细胞水平上揭示了前庭神经鞘瘤的微环境，并发现了与快速生长相关的特定细胞亚群 | 研究仅限于少数样本，可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 探究前庭神经鞘瘤的细胞异质性和微环境，以增进对该疾病临床表型的理解 | 前庭神经鞘瘤及其正常神经样本 | 数字病理学 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 7个前庭神经鞘瘤样本和2个正常神经样本 |
| 403 | 2024-08-07 |
5 signature genes revealed by single-cell profiling identified unique immune subtypes affecting the prognosis of ovarian cancer
2024-Mar, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202403_35618
PMID:38497886
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据识别出五个与卵巢癌预后相关的标志性基因，并据此将患者分为五个亚型，分析了各亚型的临床预后和治疗反应 | 首次通过单细胞测序数据识别出五个影响卵巢癌预后的标志性基因，并据此进行患者亚型分类，为临床决策提供指导 | NA | 旨在识别预测卵巢癌临床预后的生物标志物，特别是针对免疫治疗和化疗的预后分组 | 卵巢癌患者的基因标志物和预后亚型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 共识聚类 | 基因表达数据 | TCGA-OV数据库中的患者样本 |
| 404 | 2024-08-04 |
Mast cell activation disrupts interactions between endothelial cells and pericytes during early life allergic asthma
2024-Mar-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173676
PMID:38487999
|
研究论文 | 这篇文章研究了过敏性哮喘如何影响早期生命小鼠的肺微循环 | 揭示了肥大细胞激活如何通过蛋白酶破坏内皮细胞与周细胞之间的相互作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚需在人类样本中验证 | 探讨过敏性哮喘对早期生命肺微循环的影响 | 新生小鼠肺脏切片以及儿童哮喘支气管活检样本 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 定量成像与空间转录组学 | NA | 图像和生物样本 | 新生小鼠肺脏切片与儿童哮喘的支气管活检样本 |
| 405 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing shows mosaic aneuploidy in most human embryos
2024-Mar-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179134
PMID:38488008
|
研究论文 | 该文章探讨了人类胚胎中的马赛克非整倍体现象，指出这一现象在大多数胚胎中普遍存在 | 提供了单细胞基因组测序数据，严谨评估了健康人类IVF胚胎中马赛克非整倍体的发生率和程度 | 研究未探讨非整倍体对胚胎结果的具体临床后果 | 旨在评估人类IVF胚胎中马赛克非整倍体现象的普遍性及其影响 | 健康的人类体外受精（IVF）胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 至少80%的胚胎样本 |
| 406 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-sequencing of cellular heterogeneity and pathogenic mechanisms in paraquat-induced Parkinson's disease with depression
2024-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116169
PMID:38447518
|
研究论文 | 本研究探讨了对于帕金森病合并抑郁症的小鼠模型中细胞异质性及其病理机制的单细胞RNA测序分析 | 揭示了特定的谷氨酸能神经元群体在帕金森病合并抑郁症进展中的作用并建立了全面的基因表达图谱 | 该研究主要依赖小鼠模型，可能无法完全推导到人类疾病的复杂性 | 全面研究在帕金森病背景下抑郁症进展的细胞异质性和机制 | 以PQ诱导的帕金森病合并抑郁症小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了多只小鼠进行实验 |
| 407 | 2024-08-04 |
Single-cell and multi-omics analyses highlight cancer-associated fibroblasts-induced immune evasion and epithelial mesenchymal transition for smoking bladder cancer
2024-Mar-15, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2024.153782
PMID:38493947
|
研究论文 | 研究揭示了吸烟膀胱癌中癌相关成纤维细胞诱导的免疫逃逸和上皮-间质转化的机制 | 构建了一个新的预后标志，并识别了33个与烟草致癌物相关的关键基因 | 对烟草致癌物及其在膀胱癌预后中的具体功能尚缺乏深入阐述 | 系统评估烟草致癌物对膀胱癌预后的影响 | 膀胱癌特异性烟草致癌物相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，癌基因组分析 | 基因×基因交互模型 | 基因数据 | 来自南京膀胱癌队列和TCGA数据库的基因数据 |
| 408 | 2024-08-04 |
Highly sensitive spatial transcriptomics using FISHnCHIPs of multiple co-expressed genes
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46669-y
PMID:38491027
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FISHnCHIPs的技术，用于高度灵敏的细胞类型和基因表达程序的原位剖析 | FISHnCHIPs能够同时成像~2-35个共同表达的基因，具有~2-20倍于单基因FISH的灵敏度 | 未在摘要中提到具体的局限性 | 旨在提高组织样本的空间转录组学分析的灵敏度 | 涉及鼠类肾脏和脑部的组织样本，以及人类结直肠癌活检样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | FISH | NA | 组织样本 | 分析了多个鼠类样本和一个人类活检样本 |
| 409 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-Mar-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-08-07 |
Autophagy regulates the maturation of hematopoietic precursors in the embryo
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46453-y
PMID:38490977
|
研究论文 | 本文研究了自噬在胚胎造血前体细胞成熟过程中的作用 | 首次揭示了自噬在胚胎造血前体细胞成熟中的作用，并探讨了自噬相关基因Atg5在血管内皮细胞中的缺失对内皮到造血转变的影响 | NA | 理解调控胚胎造血干细胞发育的机制，促进其再生 | 胚胎造血前体细胞和造血干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LC3-RFP-EGFP小鼠模型 |
| 411 | 2024-08-07 |
Sex disparities revealed by single-cell and bulk sequencing and their impacts on the efficacy of immunotherapy in esophageal cancer
2024-Mar-15, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-024-00598-z
PMID:38491510
|
研究论文 | 本研究探讨了性别差异对食管癌免疫治疗效果的影响，通过单细胞和批量测序技术揭示了性别在免疫抑制肿瘤微环境中的作用 | 首次系统地描述了食管癌中性别相关的基因组和细胞差异，并构建了一个性别相关的预测免疫治疗效果的特征 | 研究结果主要基于回顾性数据，未来需要前瞻性研究来验证这些发现 | 探索性别差异对食管癌免疫治疗效果的影响及其分子基础 | 食管癌患者及其免疫治疗效果 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 基因组数据，免疫细胞数据 | 2360名食管癌患者，1425个样本，105,145个免疫细胞 |
| 412 | 2024-08-04 |
Large-scale single-cell profiling of stem cells uncovers redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2024-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.04.583414
PMID:38496543
|
研究论文 | 本文揭示了在植物茎尖干细胞中表达的冗余调控因子，这对于提高作物产量具有重要意义 | 首次对玉米和拟南芥的茎尖干细胞进行了大规模单细胞RNA测序，识别出保守的干细胞调控因子 | 在现有单细胞分析中，植物茎尖干细胞的获取和调控因子的检测存在困难 | 研究植物茎尖干细胞中的调控因子，以促进作物工程提升生产力 | 玉米和拟南芥的茎尖干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自玉米和拟南芥的成千上万的干细胞表达细胞 |
| 413 | 2024-08-07 |
Histone Trimethylations and HDAC5 Regulate Spheroid Subpopulation and Differentiation Signaling of Human Adipose-Derived Stem Cells
2024-Mar-15, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad090
PMID:38173411
|
研究论文 | 本文研究了人类脂肪干细胞（ASCs）球状体形成的表观遗传调控及其信号协调机制 | 发现了H3K4me3、H3K9me3和HDAC5在干细胞命运和定向分化中的关键作用 | NA | 揭示ASCs球状体形成的细胞命运和分化机制 | 人类脂肪干细胞（ASCs）及其球状体 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用10x Genomics平台分析了ASCs球状体 |
| 414 | 2024-08-07 |
Decoding the Cell Atlas and Inflammatory Features of Human Intracranial Aneurysm Wall by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Mar-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.032456
PMID:38390814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人颅内动脉瘤壁的细胞图谱和炎症特征 | 首次在颅内动脉瘤壁中鉴定出具有ABCC9和HIGD1B特征的周细胞，并通过机器学习算法证实了巨噬细胞与动脉瘤破裂的关联 | NA | 深入了解颅内动脉瘤壁的细胞结构和炎症特征，为未破裂动脉瘤的治疗提供新思路 | 破裂和未破裂的人颅内动脉瘤壁 | 数字病理学 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA | 21,332个合格细胞，以及126名患者的血清学结果 |
| 415 | 2024-08-04 |
TISSUE: uncertainty-calibrated prediction of single-cell spatial transcriptomics improves downstream analyses
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02184-y
PMID:38347138
|
研究论文 | 本文提出了一种新框架TISSUE，用于评估空间基因表达预测的不确定性，改善下游分析 | TISSUE框架利用保形推断提供良好校准的预测区间，并减少差异基因表达分析中的假发现率 | 未提及具体的局限性 | 提高单细胞空间转录组学预测的准确性及其下游分析 | 对小鼠成年人侧脑室区域的MERFISH空间转录组数据进行分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 11个基准数据集及一个小鼠数据集 |
| 416 | 2024-08-04 |
Correcting PCR amplification errors in unique molecular identifiers to generate accurate numbers of sequencing molecules
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02168-y
PMID:38317008
|
研究论文 | 本研究探讨了PCR扩增误差对RNA分子绝对计数的准确性影响。 | 研究展示了一种使用同聚三聚体核苷酸块合成唯一分子标识符的方法，以纠正PCR错误并实现精确计数。 | 研究未提及样本数量及多样性限制。 | 探讨PCR扩增误差对RNA分子计数准确性的影响。 | 研究对象为RNA分子及其测序数据。 | 数字病理 | NA | PCR | NA | RNA数据 | NA |
| 417 | 2024-08-04 |
In situ single-cell profiling sheds light on IFI27 localisation during SARS-CoV-2 infection
2024-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105016
PMID:38377798
|
研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组技术描绘了SARS-CoV-2感染期间的免疫反应 | 首次识别了在感染部位M1巨噬细胞中IFI27的高表达 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染下的免疫反应 | 感染部位的M1巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-08-07 |
Amphiregulin switches progenitor cell fate for lineage commitment during gastric mucosal regeneration
2024-Mar-14, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.03.009
PMID:38492892
|
研究论文 | 研究胃黏膜再生过程中，Amphiregulin如何调控前体细胞的谱系承诺 | 首次揭示了Amphiregulin在胃黏膜再生中对前体细胞谱系承诺的调控作用 | NA | 探讨胃黏膜损伤后前体细胞微环境的调控机制 | 胃黏膜中的Isthmic前体细胞及其在再生过程中的谱系承诺 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胃黏膜上皮细胞 |
| 419 | 2024-08-04 |
BANKSY unifies cell typing and tissue domain segmentation for scalable spatial omics data analysis
2024-Mar, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01664-3
PMID:38413725
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为BANKSY的算法，用于统一细胞类型和组织区域的空间聚类问题 | 通过将细胞嵌入到自身和局部邻域转录组的乘积空间中，BANKSY提供了一种新的空间特征增强策略，显著提高了任务性能 | NA | 研究旨在提供一种准确且可扩展的框架，以分析空间分辨的组学数据 | 主要研究对象为细胞类型和组织域在空间组学数据中的聚类 | 数字病理学 | NA | RNA测序，蛋白质成像 | NA | RNA和蛋白质图像数据 | 数百万个细胞数据集 |
| 420 | 2024-08-07 |
The platelet-related genes associated with the prognosis of HCC by regulating cycling T cell and prolif-TAMs
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26798
PMID:38486758
|
研究论文 | 本研究通过TCGA和ICGC数据库分析了92个与肝细胞癌（HCC）相关的差异表达的血小板相关基因（PRGs），并开发了PRGs预后标志物，揭示了这些基因在HCC中的潜在机制。 | 首次详细探讨了血小板相关基因在HCC中的预后价值及其对免疫微环境的调控作用。 | 研究主要基于数据库分析，需要进一步的实验验证。 | 构建与HCC相关的血小板相关基因风险标志物，并揭示其调控免疫微环境的潜在机制。 | 血小板相关基因在HCC中的表达及其预后价值。 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 92个差异表达的血小板相关基因 |