单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 540 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-04 |
Single-cell and multi-omics analyses highlight cancer-associated fibroblasts-induced immune evasion and epithelial mesenchymal transition for smoking bladder cancer
2024-Mar-15, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2024.153782
PMID:38493947
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研究论文 | 研究揭示了吸烟膀胱癌中癌相关成纤维细胞诱导的免疫逃逸和上皮-间质转化的机制 | 构建了一个新的预后标志，并识别了33个与烟草致癌物相关的关键基因 | 对烟草致癌物及其在膀胱癌预后中的具体功能尚缺乏深入阐述 | 系统评估烟草致癌物对膀胱癌预后的影响 | 膀胱癌特异性烟草致癌物相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，癌基因组分析 | 基因×基因交互模型 | 基因数据 | 来自南京膀胱癌队列和TCGA数据库的基因数据 |
| 402 | 2024-08-04 |
Highly sensitive spatial transcriptomics using FISHnCHIPs of multiple co-expressed genes
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46669-y
PMID:38491027
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FISHnCHIPs的技术，用于高度灵敏的细胞类型和基因表达程序的原位剖析 | FISHnCHIPs能够同时成像~2-35个共同表达的基因，具有~2-20倍于单基因FISH的灵敏度 | 未在摘要中提到具体的局限性 | 旨在提高组织样本的空间转录组学分析的灵敏度 | 涉及鼠类肾脏和脑部的组织样本，以及人类结直肠癌活检样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | FISH | NA | 组织样本 | 分析了多个鼠类样本和一个人类活检样本 |
| 403 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-Mar-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-08-07 |
Autophagy regulates the maturation of hematopoietic precursors in the embryo
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46453-y
PMID:38490977
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研究论文 | 本文研究了自噬在胚胎造血前体细胞成熟过程中的作用 | 首次揭示了自噬在胚胎造血前体细胞成熟中的作用，并探讨了自噬相关基因Atg5在血管内皮细胞中的缺失对内皮到造血转变的影响 | NA | 理解调控胚胎造血干细胞发育的机制，促进其再生 | 胚胎造血前体细胞和造血干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LC3-RFP-EGFP小鼠模型 |
| 405 | 2024-08-07 |
Sex disparities revealed by single-cell and bulk sequencing and their impacts on the efficacy of immunotherapy in esophageal cancer
2024-Mar-15, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-024-00598-z
PMID:38491510
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研究论文 | 本研究探讨了性别差异对食管癌免疫治疗效果的影响，通过单细胞和批量测序技术揭示了性别在免疫抑制肿瘤微环境中的作用 | 首次系统地描述了食管癌中性别相关的基因组和细胞差异，并构建了一个性别相关的预测免疫治疗效果的特征 | 研究结果主要基于回顾性数据，未来需要前瞻性研究来验证这些发现 | 探索性别差异对食管癌免疫治疗效果的影响及其分子基础 | 食管癌患者及其免疫治疗效果 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 基因组数据，免疫细胞数据 | 2360名食管癌患者，1425个样本，105,145个免疫细胞 |
| 406 | 2024-08-04 |
Large-scale single-cell profiling of stem cells uncovers redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2024-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.04.583414
PMID:38496543
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研究论文 | 本文揭示了在植物茎尖干细胞中表达的冗余调控因子，这对于提高作物产量具有重要意义 | 首次对玉米和拟南芥的茎尖干细胞进行了大规模单细胞RNA测序，识别出保守的干细胞调控因子 | 在现有单细胞分析中，植物茎尖干细胞的获取和调控因子的检测存在困难 | 研究植物茎尖干细胞中的调控因子，以促进作物工程提升生产力 | 玉米和拟南芥的茎尖干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自玉米和拟南芥的成千上万的干细胞表达细胞 |
| 407 | 2024-08-07 |
Histone Trimethylations and HDAC5 Regulate Spheroid Subpopulation and Differentiation Signaling of Human Adipose-Derived Stem Cells
2024-Mar-15, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad090
PMID:38173411
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研究论文 | 本文研究了人类脂肪干细胞（ASCs）球状体形成的表观遗传调控及其信号协调机制 | 发现了H3K4me3、H3K9me3和HDAC5在干细胞命运和定向分化中的关键作用 | NA | 揭示ASCs球状体形成的细胞命运和分化机制 | 人类脂肪干细胞（ASCs）及其球状体 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用10x Genomics平台分析了ASCs球状体 |
| 408 | 2024-08-07 |
Decoding the Cell Atlas and Inflammatory Features of Human Intracranial Aneurysm Wall by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Mar-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.032456
PMID:38390814
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人颅内动脉瘤壁的细胞图谱和炎症特征 | 首次在颅内动脉瘤壁中鉴定出具有ABCC9和HIGD1B特征的周细胞，并通过机器学习算法证实了巨噬细胞与动脉瘤破裂的关联 | NA | 深入了解颅内动脉瘤壁的细胞结构和炎症特征，为未破裂动脉瘤的治疗提供新思路 | 破裂和未破裂的人颅内动脉瘤壁 | 数字病理学 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA | 21,332个合格细胞，以及126名患者的血清学结果 |
| 409 | 2024-08-04 |
TISSUE: uncertainty-calibrated prediction of single-cell spatial transcriptomics improves downstream analyses
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02184-y
PMID:38347138
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研究论文 | 本文提出了一种新框架TISSUE，用于评估空间基因表达预测的不确定性，改善下游分析 | TISSUE框架利用保形推断提供良好校准的预测区间，并减少差异基因表达分析中的假发现率 | 未提及具体的局限性 | 提高单细胞空间转录组学预测的准确性及其下游分析 | 对小鼠成年人侧脑室区域的MERFISH空间转录组数据进行分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 11个基准数据集及一个小鼠数据集 |
| 410 | 2024-08-04 |
Correcting PCR amplification errors in unique molecular identifiers to generate accurate numbers of sequencing molecules
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02168-y
PMID:38317008
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研究论文 | 本研究探讨了PCR扩增误差对RNA分子绝对计数的准确性影响。 | 研究展示了一种使用同聚三聚体核苷酸块合成唯一分子标识符的方法，以纠正PCR错误并实现精确计数。 | 研究未提及样本数量及多样性限制。 | 探讨PCR扩增误差对RNA分子计数准确性的影响。 | 研究对象为RNA分子及其测序数据。 | 数字病理 | NA | PCR | NA | RNA数据 | NA |
| 411 | 2024-08-04 |
In situ single-cell profiling sheds light on IFI27 localisation during SARS-CoV-2 infection
2024-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105016
PMID:38377798
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组技术描绘了SARS-CoV-2感染期间的免疫反应 | 首次识别了在感染部位M1巨噬细胞中IFI27的高表达 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染下的免疫反应 | 感染部位的M1巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-08-07 |
Amphiregulin switches progenitor cell fate for lineage commitment during gastric mucosal regeneration
2024-Mar-14, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.03.009
PMID:38492892
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研究论文 | 研究胃黏膜再生过程中，Amphiregulin如何调控前体细胞的谱系承诺 | 首次揭示了Amphiregulin在胃黏膜再生中对前体细胞谱系承诺的调控作用 | NA | 探讨胃黏膜损伤后前体细胞微环境的调控机制 | 胃黏膜中的Isthmic前体细胞及其在再生过程中的谱系承诺 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胃黏膜上皮细胞 |
| 413 | 2024-08-04 |
BANKSY unifies cell typing and tissue domain segmentation for scalable spatial omics data analysis
2024-Mar, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01664-3
PMID:38413725
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研究论文 | 本研究提出了一种名为BANKSY的算法，用于统一细胞类型和组织区域的空间聚类问题 | 通过将细胞嵌入到自身和局部邻域转录组的乘积空间中，BANKSY提供了一种新的空间特征增强策略，显著提高了任务性能 | NA | 研究旨在提供一种准确且可扩展的框架，以分析空间分辨的组学数据 | 主要研究对象为细胞类型和组织域在空间组学数据中的聚类 | 数字病理学 | NA | RNA测序，蛋白质成像 | NA | RNA和蛋白质图像数据 | 数百万个细胞数据集 |
| 414 | 2024-08-07 |
The platelet-related genes associated with the prognosis of HCC by regulating cycling T cell and prolif-TAMs
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26798
PMID:38486758
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研究论文 | 本研究通过TCGA和ICGC数据库分析了92个与肝细胞癌（HCC）相关的差异表达的血小板相关基因（PRGs），并开发了PRGs预后标志物，揭示了这些基因在HCC中的潜在机制。 | 首次详细探讨了血小板相关基因在HCC中的预后价值及其对免疫微环境的调控作用。 | 研究主要基于数据库分析，需要进一步的实验验证。 | 构建与HCC相关的血小板相关基因风险标志物，并揭示其调控免疫微环境的潜在机制。 | 血小板相关基因在HCC中的表达及其预后价值。 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 92个差异表达的血小板相关基因 |
| 415 | 2024-08-04 |
MSX1+PDGFRAlow limb mesenchyme-like cells as an efficient stem cell source for human cartilage regeneration
2024-Mar-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.001
PMID:38428414
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研究论文 | 本文探讨了MSX1+PDGFRAlow肢体间充质样细胞在人体软骨再生中的潜在应用 | 识别和表征了具有优异骨软骨再生能力的MSX1间充质前体细胞，并开发出从人类多能干细胞生成的MSX1PDGFRA肢体间充质样细胞 | 对于临床应用的长期效果和细胞的复杂相互作用仍需进一步研究 | 查明并开发替代的干细胞来源以促进人类软骨再生 | MSX1+PDGFRAlow肢体间充质样细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 416 | 2024-08-04 |
The HIF-1α/PLOD2 axis integrates extracellular matrix organization and cell metabolism leading to aberrant musculoskeletal repair
2024-Mar-12, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00320-0
PMID:38472175
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研究论文 | 本文研究了HIF-1α/PLOD2轴在异常骨骼修复中的作用 | 揭示了HIF-1α在间充质前体细胞中调控胶原蛋白交叉链接的分子机制 | 实验仅在小鼠模型中进行，可能无法完全代表人类情况 | 探讨缺氧信号在肌肉骨骼损伤后细胞命运和细胞外基质组织中的作用 | 研究对象是间充质前体细胞和异位骨化模型 | 数字病理学 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学分析 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型 |
| 417 | 2024-08-07 |
ER stress and lipid imbalance drive diabetic embryonic cardiomyopathy in an organoid model of human heart development
2024-Mar-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.01.003
PMID:38335962
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研究论文 | 本文利用先进的人类心脏类器官系统，模拟了妊娠前糖尿病条件下胚胎心脏发育的情况，并探讨了其病理机制及潜在的治疗策略。 | 首次使用人类心脏类器官模型模拟妊娠前糖尿病对胚胎心脏发育的影响，并通过单细胞RNA测序、成像和脂质组学技术揭示了特定的细胞类型功能障碍和代谢改变。 | 研究主要基于类器官模型，可能与真实的人类胚胎心脏发育环境存在差异。 | 探索妊娠前糖尿病条件下胚胎心脏发育的病理机制，并寻找可能的预防和治疗策略。 | 人类心脏类器官，特别是心肌细胞和心外膜细胞在妊娠前糖尿病条件下的功能和代谢变化。 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 脂质组学 | 类器官模型 | 细胞类型特异性RNA数据, 脂质代谢数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 418 | 2024-08-04 |
Single-cell division tracing and transcriptomics reveal cell types and differentiation paths in the regenerating lung
2024-Mar-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46469-4
PMID:38472236
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研究论文 | 本研究结合小鼠模型和单细胞转录组学，揭示了再生肺的细胞类型和分化路径 | 首次展示了Krt13基底细胞与Krt15俱乐部细胞之间的中间细胞状态，并揭示了腺泡细胞作为积极分裂的前体细胞 | 未提及具体的样本数量和实验限制 | 理解肺上皮再生中的分子和细胞过程，以促进肺疾病的治疗方法发展 | 特定上皮细胞类型的损伤小鼠模型，细胞分裂功能标记细胞和单细胞转录组学 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | NA |
| 419 | 2024-08-05 |
Discovery of Multiple Effects of Reactive Oxygen Species on Lung Adenocarcinoma at the Single-cell and Bulk Tissue Levels
2024-Mar-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究探讨了反应性氧种（ROS）在肺腺癌中的作用机制 | 该研究提供了ROS在肺腺癌单细胞和整体组织水平上的新见解，揭示了其对病理的影响 | NA | 探索ROS在肺腺癌发展和治疗中的机制 | 反应性氧种对肺腺癌进展的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | LUAD组织中识别的七种细胞类型 |
| 420 | 2024-08-07 |
Combined IL6 and CCR2 blockade potentiates antitumor activity of NK cells in HPV-negative head and neck cancer
2024-Mar-12, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03002-1
PMID:38468260
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研究论文 | 本研究探讨了在HPV阴性的头颈部鳞状细胞癌中，联合阻断IL6和CCR2通路对NK细胞抗肿瘤活性的增强作用 | 首次展示了在HPV阴性的头颈部鳞状细胞癌中，通过联合阻断IL6和CCR2通路可以有效增强NK细胞的抗肿瘤活性 | NA | 探索增强NK细胞在HPV阴性头颈部鳞状细胞癌中的抗肿瘤活性的新治疗方法 | HPV阴性的头颈部鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用了HPV阳性和阴性的头颈部鳞状细胞癌细胞系及同种异体小鼠模型 |