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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-04 |
STEP: profiling cellular-specific targets and pathways of bioactive small molecules in tissues via integrating single-cell transcriptomics and chemoproteomics
2024-Mar-20, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d3sc04826h
PMID:38516082
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的多组学集成管道STEP,能够在单细胞分辨率下剖析哺乳动物组织中的蛋白质靶标。 | STEP是一种新策略,首次实现了细胞特异性靶标和功能过程的全球剖析,提供了前所未有的分辨率。 | 未提及具体的局限性 | 本研究旨在提升对生物活性小分子的药物作用机制的理解。 | 研究对象为哺乳动物组织中的生物活性小分子及其细胞靶标。 | 化学生物学 | NA | 单细胞转录组学与化学蛋白组学的集成 | NA | 蛋白质靶标数据 | 采用了经典药物(如阿司匹林、马兜铃酸和顺铂)作为示例 | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-08-04 |
Single cell atlas of Xenoturbella bocki highlights limited cell-type complexity
2024-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45956-y
PMID:38503762
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研究论文 | 这篇文章展示了对海洋生物Xenoturbella bocki进行单细胞RNA测序的研究,突出了其细胞类型的复杂性有限。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Xenacoelomorpha的细胞类型补充,提供了与其他动物的比较。 | 研究主要集中在单一物种上,可能无法全面代表整个Xenacoelomorpha门的细胞类型多样性。 | 探索Xenacoelomorpha中的细胞类型及其与其他生物的关系,理解动物细胞类型演化。 | 研究对象为海洋生物Xenoturbella bocki及其细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及Xenoturbella bocki的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-08-07 |
Long-term effects of Omicron BA.2 breakthrough infection on immunity-metabolism balance: a 6-month prospective study
2024-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46692-z
PMID:38503738
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研究论文 | 本研究追踪了轻度BA.2突破性感染康复者在六个月内的免疫代谢平衡情况 | 首次详细探讨了Omicron BA.2突破性感染后长期免疫代谢失衡的机制和病理特征 | 研究仅限于轻度BA.2突破性感染康复者,可能无法完全代表所有感染情况 | 评估COVID-19长期影响及Omicron突破性感染后的免疫恢复情况,为理解疾病和新一代疫苗管理提供依据 | 轻度BA.2突破性感染康复者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 血液检测数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-08-04 |
Region-specific cellular and molecular basis of liver regeneration after acute pericentral injury
2024-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.01.013
PMID:38402618
|
研究论文 | 本研究探讨了急性中心周围损伤后肝脏再生的细胞和分子基础 | 使用Cyp2e1-DreER追踪肝脏再生,并揭示了mTOR/4E-BP1轴和乳酸脱氢酶A在中心周围再生中的重要作用 | 研究主要集中在特定的损伤模式上,可能不适用于所有类型的肝脏损伤 | 研究急性中心周围损伤后肝脏的再生机制 | 重点关注中心周围肝细胞及其再生反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫染色、体内功能测定 | NA | NA | 使用Cyp2e1-DreER命运追踪系统进行的实验,样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-08-07 |
Canonical Wnt signaling directs the generation of functional human PSC-derived atrioventricular canal cardiomyocytes in bioprinted cardiac tissues
2024-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.01.008
PMID:38366588
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析和3D生物打印技术,发现阶段特异性激活的规范Wnt信号通路可以生成功能性的人类多能干细胞衍生的房室管(AVC)心肌细胞 | 首次发现规范Wnt信号通路在体外调控AVC心肌细胞分化的关键作用,并提供了一种用于功能性人心脏生物制造的关键细胞来源 | NA | 探索生成功能性3D生物打印人类心脏的方法 | 房室管(AVC)心肌细胞 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序分析,3D生物打印技术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-08-07 |
Exploring the metastasis-related biomarker and carcinogenic mechanism in liver cancer based on single cell technology
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27473
PMID:38509894
|
研究论文 | 本研究利用单细胞技术探索肝癌中的转移相关生物标志物和致癌机制 | 本研究首次定义了四种支持转移的细胞集群,并发现特定共享基因在促进癌症进展中发挥关键作用 | NA | 探索肝细胞癌(HCC)发展背后的转移相关机制 | 肝细胞癌中的细胞集群及其与癌症转移的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9种细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-08-07 |
Combined analysis of bulk RNA and single-cell RNA sequencing to identify pyroptosis-related markers and the role of dendritic cells in chronic obstructive pulmonary disease
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27808
PMID:38509896
|
研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术,识别与慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关的焦亡标志物,并探讨树突状细胞在COPD中的作用 | 本研究首次结合多种机器学习算法,从GEO数据集中筛选出与COPD诊断相关的焦亡相关基因,并通过外部数据集验证其有效性 | NA | 旨在识别与COPD相关的焦亡标志物,并探讨树突状细胞在COPD发病机制中的作用 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)及其相关焦亡标志物和树突状细胞的作用 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序 | 深度神经网络,逻辑回归 | RNA测序数据 | 使用了GEO数据集和外部数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of age-related changes in leukocytes of diabetic mouse hindpaws
2024-Mar-19, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05128-z
PMID:38502310
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了健康和糖尿病小鼠后爪中免疫细胞群在12周和21周龄时的失调情况,以揭示慢性糖尿病远端肢体中发生的免疫紊乱。 | 研究首次详细描述了糖尿病小鼠后爪中多种免疫细胞类型的免疫功能和表型随着代谢紊乱和疾病持续时间的改变,特别是在21周龄的Lepr小鼠中观察到 mast 细胞/basophils、真皮γδ T 细胞、异质性 T 细胞和 Type 2 先天淋巴细胞的增加。 | 研究仅限于小鼠模型,可能不完全适用于人类糖尿病患者。 | 探讨糖尿病小鼠后爪中免疫细胞群的失调情况,以理解与糖尿病代谢紊乱相关的病理变化。 | 健康和糖尿病小鼠后爪中的免疫细胞群。 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康和糖尿病小鼠后爪中的免疫细胞群,年龄分别为12周和21周。 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-08-07 |
Switch of innate to adaptative immune responses in the brain of patients with Alzheimer's disease correlates with tauopathy progression
2024-Mar-18, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-024-00145-5
PMID:38499592
|
研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病(AD)患者大脑中的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,揭示了在tauopathy进展过程中,从先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | 首次通过单细胞RNA测序数据证实了阿尔茨海默病患者大脑中先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | NA | 探讨阿尔茨海默病中神经炎症的关键特征及其与tauopathy进展的关系 | 阿尔茨海默病患者大脑中的免疫反应变化 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-08-07 |
Antidepressant fluoxetine alleviates colitis by reshaping intestinal microenvironment
2024-03-12, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01538-5
PMID:38475799
|
research paper | 本文研究了抗抑郁药氟西汀通过重塑肠道微环境缓解结肠炎的作用及其分子机制 | 首次揭示了氟西汀通过影响不同细胞群的分布、细胞间通讯和KEGG通路富集来减轻结肠炎症的作用 | NA | 探讨抗抑郁药氟西汀缓解结肠炎的生物效应和分子机制 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 | NA | Inflammatory bowel diseases (IBD) | RT-qPCR, western blot, 单细胞RNA测序, H&E染色, 免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-08-07 |
Spatially Resolved Tumor Microenvironment Predicts Treatment Outcomes in Relapsed/Refractory Hodgkin Lymphoma
2024-Mar-20, Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology
IF:42.1Q1
DOI:10.1200/JCO.23.01115
PMID:38113419
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研究论文 | 研究通过空间解析的肿瘤微环境(TME)生态系统,为复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤(r/r CHL)的治疗失败建立新型生物标志物 | 开发了一种新的预后模型RHL4S,利用TME生物学特性,适用于r/r CHL活检,为空间生物标志物的发展开辟了新途径 | NA | 描述空间解析的肿瘤微环境生态系统,建立与r/r CHL治疗失败相关的生物标志物 | 复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 成像质谱流式细胞术(IMC) | NA | 图像 | 71对原发诊断和复发活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-08-04 |
ISR inhibition reverses pancreatic β-cell failure in Wolfram syndrome models
2024-03, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01258-w
PMID:38321214
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研究论文 | 本研究探讨了Wolfram综合征中胰腺β细胞功能失衡的机制以及ISR抑制剂的治疗潜力 | 首次在Wolfram综合征模型中揭示ISR作为β细胞失功能的关键机制,并验证了ISR抑制剂的治疗效果 | 在研究中可能忽略了其他潜在的治疗路径或机制 | 研究Wolfram综合征模型中胰腺β细胞失功能的病因及潜在治疗方法 | WFS1缺乏的胰腺β细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠Wfs1特异性敲除模型 | 细胞数据 | 人体多能干细胞衍生的胰岛细胞(NA)和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-08-04 |
Identification of macrophage-related genes correlated with prognosis and immunotherapy efficacy in non-small cell lung cancer
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27170
PMID:38500993
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研究论文 | 本文研究了与非小细胞肺癌预后及免疫疗效相关的巨噬细胞相关基因 | 本研究首次识别出与非小细胞肺癌患者预后和免疫疗效相关的特定巨噬细胞相关基因 | 缺乏临床验证和更大规模的样本确认 | 探索能预测非小细胞肺癌预后和药物有效性的基因标志物 | 非小细胞肺癌及其周围组织中的细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing unveils the hidden powers of zebrafish kidney for generating both hematopoiesis and adaptive antiviral immunity
2024-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92424
PMID:38497789
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了斑马鱼肾脏在造血和适应性抗病毒免疫中的双重功能 | 首次全面展示了斑马鱼肾脏中59种造血干细胞/祖细胞和免疫细胞类型,并揭示了其在抗病毒免疫中的多样性功能 | NA | 阐明斑马鱼肾脏在造血和免疫系统中的功能 | 斑马鱼肾脏中的造血干细胞/祖细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 59种造血干细胞/祖细胞和免疫细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-08-07 |
scRNA-seq analysis discovered suppression of immunomodulatory dependent inflammatory response in PMBCs exposed to silver nanoparticles
2024-Mar-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02364-0
PMID:38494495
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq分析揭示了银纳米颗粒暴露下PBMCs中免疫调节依赖性炎症反应的抑制 | 本研究首次深入分析了单细胞水平上细胞与金属离子的关联以及特定的免疫反应 | 研究主要集中在体外模型,未涉及体内模型的验证 | 探究银纳米颗粒对PBMCs的免疫毒性 | 银纳米颗粒对PBMCs的免疫反应 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | PBMCs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-08-07 |
odd skipped-related 2 as a novel mark for labeling the proximal convoluted tubule within the zebrafish kidney
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27582
PMID:38496848
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研究论文 | 本文通过分析成年斑马鱼肾脏的单细胞转录组数据,发现odd-skipped-related 2(Osr2)在近端卷曲小管(PCT)中的表达,并生成了一种表达增强绿色荧光蛋白(EGFP)的转基因斑马鱼系,用于研究PCT的形态发生。 | 首次识别并利用Osr2作为标记物来标记斑马鱼肾脏中的PCT,并成功生成了一种转基因斑马鱼系,该系可以用于PCT的遗传和化学分析。 | 文章未明确提及研究的具体局限性。 | 研究近端卷曲小管(PCT)的形态发生及其在斑马鱼肾脏中的功能。 | 斑马鱼肾脏中的近端卷曲小管(PCT)。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 成年斑马鱼肾脏的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-08-07 |
Temporospatial hierarchy and allele-specific expression of zygotic genome activation revealed by distant interspecific urochordate hybrids
2024-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46780-0
PMID:38493164
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研究论文 | 本文通过研究两种深度分化(1.2亿年前)的栉水母物种的杂交后代,揭示了合子基因组激活(ZGA)的时空层次结构和等位基因特异性表达 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术,揭示了ZGA的两个协调波,分别代表早期发育和管家基因的重新激活,并展示了空间异质性和细胞命运的显著相关性 | NA | 研究合子基因组激活(ZGA)的机制及其在早期胚胎发生中的作用 | 两种深度分化的栉水母物种的杂交后代 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-08-04 |
Holistic exploration of CHGA and hsa-miR-137 in colorectal cancer via multi-omic data Integration
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27046
PMID:38495181
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研究论文 | 本研究通过多组学数据整合,探索了与结直肠癌相关的mRNA-miRNA网络 | 提出了hsa-miR-137和Chromogranin A作为有前景的结直肠癌生物标志物 | 尽管蛋白质组分析未能直接相关,但多方面的方法提供了对结直肠癌复杂调控机制的全面理解 | 揭示与结直肠癌发病机制有关的复杂mRNA-miRNA网络 | 结直肠癌相关转录组和关键基因,其中特别关注Chromogranin A和hsa-miR-137 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微阵列、Bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | WGCNA | 转录组数据 | 多种数据集的综合,具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-08-07 |
Identification of immune characteristic biomarkers and therapeutic targets in cuproptosis for sepsis by integrated bioinformatics analysis and single-cell RNA sequencing analysis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27379
PMID:38495196
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和单细胞RNA测序分析,识别了铜依赖性细胞死亡(cuproptosis)在脓毒症中的免疫特征生物标志物和治疗靶点 | 首次揭示了cuproptosis在脓毒症免疫特征中的作用,并识别了关键的差异表达cuproptosis相关基因(DECuGs)和潜在的新药 | 研究依赖于已有的公开数据集,未涉及临床试验验证 | 探索cuproptosis在脓毒症中的免疫特征和潜在的治疗靶点 | 脓毒症患者的免疫细胞和cuproptosis相关基因 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 两个脓毒症数据集(GSE9960和GSE134347),具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-08-07 |
Tumor-infiltrating CD8+ sub-populations in primary and recurrent glioblastoma: An in-silico study
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27329
PMID:38495199
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研究论文 | 研究分析了原发性和复发性胶质母细胞瘤中肿瘤浸润性CD8+ T细胞的亚群,并探讨了其在肿瘤微环境中的作用 | 提供了原发性和复发性胶质母细胞瘤中CD8+ TILs亚群的详细图谱,为未来的精准免疫治疗提供了概念验证 | NA | 研究CD8+ TILs亚群在原发性和复发性胶质母细胞瘤中的分布及其在肿瘤微环境中的作用 | 原发性和复发性胶质母细胞瘤中的肿瘤浸润性CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |