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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-07 |
Involvement of TGFBI-TAGLN axis in cancer stem cell property of head and neck squamous cell carcinoma
2024-03-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57478-0
PMID:38514830
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研究论文 | 本研究探讨了TGFBI在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的作用及其通过TAGLN轴促进癌症干细胞特性的机制 | 首次揭示了TGFBI通过上调TAGLN促进HNSCC中癌症干细胞特性的新机制 | NA | 阐明TGFBI对HNSCC细胞恶性行为的影响 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用TCGA数据库中的RNA测序数据进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-04 |
Transcriptomic changes associated with oral immunotherapy for food allergy
2024-Mar, Pediatric allergy and immunology : official publication of the European Society of Pediatric Allergy and Immunology
IF:4.3Q1
DOI:10.1111/pai.14106
PMID:38520061
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综述 | 这篇综述总结了与口服免疫疗法相关的转录通路的最新进展 | 采用单细胞测序等技术,提供了对口服免疫疗法后基因表达变化的新见解 | 对长期和明确临床结果相关的免疫特征的研究仍然不足 | 研究口服免疫疗法后免疫机制的转录变化 | 关注过敏性食物患者在接受口服免疫疗法后的基因表达变化 | 数字病理学 | 食物过敏 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-04 |
Characterization of macrophages in ischemia-reperfusion injury-induced acute kidney injury based on single-cell RNA-Seq and bulk RNA-Seq analysis
2024-Mar-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111754
PMID:38428147
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和总体RNA测序分析来表征缺血再灌注损伤引起的急性肾损伤中的巨噬细胞 | 识别了在缺血再灌注肾损伤中参与的巨噬细胞亚型及相关的中心基因,提出了四个新的生物标志物和潜在的治疗靶点 | 本研究的局限性在于对巨噬细胞功能机制的理解仍不清晰,针对巨噬细胞的策略在急性肾损伤中的效果存在争议 | 探讨缺血再灌注损伤中巨噬细胞的作用及其相关基因 | 本研究的研究对象为参与缺血再灌注引起的急性肾损伤的巨噬细胞亚型及其相关基因 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA-seq和总体RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包含正常样本和缺血再灌注后3天的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-07 |
Prognostic implication of UBE2C + CD8 + T cell in neoadjuvant immune checkpoint blockade plus chemotherapy for locally advanced esophageal cancer
2024-Mar-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111696
PMID:38412672
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研究论文 | 本研究旨在探讨免疫检查点抑制剂(ICBs)联合化疗作为新辅助治疗在局部晚期食管癌患者中的早期和中期疗效,并发现与主要病理反应(MPR)相关的免疫预测因子。 | 本研究首次揭示了UBE2C+CD8+T细胞作为局部晚期食管癌患者接受新辅助ICBs联合化疗后的不良预后因子。 | 研究为回顾性分析,样本量相对较小,且仅限于特定时间段内的患者。 | 研究新辅助ICBs联合化疗在局部晚期食管癌中的疗效及免疫预测因子。 | 局部晚期食管癌患者。 | 免疫学 | 食管癌 | Bulk-RNA seq, scRNA seq, 多重免疫荧光 | NA | RNA序列数据, 免疫荧光图像 | 76名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-04 |
eSVD-DE: cohort-wide differential expression in single-cell RNA-seq data using exponential-family embeddings
2024-Mar-15, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05724-7
PMID:38486150
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研究论文 | 本文介绍了eSVD-DE,一种针对单细胞RNA测序数据的大规模人群差异表达检测的新方法 | 提出了一种新的矩阵分解方法,能够在去除混杂变量影响的同时进行差异基因测试 | 在较大的数据集中,可能仍然存在一些人类变异的影响 | 旨在更准确地识别单细胞RNA测序数据中群体级的差异表达基因 | 对大量案例和对照个体的单细胞RNA测序数据进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 层次模型 | 基因表达数据 | 使用了多个生物系统的已发布数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-07 |
Profiling Cell Heterogeneity and Fructose Transporter Expression in the Rat Nephron by Integrating Single-Cell and Microdissected Tubule Segment Transcriptomes
2024-Mar-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25053071
PMID:38474316
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和微切割管状段转录组数据,研究了大鼠肾单位中的细胞异质性和果糖转运蛋白表达 | 首次揭示了大鼠近端小管各亚段中果糖转运蛋白的复杂异质性表达模式,并发现S3段是果糖重吸收的主要部位 | 研究仅基于公开数据库的数据,未进行实验验证 | 探究大鼠肾单位中细胞异质性和果糖转运蛋白表达模式 | 大鼠肾单位中的细胞异质性和果糖转运蛋白表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了公开数据库中的大鼠肾脏转录组和蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-04 |
eSVD-DE: Cohort-wide differential expression in single-cell RNA-seq data using exponential-family embeddings
2024-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.22.568369
PMID:38045428
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研究论文 | 本文提出了一种新方法eSVD-DE,用于在单细胞RNA-seq数据中分析 cohort-wide 差异表达基因 | eSVD-DE通过矩阵分解汇集基因信息,并引入层次模型以准确测试病例和对照个体的后验均值分布差异 | 本研究在处理人类变异带来的混杂协变量时可能仍然面临一些挑战 | 旨在开发一套新方法,分析大规模聚类中单细胞RNA-seq数据的差异表达基因 | 研究对象为大量病例和对照个体的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 层次模型 | 基因表达数据 | 多个生物系统的已发布数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-07 |
The pelvic organs receive no parasympathetic innervation
2024-Mar-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91576
PMID:38488657
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research paper | 本研究使用单细胞RNA测序技术,发现小鼠盆腔神经节由四种不同于交感和副交感神经元的神经元组成,这些神经元与交感神经元有亲缘关系,但不与副交感神经元相关。研究还表明,脊髓腰段节前神经元在盆腔神经节中与去甲肾上腺素能和胆碱能细胞形成突触,这两种细胞均作为交感神经的传递介质。因此,盆腔器官不接受来自副交感或典型交感神经元的神经支配,而是接受来自交感神经链末端分支的神经支配,负责其特有的功能。 | 本研究首次揭示了盆腔神经节中的神经元类型及其与交感和副交感神经元的关系,并证明了盆腔器官不接受副交感神经的神经支配。 | NA | 探讨盆腔器官的自主神经支配机制 | 小鼠盆腔神经节中的神经元类型及其功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-04 |
STEP: profiling cellular-specific targets and pathways of bioactive small molecules in tissues via integrating single-cell transcriptomics and chemoproteomics
2024-Mar-20, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d3sc04826h
PMID:38516082
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的多组学集成管道STEP,能够在单细胞分辨率下剖析哺乳动物组织中的蛋白质靶标。 | STEP是一种新策略,首次实现了细胞特异性靶标和功能过程的全球剖析,提供了前所未有的分辨率。 | 未提及具体的局限性 | 本研究旨在提升对生物活性小分子的药物作用机制的理解。 | 研究对象为哺乳动物组织中的生物活性小分子及其细胞靶标。 | 化学生物学 | NA | 单细胞转录组学与化学蛋白组学的集成 | NA | 蛋白质靶标数据 | 采用了经典药物(如阿司匹林、马兜铃酸和顺铂)作为示例 | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-04 |
Single cell atlas of Xenoturbella bocki highlights limited cell-type complexity
2024-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45956-y
PMID:38503762
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研究论文 | 这篇文章展示了对海洋生物Xenoturbella bocki进行单细胞RNA测序的研究,突出了其细胞类型的复杂性有限。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Xenacoelomorpha的细胞类型补充,提供了与其他动物的比较。 | 研究主要集中在单一物种上,可能无法全面代表整个Xenacoelomorpha门的细胞类型多样性。 | 探索Xenacoelomorpha中的细胞类型及其与其他生物的关系,理解动物细胞类型演化。 | 研究对象为海洋生物Xenoturbella bocki及其细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及Xenoturbella bocki的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-07 |
Long-term effects of Omicron BA.2 breakthrough infection on immunity-metabolism balance: a 6-month prospective study
2024-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46692-z
PMID:38503738
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研究论文 | 本研究追踪了轻度BA.2突破性感染康复者在六个月内的免疫代谢平衡情况 | 首次详细探讨了Omicron BA.2突破性感染后长期免疫代谢失衡的机制和病理特征 | 研究仅限于轻度BA.2突破性感染康复者,可能无法完全代表所有感染情况 | 评估COVID-19长期影响及Omicron突破性感染后的免疫恢复情况,为理解疾病和新一代疫苗管理提供依据 | 轻度BA.2突破性感染康复者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 血液检测数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-04 |
Region-specific cellular and molecular basis of liver regeneration after acute pericentral injury
2024-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.01.013
PMID:38402618
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研究论文 | 本研究探讨了急性中心周围损伤后肝脏再生的细胞和分子基础 | 使用Cyp2e1-DreER追踪肝脏再生,并揭示了mTOR/4E-BP1轴和乳酸脱氢酶A在中心周围再生中的重要作用 | 研究主要集中在特定的损伤模式上,可能不适用于所有类型的肝脏损伤 | 研究急性中心周围损伤后肝脏的再生机制 | 重点关注中心周围肝细胞及其再生反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫染色、体内功能测定 | NA | NA | 使用Cyp2e1-DreER命运追踪系统进行的实验,样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-07 |
Canonical Wnt signaling directs the generation of functional human PSC-derived atrioventricular canal cardiomyocytes in bioprinted cardiac tissues
2024-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.01.008
PMID:38366588
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析和3D生物打印技术,发现阶段特异性激活的规范Wnt信号通路可以生成功能性的人类多能干细胞衍生的房室管(AVC)心肌细胞 | 首次发现规范Wnt信号通路在体外调控AVC心肌细胞分化的关键作用,并提供了一种用于功能性人心脏生物制造的关键细胞来源 | NA | 探索生成功能性3D生物打印人类心脏的方法 | 房室管(AVC)心肌细胞 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序分析,3D生物打印技术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-07 |
Exploring the metastasis-related biomarker and carcinogenic mechanism in liver cancer based on single cell technology
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27473
PMID:38509894
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术探索肝癌中的转移相关生物标志物和致癌机制 | 本研究首次定义了四种支持转移的细胞集群,并发现特定共享基因在促进癌症进展中发挥关键作用 | NA | 探索肝细胞癌(HCC)发展背后的转移相关机制 | 肝细胞癌中的细胞集群及其与癌症转移的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9种细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-07 |
Combined analysis of bulk RNA and single-cell RNA sequencing to identify pyroptosis-related markers and the role of dendritic cells in chronic obstructive pulmonary disease
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27808
PMID:38509896
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研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术,识别与慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关的焦亡标志物,并探讨树突状细胞在COPD中的作用 | 本研究首次结合多种机器学习算法,从GEO数据集中筛选出与COPD诊断相关的焦亡相关基因,并通过外部数据集验证其有效性 | NA | 旨在识别与COPD相关的焦亡标志物,并探讨树突状细胞在COPD发病机制中的作用 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)及其相关焦亡标志物和树突状细胞的作用 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序 | 深度神经网络,逻辑回归 | RNA测序数据 | 使用了GEO数据集和外部数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of age-related changes in leukocytes of diabetic mouse hindpaws
2024-Mar-19, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05128-z
PMID:38502310
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了健康和糖尿病小鼠后爪中免疫细胞群在12周和21周龄时的失调情况,以揭示慢性糖尿病远端肢体中发生的免疫紊乱。 | 研究首次详细描述了糖尿病小鼠后爪中多种免疫细胞类型的免疫功能和表型随着代谢紊乱和疾病持续时间的改变,特别是在21周龄的Lepr小鼠中观察到 mast 细胞/basophils、真皮γδ T 细胞、异质性 T 细胞和 Type 2 先天淋巴细胞的增加。 | 研究仅限于小鼠模型,可能不完全适用于人类糖尿病患者。 | 探讨糖尿病小鼠后爪中免疫细胞群的失调情况,以理解与糖尿病代谢紊乱相关的病理变化。 | 健康和糖尿病小鼠后爪中的免疫细胞群。 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康和糖尿病小鼠后爪中的免疫细胞群,年龄分别为12周和21周。 | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing Reveals Functional Alterations in Tuberculosis
2024-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305592
PMID:38192178
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研究论文 | 这项研究揭示了结核分枝杆菌与人类免疫细胞之间相互作用的功能异质性。 | 开发了一种新的技术平台,结合单细胞RNA测序和细胞表面抗体测序,提供同一样本的基因组和表型信息。 | 研究对象限于初次结核病患者和健康对照,可能无法全面代表所有结核患者。 | 阐明结核病患者的免疫功能差异及其对结核病结果的影响。 | 分析了23990个外周血单核细胞,来自新一组初次结核患者和健康对照。 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,细胞表面抗体测序 | NA | 基因组数据,表型数据 | 23990个外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-07 |
Exploration of the prognostic prediction value of the PANoptosis-based risk score and its correlation with tumor immunity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3682
PMID:38508210
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研究论文 | 本研究探索了基于PANoptosis风险评分在肺腺癌中的预后预测价值及其与肿瘤免疫的相关性 | 首次构建了基于PANoptosis的15个相关基因的风险模型,用于肺腺癌的预后预测 | NA | 探索肺腺癌中PANoptosis相关基因的预后预测价值及与肿瘤免疫的相关性 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归分析 | RNA表达谱 | 来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus数据库的肺腺癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-07 |
Switch of innate to adaptative immune responses in the brain of patients with Alzheimer's disease correlates with tauopathy progression
2024-Mar-18, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-024-00145-5
PMID:38499592
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研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病(AD)患者大脑中的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,揭示了在tauopathy进展过程中,从先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | 首次通过单细胞RNA测序数据证实了阿尔茨海默病患者大脑中先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | NA | 探讨阿尔茨海默病中神经炎症的关键特征及其与tauopathy进展的关系 | 阿尔茨海默病患者大脑中的免疫反应变化 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-07 |
Antidepressant fluoxetine alleviates colitis by reshaping intestinal microenvironment
2024-03-12, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01538-5
PMID:38475799
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research paper | 本文研究了抗抑郁药氟西汀通过重塑肠道微环境缓解结肠炎的作用及其分子机制 | 首次揭示了氟西汀通过影响不同细胞群的分布、细胞间通讯和KEGG通路富集来减轻结肠炎症的作用 | NA | 探讨抗抑郁药氟西汀缓解结肠炎的生物效应和分子机制 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 | NA | Inflammatory bowel diseases (IBD) | RT-qPCR, western blot, 单细胞RNA测序, H&E染色, 免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 | NA | NA | NA | NA |