单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-07-21	Inositol phosphatase INPP4B sustains ILC1s and intratumoral NK cells through an AKT-driven pathway 2024-Mar-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20230124 PMID:38197946	研究论文	研究揭示了肌醇磷酸酶INPP4B在维持ILC1s和肿瘤内NK细胞中的作用及其通过AKT驱动的机制	首次发现INPP4B是组织驻留ILC1s和肿瘤内NK细胞的标志性特征，并揭示了其在抗肿瘤免疫中的关键作用	研究未涉及INPP4B在其他免疫细胞类型中的作用，也未探讨其在其他疾病模型中的潜在功能	探究INPP4B在ILC1s和NK细胞中的作用及其对抗肿瘤免疫的影响	组织驻留ILC1s和肿瘤内NK细胞	免疫学	肿瘤	scRNA-seq	NA	基因表达数据	未明确说明样本数量，但使用了组织相关和循环NK/ILC1s的单细胞RNA测序图谱
22	2025-07-20	Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells 2024-Mar-11, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-46428-z PMID:38467611	研究论文	本研究通过单细胞RNA-seq分析探索了细胞间通讯对视网膜神经节细胞（RGC）在视神经损伤后存活的影响	揭示了μ-阿片受体（Oprm1）作为视网膜神经节细胞的神经保护因子，并证明其神经保护作用可通过泛RGC过表达转移至其他亚类	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探索细胞间通讯对视网膜神经节细胞存活的贡献	视网膜神经节细胞（RGCs）、星形胶质细胞和Müller胶质细胞	神经科学	视神经损伤	单细胞RNA-seq分析	NA	RNA-seq数据	NA
23	2025-07-20	An organism-wide atlas of hormonal signaling based on the mouse lemur single-cell transcriptome 2024-Mar-11, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-46070-9 PMID:38467625	research paper	利用小鼠狐猴单细胞转录组数据构建了全生物体范围的激素信号图谱	首次系统地绘制了84类激素的源细胞和靶细胞图谱，揭示了激素信号网络的密集连接、去中心化和丰富的反馈循环	研究仅基于非人灵长类动物小鼠狐猴，未直接验证人类数据	系统性地研究激素信号传导网络及其在生理和代谢中的作用	小鼠狐猴（Microcebus murinus）的全生物体单细胞转录组	生物信息学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	NA
24	2025-07-18	Comparable CD8+ T-cell responses to SARS-CoV-2 vaccination in single-cell transcriptomics of recently allogeneic transplanted patients and healthy individuals 2024-03, Journal of medical virology IF:6.8Q1 DOI:10.1002/jmv.29539 PMID:38516755	研究论文	本研究比较了异基因造血干细胞移植(ASCT)患者与健康个体在接种SARS-CoV-2疫苗后的CD8+ T细胞反应	首次在ASCT患者中进行了纵向多模态分析，包括T细胞功能性和单细胞RNA测序结合TCR/BCR分析，并与健康接种者公开数据集进行比较	样本量相对较小，仅40%患者达到保护性抗体滴度	评估ASCT患者对SARS-CoV-2疫苗的免疫反应	异基因造血干细胞移植患者和健康个体	免疫学	传染病	单细胞RNA测序, TCR/BCR分析	NA	转录组数据, 免疫组库数据	ASCT患者队列(具体数量未明确提及), 与公开健康接种者数据集对比
25	2025-07-17	Neoadjuvant chemotherapy-induced remodeling of human hormonal receptor-positive breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing 2024-03-31, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216656 PMID:38266804	研究论文	通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色分析，揭示了激素受体阳性乳腺癌在化疗诱导下的免疫微环境重塑机制	发现了化疗后未被识别的免疫细胞亚群增加，以及CD8 T细胞免疫检查点表达的不一致性变化，并鉴定了化疗耐药癌细胞的基因组和转录组新模式	样本量有限，且仅针对激素受体阳性乳腺癌	探索激素受体阳性乳腺癌对化疗不敏感的机制及化疗如何重塑免疫微环境	激素受体阳性乳腺癌患者的配对化疗前后样本	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序，多重免疫荧光染色	NA	RNA测序数据，图像数据	配对化疗前后的HR BC样本
26	2025-07-17	scRNA-seq of colorectal cancer shows regional immune atlas with the function of CD20+ B cells 2024-03-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216664 PMID:38253219	研究论文	通过单细胞RNA测序技术分析结直肠癌不同区域的免疫图谱，特别关注CD20+ B细胞的功能	揭示了结直肠癌不同区域免疫细胞浸润的差异，特别是B细胞在左右侧结直肠癌中的不同发育轨迹及其与髓系细胞和T细胞的相互作用	样本量较小（19个样本），可能影响结果的普遍性	表征结直肠癌不同区域的免疫景观并寻找潜在的治疗靶点	结直肠癌和配对正常组织的单细胞转录数据	数字病理学	结直肠癌	scRNA-seq	NA	单细胞转录数据	19个样本（39,484个单细胞）
27	2025-07-16	Single-cell RNA sequencing highlights epithelial and microenvironmental heterogeneity in malignant progression of pancreatic ductal adenocarcinoma 2024-03-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216607 PMID:38246225	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMN）向胰腺导管腺癌（PDAC）恶性进展过程中的上皮和微环境异质性	首次利用单细胞转录组学解析IPMN向PDAC进展中的上皮和微环境异质性，并发现SPP1作为IPMN癌变的生物标志物	样本量较小（3个高级别IPMN和2个IPMN衍生的PDAC），且所有样本均为手术切除组织	探究胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤向胰腺导管腺癌恶性进展的分子机制	胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMN）和胰腺导管腺癌（PDAC）	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	35,693个细胞，来自3个高级别IPMN和2个IPMN衍生的PDAC
28	2025-07-16	Advanced insights on tumor-associated macrophages revealed by single-cell RNA sequencing: The intratumor heterogeneity, functional phenotypes, and cellular interactions 2024-03-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216610 PMID:38244910	综述	本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的异质性、功能表型及细胞间相互作用方面的最新研究进展	利用scRNA-seq技术全面解析TAMs在肿瘤微环境中的异质性和功能变化，为优化肿瘤治疗策略提供新视角	主要基于现有文献综述，缺乏原创性实验数据验证	探讨TAMs在肿瘤微环境中的动态变化及其对肿瘤治疗的影响	肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）	肿瘤免疫学	肿瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	NA
29	2025-07-11	Single-cell sequencing reveals the immune landscape of breast cancer patients with brain metastasis 2024-03, Thoracic cancer IF:2.3Q2 DOI:10.1111/1759-7714.15243 PMID:38316626	研究论文	通过单细胞RNA测序技术分析乳腺癌脑转移患者的脑脊液免疫细胞，揭示其免疫微环境景观	首次使用scRNA-seq技术非侵入性地描述乳腺癌脑转移患者的肿瘤免疫微环境，并发现促进和抑制肿瘤免疫功能的基因	研究样本可能有限，且仅分析了脑脊液中的免疫细胞，未涵盖其他可能的免疫微环境组成部分	揭示乳腺癌脑转移患者的免疫微环境特征，以指导免疫治疗	乳腺癌脑转移患者的脑脊液免疫细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	乳腺癌脑转移患者的脑脊液样本
30	2024-08-07	Single-cell RNA-seq reveals the links between the metabolic heterogeneity and cell identity in NBM and AML 2024-03, British journal of haematology IF:5.1Q1 DOI:10.1111/bjh.19233 PMID:38009537	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
31	2025-07-08	Improved therapeutic consistency and efficacy of CD317+ MSCs through stabilizing TSG6 by PTX3 2024-03-27, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03706-3 PMID:38539221	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了不同批次培养基对MSCs亚群组成和异质性的影响，并发现CD317+ MSCs具有增强的免疫抑制活性	发现CD317+ MSCs亚群通过PTX3稳定TSG6蛋白，从而提高治疗效果，并提出了减少MSCs异质性和提高治疗一致性的新策略	研究未涉及CD317+ MSCs在其他疾病模型中的应用效果	提高间充质干细胞（MSCs）的治疗一致性和效果	间充质干细胞（MSCs）及其CD317+亚群	细胞治疗	NA	scRNA-seq分析	NA	转录组数据	NA
32	2025-07-08	Short cell cycle duration is a phenotype of human epidermal stem cells 2024-03-13, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03670-y PMID:38475896	研究论文	本文研究了人类表皮干细胞（SCs）的细胞周期持续时间（CCD），发现与传统观点相反，SCs的细胞周期比更分化的祖细胞（CPs）更短	挑战了干细胞分裂缓慢的传统观点，揭示了人类表皮干细胞具有更短的细胞周期持续时间	研究仅限于体外培养的人类角质形成细胞，未涉及体内环境或其他类型的干细胞	探究人类表皮干细胞的细胞周期特性及其与分化祖细胞的差异	人类角质形成细胞（包括干细胞和分化祖细胞）	细胞生物学	NA	活细胞成像、单细胞RNA测序	NA	图像数据、基因表达数据	初始传代的人类角质形成细胞
33	2025-07-05	Temporal Single-Cell Sequencing Analysis Reveals That GPNMB-Expressing Macrophages Potentiate Muscle Regeneration 2024-Mar-28, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-4108866/v1 PMID:38585871	研究论文	通过单细胞RNA测序分析揭示表达GPNMB的巨噬细胞在肌肉再生中的关键作用	发现了一个表达GPNMB的巨噬细胞亚群，该亚群在巨噬细胞介导的肌肉再生中发挥关键作用	研究未详细探讨GPNMB信号通路在肌肉再生中的具体分子机制	探究巨噬细胞在骨骼肌修复过程中的表型多样性和功能	骨骼肌损伤后的巨噬细胞	单细胞测序	肌肉损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	不同时间点的骨骼肌单细胞样本
34	2025-06-24	Toolkit for mapping the clonal landscape of tumor-infiltrating B cells 2024-03, Seminars in immunology IF:7.4Q1 DOI:10.1016/j.smim.2024.101864 PMID:38301345	review	本文综述了现有技术，总结了它们在B细胞研究中的应用，并提出了推进B细胞探索的未来方向	提出了一个工具包，用于绘制肿瘤浸润B细胞的克隆景观，并概述了现有技术在B细胞研究中的应用	未提及具体的实验验证或样本量，可能缺乏实证支持	理解和区分B细胞在肿瘤微环境中的不同作用	肿瘤浸润B细胞	digital pathology	NA	单细胞和空间转录组学、基因组学、蛋白质组学、B细胞受体库深度无错误分析	NA	转录组、基因组、蛋白质组数据	NA
35	2025-06-18	Glutamine antagonist DRP-104 suppresses tumor growth and enhances response to checkpoint blockade in KEAP1 mutant lung cancer 2024-03-29, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adm9859 PMID:38536921	研究论文	研究谷氨酰胺拮抗剂DRP-104在KEAP1突变肺癌中抑制肿瘤生长并增强检查点阻断反应的效果	首次展示了DRP-104通过抑制谷氨酰胺依赖的核苷酸合成和促进抗肿瘤T细胞反应来抑制KEAP1突变肿瘤的生长，并增强抗PD1治疗的响应	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证	开发针对KEAP1突变肺癌的靶向治疗方法	KEAP1突变的肺癌肿瘤	肿瘤学	肺癌	多模态单细胞测序和体外功能实验	NA	NA	临床前患者来源的异种移植模型和抗原性原位肺癌模型
36	2025-06-18	Spatially resolved single-cell atlas of ascidian endostyle provides insight into the origin of vertebrate pharyngeal organs 2024-03-29, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adi9035 PMID:38552007	research paper	通过Stereo-seq和单细胞RNA测序技术，构建了海鞘内柱的空间分辨单细胞图谱，揭示了脊椎动物咽部器官的进化起源	发现了与脊椎动物听觉侧线系统毛细胞转录组相似的细胞群，重塑了对基础脊索动物咽部的理解	NA	探索脊椎动物咽部器官的进化起源	海鞘内柱	单细胞测序	NA	Stereo-seq, 单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	NA
37	2025-06-18	Multiple parallel cell lineages in the developing mammalian cerebral cortex 2024-03-29, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adn9998 PMID:38536915	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和条形码谱系追踪技术，揭示了哺乳动物大脑皮层发育中多个平行细胞谱系的存在	发现了多个顶端放射状胶质细胞(RGC)类别启动平行谱系，最终汇聚到共同的新生神经元类别，这一现象在具有折叠皮层的物种(如雪貂和人类)中保守，但在小鼠中不保守	研究主要关注雪貂和人类，未全面涵盖其他哺乳动物物种	探究具有扩展生发区和折叠皮层物种(如人类)的大脑皮层神经发生机制	雪貂和人类大脑皮层生发区的祖细胞及其谱系	发育神经生物学	大脑皮层畸形	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 条形码谱系追踪	NA	单细胞转录组数据	未明确说明具体样本数量，但涉及多个雪貂和人类皮层生发区样本
38	2025-06-18	Gastrulation-stage gene expression in Nipbl+/- mouse embryos foreshadows the development of syndromic birth defects 2024-03-22, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adl4239 PMID:38507484	research paper	研究Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚阶段的基因表达变化，以预测综合征性出生缺陷的发生	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚和早期心脏新月阶段的基因表达异常及其与Cornelia de Lange综合征的关联	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证	探讨Nipbl基因缺陷如何通过基因表达失调和细胞谱系分配异常导致出生缺陷	Nipbl+/-和野生型小鼠胚胎	发育生物学	Cornelia de Lange综合征	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	野生型和Nipbl+/-小鼠胚胎
39	2025-06-18	Kidins220 and Aiolos promote thymic iNKT cell development by reducing TCR signals 2024-03-15, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adj2802 PMID:38489359	研究论文	本文研究了Kidins220和Aiolos在胸腺iNKT细胞发育过程中通过减少TCR信号的作用	首次揭示了Kidins220通过调节TCR信号在iNKT细胞发育不同阶段的双重作用，并确定了Aiolos作为Kidins220下游效应分子的角色	研究主要基于小鼠模型，人类iNKT细胞中的类似机制尚未验证	阐明Kidins220在iNKT细胞发育过程中的调控机制	胸腺iNKT细胞	免疫学	NA	scRNA-seq	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	T细胞特异性Kidins220敲除小鼠和Aiolos敲除小鼠
40	2025-06-18	Single-cell nanobiopsy enables multigenerational longitudinal transcriptomics of cancer cells 2024-03-08, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adl0515 PMID:38446884	研究论文	介绍了一种能够从单个细胞及其后代中进行多代纵向细胞质采样的纳米活检平台	开发了一种基于扫描离子电导显微镜（SICM）的纳米活检平台，实现了对单个细胞及其后代的多代纵向转录组分析	目前仅在体外对胶质母细胞瘤细胞进行了72小时的实验，尚未在更广泛的细胞类型或更长时间内验证	研究细胞状态转换的动态轨迹，特别是癌症细胞在化疗和放疗后的转录组变化	胶质母细胞瘤（GBM）脑肿瘤细胞	单细胞测序技术	胶质母细胞瘤	扫描离子电导显微镜（SICM），单细胞RNA测序	NA	转录组数据	体外培养的胶质母细胞瘤细胞，实验持续72小时