单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 540 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of age-related changes in leukocytes of diabetic mouse hindpaws
2024-Mar-19, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05128-z
PMID:38502310
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了健康和糖尿病小鼠后爪中免疫细胞群在12周和21周龄时的失调情况，以揭示慢性糖尿病远端肢体中发生的免疫紊乱。 | 研究首次详细描述了糖尿病小鼠后爪中多种免疫细胞类型的免疫功能和表型随着代谢紊乱和疾病持续时间的改变，特别是在21周龄的Lepr小鼠中观察到 mast 细胞/basophils、真皮γδ T 细胞、异质性 T 细胞和 Type 2 先天淋巴细胞的增加。 | 研究仅限于小鼠模型，可能不完全适用于人类糖尿病患者。 | 探讨糖尿病小鼠后爪中免疫细胞群的失调情况，以理解与糖尿病代谢紊乱相关的病理变化。 | 健康和糖尿病小鼠后爪中的免疫细胞群。 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康和糖尿病小鼠后爪中的免疫细胞群，年龄分别为12周和21周。 |
| 362 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing Reveals Functional Alterations in Tuberculosis
2024-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305592
PMID:38192178
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研究论文 | 这项研究揭示了结核分枝杆菌与人类免疫细胞之间相互作用的功能异质性。 | 开发了一种新的技术平台，结合单细胞RNA测序和细胞表面抗体测序，提供同一样本的基因组和表型信息。 | 研究对象限于初次结核病患者和健康对照，可能无法全面代表所有结核患者。 | 阐明结核病患者的免疫功能差异及其对结核病结果的影响。 | 分析了23990个外周血单核细胞，来自新一组初次结核患者和健康对照。 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，细胞表面抗体测序 | NA | 基因组数据，表型数据 | 23990个外周血单核细胞 |
| 363 | 2024-08-07 |
Exploration of the prognostic prediction value of the PANoptosis-based risk score and its correlation with tumor immunity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3682
PMID:38508210
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研究论文 | 本研究探索了基于PANoptosis风险评分在肺腺癌中的预后预测价值及其与肿瘤免疫的相关性 | 首次构建了基于PANoptosis的15个相关基因的风险模型，用于肺腺癌的预后预测 | NA | 探索肺腺癌中PANoptosis相关基因的预后预测价值及与肿瘤免疫的相关性 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归分析 | RNA表达谱 | 来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus数据库的肺腺癌患者数据 |
| 364 | 2024-08-07 |
Recent advances in cancer-associated fibroblast: Biomarkers, signaling pathways, and therapeutic opportunities
2024-Mar-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003031
PMID:38420743
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）的研究进展，重点关注其表型和功能的异质性、特定信号通路以及涉及CAFs的治疗策略 | 单细胞RNA测序和遗传工程小鼠模型增进了对CAF多样性的理解，并定义了许多亚型 | CAFs在肿瘤微环境中的复杂性仍大部分未知，且针对CAFs的临床试验结果并不乐观 | 探讨CAFs在肿瘤微环境中的作用及其作为潜在治疗靶点的可能性 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-07 |
Switch of innate to adaptative immune responses in the brain of patients with Alzheimer's disease correlates with tauopathy progression
2024-Mar-18, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-024-00145-5
PMID:38499592
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研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病（AD）患者大脑中的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，揭示了在tauopathy进展过程中，从先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | 首次通过单细胞RNA测序数据证实了阿尔茨海默病患者大脑中先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | NA | 探讨阿尔茨海默病中神经炎症的关键特征及其与tauopathy进展的关系 | 阿尔茨海默病患者大脑中的免疫反应变化 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 366 | 2024-08-07 |
Activated mesenchymal stem/stromal cells promote myeloid cell differentiation via CCL2/CCR2 signaling
2024-Mar-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.002
PMID:38428413
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研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞/基质细胞（MSCs）通过CCL2/CCR2信号通路对造血干细胞/祖细胞（HSPCs）分化的影响 | 首次揭示了MSCs通过分泌CCL2促进粒细胞/巨噬细胞祖细胞向髓系分化的机制 | NA | 探索MSCs对HSPCs分化的影响及其机制 | 间充质干细胞、造血干细胞/祖细胞、髓系细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠和人类骨髓细胞 |
| 367 | 2024-08-07 |
Antidepressant fluoxetine alleviates colitis by reshaping intestinal microenvironment
2024-03-12, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01538-5
PMID:38475799
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research paper | 本文研究了抗抑郁药氟西汀通过重塑肠道微环境缓解结肠炎的作用及其分子机制 | 首次揭示了氟西汀通过影响不同细胞群的分布、细胞间通讯和KEGG通路富集来减轻结肠炎症的作用 | NA | 探讨抗抑郁药氟西汀缓解结肠炎的生物效应和分子机制 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 | NA | Inflammatory bowel diseases (IBD) | RT-qPCR, western blot, 单细胞RNA测序, H&E染色, 免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 |
| 368 | 2024-08-07 |
An organism-wide atlas of hormonal signaling based on the mouse lemur single-cell transcriptome
2024-Mar-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46070-9
PMID:38467625
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研究论文 | 本研究利用鼠狐猴（Microcebus murinus）的全器官单细胞转录组图谱，系统地绘制了84类激素的源细胞和目标细胞 | 该研究揭示了先前未被表征的激素调控位点，并展示了激素信号网络密集连接、分散且富含反馈回路的特性 | NA | 旨在系统地研究激素信号在全器官水平上的作用 | 鼠狐猴的激素信号网络及其与人类的比较 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 涉及84类激素的源细胞和目标细胞 |
| 369 | 2024-08-04 |
Recent advances in differential expression analysis for single-cell RNA-seq and spatially resolved transcriptomic studies
2024-Mar-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad011
PMID:37022699
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综述 | 本文讨论了单细胞RNA测序和空间解析转录组数据的差异表达分析的最新进展 | 本文填补了有关多条件、多样本实验设计的单细胞RNA测序和空间解析转录组数据差异表达基因检测的综述空白 | 缺乏对现有DE工具的系统评估 | 研究单细胞RNA-seq和空间解析转录组的差异表达分析 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间解析转录组(SRT)数据的差异表达基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-04 |
An improved hierarchical variational autoencoder for cell-cell communication estimation using single-cell RNA-seq data
2024-Mar-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac056
PMID:36752035
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研究论文 | 该文章提出了一种改进的层次变分自编码器模型，用于利用单细胞RNA-seq数据自动估算细胞间通信 | 提出了一种改进的HiVAE模型，通过学习细胞在已知配体-受体基因和所有基因上的潜在表示，提升了细胞间通信的估计准确性 | 使用的先前信息不足，仅涉及一部分细胞通信，可能导致假阳性或假阴性结果 | 旨在利用单细胞RNA-seq数据深入分析肿瘤微环境中的细胞间通信 | 研究对象为单细胞RNA-seq数据，特别是人类皮肤疾病数据集和黑色素瘤数据集 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 层次变分自编码器（HiVAE） | RNA-seq数据 | 涉及人类皮肤疾病数据集和黑色素瘤数据集的单细胞样本 |
| 371 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq data clustering by deep information fusion
2024-Mar-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad017
PMID:37208992
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度信息融合的单细胞数据聚类方法scDeepFC | scDeepFC通过深度自编码器和深度图卷积网络有效融合基因属性信息和细胞拓扑信息，以提升聚类效果 | 目前仍未提及具体的计算复杂度或模型训练时间等限制 | 旨在通过深度学习技术提升单细胞转录组数据的聚类和数据插补能力 | 研究对象为单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度自编码器，深度图卷积网络 | 深度自编码器，图卷积网络 | 单细胞转录组数据 | 在真实单细胞数据集上进行了广泛实验 |
| 372 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell RNA sequencing data to genome-wide association analysis data identifies significant cell types in influenza A virus infection and COVID-19
2024-Mar-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad025
PMID:37340787
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据与全基因组关联分析数据，揭示了流感病毒感染和COVID-19中与疾病相关的细胞类型 | 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究相结合，以高分辨率解析流感疾病中的细胞多样性 | 研究结果需要在未来的研究中得到更多的关注和验证 | 揭示流感疾病和COVID-19的发病机制中与疾病相关的细胞类型 | 流感病毒感染和COVID-19的细胞类型关联 | 基因组学 | 流感 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 约70,000个细胞，涉及欧洲和东亚人群 |
| 373 | 2024-08-07 |
Spatially Resolved Tumor Microenvironment Predicts Treatment Outcomes in Relapsed/Refractory Hodgkin Lymphoma
2024-Mar-20, Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology
IF:42.1Q1
DOI:10.1200/JCO.23.01115
PMID:38113419
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研究论文 | 研究通过空间解析的肿瘤微环境（TME）生态系统，为复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤（r/r CHL）的治疗失败建立新型生物标志物 | 开发了一种新的预后模型RHL4S，利用TME生物学特性，适用于r/r CHL活检，为空间生物标志物的发展开辟了新途径 | NA | 描述空间解析的肿瘤微环境生态系统，建立与r/r CHL治疗失败相关的生物标志物 | 复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | 图像 | 71对原发诊断和复发活检样本 |
| 374 | 2024-08-04 |
ISR inhibition reverses pancreatic β-cell failure in Wolfram syndrome models
2024-03, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01258-w
PMID:38321214
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研究论文 | 本研究探讨了Wolfram综合征中胰腺β细胞功能失衡的机制以及ISR抑制剂的治疗潜力 | 首次在Wolfram综合征模型中揭示ISR作为β细胞失功能的关键机制，并验证了ISR抑制剂的治疗效果 | 在研究中可能忽略了其他潜在的治疗路径或机制 | 研究Wolfram综合征模型中胰腺β细胞失功能的病因及潜在治疗方法 | WFS1缺乏的胰腺β细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠Wfs1特异性敲除模型 | 细胞数据 | 人体多能干细胞衍生的胰岛细胞(NA)和小鼠模型 |
| 375 | 2024-08-04 |
Deep-qGFP: A Generalist Deep Learning Assisted Pipeline for Accurate Quantification of Green Fluorescent Protein Labeled Biological Samples in Microreactors
2024-Mar, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301293
PMID:38010980
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研究论文 | 本文介绍了一种用于准确量化绿色荧光蛋白标记生物样本的深度学习辅助管道Deep-qGFP | Deep-qGFP是第一个成功实现于多种荧光标记场景的全能图像分析算法，适用于多种数字PCR和细胞测序技术，无需迁移学习或改动 | 当前方法在不同实验室的适应性和普遍性可能受限于不同设备测量的一致性 | 提高微反应器中绿色荧光蛋白标记样本的绝对量化精度和效率 | 使用标准实验室荧光显微镜对绿色荧光蛋白标记的微反应器进行检测和分类 | 机器学习 | NA | 荧光成像 | 深度学习模型 | 图像 | 超过2000个微反应器 |
| 376 | 2024-08-04 |
Identification of macrophage-related genes correlated with prognosis and immunotherapy efficacy in non-small cell lung cancer
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27170
PMID:38500993
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研究论文 | 本文研究了与非小细胞肺癌预后及免疫疗效相关的巨噬细胞相关基因 | 本研究首次识别出与非小细胞肺癌患者预后和免疫疗效相关的特定巨噬细胞相关基因 | 缺乏临床验证和更大规模的样本确认 | 探索能预测非小细胞肺癌预后和药物有效性的基因标志物 | 非小细胞肺癌及其周围组织中的细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 377 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing unveils the hidden powers of zebrafish kidney for generating both hematopoiesis and adaptive antiviral immunity
2024-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92424
PMID:38497789
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了斑马鱼肾脏在造血和适应性抗病毒免疫中的双重功能 | 首次全面展示了斑马鱼肾脏中59种造血干细胞/祖细胞和免疫细胞类型，并揭示了其在抗病毒免疫中的多样性功能 | NA | 阐明斑马鱼肾脏在造血和免疫系统中的功能 | 斑马鱼肾脏中的造血干细胞/祖细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 59种造血干细胞/祖细胞和免疫细胞类型 |
| 378 | 2024-08-07 |
scRNA-seq analysis discovered suppression of immunomodulatory dependent inflammatory response in PMBCs exposed to silver nanoparticles
2024-Mar-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02364-0
PMID:38494495
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq分析揭示了银纳米颗粒暴露下PBMCs中免疫调节依赖性炎症反应的抑制 | 本研究首次深入分析了单细胞水平上细胞与金属离子的关联以及特定的免疫反应 | 研究主要集中在体外模型，未涉及体内模型的验证 | 探究银纳米颗粒对PBMCs的免疫毒性 | 银纳米颗粒对PBMCs的免疫反应 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | PBMCs样本 |
| 379 | 2024-08-04 |
Protocol to dissect and dissociate the mouse brainstem for single-cell RNA-seq applications
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102908
PMID:38461411
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研究论文 | 本文提供了一种用于解剖和分离小鼠脑干以进行单细胞RNA-seq应用的协议 | 提出了一种针对小脑结构（如脑干核）的单细胞转录组学样本处理的新方法 | 样本产量可能较低，协议主要针对新生小鼠的脑干组织 | 研究小鼠脑干的单细胞转录组学 | 小鼠脑干及其相应的细胞样本 | 数字病理学 | NA | SmartSeq3 cDNA文库准备 | NA | 细胞 | 新生小鼠的脑干组织样本 |
| 380 | 2024-08-04 |
Protocol for acquiring high-quality fresh mouse lung spatial transcriptomics data
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102825
PMID:38280199
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研究论文 | 本文介绍了一种高质量新鲜小鼠肺部空间转录组数据的获取协议 | 提出了一种新的协议来克服肺泡内腔给空间转录组实验带来的挑战 | 未提及协议在不同实验条件下的适用性 | 旨在为空间转录组学的实验提供一种有效的样本获取方法 | 新鲜小鼠肺组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | cDNA数据 | NA |