单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 535 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
Single-cell atlas of the small intestine throughout the human lifespan demonstrates unique features of fetal immune cells
2024-Mar-28, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.03.011
PMID:38555026
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞RNA测序数据集，创建了人类小肠在整个生命周期中的转录组图谱，特别关注免疫细胞，并揭示了胎儿期小肠免疫细胞的独特特征 | 首次展示了胎儿小肠免疫细胞的复杂免疫景观，并识别了其在整个生命周期中的变化 | NA | 探讨人类小肠黏膜免疫系统的发育过程及其在不同生命阶段的特点 | 人类小肠的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涵盖从第一孕期到成年的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-04 |
Systematic immune cell dysregulation and molecular subtypes revealed by single-cell RNA-seq of subjects with type 1 diabetes
2024-Mar-27, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01300-z
PMID:38539228
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了1型糖尿病患者的免疫细胞失调及其分子亚型 | 首次在单细胞层面全面评估1型糖尿病中的免疫细胞表型 | 可能缺乏其他类型糖尿病的对照数据 | 评估1型糖尿病的免疫细胞特征及分子亚型 | 46名明显的1型糖尿病患者和31名匹配的对照者 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 46名1型糖尿病患者和31名对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-08-07 |
Pan-cancer evaluation of regulated cell death to predict overall survival and immune checkpoint inhibitor response
2024-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00570-5
PMID:38538696
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研究论文 | 本研究评估了调控细胞死亡（RCD）在泛癌水平上的状态及其与免疫检查点抑制剂（ICI）反应和总体生存率的关系 | 首次在泛癌水平上全面评估RCD状态及其相关特征，并开发了用于预测ICI反应和总体生存率的RCD签名 | NA | 探索RCD状态作为预测恶性肿瘤患者ICI反应和总体生存率的生物标志物的潜力 | RCD水平在30种癌症类型、29种正常组织和82个scRNA-Seq数据集中的2,573,921个细胞中的分布 | 数字病理学 | 泛癌 | scRNA-Seq | 机器学习算法 | 数据集 | 30种癌症类型，29种正常组织，2,573,921个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-04 |
Cell Heterogeneity and Variability in Peripheral Nerve after Injury
2024-Mar-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25063511
PMID:38542483
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综述 | 本文总结了外周神经损伤后的细胞异质性和变异性。 | 本研究通过总结当前的测序数据，揭示了外周神经中特别是坐骨神经的细胞异质性。 | 没有提到具体的实验数据，主要依赖于现有文献的汇总。 | 研究外周神经的细胞组成和其在损伤后的变化。 | 探讨施旺细胞、成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞的细胞变异。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-07 |
Subepithelial Stromal Cells: Their Roles and Interactions with Intestinal Epithelial Cells during Gut Mucosal Homeostasis and Regeneration
2024-Mar-17, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12030668
PMID:38540281
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综述 | 本文综述了肠道黏膜稳态和再生过程中上皮下基质细胞与肠上皮细胞的相互作用及其功能 | 利用单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、共聚焦显微镜和计算重构等新技术，识别和表征了特定的肠道间质干细胞亚群 | 由于缺乏大多数功能同质亚群的特异性标记，探索这些异质性肠道间质干细胞的功能仍然具有挑战性 | 旨在理解调控这些细胞激活的细胞途径及其在肠上皮再生过程中的相互作用 | 肠道间质干细胞及其在肠道形态发生、稳态和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS), 共聚焦显微镜 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-04 |
A Retrospective View of the Triple-Negative Breast Cancer Microenvironment: Novel Markers, Interactions, and Mechanisms of Tumor-Associated Components Using Public Single-Cell RNA-Seq Datasets
2024-Mar-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16061173
PMID:38539508
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研究论文 | 该文章回顾了三阴性乳腺癌的肿瘤微环境，探讨了新的标记物、相互作用及相关机制 | 通过公共单细胞RNA测序数据集发现了特定的TNBC标记和细胞类型间的相互作用 | 该研究使用了公共数据集，可能限制了对特定临床背景的分析 | 寻找新的治疗靶点，以更好地理解三阴性乳腺癌的肿瘤微环境 | 分析三阴性乳腺癌肿瘤细胞及其微环境中的不同细胞类型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 利用公共单细胞RNA测序数据集分析多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-07 |
Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Elucidate the Etiology of Severe COVID-19
2024-Mar-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25063280
PMID:38542251
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序技术，探讨了严重COVID-19的潜在病因及其与系统性自身免疫疾病的相似性 | 本研究首次综合分析了批量和单细胞RNA测序数据，揭示了严重COVID-19与炎症相关基因的上调关系 | NA | 阐明严重COVID-19的病因 | 严重COVID-19的基因表达模式及其与炎症综合征的关联 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 27项研究和8项meta分析的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-04 |
Unveiling Shared Immune Responses in Porcine Alveolar Macrophages during ASFV and PRRSV Infection Using Single-Cell RNA-seq
2024-Mar-12, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12030563
PMID:38543614
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研究论文 | 本研究揭示了非洲猪瘟病毒（ASFV）和猪繁殖与呼吸综合症病毒（PRRSV）感染期间猪肺泡巨噬细胞的共同免疫反应 | 首次比较了ASFV和PRRSV感染后猪肺泡巨噬细胞共享的免疫反应 | 本研究可能仅适用于特定的细胞类型和病毒模型，结果的普遍性尚待验证 | 研究ASFV和PRRSV感染对猪肺泡巨噬细胞免疫反应的影响 | 猪肺泡巨噬细胞（PAMs）在ASFV和PRRSV感染后的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用两个单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-04 |
Exploring Transcriptional Regulation of Beta Cell SASP by Brd4-Associated Proteins and Cell Cycle Control Protein p21
2024-Mar-06, Epigenomes
IF:2.5Q3
DOI:10.3390/epigenomes8010010
PMID:38534794
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研究论文 | 这篇文章探讨了Brd4相关蛋白和细胞周期控制蛋白p21对β细胞SASP的转录调控。 | 揭示了Brd4与多种蛋白绑定，并探讨了p21在β细胞SASP机制中的作用。 | 在NIT-1细胞中，p21的RNAi干扰对细胞活力或SASP没有显著影响，这可能限制了对p21功能的全面理解。 | 探讨在1型糖尿病模型中β细胞SASP的转录调控机制。 | 使用NOD小鼠模型的β细胞系NIT-1作为研究对象。 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | RNA干扰 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NOD小鼠模型中的小鼠β细胞和来自对照、自身抗体阳性及1型糖尿病供体的人类β细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-04 |
Population-level comparisons of gene regulatory networks modeled on high-throughput single-cell transcriptomics data
2024-Mar, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00597-5
PMID:38438786
|
研究论文 | 该文章介绍了一种名为SCORPION的工具，通过高通量单细胞转录组数据重建可比较的基因调控网络 | SCORPION使用信息传递算法重建基因调控网络，并在合成数据上优于12种现有技术，显示其准确识别不同细胞间调控网络差异的能力 | 文章未讨论SCORPION在不同生物背景下的适应性 | 研究旨在实现单细胞RNA测序数据在群体水平的基因调控网络比较 | 文章研究了来自结直肠癌及其相邻健康组织的200,436个单细胞的基因调控网络 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 单细胞 RNA 测序数据 | 200,436个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-07 |
Schnurri-3 controls osteogenic fate of Adipoq-lineage progenitors in bone marrow
2024-Mar, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.01.008
PMID:38549808
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型，探讨了Schnurri-3在Adipoq谱系前体细胞中的作用及其对骨形成和骨折愈合的影响 | 首次揭示了Schnurri-3在Adipoq谱系前体细胞中的功能，及其对骨形成和骨折愈合的促进作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证其临床应用潜力 | 探讨Schnurri-3在Adipoq谱系前体细胞中的作用及其对骨形成和骨折愈合的影响 | Adipoq谱系前体细胞和Schnurri-3基因 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | RNA序列数据 | 小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-07 |
Predicting mechanism of immune response in microsatellite instability colorectal cancer
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28120
PMID:38545192
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研究论文 | 本研究利用计算程序分析单细胞RNA测序数据，识别出微卫星不稳定性结直肠癌（MSI-CRC）中特定的表达程序，并探讨了这些程序与免疫反应和转移功能的关系 | 首次通过非负矩阵分解（NMF）识别出MSI-CRC特有的三个复发模块，并发现这些模块与代谢和炎症反应功能富集相关 | 研究主要集中在MSI-CRC的免疫反应机制，未涉及微卫星稳定性（MSS）结直肠癌的比较分析 | 探讨微卫星不稳定性结直肠癌中免疫反应的预测机制 | 微卫星不稳定性结直肠癌（MSI-CRC）的免疫反应和转移功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 涉及多个结直肠癌细胞系的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-07 |
A p53 score derived from TP53 CRISPR/Cas9 HMCLs predicts survival and reveals a major role of BAX in the response to BH3 mimetics
2024-Mar-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021581
PMID:38096363
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术从TP53+/+和TP53-/mut t(4;14)人类骨髓瘤细胞系(HMCLs)中衍生出TP53-/-克隆，建立了严格的p53依赖性基因表达谱，并开发了一个功能性p53评分系统，该评分系统涉及13个在p53沉默时特异性下调的基因。 | 本研究首次建立了一个功能性p53评分系统，能够有效识别双等位TP53失活的骨髓瘤患者样本，并预测其总体生存率。此外，研究还发现p53调控的BAX表达对骨髓瘤细胞对BH3模拟物的敏感性有直接影响，并且MCL1和BCL2 BH3模拟物的组合显示出协同效应。 | 研究主要集中在骨髓瘤细胞系和患者样本上，未来需要进一步验证该评分系统在其他癌症类型中的应用。 | 建立一个功能性p53评分系统，以识别双等位TP53失活的骨髓瘤细胞，并研究p53调控的BAX在骨髓瘤细胞对BH3模拟物反应中的作用。 | TP53+/+和TP53-/mut t(4;14)人类骨髓瘤细胞系(HMCLs)，以及骨髓瘤患者样本。 | 数字病理学 | 骨髓瘤 | CRISPR/Cas9技术 | NA | 基因表达数据 | 涉及17个失调基因，13个特异性下调基因，以及多个骨髓瘤细胞系和患者样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immune features and viral tropism in the central nervous system of mice infected with Japanese encephalitis virus
2024-Mar-26, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03071-1
PMID:38532383
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了日本脑炎病毒感染小鼠中枢神经系统后的免疫特征和病毒趋向性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了日本脑炎病毒对小鼠大脑中不同神经亚型的病毒趋向性和细胞组成的改变 | NA | 探讨日本脑炎病毒在小鼠中枢神经系统中的作用机制及其对神经损伤和炎症的影响 | 日本脑炎病毒感染的小鼠中枢神经系统细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 88,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-08-07 |
Unveiling the functional heterogeneity of cytokine-primed human umbilical cord mesenchymal stem cells through single-cell RNA sequencing
2024-Mar-26, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01219-3
PMID:38532459
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了由不同细胞因子预处理的脐带间充质干细胞的功能异质性及其分子机制 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了细胞因子预处理对间充质干细胞异质性、生物功能及其功能亚群的调控作用 | NA | 揭示细胞因子预处理的间充质干细胞的细胞异质性、功能亚群及分子机制 | 脐带间充质干细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及IFN-γ、TNF-α、IL-4、IL-6、IL-15和IL-17预处理的脐带间充质干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Small Cell Neuroendocrine Carcinoma of the Endometrium Reveals ISL1 as a Potential Biomarker for Diagnosis and Treatment
2024-Mar-13, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2903100
PMID:38538277
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了子宫内膜小细胞神经内分泌癌的转录组，揭示了ISL1作为潜在的诊断和治疗生物标志物 | 首次在子宫内膜小细胞神经内分泌癌中探讨了ISL1的表达及其作为生物标志物的潜力 | 研究样本量较小，仅基于单一病例的样本进行分析 | 探索子宫内膜小细胞神经内分泌癌的诊断和治疗标志物 | 子宫内膜小细胞神经内分泌癌及其细胞内的ISL1表达 | 数字病理学 | 妇科肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单一病例样本 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell analysis reveals heterogeneity of fibroblast subpopulations in ovarian cancer tissue microenvironment
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27873
PMID:38533040
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研究论文 | 该研究揭示了卵巢癌组织微环境中成纤维细胞亚群的异质性。 | 首次较为全面地分析了卵巢癌组织微环境中成纤维细胞亚群的特性及其在TGFβ信号通路中的功能。 | 对成纤维细胞亚群的特定功能了解仍然不够充分。 | 探讨卵巢癌组织中成纤维细胞亚群的异质性及其在癌症进展中的作用。 | 卵巢癌组织样本中的成纤维细胞亚群。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | RNA-seq | 32个卵巢癌样本和3226个公共数据库中的大规模RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-08-07 |
Prognostic prediction using a gene signature developed based on exhausted T cells for liver cancer patients
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28156
PMID:38533068
|
研究论文 | 本研究基于T细胞耗竭的关键预后基因开发了一个用于肝癌患者的预后预测模型 | 利用单细胞RNA测序数据和基因共表达网络分析，结合Lasso和多/单变量Cox分析构建了一个新的风险评分系统，并开发了一个能够预测不同风险组免疫浸润和免疫治疗敏感性的诺模图 | NA | 开发一个基于T细胞耗竭的关键预后基因的预后预测模型，以改善肝癌患者的临床治疗 | 肝癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分系统 | 单细胞RNA测序数据 | 18,413个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-08-07 |
Nephroblastoma-specific dysregulated gene SNHG15 with prognostic significance: scRNA-Seq with bulk RNA-Seq data and experimental validation
2024-Mar-25, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-024-00946-w
PMID:38526609
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和批量RNA测序（RNA-Seq）数据，识别并验证了在肾母细胞瘤（WT）中具有预后意义的失调基因SNHG15。 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了SNHG15在肾母细胞瘤中的预后价值及其功能机制。 | 实验仅限于G401细胞系，未来研究需在更多细胞系和临床样本中验证SNHG15的作用。 | 探索肾母细胞瘤中的预后标志物及其分子机制。 | 肾母细胞瘤组织中的SNHG15基因及其在细胞增殖、迁移和凋亡中的作用。 | 数字病理学 | 肾母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），批量RNA测序（RNA-Seq） | NA | RNA | 基于scRNA-seq数据识别了20个簇，并注释了10种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing unveils tumor heterogeneity and immune microenvironment between subungual and plantar melanoma
2024-03-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57640-8
PMID:38528036
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了指（趾）甲下黑色素瘤（SM）和足底黑色素瘤（PM）之间的肿瘤异质性和免疫微环境差异 | 首次详细比较了SM和PM在基因表达、拷贝数变异（CNV）及肿瘤相关通路（如NF-κb和Wnt）的差异，并揭示了免疫微环境中特定轴（EPHA3-EFNA1和TIGIT-NECTIN2）的表达情况 | 研究样本仅限于SM和PM患者，可能无法完全代表所有类型的黑色素瘤 | 探索不同亚型黑色素瘤的肿瘤异质性和免疫微环境 | 指（趾）甲下黑色素瘤（SM）和足底黑色素瘤（PM） | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 24,789个单细胞 | NA | NA | NA | NA |