单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 535 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-07 |
Unlocking the potential of T-cell metabolism reprogramming: Advancing single-cell approaches for precision immunotherapy in tumour immunity
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1620
PMID:38468489
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在解析T细胞亚群及其代谢状态中的应用，以及这些代谢途径如何影响肿瘤微环境中的T细胞功能 | 本文揭示了T细胞代谢重编程与免疫功能之间的相互作用，为精准免疫治疗提供了新的视角 | NA | 探索T细胞代谢与免疫功能之间的相互作用机制，以推动精准免疫治疗的发展 | T细胞的代谢途径及其在肿瘤微环境中的功能 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-08-07 |
Mechanism and endoscopic-treatment-induced evolution of biliary non-anastomotic stricture after liver transplantation revealed by single-cell RNA sequencing
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1622
PMID:38481381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝移植后胆道非吻合口狭窄的机制及内镜治疗引起的演变 | 首次对胆道并发症患者的胆管进行单细胞转录组测序，分析了非吻合口狭窄及内镜治疗期间多种细胞类型的比例和表型变化 | 样本采集不足且缺乏公认的动物模型 | 揭示肝移植后胆道非吻合口狭窄的病理生理和遗传机制及内镜治疗引起的演变 | 肝移植后胆道非吻合口狭窄患者 | 数字病理学 | 肝移植并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自接受连续胆道支架植入的非吻合口狭窄患者的胆管样本 | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomes reveals COL4A1/2 facilitates the spatial organisation of stromal cells differentiation in breast phyllodes tumours
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1611
PMID:38481388
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据，揭示了COL4A1/2在乳腺叶状肿瘤中促进间质细胞空间组织分化的作用 | 首次揭示了COL4A1/2在乳腺叶状肿瘤中间质细胞空间组织分化的作用，并发现了新的诊断标志物 | NA | 阐明乳腺叶状肿瘤中的细胞亚群组成和空间结构，并探索其发病机制中的诊断标志物 | 乳腺叶状肿瘤及其周围正常组织 | 数字病理学 | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光实验、激光捕获显微切割、数据非依赖性采集质谱 | NA | 转录组数据 | 30个样本来自11个乳腺叶状肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the peripheral blood mononuclear cell landscape and monocyte status during colorectal adenocarcinoma formation
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1609
PMID:38488463
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing unveils an Odc1-marked endothelial subpopulation critical for pathological angiogenesis
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1640
PMID:38533645
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-08-05 |
Machine Learning-Based Characterization and Identification of Tertiary Lymphoid Structures Using Spatial Transcriptomics Data
2024-Mar-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25073887
PMID:38612697
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研究论文 | 该研究利用空间转录组数据对三级淋巴结构进行表征和识别 | 首次应用机器学习技术识别三级淋巴结构的标记，并建立预测模型 | 目前对TLS标记的一致性仍有待进一步验证 | 旨在通过机器学习方法识别和预测三级淋巴结构 | 三级淋巴结构及其标记基因 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学 | 支持向量分类器 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-08-07 |
Comparative Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Methods with and without Sample Multiplexing
2024-Mar-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25073828
PMID:38612639
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研究论文 | 本研究对比分析了有无样本多重化的单细胞RNA测序方法 | 首次对比了使用样本多重化的Parse Biosciences平台和未使用样本多重化的10x Genomics平台的单细胞RNA测序方法 | 研究仅使用了来自两名健康个体的PBMCs样本，可能限制了结果的普遍性 | 评估不同单细胞RNA测序方法在样本多重化与非多重化条件下的性能 | 来自两名健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 两名健康个体的PBMCs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-08-04 |
A comprehensive multi-omics analysis identifies a robust scoring system for cancer-associated fibroblasts and intervention targets in colorectal cancer
2024-Mar-13, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05548-7
PMID:38478111
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研究论文 | 本研究建立了一个癌症相关成纤维细胞的评分系统，并识别了结直肠癌的干预靶点 | 创新性地开发了一个基于CAF基因评分的系统，用于评估结直肠癌患者的免疫微环境和预后 | 研究的局限性在于样本量和真实性的验证需要进一步的临床试验支持 | 研究癌症相关成纤维细胞在结直肠癌中的临床应用和生物学机制 | 癌症相关成纤维细胞及其在结直肠癌中的不同亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 机器学习分析 | NA | 基因组数据 | 多个结直肠癌队列的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-08-07 |
Differentiation Potential of Hypodifferentiated Subsets of Nephrogenic Rests and Its Relationship to Prognosis in Wilms Tumor
2024 Mar-Apr, Fetal and pediatric pathology
IF:0.7Q4
DOI:10.1080/15513815.2024.2303081
PMID:38217324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据进行伪时间分析，生成了一个与Wilms瘤分化相关的基因签名，用于预测儿童总体生存率，并探讨了肾源性残余向Wilms瘤的分化轨迹及其与预后的关系。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了肾源性残余向Wilms瘤的分化轨迹，并开发了一个基于WTDRG的风险模型和临床适用的列线图。 | NA | 探讨Wilms瘤的发生机制及针对不良预后的干预措施。 | 肾源性残余和Wilms瘤。 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-04 |
[Exploring the Role of PCDHGB4 in the Occurrence of Lung Squamous Cell Carcinoma Based on Bioinformatics Analysis]
2024-Mar-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
研究论文 | 本研究探讨了PCDHGB4在肺鳞癌发生中的作用及其潜在的预后价值 | 首次系统分析了PCDHGB4在肺鳞癌中的表达特征及其与肿瘤免疫和预后的关联 | 目前数据主要来源于单一数据库，可能存在样本选择偏倚 | 研究PCDHGB4在肺鳞癌发展中的作用及其预后潜力 | 主要研究对象为肺鳞癌患者中PCDHGB4的表达和相关临床特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 通过TCGA等数据库分析了大量肺鳞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-08-07 |
miR-644a is a tumor cell-intrinsic mediator of sex bias in glioblastoma
2024-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.11.584443
PMID:38559056
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研究论文 | 本文研究了miR-644a在胶质母细胞瘤（GBM）中性别偏倚的肿瘤细胞内在介导作用 | 首次揭示了miR-644a在GBM中性别偏倚的肿瘤细胞内在介导作用 | NA | 探讨miR-644a在胶质母细胞瘤中性别偏倚的机制 | miR-644a及其在GBM中的性别偏倚作用 | NA | 脑瘤 | miRNA和mRNA测序 | NA | 测序数据 | 39名GBM患者（22名男性，17名女性）和110名GBM患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-08-07 |
IRF1 governs the expression of SMARCC1 via the GCN5-SETD2 axis and actively engages in the advancement of osteoarthritis
2024-Mar, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.01.002
PMID:38586591
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研究论文 | 本研究分析了IRF1-GCN5-SETD2-SMARCC1轴在骨关节炎（OA）发展中的作用 | 发现IRF1通过GCN5和SETD2调控SMARCC1的表达，进而影响H3K27ac和H3K4me3修饰，促进M1巨噬细胞的极化，推动骨关节炎的进展 | NA | 分析IRF1-GCN5-SETD2-SMARCC1轴在骨关节炎发展中的功能 | IRF1、SMARCC1、GCN5、SETD2以及它们在骨关节炎中的作用 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 13名骨关节炎患者和7名无骨关节炎的骨折患者 | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-07 |
DELVE: feature selection for preserving biological trajectories in single-cell data
2024-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46773-z
PMID:38553455
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research paper | 本文介绍了一种名为DELVE的无监督特征选择方法，用于在单细胞数据中保留生物学轨迹 | DELVE采用自下而上的方法来减少混杂变异源的影响，并基于核心调控复合体从动态基因或蛋白质模块中建模细胞状态 | NA | 旨在识别能够稳健重现细胞轨迹的分子特征子集 | 单细胞数据中的生物学轨迹 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing, iterative immunofluorescence imaging | NA | single-cell data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-07 |
The remission status of AML patients after allo-HCT is associated with a distinct single-cell bone marrow T-cell signature
2024-Mar-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021815
PMID:38197505
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性髓系白血病（AML）患者在接受异基因造血干细胞移植（allo-HCT）100天后骨髓T淋巴细胞和CD34+细胞的特征，以识别与即将复发（REL）或持续完全缓解（CR）相关的T细胞特征。 | 研究首次揭示了在allo-HCT后，骨髓T细胞的特定单细胞特征与AML患者的缓解状态相关，并识别出ADGRG1/GPR56作为CR CD8+ T细胞的表面标记物。 | 研究样本量较小，仅涉及6名患者，可能影响结果的普遍性。 | 旨在识别与AML患者allo-HCT后缓解状态相关的T细胞特征。 | 急性髓系白血病患者的骨髓T淋巴细胞和CD34+细胞。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 6名AML患者 | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-08-04 |
Modeling interpretable correspondence between cell state and perturbation response with CellCap
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.585078
PMID:38558987
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研究论文 | 本研究提出CellCap，一种旨在对单细胞扰动实验进行端到端分析的深度生成模型 | CellCap通过稀疏字典学习将细胞状态特异的扰动响应解构为一组转录响应程序，并通过点积交叉注意力来增强模型的解释能力 | 该研究主要评估CellCap在多个模拟场景下的模型可解释性，可能在某些实际应用中表现不佳 | 揭示细胞状态与扰动响应之间的关系，以深入理解细胞行为 | 使用单细胞转录组学和扰动数据集进行分析 | 数字病理学 | NA | 深度生成模型 | 生成模型 | 转录组数据 | 两个真实的单细胞扰动数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of layer 4 in visual areas of rhesus macaque cortex
2024-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.11.584345
PMID:38559123
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细研究了猕猴视觉皮层中五个相邻区域的细胞异质性，并开发了一种新的脑空间存档方法BrainSPACE。 | 开发了一种新的脑空间存档方法BrainSPACE，并首次揭示了猕猴视觉皮层中特定神经元亚型的分布和密度梯度。 | NA | 探索猕猴视觉皮层中相邻区域的细胞异质性和层次结构。 | 猕猴视觉皮层中的V1、V2、V4、MT和TEO区域。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），小分子荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 约100,000个来自视觉区域V1和V4的细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-07 |
Self-assembly of differentiated dental pulp stem cells facilitates spheroid human dental organoid formation and prevascularization
2024-Mar-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i3.287
PMID:38577232
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研究论文 | 本研究展示了成人干细胞和人牙髓干细胞在体外低氧和条件培养基下的三维自组装，形成新型球形牙髓类器官并促进其血管化 | 本研究创新性地建立了体外血管化牙髓类器官模型，并阐明了再生过程中血管生成的新机制 | 牙髓类器官缺乏血管限制了其应用 | 提高干细胞移植后的存活率和恢复能力 | 成人干细胞、人牙髓干细胞和内皮细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定比例的预处理人牙髓干细胞与内皮细胞混合 | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-08-07 |
Ferroptosis biomarkers predict tumor mutation burden's impact on prognosis in HER2-positive breast cancer
2024-Mar-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i3.391
PMID:38576597
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研究论文 | 本研究旨在识别和评估HER2阳性乳腺癌中与铁死亡相关的新型生物标志物，并探讨其与肿瘤突变负荷对预后的影响。 | 开发了一个包含PROM2、SLC7A11、FANCD2和FH的四基因预测模型，并在TCGA和METABRIC队列中验证了其有效性。 | NA | 识别和评估HER2阳性乳腺癌中与铁死亡相关的新型生物标志物。 | HER2阳性乳腺癌患者。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | TCGA和METABRIC数据库中的HER2阳性乳腺癌患者。 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-08-07 |
Monocyte state 1 (MS1) cells in critically ill patients with sepsis or non-infectious conditions: association with disease course and host response
2024-03-19, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-024-04868-5
PMID:38504349
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研究论文 | 本研究探讨了单核细胞状态1（MS1）细胞在重症监护病房（ICU）中患有脓毒症或非感染性疾病的患者中的分布及其与疾病进程和宿主反应的关系 | 首次使用转录组反卷积方法（CIBERSORTx）评估MS1细胞在脓毒症患者中的比例，并研究其与疾病严重程度和宿主反应失调的关系 | 研究未区分MS1细胞在幸存者和非幸存者之间或二次感染患者之间的差异 | 确定MS1细胞特征与疾病表现、预后和宿主反应特征之间的关联 | 脓毒症患者和ICU中无感染的患者 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 332名脓毒症患者和215名无感染的ICU患者 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-07 |
Monocytes Release Pro-Cathepsin D to Drive Blood-to-Brain Transcytosis in Diabetes
2024-Mar-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323622
PMID:38420756
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研究论文 | 研究探讨了单核细胞释放的前胱天蛋白酶D在糖尿病中驱动血液到大脑的转胞吞作用中的作用 | 发现了循环中的前胱天蛋白酶D在糖尿病脑微血管病变发病机制中的新作用 | NA | 确定2型糖尿病进展中微血管并发症的潜在机制 | 人类单核细胞样本和表达人胱天蛋白酶D的转基因小鼠 | NA | 糖尿病 | 高通量RNA测序 | NA | RNA | 控制组和糖尿病患者的单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |