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当前共找到 534 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-04 |
Integrated single-cell sequencing, spatial transcriptome sequencing and bulk RNA sequencing highlights the molecular characteristics of parthanatos in gastric cancer
2024-03-18, Aging
DOI:10.18632/aging.205658
PMID:38499384
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研究论文 | 本研究首次揭示了胃癌中parthanatos的单细胞和空间转录组学的分子特征 | 提出新的基于parthanatos信号的模型，用于区分个体异质性和预测胃癌患者的临床结果 | 研究中可能存在的特定肿瘤微环境复杂性和样本数量的限制未被详细讨论 | 探讨parthanatos在胃癌中的分子特征及其在临床结果中的应用 | 胃癌患者的肿瘤细胞及其微环境中的不同细胞类型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、空间转录组测序和大宗RNA测序 | NA | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-08-04 |
Comprehensive assessment of regulatory T-cells-related scoring system for predicting the prognosis, immune microenvironment and therapeutic response in hepatocellular carcinoma
2024-03-08, Aging
DOI:10.18632/aging.205649
PMID:38461439
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研究论文 | 本文探讨了一种新的Tregs相关评分系统来预测肝细胞癌的肿瘤免疫微环境、临床结果和个体化治疗 | 构建了一种新的Tregs相关生物标志物，具有良好的预后预测效能和稳定性 | 可能在样本选择和数据一致性上存在局限性，未来需要更多的研究来验证 | 研究肝细胞癌的预后和免疫微环境 | 肝细胞癌患者的Tregs及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | Cox回归和LASSO回归 | 基因组数据 | 三组独立队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-08-05 |
Investigating the mechanisms of drug resistance and prognosis in ovarian cancer using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2024-03-08, Aging
DOI:10.18632/aging.205628
PMID:38461424
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研究论文 | 本文研究了卵巢癌中药物耐受性及预后的机制 | 揭示了不同表皮细胞亚群与卵巢癌预后的相关基因，特别是EPCs耐药性与氧化磷酸化通路之间的强关联 | 本文未详细探讨其他影响卵巢癌预后的因素 | 研究卵巢癌中药物耐受性与预后的机制 | 核心肿瘤细胞及其不同表皮细胞亚群 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA combined with bulk RNA analysis to explore oxidative stress and energy metabolism factors and found a new prostate cancer oncogene MXRA8
2024-03-04, Aging
DOI:10.18632/aging.205599
PMID:38441550
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研究论文 | 本文探讨了氧化应激和能量代谢因素，并发现了一种新的前列腺癌致癌基因MXRA8 | 本研究首次整合单细胞RNA测序和总体RNA测序数据，识别了前列腺癌的分子亚型，并构建了风险评分模型 | 研究可能受到样本数量和异质性的限制，影响结果的普适性 | 旨在通过分析氧化应激和能量代谢相关基因，提升前列腺癌的预后评估和个性化治疗 | 前列腺癌患者及其组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序和总体RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-08-04 |
Critical view on oligo(dT)-based RNA-seq: bias arising, modeling, and mitigating
2024-03-06, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyad190
PMID:37857456
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研究论文 | 本文探讨了基于oligo(dT)的RNA测序中存在的偏差及其缓解方法。 | 本研究识别了两个新的未被考虑的偏差，并发展出一种普适的缓解方法以减少这些偏差的影响。 | 研究可能未涵盖所有类型的RNA测序偏差，且其通用性需进一步验证。 | 研究的目的是理解和解决基于oligo(dT)的RNA测序数据中的偏差。 | 研究主要集中在单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集及其分析上。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-08-04 |
Dual-Targeting Nanovesicles Carrying CSF1/CD47 Identified from Single-Cell Transcriptomics of Innate Immune Cells in Heart Transplant for Alleviating Acute Rejection
2024-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202302443
PMID:37962054
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研究论文 | 本文研究了双靶向纳米囊泡CSF1/CD47在心脏移植中的作用，以缓解急性排斥反应 | 提出了一种新型的CSF1/CD47双靶向纳米囊泡，通过调节Ly6G Ly6C抑制性巨噬细胞来减轻免疫排斥 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床应用可能需要更多验证 | 探讨固有免疫细胞在心脏移植急性排斥反应中的动态变化和调控机制 | 研究了Ly6G Ly6C炎性巨噬细胞及其与中性粒细胞的相互信号传导 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Ameliorative Effect of Oridonin on Septic Liver Injury
2024-03, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300542
PMID:38408269
|
研究论文 | 该文章主要研究了Oridonin对脓毒症肝损伤的改善作用及其机制 | 通过单细胞转录组学揭示Oridonin在脓毒症模型中的保护机制 | 实验主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探索Oridonin对脓毒症引起的生理变化的保护作用 | 脓毒症诱导的小鼠肝脏模型 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 63,486个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-08-04 |
Identification of Surface Markers and Functional Characterization of Myeloid Derived Suppressor Cell-Like Adherent Cells
2024-03, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300159
PMID:37986133
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研究论文 | 本研究识别了髓源抑制细胞样附着细胞的基因特征及功能 | 本研究首次识别了特定的MLAC表面标记，为进一步研究这种细胞类型提供了重要工具 | 缺乏对MLAC特异性标记的了解在进一步特性化该细胞类型时造成限制 | 研究髓源抑制细胞样附着细胞在肿瘤微环境中的角色以及其特征 | 髓源抑制细胞样附着细胞的基因签名和功能特性 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公共单细胞RNA-seq数据分析特定细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals transcriptional and cell subpopulation differences between human and pig immune cells
2024-03, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01456-9
PMID:37979077
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人类与猪免疫细胞之间的转录和细胞亚群差异 | 首次研究了人类和猪免疫细胞亚群之间的基因转录谱差异 | 样本量较小，仅包含两只猪和两位健康人类PBMCs | 评估猪和人类之间基因转录的相似性和差异 | 研究对象为猪和人类的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | NA | 10×基因组单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2只猪和2位健康人类的PBMC | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-08-05 |
Integrated multiomics implicates dysregulation of ECM and cell adhesion pathways as drivers of severe COVID-associated kidney injury
2024-Mar-19, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.03.18.24304401
PMID:38562892
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研究论文 | 本研究探讨了导致严重COVID相关肾损伤的机制，结合深度尿液蛋白组学和机器学习进行分析 | 通过整合多种组学数据，揭示了细胞外基质及细胞黏附通路在严重COVID肾损伤中的独特影响 | 研究样本及机制分析的复杂性可能限制了结果的普遍适用性 | 旨在理解严重COVID相关肾损伤的机制 | 住院COVID-19患者的尿液样本与肾小管细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 深度蛋白组学, 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 尿液蛋白质, 血浆蛋白质, 单细胞RNA测序 | 多个中心住院COVID-19患者的尿液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-08-05 |
Long noncoding RNA Malat1 protects against osteoporosis and bone metastasis
2024-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46602-3
PMID:38493144
|
研究论文 | 本研究发现长链非编码RNA Malat1在骨质疏松和骨转移中的保护作用 | 本研究首次揭示了MALAT1在骨吸收过程中的关键调控角色及其对骨质疏松和肿瘤骨转移的保护机制 | 本研究主要基于小鼠模型，临床应用性尚需进一步验证 | 探讨MALAT1在生理和病理过程中对骨质疏松及骨转移的影响 | 研究了MALAT1缺失对小鼠骨质疏松和黑色素瘤及乳腺肿瘤细胞骨转移的影响 | 数字病理学 | 骨质疏松 | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 临床骨样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-08-05 |
A Single-Cell Transcriptome of Bovine Milk Somatic Cells
2024-03-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15030349
PMID:38540408
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析牛奶中细胞，探讨乳腺的生物学特性 | 首次在单细胞水平上分析了高产乳牛的牛奶转录组 | 研究仅使用了两只荷斯坦奶牛的样本，结果的普遍适用性可能有限 | 探索牛奶产生过程中的细胞级机制 | 来自两只荷斯坦奶牛的乳液样本 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 2只牛的乳液样本，获得9313和14544个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-08-04 |
Mapping the Cellular Biogeography of Human Bone Marrow Niches Using Single-Cell Transcriptomics and Proteomic Imaging
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.585083
PMID:38559168
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研究论文 | 本文使用单细胞转录组学和蛋白质组成像绘制了人类骨髓微环境的细胞生物地理学 | 首次全面构建了人类骨髓的空间分辨多组学图谱 | 研究主要集中于较小的样本量，可能无法代表所有人群 | 探索人类骨髓中非造血细胞的空间组织及其功能 | 29,325个富集的非造血骨髓细胞及18例个体的样品 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) 和CO-检测通过索引 (CODEX) 多重成像 | NA | 图像和转录组数据 | 29,325个非造血骨髓细胞和18个个体样本 | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-08-05 |
Gene-expression memory-based prediction of cell lineages from scRNA-seq datasets
2024-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47158-y
PMID:38553478
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研究论文 | 该文章介绍了一种基于基因表达记忆的细胞谱系推断工具GEMLI，用于从scRNA-seq数据集中识别细胞谱系 | GEMLI能够从缺乏谱系信息的scRNA-seq数据中可靠地识别小到中型细胞谱系，并重建多细胞结构 | 该方法在技术上复杂，通常受限于时间分辨率 | 研究细胞分化过程中的遗传信息传递 | 人类乳腺癌活检样本中的细胞谱系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 人类乳腺癌活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-08-04 |
Navigating the landscapes of spatial transcriptomics: How computational methods guide the way
2024 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1839
PMID:38527900
|
综述 | 本文综述了空间转录组数据挖掘的当前计算方法 | 提出了对现有分析理论和工具的更新和改革建议，以应对新的实验技术 | 数据分析和生物学见解生成的困难尚未完全解决 | 探讨空间转录组研究中的计算方法 | 空间转录组数据及其挖掘方法 | 计算生物学 | NA | NA | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-08-04 |
Spatial analysis toolkits for RNA in situ sequencing
2024 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1842
PMID:38605484
|
综述 | 本文介绍了RNA原位测序（ISS）的生物信息学工具包及其数据分析流程 | 提出了适用于ISS数据分析的先进生物信息学工具，并详细审查了每种工具的应用及其与ISS数据的兼容性 | 未提及具体的实验实例支持工具的有效性 | 帮助研究者选择合适的工具以进行ISS数据分析 | RNA原位测序（ISS）和相关数据分析工具 | 数字病理学 | NA | 原位测序（ISS） | NA | 图像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-08-05 |
scX: A user-friendly tool for scRNA-seq exploration
2024-Mar-07, ArXiv
PMID:37961742
|
研究论文 | 本论文介绍了scX，一个基于Shiny框架的R包，用于简化单细胞RNA测序的数据分析和可视化 | scX提供了一个用户友好的互动图形界面，使用户能够轻松访问关键的scRNA-seq分析 | 需要熟练的专业知识来处理和解释数据 | 研究旨在简化单细胞RNA测序实验的数据分析和可视化 | 单细胞RNA测序实验的数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-08-05 |
Investigation of cellular communication and signaling pathways in tumor microenvironment for high TP53-expressing osteosarcoma cells through single-cell RNA sequencing
2024-Mar-25, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-024-02318-4
PMID:38526643
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨高TP53表达骨肉瘤细胞在肿瘤微环境中的细胞间通信和信号通路 | 探究了高TP53表达骨肉瘤细胞与肿瘤微环境内相邻细胞类型之间的细胞间动态，识别了重要的信号通路 | 对细胞间通信网络的理解仍需更深入的研究 | 阐明骨肉瘤TME内细胞间通信网络的复杂性 | 高TP53表达骨肉瘤细胞及其周围的巨噬细胞、单核细胞、内皮细胞和PVLs | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-08-04 |
Casp11 Deficiency Alters Subgingival Microbiota and Attenuates Periodontitis
2024-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231221712
PMID:38197150
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研究论文 | 本研究探讨了Caspase-11介导的非经典焦亡、亚龈微生物群变化与巨噬细胞极化之间的相互作用 | 揭示了Caspase-11在牙周炎病理生理过程中的关键作用，并强调其对亚龈微生物群和巨噬细胞M1极化的影响 | 具体机制尚不清楚，需进一步研究以验证这些发现 | 探讨Caspase-11缺失对亚龈微生物群及牙周炎的影响 | 牙周炎患者的临床样本以及实验性牙周炎小鼠模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 临床样本 | 牙周炎患者的临床样本及实验性小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-08-05 |
Tumor-infiltrating monocytic myeloid-derived suppressor cells contribute to the development of an immunosuppressive tumor microenvironment in gastric cancer
2024-03, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association
IF:6.0Q1
DOI:10.1007/s10120-023-01456-4
PMID:38217732
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研究论文 | 本研究探讨了不同免疫抑制细胞在胃癌免疫微环境发展中的作用 | 识别了肿瘤浸润的单核细胞来源抑制性细胞在胃癌免疫抑制微环境中的关键作用，尤其是IER3+ M-MDSCs | 研究主要集中于未治疗或对免疫检查点抑制剂(Ici)有抵抗性的胃癌患者的样本 | 探讨不同免疫抑制细胞类型在胃癌免疫微环境中的作用 | 未治疗或对免疫检查点抑制剂抵抗的胃癌患者的样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和多重免疫染色 | NA | 基因表达数据 | 未处理或免疫检查点抑制剂抵抗的胃癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |