单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 540 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-04 |
Molecular architecture of primate specific neural circuit formation
2024-Mar-22, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4082064/v1
PMID:38562839
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研究论文 | 本研究分析了豚鼠皮层发育过程中的基因表达动态，揭示了灵长类特有神经回路形成的分子机制 | 首次应用空间转录组学技术识别灵长类发展中的轴突引导分子，并发现其在皮层不同区域具有独特的时空表达模式 | 研究仅限于豚鼠皮层，可能无法完全代表其他灵长类或人类的大脑发育机制 | 旨在理解灵长类特定神经回路形成的分子机制 | 豚鼠皮层发育过程中的基因表达变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及，但关注了豚鼠皮层的多个关键区域和时间点 |
| 242 | 2024-08-04 |
[High expression of UBE2S promotes progression of hepatocellular carcinoma by increasing cancer cell stemness]
2024-Mar-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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研究论文 | 本研究调查了UBE2S在肝细胞癌微环境中不同细胞类型的表达及其对HCC细胞增殖和干性影响 | 揭示了UBE2S在肝细胞癌细胞干性中的重要作用，并首次在HCC微环境中展示了其与T细胞的高表达相关性和不良预后 | 未能详细探讨UBE2S在其他癌症类型中的作用以及其潜在的分子机制 | 深入研究UBE2S在肝细胞癌中的表达及其生物学功能 | 主要针对肝细胞癌细胞和微环境中的T细胞进行研究 | 数字病理 | 肝癌 | 免疫组化，免疫荧光染色，单细胞测序 | NA | 临床样本数据，单细胞数据 | 基于TCGA和CPTAC数据库的多组肝细胞癌样本，具体样本量未提供 |
| 243 | 2024-08-07 |
Hapln1 promotes dedifferentiation and proliferation of iPSC-derived cardiomyocytes by promoting versican-based GDF11 trapping
2024-Mar, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.09.013
PMID:38618242
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研究论文 | 本研究探讨了Hapln1在诱导多能干细胞（iPSC）衍生的心肌细胞去分化和增殖中的潜在调控作用及其在心肌梗死治疗中的价值 | 首次揭示了Hapln1通过促进基于versican的GDF11捕获，进而激活TGF-β/SMAD2/3信号通路，刺激iPSC衍生心肌细胞的去分化和增殖 | 研究主要基于体外细胞实验和成年小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探索Hapln1在心肌细胞去分化和增殖中的调控作用及其在心肌梗死治疗中的潜在价值 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞（hiPSC-CMs）和成年小鼠心肌梗死模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了hiPSC-CMs和成年小鼠心肌梗死模型 |
| 244 | 2024-08-07 |
Identification of SARS-CoV-2-specific T cell and its receptor
2024-03-27, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01537-6
PMID:38539271
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研究论文 | 本研究开发了一种机器学习模型，能够基于TCR序列特征区分COVID-19患者和健康个体，并识别了与SARS-CoV-2特异性T细胞及其受体相关的TCR库 | 首次精确识别了疫苗诱导的SARS-CoV-2特异性TCR和T细胞免疫机制，并展示了这些T细胞的高细胞毒性和延长生存期 | NA | 识别SARS-CoV-2特异性T细胞及其受体，为开发有效的免疫策略提供理论基础 | SARS-CoV-2特异性T细胞和TCR，以及疫苗诱导的细胞免疫 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫库测序（IR-seq），流式细胞术 | 机器学习模型 | TCR序列 | HLA-A*02疫苗接种个体 |
| 245 | 2024-08-04 |
Identification of TMZ resistance-associated histone post-translational modifications in glioblastoma using multi-omics data
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14649
PMID:38448295
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研究论文 | 本文探讨了在多组学数据中识别与 TMZ 耐药性相关的组蛋白翻译后修饰。 | 研究发现 H3K9ac 可能通过促进 SP1 转录因子的招募来增强 MGMT 转录，从而驱动 GBM 耐药性。 | 本研究主要分析了 TMZ 处理的少量 GBM 细胞系，可能缺乏临床样本的充分代表性。 | 探讨 GBM 耐药性机制，特别是与组蛋白翻译后修饰相关的机制。 | 建立了两个 TMZ 耐药的 GBM 细胞系，并分析了其转录组序列。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序 | NA | 多组学数据 | 建立了两个 TMZ 耐药的 GBM 细胞系 |
| 246 | 2024-08-04 |
Exosome-transmitted podoplanin promotes tumor-associated macrophage-mediated immune tolerance in glioblastoma
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14643
PMID:38470096
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研究论文 | 本研究探讨了外泌体转运的podoplanin如何促进胶质母细胞瘤相关巨噬细胞介导的免疫耐受。 | 该研究首次揭示了胶质母细胞瘤细胞来源的外泌体中podoplanin与巨噬细胞功能之间的具体关系，从而为免疫逃逸机制提供了新的理解。 | 研究依赖于公共数据库中的样本，可能存在样本异质性和数据完整性的问题。 | 研究胶质母细胞瘤中巨噬细胞浸润模式及podoplanin的作用，探讨其对免疫抑制的影响。 | 灵长类动物和小鼠的巨噬细胞和T细胞。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 免疫组化 | NA | 转录组数据, 组织切片 | 公共数据库中的胶质瘤患者样本以及BALB/c和OT-II小鼠的巨噬细胞和T细胞 |
| 247 | 2024-08-07 |
CD8+ T cell infiltration and proliferation in the brainstem during experimental cerebral malaria
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14431
PMID:37697956
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光技术，探讨了实验性脑型疟疾（ECM）中脑干内CD8+ T细胞的浸润和增殖情况，并分析了脑内浸润CD8+ T细胞与脑实质细胞的相互作用。 | 首次在单细胞分辨率下系统研究了ECM期间脑实质区域的细胞变化，发现脑内浸润的CD8+ T细胞高度激活并表达PD-1，脑实质细胞上调PD-L1表达，揭示了PD-1/PD-L1信号通路在ECM治疗中的潜在价值。 | NA | 探讨实验性脑型疟疾中脑干内CD8+ T细胞的浸润和增殖情况，以及脑内浸润CD8+ T细胞与脑实质细胞的相互作用。 | 实验性脑型疟疾小鼠的脑干组织 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫荧光 | NA | RNA | 健康和实验性脑型疟疾小鼠的脑干组织 |
| 248 | 2024-08-07 |
Unraveling the complex pathophysiology of white matter hemorrhage in intracerebral stroke: A single-cell RNA sequencing approach
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14652
PMID:38433011
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研究论文 | 本研究旨在阐明白质出血（WMH）在脑内出血（ICH）中的细胞动态和病理生理机制 | 采用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，深入分析了WMH后的细胞变化和基因表达 | NA | 阐明白质出血在脑内出血中的细胞动态和病理生理机制 | 脑内出血中的白质出血 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从脑内出血后第三天的同侧纹状体出血区域提取的单细胞悬液 |
| 249 | 2024-08-04 |
Intermittent fasting promotes type 3 innate lymphoid cells secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-03-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91060
PMID:38536726
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研究论文 | 这篇文章研究了间歇性禁食如何促进3型固有淋巴细胞分泌IL-22，进而有助于白色脂肪组织的变白。 | 文章首次揭示了肠道ILC3s在白色脂肪组织变白中的作用，以及ILC3/IL-22/IL-22R轴对间歇性禁食代谢益处的贡献 | 文章未提及临床试验或人类数据的支持 | 探讨间歇性禁食对代谢的益处及其机制 | 研究对象为小鼠，特别是饮食诱导肥胖的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 饮食诱导肥胖的小鼠 |
| 250 | 2024-08-04 |
Distinct fibroblast subpopulations associated with bone, brain or intrapulmonary metastasis in advanced non-small-cell lung cancer
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1605
PMID:38445456
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研究论文 | 本研究探讨了与骨、脑或肺内转移相关的非小细胞肺癌中的成纤维细胞亚群。 | 本研究首次在单细胞水平上区分和分析了与骨转移、大脑转移和肺内转移相关的成纤维细胞亚群。 | 本研究的样本量较小，仅分析了14个组织活检样本，限制了结果的广泛适用性。 | 研究非小细胞肺癌中成纤维细胞与转移之间的关系。 | 重点分析了14例具有骨转移、脑转移或肺内转移的晚期非小细胞肺癌患者的组织样本。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 14个组织活检样本 |
| 251 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals prognosis-associated cellular heterogeneity in the papillary thyroid carcinoma microenvironment
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1594
PMID:38426403
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术揭示了乳头状甲状腺癌微环境中的预后相关细胞异质性 | 本文通过开发空间RNA临床分析方法，首次揭示了乳头状甲状腺癌微环境中的细胞异质性与预后之间的相关性 | 研究仅分析了五个乳头状甲状腺癌组织切片，样本量相对较小，可能影响结论的普适性 | 探讨乳头状甲状腺癌微环境中的细胞异质性及其对预后的影响 | 乳头状甲状腺癌患者的肿瘤组织切片 | 数字病理 | 甲状腺癌 | 空间转录组技术 | NA | RNA表达数据 | 5个乳头状甲状腺癌组织切片 |
| 252 | 2024-08-07 |
Unlocking the potential of T-cell metabolism reprogramming: Advancing single-cell approaches for precision immunotherapy in tumour immunity
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1620
PMID:38468489
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在解析T细胞亚群及其代谢状态中的应用，以及这些代谢途径如何影响肿瘤微环境中的T细胞功能 | 本文揭示了T细胞代谢重编程与免疫功能之间的相互作用，为精准免疫治疗提供了新的视角 | NA | 探索T细胞代谢与免疫功能之间的相互作用机制，以推动精准免疫治疗的发展 | T细胞的代谢途径及其在肿瘤微环境中的功能 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 253 | 2024-08-07 |
Mechanism and endoscopic-treatment-induced evolution of biliary non-anastomotic stricture after liver transplantation revealed by single-cell RNA sequencing
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1622
PMID:38481381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝移植后胆道非吻合口狭窄的机制及内镜治疗引起的演变 | 首次对胆道并发症患者的胆管进行单细胞转录组测序，分析了非吻合口狭窄及内镜治疗期间多种细胞类型的比例和表型变化 | 样本采集不足且缺乏公认的动物模型 | 揭示肝移植后胆道非吻合口狭窄的病理生理和遗传机制及内镜治疗引起的演变 | 肝移植后胆道非吻合口狭窄患者 | 数字病理学 | 肝移植并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自接受连续胆道支架植入的非吻合口狭窄患者的胆管样本 |
| 254 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomes reveals COL4A1/2 facilitates the spatial organisation of stromal cells differentiation in breast phyllodes tumours
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1611
PMID:38481388
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据，揭示了COL4A1/2在乳腺叶状肿瘤中促进间质细胞空间组织分化的作用 | 首次揭示了COL4A1/2在乳腺叶状肿瘤中间质细胞空间组织分化的作用，并发现了新的诊断标志物 | NA | 阐明乳腺叶状肿瘤中的细胞亚群组成和空间结构，并探索其发病机制中的诊断标志物 | 乳腺叶状肿瘤及其周围正常组织 | 数字病理学 | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光实验、激光捕获显微切割、数据非依赖性采集质谱 | NA | 转录组数据 | 30个样本来自11个乳腺叶状肿瘤 |
| 255 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the peripheral blood mononuclear cell landscape and monocyte status during colorectal adenocarcinoma formation
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1609
PMID:38488463
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing unveils an Odc1-marked endothelial subpopulation critical for pathological angiogenesis
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1640
PMID:38533645
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-08-04 |
Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids
2024-Mar-29, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66225
PMID:38619271
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研究论文 | 本研究提供了一种单细胞和单核转录组分析的新方法，适用于脑类器官的研究 | 通过使用单核而非完整细胞进行测序，克服了难以分离细胞类型的限制，使转录组分析具有更广泛的适用性 | 未提及具体的局限性 | 本研究旨在推动脑类器官研究中的单细胞转录组学应用 | 关注于脑类器官中的神经元和非神经元细胞类型 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 258 | 2024-08-05 |
Machine Learning-Based Characterization and Identification of Tertiary Lymphoid Structures Using Spatial Transcriptomics Data
2024-Mar-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25073887
PMID:38612697
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研究论文 | 该研究利用空间转录组数据对三级淋巴结构进行表征和识别 | 首次应用机器学习技术识别三级淋巴结构的标记，并建立预测模型 | 目前对TLS标记的一致性仍有待进一步验证 | 旨在通过机器学习方法识别和预测三级淋巴结构 | 三级淋巴结构及其标记基因 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学 | 支持向量分类器 | 基因表达数据 | NA |
| 259 | 2024-08-07 |
Comparative Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Methods with and without Sample Multiplexing
2024-Mar-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25073828
PMID:38612639
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研究论文 | 本研究对比分析了有无样本多重化的单细胞RNA测序方法 | 首次对比了使用样本多重化的Parse Biosciences平台和未使用样本多重化的10x Genomics平台的单细胞RNA测序方法 | 研究仅使用了来自两名健康个体的PBMCs样本，可能限制了结果的普遍性 | 评估不同单细胞RNA测序方法在样本多重化与非多重化条件下的性能 | 来自两名健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 两名健康个体的PBMCs样本 |
| 260 | 2024-08-04 |
A comprehensive multi-omics analysis identifies a robust scoring system for cancer-associated fibroblasts and intervention targets in colorectal cancer
2024-Mar-13, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05548-7
PMID:38478111
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研究论文 | 本研究建立了一个癌症相关成纤维细胞的评分系统，并识别了结直肠癌的干预靶点 | 创新性地开发了一个基于CAF基因评分的系统，用于评估结直肠癌患者的免疫微环境和预后 | 研究的局限性在于样本量和真实性的验证需要进一步的临床试验支持 | 研究癌症相关成纤维细胞在结直肠癌中的临床应用和生物学机制 | 癌症相关成纤维细胞及其在结直肠癌中的不同亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 机器学习分析 | NA | 基因组数据 | 多个结直肠癌队列的样本 |