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当前共找到 535 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-10 |
Intermittent fasting promotes type 3 innate lymphoid cells secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-03-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91060
PMID:38536726
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研究论文 | 间歇性禁食通过促进3型先天淋巴细胞分泌IL-22从而诱导白色脂肪组织褐变 | 首次揭示肠道3型先天淋巴细胞在间歇性禁食诱导白色脂肪组织褐变中的关键作用，阐明了ILC3/IL-22/IL-22R信号轴参与间歇性禁食代谢益处的机制 | 尚未明确间歇性禁食如何具体调节ILC3细胞的芳香烃受体信号通路，以及树突状细胞和巨噬细胞与ILC3相互作用的详细分子机制 | 探究间歇性禁食促进白色脂肪组织褐变的细胞和分子机制 | 饮食诱导肥胖小鼠模型及肠道免疫细胞 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 饮食诱导肥胖小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对分选的肠道免疫细胞进行单细胞测序 |
| 2 | 2026-07-07 |
scNovel: a scalable deep learning-based network for novel rare cell discovery in single-cell transcriptomics
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae112
PMID:38555470
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研究论文 | 提出了scNovel，一个基于深度学习的可扩展神经网络，用于单细胞转录组学中发现新型稀有细胞 | 首次专门针对单细胞转录组中的新型稀有细胞发现设计深度学习网络，在AUROC性能上显著优于现有最优模型（平均AUROC超过94%，比第二好方法高16.26%） | 未明确说明局限性 | 开发一种可自动发现单细胞转录组中新型稀有细胞类型的方法 | 不同规模、协议和不平衡程度的单细胞转录组数据集，以及临床COVID-19数据集 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 深度学习神经网络 | 单细胞转录组数据 | 多种数据集，包括百万级规模的数据集及临床COVID-19数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-07 |
PANoptosis, an indicator of COVID-19 severity and outcomes
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae124
PMID:38555477
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研究论文 | 通过生物信息学分析探索PANoptosis作为COVID-19严重程度和预后指标的潜力 | 首次将PANoptosis作为COVID-19严重程度和预后的生物标志物，并揭示其与炎症性单核细胞的关系及地塞米松的缓解机制 | 需要进一步研究阐明PANoptosis调控COVID-19免疫反应和预后的确切过程 | 探索PANoptosis作为COVID-19严重程度指标的可能性 | COVID-19患者支气管肺泡灌洗液和外周血单核细胞中的PANoptosis程度 | 机器学习 | 新冠病毒病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 在线单细胞RNA测序和批量RNA测序公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-07 |
SpatialcoGCN: deconvolution and spatial information-aware simulation of spatial transcriptomics data via deep graph co-embedding
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae130
PMID:38557675
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研究论文 | 提出深度图共嵌入框架SpatialcoGCN，用于空间转录组数据的去卷积和空间信息模拟 | 首次将深度图共嵌入框架应用于空间转录组数据的细胞类型去卷积和缺失转录本空间分布恢复，并基于此开发了空间信息感知的模拟方法SpatialcoGCN-Sim | 未提及 | 提高空间转录组数据的空间分辨率和检测转录本数量，开发高效的数据去卷积和模拟工具 | 空间转录组数据和单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 导管原位癌（人类） | 空间转录组学 | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | 模拟数据集、人类导管原位癌、发育中人类心脏和小鼠大脑的真实空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-07-07 |
HyGAnno: hybrid graph neural network-based cell type annotation for single-cell ATAC sequencing data
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae152
PMID:38581422
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研究论文 | 提出了一种基于混合图神经网络的细胞类型注释方法HyGAnno，用于单细胞ATAC测序数据的细胞类型标注 | 利用全基因组可及性峰特征而非仅基因表达或基因活性特征，并通过并行图神经网络在半监督方式下实现scRNA-seq参考到scATAC-seq目标的细胞类型信息转移；重建参考-目标细胞图以检测低预测可靠性的细胞 | 未在文中明确说明局限性 | 解决单细胞ATAC-seq数据因极端稀疏性和染色质可及性不一致导致的细胞类型注释不准确问题 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC测序 | 图神经网络 | 单细胞ATAC-seq数据及scRNA-seq参考数据 | 多种数据集评估 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-06-30 |
scRNA-Seq: First Atlas and Cellular Landscape of Lacrimal Sac: Implications in Primary Acquired Nasolacrimal Duct Obstruction Pathogenesis
2024-03-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.3.38
PMID:38551583
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建泪囊首次细胞图谱，揭示原发性获得性鼻泪管阻塞发病机制中的细胞转录变化 | 首次构建泪囊细胞图谱，阐明PANDO不同炎症阶段T细胞、B细胞和上皮细胞的转录变化及细胞间信号网络 | 样本量较小（仅5例患者），可能未完全覆盖疾病异质性 | 阐明原发性获得性鼻泪管阻塞发病机制中的细胞转录变化和潜在驱动因素 | 泪囊组织中的上皮细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 原发性获得性鼻泪管阻塞 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5例患者的泪囊样本，共25,791个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 7 | 2026-06-30 |
Mutual Regulation of Transcriptomes between Murine Pneumocytes and Fibroblasts Mediates Alveolar Regeneration in Air-Liquid Interface Cultures
2024-03, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0078OC
PMID:38051640
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研究论文 | 通过气液界面共培养模型，研究鼠肺上皮细胞与成纤维细胞之间的转录组相互调控，揭示肺泡再生机制 | 利用单细胞转录组学首次揭示共培养中成纤维细胞促进肺泡2型细胞标志物表达、Etv5调控子激活及Club细胞向肺泡细胞转分化，并发现NF-κB通路和IL-6在成纤维细胞中上调 | 基于体外共培养模型，可能无法完全模拟体内复杂微环境；未涉及体内验证 | 理解成纤维细胞与肺上皮细胞在肺泡再生过程中的相互作用机制 | 小鼠肺上皮细胞（肺泡2型细胞和Club细胞）与成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 慢性肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量（小鼠气液界面培养模型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-06-30 |
Predicting Radiation-Induced Lung Injury in Patients With Lung Cancer: Challenges and Opportunities
2024-03-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2023.10.044
PMID:37924986
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综述 | 探讨预测肺癌患者放射性肺损伤的挑战与机遇 | 结合细胞因子评估、γH2AX检测、表观遗传标记以及CT密度测定、FDG-PET摄取等工具，提出通过组学技术、单细胞RNA测序等新技术加速生物标志物发现，实现个性化治疗决策 | 缺乏对放射性肺损伤的客观定义，且其发生机制尚不完全清楚 | 探讨肺癌放疗中放射性肺损伤的预测方法及其临床应用的挑战与前景 | 肺癌患者放射性肺损伤的预测 | 机器学习 | 肺癌 | NA | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序 |
| 9 | 2026-06-29 |
Decoding the Cell Atlas and Inflammatory Features of Human Intracranial Aneurysm Wall by Single-Cell RNA Sequencing
2024-03-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.032456
PMID:38390814
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解码人颅内动脉瘤壁的细胞图谱和炎症特征 | 首次在颅内动脉瘤穹顶中鉴定出由ABCC9和HIGD1B标记的周细胞，并利用机器学习算法发现巨噬细胞与动脉瘤破裂的稳健关联，且不依赖于其极化状态 | 未提及明确的局限性 | 阐明颅内动脉瘤穹顶的细胞结构和炎症特征 | 破裂和未破裂的人颅内动脉瘤穹顶样本 | 数字病理学, 自然语言处理 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 21332个合格细胞，来自破裂和未破裂颅内动脉瘤穹顶；另外收集了126名患者的血清学结果和两个外部批量mRNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-06-29 |
Can uric acid affect the immune microenvironment in bladder cancer? A single-center multi-omics study
2024-03, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23664
PMID:38018692
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研究论文 | 通过一项单中心多组学研究，探讨尿酸如何影响膀胱癌的免疫微环境 | 首次揭示尿酸作为独立预后生物标志物与膀胱癌免疫治疗反应不良相关，并通过单细胞测序等多组学分析阐明其机制 | 单中心回顾性研究，样本量有限（39例PD-1治疗患者、169例根治性膀胱切除术患者） | 研究尿酸对膀胱癌免疫微环境的影响及其作为预后生物标志物的潜力 | 膀胱癌患者及高尿酸血症小鼠模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据（包括单细胞测序数据） | 39例PD-1治疗患者和169例根治性膀胱切除术患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-06-26 |
Liver-restricted Type I IFN Signature Precedes Liver Damage in Chronic Hepatitis B Patients Stopping Antiviral Therapy
2024-03-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300569
PMID:38294274
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研究论文 | 本研究通过纵向采样慢性乙型肝炎患者停止抗病毒治疗后的肝脏样本，发现肝脏限制性I型干扰素信号在肝损伤之前出现，并揭示了先天免疫激活先于临床显著肝损伤的早期免疫触发机制 | 首次在停止抗病毒治疗的慢性乙肝患者中捕获肝损伤前的早期免疫事件，发现肝脏特异性I型干扰素信号和MIF因子是旁观者淋巴细胞活化的最早免疫触发因子 | 未明确说明 | 阐明慢性乙型肝炎患者停止抗病毒治疗后肝损伤发生前的早期免疫激活机制 | 慢性乙型肝炎患者停止抗病毒治疗后的肝脏和血液样本 | 数字病理学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 测序数据, 流式数据 | 纵向采样的慢性乙型肝炎患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 12 | 2026-06-26 |
Impaired innate and adaptive immune responses to BNT162b2 SARS-CoV-2 vaccination in systemic lupus erythematosus
2024-03-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176556
PMID:38456511
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研究论文 | 系统性红斑狼疮患者对BNT162b2 SARS-CoV-2疫苗的先天性和适应性免疫反应受损 | 首次全面比较系统性红斑狼疮患者与健康对照者对BNT162b2 mRNA疫苗的先天性和适应性免疫反应，发现免疫抑制治疗与未治疗患者均存在T细胞反应受损，并揭示疫苗诱导的单核细胞群体减少 | 样本量较小（19例SLE患者和56例健康对照），且未评估长期免疫持久性 | 评估系统性红斑狼疮患者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫反应，优化自身免疫疾病患者的疫苗接种策略 | 系统性红斑狼疮患者和健康志愿者 | 机器学习和生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，临床样本数据 | 19例系统性红斑狼疮患者和56例健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析外周血单个核细胞 |
| 13 | 2026-06-26 |
A mouse model of Zhu-Tokita-Takenouchi-Kim syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis
2024-03-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175053
PMID:38290089
|
研究论文 | 通过构建Son单倍剂量不足的小鼠模型，揭示SON基因在器官发育和造血过程中的重要作用 | 首次通过小鼠模型系统研究SON单倍剂量不足导致的ZTTK综合征的临床症状，并利用单细胞转录组分析揭示造血异常机制 | 未提及具体局限性，可能缺乏对人类患者与小鼠模型差异的全面比较 | 建立ZTTK综合征的小鼠模型并探索SON基因在器官发育和造血中的功能 | Son单倍剂量不足小鼠（Son+/-）及其造血干细胞和祖细胞 | 机器学习和转录组分析 | ZTTK综合征（罕见遗传病） | RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | Son+/-小鼠及对照组，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-06-17 |
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2024-Mar-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3997426/v1
PMID:38496447
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、免疫组化、空间转录组和功能实验，研究APOBEC3A和APOBEC3B在健康与恶性黏膜上皮中的表达，揭示分化信号通过GRHL3诱导APOBEC3A表达及其在鳞状细胞癌中的突变机制 | 首次发现APOBEC3A主要在终末分化细胞中表达，需GRHL3调控；在鳞状细胞癌中，APOBEC3A表达扩展到DNA复制的细胞亚群，与APOBEC3B在增殖细胞中的表达共同驱动突变 | 未提供具体局限性信息 | 阐明APOBEC3A和APOBEC3B在正常组织和鳞状细胞癌中的表达模式及调控机制 | 健康与恶性黏膜上皮组织中的角质形成细胞及鳞状细胞癌细胞 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-17 |
Empagliflozin attenuates inflammation levels in autoimmune myocarditis through the STAT3 pathway and macrophage phenotype transformation
2024-03, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.02.006
PMID:38354482
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研究论文 | 探究恩格列净通过STAT3通路和巨噬细胞表型转化减轻自身免疫性心肌炎炎症水平的作用及机制 | 首次揭示SGLT-2抑制剂恩格列净通过STAT3通路调节巨噬细胞M2表型转化从而减轻自身免疫性心肌炎炎症 | NA | 研究SGLT-2抑制剂恩格列净对自身免疫性心肌炎的抗炎作用及其分子机制 | 实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型及巨噬细胞 | 机器学习和数字病理学 | 自身免疫性心肌炎 | 单细胞测序、Western blot、ELISA、免疫荧光染色、逆转录聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据、图像数据 | EAM小鼠模型（具体数量未提及）及单细胞测序数据（第0天和第21天） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | Genomic Spatial Event 142564数据集 |
| 16 | 2026-06-15 |
A distinct tumor microenvironment makes anaplastic thyroid cancer more lethal but immunotherapy sensitive than papillary thyroid cancer
2024-03-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173712
PMID:38478516
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序绘制甲状腺癌单细胞图谱，揭示间变性甲状腺癌（ATC）与乳头状甲状腺癌（PTC）肿瘤微环境差异，解释ATC预后更差但免疫治疗更敏感的原因 | 首次通过单细胞测序全面比较ATC和PTC的肿瘤微环境差异，发现CXCL13+ T淋巴细胞富集于ATC且可能促进早期三级淋巴结构（TLS）形成，为ATC免疫治疗敏感性提供新机制解释 | 研究主要基于有限样本和动物模型，需要更大规模队列验证；TLS形成与免疫治疗响应的因果关系尚需进一步实验证实 | 探索间变性甲状腺癌和乳头状甲状腺癌肿瘤微环境差异，解释两者预后和免疫治疗响应性不同的机制 | 间变性甲状腺癌和乳头状甲状腺癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 序列数据 | 甲状腺癌患者肿瘤样本及治疗患者肿瘤样本各一个（未明确具体数量） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 17 | 2026-05-31 |
FOXO1 reshapes neutrophils to aggravate acute brain damage and promote late depression after traumatic brain injury
2024-03-31, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00523-w
PMID:38556884
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研究论文 | 通过单细胞转录组学、代谢组学和蛋白质组学分析，发现FOXO1高表达的中性粒细胞在创伤性脑损伤急性和慢性阶段的作用 | 首次揭示了FOXO1高表达中性粒细胞作为一种新型中性粒细胞表型，在创伤性脑损伤急性和慢性阶段通过不同机制促进脑损伤和晚期抑郁 | 未提及明显局限性，但可能需进一步验证机制在人体的普适性 | 探究中性粒细胞在创伤性脑损伤后的异质性、多功能性和时间依赖性调控，以及FOXO1在其中介导的脑损伤和行为结局 | 创伤性脑损伤患者和小鼠模型的中性粒细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、代谢组学、蛋白质组学、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 | 创伤性脑损伤患者和FOXO1条件性基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-05-30 |
Shotgun lipidomics of human subretinal fluids under rod-dominant retina reveals cone-dominated lipids
2024-03, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109807
PMID:38278468
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研究论文 | 使用鸟枪法脂质组学鉴定孔源性视网膜脱离患者视网膜下液中的脂质分子，发现其与视锥细胞外节脂质谱相似 | 首次对孔源性视网膜脱离患者视网膜下液进行全面的脂质分子鉴定，并通过与公开单细胞测序数据对比，提出视锥细胞外节降解产物持续释放到光感受器间基质的假设 | 样本量只有两例患者，脂质来源的验证主要依赖公开数据库的基因表达数据，缺乏直接证据 | 阐明孔源性视网膜脱离患者视网膜下液中的脂质成分及其来源，为外视网膜相关疾病发病机制提供线索 | 孔源性视网膜脱离患者视网膜下液样本中的脂质分子 | 数字病理学 | 视网膜疾病（孔源性视网膜脱离） | 鸟枪法脂质组学、质谱、串联质谱、电喷雾电离四极杆飞行时间质谱 | NA | 质谱数据、单细胞测序数据 | 2例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals that PTPRG activates the m6A methyltransferase VIRMA to block mitophagy-mediated neuronal death in Alzheimer's disease
2024-03, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107098
PMID:38325728
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示PTPRG通过激活m6A甲基转移酶VIRMA阻断线粒体自噬介导的阿尔茨海默病神经元死亡 | 首次发现PTPRG通过结合并上调m6A甲基转移酶VIRMA抑制PRKN mRNA翻译，从而阻断线粒体自噬导致神经元死亡的信号通路，并阐明小胶质细胞亚群Mic_PTPRG与特定神经元亚群的通讯机制 | 未提及但可能包括：动物模型与人类AD的差异、实验验证范围有限、样本来源的地理和人口多样性不足 | 阐明阿尔茨海默病中神经元死亡的起始机制，探索潜在治疗靶点 | 阿尔茨海默病相关脑区和外周血 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 85个AD样本和83个对照样本，6只App AD小鼠和6只对照C57Bl/6J小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-29 |
Allosteric inhibitor of SHP2 enhances macrophage endocytosis and bacteria elimination by increasing caveolae activation and protects against bacterial sepsis
2024-03, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107096
PMID:38320736
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研究论文 | SHP2变构抑制剂通过增强小窝蛋白活化促进巨噬细胞胞吞和细菌清除，保护小鼠免受细菌性脓毒症侵害 | 首次揭示SHP2变构抑制剂通过维持Cav-1磷酸化增强巨噬细胞胞吞功能以清除细菌，并提出其与抗生素联用可完全保护小鼠免于死亡 | 未明确说明本研究的局限性 | 研究巨噬细胞在脓毒症中胞吞功能受损的分子机制，并评估SHP2变构抑制剂作为治疗脓毒症的潜力 | 脓毒症小鼠和巨噬细胞 | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（大肠杆菌感染或盲肠结扎穿刺诱导脓毒症） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于单细胞RNA测序；Illumina NovaSeq用于批量RNA测序 |