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当前共找到 534 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-20 |
Spatial, transcriptomic and epigenomic analyses link dorsal horn neurons to chronic pain genetic predisposition
2024-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.04.01.486135
PMID:41427296
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研究论文 | 该文章通过多物种单细胞转录组、空间转录组和表观基因组分析，将背角神经元与慢性疼痛遗传易感性联系起来 | 整合恒河猴、人类和小鼠的单细胞图谱，利用空间转录组学绘制保守神经元亚型的层状分布，并生成小鼠单核开放染色质图谱以划分慢性疼痛遗传力 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 确定慢性疼痛遗传变异是否影响背角神经元的调控元件 | 背角神经元、慢性疼痛遗传变异、恒河猴、人类和小鼠 | 数字病理学、机器学习 | 慢性疼痛 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、单核ATAC测序 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学、单核ATAC测序 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 2 | 2026-09-18 |
CD38-RyR2 axis-mediated signaling impedes CD8+ T cell response to anti-PD1 therapy in cancer
2024-03-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315989121
PMID:38451948
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研究论文 | 该研究揭示了CD38通过RyR2钙通道介导的信号通路促进CD8+ T细胞终末耗竭，从而削弱抗PD1治疗效果的机制 | 首次发现CD38-RyR2轴通过升高细胞内钙离子水平、激活AKT、抑制TCF1表达来驱动CD8+ T细胞终末耗竭，并证明靶向CD38或RyR2可恢复抗PD1治疗响应 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类临床试验中验证靶向CD38策略的安全性和有效性 | 探究CD38在CD8+ T细胞对抗PD1治疗抵抗中的作用及其分子机制 | 肿瘤浸润CD8+ T细胞和体外慢性刺激的CD8+ T细胞 | 免疫学、肿瘤学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-13 |
scATAnno: Automated Cell Type Annotation for single-cell ATAC Sequencing Data
2024-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543296
PMID:37333088
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研究论文 | 该论文介绍了一个名为scATAnno的Python软件包，用于利用大规模scATAC-seq参考图谱自动注释单细胞ATAC测序数据的细胞类型 | scATAnno不依赖scRNA-seq数据，通过整合查询数据与参考图谱实现准确注释，并引入了基于KNN和加权距离的不确定性分数以有效检测查询数据中与参考数据中所有细胞类型均不同的细胞群 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一个自动化工具，用于单细胞ATAC测序数据的参考图谱构建和细胞类型注释，以辅助复杂生物系统中新scATAC-seq数据集的解读 | 外周血单核细胞（PBMC）、三阴性乳腺癌（TNBC）和基底细胞癌（BCC）的单细胞ATAC-seq数据 | 单细胞表观基因组学 | 三阴性乳腺癌, 基底细胞癌 | scATAC-seq | KNN | 单细胞ATAC-seq数据 | 多个数据集（包括PBMC、TNBC、BCC），具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-09-13 |
Interrogations of single-cell RNA splicing landscapes with SCASL define new cell identities with physiological relevance
2024-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46480-9
PMID:38461306
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研究论文 | 该文章提出了SCASL方法，利用单细胞RNA测序数据基于可变剪接景观进行单细胞聚类，以揭示细胞身份和生理相关性 | SCASL方法解决了单细胞RNA剪接数据覆盖偏差和稀疏的问题，并提供了基于剪接景观的细胞身份分类新方案，能够识别传统基因表达聚类无法发现的细胞亚群 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 研究RNA剪接异质性，并开发基于单细胞RNA剪接景观的聚类方法以定义具有生理相关性的新细胞身份 | 三阴性乳腺癌、胚胎肝发育、肿瘤相关CD4和CD8 T细胞 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-09-13 |
Single-cell profiling identifies IL1Bhi macrophages associated with inflammation in PD-1 inhibitor-induced inflammatory arthritis
2024-03-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46195-x
PMID:38453911
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎（PD-1-IA）与类风湿关节炎（RA）患者外周血和滑液中的CD45细胞，揭示了PD-1-IA中IL1Bhi巨噬细胞的扩增及其与炎症的关联 | 首次在单细胞水平上比较PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎与类风湿关节炎的免疫细胞图谱，发现IL1B髓系细胞在PD-1-IA中特异性扩增且NLRP3炎症小体活性增强，并揭示了IL1B巨噬细胞与耗竭CD8 T细胞之间的潜在通讯轴 | 摘要中未明确提及样本量及具体实验验证的局限性，可能受限于样本数量及缺乏功能验证实验 | 解析PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎与类风湿关节炎之间的细胞和分子差异，探寻PD-1-IA的潜在治疗靶点 | PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎患者和类风湿关节炎患者的外周血及滑液中的CD45+细胞 | 单细胞组学 | 炎症性关节炎、类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-09-10 |
Pharmacological suppression of the OTUD4/CD73 proteolytic axis revives antitumor immunity against immune-suppressive breast cancers
2024-03-26, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176390
PMID:38530357
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研究论文 | 该研究通过多组学分析和实验验证，确定了OTUD4/CD73蛋白水解轴作为治疗免疫抑制性三阴性乳腺癌的靶点，并开发了新型抑制剂ST80以恢复抗肿瘤免疫。 | 首次揭示OTUD4通过去泛素化稳定CD73，对抗TRIM21介导的泛素化，从而抑制肿瘤免疫反应；开发了特异性抑制剂ST80，能破坏CD73与OTUD4的蛋白水解相互作用，增敏抗PD-L1治疗。 | 未提及明显的局限性。 | 探究并靶向免疫抑制性乳腺癌中的OTUD4/CD73蛋白水解轴，以改善免疫治疗的效果。 | 三阴性乳腺癌细胞及肿瘤微环境中的恶性细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 多组学分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未具体说明样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium 空间转录组学用于分析恶性细胞和免疫细胞的相互作用 |
| 7 | 2026-09-04 |
BAP1 is required prenatally for differentiation and maintenance of postnatal murine enteric nervous system
2024-03-12, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI177771
PMID:38690732
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调节因子Bap1在产前对于产后小鼠肠道神经系统分化和维持的关键作用。 | 首次发现Bap1在产前阶段对肠道神经元的产后分化和存活至关重要，且与人类BAP1相关神经发育障碍有关，填补了该基因在肠道神经系统发育中的功能空白。 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全反映人类ENS的复杂性。产后Bap1缺失模型未显著影响ENS，提示需要探索其与人类神经发育障碍的关联机制。 | 探究Bap1在肠道神经系统发育和维持中的表观遗传调控作用及其对肠道功能的影响。 | 小鼠肠道神经系统及其神经元亚型。 | 表观遗传学、发育生物学、神经科学 | BAP1相关神经发育障碍疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究涉及Tyrosinase-Cre Bap1fl/fl小鼠模型，具体数量未在摘要中说明。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 或等效平台用于P5阶段小鼠肠道单细胞测序。 |
| 8 | 2026-09-01 |
A single-cell atlas of Drosophila trachea reveals glycosylation-mediated Notch signaling in cell fate specification
2024-03-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46455-w
PMID:38448482
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术构建了果蝇气管的全面细胞图谱，揭示了糖基化介导的Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 首次提供了果蝇气管的单细胞转录组图谱，并发现糖基化反应性Notch信号在气管细胞命运决定中的新机制 | 未提及 | 研究果蝇气管发育和再生过程中的细胞类型及其调控机制，特别是Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 果蝇气管细胞，特别是气管成体干细胞（气管母细胞） | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量，但涵盖果蝇气管的9个主要细胞亚型 | 未提及 | 单细胞RNA-seq | 未提及 | 未提及 |
| 9 | 2026-08-23 |
The HIF-1α/PLOD2 axis integrates extracellular matrix organization and cell metabolism leading to aberrant musculoskeletal repair
2024-Mar-12, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00320-0
PMID:38472175
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了HIF-1α/PLOD2轴在整合细胞外基质组织和细胞代谢中的作用，从而驱动异常肌肉骨骼修复，并提出了治疗异位骨化的潜在策略 | 首次通过单细胞和空间转录组学结合小鼠模型，明确HIF-1α/PLOD2/LOX通路在间充质祖细胞中介导异位骨化的代谢和基质重塑机制，并鉴定出新的PLOD2抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型，需进一步验证在人类中的适用性；PLOD2抑制剂的具体临床转化效果和安全性尚未评估 | 阐明HIF-1α通路在间充质祖细胞中如何通过调控细胞外基质组织和代谢来促进异位骨化，并探索潜在治疗靶点 | 小鼠间充质祖细胞和损伤诱导的异位骨化模型 | 数字病理学 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠模型（具体样本数未在摘要中提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学（具体配置未详细说明） |
| 10 | 2026-08-21 |
ALKBH5-mediated m6A modification of IL-11 drives macrophage-to-myofibroblast transition and pathological cardiac fibrosis in mice
2024-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46357-x
PMID:38443404
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等揭示了ALKBH5介导的IL-11 mRNA m6A去甲基化促进巨噬细胞向肌成纤维细胞转变及高血压性心脏纤维化的机制 | 首次发现ALKBH5通过m6A去甲基化稳定IL-11 mRNA，驱动巨噬细胞向肌成纤维细胞转变，并验证靶向递送siRNA可缓解心脏纤维化 | 研究基于小鼠模型，结果需在人类中验证；未详细探讨其他RNA修饰或细胞类型的作用 | 阐明心脏巨噬细胞在纤维化中转变的调控机制，并探索治疗靶点 | 小鼠心脏巨噬细胞、循环单核细胞、Ang II诱导的高血压心脏纤维化模型 | 单细胞转录组学 | 心脏纤维化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、连体共生、RNA免疫沉淀测序 | NA | 单细胞转录组数据、RNA测序数据 | 小鼠模型，具体样本数未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-08-21 |
5 signature genes revealed by single-cell profiling identified unique immune subtypes affecting the prognosis of ovarian cancer
2024-03, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202403_35618
PMID:38497886
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别出5个预后相关基因，并据此将卵巢癌患者划分为不同免疫亚型，以评估其预后及对免疫治疗和化疗的反应 | 利用单细胞RNA测序数据识别出5个预后关键基因（IGFBP7、JCHAIN、CCDC80、VSIG4、MS4A1），并通过无监督共识聚类将患者分为不同预后亚型，为卵巢癌的免疫治疗和化疗反应预测提供了新的生物标志物和分型方法 | 研究主要基于公共数据库（TIGER、TCGA、TIMER等），缺乏外部独立验证；且为回顾性分析，需进一步前瞻性临床研究验证其应用价值 | 识别卵巢癌中预测预后的基因特征并建立预后亚型，以指导免疫治疗和化疗的临床决策 | 卵巢癌患者 | 基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督共识聚类 | 基因表达数据 | TCGA-OV患者样本（具体数量未在摘要中提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-08-20 |
Chemotherapy induces myeloid-driven spatial T-cell exhaustion in ovarian cancer
2024-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.19.585657
PMID:38562799
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研究论文 | 本研究通过整合空间和分子分析，揭示了化疗诱导的高级别浆液性卵巢癌微环境中T细胞耗竭的空间动态变化 | 首次发现化疗通过巨噬细胞在“髓系网络”中延长抗原呈递，驱动CD8+ T细胞的空间重分布和耗竭，并识别出TIGIT-NECTIN2配体-受体相互作用，为联合免疫治疗提供新策略 | 摘要中未提及明确局限性 | 探究化疗诱导的肿瘤微环境时空重塑，特别是T细胞耗竭机制，为改善免疫治疗疗效提供依据 | 97例化疗前后的高级别浆液性卵巢癌样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 97例高级别浆液性卵巢癌样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'、10x Visium空间转录组 |
| 13 | 2026-08-20 |
Domain generalization enables general cancer cell annotation in single-cell and spatial transcriptomics
2024-03-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46413-6
PMID:38431724
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研究论文 | 本文介绍了Cancer-Finder，一种基于域泛化的深度学习算法，用于在单细胞和空间转录组数据中快速准确地注释恶性细胞，平均准确率达95.16% | 提出了一种基于域泛化的深度学习算法Cancer-Finder，能够跨数据集泛化，在单细胞和空间转录组数据中准确识别恶性细胞，并在肾细胞癌样本中识别出与预后相关的基因签名 | 未明确提及局限性 | 解决当前算法在泛癌数据中恶性细胞注释的准确性和泛化性问题 | 单细胞和空间转录组数据中的恶性细胞，包括5个透明细胞肾细胞癌空间转录组样本 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | 深度学习 | 单细胞和空间转录组数据 | 5个透明细胞肾细胞癌空间转录组样本 | NA | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-08-20 |
TREX1 is required for microglial cholesterol homeostasis and oligodendrocyte terminal differentiation in human neural assembloids
2024-03, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02348-w
PMID:38129659
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研究论文 | 本研究利用人类胚胎干细胞衍生的微胶质细胞和含有少突胶质细胞的类组装体，探究TREX1在人类微胶质细胞胆固醇代谢和少突胶质细胞终末分化中的作用 | 首次揭示TREX1在人类微胶质细胞中的功能，表明其调节胆固醇代谢以维持微胶质细胞稳态，并影响少突胶质细胞谱系的分化，且提出他汀类药物作为潜在治疗策略 | 研究基于体外模型，可能无法完全反映体内复杂环境，且长期效应和临床相关性需进一步验证 | 阐明TREX1在人类微胶质细胞中的生物学功能及其在神经发育和疾病中的作用机制 | 人类胚胎干细胞衍生的微胶质样细胞、含有微胶质细胞和少突胶质细胞的类组装体 | 神经科学 | Aicardi-Goutières综合征 | 转录组学、单细胞转录组学、光学显微镜、透射电子显微镜 | 细胞模型、类组装体 | 转录组数据、图像数据 | 未明确说明样本数量，但涉及多个细胞系和类组装体 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-08-19 |
Spatial transcriptomics reveal neuron-astrocyte synergy in long-term memory
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07011-6
PMID:38326616
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研究论文 | 通过空间和单细胞转录组学揭示基底外侧杏仁核在长期记忆形成中神经元和星形胶质细胞的协同作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，绘制了长期记忆印迹的空间图谱，并发现特定神经元亚群与邻近星形胶质细胞的相互作用对长期记忆编码至关重要 | 未提供明确的局限性信息 | 阐明基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子机制 | 小鼠基底外侧杏仁核中的神经元和星形胶质细胞亚群 | 单细胞转录组学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提供具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学，10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 16 | 2026-08-17 |
JAK/STAT3 represents a therapeutic target for colorectal cancer patients with stromal-rich tumors
2024-Mar-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02958-4
PMID:38424636
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研究论文 | 本研究探讨了JAK/STAT3抑制在结直肠癌中的治疗效果，并发现高表达与富含基质肿瘤患者的不良预后相关。 | 通过空间转录组学揭示高pSTAT3病例中肿瘤与微环境差异基因表达，并识别非经典成纤维细胞信号。 | 未提及 | 评估JAK/STAT3抑制在结直肠癌中的抗癌活性，并确定高表达作为预后标志物的适用背景。 | 结直肠癌细胞系、小鼠类器官、患者来源类器官及临床患者队列。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化、突变谱分析、bulk RNA测序、空间转录组学 | 类器官模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、临床病理数据 | 3个结直肠癌患者队列，包括TransSCOT临床试验队列及两个独立回顾性队列 | NanoString | 空间转录组学 | NanoString GeoMx | NanoString GeoMx® 空间转录组学平台 |
| 17 | 2026-08-12 |
Sex disparities revealed by single-cell and bulk sequencing and their impacts on the efficacy of immunotherapy in esophageal cancer
2024-03-15, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-024-00598-z
PMID:38491510
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量测序揭示了食管癌中的性别差异，并评估了这些差异对免疫治疗疗效的影响 | 首次系统性地整合基因组、单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据，揭示食管癌中性别相关的免疫微环境差异，并构建了性别相关特征以预测免疫治疗结局 | 研究主要基于回顾性数据，可能受到选择偏倚的影响；样本量在某些分析中有限，且未进行前瞻性验证 | 探索食管癌中性别差异的分子基础及其对免疫治疗疗效的影响 | 食管癌患者，包括来自3期试验的2360名患者，以及1425个样本的基因组数据和来自60名患者的105,145个免疫细胞 | 基因组学、单细胞测序、免疫治疗 | 食管癌 | 批量测序、单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据、临床生存数据 | 2360名食管癌患者（用于生存分析），1425个样本（基因组数据），105,145个免疫细胞（来自60名患者） | NA | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-08-11 |
CHAI: Consensus Clustering Through Similarity Matrix Integration for Cell-Type Identification
2024-Mar-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.19.585758
PMID:38562750
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研究论文 | 提出CHAI方法，一种基于相似性矩阵整合的共识聚类方法，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型鉴定，并通过多个基准数据集展示其性能提升和实际应用。 | 创新性地引入两种聚合策略（CHAI-AvgSim和CHAI-SNF）整合七种先进聚类方法的结果，在多个基准数据集上优于现有共识聚类方法，并能整合空间转录组数据。 | 未明确提及局限性，但可能受限于基准数据集的多样性和对特定聚类方法的依赖。 | 解决单细胞RNA测序数据聚类中方法选择难题，提供统一且稳健的细胞类型鉴定框架。 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、多种细胞类型聚类方法。 | 生物信息学、单细胞分析。 | NA | scRNA-seq、空间转录组学。 | 共识聚类（基于图融合和相似性平均）。 | 基因表达矩阵、空间转录组数据。 | 多个基准数据集，具体样本数量未在标题和摘要中注明。 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学。 | NA | NA |
| 19 | 2026-08-06 |
Cellular heterogeneity and dynamics of the human uterus in healthy premenopausal women
2024-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.07.583985
PMID:38559249
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康绝经前女性子宫的细胞异质性和动态变化，构建了包含超过167K细胞的正常子宫细胞图谱，并提出了39种亚型的共识注释系统。 | 创新点在于提供了全面的正常子宫细胞图谱，解决了先前研究中的命名冲突，并识别出多种潜在祖细胞，包括跨谱系多能基质祖细胞。 | 研究样本量有限，且未包含多种病理状态，可能限制了对疾病相关变化的全面理解。 | 旨在描绘健康绝经前女性子宫的细胞组成和动态变化，为子宫功能及其疾病的基础研究提供参考。 | 健康绝经前女性的子宫内膜和肌层细胞，以及产后和绝经后子宫样本。 | 单细胞组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 5名健康绝经前个体（超过50,000个细胞）及先前发表的15名受试者数据，总计超过167K细胞，另包括1个产后和1个绝经后样本 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 20 | 2026-08-01 |
CPPLS-MLP: a method for constructing cell-cell communication networks and identifying related highly variable genes based on single-cell sequencing and spatial transcriptomics data
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae198
PMID:38678387
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研究论文 | 提出CPPLS-MLP方法，基于单细胞测序和空间转录组数据构建细胞通信网络并识别相关高变基因 | 首次将细胞间通信与高变基因关联起来，利用MLP分析多输入多输出通信对高变基因表达的影响 | 未在摘要中明确说明，但可能依赖数据质量或计算资源 | 构建细胞通信网络并识别与细胞间通信密切相关的高变基因，以提升网络构建准确性 | 单细胞测序和空间转录组数据中的细胞通信与高变基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序、空间转录组测序 | MLP | 单细胞测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |