单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 537 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-11 |
Single-cell sequencing reveals the immune landscape of breast cancer patients with brain metastasis
2024-03, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15243
PMID:38316626
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析乳腺癌脑转移患者的脑脊液免疫细胞，揭示其免疫微环境景观 | 首次使用scRNA-seq技术非侵入性地描述乳腺癌脑转移患者的肿瘤免疫微环境，并发现促进和抑制肿瘤免疫功能的基因 | 研究样本可能有限，且仅分析了脑脊液中的免疫细胞，未涵盖其他可能的免疫微环境组成部分 | 揭示乳腺癌脑转移患者的免疫微环境特征，以指导免疫治疗 | 乳腺癌脑转移患者的脑脊液免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 乳腺癌脑转移患者的脑脊液样本 |
| 2 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the links between the metabolic heterogeneity and cell identity in NBM and AML
2024-03, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19233
PMID:38009537
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2025-07-08 |
Improved therapeutic consistency and efficacy of CD317+ MSCs through stabilizing TSG6 by PTX3
2024-03-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03706-3
PMID:38539221
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了不同批次培养基对MSCs亚群组成和异质性的影响，并发现CD317+ MSCs具有增强的免疫抑制活性 | 发现CD317+ MSCs亚群通过PTX3稳定TSG6蛋白，从而提高治疗效果，并提出了减少MSCs异质性和提高治疗一致性的新策略 | 研究未涉及CD317+ MSCs在其他疾病模型中的应用效果 | 提高间充质干细胞（MSCs）的治疗一致性和效果 | 间充质干细胞（MSCs）及其CD317+亚群 | 细胞治疗 | NA | scRNA-seq分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4 | 2025-07-08 |
Short cell cycle duration is a phenotype of human epidermal stem cells
2024-03-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03670-y
PMID:38475896
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研究论文 | 本文研究了人类表皮干细胞（SCs）的细胞周期持续时间（CCD），发现与传统观点相反，SCs的细胞周期比更分化的祖细胞（CPs）更短 | 挑战了干细胞分裂缓慢的传统观点，揭示了人类表皮干细胞具有更短的细胞周期持续时间 | 研究仅限于体外培养的人类角质形成细胞，未涉及体内环境或其他类型的干细胞 | 探究人类表皮干细胞的细胞周期特性及其与分化祖细胞的差异 | 人类角质形成细胞（包括干细胞和分化祖细胞） | 细胞生物学 | NA | 活细胞成像、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、基因表达数据 | 初始传代的人类角质形成细胞 |
| 5 | 2025-07-05 |
Temporal Single-Cell Sequencing Analysis Reveals That GPNMB-Expressing Macrophages Potentiate Muscle Regeneration
2024-Mar-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4108866/v1
PMID:38585871
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示表达GPNMB的巨噬细胞在肌肉再生中的关键作用 | 发现了一个表达GPNMB的巨噬细胞亚群，该亚群在巨噬细胞介导的肌肉再生中发挥关键作用 | 研究未详细探讨GPNMB信号通路在肌肉再生中的具体分子机制 | 探究巨噬细胞在骨骼肌修复过程中的表型多样性和功能 | 骨骼肌损伤后的巨噬细胞 | 单细胞测序 | 肌肉损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 不同时间点的骨骼肌单细胞样本 |
| 6 | 2025-06-24 |
Toolkit for mapping the clonal landscape of tumor-infiltrating B cells
2024-03, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2024.101864
PMID:38301345
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review | 本文综述了现有技术，总结了它们在B细胞研究中的应用，并提出了推进B细胞探索的未来方向 | 提出了一个工具包，用于绘制肿瘤浸润B细胞的克隆景观，并概述了现有技术在B细胞研究中的应用 | 未提及具体的实验验证或样本量，可能缺乏实证支持 | 理解和区分B细胞在肿瘤微环境中的不同作用 | 肿瘤浸润B细胞 | digital pathology | NA | 单细胞和空间转录组学、基因组学、蛋白质组学、B细胞受体库深度无错误分析 | NA | 转录组、基因组、蛋白质组数据 | NA |
| 7 | 2025-06-18 |
Glutamine antagonist DRP-104 suppresses tumor growth and enhances response to checkpoint blockade in KEAP1 mutant lung cancer
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9859
PMID:38536921
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研究论文 | 研究谷氨酰胺拮抗剂DRP-104在KEAP1突变肺癌中抑制肿瘤生长并增强检查点阻断反应的效果 | 首次展示了DRP-104通过抑制谷氨酰胺依赖的核苷酸合成和促进抗肿瘤T细胞反应来抑制KEAP1突变肿瘤的生长，并增强抗PD1治疗的响应 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对KEAP1突变肺癌的靶向治疗方法 | KEAP1突变的肺癌肿瘤 | 肿瘤学 | 肺癌 | 多模态单细胞测序和体外功能实验 | NA | NA | 临床前患者来源的异种移植模型和抗原性原位肺癌模型 |
| 8 | 2025-06-18 |
Spatially resolved single-cell atlas of ascidian endostyle provides insight into the origin of vertebrate pharyngeal organs
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi9035
PMID:38552007
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research paper | 通过Stereo-seq和单细胞RNA测序技术，构建了海鞘内柱的空间分辨单细胞图谱，揭示了脊椎动物咽部器官的进化起源 | 发现了与脊椎动物听觉侧线系统毛细胞转录组相似的细胞群，重塑了对基础脊索动物咽部的理解 | NA | 探索脊椎动物咽部器官的进化起源 | 海鞘内柱 | 单细胞测序 | NA | Stereo-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 9 | 2025-06-18 |
Multiple parallel cell lineages in the developing mammalian cerebral cortex
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn9998
PMID:38536915
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和条形码谱系追踪技术，揭示了哺乳动物大脑皮层发育中多个平行细胞谱系的存在 | 发现了多个顶端放射状胶质细胞(RGC)类别启动平行谱系，最终汇聚到共同的新生神经元类别，这一现象在具有折叠皮层的物种(如雪貂和人类)中保守，但在小鼠中不保守 | 研究主要关注雪貂和人类，未全面涵盖其他哺乳动物物种 | 探究具有扩展生发区和折叠皮层物种(如人类)的大脑皮层神经发生机制 | 雪貂和人类大脑皮层生发区的祖细胞及其谱系 | 发育神经生物学 | 大脑皮层畸形 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 条形码谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多个雪貂和人类皮层生发区样本 |
| 10 | 2025-06-18 |
Gastrulation-stage gene expression in Nipbl+/- mouse embryos foreshadows the development of syndromic birth defects
2024-03-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4239
PMID:38507484
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research paper | 研究Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚阶段的基因表达变化，以预测综合征性出生缺陷的发生 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚和早期心脏新月阶段的基因表达异常及其与Cornelia de Lange综合征的关联 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探讨Nipbl基因缺陷如何通过基因表达失调和细胞谱系分配异常导致出生缺陷 | Nipbl+/-和野生型小鼠胚胎 | 发育生物学 | Cornelia de Lange综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和Nipbl+/-小鼠胚胎 |
| 11 | 2025-06-18 |
Kidins220 and Aiolos promote thymic iNKT cell development by reducing TCR signals
2024-03-15, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj2802
PMID:38489359
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研究论文 | 本文研究了Kidins220和Aiolos在胸腺iNKT细胞发育过程中通过减少TCR信号的作用 | 首次揭示了Kidins220通过调节TCR信号在iNKT细胞发育不同阶段的双重作用，并确定了Aiolos作为Kidins220下游效应分子的角色 | 研究主要基于小鼠模型，人类iNKT细胞中的类似机制尚未验证 | 阐明Kidins220在iNKT细胞发育过程中的调控机制 | 胸腺iNKT细胞 | 免疫学 | NA | scRNA-seq | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | T细胞特异性Kidins220敲除小鼠和Aiolos敲除小鼠 |
| 12 | 2025-06-18 |
Single-cell nanobiopsy enables multigenerational longitudinal transcriptomics of cancer cells
2024-03-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl0515
PMID:38446884
|
研究论文 | 介绍了一种能够从单个细胞及其后代中进行多代纵向细胞质采样的纳米活检平台 | 开发了一种基于扫描离子电导显微镜（SICM）的纳米活检平台，实现了对单个细胞及其后代的多代纵向转录组分析 | 目前仅在体外对胶质母细胞瘤细胞进行了72小时的实验，尚未在更广泛的细胞类型或更长时间内验证 | 研究细胞状态转换的动态轨迹，特别是癌症细胞在化疗和放疗后的转录组变化 | 胶质母细胞瘤（GBM）脑肿瘤细胞 | 单细胞测序技术 | 胶质母细胞瘤 | 扫描离子电导显微镜（SICM），单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 体外培养的胶质母细胞瘤细胞，实验持续72小时 |
| 13 | 2025-06-17 |
Human surface ectoderm and amniotic ectoderm are sequentially specified according to cellular density
2024-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh7748
PMID:38427729
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research paper | 该研究开发了一种人类多能干细胞模型，用于研究羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制 | 提出了基于细胞密度的人类羊膜外胚层和表面外胚层分化机制的新模型 | 研究结果基于体外培养系统，可能无法完全反映体内发育情况 | 探究人类非神经外胚层发育机制 | 人类多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 干细胞分化模型 | 基因表达数据 | NA |
| 14 | 2025-06-07 |
Protocol to dissect and dissociate the mouse brainstem for single-cell RNA-seq applications
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102908
PMID:38461411
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研究论文 | 本文提出了一种用于小鼠脑干单细胞RNA测序的解剖、解离和冷冻保存方案 | 该方案允许异步样本收集和下游处理，适用于脑干组织中的细胞，特别是新生儿小鼠 | 虽然该方案以孤立的preBötzinger复合体和SmartSeq3 cDNA文库制备为例，但可能不适用于所有脑干区域和文库制备方法 | 开发一种适用于小鼠脑干单细胞RNA测序的样本处理方案 | 小鼠脑干组织，特别是新生儿小鼠的脑干细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），SmartSeq3 cDNA文库制备 | NA | RNA测序数据 | 新生儿小鼠的脑干组织 |
| 15 | 2025-06-07 |
Protocol for acquiring high-quality fresh mouse lung spatial transcriptomics data
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102825
PMID:38280199
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研究论文 | 本文提出了一种获取高质量新鲜小鼠肺空间转录组数据的实验方案 | 针对肺肺泡中存在空腔导致切片困难的问题，提出了一种新的实验方案，包括肺灌注、获取冷冻切片、收集肺切片cDNA及数据分析等步骤 | NA | 解决肺组织空间转录组实验中切片困难的问题，获取高质量的空间转录组数据 | 小鼠肺组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 16 | 2025-06-07 |
An optimized protocol for isolation of murine pancreatic single cells with high yield and purity
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102836
PMID:38219150
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研究论文 | 本文提出了一种从小鼠胰腺中快速分离单细胞的优化方案，旨在减少消化酶对胰腺外分泌细胞的损伤 | 优化了解剖顺序、酶组成和操作步骤，从而获得高产量且高纯度的胰腺单细胞 | NA | 开发一种高效的小鼠胰腺单细胞分离方案 | 小鼠胰腺单细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞分离技术 | NA | NA | NA |
| 17 | 2025-06-07 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
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研究论文 | 开发了一种用于人类和小鼠脂肪组织的流式细胞术辅助单核RNA测序工作流程，整合了样本多重标记 | 整合流式细胞术进行质量控制、计数和精确核池化，显著减少低质量核、环境RNA污染及试剂浪费 | 未提及具体样本量或实验验证的广泛性 | 优化脂肪组织的单核RNA测序流程，提高信息内容和成本效率 | 人类和小鼠脂肪组织 | 单细胞测序 | NA | 流式细胞术, 单核RNA测序, 10× Chromium控制器 | NA | RNA测序数据 | 未提及具体样本数量 |
| 18 | 2025-06-07 |
Protocol for inferring epithelial-to-mesenchymal transition trajectories from single-cell RNA sequencing data using R
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102819
PMID:38183653
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研究论文 | 介绍了一个名为COMET的R包，用于从单细胞RNA测序数据推断上皮-间质转化(EMT)轨迹和状态间转换速率 | 开发了COMET这一新工具，能够优化EMT基因数量并拟合连续时间马尔可夫链来估计状态转换速率 | 未提及具体验证数据集或应用范围的限制 | 开发从单细胞RNA测序数据推断EMT轨迹的分析方法 | 上皮-间质转化过程 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 连续时间马尔可夫链 | 基因表达数据 | NA |
| 19 | 2025-06-07 |
Establishing a 3D culture system for early organogenesis of monkey embryos ex vivo and single-cell transcriptome analysis of cultured embryos
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102835
PMID:38224493
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研究论文 | 建立了一个用于猴子胚胎早期器官发生的3D体外培养系统，并对培养的胚胎进行了单细胞转录组分析 | 开发了一种能够在体外培养食蟹猴胚胎长达25天的3D培养系统，并利用单细胞RNA测序技术解析了原肠胚形成和早期器官发生的关键发育事件 | NA | 理解灵长类动物胚胎发生最初4周的发育过程 | 食蟹猴胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、生物信息学分析 | 3D培养系统 | 转录组数据 | NA |
| 20 | 2025-06-07 |
Protocol for optimized dissociation of human scalp tissue for hair follicle transcriptomics by scRNA-seq
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102848
PMID:38319786
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research paper | 本文提出了一种优化的人体头皮组织解离方案，用于通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究毛囊转录组学 | 优化了人体头皮组织的解离步骤，以获得高质量的单细胞悬液用于scRNA-seq | NA | 研究人体毛囊的转录组学 | 人体头皮组织 | 转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA |