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当前共找到 535 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-29 |
Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids
2024-03-29, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66225
PMID:38619271
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研究论文 | 本文提供了一个关于在脑类器官中生成和分析单细胞及单核转录组的逐步实验指南 | 通过结合单细胞和单核转录组学方法，克服了难以分离细胞类型的限制，使单个细胞的转录组分析在脑类器官研究中普遍适用 | NA | 为脑类器官研究提供单细胞和单核转录组学的实验流程，以促进对大脑发育的细胞过程和分子机制的全面研究 | 脑类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，单核转录组学，RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-29 |
Spatial High-resolution Analysis of Gene Expression Levels in Tendons
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65852
PMID:38526117
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方法论文 | 本文综述了肌腱组织中空间高分辨率基因表达水平的分析方法，重点关注新型原位杂交技术 | 针对富含基质的肌腱组织，提出了单细胞水平的空间转录组学分析方法，解决了低细胞数、低RNA含量和高基质背景的挑战 | NA | 开发并优化肌腱组织中空间基因表达水平的分析方法 | 肌腱组织，特别是年轻和老年动物模型及人类肌腱样本 | 数字病理学 | NA | 原位杂交，空间转录组学 | NA | 图像，RNA空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-03-21 |
Exploration of the prognostic prediction value of the PANoptosis-based risk score and its correlation with tumor immunity in lung adenocarcinoma
2024-03, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3682
PMID:38508210
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据和RNA表达谱，构建了一个基于15个PANoptosis相关基因的风险评分模型，用于预测肺腺癌患者的预后并指导临床治疗策略 | 首次在肺腺癌中系统探索PANoptosis相关基因的预后价值，并构建了基于PANoptosis的风险评分模型，该模型与肿瘤免疫、基因突变和临床药物敏感性相关 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和临床应用价值 | 探索PANoptosis相关基因在肺腺癌中的预后预测价值及其与肿瘤免疫的关联 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，RNA表达谱分析 | LASSO-Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-20 |
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2024-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.20.585926
PMID:38585819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PreTSA的计算方法，用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时空基因表达模式 | PreTSA在保持与最先进方法结果一致的同时，显著减少了计算时间，为研究极大数据集中的基因表达模式提供了独特解决方案 | NA | 开发一种计算高效的方法来建模时空基因表达模式 | 大规模单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA-seq revealed heterogeneous responses and functional differentiation of hemocytes against white spot syndrome virus infection in Litopenaeus vannamei
2024-03-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01805-23
PMID:38323810
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了南美白对虾血细胞在感染白斑综合征病毒后的异质性反应和功能分化 | 首次应用单细胞RNA测序技术绘制对虾血细胞在病毒感染下的转录组图谱，并识别出16个转录不同的细胞簇，揭示了血细胞在抗病毒免疫反应中的功能分化 | 研究仅关注白斑综合征病毒感染，未涉及其他病原体或环境因素对血细胞反应的影响 | 探究对虾血细胞在病毒感染下的免疫反应机制和功能分化 | 南美白对虾的血细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 无监督伪时间分析 | 转录组数据 | 健康与感染白斑综合征病毒的对虾血细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-20 |
Drug resistance mechanisms in dopamine agonist-resistant prolactin pituitary neuroendocrine tumors and exploration for new drugs
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101056
PMID:38277755
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研究论文 | 本研究探讨了多巴胺激动剂耐药性催乳素垂体神经内分泌肿瘤的耐药机制，并通过类器官模型筛选出潜在有效药物金雀异黄素 | 首次结合转录组测序和单细胞测序分析催乳素瘤的DA耐药机制，并成功建立DA耐药催乳素瘤类器官模型进行药物筛选 | 样本量相对较小（27例耐药和10例敏感肿瘤），类器官模型仅使用8个进行药物筛选 | 探究多巴胺激动剂耐药性催乳素瘤的耐药机制并寻找新的潜在治疗药物 | 多巴胺激动剂耐药性和敏感性的催乳素垂体神经内分泌肿瘤 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 转录组测序，单细胞测序，类器官培养，药物筛选 | 类器官模型 | RNA测序数据，单细胞测序数据，体外实验数据 | 27例DA耐药催乳素瘤，10例敏感催乳素瘤，3例耐药和3例敏感肿瘤进行单细胞测序，8个类器官用于药物筛选 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-20 |
MAFF confers vulnerability to cisplatin-based and ionizing radiation treatments by modulating ferroptosis and cell cycle progression in lung adenocarcinoma
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101057
PMID:38266355
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研究论文 | 本研究通过CRISPR筛选和单细胞RNA测序，发现MAFF在肺腺癌中通过调控铁死亡和细胞周期进程，影响肿瘤生长和对顺铂及电离辐射治疗的敏感性 | 首次将MAFF识别为肺腺癌中调控铁死亡和细胞周期进程的关键因子，并揭示其通过cAMP/PKA/CREB1通路上调，增强肿瘤对顺铂和电离辐射治疗的脆弱性 | 研究主要基于细胞和异种移植模型，临床样本验证有限，且MAFF的药理学激动剂开发尚未在人体试验中验证 | 探索肺腺癌中肿瘤生长和治疗抵抗的机制，以改善顺铂和电离辐射治疗的效果 | 肺腺癌细胞系、小鼠模型和患者样本 | 癌症生物学 | 肺癌 | CRISPR筛选、单细胞RNA测序、RNA测序、ChIP测序 | 细胞模型、异种移植模型 | 基因表达数据、转录组数据 | 未明确指定样本数量，涉及细胞和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-03-20 |
The role of histone H1.2 in pancreatic cancer metastasis and chemoresistance
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2023.101027
PMID:38290407
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白H1.2在胰腺癌转移和化疗耐药中的作用，并开发了一个基于基因表达的评分系统来预测患者生存 | 开发了一个新颖的转移和化疗耐药特征评分系统，并首次将组蛋白H1.2与c-MYC信号通路在胰腺癌中的调控联系起来 | 研究主要基于基因表达数据和实验模型，临床验证和机制细节有待进一步探索 | 探索胰腺癌化疗耐药与肿瘤转移之间的关联及其分子细胞机制 | 胰腺癌患者基因表达数据、单细胞RNA测序数据以及体外和体内实验模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、体外增殖、侵袭、迁移、药物敏感性实验、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-03-20 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between histone lactylation and cisplatin resistance in bladder cancer
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101059
PMID:38295753
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了膀胱癌中组蛋白乳酸化与顺铂耐药之间的关联 | 首次在单细胞层面揭示了H3K18乳酸化通过富集于靶基因启动子区域激活转录，从而驱动膀胱癌顺铂耐药的新机制，并鉴定出YBX1和YY1为关键转录因子 | 未在文中明确说明，可能包括样本量有限、机制验证主要在细胞层面进行、临床转化潜力需进一步验证等 | 探究膀胱癌顺铂耐药的分子机制，特别是组蛋白乳酸化在其中的作用 | 膀胱癌细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-03-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals transdifferentiation of parathyroid chief cells into oxyphil cells in patients with uremic secondary hyperparathyroidism
2024-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.11.027
PMID:38142040
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中甲状旁腺主细胞向嗜酸性细胞转分化的过程 | 首次建立了人类甲状旁腺的单细胞转录组图谱，并发现了主细胞向嗜酸性细胞的转分化过程，该过程与尿毒症环境中线粒体逐渐富集相关 | 研究样本量较小（仅3名患者），且动物模型（裸鼠移植）可能无法完全模拟人体内的复杂生理环境 | 探究尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中甲状旁腺嗜酸性细胞的起源和增殖机制 | 从尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者切除的甲状旁腺结节（主细胞结节、嗜酸性细胞结节和混合结节） | 单细胞组学 | 继发性甲状旁腺功能亢进 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者的甲状旁腺混合结节 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-13 |
Advancing parathyroid anatomy understanding through single-cell RNA sequencing in uremic secondary hyperparathyroidism
2024-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.12.005
PMID:38388141
|
评论 | 本文探讨了单细胞RNA测序在尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症研究中的最新应用，揭示了甲状旁腺内的细胞动态 | 通过单细胞RNA测序技术，对主细胞和嗜酸性细胞的分化过程提供了新见解，挑战了传统观点 | NA | 利用单细胞RNA测序技术增进对甲状旁腺解剖结构的理解 | 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症中的甲状旁腺细胞 | 数字病理学 | 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-05 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
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研究论文 | 本文介绍了一种用于人和小鼠脂肪组织的流式细胞术辅助单核RNA测序协议，支持样本多重分析 | 开发了一种整合流式细胞术进行质量控制、计数和精确核池化的新工作流程，以直接加载到10x Chromium控制器，有效消除批次混淆、减少低质量核、环境RNA污染和试剂浪费 | NA | 优化脂肪组织的单细胞RNA测序方法，克服脂肪细胞大小、脆弱性和商业试剂盒成本限制 | 人和小鼠的脂肪组织 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium控制器 |
| 13 | 2026-03-03 |
Modulator of TMB-associated immune infiltration (MOTIF) predicts immunotherapy response and guides combination therapy
2024-03-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.01.025
PMID:38320897
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研究论文 | 开发了一种名为MOTIF的新工具，用于预测肿瘤突变负荷相关的免疫浸润，并指导免疫检查点抑制剂的治疗反应和联合疗法 | 首次提出MOTIF工具，通过整合多癌种的大规模RNA-seq数据，识别能决定CD8 T细胞浸润程度的基因，并揭示其在癌症-免疫循环中的完整性缺陷 | 研究主要基于回顾性数据，需要前瞻性临床试验进一步验证MOTIF的预测准确性 | 预测免疫检查点抑制剂的治疗反应并指导联合疗法 | 肿瘤样本和免疫细胞浸润 | 生物信息学 | 多种实体瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 9311个肿瘤样本（来自30种癌症类型）和84个人类单细胞RNA-seq数据集（来自32种实体瘤） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-02-28 |
Sirtuin 6 ameliorates bleomycin-induced pulmonary fibrosis via activation of lipid catabolism
2024-03, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31027
PMID:37099691
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研究论文 | 本文探讨了Sirtuin 6通过激活脂质分解代谢改善博来霉素诱导的肺纤维化的机制 | 揭示了SIRT6通过PPARα介导的脂质分解代谢在肺纤维化中的保护作用，为治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类临床相关性需进一步验证 | 探究SIRT6在肺纤维化中的作用机制及潜在治疗策略 | 人类肺组织、小鼠模型、肺泡上皮细胞 | 分子生物学 | 肺纤维化 | 单细胞测序、高通量测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-02-27 |
Multi-organ single-cell transcriptomics of immune cells uncovered organ-specific gene expression and functions
2024-03-27, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03152-z
PMID:38538617
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞转录组数据集，揭示了健康供体14个器官中免疫细胞的器官特异性基因表达和功能差异 | 首次大规模整合多器官单细胞转录组数据，系统识别了免疫细胞在器官间的特异性基因表达模式，如肾脏中的GTPX3和胸腺中的DNTT与ACVR2B，并关联了转录因子活性和代谢通路 | 研究基于公开数据集进行荟萃分析，可能受原始数据质量和批次效应影响；样本来源限于健康供体，未涵盖疾病状态 | 探究不同人类器官中驻留免疫细胞的独特基因表达特征和功能 | 114,275个CD45+免疫细胞，来源于健康供体的14个器官 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 114,275个免疫细胞，来自14个器官的健康供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-02-26 |
Single-cell integrative analysis reveals consensus cancer cell states and clinical relevance in breast cancer
2024-03-12, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03127-0
PMID:38472225
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研究论文 | 本研究通过整合分析乳腺癌单细胞RNA测序数据，揭示了七种跨患者重复出现的共识癌细胞状态，并系统阐明了其生物学功能、亚型特异性分布、潜在起源细胞及相互关系 | 首次通过整合分析识别出乳腺癌中七种跨患者重复出现的共识癌细胞状态，并揭示了其与肿瘤微环境的相互作用及对生存预后的影响 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能未完全捕捉到蛋白质水平或空间维度的异质性 | 探究乳腺癌中恶性细胞的共同状态及其临床相关性 | 乳腺癌恶性细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个独立数据集中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-03-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2026-02-21 |
Canopy2: tumor phylogeny inference by bulk DNA and single-cell RNA sequencing
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585595
PMID:38562795
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研究论文 | 本文提出Canopy2，一种贝叶斯框架，利用批量DNA和单细胞RNA测序数据推断肿瘤系统发育树并进行突变分析 | Canopy2通过结合批量DNA和单细胞RNA测序数据，使用马尔可夫链蒙特卡洛方法从二项分布和β-二项分布的混合概率分布中采样，能有效解析单细胞数据中的零值来源，区分非癌性、随机性和技术性零值 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 推断肿瘤系统发育树并进行肿瘤亚群的突变分析，以理解肿瘤异质性 | 肿瘤细胞，特别是乳腺癌和胶质母细胞瘤数据 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，批量DNA测序 | 贝叶斯框架，马尔可夫链蒙特卡洛方法 | 单核苷酸变异数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量DNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-02-12 |
Mast cell activation disrupts interactions between endothelial cells and pericytes during early life allergic asthma
2024-Mar-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173676
PMID:38487999
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研究论文 | 本研究通过定量成像和空间转录组学揭示了早期生命过敏性哮喘中肥大细胞激活破坏内皮细胞与周细胞相互作用的机制 | 首次发现新生儿期过敏暴露通过肥大细胞蛋白酶（如类胰蛋白酶）驱动周细胞覆盖缺失，并利用空间转录组学在儿科哮喘活检中验证血管应激与肥大细胞激活通路的关联 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自活检样本的空间转录组学分析，样本量有限 | 探究早期生命过敏性哮喘对肺微循环的影响及肥大细胞在血管重塑中的作用 | 新生小鼠的肺组织切片（PCLSs）和儿科哮喘患者的气管内活检样本 | 数字病理学 | 哮喘 | 定量成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-02-06 |
MEF2C Hypofunction in GABAergic Cells Alters Sociability and Prefrontal Cortex Inhibitory Synaptic Transmission in a Sex-Dependent Manner
2024-Mar, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2024.100289
PMID:38390348
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研究论文 | 本研究探讨了GABA能细胞中MEF2C功能减退如何以性别依赖的方式影响小鼠的社交行为和前额叶皮层抑制性突触传递 | 首次在GABA能细胞中特异性操纵Mef2c杂合性，揭示了其在雌性小鼠中导致社交偏好缺陷和抑制性神经元功能异常的性别特异性效应 | 研究仅在小鼠模型中进行，未直接验证人类MCHS患者中的类似机制，且样本量可能有限 | 探究MEF2C功能减退在GABA能神经元中对MCHS样表型的影响，特别是社交行为和神经环路功能 | 小鼠模型，特别是GABA能细胞中Mef2c杂合性的雌雄个体 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学、膜片钳电生理学、光遗传学、脑电图 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据、电生理记录、行为数据 | 未明确指定，但涉及雌雄小鼠的多个实验组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |