单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-04-01	Gsα Regulates Macrophage Foam Cell Formation During Atherosclerosis 2024-Mar-29, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323156 PMID:38375634	研究论文	本研究探讨了Gsα在动脉粥样硬化过程中对巨噬细胞泡沫细胞形成的调控作用	揭示了Gsα通过激活cAMP反应元件结合蛋白的转录活性，增加CD36和SR-A1的表达，从而促进脂质摄取和泡沫细胞形成的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化仍需进一步验证	阐明Gsα在动脉粥样硬化发展中的具体作用机制	巨噬细胞和动脉粥样硬化斑块	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞测序、批量测序、免疫荧光、cAMP测量、骨髓移植、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测	巨噬细胞特异性Gsα敲除小鼠模型	基因表达数据、蛋白质活性数据、影像数据	小鼠模型和人类斑块巨噬细胞样本
2	2025-03-30	Clearance of VWF by hepatic macrophages is critical for the protective effect of ADAMTS13 in sickle cell anemia mice 2024-03-28, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2023021583 PMID:38142410	研究论文	本研究探讨了肝巨噬细胞在镰状细胞贫血（SCA）中的作用，特别是Clec4f+Marcohigh巨噬细胞亚群在清除ADAMTS13切割的VWF和镰状红细胞中的关键作用	首次揭示了Clec4f+Marcohigh巨噬细胞亚群通过去唾液酸化依赖的方式清除VWF，并证实了巨噬细胞介导的VWF清除对ADAMTS13保护效应的必要性	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类SCA患者中验证	阐明肝巨噬细胞在SCA病理机制中的作用及其与ADAMTS13保护效应的关系	镰状细胞贫血小鼠模型中的肝巨噬细胞	血液病学	镰状细胞贫血	单细胞RNA测序、空间转录组学、多重误差稳健荧光原位杂交	小鼠疾病模型	基因表达数据、空间分布数据	未明确说明样本数量，使用SCA小鼠模型
3	2025-03-30	Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference 2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae216 PMID:38725155	research paper	该论文介绍了一个名为Escort的新框架，用于评估单细胞RNA测序数据在轨迹推断中的适用性，并量化分析决策对轨迹属性的影响	开发了Escort框架，通过数据驱动的方法评估单细胞RNA测序数据的轨迹推断适用性，减少了分析过程中的不确定性和决策负担	未提及具体的局限性	解决单细胞RNA测序数据分析中方法选择和参数不确定性的问题	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞RNA测序数据	NA
4	2025-03-27	A revised conceptual framework for mouse vomeronasal pumping and stimulus sampling 2024-03-25, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2024.01.036 PMID:38320553	research paper	本文重新审视了小鼠犁鼻器刺激采样的经典血管运动泵假说，并提出了一个修订的概念框架	发现了犁鼻器平滑肌组织的两个亚群，具有不同的结构和收缩特性，揭示了新的功能模式	研究仅针对小鼠犁鼻器，结果可能不适用于其他哺乳动物	探究犁鼻器的物理机械功能和刺激采样机制	小鼠犁鼻器	生理学	NA	解剖学、组织学、生理学方法、单细胞转录组学、药理学分析、2D/3D断层扫描	NA	解剖数据、生理数据、转录组数据、影像数据	NA
5	2025-03-26	De novo antibody discovery in human blood from full-length single B cell transcriptomics and matching haplotyped-resolved germline assemblies 2024-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.26.586834 PMID:38585716	研究论文	该研究通过结合人类基因组中免疫球蛋白位点的全基因组测序和来自同一供体的B细胞的单细胞转录组测序，探索了生殖系IG单倍型如何影响表达的抗体库	首次将生殖系IG位点的全基因组测序与单细胞转录组测序结合，以解析生殖系V、D和J等位基因对表达抗体库的贡献	研究仅针对麻疹、腮腺炎和风疹(MMR)疫苗接种后的B细胞，可能无法全面反映其他免疫挑战下的抗体库	理解生殖系IG单倍型如何影响表达的抗体库	人类B细胞及其表达的抗体	基因组学与免疫学	麻疹	全基因组测序、单细胞转录组测序	NA	基因组序列数据、转录组数据	来自同一供体的B细胞，具体数量未明确说明
6	2025-03-23	Age-associated CD4+ T cells with B cell-promoting functions are regulated by ZEB2 in autoimmunity 2024-03-29, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk1643 PMID:38330141	研究论文	本文通过流式细胞术和批量RNA测序分析了354名自身免疫性疾病患者和健康对照的CD4 T细胞亚群，发现了一种随着年龄增长而扩增的CXCR3CD4效应记忆T细胞亚群，命名为'年龄相关T辅助细胞（TA细胞）'	发现了一种新的年龄相关T细胞亚群（TA细胞），并揭示了其在自身免疫性疾病中的作用及其调控机制	研究主要基于流式细胞术和RNA测序，未涉及功能验证实验	探讨年龄与自身免疫性疾病之间的关系	354名自身免疫性疾病患者和健康对照的CD4 T细胞亚群	免疫学	自身免疫性疾病	流式细胞术，批量RNA测序，单细胞RNA测序	NA	细胞数据，RNA测序数据	354名患者和健康对照
7	2025-03-22	Clonal differences underlie variable responses to sequential and prolonged treatment 2024-Mar-20, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.01.011 PMID:38401539	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和条形码技术追踪了癌症细胞在长期和连续治疗中的抗性克隆，揭示了克隆间基因表达状态的差异如何影响对后续治疗的反应	结合单细胞RNA测序和条形码技术，首次系统地追踪了抗性克隆在长期和连续治疗中的命运，并识别了预测克隆存活的基因表达状态	研究主要基于实验室环境下的细胞模型，未涉及体内肿瘤微环境的复杂性	探究癌症细胞克隆间基因表达差异如何影响对连续或长期治疗的反应，并寻找预测克隆存活的基因表达状态	癌症细胞及其抗性克隆	癌症生物学	癌症	单细胞RNA测序，条形码技术	NA	单细胞RNA测序数据	未明确说明具体样本数量，但涉及多个抗性克隆的追踪和分析
8	2025-03-22	Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology 2024-Mar, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07187-5 PMID:38509377	研究论文	本文识别了一种表观遗传控制的记忆性星形胶质细胞亚群，该亚群在再次刺激时表现出加剧的促炎反应	发现了由代谢酶ATP-柠檬酸裂解酶（ACLY）控制的星形胶质细胞记忆机制，该机制通过产生乙酰辅酶A（acetyl-CoA）并由组蛋白乙酰转移酶p300控制染色质可及性	研究主要基于实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型，人类星形胶质细胞的研究仅限于体外实验	探讨星形胶质细胞亚群在神经系统疾病中的病理作用及其表观遗传记忆机制	星形胶质细胞亚群	神经科学	多发性硬化症	单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序、染色质免疫共沉淀测序、核酸检测和测序、CRISPR-Cas9基因扰动	NA	单细胞RNA测序数据、染色质可及性数据	急性及慢性EAE模型、人类星形胶质细胞体外培养
9	2025-03-21	Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotype and phenotype in chronic lymphocytic leukemia 2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.15.585298 PMID:38559060	研究论文	本研究利用长读长单细胞RNA测序技术，探讨了慢性淋巴细胞白血病（CLL）中癌症亚克隆的基因型和表型特征	采用MAS-seq长读长单细胞RNA测序技术，显著提高了转录本的覆盖范围，并扩展了可用于将细胞与癌症亚克隆关联的信息突变集	研究样本量较小，仅涉及六名CLL患者	研究CLL亚克隆中是否存在额外的驱动突变加速亚克隆扩展，以及突变亚克隆是否表现出与其他癌症亚克隆不同的转录组行为	慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者	数字病理学	慢性淋巴细胞白血病	长读长单细胞RNA测序（MAS-seq）	NA	RNA测序数据	六名CLL患者
10	2025-03-20	Ibudilast Protects Retinal Bipolar Cells from Excitotoxic Retinal Damage and Activates the mTOR Pathway 2024-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.18.585556 PMID:38562805	研究论文	本研究探讨了Ibudilast在保护视网膜双极细胞免受兴奋性毒性视网膜损伤中的作用，并激活了mTOR通路	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了Ibudilast在视网膜损伤中的神经保护机制，并发现其通过激活mTOR通路发挥作用	研究主要基于鸡的兴奋性毒性视网膜损伤模型，尚未在人体中进行验证	研究Ibudilast在保护视网膜神经元免受兴奋性毒性损伤中的作用及其机制	视网膜双极细胞和Müller胶质细胞	神经科学	视网膜疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	鸡的兴奋性毒性视网膜损伤模型
11	2025-03-13	Single-cell transcriptomics of the human parasite Schistosoma mansoni first intra-molluscan stage reveals tentative tegumental and stem-cell regulators 2024-03-12, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-55790-3 PMID:38472267	研究论文	本文通过单细胞转录组学技术研究了人类寄生虫曼氏血吸虫在软体动物宿主内的第一阶段发育，揭示了可能的表皮和干细胞调控因子	首次使用单细胞转录组学技术对曼氏血吸虫在软体动物宿主内的发育阶段进行详细分析，识别了六个细胞群及其关键生物过程	研究局限于曼氏血吸虫的特定发育阶段，未涵盖整个生命周期	探索曼氏血吸虫在软体动物宿主内发育阶段的细胞和分子机制	曼氏血吸虫的母孢子囊	单细胞转录组学	血吸虫病	10X Genomics Chromium平台	NA	单细胞RNA测序数据	曼氏血吸虫母孢子囊的单细胞悬浮液
12	2025-03-11	Reciprocal regulation of SIRT1 and AMPK by Ginsenoside compound K impedes the conversion from plasma cells to mitigate for podocyte injury in MRL/lpr mice in a B cell-specific manner 2024-Mar, Journal of ginseng research IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.jgr.2023.11.006 PMID:38465215	研究论文	本研究探讨了人参皂苷化合物K（CK）通过调节SIRT1和AMPK在MRL/lpr小鼠中抑制B细胞向浆细胞转化，从而减轻肾小球足细胞损伤的机制	揭示了CK通过激活B细胞特异性SIRT1和AMPK，阻碍肾B细胞向浆细胞转化，从而减轻系统性炎症和免疫复合物沉积的创新机制	研究仅限于MRL/lpr小鼠模型，未在人类患者中进行验证	探讨CK在狼疮性肾炎（LN）中通过调节B细胞亚群减轻肾小球足细胞损伤的机制	MRL/lpr小鼠	生物医学	狼疮性肾炎	单细胞RNA测序、流式细胞术、代谢组学分析、免疫印迹和免疫荧光检测	NA	RNA测序数据、代谢物数据、免疫印迹和免疫荧光图像	雌性MRL/lpr小鼠
13	2025-03-08	Tetrahedral DNA loaded siCCR2 restrains M1 macrophage polarization to ameliorate pulmonary fibrosis in chemoradiation-induced murine model 2024-Mar-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2024.01.022 PMID:38273656	研究论文	本文通过整合博来霉素气管内给药和胸部照射，构建了一种模拟特发性肺纤维化（IPF）临床特征的鼠模型，揭示了CCL2/CCR2轴在驱动M1巨噬细胞极化中的决定性作用，并开发了一种新型的FNA-siCCR2治疗策略	构建了一种新的IPF鼠模型，揭示了M1巨噬细胞在IPF中的关键作用，并开发了FNA-siCCR2作为潜在的治疗策略	研究主要基于鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	研究特发性肺纤维化（IPF）的发病机制及潜在治疗方法	鼠模型和IPF患者	数字病理学	肺纤维化	scRNA-seq	鼠模型	基因表达数据	鼠模型和IPF患者的scRNA-seq数据
14	2025-03-05	Single-cell transcriptome analysis upon ECM-remodeling meningioma cells 2024-Mar-16, Neurosurgical review IF:2.5Q1 DOI:10.1007/s10143-024-02349-5 PMID:38491247	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了ECM重塑脑膜瘤细胞的转录组特征和生物学特性	首次在单细胞水平上对ECM重塑脑膜瘤细胞进行了全面的转录组分析，揭示了其与细胞粘附和细胞外基质组织相关的基因表达特征	研究样本量未明确说明，可能限制了结果的普遍性	研究ECM重塑脑膜瘤细胞的转录组特征和生物学特性	脑膜瘤细胞	数字病理学	脑膜瘤	单细胞RNA测序（ScRNA-seq）	NA	RNA测序数据	未明确说明
15	2025-03-03	Synovial Tissue Insights into Heterogeneity of Rheumatoid Arthritis 2024-03, Current rheumatology reports IF:5.7Q1 DOI:10.1007/s11926-023-01129-2 PMID:38157158	综述	本文综述了类风湿性关节炎（RA）在滑膜组织中的异质性研究进展，包括单细胞RNA测序技术的应用和最新研究成果	通过单细胞RNA测序技术揭示了RA滑膜组织中与疾病相关的细胞群体，如外周辅助T细胞、自身免疫相关B细胞（ABCs）和NOTCH3+亚层成纤维细胞	NA	探讨类风湿性关节炎在滑膜组织中的细胞和分子异质性，以优化患者护理和治疗效果	类风湿性关节炎患者的滑膜组织	生物医学	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序、空间转录组学、机器学习	NA	RNA测序数据	NA
16	2025-03-03	Associating growth factor secretions and transcriptomes of single cells in nanovials using SEC-seq 2024-Mar, Nature nanotechnology IF:38.1Q1 DOI:10.1038/s41565-023-01560-7 PMID:38082117	研究论文	本文开发并应用了SEC-seq技术，通过纳米孔捕获单个细胞及其分泌物，同时测量了数千个间充质基质细胞的VEGF-A分泌和转录组	开发了SEC-seq技术，首次实现了在单细胞水平上同时测量分泌蛋白和转录组，揭示了VEGF-A分泌的异质性及其与转录水平的相关性	研究主要集中于间充质基质细胞，未涉及其他细胞类型，且样本量相对有限	研究单细胞分泌蛋白与转录组之间的关系，探索细胞分泌异质性的机制	间充质基质细胞	单细胞测序	NA	SEC-seq	NA	单细胞转录组数据、分泌蛋白数据	数千个间充质基质细胞
17	2025-03-03	CFTR expression in human salivary gland acinar cells 2024-03-01, American journal of physiology. Cell physiology DOI:10.1152/ajpcell.00549.2023 PMID:38284125	研究论文	本研究评估了CFTR在人类颌下腺和腮腺中的表达，并首次提供了CFTR在人类唾液腺腺泡细胞中功能表达的文档证据	首次在人类唾液腺腺泡细胞中发现了CFTR的功能表达，挑战了CFTR仅存在于外分泌腺导管细胞的既定模型	研究主要基于免疫定位和单细胞RNA测序分析，需要进一步的功能研究来验证CFTR在腺泡细胞中的具体作用	探讨CFTR在人类唾液腺中的表达及其对唾液腺功能的影响	人类颌下腺和腮腺	NA	NA	免疫定位、单细胞RNA测序、胶原酶消化	NA	RNA测序数据、免疫定位数据	人类颌下腺和腮腺样本
18	2025-03-03	Highlights of how single-cell analyses are illuminating differentiation and disease in the gastric corpus 2024-Mar-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology DOI:10.1152/ajpgi.00164.2023 PMID:38193187	review	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在胃体分化和疾病研究中的应用	通过scRNA-seq技术揭示了胃体器官发生、发育和成体中的新标记物，以及再生和肿瘤发生过程中的转录变化	NA	探讨scRNA-seq在胃体分化和疾病研究中的应用及其对个性化治疗的潜在影响	人类和鼠类系统中的胃体	生物信息学	胃部疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	NA
19	2025-03-03	Morphological, molecular, and functional characterization of mouse glutamatergic myenteric neurons 2024-Mar-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology DOI:10.1152/ajpgi.00200.2023 PMID:38193160	研究论文	本文系统地描述了小鼠结肠和直肠中VGLUT2阳性的肠神经元（VGLUT2-ENs）的形态、分子和功能特征	首次通过稀疏标记、单细胞mRNA测序和钙成像技术全面表征了VGLUT2-ENs的形态、分子和功能特性	研究仅针对小鼠模型，尚未在人类中进行验证	研究VGLUT2阳性肠神经元的结构和功能	小鼠结肠和直肠中的VGLUT2阳性肠神经元	神经科学	NA	稀疏标记、单细胞mRNA测序（scRNA-seq）、GCaMP6f钙成像	NA	分子数据、图像数据	52个VGLUT2-ENs进行单细胞mRNA测序，215个VGLUT2-ENs进行钙成像
20	2025-03-03	Incongruity between T cell receptor recognition of breast cancer hotspot mutations ESR1 Y537S and D538G following exogenous peptide loading versus endogenous antigen processing 2024-03, Cytotherapy IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.jcyt.2023.12.002 PMID:38231165	研究论文	本文研究了T细胞受体（TCR）工程化T细胞疗法在识别乳腺癌热点突变ESR1 Y537S和D538G时的差异，探讨了外源性肽加载与内源性抗原处理之间的不一致性	通过单细胞RNA测序和免疫肽组学分析，发现了ESR1 Y537S和D538G突变特异性T细胞克隆，并揭示了这些TCRs在识别内源性突变ESR1时的局限性	研究发现，尽管TCRs能够识别外源性加载的ESR1突变肽，但无法识别内源性表达的突变ESR1，这可能限制了TCR T疗法在乳腺癌治疗中的应用	探索TCR T疗法在乳腺癌治疗中的潜力，特别是针对ESR1 Y537S和D538G突变的特异性识别	乳腺癌患者和健康捐赠者的T细胞	免疫疗法	乳腺癌	单细胞RNA测序、免疫肽组学分析、IFN-γ ELISpot筛选	NA	RNA序列数据、肽段数据	健康捐赠者和转移性乳腺癌患者的T细胞样本