单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 535 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-24 |
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07187-5
PMID:38509377
|
研究论文 | 研究鉴定出一个由表观遗传控制的记忆星形胶质细胞亚群，该亚群在再刺激时表现出加剧的促炎反应，并促进中枢神经系统病理 | 首次发现星形胶质细胞存在表观遗传记忆，并阐明ACLY-p300轴通过调控染色质可及性控制该记忆的形成 | 未明确记忆星形胶质细胞在人类多发性硬化症中的长期稳定性及与其他神经退行性疾病的关联 | 探究疾病相关星形胶质细胞亚群的稳定性及其整合过去刺激事件的能力 | 星形胶质细胞和实验性自身免疫性脑脊髓炎与多发性硬化症模型 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序、染色质免疫沉淀测序、核酸靶向检测测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 测序数据和图像数据 | 急性与慢性EAE小鼠模型及人类慢性多发性硬化症尸检样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC-seq、ChIP-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序用于单细胞转录组分析；Illumina NovaSeq用于测序文库测序 |
| 2 | 2026-04-23 |
A vagal reflex evoked by airway closure
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07144-2
PMID:38448588
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研究论文 | 本研究鉴定了一种由气道闭合触发的迷走神经反射，该反射会导致喘息，并揭示了表达PVALB的迷走神经元和表达PIEZO2的神经上皮小体在这一过程中的关键作用 | 首次描述了由气道闭合特异性触发的迷走神经反射通路，并确定了表达PVALB的迷走神经元和表达PIEZO2的神经上皮小体作为该反射的关键感受器 | 研究主要在小鼠模型中进行，其在人类中的直接适用性尚需验证；神经上皮小体在其他呼吸反射中的作用尚未完全阐明 | 揭示在气道闭合时维持呼吸功能的神经反射机制 | 小鼠的迷走神经感觉神经元、肺神经上皮小体 | 神经科学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序、体内迷走神经节成像、基因敲除 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-04-11 |
Universal recording of immune cell interactions in vivo
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07134-4
PMID:38448581
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研究论文 | 本文报道了一种名为uLIPSTIC的通用技术，用于在体内记录免疫细胞之间以及免疫与非免疫细胞之间的瞬时物理相互作用 | 开发了通用版本的LIPSTIC技术，不再依赖特定受体-配体通路，能够记录任意细胞间的物理相互作用 | 未明确提及技术本身的局限性，但暗示了先前版本仅能测量特定细胞间相互作用的限制 | 开发一种通用技术以在体内记录细胞间的物理相互作用 | 免疫细胞（如CD8 T细胞、树突状细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞）与非免疫细胞（如肠道上皮细胞） | 免疫学 | NA | LIPSTIC/uLIPSTIC技术，单细胞转录组学 | NA | 分子标记数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-04-10 |
Spatial transcriptomics reveal neuron-astrocyte synergy in long-term memory
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07011-6
PMID:38326616
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研究论文 | 本研究利用空间和单细胞转录组学揭示了基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子结构 | 首次结合单细胞RNA测序和单分子空间转录组学技术，在完整脑切片中提供了长期记忆印迹的丰富空间图谱，并揭示了神经元与星形胶质细胞之间的协同作用 | NA | 阐明基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子机制 | 基底外侧杏仁核中的神经元和星形胶质细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-03-30 |
Population-level comparisons of gene regulatory networks modeled on high-throughput single-cell transcriptomics data
2024-03, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00597-5
PMID:38438786
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCORPION的工具，用于从单细胞/核RNA测序数据重建可比较的基因调控网络，以支持群体水平的比较 | SCORPION利用消息传递算法和相同基线先验，克服了数据稀疏性和细胞异质性，在合成数据上优于12种现有基因调控网络重建技术，并能准确识别野生型和转录因子扰动细胞间的调控网络差异 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种工具，用于从单细胞转录组学数据重建可比较的基因调控网络，以进行群体水平的比较 | 单细胞/核RNA测序数据，特别是来自结直肠癌和相邻健康组织的200,436个细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 消息传递算法 | 单细胞转录组学数据 | 200,436个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-29 |
Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids
2024-03-29, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66225
PMID:38619271
|
研究论文 | 本文提供了一个关于在脑类器官中生成和分析单细胞及单核转录组的逐步实验指南 | 通过结合单细胞和单核转录组学方法，克服了难以分离细胞类型的限制，使单个细胞的转录组分析在脑类器官研究中普遍适用 | NA | 为脑类器官研究提供单细胞和单核转录组学的实验流程，以促进对大脑发育的细胞过程和分子机制的全面研究 | 脑类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，单核转录组学，RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-29 |
Spatial High-resolution Analysis of Gene Expression Levels in Tendons
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65852
PMID:38526117
|
方法论文 | 本文综述了肌腱组织中空间高分辨率基因表达水平的分析方法，重点关注新型原位杂交技术 | 针对富含基质的肌腱组织，提出了单细胞水平的空间转录组学分析方法，解决了低细胞数、低RNA含量和高基质背景的挑战 | NA | 开发并优化肌腱组织中空间基因表达水平的分析方法 | 肌腱组织，特别是年轻和老年动物模型及人类肌腱样本 | 数字病理学 | NA | 原位杂交，空间转录组学 | NA | 图像，RNA空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-03-21 |
Exploration of the prognostic prediction value of the PANoptosis-based risk score and its correlation with tumor immunity in lung adenocarcinoma
2024-03, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3682
PMID:38508210
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据和RNA表达谱，构建了一个基于15个PANoptosis相关基因的风险评分模型，用于预测肺腺癌患者的预后并指导临床治疗策略 | 首次在肺腺癌中系统探索PANoptosis相关基因的预后价值，并构建了基于PANoptosis的风险评分模型，该模型与肿瘤免疫、基因突变和临床药物敏感性相关 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和临床应用价值 | 探索PANoptosis相关基因在肺腺癌中的预后预测价值及其与肿瘤免疫的关联 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，RNA表达谱分析 | LASSO-Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-03-20 |
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2024-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.20.585926
PMID:38585819
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PreTSA的计算方法，用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时空基因表达模式 | PreTSA在保持与最先进方法结果一致的同时，显著减少了计算时间，为研究极大数据集中的基因表达模式提供了独特解决方案 | NA | 开发一种计算高效的方法来建模时空基因表达模式 | 大规模单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA-seq revealed heterogeneous responses and functional differentiation of hemocytes against white spot syndrome virus infection in Litopenaeus vannamei
2024-03-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01805-23
PMID:38323810
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了南美白对虾血细胞在感染白斑综合征病毒后的异质性反应和功能分化 | 首次应用单细胞RNA测序技术绘制对虾血细胞在病毒感染下的转录组图谱，并识别出16个转录不同的细胞簇，揭示了血细胞在抗病毒免疫反应中的功能分化 | 研究仅关注白斑综合征病毒感染，未涉及其他病原体或环境因素对血细胞反应的影响 | 探究对虾血细胞在病毒感染下的免疫反应机制和功能分化 | 南美白对虾的血细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 无监督伪时间分析 | 转录组数据 | 健康与感染白斑综合征病毒的对虾血细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-20 |
Drug resistance mechanisms in dopamine agonist-resistant prolactin pituitary neuroendocrine tumors and exploration for new drugs
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101056
PMID:38277755
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研究论文 | 本研究探讨了多巴胺激动剂耐药性催乳素垂体神经内分泌肿瘤的耐药机制，并通过类器官模型筛选出潜在有效药物金雀异黄素 | 首次结合转录组测序和单细胞测序分析催乳素瘤的DA耐药机制，并成功建立DA耐药催乳素瘤类器官模型进行药物筛选 | 样本量相对较小（27例耐药和10例敏感肿瘤），类器官模型仅使用8个进行药物筛选 | 探究多巴胺激动剂耐药性催乳素瘤的耐药机制并寻找新的潜在治疗药物 | 多巴胺激动剂耐药性和敏感性的催乳素垂体神经内分泌肿瘤 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 转录组测序，单细胞测序，类器官培养，药物筛选 | 类器官模型 | RNA测序数据，单细胞测序数据，体外实验数据 | 27例DA耐药催乳素瘤，10例敏感催乳素瘤，3例耐药和3例敏感肿瘤进行单细胞测序，8个类器官用于药物筛选 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-20 |
MAFF confers vulnerability to cisplatin-based and ionizing radiation treatments by modulating ferroptosis and cell cycle progression in lung adenocarcinoma
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101057
PMID:38266355
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR筛选和单细胞RNA测序，发现MAFF在肺腺癌中通过调控铁死亡和细胞周期进程，影响肿瘤生长和对顺铂及电离辐射治疗的敏感性 | 首次将MAFF识别为肺腺癌中调控铁死亡和细胞周期进程的关键因子，并揭示其通过cAMP/PKA/CREB1通路上调，增强肿瘤对顺铂和电离辐射治疗的脆弱性 | 研究主要基于细胞和异种移植模型，临床样本验证有限，且MAFF的药理学激动剂开发尚未在人体试验中验证 | 探索肺腺癌中肿瘤生长和治疗抵抗的机制，以改善顺铂和电离辐射治疗的效果 | 肺腺癌细胞系、小鼠模型和患者样本 | 癌症生物学 | 肺癌 | CRISPR筛选、单细胞RNA测序、RNA测序、ChIP测序 | 细胞模型、异种移植模型 | 基因表达数据、转录组数据 | 未明确指定样本数量，涉及细胞和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-03-20 |
The role of histone H1.2 in pancreatic cancer metastasis and chemoresistance
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2023.101027
PMID:38290407
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白H1.2在胰腺癌转移和化疗耐药中的作用，并开发了一个基于基因表达的评分系统来预测患者生存 | 开发了一个新颖的转移和化疗耐药特征评分系统，并首次将组蛋白H1.2与c-MYC信号通路在胰腺癌中的调控联系起来 | 研究主要基于基因表达数据和实验模型，临床验证和机制细节有待进一步探索 | 探索胰腺癌化疗耐药与肿瘤转移之间的关联及其分子细胞机制 | 胰腺癌患者基因表达数据、单细胞RNA测序数据以及体外和体内实验模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、体外增殖、侵袭、迁移、药物敏感性实验、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-03-20 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between histone lactylation and cisplatin resistance in bladder cancer
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101059
PMID:38295753
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了膀胱癌中组蛋白乳酸化与顺铂耐药之间的关联 | 首次在单细胞层面揭示了H3K18乳酸化通过富集于靶基因启动子区域激活转录，从而驱动膀胱癌顺铂耐药的新机制，并鉴定出YBX1和YY1为关键转录因子 | 未在文中明确说明，可能包括样本量有限、机制验证主要在细胞层面进行、临床转化潜力需进一步验证等 | 探究膀胱癌顺铂耐药的分子机制，特别是组蛋白乳酸化在其中的作用 | 膀胱癌细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals transdifferentiation of parathyroid chief cells into oxyphil cells in patients with uremic secondary hyperparathyroidism
2024-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.11.027
PMID:38142040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中甲状旁腺主细胞向嗜酸性细胞转分化的过程 | 首次建立了人类甲状旁腺的单细胞转录组图谱，并发现了主细胞向嗜酸性细胞的转分化过程，该过程与尿毒症环境中线粒体逐渐富集相关 | 研究样本量较小（仅3名患者），且动物模型（裸鼠移植）可能无法完全模拟人体内的复杂生理环境 | 探究尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中甲状旁腺嗜酸性细胞的起源和增殖机制 | 从尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者切除的甲状旁腺结节（主细胞结节、嗜酸性细胞结节和混合结节） | 单细胞组学 | 继发性甲状旁腺功能亢进 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者的甲状旁腺混合结节 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-13 |
Advancing parathyroid anatomy understanding through single-cell RNA sequencing in uremic secondary hyperparathyroidism
2024-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.12.005
PMID:38388141
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评论 | 本文探讨了单细胞RNA测序在尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症研究中的最新应用，揭示了甲状旁腺内的细胞动态 | 通过单细胞RNA测序技术，对主细胞和嗜酸性细胞的分化过程提供了新见解，挑战了传统观点 | NA | 利用单细胞RNA测序技术增进对甲状旁腺解剖结构的理解 | 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症中的甲状旁腺细胞 | 数字病理学 | 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-03-05 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于人和小鼠脂肪组织的流式细胞术辅助单核RNA测序协议，支持样本多重分析 | 开发了一种整合流式细胞术进行质量控制、计数和精确核池化的新工作流程，以直接加载到10x Chromium控制器，有效消除批次混淆、减少低质量核、环境RNA污染和试剂浪费 | NA | 优化脂肪组织的单细胞RNA测序方法，克服脂肪细胞大小、脆弱性和商业试剂盒成本限制 | 人和小鼠的脂肪组织 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium控制器 |
| 18 | 2026-03-03 |
Modulator of TMB-associated immune infiltration (MOTIF) predicts immunotherapy response and guides combination therapy
2024-03-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.01.025
PMID:38320897
|
研究论文 | 开发了一种名为MOTIF的新工具，用于预测肿瘤突变负荷相关的免疫浸润，并指导免疫检查点抑制剂的治疗反应和联合疗法 | 首次提出MOTIF工具，通过整合多癌种的大规模RNA-seq数据，识别能决定CD8 T细胞浸润程度的基因，并揭示其在癌症-免疫循环中的完整性缺陷 | 研究主要基于回顾性数据，需要前瞻性临床试验进一步验证MOTIF的预测准确性 | 预测免疫检查点抑制剂的治疗反应并指导联合疗法 | 肿瘤样本和免疫细胞浸润 | 生物信息学 | 多种实体瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 9311个肿瘤样本（来自30种癌症类型）和84个人类单细胞RNA-seq数据集（来自32种实体瘤） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-02-28 |
Sirtuin 6 ameliorates bleomycin-induced pulmonary fibrosis via activation of lipid catabolism
2024-03, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31027
PMID:37099691
|
研究论文 | 本文探讨了Sirtuin 6通过激活脂质分解代谢改善博来霉素诱导的肺纤维化的机制 | 揭示了SIRT6通过PPARα介导的脂质分解代谢在肺纤维化中的保护作用，为治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类临床相关性需进一步验证 | 探究SIRT6在肺纤维化中的作用机制及潜在治疗策略 | 人类肺组织、小鼠模型、肺泡上皮细胞 | 分子生物学 | 肺纤维化 | 单细胞测序、高通量测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-02-27 |
Multi-organ single-cell transcriptomics of immune cells uncovered organ-specific gene expression and functions
2024-03-27, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03152-z
PMID:38538617
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞转录组数据集，揭示了健康供体14个器官中免疫细胞的器官特异性基因表达和功能差异 | 首次大规模整合多器官单细胞转录组数据，系统识别了免疫细胞在器官间的特异性基因表达模式，如肾脏中的GTPX3和胸腺中的DNTT与ACVR2B，并关联了转录因子活性和代谢通路 | 研究基于公开数据集进行荟萃分析，可能受原始数据质量和批次效应影响；样本来源限于健康供体，未涵盖疾病状态 | 探究不同人类器官中驻留免疫细胞的独特基因表达特征和功能 | 114,275个CD45+免疫细胞，来源于健康供体的14个器官 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 114,275个免疫细胞，来自14个器官的健康供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |