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当前共找到 444 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-10-27 |
Genetically inspired organoids prevent joint degeneration and alleviate chondrocyte senescence via Col11a1-HIF1α-mediated glycolysis-OXPHOS metabolism shift
2024-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1574
PMID:38314968
|
研究论文 | 研究报告了COL11A1基因与髋关节发育不良（DDH）的关联，并通过基因工程器官模型预防关节退化和减轻软骨细胞衰老 | 首次报道了COL11A1基因与DDH的关联，并开发了一种基于COL11A1过表达的器官模型用于预防关节退化和减轻软骨细胞衰老 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中进行验证 | 探索COL11A1基因在髋关节发育不良和关节退化中的作用，并开发新的治疗方法 | 髋关节发育不良患者、Col11a1基因敲除小鼠、软骨细胞 | 生物医学 | 骨关节疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、外显子测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据、单细胞RNA测序数据 | 不同人群的家族性DDH患者、Col11a1基因敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-10-21 |
Downregulation of N4-acetylcytidine modification in myeloid cells attenuates immunotherapy and exacerbates hepatocellular carcinoma progression
2024-02, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02510-9
PMID:38040817
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研究论文 | 研究了N4-乙酰胞苷修饰在髓系细胞中下调对肝细胞癌进展和免疫治疗的影响 | 首次探讨了N4-乙酰胞苷修饰在肝细胞癌发展和免疫治疗中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人体中验证 | 探讨N4-乙酰胞苷修饰在肝细胞癌发展和免疫治疗中的作用 | 髓系细胞和肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、RNA测序、RNA免疫沉淀测序、酪胺信号放大分析 | NA | RNA | 小鼠模型和肝细胞癌患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-10-21 |
Modulation of canonical Wnt signaling regulates peribiliary mesenchymal identity during homeostasis and injury
2024-02-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000368
PMID:38251878
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研究论文 | 研究了Wnt信号通路在调节外周胆管周围间充质细胞身份中的作用，特别是在稳态和损伤情况下的变化 | 首次采用完全体内方法结合转录组分析，揭示了Wnt4、Wnt5a和Wnt7b在调节外周胆管周围间充质细胞身份中的关键作用 | 研究主要集中在体内实验，未涉及体外实验验证 | 探讨外周胆管周围间充质细胞身份的分子驱动因素及其在损伤情况下的变化 | 外周胆管周围间充质细胞（PMCs）及其在损伤情况下的变化 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-10-21 |
Molecular Insights From Multiomics Studies of Physical Activity
2024-02-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi23-0004
PMID:38241506
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研究论文 | 本文探讨了多组学技术在理解身体活动分子效应中的应用 | 利用多组学技术（包括代谢组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学、脂质组学、单细胞RNA测序和表观基因组学）系统地研究身体活动引起的分子变化 | NA | 探讨多组学技术如何提供关于身体活动系统效应的新见解 | 身体活动的分子效应及其在器官间的整合响应 | NA | NA | 多组学技术（代谢组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学、脂质组学、单细胞RNA测序、表观基因组学） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-10-21 |
Single-cell landscape identifies the immunophenotypes and microenvironments of HBV-positive and HBV-negative liver cancer
2024-02-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000364
PMID:38251896
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析HBV阳性和阴性肝癌的免疫表型和微环境 | 首次系统地比较了HBV阳性和阴性肝癌的肿瘤微环境，揭示了HBV感染对免疫治疗反应的影响 | 研究仅限于单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的数据或技术 | 深入理解HBV感染对肝细胞癌免疫微环境的影响，并设计更有效的免疫治疗策略 | HBV阳性和阴性肝细胞癌的肿瘤微环境和免疫表型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括HBV阳性和阴性肝细胞癌的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-10-19 |
Aneuploid embryonic stem cells drive teratoma metastasis
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45265-4
PMID:38316790
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研究论文 | 研究探讨了非整倍体胚胎干细胞驱动的畸胎瘤转移机制 | 首次证明了非整倍体胚胎干细胞衍生的畸胎瘤能够转移到多个器官，且不需要额外的拷贝数变异 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类癌症中验证 | 探索非整倍体在癌症转移中的因果关系 | 非整倍体和二倍体胚胎干细胞衍生的畸胎瘤 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胚胎干细胞及其衍生的畸胎瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-10-12 |
Macrophage profiling in atherosclerosis: understanding the unstable plaque
2024-02, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-01023-z
PMID:38244055
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的作用及其对斑块稳定性的影响 | 重新定义了传统的巨噬细胞模型，引入了基于深度无偏单细胞方法的多种免疫和非免疫细胞群 | NA | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的表型和功能特性，以及单细胞RNA测序研究在免疫学方面的进展 | 巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的作用及其对斑块稳定性的影响 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-10-09 |
Brief Report: Comprehensive Clinicogenomic Profiling of Small Cell Transformation From EGFR-Mutant NSCLC Informs Potential Therapeutic Targets
2024-Feb, JTO clinical and research reports
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jtocrr.2023.100623
PMID:38357092
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研究论文 | 本研究对EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者进行了临床和基因组特征的回顾性分析，并探讨了潜在的治疗靶点 | 首次对EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者进行了全面的临床基因组分析，并揭示了潜在的治疗靶点 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模研究来验证结果 | 探讨EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的临床和基因组特征，并寻找潜在的治疗靶点 | EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、临床数据 | 34例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-10-06 |
Multiomics identifies metabolic subtypes based on fatty acid degradation allocating personalized treatment in hepatocellular carcinoma
2024-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000553
PMID:37540187
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研究论文 | 本文通过多组学分析，基于脂肪酸降解途径对肝细胞癌进行分子分类，并评估其指导个性化治疗的能力 | 本文首次基于脂肪酸降解途径对肝细胞癌进行分子分类，并发现不同亚型对特定治疗的响应差异 | 本文的样本量较小，且主要基于已有的公开数据集进行分析，需要进一步的临床验证 | 开发基于脂肪酸降解途径的肝细胞癌分子分类，并评估其指导个性化治疗的能力 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、PCR阵列、脂质组学、代谢组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | 41名肝细胞癌患者，其中17名接受PD-1治疗 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-09-28 |
cnnImpute: missing value recovery for single cell RNA sequencing data
2024-02-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53998-x
PMID:38365936
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于卷积神经网络（CNN）的方法cnnImpute，用于恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 提出了cnnImpute，一种新颖的基于卷积神经网络的方法，用于解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | 未提及 | 开发一种有效的方法来恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络（CNN） | RNA测序数据 | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-09-20 |
A Large-Scale Meta-Analysis Reveals Positive Feedback between Macrophages and T Cells That Sensitizes Tumors to Immunotherapy
2024-02-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2006
PMID:38117502
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研究论文 | 本研究通过大规模的元分析揭示了巨噬细胞和T细胞之间的正反馈机制，增强了肿瘤对免疫治疗的敏感性 | 本研究发现了与ICI治疗结果相关的可靠标志物，包括肿瘤突变负荷、IFNG和PDCD1表达，以及巨噬细胞和T细胞之间的相互作用 | 本研究依赖于大规模的多组学数据，可能存在数据异质性和样本偏倚的问题 | 旨在通过大规模元分析发现预测免疫检查点抑制剂治疗反应的可靠生物标志物 | ICI治疗的3037名患者，涉及14种实体瘤的遗传和/或转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 多组学分析 | 多变量模型 | 遗传和转录组学数据 | 3037名ICI治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-09-20 |
scKWARN: Kernel-weighted-average robust normalization for single-cell RNA-seq data
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae008
PMID:38237908
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scKWARN的单细胞RNA-seq数据稳健归一化方法 | scKWARN通过核加权平均技术，不依赖于特定的数据分布或计数-深度关系，能够有效校正已知或隐藏的技术混杂因素 | NA | 开发一种新的单细胞RNA-seq数据归一化方法，以校正技术偏差并保留生物异质性 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 核加权平均 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-09-19 |
Single-cell and whole-transcriptome sequencing of lymph node metastasis-related gene signature: A large-scale pan-cancer cohort, machine learning and experimental study
2024-Feb-19, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001144
PMID:38385962
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研究论文 | 研究通过单细胞和全转录组测序，结合机器学习和实验方法，构建了一个基于淋巴结转移相关基因的评分模型，用于预测癌症患者的生存和药物敏感性 | 首次通过综合分析淋巴结转移相关基因，构建了一个新的评分模型，能够准确预测患者的生存和药物敏感性，并揭示了淋巴结转移的机制 | NA | 构建一个基于淋巴结转移相关基因的评分模型，用于预测癌症患者的生存和药物敏感性，并揭示淋巴结转移的机制 | 淋巴结转移相关基因、癌症患者的生存和药物敏感性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、全转录组测序、机器学习、Cox回归分析 | 评分模型 | 基因测序数据 | 33种癌症类型的数据，包括10,071例原发患者和5,036例测试患者 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-09-14 |
Forseti: A mechanistic and predictive model of the splicing status of scRNA-seq reads
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.01.577813
PMID:38370848
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研究论文 | 开发了一种名为Forseti的机械性和预测性模型，用于确定scRNA-seq读取的剪接状态 | 提出了Forseti模型，通过结合绑定亲和力模型和片段长度分布模型，能够概率性地分配scRNA-seq读取的剪接状态 | NA | 开发一种方法来恢复scRNA-seq数据中模糊读取的剪接状态，从而提高下游分析的准确性和置信度 | scRNA-seq数据中的剪接状态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 预测模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-09-14 |
Phenotype prediction from single-cell RNA-seq data using attention-based neural networks
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae067
PMID:38390963
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研究论文 | 本文提出了一种基于注意力机制神经网络的单细胞RNA测序数据表型预测方法ScRAT | ScRAT通过使用mixup模块增加训练样本数量，并采用多头注意力机制学习每个表型中最具信息量的细胞，无需依赖给定的细胞类型注释 | NA | 开发一种能够在有限样本数量下准确预测疾病表型的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞表型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 注意力机制神经网络 | 基因表达数据 | 三个公开的COVID数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-09-11 |
Reprogramming macrophage by targeting VEGF and CD40 potentiates OX40 immunotherapy
2024-02-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.149546
PMID:38266314
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研究论文 | 研究通过靶向VEGF和CD40重编程巨噬细胞，增强OX40免疫疗法的抗肿瘤效果 | 首次分析了抗OX40治疗对巨噬细胞的抗肿瘤作用，并发现VEGF和CD40信号通路的动态变化，提出这些可能是提高抗OX40激动剂疗效的潜在联合靶点 | 研究仅限于体外实验和细胞水平的分析，尚未进行临床试验验证 | 探索提高OX40免疫疗法抗肿瘤疗效的机制和策略 | 肿瘤浸润免疫细胞、巨噬细胞、VEGF和CD40信号通路 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的肿瘤浸润免疫细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-09-01 |
Variable expression of MECP2, CDKL5, and FMR1 in the human brain: Implications for gene restorative therapies
2024-Feb-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2312757121
PMID:38386709
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研究论文 | 本文通过元分析单细胞转录组学数据，研究了MECP2、CDKL5和FMR1基因在人脑中的表达变异性，并探讨了这些变异性对基因修复疗法的潜在影响 | 首次系统地分析了MECP2、CDKL5和FMR1基因在人脑不同发育阶段、不同脑区和多个供体中的表达变异性，为基因修复疗法提供了新的治疗窗口和潜在的生物标志物 | 文章中提到的基因疗法、基因编辑和选择性Xi激活方法在脑组织渗透和整体递送方面仍面临挑战 | 探讨MECP2、CDKL5和FMR1基因在人脑中的表达变异性，以及这些变异性对基因修复疗法的影响 | MECP2、CDKL5和FMR1基因在人脑中的表达变异性 | 神经发育 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个供体和多个脑区的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-29 |
Highly Accurate Estimation of Cell Type Abundance in Bulk Tissues Based on Single-Cell Reference and Domain Adaptive Matching
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306329
PMID:38072669
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCROAM的新型计算方法，用于基于单细胞参考和域自适应匹配，准确估计大量组织中的细胞类型丰度 | SCROAM方法通过将单细胞和大量RNA测序数据转换到共享特征空间，有效消除了潜在空间中的分布差异，从而提高了细胞类型识别的准确性 | NA | 旨在提高对复杂组织细胞组成的识别准确性，以更好地理解疾病发病机制、早期诊断和预防 | 单细胞和大量RNA测序数据，以及小鼠脊髓组织 | 数字病理学 | 肝癌，胶质母细胞瘤 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及小鼠脊髓组织和多种癌症组织 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-29 |
Targeting YAP1-regulated Glycolysis in Fibroblast-Like Synoviocytes Impairs Macrophage Infiltration to Ameliorate Diabetic Osteoarthritis Progression
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304617
PMID:38044289
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨糖尿病性骨关节炎中滑膜细胞的组成，发现纤维母细胞样滑膜细胞中YAP1调控的糖酵解增加是导致滑膜巨噬细胞浸润和极化的关键因素，并开发了一种新型纳米粒子治疗策略。 | 首次揭示YAP1/TXNIP信号轴在纤维母细胞样滑膜细胞中调控糖酵解的作用，并开发了一种针对糖尿病性骨关节炎的新型治疗策略。 | NA | 探讨糖尿病性骨关节炎中免疫细胞与纤维母细胞样滑膜细胞的相互作用及其在疾病进展中的作用。 | 糖尿病性骨关节炎患者的滑膜细胞及纤维母细胞样滑膜细胞。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及糖尿病性骨关节炎患者的滑膜细胞及db/db糖尿病骨关节炎小鼠模型。 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-08-29 |
Pan-Cancer Single-Nucleus Total RNA Sequencing Using snHH-Seq
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304755
PMID:38010945
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研究论文 | 本文开发了一种名为snHH-seq的高通量和高灵敏度方法，用于对临床冷冻样本中的单个细胞核进行总RNA测序，并应用于多种肿瘤类型的研究。 | snHH-seq方法结合了随机引物和预索引策略，能够在单个细胞核水平上检测总RNA，为肿瘤异质性研究提供了新的工具。 | NA | 研究肿瘤异质性及其对肿瘤进展和癌症治疗的影响。 | 单个细胞核中的总RNA。 | 数字病理学 | 多种肿瘤类型 | snHH-seq | NA | RNA序列数据 | 超过730,000个单个细胞核，来自32名不同肿瘤类型的患者 | NA | NA | NA | NA |