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当前共找到 444 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-10-28 |
Spatial Transcriptomics Suggests That Alterations Occur in the Preneoplastic Breast Microenvironment of BRCA1/2 Mutation Carriers
2024-02-01, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-23-0489
PMID:37878345
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研究论文 | 本文利用空间转录组学研究了BRCA1/2突变携带者癌前乳腺微环境中的缺陷和微环境变化 | 首次揭示了BRCA1/2突变携带者癌前乳腺组织中空间定义的受体-配体相互作用，并发现了β1-整合素介导的自分泌信号在BRCA2缺陷乳腺上皮细胞中与BRCA1缺陷细胞的差异 | NA | 研究BRCA1/2突变携带者癌前乳腺微环境中的缺陷和微环境变化 | BRCA1/2突变携带者和非携带者的癌前乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | BRCA1/2突变携带者和非携带者的癌前乳腺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-10-28 |
Resolving the heterogeneous tumour microenvironment in cardiac myxoma through single-cell and spatial transcriptomics
2024-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1581
PMID:38318640
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学技术解析心脏粘液瘤的异质性肿瘤微环境 | 首次在单细胞和空间分辨率上全面表征心脏粘液瘤的肿瘤微环境，揭示了粘液瘤肿瘤细胞的分化机制和免疫微环境的特征 | NA | 解析心脏粘液瘤的肿瘤微环境，为开发针对不适合手术患者的新疗法提供依据 | 心脏粘液瘤患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞转录组测序和Visium CytAssist空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 34759个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-10-28 |
Sulfotransferase SULT2B1 facilitates colon cancer metastasis by promoting SCD1-mediated lipid metabolism
2024-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1587
PMID:38372484
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研究论文 | 本文研究了硫转移酶SULT2B1在结肠癌转移中的作用及其机制 | 首次揭示了SULT2B1作为结肠癌转移的新型肿瘤标志物，并阐明了其通过促进SCD1介导的脂质代谢促进结肠癌转移的机制 | NA | 探讨硫转移酶SULT2B1在结肠癌转移中的作用及其机制 | 结肠癌细胞及其转移机制 | NA | 结肠癌 | 单细胞测序和蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-10-28 |
FAVA: high-quality functional association networks inferred from scRNA-seq and proteomics data
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae010
PMID:38192003
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FAVA的新方法，用于从单细胞RNA测序和蛋白质组学数据中推断高质量的功能关联网络 | FAVA利用变分自编码器将高维数据压缩到低维空间，从而提高了从高维组学数据中推断网络的准确性 | NA | 开发一种新的方法来推断蛋白质功能关联网络，特别是针对研究较少的蛋白质 | 单细胞RNA测序和蛋白质组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | 变分自编码器 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 超过0.5百万个条件，预测了1039个研究较少的蛋白质之间的4210个相互作用 | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-10-28 |
Identifying squalene epoxidase as a metabolic vulnerability in high-risk osteosarcoma using an artificial intelligence-derived prognostic index
2024-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1586
PMID:38372422
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研究论文 | 本研究通过结合10种机器学习算法，建立了一个基于转录组数据预测骨肉瘤患者总体生存率的模型，并发现角鲨烯环氧化酶（SQLE）作为高风险骨肉瘤患者的代谢脆弱点 | 本研究首次将人工智能衍生的预后指数（AIDPI）应用于骨肉瘤患者的分层，并验证了SQLE作为潜在治疗靶点的有效性 | 本研究主要基于转录组数据，未涵盖所有可能的生物标志物和治疗靶点 | 识别新的生物标志物以分层高风险骨肉瘤患者并指导治疗 | 骨肉瘤患者及其转录组、基因组和表观基因组数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 转录组数据 | 254个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-10-28 |
Redefining Mucosal Inflammation with Spatial Genomics
2024-02, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231216114
PMID:38166489
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研究论文 | 本文讨论了空间基因组学技术在重新定义黏膜炎症中的作用 | 引入空间转录组学方法，避免了组织样本的解离，保留了细胞间的空间关系 | 讨论了空间测序技术的局限性和未来发展方向 | 探讨空间技术如何帮助我们更好地理解复杂的黏膜系统 | 人类口腔黏膜及其在健康和疾病中的分子和细胞特征 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-10-27 |
The implication of integrative multiple RNA modification-based subtypes in gastric cancer immunotherapy and prognosis
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108897
PMID:38318382
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研究论文 | 本研究全面探讨了多种RNA修饰对胃癌的影响，并开发了一种预测模型来评估其对免疫治疗和预后的影响 | 首次综合研究多种RNA修饰对胃癌的影响，并开发了基于Stepwise Regression和Random Survival Forest算法的预测模型 | NA | 探讨多种RNA修饰对胃癌免疫治疗和预后的影响 | 胃癌样本中的多种RNA修饰 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据 | 1,946个胃癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-10-27 |
Genetically inspired organoids prevent joint degeneration and alleviate chondrocyte senescence via Col11a1-HIF1α-mediated glycolysis-OXPHOS metabolism shift
2024-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1574
PMID:38314968
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研究论文 | 研究报告了COL11A1基因与髋关节发育不良（DDH）的关联，并通过基因工程器官模型预防关节退化和减轻软骨细胞衰老 | 首次报道了COL11A1基因与DDH的关联，并开发了一种基于COL11A1过表达的器官模型用于预防关节退化和减轻软骨细胞衰老 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中进行验证 | 探索COL11A1基因在髋关节发育不良和关节退化中的作用，并开发新的治疗方法 | 髋关节发育不良患者、Col11a1基因敲除小鼠、软骨细胞 | 生物医学 | 骨关节疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、外显子测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据、单细胞RNA测序数据 | 不同人群的家族性DDH患者、Col11a1基因敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-10-21 |
Downregulation of N4-acetylcytidine modification in myeloid cells attenuates immunotherapy and exacerbates hepatocellular carcinoma progression
2024-02, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02510-9
PMID:38040817
|
研究论文 | 研究了N4-乙酰胞苷修饰在髓系细胞中下调对肝细胞癌进展和免疫治疗的影响 | 首次探讨了N4-乙酰胞苷修饰在肝细胞癌发展和免疫治疗中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人体中验证 | 探讨N4-乙酰胞苷修饰在肝细胞癌发展和免疫治疗中的作用 | 髓系细胞和肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、RNA测序、RNA免疫沉淀测序、酪胺信号放大分析 | NA | RNA | 小鼠模型和肝细胞癌患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-10-21 |
Modulation of canonical Wnt signaling regulates peribiliary mesenchymal identity during homeostasis and injury
2024-02-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000368
PMID:38251878
|
研究论文 | 研究了Wnt信号通路在调节外周胆管周围间充质细胞身份中的作用，特别是在稳态和损伤情况下的变化 | 首次采用完全体内方法结合转录组分析，揭示了Wnt4、Wnt5a和Wnt7b在调节外周胆管周围间充质细胞身份中的关键作用 | 研究主要集中在体内实验，未涉及体外实验验证 | 探讨外周胆管周围间充质细胞身份的分子驱动因素及其在损伤情况下的变化 | 外周胆管周围间充质细胞（PMCs）及其在损伤情况下的变化 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-10-21 |
Molecular Insights From Multiomics Studies of Physical Activity
2024-02-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi23-0004
PMID:38241506
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研究论文 | 本文探讨了多组学技术在理解身体活动分子效应中的应用 | 利用多组学技术（包括代谢组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学、脂质组学、单细胞RNA测序和表观基因组学）系统地研究身体活动引起的分子变化 | NA | 探讨多组学技术如何提供关于身体活动系统效应的新见解 | 身体活动的分子效应及其在器官间的整合响应 | NA | NA | 多组学技术（代谢组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学、脂质组学、单细胞RNA测序、表观基因组学） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-10-21 |
Single-cell landscape identifies the immunophenotypes and microenvironments of HBV-positive and HBV-negative liver cancer
2024-02-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000364
PMID:38251896
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析HBV阳性和阴性肝癌的免疫表型和微环境 | 首次系统地比较了HBV阳性和阴性肝癌的肿瘤微环境，揭示了HBV感染对免疫治疗反应的影响 | 研究仅限于单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的数据或技术 | 深入理解HBV感染对肝细胞癌免疫微环境的影响，并设计更有效的免疫治疗策略 | HBV阳性和阴性肝细胞癌的肿瘤微环境和免疫表型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括HBV阳性和阴性肝细胞癌的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-10-19 |
Aneuploid embryonic stem cells drive teratoma metastasis
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45265-4
PMID:38316790
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研究论文 | 研究探讨了非整倍体胚胎干细胞驱动的畸胎瘤转移机制 | 首次证明了非整倍体胚胎干细胞衍生的畸胎瘤能够转移到多个器官，且不需要额外的拷贝数变异 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类癌症中验证 | 探索非整倍体在癌症转移中的因果关系 | 非整倍体和二倍体胚胎干细胞衍生的畸胎瘤 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胚胎干细胞及其衍生的畸胎瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-10-12 |
Macrophage profiling in atherosclerosis: understanding the unstable plaque
2024-02, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-01023-z
PMID:38244055
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的作用及其对斑块稳定性的影响 | 重新定义了传统的巨噬细胞模型，引入了基于深度无偏单细胞方法的多种免疫和非免疫细胞群 | NA | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的表型和功能特性，以及单细胞RNA测序研究在免疫学方面的进展 | 巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的作用及其对斑块稳定性的影响 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-10-09 |
Brief Report: Comprehensive Clinicogenomic Profiling of Small Cell Transformation From EGFR-Mutant NSCLC Informs Potential Therapeutic Targets
2024-Feb, JTO clinical and research reports
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jtocrr.2023.100623
PMID:38357092
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研究论文 | 本研究对EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者进行了临床和基因组特征的回顾性分析，并探讨了潜在的治疗靶点 | 首次对EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者进行了全面的临床基因组分析，并揭示了潜在的治疗靶点 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模研究来验证结果 | 探讨EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的临床和基因组特征，并寻找潜在的治疗靶点 | EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、临床数据 | 34例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-10-06 |
Multiomics identifies metabolic subtypes based on fatty acid degradation allocating personalized treatment in hepatocellular carcinoma
2024-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000553
PMID:37540187
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研究论文 | 本文通过多组学分析，基于脂肪酸降解途径对肝细胞癌进行分子分类，并评估其指导个性化治疗的能力 | 本文首次基于脂肪酸降解途径对肝细胞癌进行分子分类，并发现不同亚型对特定治疗的响应差异 | 本文的样本量较小，且主要基于已有的公开数据集进行分析，需要进一步的临床验证 | 开发基于脂肪酸降解途径的肝细胞癌分子分类，并评估其指导个性化治疗的能力 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、PCR阵列、脂质组学、代谢组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | 41名肝细胞癌患者，其中17名接受PD-1治疗 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-09-28 |
cnnImpute: missing value recovery for single cell RNA sequencing data
2024-02-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53998-x
PMID:38365936
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于卷积神经网络（CNN）的方法cnnImpute，用于恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 提出了cnnImpute，一种新颖的基于卷积神经网络的方法，用于解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | 未提及 | 开发一种有效的方法来恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络（CNN） | RNA测序数据 | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-09-20 |
A Large-Scale Meta-Analysis Reveals Positive Feedback between Macrophages and T Cells That Sensitizes Tumors to Immunotherapy
2024-02-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2006
PMID:38117502
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研究论文 | 本研究通过大规模的元分析揭示了巨噬细胞和T细胞之间的正反馈机制，增强了肿瘤对免疫治疗的敏感性 | 本研究发现了与ICI治疗结果相关的可靠标志物，包括肿瘤突变负荷、IFNG和PDCD1表达，以及巨噬细胞和T细胞之间的相互作用 | 本研究依赖于大规模的多组学数据，可能存在数据异质性和样本偏倚的问题 | 旨在通过大规模元分析发现预测免疫检查点抑制剂治疗反应的可靠生物标志物 | ICI治疗的3037名患者，涉及14种实体瘤的遗传和/或转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 多组学分析 | 多变量模型 | 遗传和转录组学数据 | 3037名ICI治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-09-20 |
scKWARN: Kernel-weighted-average robust normalization for single-cell RNA-seq data
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae008
PMID:38237908
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scKWARN的单细胞RNA-seq数据稳健归一化方法 | scKWARN通过核加权平均技术，不依赖于特定的数据分布或计数-深度关系，能够有效校正已知或隐藏的技术混杂因素 | NA | 开发一种新的单细胞RNA-seq数据归一化方法，以校正技术偏差并保留生物异质性 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 核加权平均 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-09-19 |
Single-cell and whole-transcriptome sequencing of lymph node metastasis-related gene signature: A large-scale pan-cancer cohort, machine learning and experimental study
2024-Feb-19, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001144
PMID:38385962
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研究论文 | 研究通过单细胞和全转录组测序，结合机器学习和实验方法，构建了一个基于淋巴结转移相关基因的评分模型，用于预测癌症患者的生存和药物敏感性 | 首次通过综合分析淋巴结转移相关基因，构建了一个新的评分模型，能够准确预测患者的生存和药物敏感性，并揭示了淋巴结转移的机制 | NA | 构建一个基于淋巴结转移相关基因的评分模型，用于预测癌症患者的生存和药物敏感性，并揭示淋巴结转移的机制 | 淋巴结转移相关基因、癌症患者的生存和药物敏感性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、全转录组测序、机器学习、Cox回归分析 | 评分模型 | 基因测序数据 | 33种癌症类型的数据，包括10,071例原发患者和5,036例测试患者 | NA | NA | NA | NA |