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当前共找到 444 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-11-09 |
Pan-cancer scRNA-seq analysis reveals immunological and diagnostic significance of the peripheral blood mononuclear cells
2024-02-01, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddad187
PMID:37944069
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了癌症患者和健康供者外周血单核细胞的组成和状态差异，并探讨了这些特征在癌症诊断中的潜力 | 首次系统性地分析了癌症患者外周血单核细胞的免疫激活和分化状态，并基于这些特征构建了高敏感性的癌症诊断模型 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定类型的癌症和健康对照 | 探讨外周血单核细胞在癌症进展中的免疫反应及其在癌症诊断中的应用潜力 | 癌症患者和健康供者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归 | RNA | 262,025个外周血单核细胞，来自68个癌症样本和14个健康样本 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-11-07 |
Impacts of cryopreservation on phenotype and functionality of mononuclear cells in peripheral blood and ascites
2024-Feb, Journal of translational internal medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.2478/jtim-2023-0136
PMID:38525442
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研究论文 | 研究了不同冷冻保存时间和额外冷冻-解冻循环对血液和腹水中单核细胞数量和功能的影响 | 首次探讨了不同冷冻保存条件对单核细胞亚型耐受性的影响 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 探讨冷冻保存对单核细胞表型和功能的影响 | 血液和腹水中的单核细胞 | NA | 卵巢癌 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 细胞 | 21份血液样本和8份腹水样本 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-11-04 |
High-Resolution Spatial Transcriptomic Atlas of Mouse Soleus Muscle: Unveiling Single Cell and Subcellular Heterogeneity in Health and Denervation
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582103
PMID:38464282
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研究论文 | 本研究利用Seq-Scope技术，构建了小鼠比目鱼肌的高分辨率空间转录组图谱，揭示了健康和去神经化状态下肌肉细胞和亚细胞的异质性 | 本研究首次在亚微米空间分辨率下观察整个转录组，揭示了肌肉纤维、其他细胞类型和特定亚细胞结构的详细特征 | NA | 深入理解肌肉细胞转录组的多样性及其在去神经化反应中的变化 | 小鼠比目鱼肌在健康和去神经化状态下的基因表达 | 数字病理学 | NA | Seq-Scope | NA | 基因表达数据 | 小鼠比目鱼肌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-11-02 |
Deciphering Endothelial and Mesenchymal Organ Specification in Vascularized Lung and Intestinal Organoids
2024-Feb-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.06.577460
PMID:38370768
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研究论文 | 研究构建了包含肺或肠上皮、器官型间质和血管的人多能干细胞衍生的类器官系统，以研究血管、间质和上皮在器官发生中的协同发育 | 通过精确的BMP调控实现中胚层和内胚层的共分化，生成多谱系类器官和肠道管模式；单细胞RNA测序揭示了内皮和间质的器官特异性，并发现了驱动肺和肠内皮特化的关键配体 | NA | 研究血管、间质和上皮在器官发生中的协同发育及其在器官特化中的作用 | 人多能干细胞衍生的肺和肠类器官系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-10-29 |
A comparison of marker gene selection methods for single-cell RNA sequencing data
2024-02-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03183-0
PMID:38409056
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研究论文 | 本文比较了59种用于单细胞RNA测序数据中标记基因选择的计算方法 | 首次全面评估了多种标记基因选择方法在单细胞RNA测序数据中的表现 | 仅限于单细胞RNA测序数据，未涵盖其他类型的基因表达数据 | 评估和比较不同标记基因选择方法在单细胞RNA测序数据中的性能 | 单细胞RNA测序数据中的标记基因选择方法 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14个真实数据集和超过170个模拟数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-10-28 |
Single-cell and spatial multi-omics highlight effects of anti-integrin therapy across cellular compartments in ulcerative colitis
2024-Feb-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45665-6
PMID:38374043
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研究论文 | 研究探讨了抗整合素疗法在溃疡性结肠炎中对不同细胞区室的影响 | 通过单细胞转录组和蛋白质组学分析，揭示了抗整合素疗法对单核吞噬细胞和淋巴细胞亚群的影响 | 研究主要集中在单细胞和空间多组学分析，未涉及其他治疗方法的比较 | 识别溃疡性结肠炎中促炎细胞并评估抗整合素疗法的效果 | 溃疡性结肠炎患者的外周血和结肠活检样本 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞转录组学和蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据和蛋白质数据 | 健康对照组和接受抗整合素疗法或其他疗法的溃疡性结肠炎患者 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-10-28 |
MarkerMap: nonlinear marker selection for single-cell studies
2024-Feb-14, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00339-3
PMID:38351188
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研究论文 | 介绍了一种名为MarkerMap的生成模型，用于单细胞研究中的非线性标记选择 | 提出了MarkerMap模型，能够选择最小但最具信息量的基因集，用于细胞类型起源的识别和全转录组重构 | 未提及 | 开发一种可扩展的框架，用于监督和非监督标记选择，以提高单细胞研究的解释性 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成模型 | 基因表达数据 | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-10-28 |
Single-cell RNA sequencing of mid-to-late stage spider embryos: new insights into spider development
2024-Feb-07, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09898-x
PMID:38326752
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了中晚期蜘蛛胚胎的发育过程 | 首次对中晚期蜘蛛胚胎进行单细胞RNA测序，提供了对蜘蛛发育不同阶段的深入见解 | 仅限于对Parasteatoda tepidariorum蜘蛛的研究，未涉及其他物种 | 探讨蜘蛛中晚期胚胎的发育过程及其细胞类型和组织的分化 | Parasteatoda tepidariorum蜘蛛的中晚期胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 中晚期蜘蛛胚胎的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-10-28 |
High-throughput identification of the spatial origins of Drosophila optic lobe neurons using single-cell mRNA-sequencing
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.05.578975
PMID:38370610
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研究论文 | 本文通过单细胞mRNA测序技术，识别了果蝇视叶神经元的空间起源 | 本文首次通过单细胞mRNA测序技术，高吞吐量地确定了所有视叶神经元的空间起源，并发现了OPC的两个新空间亚区 | 本文主要集中在视叶神经元的空间起源研究，未涉及其他发育阶段或机制的详细探讨 | 研究果蝇视叶神经元的空间起源及其在发育过程中的基因表达影响 | 果蝇视叶神经元的空间起源及其基因表达 | NA | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自不同OPC空间域的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-10-28 |
Spatial Transcriptomics Suggests That Alterations Occur in the Preneoplastic Breast Microenvironment of BRCA1/2 Mutation Carriers
2024-02-01, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-23-0489
PMID:37878345
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研究论文 | 本文利用空间转录组学研究了BRCA1/2突变携带者癌前乳腺微环境中的缺陷和微环境变化 | 首次揭示了BRCA1/2突变携带者癌前乳腺组织中空间定义的受体-配体相互作用，并发现了β1-整合素介导的自分泌信号在BRCA2缺陷乳腺上皮细胞中与BRCA1缺陷细胞的差异 | NA | 研究BRCA1/2突变携带者癌前乳腺微环境中的缺陷和微环境变化 | BRCA1/2突变携带者和非携带者的癌前乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | BRCA1/2突变携带者和非携带者的癌前乳腺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-10-28 |
Resolving the heterogeneous tumour microenvironment in cardiac myxoma through single-cell and spatial transcriptomics
2024-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1581
PMID:38318640
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学技术解析心脏粘液瘤的异质性肿瘤微环境 | 首次在单细胞和空间分辨率上全面表征心脏粘液瘤的肿瘤微环境，揭示了粘液瘤肿瘤细胞的分化机制和免疫微环境的特征 | NA | 解析心脏粘液瘤的肿瘤微环境，为开发针对不适合手术患者的新疗法提供依据 | 心脏粘液瘤患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞转录组测序和Visium CytAssist空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 34759个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-10-28 |
Sulfotransferase SULT2B1 facilitates colon cancer metastasis by promoting SCD1-mediated lipid metabolism
2024-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1587
PMID:38372484
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研究论文 | 本文研究了硫转移酶SULT2B1在结肠癌转移中的作用及其机制 | 首次揭示了SULT2B1作为结肠癌转移的新型肿瘤标志物，并阐明了其通过促进SCD1介导的脂质代谢促进结肠癌转移的机制 | NA | 探讨硫转移酶SULT2B1在结肠癌转移中的作用及其机制 | 结肠癌细胞及其转移机制 | NA | 结肠癌 | 单细胞测序和蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-10-28 |
FAVA: high-quality functional association networks inferred from scRNA-seq and proteomics data
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae010
PMID:38192003
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FAVA的新方法，用于从单细胞RNA测序和蛋白质组学数据中推断高质量的功能关联网络 | FAVA利用变分自编码器将高维数据压缩到低维空间，从而提高了从高维组学数据中推断网络的准确性 | NA | 开发一种新的方法来推断蛋白质功能关联网络，特别是针对研究较少的蛋白质 | 单细胞RNA测序和蛋白质组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | 变分自编码器 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 超过0.5百万个条件，预测了1039个研究较少的蛋白质之间的4210个相互作用 | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-10-28 |
Identifying squalene epoxidase as a metabolic vulnerability in high-risk osteosarcoma using an artificial intelligence-derived prognostic index
2024-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1586
PMID:38372422
|
研究论文 | 本研究通过结合10种机器学习算法，建立了一个基于转录组数据预测骨肉瘤患者总体生存率的模型，并发现角鲨烯环氧化酶（SQLE）作为高风险骨肉瘤患者的代谢脆弱点 | 本研究首次将人工智能衍生的预后指数（AIDPI）应用于骨肉瘤患者的分层，并验证了SQLE作为潜在治疗靶点的有效性 | 本研究主要基于转录组数据，未涵盖所有可能的生物标志物和治疗靶点 | 识别新的生物标志物以分层高风险骨肉瘤患者并指导治疗 | 骨肉瘤患者及其转录组、基因组和表观基因组数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 转录组数据 | 254个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-10-28 |
Redefining Mucosal Inflammation with Spatial Genomics
2024-02, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231216114
PMID:38166489
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研究论文 | 本文讨论了空间基因组学技术在重新定义黏膜炎症中的作用 | 引入空间转录组学方法，避免了组织样本的解离，保留了细胞间的空间关系 | 讨论了空间测序技术的局限性和未来发展方向 | 探讨空间技术如何帮助我们更好地理解复杂的黏膜系统 | 人类口腔黏膜及其在健康和疾病中的分子和细胞特征 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-10-27 |
The implication of integrative multiple RNA modification-based subtypes in gastric cancer immunotherapy and prognosis
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108897
PMID:38318382
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研究论文 | 本研究全面探讨了多种RNA修饰对胃癌的影响，并开发了一种预测模型来评估其对免疫治疗和预后的影响 | 首次综合研究多种RNA修饰对胃癌的影响，并开发了基于Stepwise Regression和Random Survival Forest算法的预测模型 | NA | 探讨多种RNA修饰对胃癌免疫治疗和预后的影响 | 胃癌样本中的多种RNA修饰 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据 | 1,946个胃癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-10-27 |
Genetically inspired organoids prevent joint degeneration and alleviate chondrocyte senescence via Col11a1-HIF1α-mediated glycolysis-OXPHOS metabolism shift
2024-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1574
PMID:38314968
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研究论文 | 研究报告了COL11A1基因与髋关节发育不良（DDH）的关联，并通过基因工程器官模型预防关节退化和减轻软骨细胞衰老 | 首次报道了COL11A1基因与DDH的关联，并开发了一种基于COL11A1过表达的器官模型用于预防关节退化和减轻软骨细胞衰老 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中进行验证 | 探索COL11A1基因在髋关节发育不良和关节退化中的作用，并开发新的治疗方法 | 髋关节发育不良患者、Col11a1基因敲除小鼠、软骨细胞 | 生物医学 | 骨关节疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、外显子测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据、单细胞RNA测序数据 | 不同人群的家族性DDH患者、Col11a1基因敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-10-21 |
Downregulation of N4-acetylcytidine modification in myeloid cells attenuates immunotherapy and exacerbates hepatocellular carcinoma progression
2024-02, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02510-9
PMID:38040817
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研究论文 | 研究了N4-乙酰胞苷修饰在髓系细胞中下调对肝细胞癌进展和免疫治疗的影响 | 首次探讨了N4-乙酰胞苷修饰在肝细胞癌发展和免疫治疗中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人体中验证 | 探讨N4-乙酰胞苷修饰在肝细胞癌发展和免疫治疗中的作用 | 髓系细胞和肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、RNA测序、RNA免疫沉淀测序、酪胺信号放大分析 | NA | RNA | 小鼠模型和肝细胞癌患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-10-21 |
Modulation of canonical Wnt signaling regulates peribiliary mesenchymal identity during homeostasis and injury
2024-02-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000368
PMID:38251878
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研究论文 | 研究了Wnt信号通路在调节外周胆管周围间充质细胞身份中的作用，特别是在稳态和损伤情况下的变化 | 首次采用完全体内方法结合转录组分析，揭示了Wnt4、Wnt5a和Wnt7b在调节外周胆管周围间充质细胞身份中的关键作用 | 研究主要集中在体内实验，未涉及体外实验验证 | 探讨外周胆管周围间充质细胞身份的分子驱动因素及其在损伤情况下的变化 | 外周胆管周围间充质细胞（PMCs）及其在损伤情况下的变化 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-10-21 |
Molecular Insights From Multiomics Studies of Physical Activity
2024-02-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi23-0004
PMID:38241506
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研究论文 | 本文探讨了多组学技术在理解身体活动分子效应中的应用 | 利用多组学技术（包括代谢组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学、脂质组学、单细胞RNA测序和表观基因组学）系统地研究身体活动引起的分子变化 | NA | 探讨多组学技术如何提供关于身体活动系统效应的新见解 | 身体活动的分子效应及其在器官间的整合响应 | NA | NA | 多组学技术（代谢组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学、脂质组学、单细胞RNA测序、表观基因组学） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |