单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 444 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 121 | 2025-10-07 |
Stem-like progenitor and terminally differentiated TFH-like CD4+ T cell exhaustion in the tumor microenvironment
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113797
PMID:38363680
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和小鼠模型揭示了肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞耗竭的分化特征及其抗肿瘤免疫机制 | 首次发现肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞存在干细胞样祖细胞和终末分化的细胞毒性亚群，并阐明其与CD8+ T细胞耗竭模式的相似性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚需进一步研究 | 探究肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞的耗竭特征及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肿瘤浸润性CD4+ T细胞和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2025-10-07 |
Endocardium gives rise to blood cells in zebrafish embryos
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113736
PMID:38308842
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼胚胎模型证实心内膜能够产生血细胞 | 首次在斑马鱼胚胎中通过实时成像和谱系追踪证实心内膜来源的髓系细胞生成 | 研究仅针对斑马鱼胚胎模型，在哺乳动物中的保守性需要进一步验证 | 探究心内膜在造血过程中的贡献 | 斑马鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,实时成像,谱系追踪,表达分析 | NA | 基因表达数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal role of SETD2-H3K36me3 in murine pancreatic organogenesis
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113703
PMID:38265933
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术揭示了SETD2-H3K36me3在小鼠胰腺器官发生中的时空调控作用 | 首次系统阐明SETD2介导的H3K36me3修饰在胰腺发育过程中的动态变化及其对内外分泌谱系分化的调控机制 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人类胰腺发育中验证 | 探究组蛋白修饰H3K36me3在胰腺器官发生中的调控作用 | 小鼠胚胎胰腺发育过程 | 表观遗传学 | 胰腺疾病 | CUT&Tag, ATAC-seq, bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据，转录组数据，表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，染色质可及性测序，靶向切割标记技术 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-07 |
The single-cell transcriptome program of nodule development cellular lineages in Medicago truncatula
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113747
PMID:38329875
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了蒺藜苜蓿根瘤发育过程中细胞谱系的转录重编程机制 | 首次在蒺藜苜蓿中构建了根瘤发育的单细胞转录组图谱，鉴定了参与共生响应的表皮根毛和中柱亚细胞类型，并发现新的根瘤形成调控因子STYLISH 4 | 研究主要关注早期根瘤发育阶段，对成熟根瘤的功能研究相对有限 | 解析豆科植物与根瘤菌共生过程中根瘤发育的细胞类型特异性转录调控网络 | 蒺藜苜蓿野生型Jemalong A17及其超结瘤突变体sunn-4的根组织细胞 | 植物单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断，基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 野生型和突变体苜蓿根组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of cervical exfoliated cells reveals potential biomarkers and cellular pathogenesis in cervical carcinogenesis
2024-02-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06522-y
PMID:38346944
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈脱落细胞，揭示宫颈癌发生过程中的潜在生物标志物和细胞发病机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘宫颈癌发生过程中免疫细胞和上皮细胞的动态变化，鉴定出脂质相关巨噬细胞作为预测LSIL向HSIL进展的生物标志物 | 样本量相对有限（15个样本），需要在更大队列中验证研究结果 | 探索宫颈癌发生过程中的细胞异质性和潜在生物标志物 | 宫颈脱落细胞 | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 15个样本（包含正常宫颈、LSIL、HSIL和恶性肿瘤），56,173个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-07 |
Pro-inflammatory feedback loops define immune responses to pathogenic Lentivirus infection
2024-02-05, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01290-y
PMID:38317183
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示致病性慢病毒感染引发促炎反馈环路导致疾病进展的免疫机制 | 利用遗传相似但毒力不同的SIV变异株感染模型，结合纵向单细胞转录组和细胞通讯分析，首次发现致病性慢病毒通过逃逸干扰素应答并激活CXCL10/CXCL16驱动的促炎放大环路 | 研究局限于猪尾猕猴模型，未在人类HIV感染中直接验证 | 揭示慢病毒致病性差异的免疫学基础 | 感染不同毒力SIV变异株的猪尾猕猴免疫细胞 | 免疫学 | 艾滋病 | 单细胞转录组测序，细胞间通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 猪尾猕猴感染队列的纵向样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2025-01-04 |
Deciphering the heterogeneity of neutrophil cells within circulation and the lung cancer microenvironment pre- and post-operation
2024-02-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09850-z
PMID:38319415
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了非小细胞肺癌患者手术前后血液和肿瘤组织中的中性粒细胞亚群的分布，并开发了一种过表达率（OER）计算方法来评估中性粒细胞亚群的特异性 | 开发了过表达率（OER）计算方法，用于评估中性粒细胞亚群的特异性，并识别出具有潜在临床应用价值的基因组合 | 研究样本量有限，且仅针对非小细胞肺癌患者，未涵盖其他类型的癌症 | 评估非小细胞肺癌患者手术前后中性粒细胞亚群的分布及其特异性，以帮助诊断和预后评估 | 非小细胞肺癌患者手术前后的血液和肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤和癌旁组织、手术前后血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-12-28 |
A New Graph Autoencoder-Based Consensus-Guided Model for scRNA-seq Cell Type Detection
2024-02, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2022.3190289
PMID:35857730
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研究论文 | 本文提出了一种基于图自编码器的共识引导模型（scGAC），用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）中的细胞类型检测 | 提出了一种新的基于图自编码器（GAE）的共识引导模型（scGAC），通过迭代学习相似性矩阵来整合最终的一致性相似性矩阵，从而提高细胞类型识别的准确性 | 未提及具体的数据集或实验结果的局限性 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图自编码器（GAE） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-12-24 |
PD-L1 regulates inflammatory programs of macrophages from human pluripotent stem cells
2024-02, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302461
PMID:37949473
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研究论文 | 本文研究了PD-L1在人类多能干细胞衍生的巨噬细胞中的炎症调控作用 | 首次揭示了PD-L1在人类多能干细胞衍生的巨噬细胞中调控炎症程序的作用 | 实验中使用的PD-L1 KO细胞系和抑制剂的具体细节未在摘要中明确说明 | 探讨PD-L1在巨噬细胞发育和炎症调控中的作用 | 人类多能干细胞衍生的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | PD-L1 KO人类多能干细胞及其衍生的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-12-18 |
Single-cell RNA-seq reveals the metabolic status of immune cells response to immunotherapy in triple-negative breast cancer
2024-02, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.107926
PMID:38183706
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了三阴性乳腺癌中免疫细胞对免疫检查点阻断疗法的代谢状态及其与治疗反应的关系 | 本研究开发了一种分析流程，揭示了与免疫检查点阻断疗法结果相关的代谢异质性，并识别了非应答者富集的代谢亚亚型 | 本研究主要集中在三阴性乳腺癌中的免疫细胞代谢机制，未涵盖其他癌症类型或其他免疫疗法 | 阐明三阴性乳腺癌中免疫检查点阻断疗法非应答的代谢机制 | 三阴性乳腺癌中的免疫细胞及其代谢状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-12-13 |
Multiomic profiling reveals metabolic alterations mediating aberrant platelet activity and inflammation in myeloproliferative neoplasms
2024-Feb-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172256
PMID:38060311
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研究论文 | 研究揭示了骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者血小板异常活性和炎症的代谢改变 | 首次揭示了MPN患者中与PI3K/AKT/mTOR信号通路异常相关的代谢紊乱，并发现α-酮戊二酸（α-KG）补充能够显著减少血小板活化和炎症反应 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上，尚未在人体中进行临床试验验证 | 探讨骨髓增殖性肿瘤患者血小板异常活性和炎症的代谢机制 | 骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者的血小板和单核细胞 | NA | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学 | NA | RNA、蛋白质、代谢物 | 包括MPN患者和Jak2 V617F-knockin小鼠的血小板和单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-12-12 |
Common mitochondrial deletions in RNA-Seq: evaluation of bulk, single-cell, and spatial transcriptomic datasets
2024-02-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-05877-4
PMID:38368460
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研究论文 | 本文评估了在批量、单细胞和空间转录组数据中检测常见线粒体DNA缺失的方法 | 首次应用Splice-Break2管道对RNA-Seq数据进行常见线粒体DNA缺失的定量分析，并比较了不同类型转录组数据中的检测结果 | 研究仅限于已有的RNA-Seq数据集，未涉及其他类型的数据 | 评估在不同类型转录组数据中检测常见线粒体DNA缺失的方法 | 常见线粒体DNA缺失在不同组织和疾病中的分布 | 基因组学 | NA | RNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | 1570个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-12-12 |
Single-cell analysis of uterosacral ligament revealed cellular heterogeneity in women with pelvic organ prolapse
2024-02-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-05808-3
PMID:38326542
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研究论文 | 本文使用单细胞RNA测序技术分析了子宫骶韧带中的细胞异质性，揭示了盆腔器官脱垂（POP）的分子机制 | 首次构建了盆腔器官脱垂患者和对照组子宫骶韧带的单细胞转录组图谱，并发现了与细胞外基质和细胞粘附相关的受体-配体对的显著减少 | NA | 探讨盆腔器官脱垂的分子机制 | 盆腔器官脱垂患者和对照组的子宫骶韧带细胞 | 数字病理学 | 盆腔器官脱垂 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 30,452个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-12-01 |
Massively parallel single-cell sequencing of diverse microbial populations
2024-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02157-7
PMID:38233503
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研究论文 | 本文介绍了一种简单、稳健且可推广的高通量单细胞测序方法，用于多样性微生物群体中的目标基因座测序 | 开发了一种名为DoTA-seq的新方法，利用简单的液滴微流控设备进行高通量单细胞测序，适用于多样性微生物群体 | NA | 研究微生物群体中的单细胞遗传异质性 | 人类和小鼠肠道微生物群中的抗生素抗性基因和质粒 | 基因组学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | 基因组数据 | 超过10个抗生素抗性基因和质粒 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-12-01 |
SEVtras delineates small extracellular vesicles at droplet resolution from single-cell transcriptomes
2024-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02117-1
PMID:38049696
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SEVtras的算法，利用基于液滴的单细胞RNA测序技术，从单细胞转录组中识别小细胞外囊泡（sEVs）并估计其分泌活性 | SEVtras算法能够高效地捕获含有sEVs的液滴，并表征特定细胞类型的分泌活性，为研究sEVs的异质性和细胞行为提供了新的工具 | NA | 开发一种高吞吐量技术来解析sEVs的复杂异质性并揭示其分泌机制 | 小细胞外囊泡（sEVs）及其在肿瘤进展中的作用 | 单细胞测序 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 四个肿瘤scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-11-29 |
JLONMFSC: Clustering scRNA-seq data based on joint learning of non-negative matrix factorization and subspace clustering
2024-02, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2023.11.019
PMID:38128706
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研究论文 | 提出了一种基于联合学习非负矩阵分解和子空间聚类的单细胞RNA测序数据聚类方法JLONMFSC | 结合了图正则化矩阵分解和低秩表示子空间聚类，以学习局部和全局特征，从而提高聚类性能 | 未提及 | 解决单细胞RNA测序数据的高维、稀疏和噪声问题，提高聚类效果 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 非负矩阵分解、子空间聚类 | JLONMFSC | 单细胞RNA测序数据 | 六个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-11-20 |
Spatially Resolved Transcriptomic Signatures of Hippocampal Subregions and Arc-Expressing Ensembles in Active Place Avoidance Memory
2024-Feb-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573225
PMID:38260257
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研究论文 | 研究通过bulk RNA测序和空间转录组学实验，分析了海马体背侧区域在主动位置回避记忆（APA）回忆后的基因表达变化 | 首次通过空间转录组学技术，揭示了海马体不同亚区域在APA记忆回忆后的基因表达差异，并发现了与突触可塑性和记忆相关的基因富集 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小，可能影响结果的普适性 | 探讨海马体在主动位置回避记忆回忆过程中的基因表达变化及其机制 | 海马体背侧区域的CA1、CA3和齿状回（DG）亚区域 | 神经科学 | NA | bulk RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 训练和未训练的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-11-17 |
Spatially Exploring RNA Biology in Archival Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Tissues
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.06.579143
PMID:38370833
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Patho-DBiT的技术，结合多聚腺苷酸化和确定性条形码，用于空间全覆盖转录组测序，特别适用于临床存档的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本中的RNA生物学研究 | Patho-DBiT技术能够在FFPE组织中进行空间共分析基因表达和RNA加工，揭示区域特异性剪接异构体，并进行高灵敏度的转录组映射 | NA | 探索福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中的RNA生物学 | 人类疾病相关组织的RNA生物学 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA | 临床存档的FFPE肿瘤组织样本，存储时间长达五年 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-11-15 |
Exploring biomarkers of Alzheimer's disease based on multi-omics and Mendelian randomisation analysis
2024-Feb, Annals of human biology
IF:1.2Q4
DOI:10.1080/03014460.2024.2415035
PMID:39508514
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研究论文 | 本研究通过结合多组学和孟德尔随机化分析，探索阿尔茨海默病的生物标志物 | 本研究创新性地整合了PET、SNP和基因表达数据，并使用AdaSMCCA、rAdaSMCCA和unAdaSMCCA算法进行高级相关性分析，以识别与阿尔茨海默病相关的关键区域、风险SNP位点和风险基因 | NA | 识别有效的阿尔茨海默病诊断和治疗生物标志物 | 阿尔茨海默病患者的多组学数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化分析、单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-11-13 |
Exploration of neuron heterogeneity in human heart failure with dilated cardiomyopathy through single-cell RNA sequencing analysis
2024-02-03, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-024-03739-9
PMID:38310240
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析探索扩张型心肌病（DCM）患者心脏衰竭中神经元的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了DCM患者心脏衰竭中神经元的异质性及其在免疫和炎症反应中的潜在作用 | 研究仅限于GSE183852和GSE120895数据集，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探索扩张型心肌病（DCM）患者心脏衰竭中神经元的异质性 | DCM患者和健康对照样本中的神经元 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | GSE183852数据集中的DCM患者和慢性心力衰竭患者及健康对照样本 | NA | NA | NA | NA |