单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 444 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
101	2025-10-07	Multi-omic analysis of human kidney tissue identified medulla-specific gene expression patterns 2024-Feb, Kidney international IF:14.8Q1 DOI:10.1016/j.kint.2023.10.024 PMID:37995909	研究论文	通过多组学分析揭示成人肾脏髓质特异性基因表达模式	首次系统描述成人肾脏髓质的基线基因表达和表观基因组特征，并整合染色质可及性、构象与空间转录组数据	样本量较小（仅5例男性患者），仅使用肿瘤旁正常组织	解析肾脏髓质发育和功能的分子机制	成人肾脏皮质和髓质组织	基因组学	肾脏疾病	RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C, 空间转录组, 免疫组织化学	NA	基因表达数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据	5例男性患者的肾切除标本	NA	RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C, 空间转录组	NA	NA
102	2025-10-07	Comprehensive Integration of Multiple Single-Cell Transcriptomic Data Sets Defines Distinct Cell Populations and Their Phenotypic Changes in Murine Atherosclerosis 2024-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320030 PMID:38152886	研究论文	通过整合多个单细胞转录组数据集，定义了小鼠动脉粥样硬化中不同的细胞群体及其表型变化	开发了基于报告基因表达的细胞类型分类算法，首次系统验证了平滑肌细胞向巨噬细胞转分化的罕见性	受限于现有研究数据的实验条件，转分化现象的检测可能存在灵敏度限制	解决血管疾病单细胞RNA测序研究中存在的争议性发现，深入理解驻留血管细胞在解剖和疾病中的作用	小鼠动脉粥样硬化模型中的血管细胞	单细胞转录组学	心血管疾病	单细胞RNA测序，原位杂交	细胞分类算法	单细胞转录组数据	多个已发表数据集的整合分析	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
103	2025-10-07	Single-cell resolution of human airway epithelial cells exposed to bronchiolitis obliterans-associated chemicals 2024-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology DOI:10.1152/ajplung.00304.2023 PMID:38084407	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术分析暴露于闭塞性细支气管炎相关化学物质的人气道上皮细胞的转录组特征	首次在单细胞分辨率下揭示不同BO相关化学物质暴露引起的气道上皮细胞表型变化和功能通路差异	研究仅限于体外细胞模型，未涉及动物模型或临床样本验证	阐明闭塞性细支气管炎相关化学物质暴露诱导疾病发生的分子机制	原代人气道上皮细胞	单细胞组学	肺纤维化疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	75,663个单细胞	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
104	2025-10-07	Distribution of P2Y and P2X purinergic receptor expression within the intestine 2024-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology DOI:10.1152/ajpgi.00108.2023 PMID:37987757	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了肠道上皮细胞中P2Y和P2X嘌呤能受体的分布模式	首次系统性地描述了胃肠道上皮细胞中嘌呤能受体的表达谱，并发现人肠道类器官是研究肠道嘌呤能信号传导的优选模型	研究主要基于mRNA表达水平，蛋白质表达和功能验证需要进一步研究	探究嘌呤能受体在肠道上皮细胞中的表达分布和功能	人类小肠和大肠组织、人肠道类器官、T84、Caco2和HT29肠道上皮细胞系	单细胞生物学	肠道炎性疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	人类肠道组织单细胞测序数据、三种肠道上皮细胞系和人肠道类器官	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
105	2025-10-07	A review of computational methods for predicting cancer drug response at the single-cell level through integration with bulk RNAseq data 2024-02, Current opinion in structural biology IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.sbi.2023.102745 PMID:38109840	综述	综述通过整合单细胞RNA测序与bulk RNAseq数据预测癌症药物反应的计算方法	系统梳理了利用大规模药物筛选数据在单细胞层面预测药物敏感性的计算方法	NA	填补单细胞RNA测序知识向治疗策略转化的空白，解决肿瘤异质性导致的治疗抵抗问题	肿瘤异质性、恶性细胞克隆	计算生物学	癌症	单细胞RNA测序、bulk RNA测序	NA	基因表达数据	NA	NA	单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq	NA	NA
106	2025-10-07	Single-cell RNA sequencing of human prostate basal epithelial cells reveals zone-specific cellular populations and gene expression signatures 2024-02, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6227 PMID:37984408	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示人类前列腺基底上皮细胞的区域特异性细胞群体和基因表达特征	首次在前列腺基底细胞中识别出区域特异性细胞群体和与前列腺癌及良性前列腺增生相关的基因表达特征	研究基于原代前列腺上皮细胞培养，可能无法完全反映体内微环境的影响	探究前列腺基底细胞在区域特异性疾病发生中的潜在驱动作用	人类前列腺和精囊的原代基底上皮细胞	单细胞组学	前列腺癌	单细胞RNA测序，免疫染色，生物信息学分析	Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP)	单细胞RNA测序数据	人类前列腺和精囊的原代上皮细胞	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
107	2025-10-07	Interleukin-10 signaling in somatosensory neurons controls CCL2 release and inflammatory response 2024-02, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2023.12.013 PMID:38081433	研究论文	本研究揭示了白细胞介素-10通过直接作用于感觉神经元上的受体来下调CCL2释放并调控炎症反应的新机制	首次证明抗炎细胞因子可通过直接结合感觉神经元受体来限制炎症	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证	探究IL-10信号在感觉神经元中对炎症反应的调控作用	背根神经节感觉神经元、三叉神经节神经元	神经免疫学	炎症性疾病	scRNA-seq, 原代神经元培养	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、细胞因子水平数据	野生型与IL-10R1特异性敲除小鼠的比较研究	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
108	2025-10-07	Method for Collecting Single Epithelial Cells from the Mouse Larynx 2024-02, The Laryngoscope DOI:10.1002/lary.30970 PMID:37602769	研究论文	开发了一种从小鼠喉部收集单个上皮细胞的可靠方法	首次建立了使用小型牙科刷从小鼠喉部特异性收集上皮细胞的技术，能够最小化非喉部部位和非上皮细胞的污染	该方法会移除喉部上皮层和部分下层组织，可能影响组织完整性	开发从小鼠喉部收集单个上皮细胞的可靠方法	小鼠喉部上皮细胞	单细胞生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫荧光染色, 组织病理学	NA	单细胞RNA测序数据, 图像数据	单个喉部收集6000-8000个细胞，三个组织合并收集35000-40000个细胞	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
109	2024-08-07	Partners in Crime: Inferring Cell-to-cell Interactions in Kidney Allograft Rejection From Single-cell RNA Sequencing 2024-Feb-01, Transplantation IF:5.3Q1 DOI:10.1097/TP.0000000000004763 PMID:37638872	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
110	2025-10-07	Analysis of brain and blood single-cell transcriptomics in acute and subacute phases after experimental stroke 2024-Feb, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-023-01711-x PMID:38177281	研究论文	通过单细胞转录组学分析实验性中风后急性和亚急性期大脑与血液细胞的动态变化	首次系统揭示缺血性中风后不同时间点大脑和血液免疫细胞的转录组动态，预测巨噬细胞原位转分化和中性粒细胞的持续新招募过程	研究仅限于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证	阐明缺血性中风后大脑和血液免疫细胞的动态变化和多样性	实验性中风小鼠模型中的大脑和血液细胞	单细胞转录组学	缺血性中风	单细胞RNA测序	轨迹推断分析	单细胞转录组数据	年轻和老年雌雄小鼠的中风模型	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
111	2025-10-07	Circulating myeloid-derived MMP8 in stress susceptibility and depression 2024-Feb, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-07015-2 PMID:38326622	研究论文	研究发现循环髓系细胞来源的MMP8在应激易感性和抑郁症中起关键作用	首次揭示外周免疫细胞来源的MMP8蛋白能够直接渗透到大脑伏隔核区域并调控细胞外空间超微结构	机制研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限	探索应激相关精神疾病中外周免疫系统与中枢神经系统功能的关联机制	重度抑郁症患者和经历慢性社交挫败应激的小鼠	神经免疫学	抑郁症	质谱流式细胞术,单细胞RNA测序	NA	血清样本,脑组织样本,行为学数据	人类MDD患者和应激小鼠模型	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
112	2025-10-07	An atlas of cells in the human tonsil 2024-02-13, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2024.01.006 PMID:38301653	研究论文	构建了包含超过55.6万个细胞的人类扁桃体细胞图谱，整合了五种数据模态	首次整合单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组、免疫组库测序和空间转录组学五种数据模态构建人类扁桃体细胞图谱	NA	建立人类扁桃体细胞图谱并解析其免疫功能	人类扁桃体细胞	单细胞多组学	淋巴瘤	单细胞转录组测序, 单细胞表观基因组测序, 单细胞蛋白质组测序, 免疫组库测序, 空间转录组学	NA	单细胞多组学数据, 空间转录组数据	超过556,000个细胞	NA	单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学, 空间转录组学	NA	NA
113	2025-10-07	Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data Reveals Memory-like NK Cell Subset Associated with Mycobacterium tuberculosis Latency 2024-02-06, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13040293 PMID:38391906	研究论文	通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，揭示了与结核分枝杆菌潜伏感染相关的记忆样NK细胞亚群	首次结合单细胞和bulk RNA测序数据识别出在潜伏结核感染中显著扩增的记忆样NK细胞亚群	流式细胞术验证仅在小样本队列中进行，样本量有限	阐明NK细胞在结核分枝杆菌感染保护性免疫应答中的作用	外周血NK细胞	单细胞组学	结核病	单细胞RNA测序,bulk RNA测序,流式细胞术	NA	RNA测序数据,流式细胞数据	活动性结核病患者、潜伏感染者和健康供者的样本	NA	单细胞RNA测序,bulk RNA测序	NA	NA
114	2025-10-07	Single-Cell RNA Sequencing Reveals HIF1A as a Severity-Sensitive Immunological Scar in Circulating Monocytes of Convalescent Comorbidity-Free COVID-19 Patients 2024-02-06, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13040300 PMID:38391913	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示HIF1A作为康复期无合并症COVID-19患者循环单核细胞中疾病严重程度敏感的长期免疫学疤痕	首次在无合并症康复者中揭示HIF1A作为疾病严重程度敏感的长期免疫印记，并发现单核细胞与T细胞/NK细胞形成的循环复合物是康复期特征性细胞标志物	研究仅针对无合并症患者，结果可能不适用于有基础疾病的COVID-19患者	揭示不同严重程度COVID-19康复期患者的转录组免疫细胞失调机制	无合并症的康复期COVID-19患者	单细胞转录组学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
115	2025-10-07	Stem-like progenitor and terminally differentiated TFH-like CD4+ T cell exhaustion in the tumor microenvironment 2024-02-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113797 PMID:38363680	研究论文	本研究通过单细胞测序和小鼠模型揭示了肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞耗竭的分化特征及其抗肿瘤免疫机制	首次发现肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞存在干细胞样祖细胞和终末分化的细胞毒性亚群，并阐明其与CD8+ T细胞耗竭模式的相似性	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚需进一步研究	探究肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞的耗竭特征及其在抗肿瘤免疫中的作用	肿瘤浸润性CD4+ T细胞和CD8+ T细胞	免疫学	癌症	单细胞测序	小鼠模型	基因表达数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
116	2025-10-07	Endocardium gives rise to blood cells in zebrafish embryos 2024-02-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113736 PMID:38308842	研究论文	本研究通过斑马鱼胚胎模型证实心内膜能够产生血细胞	首次在斑马鱼胚胎中通过实时成像和谱系追踪证实心内膜来源的髓系细胞生成	研究仅针对斑马鱼胚胎模型，在哺乳动物中的保守性需要进一步验证	探究心内膜在造血过程中的贡献	斑马鱼胚胎	发育生物学	NA	单细胞RNA测序,实时成像,谱系追踪,表达分析	NA	基因表达数据,成像数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
117	2025-10-07	Spatiotemporal role of SETD2-H3K36me3 in murine pancreatic organogenesis 2024-02-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113703 PMID:38265933	研究论文	本研究通过多组学技术揭示了SETD2-H3K36me3在小鼠胰腺器官发生中的时空调控作用	首次系统阐明SETD2介导的H3K36me3修饰在胰腺发育过程中的动态变化及其对内外分泌谱系分化的调控机制	研究局限于小鼠模型，尚未在人类胰腺发育中验证	探究组蛋白修饰H3K36me3在胰腺器官发生中的调控作用	小鼠胚胎胰腺发育过程	表观遗传学	胰腺疾病	CUT&Tag, ATAC-seq, bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序	NA	基因组学数据，转录组数据，表观遗传数据	NA	NA	单细胞RNA测序，染色质可及性测序，靶向切割标记技术	NA	NA
118	2025-10-07	The single-cell transcriptome program of nodule development cellular lineages in Medicago truncatula 2024-02-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113747 PMID:38329875	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了蒺藜苜蓿根瘤发育过程中细胞谱系的转录重编程机制	首次在蒺藜苜蓿中构建了根瘤发育的单细胞转录组图谱，鉴定了参与共生响应的表皮根毛和中柱亚细胞类型，并发现新的根瘤形成调控因子STYLISH 4	研究主要关注早期根瘤发育阶段，对成熟根瘤的功能研究相对有限	解析豆科植物与根瘤菌共生过程中根瘤发育的细胞类型特异性转录调控网络	蒺藜苜蓿野生型Jemalong A17及其超结瘤突变体sunn-4的根组织细胞	植物单细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	轨迹推断，基因调控网络分析	单细胞转录组数据	野生型和突变体苜蓿根组织细胞	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
119	2025-10-07	Single-cell RNA sequencing of cervical exfoliated cells reveals potential biomarkers and cellular pathogenesis in cervical carcinogenesis 2024-02-12, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06522-y PMID:38346944	研究论文	通过单细胞RNA测序分析宫颈脱落细胞，揭示宫颈癌发生过程中的潜在生物标志物和细胞发病机制	首次在单细胞分辨率下描绘宫颈癌发生过程中免疫细胞和上皮细胞的动态变化，鉴定出脂质相关巨噬细胞作为预测LSIL向HSIL进展的生物标志物	样本量相对有限（15个样本），需要在更大队列中验证研究结果	探索宫颈癌发生过程中的细胞异质性和潜在生物标志物	宫颈脱落细胞	单细胞测序	宫颈癌	单细胞RNA测序，免疫荧光	NA	单细胞转录组数据	15个样本（包含正常宫颈、LSIL、HSIL和恶性肿瘤），56,173个细胞	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
120	2025-10-07	Pro-inflammatory feedback loops define immune responses to pathogenic Lentivirus infection 2024-02-05, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-024-01290-y PMID:38317183	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示致病性慢病毒感染引发促炎反馈环路导致疾病进展的免疫机制	利用遗传相似但毒力不同的SIV变异株感染模型，结合纵向单细胞转录组和细胞通讯分析，首次发现致病性慢病毒通过逃逸干扰素应答并激活CXCL10/CXCL16驱动的促炎放大环路	研究局限于猪尾猕猴模型，未在人类HIV感染中直接验证	揭示慢病毒致病性差异的免疫学基础	感染不同毒力SIV变异株的猪尾猕猴免疫细胞	免疫学	艾滋病	单细胞转录组测序，细胞间通讯分析	NA	单细胞RNA测序数据	猪尾猕猴感染队列的纵向样本	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA