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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-07 |
A model of human neural networks reveals NPTX2 pathology in ALS and FTLD
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07042-7
PMID:38355792
|
研究论文 | 本研究通过建立人类神经网络模型揭示了TDP-43蛋白病变中NPTX2积累的神经毒性机制 | 开发了新型均质化神经干细胞系(iCoMoNSCs)和长效功能性神经网络模型(iNets),首次发现TDP-43通过3'UTR调控NPTX2表达并导致神经退行 | 模型虽能模拟年龄相关疾病但仍需验证其与真实人类大脑发育的一致性 | 探索TDP-43蛋白病变的发生机制及其在神经退行性疾病中的作用 | 诱导多能干细胞分化的神经网络模型及ALS/FTLD患者神经元 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症,额颞叶痴呆 | 单细胞转录组测序,干细胞分化,电生理记录 | 神经网络模型,类器官模型 | 基因表达数据,蛋白质组数据,电生理数据 | 未明确样本数量但包含患者神经元和干细胞衍生模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-07 |
Prostacyclin Mitigates Renal Fibrosis by Activating Fibroblast Prostaglandin I 2 Receptor
2024-02-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000286
PMID:38062563
|
研究论文 | 本研究探讨了前列环素通过激活成纤维细胞前列腺素I2受体减轻肾纤维化的作用机制 | 首次揭示了PGI2/PTGIR信号通路在肾纤维化中的保护作用,并证明靶向该通路可成为慢性肾脏病的潜在治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 研究前列环素在肾纤维化和慢性肾脏病进展中的作用机制 | PTGIS和PTGIR基因缺陷小鼠、PGI2类似物、选择性PTGIR激动剂、慢性肾脏病患者的单细胞RNA测序数据 | 病理生理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序,基因敲除技术 | NA | 基因表达数据,病理学数据 | 基因缺陷小鼠模型和人类慢性肾脏病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-10-07 |
Zika virus co-opts microRNA networks to persist in placental niches detected by spatial transcriptomics
2024-02, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2023.08.012
PMID:37598997
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了寨卡病毒通过劫持胎盘microRNA网络在胎盘微环境中持续存在的机制 | 首次发现寨卡病毒通过破坏胎盘microRNA调控网络实现持续感染,并利用空间转录组学技术识别了病毒特异性胎盘生态位 | 样本量相对较小(人类胎盘n=5,小鼠胎盘n=14),且动物模型与人类生理存在差异 | 探究寨卡病毒在胎盘中持续存在而不引起明显组织损伤的机制 | 人类原代滋养层细胞、人类胎盘盘标本、无菌小鼠模型 | 空间转录组学 | 寨卡病毒感染 | 空间转录组学, Argonaute HITS-CLIP, 批量RNA测序, 流式细胞术 | 动物模型 | 空间转录组数据, RNA测序数据 | 5个人类胎盘供体, 3名寨卡病毒阳性受试者, 2名未感染对照, 20只孕鼠产生187个胎儿标本, 14个小鼠胎盘 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组技术获得9743个空间转录组 |
| 104 | 2025-10-07 |
Computational cell-cell interaction technologies drive mechanistic and biomarker discovery in the tumor microenvironment
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103048
PMID:38142648
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究肿瘤微环境中细胞间相互作用的最新进展 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术阐明肿瘤微环境动态,推动关键细胞间相互作用和药物靶点生物标志物的发现 | NA | 促进肿瘤微环境中细胞间相互作用机制研究和生物标志物发现 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用网络 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-07 |
Strategies for dissecting the complexity of neurodevelopmental disorders
2024-02, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2023.10.009
PMID:37949722
|
综述 | 本文综述了利用模型生物、诱导多能干细胞、单细胞测序技术和大规模平行报告分析等策略解析神经发育障碍复杂性的方法 | 重点介绍了基于单细胞CRISPR筛选技术,能够以高效率、准确性和高通量方式研究细胞转录组 | NA | 解析神经发育障碍的复杂性并探索疾病因果关系和潜在机制 | 神经发育障碍 | 生物医学研究 | 神经发育障碍 | 高通量测序, 单细胞测序, CRISPR筛选, 大规模平行报告分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-10-07 |
Astrocyte ensheathment of calyx-forming axons of the auditory brainstem precedes accelerated expression of myelin genes and myelination by oligodendrocytes
2024-02, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25552
PMID:37916792
|
研究论文 | 本研究揭示了听觉脑干中星形胶质细胞在少突胶质细胞髓鞘形成前包裹轴突的新机制 | 首次证明小鼠MNTB中星形胶质细胞在少突胶质细胞包裹和髓鞘压实前广泛包裹生长的CH终末轴突 | 研究局限于小鼠早期 postnatal 发育阶段,需要进一步验证在其他物种或发育阶段的普适性 | 探究听觉脑干早期发育阶段神经元与胶质细胞相互作用的分子机制和时序特征 | 小鼠 medial nucleus of the trapezoid body (MNTB) 组织 | 神经科学 | NA | 微阵列基因表达分析, bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 电子显微镜3D成像 | NA | 基因表达数据, 电子显微镜图像 | postnatal day P0-P14 发育时间序列的小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-10-07 |
Multi-omic analysis of human kidney tissue identified medulla-specific gene expression patterns
2024-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.10.024
PMID:37995909
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示成人肾脏髓质特异性基因表达模式 | 首次系统描述成人肾脏髓质的基线基因表达和表观基因组特征,并整合染色质可及性、构象与空间转录组数据 | 样本量较小(仅5例男性患者),仅使用肿瘤旁正常组织 | 解析肾脏髓质发育和功能的分子机制 | 成人肾脏皮质和髓质组织 | 基因组学 | 肾脏疾病 | RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C, 空间转录组, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 5例男性患者的肾切除标本 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C, 空间转录组 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-07 |
Comprehensive Integration of Multiple Single-Cell Transcriptomic Data Sets Defines Distinct Cell Populations and Their Phenotypic Changes in Murine Atherosclerosis
2024-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320030
PMID:38152886
|
研究论文 | 通过整合多个单细胞转录组数据集,定义了小鼠动脉粥样硬化中不同的细胞群体及其表型变化 | 开发了基于报告基因表达的细胞类型分类算法,首次系统验证了平滑肌细胞向巨噬细胞转分化的罕见性 | 受限于现有研究数据的实验条件,转分化现象的检测可能存在灵敏度限制 | 解决血管疾病单细胞RNA测序研究中存在的争议性发现,深入理解驻留血管细胞在解剖和疾病中的作用 | 小鼠动脉粥样硬化模型中的血管细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,原位杂交 | 细胞分类算法 | 单细胞转录组数据 | 多个已发表数据集的整合分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2025-10-07 |
Single-cell resolution of human airway epithelial cells exposed to bronchiolitis obliterans-associated chemicals
2024-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00304.2023
PMID:38084407
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析暴露于闭塞性细支气管炎相关化学物质的人气道上皮细胞的转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下揭示不同BO相关化学物质暴露引起的气道上皮细胞表型变化和功能通路差异 | 研究仅限于体外细胞模型,未涉及动物模型或临床样本验证 | 阐明闭塞性细支气管炎相关化学物质暴露诱导疾病发生的分子机制 | 原代人气道上皮细胞 | 单细胞组学 | 肺纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 75,663个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2025-10-07 |
Distribution of P2Y and P2X purinergic receptor expression within the intestine
2024-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00108.2023
PMID:37987757
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了肠道上皮细胞中P2Y和P2X嘌呤能受体的分布模式 | 首次系统性地描述了胃肠道上皮细胞中嘌呤能受体的表达谱,并发现人肠道类器官是研究肠道嘌呤能信号传导的优选模型 | 研究主要基于mRNA表达水平,蛋白质表达和功能验证需要进一步研究 | 探究嘌呤能受体在肠道上皮细胞中的表达分布和功能 | 人类小肠和大肠组织、人肠道类器官、T84、Caco2和HT29肠道上皮细胞系 | 单细胞生物学 | 肠道炎性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类肠道组织单细胞测序数据、三种肠道上皮细胞系和人肠道类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-10-07 |
A review of computational methods for predicting cancer drug response at the single-cell level through integration with bulk RNAseq data
2024-02, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2023.102745
PMID:38109840
|
综述 | 综述通过整合单细胞RNA测序与bulk RNAseq数据预测癌症药物反应的计算方法 | 系统梳理了利用大规模药物筛选数据在单细胞层面预测药物敏感性的计算方法 | NA | 填补单细胞RNA测序知识向治疗策略转化的空白,解决肿瘤异质性导致的治疗抵抗问题 | 肿瘤异质性、恶性细胞克隆 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of human prostate basal epithelial cells reveals zone-specific cellular populations and gene expression signatures
2024-02, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6227
PMID:37984408
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类前列腺基底上皮细胞的区域特异性细胞群体和基因表达特征 | 首次在前列腺基底细胞中识别出区域特异性细胞群体和与前列腺癌及良性前列腺增生相关的基因表达特征 | 研究基于原代前列腺上皮细胞培养,可能无法完全反映体内微环境的影响 | 探究前列腺基底细胞在区域特异性疾病发生中的潜在驱动作用 | 人类前列腺和精囊的原代基底上皮细胞 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫染色,生物信息学分析 | Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) | 单细胞RNA测序数据 | 人类前列腺和精囊的原代上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-07 |
Interleukin-10 signaling in somatosensory neurons controls CCL2 release and inflammatory response
2024-02, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.12.013
PMID:38081433
|
研究论文 | 本研究揭示了白细胞介素-10通过直接作用于感觉神经元上的受体来下调CCL2释放并调控炎症反应的新机制 | 首次证明抗炎细胞因子可通过直接结合感觉神经元受体来限制炎症 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究IL-10信号在感觉神经元中对炎症反应的调控作用 | 背根神经节感觉神经元、三叉神经节神经元 | 神经免疫学 | 炎症性疾病 | scRNA-seq, 原代神经元培养 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、细胞因子水平数据 | 野生型与IL-10R1特异性敲除小鼠的比较研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-10-07 |
Method for Collecting Single Epithelial Cells from the Mouse Larynx
2024-02, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30970
PMID:37602769
|
研究论文 | 开发了一种从小鼠喉部收集单个上皮细胞的可靠方法 | 首次建立了使用小型牙科刷从小鼠喉部特异性收集上皮细胞的技术,能够最小化非喉部部位和非上皮细胞的污染 | 该方法会移除喉部上皮层和部分下层组织,可能影响组织完整性 | 开发从小鼠喉部收集单个上皮细胞的可靠方法 | 小鼠喉部上皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫荧光染色, 组织病理学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 单个喉部收集6000-8000个细胞,三个组织合并收集35000-40000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2024-08-07 |
Partners in Crime: Inferring Cell-to-cell Interactions in Kidney Allograft Rejection From Single-cell RNA Sequencing
2024-Feb-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004763
PMID:37638872
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2025-10-07 |
Analysis of brain and blood single-cell transcriptomics in acute and subacute phases after experimental stroke
2024-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01711-x
PMID:38177281
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析实验性中风后急性和亚急性期大脑与血液细胞的动态变化 | 首次系统揭示缺血性中风后不同时间点大脑和血液免疫细胞的转录组动态,预测巨噬细胞原位转分化和中性粒细胞的持续新招募过程 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明缺血性中风后大脑和血液免疫细胞的动态变化和多样性 | 实验性中风小鼠模型中的大脑和血液细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年雌雄小鼠的中风模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2025-10-07 |
Circulating myeloid-derived MMP8 in stress susceptibility and depression
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07015-2
PMID:38326622
|
研究论文 | 研究发现循环髓系细胞来源的MMP8在应激易感性和抑郁症中起关键作用 | 首次揭示外周免疫细胞来源的MMP8蛋白能够直接渗透到大脑伏隔核区域并调控细胞外空间超微结构 | 机制研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索应激相关精神疾病中外周免疫系统与中枢神经系统功能的关联机制 | 重度抑郁症患者和经历慢性社交挫败应激的小鼠 | 神经免疫学 | 抑郁症 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 血清样本,脑组织样本,行为学数据 | 人类MDD患者和应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-07 |
An atlas of cells in the human tonsil
2024-02-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.01.006
PMID:38301653
|
研究论文 | 构建了包含超过55.6万个细胞的人类扁桃体细胞图谱,整合了五种数据模态 | 首次整合单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组、免疫组库测序和空间转录组学五种数据模态构建人类扁桃体细胞图谱 | NA | 建立人类扁桃体细胞图谱并解析其免疫功能 | 人类扁桃体细胞 | 单细胞多组学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组测序, 单细胞表观基因组测序, 单细胞蛋白质组测序, 免疫组库测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | 超过556,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2025-10-07 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data Reveals Memory-like NK Cell Subset Associated with Mycobacterium tuberculosis Latency
2024-02-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13040293
PMID:38391906
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,揭示了与结核分枝杆菌潜伏感染相关的记忆样NK细胞亚群 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据识别出在潜伏结核感染中显著扩增的记忆样NK细胞亚群 | 流式细胞术验证仅在小样本队列中进行,样本量有限 | 阐明NK细胞在结核分枝杆菌感染保护性免疫应答中的作用 | 外周血NK细胞 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,流式细胞术 | NA | RNA测序数据,流式细胞数据 | 活动性结核病患者、潜伏感染者和健康供者的样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals HIF1A as a Severity-Sensitive Immunological Scar in Circulating Monocytes of Convalescent Comorbidity-Free COVID-19 Patients
2024-02-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13040300
PMID:38391913
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示HIF1A作为康复期无合并症COVID-19患者循环单核细胞中疾病严重程度敏感的长期免疫学疤痕 | 首次在无合并症康复者中揭示HIF1A作为疾病严重程度敏感的长期免疫印记,并发现单核细胞与T细胞/NK细胞形成的循环复合物是康复期特征性细胞标志物 | 研究仅针对无合并症患者,结果可能不适用于有基础疾病的COVID-19患者 | 揭示不同严重程度COVID-19康复期患者的转录组免疫细胞失调机制 | 无合并症的康复期COVID-19患者 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |