单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 444 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-07 |
Tim4 deficiency reduces CD301b+ macrophage and aggravates periodontitis bone loss
2024-02-28, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00270-z
PMID:38418808
|
研究论文 | 本研究探讨Tim4缺陷通过减少CD301b+巨噬细胞加剧牙周炎骨丢失的机制 | 首次揭示Tim4作为CD301b+巨噬细胞的上游调控因子，通过p38 MAPK信号通路调控其在牙周炎中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Tim4在牙周炎骨丢失中对CD301b+巨噬细胞的调控机制 | 小鼠牙周炎模型中的CD301b+巨噬细胞 | 免疫学 | 牙周炎 | 高通量RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-07 |
PRX1-positive mesenchymal stem cells drive molar morphogenesis
2024-02-19, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00277-0
PMID:38369512
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪揭示了PRX1阳性间充质干细胞通过Wnt5a信号调控磨牙形态发生的机制 | 首次发现PRX1阳性间充质细胞在磨牙形态发生中的关键作用，并阐明Wnt5a通过WNT信号通路调控细胞增殖的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究调控牙齿形态发生的关键因素和分子机制 | 小鼠磨牙发育过程中的间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-07 |
EBF1 Limits the Numbers of Cochlear Hair and Supporting Cells and Forms the Scala Tympani and Spiral Limbus during Inner Ear Development
2024-02-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1060-23.2023
PMID:38176908
|
研究论文 | 本研究探讨了早期B细胞因子1（EBF1）在小鼠内耳发育过程中对毛细胞和支持细胞数量的调控作用 | 首次发现EBF1通过抑制前感觉域和Kölliker器细胞的增殖来调控内耳细胞数量，并参与螺旋缘和鼓阶的形成 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 阐明EBF1在内耳发育过程中的功能机制 | 小鼠内耳组织 | 发育生物学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织形态学数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-07 |
Bacterial phenotypic heterogeneity through the lens of single-cell RNA sequencing
2024 Feb-Apr, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2024.2334110
PMID:38532542
|
综述 | 探讨单细胞RNA测序在细菌表型异质性研究中的应用与前景 | 首次系统阐述单细胞转录组学在微生物群体表型异质性研究中的创新应用 | 作为综述文章未涉及原始实验数据 | 解析细菌转录异质性及其生态学意义 | 微生物群体和细菌细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2025-10-07 |
Response to tumor-infiltrating lymphocyte adoptive therapy is associated with preexisting CD8+ T-myeloid cell networks in melanoma
2024-02-02, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg7995
PMID:38306416
|
研究论文 | 本研究通过分析黑色素瘤患者接受肿瘤浸润淋巴细胞过继疗法前后的样本，揭示了治疗反应与预先存在的CD8+T细胞-髓系细胞网络之间的关联 | 首次系统揭示了TIL-ACT治疗反应与基线肿瘤微环境中T细胞-髓系细胞网络的关系，并识别了潜在的生物标志物 | 样本量较小（仅13例患者），且为单中心研究 | 探索肿瘤浸润淋巴细胞过继疗法治疗反应的生物学机制和预测标志物 | 转移性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 空间蛋白质组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质空间分布数据 | 13例转移性黑色素瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-07 |
Androgen deprivation induces double-null prostate cancer via aberrant nuclear export and ribosomal biogenesis through HGF and Wnt activation
2024-Feb-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45489-4
PMID:38336745
|
研究论文 | 研究揭示雄激素剥夺疗法通过异常HGF和Wnt信号激活诱导双阴性前列腺癌的机制 | 首次发现当前ADT通过异常HGF/MET信号激活进一步升高Wnt/β-catenin信号，并鉴定XPO1和核糖体蛋白在DNPC中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本，需要更大规模临床验证 | 探索雄激素剥夺疗法诱导双阴性前列腺癌的分子机制 | 前列腺癌细胞、小鼠前列腺组织、人类DNPC临床样本 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类临床DNPC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-07 |
Identification of AgRP cells in the murine hindbrain that drive feeding
2024-Feb, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101886
PMID:38246589
|
研究论文 | 本研究在小鼠后脑中发现并表征了先前未知的AgRP细胞群，这些细胞能够独立于下丘脑AgRP神经元驱动摄食行为 | 首次在小鼠后脑区域（包括最后区、亚后区及孤束核连合部）鉴定出AgRP表达细胞群，证明这些细胞具有独立于下丘脑的促食欲功能 | 研究主要聚焦于小鼠模型，尚未在其它物种中验证；对AgRPHind细胞的具体神经环路机制仍需进一步探索 | 探究后脑中AgRP细胞的存在及其在摄食调控中的作用 | 小鼠后脑AgRP表达细胞 | 神经科学 | 代谢疾病 | 基因表达分析、单细胞RNA测序、免疫荧光分析、DREADD化学遗传学、SOUL光遗传学 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像、行为学数据 | 多种转基因小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-07 |
Preclinical Evidence for the Glucocorticoid-Sparing Potential of a Dual Toll-Like Receptor 7/8 Inhibitor in Autoimmune Diseases
2024-02-15, The Journal of pharmacology and experimental therapeutics
IF:3.1Q2
DOI:10.1124/jpet.123.001744
PMID:37673681
|
研究论文 | 本研究探讨了双重TLR7/8抑制剂在自身免疫性疾病中增强糖皮质激素疗效的潜力 | 首次证明TLR7/8抑制剂与糖皮质激素在炎症环境中具有协同作用，特别是在髓系细胞中效果显著 | IFNs受影响程度较小，研究主要基于细胞实验和小鼠模型 | 开发能够减少糖皮质激素用量的自身免疫性疾病新疗法 | 人类外周血单个核细胞、髓系细胞、单核细胞和MRL/狼疮小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | NanoString基因表达分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，细胞因子数据 | 人类外周血单个核细胞研究和MRL/小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal profiling defines persistence and resistance dynamics during targeted treatment of melanoma
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.02.577085
PMID:38370717
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析黑色素瘤靶向治疗过程中的细胞持久性状态和耐药机制 | 首次在患者来源异种移植模型中结合空间转录组学和深度学习，揭示黑色素瘤治疗过程中克隆谱系演化的时空动态 | 研究基于患者来源异种移植模型，可能与实际患者肿瘤微环境存在差异 | 阐明BRAF突变黑色素瘤靶向治疗中持久性细胞状态和耐药机制 | BRAF突变黑色素瘤细胞和患者来源异种移植模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 深度学习 | 深度学习模型 | 空间转录组数据, 组织病理切片图像 | 患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组学平台 |
| 90 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomes and Immune Repertoires Reveal the Cell State and Molecular Changes in Pemphigus Vulgaris
2024-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300312
PMID:38117802
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和免疫受体分析揭示天疱疮的细胞状态和分子变化 | 首次结合5'单细胞RNA测序与V(D)J富集技术分析天疱疮患者治疗前后样本，发现IL-1α信号通路、髓系APC细胞和功能失调的T细胞亚群在疾病中的作用 | 样本量有限，部分发现仅通过免疫组化和多重免疫荧光验证 | 阐明天疱疮的病因和发病机制，特别是免疫细胞与上皮细胞的相互作用 | 初治天疱疮患者的口腔黏膜病变和外周血样本，以及泼尼松治疗后的外周血样本 | 单细胞组学 | 天疱疮 | 5'单细胞RNA测序，V(D)J富集，免疫组化，多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，免疫受体序列数据 | 天疱疮患者的口腔黏膜和外周血样本（具体数量未明确说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞免疫受体测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 5' |
| 91 | 2025-10-07 |
Transcriptomic landscape of endothelial cells: Key tumor microenvironment components indicating variable clinical outcomes in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23881
PMID:37449672
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺导管腺癌中内皮细胞的异质性及其对临床预后的影响 | 首次在胰腺导管腺癌中系统鉴定出7个不同的内皮细胞亚群，并阐明其与肿瘤恶性进展和患者预后的关联 | 样本量相对有限（24个肿瘤和11个正常胰腺），需要更大规模的研究验证 | 阐明胰腺导管腺癌肿瘤微环境中内皮细胞的异质性及其对临床结局的影响 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织和正常胰腺组织中的内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 24个PDAC肿瘤样本和11个正常胰腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-10-07 |
CD_99 G1 neutrophils modulate osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells in the pathological process of ankylosing spondylitis
2024-Feb-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224107
PMID:37977819
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了强直性脊柱炎患者脊柱附着点中细胞亚群的异质性及其在骨生成过程中的相互作用机制 | 发现新型早期中性粒细胞亚群CD99_G1在AS中升高，并揭示间充质干细胞通过CAR细胞亚群向成骨分化的两条分化路径 | 样本量较小（5例患者和3例健康对照），需要在更大队列中验证发现 | 探究强直性脊柱炎脊柱附着点中细胞类型异质性及骨生成机制 | 强直性脊柱炎患者和健康个体的脊柱附着点组织 | 单细胞生物学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序，实时定量PCR，免疫荧光，流式细胞术，成骨诱导，茜素红染色，免疫组化，shRNA | 伪时间分析，配体-受体对分析 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 5例强直性脊柱炎患者和3例健康个体，共40,065个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-07 |
RNA-seq analysis reveals prenatal alcohol exposure is associated with placental inflammatory cells and gene expression
2024-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147951
PMID:37918548
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现产前酒精暴露与胎盘炎症细胞比例和基因表达改变相关 | 首次利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型反卷积分析，研究产前酒精暴露对胎盘细胞组成和炎症基因表达的影响 | 样本量相对较小（68例），需要未来研究进一步验证和功能分析 | 探究产前酒精暴露对胎盘细胞类型组成和炎症基因表达的影响 | 南非开普敦前瞻性出生队列中的35名重度饮酒孕妇和33名对照孕妇的胎盘样本 | 生物信息学 | 胎儿酒精谱系障碍 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，细胞类型反卷积分析 | 线性回归模型 | RNA测序数据 | 68例胎盘样本（35例酒精暴露，33例对照） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2025-10-07 |
Targeting metabolic sensing switch GPR84 on macrophages for cancer immunotherapy
2024-Feb-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03603-3
PMID:38349405
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现脂肪酸受体GPR84是调控肿瘤相关巨噬细胞抗肿瘤表型的重要代谢感应开关 | 首次发现GPR84作为代谢感应开关调控巨噬细胞抗肿瘤极化，并证明其激动剂6-OAU可增强抗PD-1疗法的疗效 | 研究主要基于小鼠肿瘤模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞代谢重编程机制以增强癌症免疫治疗效果 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其GPR84受体 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组测序，基因敲除，药理学激活 | NA | 转录组数据 | 多个肿瘤模型的小鼠数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-07 |
A model of human neural networks reveals NPTX2 pathology in ALS and FTLD
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07042-7
PMID:38355792
|
研究论文 | 本研究通过建立人类神经网络模型揭示了TDP-43蛋白病变中NPTX2积累的神经毒性机制 | 开发了新型均质化神经干细胞系(iCoMoNSCs)和长效功能性神经网络模型(iNets)，首次发现TDP-43通过3'UTR调控NPTX2表达并导致神经退行 | 模型虽能模拟年龄相关疾病但仍需验证其与真实人类大脑发育的一致性 | 探索TDP-43蛋白病变的发生机制及其在神经退行性疾病中的作用 | 诱导多能干细胞分化的神经网络模型及ALS/FTLD患者神经元 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症,额颞叶痴呆 | 单细胞转录组测序,干细胞分化,电生理记录 | 神经网络模型,类器官模型 | 基因表达数据,蛋白质组数据,电生理数据 | 未明确样本数量但包含患者神经元和干细胞衍生模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-07 |
Prostacyclin Mitigates Renal Fibrosis by Activating Fibroblast Prostaglandin I 2 Receptor
2024-02-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000286
PMID:38062563
|
研究论文 | 本研究探讨了前列环素通过激活成纤维细胞前列腺素I2受体减轻肾纤维化的作用机制 | 首次揭示了PGI2/PTGIR信号通路在肾纤维化中的保护作用，并证明靶向该通路可成为慢性肾脏病的潜在治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 研究前列环素在肾纤维化和慢性肾脏病进展中的作用机制 | PTGIS和PTGIR基因缺陷小鼠、PGI2类似物、选择性PTGIR激动剂、慢性肾脏病患者的单细胞RNA测序数据 | 病理生理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术 | NA | 基因表达数据，病理学数据 | 基因缺陷小鼠模型和人类慢性肾脏病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-07 |
Zika virus co-opts microRNA networks to persist in placental niches detected by spatial transcriptomics
2024-02, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2023.08.012
PMID:37598997
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了寨卡病毒通过劫持胎盘microRNA网络在胎盘微环境中持续存在的机制 | 首次发现寨卡病毒通过破坏胎盘microRNA调控网络实现持续感染，并利用空间转录组学技术识别了病毒特异性胎盘生态位 | 样本量相对较小（人类胎盘n=5，小鼠胎盘n=14），且动物模型与人类生理存在差异 | 探究寨卡病毒在胎盘中持续存在而不引起明显组织损伤的机制 | 人类原代滋养层细胞、人类胎盘盘标本、无菌小鼠模型 | 空间转录组学 | 寨卡病毒感染 | 空间转录组学, Argonaute HITS-CLIP, 批量RNA测序, 流式细胞术 | 动物模型 | 空间转录组数据, RNA测序数据 | 5个人类胎盘供体, 3名寨卡病毒阳性受试者, 2名未感染对照, 20只孕鼠产生187个胎儿标本, 14个小鼠胎盘 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组技术获得9743个空间转录组 |
| 98 | 2025-10-07 |
Computational cell-cell interaction technologies drive mechanistic and biomarker discovery in the tumor microenvironment
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103048
PMID:38142648
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究肿瘤微环境中细胞间相互作用的最新进展 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术阐明肿瘤微环境动态，推动关键细胞间相互作用和药物靶点生物标志物的发现 | NA | 促进肿瘤微环境中细胞间相互作用机制研究和生物标志物发现 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用网络 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-07 |
Strategies for dissecting the complexity of neurodevelopmental disorders
2024-02, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2023.10.009
PMID:37949722
|
综述 | 本文综述了利用模型生物、诱导多能干细胞、单细胞测序技术和大规模平行报告分析等策略解析神经发育障碍复杂性的方法 | 重点介绍了基于单细胞CRISPR筛选技术，能够以高效率、准确性和高通量方式研究细胞转录组 | NA | 解析神经发育障碍的复杂性并探索疾病因果关系和潜在机制 | 神经发育障碍 | 生物医学研究 | 神经发育障碍 | 高通量测序, 单细胞测序, CRISPR筛选, 大规模平行报告分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-07 |
Astrocyte ensheathment of calyx-forming axons of the auditory brainstem precedes accelerated expression of myelin genes and myelination by oligodendrocytes
2024-02, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25552
PMID:37916792
|
研究论文 | 本研究揭示了听觉脑干中星形胶质细胞在少突胶质细胞髓鞘形成前包裹轴突的新机制 | 首次证明小鼠MNTB中星形胶质细胞在少突胶质细胞包裹和髓鞘压实前广泛包裹生长的CH终末轴突 | 研究局限于小鼠早期 postnatal 发育阶段，需要进一步验证在其他物种或发育阶段的普适性 | 探究听觉脑干早期发育阶段神经元与胶质细胞相互作用的分子机制和时序特征 | 小鼠 medial nucleus of the trapezoid body (MNTB) 组织 | 神经科学 | NA | 微阵列基因表达分析, bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 电子显微镜3D成像 | NA | 基因表达数据, 电子显微镜图像 | postnatal day P0-P14 发育时间序列的小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |